当前蛋白身份:P16455 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1EH6 HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE 提交 2000-02-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–207(207 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;18 MG/ML PROTEIN, 1.5 M SUCROSE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.00 Å R-free 0.218
1EH7 METHYLATED HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE 提交 2000-02-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–207(207 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;18 MG/ML PROTEIN, 1.5 M SUCROSE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.229
1EH8 BENZYLATED HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE 提交 2000-02-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–207(207 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;18 MG/ML PROTEIN, 1.5 M SUCROSE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.230
1QNT X-ray structure of human O6alkylguanine-DNA alkyltransferase 提交 1999-10-20 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–176(176 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;1.75M (NH4)2SO4, PH 7.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.221
1T38 HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE BOUND TO DNA CONTAINING O6-METHYLGUANINE 提交 2004-04-25 Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 A 1–176(176 aa)
突变:C145S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;PEG 3000, Tris, sodium chloride, xylitol, calcium acetate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.307
1T39 HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE COVALENTLY CROSSLINKED TO DNA 提交 2004-04-25 Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 A 1–176(176 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;PEG 8000, MES, calcium acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.344
1T39 HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE COVALENTLY CROSSLINKED TO DNA 提交 2004-04-25 Assembly 2 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 B 1–176(176 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;PEG 8000, MES, calcium acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.30 Å R-free 0.344
1YFH wt Human O6-Alkylguanine-DNA Alkyltransferase Bound To DNA Containing an Alkylated Cytosine 提交 2004-12-31 Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 C 1–179(179 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;277 K;PEG 4000, sodium chloride, citrate, magnesium chloride, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.01 Å R-free 0.286
1YFH wt Human O6-Alkylguanine-DNA Alkyltransferase Bound To DNA Containing an Alkylated Cytosine 提交 2004-12-31 Assembly 2 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 A 1–179(179 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;277 K;PEG 4000, sodium chloride, citrate, magnesium chloride, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.01 Å R-free 0.286
1YFH wt Human O6-Alkylguanine-DNA Alkyltransferase Bound To DNA Containing an Alkylated Cytosine 提交 2004-12-31 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–179(179 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;277 K;PEG 4000, sodium chloride, citrate, magnesium chloride, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.01 Å R-free 0.286
28OP Structure of the human inner kinetochore CCAN and CENP-C bound to DNA 提交 2026-02-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致
链 C 1–182(182 aa)
链 T 1–182(182 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8RGG Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I2 (WDR34) in complex with dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 B 2–184(183 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RGH Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I1 (WDR60) in complex with the dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 2–184(183 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8RTY Structure of the F-actin barbed end bound by Cdc12 and profilin (ring complex) at a resolution of 6.3 Angstrom 提交 2024-01-29 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 E 2–182(181 aa)
链 F 2–182(181 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;3 seconds, force 0.
分辨率 6.25 Å
8RU2 Structure of the F-actin barbed end bound by formin mDia1 提交 2024-01-29 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 E 1–182(182 aa)
链 F 1–182(182 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;3 seconds, force 0.
分辨率 3.49 Å
9HHL Structure of Dynein-Dynactin-NuMA-LIS1 提交 2024-11-21 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 41 PDB 声明:41-meric(41) 与蛋白数一致
链 1 1–182(182 aa)
链 2 1–182(182 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.53 Å
9QEY Cryo-EM structure of the actin filament bound by a single Coronin-1B molecule. 提交 2025-03-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 H 1–182(182 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.74 Å
9QF2 Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 F 1–182(182 aa)
链 G 1–182(182 aa)
链 H 1–182(182 aa)
链 I 1–182(182 aa)
链 J 1–182(182 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.42 Å
9QFB Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致
链 H 1–182(182 aa)
链 I 1–182(182 aa)
链 J 1–182(182 aa)
链 K 1–182(182 aa)
链 L 1–182(182 aa)
链 M 1–182(182 aa)
链 N 1–182(182 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.74 Å
9QFE Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1 on separate actin strands 提交 2025-03-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致
链 L 1–182(182 aa)
链 M 1–182(182 aa)
链 N 1–182(182 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.12 Å
9QFG Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1, strand boundary 提交 2025-03-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致
链 J 1–182(182 aa)
链 K 1–182(182 aa)
链 L 1–182(182 aa)
链 M 1–182(182 aa)
链 N 1–182(182 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.49 Å
9QFK Cryo-EM structure of the Coronin-1B-decorated actin filament bound by one Cofilin-1 molecule (crosslinked) 提交 2025-03-11 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致
链 H 1–182(182 aa)
链 I 1–182(182 aa)
链 K 1–182(182 aa)
链 L 1–182(182 aa)
链 M 1–182(182 aa)
链 N 1–182(182 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.99 Å
9QFQ Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by AIP1 提交 2025-03-12 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:11-meric(11) 与蛋白数一致
链 P 1–182(182 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.76 Å
9QFW Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by two AIP1 molecules 提交 2025-03-12 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 P 1–182(182 aa)
链 Q 1–182(182 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.16 Å
9TAY Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a di-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 35 PDB 声明:37-meric(37) 与全部聚合物一致
链 T 1–182(182 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.50 Å