8upr

;Escherichia coli transcription-translation coupled complex class A (TTC-A) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 21 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome ;

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 285.9 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8upr

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8upr
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8upr
沉积日期 deposition_date2023-10-23
结构标题 title;Escherichia coli transcription-translation coupled complex class A (TTC-A) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 21 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome ;
关键词 keywordstranscription, translation, RfaH, gene expression, regulation, ops, ribosome, coupling; TRANSCRIPTION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier98.50
回转半径 Rg (电子) rg_electron104.20
零角强度 I(0) i0199879000000.00
分子量 molecular_weight2619500.0 kDa
排除体积 excluded_volume2783100 ų
包络体积 envelope_volume5196700 ų
水化壳体积 shell_volume402600 ų
包络直径 envelope_diameter371.3
壳层 Rg shell_rg107.80
包络 Rg envelope_rg103.80
形状 Rg shape_rg104.40
总 Rg total_rg103.70
总原子数 total_atoms276059
残基数 n_residues14402
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax285.9
Rg (实空间) rg_real94.57
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.90
I(0) (实空间) i0_real1.9170e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.8810e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal96.23
I(0) (倒空间) i0_reciprocal198400000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9015
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary107.2
偏度 Skewness skewness0.438
峰度 Kurtosis kurtosis-0.130
角度范围 angular_range— – 0.0800 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.8388
最高正则化参数 α highest_alpha7600000000.0000
实空间数据点数 n_real_points17
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.932; Stabil: 0.973; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.930; Smooth: 0.076

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (67)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)