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8rgh

Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I1 (WDR60) in complex with the dynein-2 heavy chain DYNC2H1.

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 125.8 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1

Homo sapiens

UniProt P16455

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2–184 未记录 Cytoplasmic dynein 2 intermediate chain 1 × 1 （Q8WVS4） Cytoplasmic dynein 2 intermediate chain 2 × 1 （Q96EX3） Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1 × 1 （Q8TCX1） Dynein light chain roadblock-type 1 × 2 （Q9NP97） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RGH Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1EH6 HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE 提交 2000-02-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–207（207 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；18 MG/ML PROTEIN, 1.5 M SUCROSE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.00 Å R-free 0.218
1EH7 METHYLATED HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE 提交 2000-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–207（207 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；18 MG/ML PROTEIN, 1.5 M SUCROSE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.229
1EH8 BENZYLATED HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE 提交 2000-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–207（207 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；18 MG/ML PROTEIN, 1.5 M SUCROSE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.230
1QNT X-ray structure of human O6alkylguanine-DNA alkyltransferase 提交 1999-10-20 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–176（176 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.75M (NH4)2SO4, PH 7.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.221
1T38 HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE BOUND TO DNA CONTAINING O6-METHYLGUANINE 提交 2004-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–176（176 aa）
突变：C145S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 3000, Tris, sodium chloride, xylitol, calcium acetate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.307
1T39 HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE COVALENTLY CROSSLINKED TO DNA 提交 2004-04-25 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–176（176 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 8000, MES, calcium acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.344
1T39 HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE COVALENTLY CROSSLINKED TO DNA 提交 2004-04-25 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–176（176 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 8000, MES, calcium acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.344
1YFH wt Human O6-Alkylguanine-DNA Alkyltransferase Bound To DNA Containing an Alkylated Cytosine 提交 2004-12-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 C 1–179（179 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；277 K；PEG 4000, sodium chloride, citrate, magnesium chloride, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.01 Å R-free 0.286
1YFH wt Human O6-Alkylguanine-DNA Alkyltransferase Bound To DNA Containing an Alkylated Cytosine 提交 2004-12-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–179（179 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；277 K；PEG 4000, sodium chloride, citrate, magnesium chloride, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.01 Å R-free 0.286
1YFH wt Human O6-Alkylguanine-DNA Alkyltransferase Bound To DNA Containing an Alkylated Cytosine 提交 2004-12-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–179（179 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；277 K；PEG 4000, sodium chloride, citrate, magnesium chloride, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.01 Å R-free 0.286
28OP Structure of the human inner kinetochore CCAN and CENP-C bound to DNA 提交 2026-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 C 1–182（182 aa）
链 T 1–182（182 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8RGG Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I2 (WDR34) in complex with dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 2–184（183 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RTY Structure of the F-actin barbed end bound by Cdc12 and profilin (ring complex) at a resolution of 6.3 Angstrom 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 2–182（181 aa）
链 F 2–182（181 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
分辨率 6.25 Å
8RU2 Structure of the F-actin barbed end bound by formin mDia1 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–182（182 aa）
链 F 1–182（182 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 seconds, force 0.
分辨率 3.49 Å
9HHL Structure of Dynein-Dynactin-NuMA-LIS1 提交 2024-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：41-meric
链 1 1–182（182 aa）
链 2 1–182（182 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.53 Å
9QEY Cryo-EM structure of the actin filament bound by a single Coronin-1B molecule. 提交 2025-03-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 H 1–182（182 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.74 Å
9QF2 Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 F 1–182（182 aa）
链 G 1–182（182 aa）
链 H 1–182（182 aa）
链 I 1–182（182 aa）
链 J 1–182（182 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.42 Å
9QFB Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 H 1–182（182 aa）
链 I 1–182（182 aa）
链 J 1–182（182 aa）
链 K 1–182（182 aa）
链 L 1–182（182 aa）
链 M 1–182（182 aa）
链 N 1–182（182 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.74 Å
9QFE Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1 on separate actin strands 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 L 1–182（182 aa）
链 M 1–182（182 aa）
链 N 1–182（182 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.12 Å
9QFG Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1, strand boundary 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 J 1–182（182 aa）
链 K 1–182（182 aa）
链 L 1–182（182 aa）
链 M 1–182（182 aa）
链 N 1–182（182 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.49 Å
9QFK Cryo-EM structure of the Coronin-1B-decorated actin filament bound by one Cofilin-1 molecule (crosslinked) 提交 2025-03-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric
链 H 1–182（182 aa）
链 I 1–182（182 aa）
链 K 1–182（182 aa）
链 L 1–182（182 aa）
链 M 1–182（182 aa）
链 N 1–182（182 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.99 Å
9QFQ Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by AIP1 提交 2025-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric
链 P 1–182（182 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.76 Å
9QFW Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by two AIP1 molecules 提交 2025-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 P 1–182（182 aa）
链 Q 1–182（182 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.16 Å
9TAY Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a di-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 T 1–182（182 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.50 Å

共 21 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MGMT_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–184； UniProt 2–184

Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1

Homo sapiens

UniProt Q8NCM8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2–4307 未记录 Cytoplasmic dynein 2 intermediate chain 1 × 1 （Q8WVS4） Cytoplasmic dynein 2 intermediate chain 2 × 1 （Q96EX3） Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1 × 1 （Q8TCX1） Dynein light chain roadblock-type 1 × 2 （Q9NP97） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RGH Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4RH7 Crystal structure of human cytoplasmic dynein 2 motor domain in complex with ADP.Vi 提交 2014-10-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1091–4307（3217 aa）
未记录 AOV ADP ORTHOVANADATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；mixing equal volumes of protein (8mg/ml) and reservoir solution (4-6 % PEG 6000 and 0.1 M Tris pH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 3.41 Å R-free 0.285
8RGG Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I2 (WDR34) in complex with dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 2–4307（4306 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DYHC2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 208–4513； UniProt 2–4307

Cytoplasmic dynein 2 intermediate chain 1

Homo sapiens

UniProt Q8WVS4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–1066 未记录 Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1 × 1 （P16455,Q8NCM8） Cytoplasmic dynein 2 intermediate chain 2 × 1 （Q96EX3） Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1 × 1 （Q8TCX1） Dynein light chain roadblock-type 1 × 2 （Q9NP97） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RGH Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6RLB Structure of the dynein-2 complex; tail domain 提交 2019-05-01 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–1066（1066 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6SC2 Structure of the dynein-2 complex; IFT-train bound model 提交 2019-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–1066（1066 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8RGG Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I2 (WDR34) in complex with dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–1066（1066 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DC2I1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–1066； UniProt 1–1066

Cytoplasmic dynein 2 intermediate chain 2

Homo sapiens

UniProt Q96EX3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–536 未记录 Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1 × 1 （P16455,Q8NCM8） Cytoplasmic dynein 2 intermediate chain 1 × 1 （Q8WVS4） Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1 × 1 （Q8TCX1） Dynein light chain roadblock-type 1 × 2 （Q9NP97） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RGH Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6RLB Structure of the dynein-2 complex; tail domain 提交 2019-05-01 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–536（536 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6SC2 Structure of the dynein-2 complex; IFT-train bound model 提交 2019-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–536（536 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8RGG Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I2 (WDR34) in complex with dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–536（536 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DC2I2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–536； UniProt 1–536

Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1

Homo sapiens

UniProt Q8TCX1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 1–351 未记录 Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1 × 1 （P16455,Q8NCM8） Cytoplasmic dynein 2 intermediate chain 1 × 1 （Q8WVS4） Cytoplasmic dynein 2 intermediate chain 2 × 1 （Q96EX3） Dynein light chain roadblock-type 1 × 2 （Q9NP97） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RGH Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6RLB Structure of the dynein-2 complex; tail domain 提交 2019-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–351（351 aa）
链 F 1–351（351 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6SC2 Structure of the dynein-2 complex; IFT-train bound model 提交 2019-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–351（351 aa）
链 F 1–351（351 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DC2L1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351

Dynein light chain roadblock-type 1

Homo sapiens

UniProt Q9NP97

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 1–96 链 H； UniProt 1–96 未记录 Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase,Cytoplasmic dynein 2 heavy chain 1 × 1 （P16455,Q8NCM8） Cytoplasmic dynein 2 intermediate chain 1 × 1 （Q8WVS4） Cytoplasmic dynein 2 intermediate chain 2 × 1 （Q96EX3） Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1 × 1 （Q8TCX1） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RGH Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1Z09 Solution structure of km23 提交 2005-03-01 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–96（96 aa） 片段：LC7 Dynein Light Chain KM23
链 B 1–96（96 aa） 片段：LC7 Dynein Light Chain KM23
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；315 K；离子强度（mmCIF原始值）0 M NaCl；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM 15N_Km23; 25 mM Sodium Acetate; pH 6.0; 95 % H2O; 5 % D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1 mM 13C,15N_Km23; 25 mM Sodium Acetate; pH 6.0; 95 % H2O; 5 % D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2B95 Solution NMR structure of protein dynein light chain 2A, cytoplasmic; Northeast structural genomics consortium TARGET HR2106 提交 2005-10-10 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 0–95（96 aa）
链 B 0–95（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 1.3mM DYNEIN LIGHT CHAIN 2A, U-15N, 13C, 50 mM MES, 95% H2O, 5% D2O, 0.02% NaN3, pH 6.0 | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2E8J Solution structure of dynein light chain 2A 提交 2007-01-21 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–96（96 aa）
链 B 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 0.6mM DL2A U-15, 13C; 20mM phosphate buffer NA; 20mM NaCl; 0.1mM EDTA; 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.6mM DL2A U-15, 13C; 20mM phosphate buffer NA; 20mM NaCl; 0.1mM EDTA; 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2HZ5 Crystal structure of human dynein light chain Dnlc2A 提交 2006-08-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 0–95（96 aa）
链 B 0–95（96 aa）
未记录 CS CESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；298 K；28% PEG 4000, 0.1M CeCl, 0.1M Tris, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
2HZ5 Crystal structure of human dynein light chain Dnlc2A 提交 2006-08-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 0–95（96 aa）
链 B 0–95（96 aa）
未记录 CS CESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；298 K；28% PEG 4000, 0.1M CeCl, 0.1M Tris, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6F1T Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and BICDR1 提交 2017-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric
链 k 1–96（96 aa）
链 l 1–96（96 aa）
链 s 1–96（96 aa）
链 t 1–96（96 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6F1Z Roadblock-1 region of the dynein tail/dynactin/BICDR1 complex 提交 2017-11-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 s 1–96（96 aa）
链 t 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6F38 Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and HOOK3 提交 2017-11-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric
链 k 1–96（96 aa）
链 l 1–96（96 aa）
链 s 1–96（96 aa）
链 t 1–96（96 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6F3A Cryo-EM structure of a single dynein tail domain bound to dynactin and BICD2N 提交 2017-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 k 1–96（96 aa）
链 l 1–96（96 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
6RLB Structure of the dynein-2 complex; tail domain 提交 2019-05-01 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–96（96 aa）
链 H 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6SC2 Structure of the dynein-2 complex; IFT-train bound model 提交 2019-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–96（96 aa）
链 H 1–96（96 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7Z8F Composite structure of dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2022-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：43-meric
链 k 1–96（96 aa）
链 l 1–96（96 aa）
链 s 1–96（96 aa）
链 t 1–96（96 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ZN ZINC ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；20 second incubation
分辨率 20.00 Å
8J07 96nm repeat of human respiratory doublet microtubule and associated axonemal complexes 提交 2023-04-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 974 PDB 声明：974-meric
链 k4 1–96（96 aa）
链 m4 1–96（96 aa）
链 o4 1–96（96 aa）
链 q4 1–96（96 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 285 MG MAGNESIUM ION × 285 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 289 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8PR1 Cytoplasmic dynein-B heavy chain bound to IC-LC tower 提交 2023-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 s 1–96（96 aa）
链 t 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
8PTK Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1 提交 2023-07-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：53-meric
链 s 1–96（96 aa）
链 t 1–96（96 aa）
链 w 1–96（96 aa）
链 z 1–96（96 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
8RGG Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I2 (WDR34) in complex with dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–96（96 aa）
链 H 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9BLY Composite structure of full-length human dynein-1 in phi-particle conformation 提交 2024-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 G 1–96（96 aa）
链 H 1–96（96 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9E12 Full-length human dynein-1 in phi comformation under Lis1 condition 提交 2024-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 G 1–96（96 aa）
链 H 1–96（96 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
9E13 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Lis1 condition 提交 2024-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–96（96 aa）
链 H 1–96（96 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
9E14 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Nde1-Lis1 condition 提交 2024-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–96（96 aa）
链 H 1–96（96 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9E23 Cryo-EM structure of Pre-Chi dynein tail 提交 2024-10-21 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 E 1–96（96 aa）
链 F 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.20 Å
9E28 Cryo-EM structure of Phi dynein tail 提交 2024-10-21 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric
链 E 1–96（96 aa）
链 F 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.40 Å
9HHL Structure of Dynein-Dynactin-NuMA-LIS1 提交 2024-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：41-meric
链 s 1–96（96 aa）
链 t 1–96（96 aa）
链 w 1–96（96 aa）
链 z 1–96（96 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.53 Å
9YNH Full-length human cytoplasmic dynein-1 in phi-like state bound to dynactin-p150glued and LIS1 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 G 1–96（96 aa）
链 H 1–96（96 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 23 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DLRB1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–96； UniProt 1–96 作者链 H； PDB构建体 1–96； UniProt 1–96

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8rgh

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8rgh
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8rgh
沉积日期 deposition_date2023-12-13
结构标题 titleStructure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I1 (WDR60) in complex with the dynein-2 heavy chain DYNC2H1.
关键词 keywordsdynein, cilia, intraflagellar transport, complex, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier37.88 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron37.27 Å
零角强度 I(0) i0294571000.00
分子量 molecular_weight137100.0 kDa
排除体积 excluded_volume170740 ų
包络体积 envelope_volume239540 ų
水化壳体积 shell_volume53951 ų
包络直径 envelope_diameter130.2 Å
壳层 Rg shell_rg42.97 Å
包络 Rg envelope_rg37.15 Å
形状 Rg shape_rg37.29 Å
总 Rg total_rg37.58 Å
总原子数 total_atoms9682
残基数 n_residues1287
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax125.8 Å
Rg (实空间) rg_real37.89 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.28 Å
I(0) (实空间) i0_real2.9460e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.8590e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal37.89 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal294600000.0000
解质量估计 total_estimate0.8832
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary41.9 Å
偏度 Skewness skewness0.355
峰度 Kurtosis kurtosis-0.369
角度范围 angular_range— – 0.2100 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha36900000.0000
实空间数据点数 n_real_points43
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.869; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.872
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)