当前蛋白身份：F2Z5G5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5ADX CryoEM structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution 提交 2015-08-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 A
7–376（370 aa）
链 B
7–376（370 aa）
链 C
7–376（370 aa）
链 D
7–376（370 aa）
链 E
7–376（370 aa）
链 F
7–376（370 aa）
链 G
7–376（370 aa）
链 I
7–376（370 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
50MM KCL, 25MM K2HPO4- KH2PO4, 1MM MGCL2,5MM DTT；pH 6.5；50MM KCL, 25MM K2HPO4- KH2PO4, 1MM MGCL2,5MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ENTHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 5AFU Cryo-EM structure of dynein tail-dynactin-BICD2N complex 提交 2015-01-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric（33） 与蛋白数一致 |
链 A
7–376（370 aa）
链 B
7–376（370 aa）
链 C
7–376（370 aa）
链 D
7–376（370 aa）
链 E
7–376（370 aa）
链 F
7–376（370 aa）
链 G
7–376（370 aa）
链 I
7–376（370 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
150MM KCL, 25MM HEPES-KOH, 1MM MGCL2, 0.1MM MGATP, 5MM DTT；pH 7.4；150MM KCL, 25MM HEPES-KOH, 1MM MGCL2, 0.1MM MGATP, 5MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 5NW4 Human cytoplasmic dynein-1 bound to dynactin and an N-terminal construct of BICD2 提交 2017-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：39-meric（39） 与蛋白数一致 |
链 G
1–376（376 aa）
链 H
1–376（376 aa）
链 O
1–376（376 aa）
链 P
1–376（376 aa）
链 Q
1–376（376 aa）
链 T
1–376（376 aa）
链 U
1–376（376 aa）
链 W
1–376（376 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.70 Å |
| 6F1T Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and BICDR1 提交 2017-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric（45） 与蛋白数一致 |
链 A
1–376（376 aa）
链 B
1–376（376 aa）
链 C
1–376（376 aa）
链 D
1–376（376 aa）
链 E
1–376（376 aa）
链 F
1–376（376 aa）
链 G
1–376（376 aa）
链 I
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6F1U N terminal region of dynein tail domains in complex with dynactin filament and BICDR-1 提交 2017-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 B
1–376（376 aa）
链 D
1–376（376 aa）
链 F
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6F38 Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and HOOK3 提交 2017-11-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric（45） 与蛋白数一致 |
链 A
1–376（376 aa）
链 B
1–376（376 aa）
链 C
1–376（376 aa）
链 D
1–376（376 aa）
链 E
1–376（376 aa）
链 F
1–376（376 aa）
链 G
1–376（376 aa）
链 I
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.70 Å |
| 6F3A Cryo-EM structure of a single dynein tail domain bound to dynactin and BICD2N 提交 2017-11-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致 |
链 A
1–376（376 aa）
链 B
1–376（376 aa）
链 C
1–376（376 aa）
链 D
1–376（376 aa）
链 E
1–376（376 aa）
链 F
1–376（376 aa）
链 G
1–376（376 aa）
链 I
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 6ZNL Cryo-EM structure of the dynactin complex 提交 2020-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric（23） 与蛋白数一致 |
链 A
1–376（376 aa）
链 B
1–376（376 aa）
链 C
1–376（376 aa）
链 D
1–376（376 aa）
链 E
1–376（376 aa）
链 F
1–376（376 aa）
链 G
1–376（376 aa）
链 I
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6ZNM The pointed end complex of dynactin bound to BICDR1 提交 2020-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 G
1–376（376 aa）
链 I
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6ZNN The pointed end complex of dynactin bound to Hook3 提交 2020-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 G
1–376（376 aa）
链 I
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6ZNO The pointed end complex of dynactin with the p150 projection docked 提交 2020-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 G
1–376（376 aa）
链 I
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.80 Å |
| 6ZO4 The pointed end complex of dynactin bound to BICD2 提交 2020-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 G
1–376（376 aa）
链 I
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 7Z8F Composite structure of dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2022-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：43-meric（43） 与蛋白数一致 |
链 A
1–376（376 aa）
链 B
1–376（376 aa）
链 C
1–376（376 aa）
链 D
1–376（376 aa）
链 E
1–376（376 aa）
链 F
1–376（376 aa）
链 G
1–376（376 aa）
链 I
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ZN ZINC ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；20 second incubation
|
分辨率 20.00 Å |
| 7Z8I The barbed end complex of dynactin bound to BICDR1 and the cytoplasmic dynein tails (A2, B1, B2) 提交 2022-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric（17） 与蛋白数一致 |
链 A
1–376（376 aa）
链 B
1–376（376 aa）
链 C
1–376（376 aa）
链 D
1–376（376 aa）
链 E
1–376（376 aa）
链 F
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；20 second incubation
|
分辨率 3.30 Å |
| 7Z8K Cytoplasmic dynein (A1) bound to BICDR1 提交 2022-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 F
1–376（376 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；20 second incubation
|
分辨率 4.37 Å |
| 7Z8M The pointed end complex of dynactin bound to BICDR1 提交 2022-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 G
1–376（376 aa）
链 I
1–376（376 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；20 second incubation
|
分辨率 3.37 Å |
| 8PTK Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：53-meric（53） 与蛋白数一致 |
链 A
1–376（376 aa）
链 B
1–376（376 aa）
链 C
1–376（376 aa）
链 D
1–376（376 aa）
链 E
1–376（376 aa）
链 F
1–376（376 aa）
链 G
1–376（376 aa）
链 I
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.00 Å |
| 9HHL Structure of Dynein-Dynactin-NuMA-LIS1 提交 2024-11-21 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：41-meric（41） 与蛋白数一致 |
链 A
1–376（376 aa）
链 B
1–376（376 aa）
链 C
1–376（376 aa）
链 D
1–376（376 aa）
链 E
1–376（376 aa）
链 F
1–376（376 aa）
链 G
1–376（376 aa）
链 I
1–376（376 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.53 Å |