当前蛋白身份:P16455
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EH6 HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE 提交 2000-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–207(207 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;18 MG/ML PROTEIN, 1.5 M SUCROSE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.218 |
| 1EH7 METHYLATED HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE 提交 2000-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–207(207 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;18 MG/ML PROTEIN, 1.5 M SUCROSE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 1EH8 BENZYLATED HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE 提交 2000-02-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–207(207 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;18 MG/ML PROTEIN, 1.5 M SUCROSE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.230 |
| 1QNT X-ray structure of human O6alkylguanine-DNA alkyltransferase 提交 1999-10-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–176(176 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5;1.75M (NH4)2SO4, PH 7.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.221 |
| 1T38 HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE BOUND TO DNA CONTAINING O6-METHYLGUANINE 提交 2004-04-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–176(176 aa)
|
突变:C145S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;PEG 3000, Tris, sodium chloride, xylitol, calcium acetate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.307 |
| 1T39 HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE COVALENTLY CROSSLINKED TO DNA 提交 2004-04-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–176(176 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;PEG 8000, MES, calcium acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.344 |
| 1T39 HUMAN O6-ALKYLGUANINE-DNA ALKYLTRANSFERASE COVALENTLY CROSSLINKED TO DNA 提交 2004-04-25 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 B
1–176(176 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;PEG 8000, MES, calcium acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.344 |
| 1YFH wt Human O6-Alkylguanine-DNA Alkyltransferase Bound To DNA Containing an Alkylated Cytosine 提交 2004-12-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–179(179 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;277 K;PEG 4000, sodium chloride, citrate, magnesium chloride, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.286 |
| 1YFH wt Human O6-Alkylguanine-DNA Alkyltransferase Bound To DNA Containing an Alkylated Cytosine 提交 2004-12-31 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–179(179 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;277 K;PEG 4000, sodium chloride, citrate, magnesium chloride, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.286 |
| 1YFH wt Human O6-Alkylguanine-DNA Alkyltransferase Bound To DNA Containing an Alkylated Cytosine 提交 2004-12-31 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
1–179(179 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;277 K;PEG 4000, sodium chloride, citrate, magnesium chloride, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.286 |
| 28OP Structure of the human inner kinetochore CCAN and CENP-C bound to DNA 提交 2026-02-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致 |
链 C
1–182(182 aa)
链 T
1–182(182 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8RGG Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I2 (WDR34) in complex with dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致 |
链 B
2–184(183 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8RGH Structure of dynein-2 intermediate chain DYNC2I1 (WDR60) in complex with the dynein-2 heavy chain DYNC2H1. 提交 2023-12-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
2–184(183 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8RTY Structure of the F-actin barbed end bound by Cdc12 and profilin (ring complex) at a resolution of 6.3 Angstrom 提交 2024-01-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 E
2–182(181 aa)
链 F
2–182(181 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;3 seconds, force 0.
|
分辨率 6.25 Å |
| 8RU2 Structure of the F-actin barbed end bound by formin mDia1 提交 2024-01-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 E
1–182(182 aa)
链 F
1–182(182 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;3 seconds, force 0.
|
分辨率 3.49 Å |
| 9HHL Structure of Dynein-Dynactin-NuMA-LIS1 提交 2024-11-21 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 41 PDB 声明:41-meric(41) 与蛋白数一致 |
链 1
1–182(182 aa)
链 2
1–182(182 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.53 Å |
| 9QEY Cryo-EM structure of the actin filament bound by a single Coronin-1B molecule. 提交 2025-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 H
1–182(182 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.74 Å |
| 9QF2 Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 F
1–182(182 aa)
链 G
1–182(182 aa)
链 H
1–182(182 aa)
链 I
1–182(182 aa)
链 J
1–182(182 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.42 Å |
| 9QFB Cryo-EM structure of the fully Coronin-1B-decorated actin filament in the ADP state. 提交 2025-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致 |
链 H
1–182(182 aa)
链 I
1–182(182 aa)
链 J
1–182(182 aa)
链 K
1–182(182 aa)
链 L
1–182(182 aa)
链 M
1–182(182 aa)
链 N
1–182(182 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.01% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.74 Å |
| 9QFE Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1 on separate actin strands 提交 2025-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致 |
链 L
1–182(182 aa)
链 M
1–182(182 aa)
链 N
1–182(182 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 9QFG Cryo-EM structure of the actin filament hetero-decorated by Coronin-1 and Cofilin-1, strand boundary 提交 2025-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致 |
链 J
1–182(182 aa)
链 K
1–182(182 aa)
链 L
1–182(182 aa)
链 M
1–182(182 aa)
链 N
1–182(182 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 9QFK Cryo-EM structure of the Coronin-1B-decorated actin filament bound by one Cofilin-1 molecule (crosslinked) 提交 2025-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致 |
链 H
1–182(182 aa)
链 I
1–182(182 aa)
链 K
1–182(182 aa)
链 L
1–182(182 aa)
链 M
1–182(182 aa)
链 N
1–182(182 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.02% Tween20).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.99 Å |
| 9QFQ Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by AIP1 提交 2025-03-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:11-meric(11) 与蛋白数一致 |
链 P
1–182(182 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 9QFW Cryo-EM structure of the cofilactin barbed end bound by two AIP1 molecules 提交 2025-03-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致 |
链 P
1–182(182 aa)
链 Q
1–182(182 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.1;1xKMEH (10 mM HEPES pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 0.5 mM TCEP, 0.015% Tween20)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 9TAY Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a di-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 35 PDB 声明:37-meric(37) 与全部聚合物一致 |
链 T
1–182(182 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 15.50 Å |