9g8r

human SKI7-SKI238 complex in the open state

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 164.9 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Superkiller complex protein 3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–1564	未记录	WD repeat-containing protein 61 × 2 （Q9GZS3） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） Superkiller complex protein 2 × 1 （Q15477）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9G8R	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7QDR Apo human SKI complex in the closed state 提交 2021-11-29	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–1564（1564 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7QDS Apo human SKI complex in the open state 提交 2021-11-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–1564（1564 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7QDY RNA-bound human SKI complex 提交 2021-12-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 B 1–1564（1564 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7QDZ 80S-bound human SKI complex in the closed state 提交 2021-12-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 B 1–1564（1564 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 B 1–1564（1564 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8Q 40S-bound human SKI238 complex in the open state (Gatekeeping module) 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–1564（1564 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.10 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SKI3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 5–1568； UniProt 1–1564

WD repeat-containing protein 61

Homo sapiens

UniProt Q9GZS3

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–305 链 D； UniProt 1–305	未记录	Superkiller complex protein 3 × 1 （Q6PGP7） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450） Superkiller complex protein 2 × 1 （Q15477）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8R	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3OW8 Crystal Structure of the WD repeat-containing protein 61 提交 2010-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–305（304 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Mix 0.5uL precipitant (6% PEG20000, 8% PEG-MME550, 0.2M calcium acetate), 0.5uL protein stock solution (11 mg/mL protein), 0.2 uL additive (5% w/v polyvinylpyrrolidine K15), vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
3OW8 Crystal Structure of the WD repeat-containing protein 61 提交 2010-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–305（304 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Mix 0.5uL precipitant (6% PEG20000, 8% PEG-MME550, 0.2M calcium acetate), 0.5uL protein stock solution (11 mg/mL protein), 0.2 uL additive (5% w/v polyvinylpyrrolidine K15), vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
3OW8 Crystal Structure of the WD repeat-containing protein 61 提交 2010-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 2–305（304 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Mix 0.5uL precipitant (6% PEG20000, 8% PEG-MME550, 0.2M calcium acetate), 0.5uL protein stock solution (11 mg/mL protein), 0.2 uL additive (5% w/v polyvinylpyrrolidine K15), vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
3OW8 Crystal Structure of the WD repeat-containing protein 61 提交 2010-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 2–305（304 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Mix 0.5uL precipitant (6% PEG20000, 8% PEG-MME550, 0.2M calcium acetate), 0.5uL protein stock solution (11 mg/mL protein), 0.2 uL additive (5% w/v polyvinylpyrrolidine K15), vapor diffusion, sitting drop, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
6GMH Structure of activated transcription complex Pol II-DSIF-PAF-SPT6 提交 2018-05-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：heptadecameric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10s wait prior to blotting, blotting 8.5s	分辨率 3.10 Å
6TED Structure of complete, activated transcription complex Pol II-DSIF-PAF-SPT6 uncovers allosteric elongation activation by RTF1 提交 2019-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2 microliters applied to both sides of grid. Sample incubated on grid for 10s prior to blotting. Blotting for 8.5s.	分辨率 3.10 Å
7OOP Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA-PAF-SPT6 (Structure 3) 提交 2021-05-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric	链 Y 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7OPC Pol II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (Structure 4) 提交 2021-05-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：28-meric	链 Y 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7OPD Pol II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (Structure 5) 提交 2021-05-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：28-meric	链 Y 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7QDR Apo human SKI complex in the closed state 提交 2021-11-29	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–305（305 aa）链 D 1–305（305 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7QDS Apo human SKI complex in the open state 提交 2021-11-30	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–305（305 aa）链 D 1–305（305 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7QDY RNA-bound human SKI complex 提交 2021-12-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 C 1–305（305 aa）链 D 1–305（305 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7QDZ 80S-bound human SKI complex in the closed state 提交 2021-12-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 C 1–305（305 aa）链 D 1–305（305 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
7UNC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS complex with rewrapped nucleosome 提交 2022-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7UND Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-nucleosome complex (stalled at +38) 提交 2022-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8A3Y Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex 提交 2022-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9EGX RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-hexasome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGY RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EGZ RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9EH0 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9EH1 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 20 bp upstream 提交 2024-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 W 5–304（300 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9EH2 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-FACT nucleosome upstream 提交 2024-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 C 1–305（305 aa）链 D 1–305（305 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8Q 40S-bound human SKI238 complex in the open state (Gatekeeping module) 提交 2024-07-23	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–305（305 aa）链 D 1–305（305 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.10 Å
9HVQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-PAF-SPT6-RECQL5 complex 提交 2024-12-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.00 Å
9MLC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-ELOF1-LEDGF-nucleosome activated elongation complex Composite map T 提交 2024-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9RTT Activated Elongation Complex with IWS1 and ELOF1 提交 2025-07-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.01 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric	链 W 1–305（305 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.40 Å

共 27 个其他 PDB 条目、30 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	WDR61_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305 作者链 D； PDB构建体 1–305； UniProt 1–305

Isoform 2 of HBS1-like protein

Homo sapiens

UniProt Q9Y450

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 372–546	未记录	Superkiller complex protein 3 × 1 （Q6PGP7） WD repeat-containing protein 61 × 2 （Q9GZS3） Superkiller complex protein 2 × 1 （Q15477）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8R	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
10AY Cryo-EM structure of CRBN-DDB1 in complex with HBS1L and TNG961 提交 2026-01-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 478–684（207 aa）片段：domain 2 + domain 3 链 D 478–684（207 aa）片段：domain 2 + domain 3	未记录	A1C4S N-{6-[(3R)-2,6-dioxopiperidin-3-yl]naphthalen-1-yl}-N'-{2-[6-(trifluoromethyl)-1-benzothiophen-2-yl]propan-2-yl}urea × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；0.1 M HEPES (pH 7.5), 0.24 M sodium chloride, 3 mM TCEP, 0.2 % n-octylglucoside cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
11MR Cryo-EM structure of CRBN in complex with HBS1L and TNG-4857 (focused refinement) 提交 2026-03-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 478–684（207 aa）片段：domain 2 + domain 3 链 C 478–684（207 aa）片段：domain 2 + domain 3	未记录	ZN ZINC ION × 2 A1C9W N-[(3S)-2,6-dioxopiperidin-3-yl]-2-fluoro-3-[(2-{4-[1-(trifluoromethyl)cyclopropyl]phenyl}propan-2-yl)carbamamido]benzamide × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM HEPES (pH 7.5), 240 mM NaCl, 3 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric	链 jj 1–684（684 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.	分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric	链 jj 1–684（684 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.	分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric	链 jj 1–684（684 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.	分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric	链 jj 1–684（684 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.	分辨率 3.47 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 E 369–632（264 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8N 80S-bound human Ski2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 E 369–632（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 E 369–632（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 E 369–632（264 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HBS1L_HUMAN
Isoform	Q9Y450-2
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 5–179； UniProt 372–546

Superkiller complex protein 2

Homo sapiens

UniProt Q15477

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–774 链 A； UniProt 1049–1246	未记录	Superkiller complex protein 3 × 1 （Q6PGP7） WD repeat-containing protein 61 × 2 （Q9GZS3） Isoform 2 of HBS1-like protein × 1 （Q9Y450）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9G8R	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7QDR Apo human SKI complex in the closed state 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7QDS Apo human SKI complex in the open state 提交 2021-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
7QDY RNA-bound human SKI complex 提交 2021-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7QDZ 80S-bound human SKI complex in the closed state 提交 2021-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
7QE0 80S-bound human SKI complex in the open state 提交 2021-12-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.50 Å
9G8M human 80S ribosome bound by a SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 87 PDB 声明：92-meric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 232 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
9G8N 80S-bound human Ski2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9G8O human 40S ribosome bound by a SKI238-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
9G8P 40S-bound human SKI2-exosome complex 提交 2024-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：13-meric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å
9G8Q 40S-bound human SKI238 complex in the open state (Gatekeeping module) 提交 2024-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1246（1246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.10 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SKI2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–774； UniProt 1–774 作者链 A； PDB构建体 779–976； UniProt 1049–1246

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9g8r
沉积日期 deposition_date	2024-07-23
结构标题 title	human SKI7-SKI238 complex in the open state
关键词 keywords	Helicase, RNA-binding, RNA-degradation, cytoplasm, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	48.10 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	48.51 Å
零角强度 I(0) i0	641407000.00
分子量 molecular_weight	210690.0 kDa
排除体积 excluded_volume	264430 Å³
包络体积 envelope_volume	382700 Å³
水化壳体积 shell_volume	69613 Å³
包络直径 envelope_diameter	178.2 Å
壳层 Rg shell_rg	48.85 Å
包络 Rg envelope_rg	48.61 Å
形状 Rg shape_rg	48.48 Å
总 Rg total_rg	48.61 Å
总原子数 total_atoms	14837
残基数 n_residues	1900
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	164.9 Å
Rg (实空间) rg_real	48.58 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.63 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.4140e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.3010e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	48.11 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	641000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8237
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	55.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.602
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.012
角度范围 angular_range	— – 0.1650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	44570000.0000
实空间数据点数 n_real_points	34
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.767; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.979; Smooth: 0.424

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Superkiller complex protein 3
分子量 formula_weight	176064.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	14837

GPDSMSSKEVKTALKSARDAIRNKEYKEALKHCKTVLKQEKNNYNAWVFIGVAAAELEQPDQAQSAYKKAAELEPDQLLAWQGLANLYEKYNHINAKDDLPGVYQKLLDLYESVDKQKWCDVCKKLVDLYYQEKKHLEVARTWHKLIKTRQEQGAENEELHQLWRKLTQFLAESTEDQNNETQQLLFTAFENALGLSDKIPSEDHQVLYRHFIQSLSKFPHESARLKKACEGMINIYPTVQYPLEVLCLHLIESGNLTDEGQQYCCRLVEMDSKSGPGLIGLGIKALQDKKYEDAVRNLTEGLKESPVCTSGWYHLAEAQVKMHRPKEAVLSCSQALKIVDNLGASGNSLYQRNLCLHLKAEALIKLSDYDSSEEAIRTLDQISDADNIPGLLVLKSLAYRNKGSFDEAAKIMEDLLSSYPDLAEVHALEALIHFTKKDYLQAEKCFQRALEKDTEVAEYHYQLGLTYWFMGEETRKDKTKALTHFLKAARLDTYMGKVFCYLGHYYRDVVGDKNRARGCYRKAFELDDTDAESGAAAVDLSVELEDMEMALAILTTVTQKASAGTAKWAWLRRGLYYLKAGQHSQAVADLQAALRADPKDFNCWESLGEAYLSRGGYTTALKSFTKASELNPESIYSVFKVAAIQQILGKYKEAVAQYQMIIKKKEDYVPALKGLGECHLMMAKAALVDYLDGKAVDYIEKALEYFTCALQHRADVSCLWKLAGDACTCLYAVAPSKVNVHVLGVLLGQKEGKQVLKKNELLHLGGRCYGRALKLMSTSNTWCDLGINYYRQAQHLAETGSNMNDLKELLEKSLHCLKKAVRLDSNNHLYWNALGVVACYSGIGNYALAQHCFIKSIQSEQINAVAWTNLGVLYLTNENIEQAHEAFKMAQSLDPSYLMCWIGQALIAEAVGSYDTMDLFRHTTELNMHTEGALGYAYWVCTTLQDKSNRETELYQYNILQMNAIPAAQVILNKYVERIQNYAPAFTMLGYLNEHLQLKKEAANAYQRAILLLQTAEDQDTYNVAIRNYGRLLCSTGEYDKAIQAFKSTPLEVLEDIIGFALALFMKGLYKESSKAYERALSIVESEQDKAHILTALAITEYKQGKTDVAKTLLFKCSILKEPTTESLQALCALGLAMQDATLSKAALNELLKHIKHKDSNYQRCLLTSAIYALQGRSVAVQKQISKAVHSNPGDPALWSLLSRVVAQYAQRNAKGGVVAGNVAHILDSNHGKKALLYTAVNQLAMGSSSAEDEKNTALKTIQKAALLSPGDPAIWAGLMAACHADDKLALVNNTQPKRIDLYLALLSAVSASIKDEKFFENYNQSLEKWSLSQAVTGLIDTGRISEAETLCTKNLKSNPDQPAVILLLRQVQCKPLLESQKPLPDAVLEELQKTVMSNSTSVPAWQWLAHVYQSQGMMRAAEMCYRKSLQLASQRGSWSGKLSSLLRLALLALKVCMANISNDHWPSLVQEATTEALKLCFCPLAVLLQALLQFKRKMGARETRRLLERVVYQPGYPKSIASTARWYLLRHLYAKDDYELIDVLVNNAKTHGDTRALELNQRLSSQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	WD repeat-containing protein 61
分子量 formula_weight	33617.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MTNQYGILFKQEQAHDDAIWSVAWGTNKKENSETVVTGSLDDLVKVWKWRDERLDLQWSLEGHQLGVVSVDISHTLPIAASSSLDAHIRLWDLENGKQIKSIDAGPVDAWTLAFSPDSQYLATGTHVGKVNIFGVESGKKEYSLDTRGKFILSIAYSPDGKYLASGAIDGIINIFDIATGKLLHTLEGHAMPIRSLTFSPDSQLLVTASDDGYIKIYDVQHANLAGTLSGHASWVLNVAFCPDDTHFVSSSSDKSVKVWDVGTRTCVHTFFDHQDQVWGVKYNGNGSKIVSVGDDQEIHIYDCPI

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Isoform 2 of HBS1-like protein
分子量 formula_weight	19333.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.5.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

GPDSESPSLTELFQEHKENNISQCFTLSDLCNQSSASFTDLSLGSFPLSQLANRCQSSPGISELTGSLSSLAFHKASPTRDLENLSLSELIAETIDVDNSQIKKESFEVSLSEVRSPGIDSNIDLSVLIKNPDFVPKPVVDPSIAPSSRTKVLSSKLGKNSNFAKDNKKNNKGSLTRKP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Superkiller complex protein 2
分子量 formula_weight	107617.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.13
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MMETERLVLPPPDPLDLPLRAVELGCTGHWELLNLPGAPESSLPHGLPPCAPDLQQEAEQLFLSSPAWLPLHGVEHSARKWQRKTDPWSLLAVLGAPVPSDLQAQRHPTTGQILGYKEVLLENTNLSATTSLSLRRPPGPASQSLWGNPTQYPFWPGGMDEPTITDLNTREEAEEEIDFEKDLLTIPPGFKKGMDFAPKDCPTPAPGLLSLSCMLEPLDLGGGDEDENEAVGQPGGPRGDTVSASPCSAPLARASSLEDLVLKEASTAVSTPEAPEPPSQEQWAIPVDATSPVGDFYRLIPQPAFQWAFEPDVFQKQAILHLERHDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAQKHMTRTIYTSPIKALSNQKFRDFRNTFGDVGLLTGDVQLHPEASCLIMTTEILRSMLYSGSDVIRDLEWVIFDEVHYINDVERGVVWEEVLIMLPDHVSIILLSATVPNALEFADWIGRLKRRQIYVISTVTRPVPLEHYLFTGNSSKTQGELFLLLDSRGAFHTKGYYAAVEAKKERMSKHAQTFGAKQPTHQGGPAQDRGVYLSLLASLRTRAQLPVVVFTFSRGRCDEQASGLTSLDLTTSSEKSEIHLFLQRCLARLRGSDRQLPQVLHMSELLNRGLGVHHSGILPILKEIVEMLFSRGLVKVLFATETFAMGVNMPARTVVFDSMRKHDGSTFRDLLPGEYVQMAGRAGRRGLDPTGTVILLCKGRVPEMADLHRMMMGKPSQLQSQFRLTYTMILNLLRVDALRVEDMMKRSFSEFPGSRGLLLLPEYHQRVEVLRTLGYVDEAGTVKLAGRVACAMSSHELLLTELMFDNALSTLRPEEIAALLSGLVCQSPGDAGDQLPNTLKQGIERVRAVAKRIGEVQVACGLNQTVEEFVGELNFGLVEVVYEWARGMPFSELAGLSGTPEGLVVRCIQRLAEMCRSLRGAARLVGEPVLGAKMETAATLLRRDIVFAASLYTQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	151860

fit	/app/data/saxs_computation/g8/9g8r/9g8r.fit
pddf	/app/data/pr_computation/g8/9g8r/9g8r.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/g8/9g8r/9g8r.dat

human SKI7-SKI238 complex in the open state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Superkiller complex protein 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

WD repeat-containing protein 61

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Isoform 2 of HBS1-like protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Superkiller complex protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)