9i6x

14-3-3sigma binding to the ERa peptide and compound 42

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 67.8 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

14-3-3 protein sigma

Homo sapiens

UniProt P31947

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–231 未记录 Estrogen receptor × 2 (P03372) A1I0U 2-chloranyl-~{N}-[4-[6-chloranyl-3-[(2,6-dimethylphenyl)amino]imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl]-3-fluoranyl-phenyl]ethanamide × 2 CA CALCIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400 分辨率 1.30 Å R-free 0.163

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 523 个其他 PDB 条目、543 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 1433S_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 6–236; UniProt 1–231

Estrogen receptor

物种未注明

UniProt P03372

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 591–595 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 14-3-3 protein sigma × 2 (P31947) A1I0U 2-chloranyl-~{N}-[4-[6-chloranyl-3-[(2,6-dimethylphenyl)amino]imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl]-3-fluoranyl-phenyl]ethanamide × 2 CA CALCIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400 分辨率 1.30 Å R-free 0.163

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 434 个其他 PDB 条目、522 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ESR1_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–5; UniProt 591–595

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9i6x

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9i6x
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9i6x
沉积日期 deposition_date2025-01-31
最后修订 last_revision2025-07-30
结构标题 title14-3-3sigma binding to the ERa peptide and compound 42
关键词 keywords14-3-3, protein-protein interactions, stabilization, PEPTIDE BINDING PROTEIN; PEPTIDE BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier20.23
回转半径 Rg (电子) rg_electron19.39
零角强度 I(0) i026180500.00
分子量 molecular_weight25823.0 kDa
排除体积 excluded_volume24761 ų
包络体积 envelope_volume41513 ų
水化壳体积 shell_volume18326 ų
包络直径 envelope_diameter70.3
壳层 Rg shell_rg25.42
包络 Rg envelope_rg19.95
形状 Rg shape_rg19.31
总 Rg total_rg20.15
总原子数 total_atoms1934
残基数 n_residues240
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax67.8
Rg (实空间) rg_real20.21
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.52
I(0) (实空间) i0_real2.6180e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.1680e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal20.21
I(0) (倒空间) i0_reciprocal26180000.0000
解质量估计 total_estimate0.8099
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary24.2
偏度 Skewness skewness0.334
峰度 Kurtosis kurtosis-0.252
角度范围 angular_range— – 0.3950 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha4502000.0000
实空间数据点数 n_real_points71
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.845; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.991; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)