9pd4

NER dual incision complex - DuIM

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit

Homo sapiens

UniProt P19447

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ERCC3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–782； UniProt 1–782

General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD

Homo sapiens

UniProt P18074

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ERCC2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–760； UniProt 1–760

General transcription factor IIH subunit 1

Homo sapiens

UniProt P32780

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TF2H1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–548； UniProt 1–548

General transcription factor IIH subunit 4, p52

Homo sapiens

UniProt Q92759

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TF2H4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–462； UniProt 1–462

General transcription factor IIH subunit 2

Homo sapiens

UniProt Q13888

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TF2H2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–395； UniProt 1–395

General transcription factor IIH subunit 3

Homo sapiens

UniProt Q13889

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TF2H3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–308； UniProt 1–308

General transcription factor IIH subunit 5

Homo sapiens

UniProt Q6ZYL4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TF2H5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–71； UniProt 1–71

DNA repair protein complementing XP-A cells

Homo sapiens

UniProt P23025

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	XPA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–273； UniProt 1–273

Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit

Homo sapiens

UniProt P27694

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RFA1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–616； UniProt 1–616

Replication protein A 32 kDa subunit

Homo sapiens

UniProt P15927

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RFA2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–270； UniProt 1–270

Replication protein A 14 kDa subunit

Homo sapiens

UniProt P35244

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RFA3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–121； UniProt 1–121

DNA repair endonuclease XPF

Homo sapiens

UniProt Q92889

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	XPF_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–916； UniProt 1–916

DNA excision repair protein ERCC-1

Homo sapiens

UniProt P07992

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-5 × 1 （P28715） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ERCC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–295； UniProt 1–295

DNA excision repair protein ERCC-5

Homo sapiens

UniProt P28715

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 14 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit × 1 （P19447） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4, p52 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） DNA repair protein complementing XP-A cells × 1 （P23025） DNA (Cy5) × 1 DNA × 1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） DNA repair endonuclease XPF × 1 （Q92889） DNA excision repair protein ERCC-1 × 1 （P07992） IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ERCC5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–1186； UniProt 1–1186

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9pd4
沉积日期 deposition_date	2025-06-30
结构标题 title	NER dual incision complex - DuIM
关键词 keywords	NER, XPA, XPG, XPF, DNA BINDING PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex; DNA BINDING PROTEIN/DNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9pd4__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9pd4__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9pd4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	63.79 Å
Rg（电子密度）	63.56 Å
总 Rg	63.60 Å
原子数	40038
残基数	4834
排除体积	709780 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9pd4__assembly_1__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit
分子量 formula_weight	89404.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	40053

MGKRDRADRDKKKSRKRHYEDEEDDEEDAPGNDPQEAVPSAAGKQVDESGTKVDEYGAKDYRLQMPLKDDHTSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVGLQTSDITEYLRKLSKTGVPDGIMQFIKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESCHPDVIQHLLQDPVIRECRLRNSEGEATELITETFTSKSAISKTAESSGGPSTSRVTDPQGKSDIPMDLFDFYEQMDKDEEEEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPTAVLRPYQEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWSTIDDSQICRFTSDAKDKPIGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPAKMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCPMSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKPYIYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRVLRAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEDLAFSTKEEQQQLLQKVLAATDLDAEEEVVAGEFGSRSSQASRRFGTMSSMSGADDTVYMEYHSSRSKAPSKHVHPLFKRFRK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD
分子量 formula_weight	88018.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MKLNVDGLLVYFPYDYIYPEQFSYMRELKRTLDAKGHGVLEMPSGTGKTVSLLALIMAYQRAYPLEVTKLIYCSRTVPEIEKVIEELRKLLNFYEKQEGEKLPFLGLALSSRKNLCIHPEVTPLRFGKDVDGKCHSLTASYVRAQYQHDTSLPHCRFYEEFDAHGREVPLPAGIYNLDDLKALGRRQGWCPYFLARYSILHANVVVYSYHYLLDPKIADLVSKELARKAVVVFDEAHNIDNVCIDSMSVNLTRRTLDRCQGNLETLQKTVLRIKETDEQRLRDEYRRLVEGLREASAARETDAHLANPVLPDEVLQEAVPGSIRTAEHFLGFLRRLLEYVKWRLRVQHVVQESPPAFLSGLAQRVCIQRKPLRFCAERLRSLLHTLEITDLADFSPLTLLANFATLVSTYAKGFTIIIEPFDDRTPTIANPILHFSCMDASLAIKPVFERFQSVIITSGTLSPLDIYPKILDFHPVTMATFTMTLARVCLCPMIIGRGNDQVAISSKFETREDIAVIRNYGNLLLEMSAVVPDGIVAFFTSYQYMESTVASWYEQGILENIQRNKLLFIETQDGAETSVALEKYQEACENGRGAILLSVARGKVSEGIDFVHHYGRAVIMFGVPYVYTQSRILKARLEYLRDQFQIRENDFLTFDAMRHAAQCVGRAIRGKTDYGLMVFADKRFARGDKRGKLPRWIQEHLTDANLNLTVDEGVQVAKYFLRQMAQPFHREDQLGLSLLSLEQLESEETLKRIEQIAQQLDYKDDDDK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	General transcription factor IIH subunit 1
分子量 formula_weight	62116.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MATSSEEVLLIVKKVRQKKQDGALYLMAERIAWAPEGKDRFTISHMYADIKCQKISPEGKAKIQLQLVLHAGDTTNFHFSNESTAVKERDAVKDLLQQLLPKFKRKANKELEEKNRMLQEDPVLFQLYKDLVVSQVISAEEFWANRLNVNATDSSSTSNHKQDVGISAAFLADVRPQTDGCNGLRYNLTSDIIESIFRTYPAVKMKYAENVPHNMTEKEFWTRFFQSHYFHRDRLNTGSKDLFAECAKIDEKGLKTMVSLGVKNPLLDLTALEDKPLDEGYGISSVPSASNSKSIKENSNAAIIKRFNHHSAMVLAAGLRKQEAQNEQTSEPSNMDGNSGDADCFQPAVKRAKLQESIEYEDLGKNNSVKTIALNLKKSDRYYHGPTPIQSLQYATSQDIINSFQSIRQEMEAYTPKLTQVLSSSAASSTITALSPGGALMQGGTQQAINQMVPNDIQSELKHLYVAVGELLRHFWSCFPVNTPFLEEKVVKMKSNLERFQVTKLCPFQEKIRRQYLSTNLVSHIEEMLQTAYNKLHTWQSRRLMKKT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	General transcription factor IIH subunit 4, p52
分子量 formula_weight	52245.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MESTPSRGLNRVHLQCRNLQEFLGGLSPGVLDRLYGHPATCLAVFRELPSLAKNWVMRMLFLEQPLPQAAVALWVKKEFSKAQEESTGLLSGLRIWHTQLLPGGLQGLILNPIFRQNLRIALLGGGKAWSDDTSQLGPDKHARDVPSLDKYAEERWEVVLHFMVGSPSAAVSQDLAQLLSQAGLMKSTEPGEPPCITSAGFQFLLLDTPAQLWYFMLQYLQTAQSRGMDLVEILSFLFQLSFSTLGKDYSVEGMSDSLLNFLQHLREFGLVFQRKRKSRRYYPTRLAINLSSGVSGAGGTVHQPGFIVVETNYRLYAYTESELQIALIALFSEMLYRFPNMVVAQVTRESVQQAIASGITAQQIIHFLRTRAHPVMLKQTPVLPPTITDQIRLWELERDRLRFTEGVLYNQFLSQVDFELLLAHARELGVLVFENSAKRLMVVTPAGHSDVKRFWKRQKHSS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	General transcription factor IIH subunit 2
分子量 formula_weight	44482.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MDEEPERTKRWEGGYERTWEILKEDESGSLKATIEDILFKAKRKRVFEHHGQVRLGMMRHLYVVVDGSRTMEDQDLKPNRLTCTLKLLEYFVEEYFDQNPISQIGIIVTKSKRAEKLTELSGNPRKHITSLKKAVDMTCHGEPSLYNSLSIAMQTLKHMPGHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLIKTLKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTVLARETGGTYHVILDESHYKELLTHHVSPPPASSSSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMAHLDGNTEPGLTLGGYFCPQCRAKYCELPVECKICGLTLVSAPHLARSYHHLFPLDAFQEIPLEEYNGERFCYGCQGELKDQHVYVCAVCQNVFCVDCDVFVHDSLHCCPGCIHKIPAPSGV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	General transcription factor IIH subunit 3
分子量 formula_weight	34416.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MVSDEDELNLLVIVVDANPIWWGKQALKESQFTLSKCIDAVMVLGNSHLFMNRSNKLAVIASHIQESRFLYPGKNGRLGDFFGDPGNPPEFNPSGSKDGKYELLTSANEVIVEEIKDLMTKSDIKGQHTETLLAGSLAKALCYIHRMNKEVKDNQEMKSRILVIKAAEDSALQYMNFMNVIFAAQKQNILIDACVLDSDSGLLQQACDITGGLYLKVPQMPSLLQYLLWVFLPDQDQRSQLILPPPVHVDYRAACFCHRNLIEIGYVCSVCLSIFCNFSPICTTCETAFKISLPPVLKAKKKKLKVSA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	General transcription factor IIH subunit 5
分子量 formula_weight	8060.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MVNVLKGVLIECDPAMKQFLLYLDESNALGKKFIIQDIDDTHVFVIAELVNVLQERVGELMDQNAFSLTQK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA repair protein complementing XP-A cells
分子量 formula_weight	31422.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MAAADGALPEAAALEQPAELPASVRASIERKRQRALMLRQARLAARPYSATAAAATGGMANVKAAPKIIDTGGGFILEEEEEEEQKIGKVVHQPGPVMEFDYVICEECGKEFMDSYLMNHFDLPTCDNCRDADDKHKLITKTEAKQEYLLKDCDLEKREPPLKFIVKKNPHHSQWGDMKLYLKLQIVKRSLEVWGSQEALEEAKEVRQENREKMKQKKFDKKVKELRRAVRSSVWKRETIVHQHEYGPEENLEDDMYRKTCTMCGHELTYEKM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA (Cy5)
分子量 formula_weight	28705.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	L

GCTGCGGTCCGTTGACGACATACAGCTCAACGATGCCACTTCAGCATTGCACTCATGTTCTGXCACTAGTACTACGACTACGCCTCGGCTCGA

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DNA
分子量 formula_weight	29180.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	M

TCGAGCCGAGGCGTAGTCGTAGTACTAGTGTTCAGAATATGAGTACAATACTGAAGTGGCATCGTTGAGCTGTATGTCGTCAACGGACCGCAGC

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit
分子量 formula_weight	68213.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MVGQLSEGAIAAIMQKGDTNIKPILQVINIRPITTGNSPPRYRLLMSDGLNTLSSFMLATQLNPLVEEEQLSSNCVCQIHRFIVNTLKDGRRVVILMELEVLKSAEAVGVKIGNPVPYNEGLGQPQVAPPAPAASPAASSRPQPQNGSSGMGSTVSKAYGASKTFGKAAGPSLSHTSGGTQSKVVPIASLTPYQSKWTICARVTNKSQIRTWSNSRGEGKLFSLELVDESGEIRATAFNEQVDKFFPLIEVNKVYYFSKGTLKIANKQFTAVKNDYEMTFNNETSVMPCEDDHHLPTVQFDFTGIDDLENKSKDSLVDIIGICKSYEDATKITVRSNNREVAKRNIYLMDTSGKVVTATLWGEDADKFDGSRQPVLAIKGARVSDFGGRSLSVLSSSTIIANPDIPEAYKLRGWFDAEGQALDGVSISDLKSGGVGGSNTNWKTLYEVKSENLGQGDKPDYFSSVATVVYLRKENCMYQACPTQDCNKKVIDQQNGLYRCEKCDTEFPNFKYRMILSVNIADFQENQWVTCFQESAEAILGQNAAYLGELKDKNEQAFEEVFQNANFRSFIFRVRVKVETYNDESRIKATVMDVKPVDYREYGRRLVMSIRRSALM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Replication protein A 32 kDa subunit
分子量 formula_weight	29276.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MWNSGFESYGSSSYGGAGGYTQSPGGFGSPAPSQAEKKSRARAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFRIGNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDTSSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQNKKSLVAFKIMPLEDMNEFTTHILEVINAHMVLSKANSQPSAGRAPISNPGMSEAGNFGGNSFMPANGLTVAQNQVLNLIKACPRPEGLNFQDLKNQLKHMSVSSIKQAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFKSTDAE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Replication protein A 14 kDa subunit
分子量 formula_weight	13583.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MVDMMDLPRSRINAGMLAQFIDKPVCFVGRLEKIHPTGKMFILSDGEGKNGTIELMEPLDEEISGIVEVVGRVTAKATILCTSYVQFKEDSHPFDLGLYNEAVKIIHDFPQFYPLGIVQHD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	DNA repair endonuclease XPF
分子量 formula_weight	104694.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.-.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MESGQPARRIAMAPLLEYERQLVLELLDTDGLVVCARGLGADRLLYHFLQLHCHPACLVLVLNTQPAEEEYFINQLKIEGVEHLPRRVTNEITSNSRYEVYTQGGVIFATSRILVVDFLTDRIPSDLITGILVYRAHRIIESCQEAFILRLFRQKNKRGFIKAFTDNAVAFDTGFCHVERVMRNLFVRKLYLWPRFHVAVNSFLEQHKPEVVEIHVSMTPTMLAIQTAILDILNACLKELKCHNPSLEVEDLSLENAIGKPFDKTIRHYLDPLWHQLGAKTKSLVQDLKILRTLLQYLSQYDCVTFLNLLESLRATEKAFGQNSGWLFLDSSTSMFINARARVYHLPDAKMSKKEKISEKMEIKEGEETKKELVLESNPKWEALTEVLKEIEAENKESEALGGPGQVLICASDDRTCSQLRDYITLGAEAFLLRLYRKTFEKDSKAEEVWMKFRKEDSSKRIRKSHKRPKDPQNKERASTKERTLKKKKRKLTLTQMVGKPEELEEEGDVEEGYRREISSSPESCPEEIKHEEFDVNLSSDAAFGILKEPLTIIHPLLGCSDPYALTRVLHEVEPRYVVLYDAELTFVRQLEIYRASRPGKPLRVYFLIYGGSTEEQRYLTALRKEKEAFEKLIREKASMVVPEEREGRDETNLDLVRGTASADVSTDTRKAGGQEQNGTQQSIVVDMREFRSELPSLIHRRDIDIEPVTLEVGDYILTPEMCVERKSISDLIGSLNNGRLYSQCISMSRYYKRPVLLIEFDPSKPFSLTSRGALFQEISSNDISSKLTLLTLHFPRLRILWCPSPHATAELFEELKQSKPQPDAATALAITADSETLPESEKYNPGPQDFLLKMPGVNAKNCRSLMHHVKNIAELAALSQDELTSILGNAANAKQLYDFIHTSFAEVVSKGKGKK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	DNA excision repair protein ERCC-1
分子量 formula_weight	32402.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MDPGKDKEGVPQPSGPPARKKFVIPLDEDEVPPGVAKPLFRSTQSLPTVDTSAQAAPQTYAEYAISQPLEGAGATCPTGSEPLAGETPNQALKPGAKSNSIIVSPRQRGNPVLKFVRNVPWEFGDVIPDYVLGQSTCALFLSLRYHNLHPDYIHGRLQSLGKNFALRVLLVQVDVKDPQQALKELAKMCILADCTLILAWSPEEAGRYLETYKAYEQKPADLLMEKLEQDFVSRVTECLTTVKSVNKTDSQTLLTTFGSLEQLIAASREDLALCPGLGPQKARRLFDVLHEPFLK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	DNA excision repair protein ERCC-5
分子量 formula_weight	133489.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.-.-
突变 mutation	D812N
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MGVQGLWKLLECSGRQVSPEALEGKILAVDISIWLNQALKGVRDRHGNSIENPHLLTLFHRLCKLLFFRIRPIFVFDGDAPLLKKQTLVKRRQRKDLASSDSRKTTEKLLKTFLKRQAIKTAFRSKRDEALPSLTQVRRENDLYVLPPLQEEEKHSSEEEDEKEWQERMNQKQALQEEFFHNPQAIDIESEDFSSLPPEVKHEILTDMKEFTKRRRTLFEAMPEESDDFSQYQLKGLLKKNYLNQHIEHVQKEMNQQHSGHIRRQYEDEGGFLKEVESRRVVSEDTSHYILIKGIQAKTVAEVDSESLPSSSKMHGMSFDVKSSPCEKLKTEKEPDATPPSPRTLLAMQAALLGSSSEEELESENRRQARGRNAPAAVDEGSISPRTLSAIKRALDDDEDVKVCAGDDVQTGGPGAEEMRINSSTENSDEGLKVRDGKGIPFTATLASSSVNSAEEHVASTNEGREPTDSVPKEQMSLVHVGTEAFPISDESMIKDRKDRLPLESAVVRHSDAPGLPNGRELTPASPTCTNSVSKNETHAEVLEQQNELCPYESKFDSSLLSSDDETKCKPNSASEVIGPVSLQETSSIVSVPSEAVDNVENVVSFNAKEHENFLETIQEQQTTESAGQDLISIPKAVEPMEIDSEESESDGSFIEVQSVISDEELQAEFPETSKPPSEQGEEELVGTREGEAPAESESLLRDNSERDDVDGEPQEAEKDAEDSLHEWQDINLEELETLESNLLAQQNSLKAQKQQQERIAATVTGQMFLESQELLRLFGIPYIQAPMEAEAQCAILDLTDQTSGTITDDSNIWLFGARHVYRNFFNKNKFVEYYQYVDFHNQLGLDRNKLINLAYLLGSDYTEGIPTVGCVTAMEILNEFPGHGLEPLLKFSEWWHEAQKNPKIRPNPHDTKVKKKLRTLQLTPGFPNPAVAEAYLKPVVDDSKGSFLWGKPDLDKIREFCQRYFGWNRTKTDESLFPVLKQLDAQQTQLRIDSFFRLAQQEKEDAKRIKSQRLNRAVTCMLRKEKEAAASEIEAVSVAMEKEFELLDKAKRKTQKRGITNTLEESSSLKRKRLSDSKRKNTCGGFLGETCLSESSDGSSSEDAESSSLMNVQRRTAAKEPKTSASDSQNSVKEAPVKNGGATTSSSSDSDDDGGKEKMVLVTARSVFGKKRRKLRRARGRKRKT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.400 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	3.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	140332

NER dual incision complex - DuIM

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription factor IIH subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription factor IIH subunit 4, p52

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription factor IIH subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription factor IIH subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription factor IIH subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA repair protein complementing XP-A cells

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Replication protein A 32 kDa subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体