当前蛋白身份：P19491
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1FTJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH GLUTAMATE AT 1.9 RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Cacodylate 15% PEG 8000 0.2 M Zinc Acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.266 |
| 1FTJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH GLUTAMATE AT 1.9 RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Cacodylate 15% PEG 8000 0.2 M Zinc Acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.266 |
| 1FTJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH GLUTAMATE AT 1.9 RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Cacodylate 15% PEG 8000 0.2 M Zinc Acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.266 |
| 1FTJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH GLUTAMATE AT 1.9 RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 GLU GLUTAMIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Cacodylate 15% PEG 8000 0.2 M Zinc Acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.266 |
| 1FTJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH GLUTAMATE AT 1.9 RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J))
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 GLU GLUTAMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Cacodylate 15% PEG 8000 0.2 M Zinc Acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.266 |
| 1FTK CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2I) IN COMPLEX WITH KAINATE AT 1.6 A RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–528（125 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE, S1S2I
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE, S1S2I
|
未记录 | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15% PEG 8000
50 mM potassium phosphate
, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.261 |
| 1FTL CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH THE ANTAGONIST DNQX AT 1.8 A RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | DNQ 6,7-DINITROQUINOXALINE-2,3-DIONE × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；19% PEG 4000
0.3 M ammonium sulfate
0.1 M sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.272 |
| 1FTM CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH AMPA AT 1.7 RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15% PEG 8000
0.2 M Zinc Acetate
0.1 M Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.247 |
| 1FTM CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH AMPA AT 1.7 RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15% PEG 8000
0.2 M Zinc Acetate
0.1 M Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.247 |
| 1FTM CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH AMPA AT 1.7 RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15% PEG 8000
0.2 M Zinc Acetate
0.1 M Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.247 |
| 1FTM CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH AMPA AT 1.7 RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15% PEG 8000
0.2 M Zinc Acetate
0.1 M Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.247 |
| 1FTM CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH AMPA AT 1.7 RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15% PEG 8000
0.2 M Zinc Acetate
0.1 M Cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.247 |
| 1FTO CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN THE APO STATE AT 2.0 A RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；22% PEG 8000 0.3 M ammonium sulfate 0.1 M sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.287 |
| 1FTO CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN THE APO STATE AT 2.0 A RESOLUTION 提交 2000-09-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；22% PEG 8000 0.3 M ammonium sulfate 0.1 M sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.287 |
| 1FW0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH KAINATE AT 2.0 A RESOLUTION 提交 2000-09-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；274 K；10% PEG 1450, 0.1 M sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 274K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.308 |
| 1GR2 STRUCTURE OF A GLUTAMATE RECEPTOR LIGAND BINDING CORE (GLUR2) COMPLEXED WITH KAINATE 提交 1998-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–528（125 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN
链 A
652–796（145 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN
|
未记录 | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；50 MM KIPI, PH 5.0, 14% PEG 8K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.273 |
| 1LB8 Crystal structure of the Non-desensitizing GluR2 ligand binding core mutant (S1S2J-L483Y) in complex with AMPA at 2.3 resolution 提交 2002-04-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand-binding core (flop)
链 A
653–796（144 aa）
片段：ligand-binding core (flop)
|
突变：L483Y 突变：L483Y | AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.267 |
| 1LB8 Crystal structure of the Non-desensitizing GluR2 ligand binding core mutant (S1S2J-L483Y) in complex with AMPA at 2.3 resolution 提交 2002-04-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：ligand-binding core (flop)
链 B
653–796（144 aa）
片段：ligand-binding core (flop)
|
突变：L483Y 突变：L483Y | AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.267 |
| 1LB9 Crystal structure of the Non-desensitizing GluR2 ligand binding core mutant (S1S2J-L483Y) in complex with antagonist DNQX at 2.3 A resolution 提交 2002-04-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (flop)
链 A
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (flop)
|
突变：L483Y 突变：L483Y | DNQ 6,7-DINITROQUINOXALINE-2,3-DIONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；PEG 4000, ammonium sulfate, sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.268 |
| 1LB9 Crystal structure of the Non-desensitizing GluR2 ligand binding core mutant (S1S2J-L483Y) in complex with antagonist DNQX at 2.3 A resolution 提交 2002-04-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (flop)
链 B
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (flop)
|
突变：L483Y 突变：L483Y | DNQ 6,7-DINITROQUINOXALINE-2,3-DIONE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；PEG 4000, ammonium sulfate, sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.268 |
| 1LBB Crystal structure of the GluR2 ligand binding domain mutant (S1S2J-N754D) in complex with kainate at 2.1 A resolution 提交 2002-04-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (flop)
链 A
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (flop)
|
突变：N754D 突变：N754D | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 1000, Li2SO4, phosphate-citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.260 |
| 1M5B X-RAY STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH 2-Me-Tet-AMPA AT 1.85 A RESOLUTION. 提交 2002-07-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 BN1 (S)-2-AMINO-3-[3-HYDROXY-5-(2-METHYL-2H-TETRAZOL-5-YL)ISOXAZOL-4-YL]PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 8000, Zn(OAc)2, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.234 |
| 1M5B X-RAY STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH 2-Me-Tet-AMPA AT 1.85 A RESOLUTION. 提交 2002-07-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 BN1 (S)-2-AMINO-3-[3-HYDROXY-5-(2-METHYL-2H-TETRAZOL-5-YL)ISOXAZOL-4-YL]PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 8000, Zn(OAc)2, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.234 |
| 1M5B X-RAY STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH 2-Me-Tet-AMPA AT 1.85 A RESOLUTION. 提交 2002-07-09 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 BN1 (S)-2-AMINO-3-[3-HYDROXY-5-(2-METHYL-2H-TETRAZOL-5-YL)ISOXAZOL-4-YL]PROPIONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 8000, Zn(OAc)2, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.234 |
| 1M5C X-RAY STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH Br-HIBO AT 1.65 A RESOLUTION 提交 2002-07-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J)
|
未记录 | BRH (S)-2-AMINO-3-(4-BROMO-3-HYDROXY-ISOXAZOL-5-YL)PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；PEG 1450, Li2SO4, phosphate-citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.221 |
| 1M5D X-RAY STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J-Y702F) IN COMPLEX WITH Br-HIBO AT 1.73 A RESOLUTION 提交 2002-07-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
链 A
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
|
突变：Y190F 突变：Y190F | SO4 SULFATE ION × 4 BRH (S)-2-AMINO-3-(4-BROMO-3-HYDROXY-ISOXAZOL-5-YL)PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；PEG 3350, Li2SO4, phosphate-citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.215 |
| 1M5E X-RAY STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH ACPA AT 1.46 A RESOLUTION 提交 2002-07-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand binding core (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand binding core (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand binding core (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 AM1 (S)-2-AMINO-3-(3-CARBOXY-5-METHYLISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 8000, Zn(OAc)2, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.216 |
| 1M5E X-RAY STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH ACPA AT 1.46 A RESOLUTION 提交 2002-07-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand binding core (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand binding core (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 AM1 (S)-2-AMINO-3-(3-CARBOXY-5-METHYLISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 2 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 8000, Zn(OAc)2, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.216 |
| 1M5E X-RAY STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH ACPA AT 1.46 A RESOLUTION 提交 2002-07-09 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand binding core (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand binding core (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand binding core (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand binding core (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand binding core (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 AM1 (S)-2-AMINO-3-(3-CARBOXY-5-METHYLISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 3 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 8000, Zn(OAc)2, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.216 |
| 1M5F X-RAY STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J-Y702F) IN COMPLEX WITH ACPA AT 1.95 A RESOLUTION 提交 2002-07-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
链 A
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
链 C
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
链 C
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
|
突变：Y190F 突变：Y190F 突变：Y190F 突变：Y190F | ZN ZINC ION × 2 AM1 (S)-2-AMINO-3-(3-CARBOXY-5-METHYLISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 8000, Zn(OAc)2, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.230 |
| 1M5F X-RAY STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J-Y702F) IN COMPLEX WITH ACPA AT 1.95 A RESOLUTION 提交 2002-07-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
链 B
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
|
突变：Y190F 突变：Y190F | ZN ZINC ION × 8 AM1 (S)-2-AMINO-3-(3-CARBOXY-5-METHYLISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 2 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 8000, Zn(OAc)2, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.230 |
| 1M5F X-RAY STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J-Y702F) IN COMPLEX WITH ACPA AT 1.95 A RESOLUTION 提交 2002-07-09 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
链 A
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
链 B
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
链 B
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
链 C
413–527（115 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
链 C
653–796（144 aa）
片段：flop ligand binding core (S1S2J-Y702F)
|
突变：Y190F 突变：Y190F 突变：Y190F 突变：Y190F 突变：Y190F 突变：Y190F | ZN ZINC ION × 6 AM1 (S)-2-AMINO-3-(3-CARBOXY-5-METHYLISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 3 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 8000, Zn(OAc)2, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.230 |
| 1MM6 crystal structure of the GluR2 ligand binding core (S1S2J) in complex with quisqualate in a non zinc crystal form at 2.15 angstroms resolution 提交 2002-09-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 8K, ammonium sulfate, sodium citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.237 |
| 1MM7 Crystal Structure of the GluR2 Ligand Binding Core (S1S2J) in Complex with Quisqualate in a Zinc Crystal Form at 1.65 Angstroms Resolution 提交 2002-09-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 8K, zinc acetate, sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.237 |
| 1MM7 Crystal Structure of the GluR2 Ligand Binding Core (S1S2J) in Complex with Quisqualate in a Zinc Crystal Form at 1.65 Angstroms Resolution 提交 2002-09-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 8K, zinc acetate, sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.237 |
| 1MQD X-ray structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with (S)-Des-Me-AMPA at 1.46 A resolution. Crystallization in the presence of lithium sulfate. 提交 2002-09-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 A
653–794（142 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 SHI (S)-2-AMINO-3-(3-HYDROXY-ISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；279 K；20% PEG 8000, 0.1M lithium sulfate, 0.1M cacodylate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.192 |
| 1MQD X-ray structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with (S)-Des-Me-AMPA at 1.46 A resolution. Crystallization in the presence of lithium sulfate. 提交 2002-09-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 B
653–794（142 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 SHI (S)-2-AMINO-3-(3-HYDROXY-ISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；279 K；20% PEG 8000, 0.1M lithium sulfate, 0.1M cacodylate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.192 |
| 1MQD X-ray structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with (S)-Des-Me-AMPA at 1.46 A resolution. Crystallization in the presence of lithium sulfate. 提交 2002-09-16 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 C
653–794（142 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
|
未记录 | SHI (S)-2-AMINO-3-(3-HYDROXY-ISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；279 K；20% PEG 8000, 0.1M lithium sulfate, 0.1M cacodylate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.192 |
| 1MQD X-ray structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with (S)-Des-Me-AMPA at 1.46 A resolution. Crystallization in the presence of lithium sulfate. 提交 2002-09-16 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 D
653–794（142 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 SHI (S)-2-AMINO-3-(3-HYDROXY-ISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；279 K；20% PEG 8000, 0.1M lithium sulfate, 0.1M cacodylate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.192 |
| 1MQG Crystal Structure of the GluR2 Ligand Binding Core (S1S2J) in Complex with Iodo-Willardiine at 2.15 Angstroms Resolution 提交 2002-09-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 IWD 2-AMINO-3-(5-IODO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；PEG 1000, Phosphate-citrate buffer, Li sulfate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.233 |
| 1MQH Crystal Structure of the GluR2 Ligand Binding Core (S1S2J) in Complex with Bromo-Willardiine at 1.8 Angstroms Resolution 提交 2002-09-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
未记录 | BWD 2-AMINO-3-(5-BROMO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 8K, ammonium sulfate, Na Acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.231 |
| 1MQI Crystal Structure of the GluR2 Ligand Binding Core (S1S2J) in Complex with Fluoro-Willardiine at 1.35 Angstroms Resolution 提交 2002-09-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
未记录 | FWD 2-AMINO-3-(5-FLUORO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 8K, NaCl, Na Citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.218 |
| 1MQJ Crystal structure of the GluR2 ligand binding core (S1S2J) in complex with willardiine at 1.65 angstroms resolution 提交 2002-09-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 HWD 2-AMINO-3-(2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 5K MME, Na Citrate, zinc acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.229 |
| 1MS7 X-ray structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with (S)-Des-Me-AMPA at 1.97 A resolution, Crystallization in the presence of zinc acetate 提交 2002-09-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 SHI (S)-2-AMINO-3-(3-HYDROXY-ISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；17% PEG 8000, 0.05M zinc acetate, 0.1M cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.213 |
| 1MS7 X-ray structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with (S)-Des-Me-AMPA at 1.97 A resolution, Crystallization in the presence of zinc acetate 提交 2002-09-19 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 SHI (S)-2-AMINO-3-(3-HYDROXY-ISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；17% PEG 8000, 0.05M zinc acetate, 0.1M cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.213 |
| 1MS7 X-ray structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with (S)-Des-Me-AMPA at 1.97 A resolution, Crystallization in the presence of zinc acetate 提交 2002-09-19 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 SHI (S)-2-AMINO-3-(3-HYDROXY-ISOXAZOL-4-YL)PROPIONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；17% PEG 8000, 0.05M zinc acetate, 0.1M cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.213 |
| 1MXU CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) in complex with bromo-willardiine (Control for the crystal titration experiments) 提交 2002-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 BWD 2-AMINO-3-(5-BROMO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8K, ammonium sulfate, zinc acetate, BrW and sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.234 |
| 1MXU CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) in complex with bromo-willardiine (Control for the crystal titration experiments) 提交 2002-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 BWD 2-AMINO-3-(5-BROMO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8K, ammonium sulfate, zinc acetate, BrW and sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.234 |
| 1MXU CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) in complex with bromo-willardiine (Control for the crystal titration experiments) 提交 2002-10-03 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 BWD 2-AMINO-3-(5-BROMO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8K, ammonium sulfate, zinc acetate, BrW and sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.234 |
| 1MXV crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 10 mM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.248 |
| 1MXV crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 10 mM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.248 |
| 1MXV crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 10 mM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.248 |
| 1MXW crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 1 mM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.252 |
| 1MXW crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 1 mM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.252 |
| 1MXW crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 1 mM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.252 |
| 1MXX crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 100 uM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 1MXX crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 100 uM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 1MXX crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 100 uM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 1MXY crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 10 uM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.259 |
| 1MXY crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 10 uM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.259 |
| 1MXY crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 10 uM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.259 |
| 1MXZ crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 1 uM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.256 |
| 1MXZ crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 1 uM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.256 |
| 1MXZ crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 1 uM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.256 |
| 1MY0 crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 100 nM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.249 |
| 1MY0 crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 100 nM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.249 |
| 1MY0 crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 100 nM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.249 |
| 1MY1 crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 10 nM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |
| 1MY1 crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 10 nM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |
| 1MY1 crystal titration experiments (AMPA co-crystals soaked in 10 nM BrW) 提交 2002-10-03 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |
| 1MY2 crystal titration experiment (AMPA complex control) 提交 2002-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.244 |
| 1MY2 crystal titration experiment (AMPA complex control) 提交 2002-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.244 |
| 1MY2 crystal titration experiment (AMPA complex control) 提交 2002-10-03 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, zinc acetate, sodium cacodylate, pH 6.5 and AMPA, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.244 |
| 1MY3 crystal structure of glutamate receptor ligand-binding core in complex with bromo-willardiine in the Zn crystal form 提交 2002-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 BWD 2-AMINO-3-(5-BROMO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, ammonium sulfate, zinc acetate and sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.255 |
| 1MY3 crystal structure of glutamate receptor ligand-binding core in complex with bromo-willardiine in the Zn crystal form 提交 2002-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 BWD 2-AMINO-3-(5-BROMO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, ammonium sulfate, zinc acetate and sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.255 |
| 1MY4 crystal structure of glutamate receptor ligand-binding core in complex with iodo-willardiine in the Zn crystal form 提交 2002-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 IWD 2-AMINO-3-(5-IODO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4K, ammonium sulfate, zinc acetate and Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.262 |
| 1MY4 crystal structure of glutamate receptor ligand-binding core in complex with iodo-willardiine in the Zn crystal form 提交 2002-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 IWD 2-AMINO-3-(5-IODO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4K, ammonium sulfate, zinc acetate and Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.262 |
| 1MY4 crystal structure of glutamate receptor ligand-binding core in complex with iodo-willardiine in the Zn crystal form 提交 2002-10-03 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 5 IWD 2-AMINO-3-(5-IODO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；PEG4K, ammonium sulfate, zinc acetate and Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.262 |
| 1N0T X-ray structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with the antagonist (S)-ATPO at 2.1 A resolution. 提交 2002-10-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J).
链 A
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J).
链 C
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J).
链 C
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J).
|
未记录 | AT1 (S)-2-AMINO-3-(5-TERT-BUTYL-3-(PHOSPHONOMETHOXY)-4-ISOXAZOLYL)PROPIONIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；279 K；PEG 3350, AMMONIUM SULFATE, SODIUM ACETATE pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.245 |
| 1N0T X-ray structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with the antagonist (S)-ATPO at 2.1 A resolution. 提交 2002-10-15 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J).
链 B
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J).
链 D
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J).
链 D
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J).
|
未记录 | AT1 (S)-2-AMINO-3-(5-TERT-BUTYL-3-(PHOSPHONOMETHOXY)-4-ISOXAZOLYL)PROPIONIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；279 K；PEG 3350, AMMONIUM SULFATE, SODIUM ACETATE pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.245 |
| 1NNK X-ray structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with (S)-ATPA at 1.85 A resolution. Crystallization with zinc ions. 提交 2003-01-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 CE2 3-(5-TERT-BUTYL-3-OXIDOISOXAZOL-4-YL)-L-ALANINATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；zinc acetate, cacodylate, PEG8000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.245 |
| 1NNP X-ray structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with (S)-ATPA at 1.9 A resolution. Crystallization without zinc ions. 提交 2003-01-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：GluR2-flop ligand-binding core (S1S2J)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CE2 3-(5-TERT-BUTYL-3-OXIDOISOXAZOL-4-YL)-L-ALANINATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；279 K；ammonium sulfate, PEG8000, sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.216 |
| 1P1N GluR2 Ligand Binding Core (S1S2J) Mutant L650T in Complex with Kainate 提交 2003-04-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
突变：L138T 突变：L138T | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；PEG 4000, ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 1P1O Crystal structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) mutant L650T in complex with quisqualate 提交 2003-04-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
突变：L138T 突变：L138T | SO4 SULFATE ION × 4 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；PEG4000, ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.235 |
| 1P1Q Crystal structure of the GluR2 ligand binding core (S1S2J) L650T mutant in complex with AMPA 提交 2003-04-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
突变：L138T 突变：L138T 突变：L138T 突变：L138T | ZN ZINC ION × 3 AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, cacodylate, zinc acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.270 |
| 1P1Q Crystal structure of the GluR2 ligand binding core (S1S2J) L650T mutant in complex with AMPA 提交 2003-04-13 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
突变：L138T 突变：L138T | ZN ZINC ION × 4 AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8000, cacodylate, zinc acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.270 |
| 1P1U Crystal structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) L650T mutant in complex with AMPA (ammonium sulfate crystal form) 提交 2003-04-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
突变：L138T 突变：L138T 突变：L138T 突变：L138T | SO4 SULFATE ION × 1 AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；PEG4000, ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.271 |
| 1P1W Crystal structure of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) with the L483Y and L650T mutations and in complex with AMPA 提交 2003-04-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
突变：L94Y,L138T 突变：L94Y,L138T 突变：L94Y,L138T 突变：L94Y,L138T | SO4 SULFATE ION × 2 AMQ (S)-ALPHA-AMINO-3-HYDROXY-5-METHYL-4-ISOXAZOLEPROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；PEG4000, ammonium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.264 |
| 1SYH X-RAY STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND-BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH (S)-CPW399 AT 1.85 A RESOLUTION. 提交 2004-04-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–796（384 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND-BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | CPW (S)-2-AMINO-3-(1,3,5,7-PENTAHYDRO-2,4-DIOXO-CYCLOPENTA[E]PYRIMIDIN-1-YL) PROIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；280 K；PEG8000, cacodylate, (NH4)2SO4 , pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.199 |
| 1SYI X-RAY STRUCTURE OF THE Y702F MUTANT OF THE GLUR2 LIGAND-BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH (S)-CPW399 AT 2.1 A RESOLUTION. 提交 2004-04-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–796（384 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND-BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–796（384 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND-BINDING CORE (S1S2J)
|
突变：Y702F 突变：Y702F | CPW (S)-2-AMINO-3-(1,3,5,7-PENTAHYDRO-2,4-DIOXO-CYCLOPENTA[E]PYRIMIDIN-1-YL) PROIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；280 K；PEG8000, CACODYLATE, (NH4)2SO4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.254 |
| 1WVJ Exploring the GluR2 ligand-binding core in complex with the bicyclic AMPA analogue (S)-4-AHCP 提交 2004-12-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–796（144 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 IBC 3-(3-HYDROXY-7,8-DIHYDRO-6H-CYCLOHEPTA[D]ISOXAZOL-4-YL)-L-ALANINE × 2 GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；PEG 3350, phosphate-citrate buffer, lithium sulfate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.214 |
| 1XHY X-ray structure of the Y702F mutant of the GluR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with kainate at 1.85 A resolution 提交 2004-09-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GluR2 flop ligand-binding core (S1S2J), UNP residues 413-527 and 653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：GluR2 flop ligand-binding core (S1S2J), UNP residues 413-527 and 653-796
|
突变：Y702F 突变：Y702F | SO4 SULFATE ION × 10 KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；280 K；PEG1000, Li2SO4, cacodylate , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.207 |
| 2AIX X-ray structure of the GLUR2 ligand-binding core (S1S2J) in complex with (s)-thio-atpa at 2.2 a resolution. 提交 2005-08-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND-BINDING CORE (S1S2J).
链 A
653–796（144 aa）
片段：GLUR2-FLOP LIGAND-BINDING CORE (S1S2J).
|
未记录 | U1K (S)-2-AMINO-3-(3-HYDROXY-5-TERT-BUTYLISOTHIAZOL-4-YL) PROPRIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；279 K；SODIUM CHLORIDE, CACODYLATE, PEG 8000, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.230 |
| 2AL4 CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH quisqualate and CX614. 提交 2005-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 F
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 F
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. | ZN ZINC ION × 5 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 3 CX6 2,3,6A,7,8,9-HEXAHYDRO-11H-[1,4]DIOXINO[2,3-G]PYRROLO[2,1-B][1,3]BENZOXAZIN-11-ONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；10-14% PEG8000, 0.1-0.15 M Zinc acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.223 |
| 2AL4 CRYSTAL STRUCTURE OF THE GLUR2 LIGAND BINDING CORE (S1S2J) IN COMPLEX WITH quisqualate and CX614. 提交 2005-08-04 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 C
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 D
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 D
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 E
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 E
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. | ZN ZINC ION × 5 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 3 CX6 2,3,6A,7,8,9-HEXAHYDRO-11H-[1,4]DIOXINO[2,3-G]PYRROLO[2,1-B][1,3]BENZOXAZIN-11-ONE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；10-14% PEG8000, 0.1-0.15 M Zinc acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.223 |
| 2AL5 Crystal structure of the GluR2 ligand binding core (S1S2J) in complex with fluoro-willardiine and aniracetam 提交 2005-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 A
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
链 B
653–796（144 aa）
片段：ligand binding core (S1S2J)
|
突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. 突变：The native GluR2 is a membrane protein. Transmembrane regions were genetically removed and replaced with a Gly-Thr linker. | FWD 2-AMINO-3-(5-FLUORO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 4MP 1-(4-METHOXYBENZOYL)-2-PYRROLIDINONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；12-14% PEG 8000, 0.25-0.35 M ammonium sulfate and 0.1 M sodium citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.220 |
| 2ANJ Crystal Structure of the Glur2 Ligand Binding Core (S1S2J-Y450W) Mutant in Complex With the Partial Agonist Kainic Acid at 2.1 A Resolution 提交 2005-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand Binding Core
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand Binding Core
|
突变：Y61W 突变：Y61W | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；279 K；PEG 8000, Cacodylate, Lithium Sulphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K, pH 6.50
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.248 |
| 2CMO The structure of a mixed glur2 ligand-binding core dimer in complex with (s)-glutamate and the antagonist (s)-ns1209 提交 2006-05-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：RESIDUES 413-527,653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：RESIDUES 413-527,653-796
链 B
413–527（115 aa）
片段：RESIDUES 413-527,653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：RESIDUES 413-527,653-796
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 M1L 2-({[(3E)-5-{4-[(DIMETHYLAMINO)(DIHYDROXY)-LAMBDA~4~-SULFANYL]PHENYL}-8-METHYL-2-OXO-6,7,8,9-TETRAHYDRO-1H-PYRROLO[3,2-H]ISOQUINOLIN-3(2H)-YLIDENE]AMINO}OXY)-4-HYDROXYBUTANOIC ACID × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.50
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.281 |
| 2GFE Crystal structure of the GluR2 A476E S673D Ligand Binding Core Mutant at 1.54 Angstroms Resolution 提交 2006-03-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–795（143 aa）
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–795（143 aa）
|
突变：A476E S673D 突变：A476E S673D 突变：A476E S673D 突变：A476E S673D | ZN ZINC ION × 3 GLU GLUTAMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1 to 1 mixture of: Reservoir: 14% PEG 8K; 0.1M Na Acetate; 0.1 M Zn Acetate.
Protein: 10 mg/ml 0.01 M Na HEPES pH 7.0; 0.02 M NaCl; 0.01 M Na Glutamate; 0.001 M EDTA, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.227 |
| 2GFE Crystal structure of the GluR2 A476E S673D Ligand Binding Core Mutant at 1.54 Angstroms Resolution 提交 2006-03-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–795（143 aa）
|
突变：A476E S673D 突变：A476E S673D | ZN ZINC ION × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1 to 1 mixture of: Reservoir: 14% PEG 8K; 0.1M Na Acetate; 0.1 M Zn Acetate.
Protein: 10 mg/ml 0.01 M Na HEPES pH 7.0; 0.02 M NaCl; 0.01 M Na Glutamate; 0.001 M EDTA, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.227 |
| 2GFE Crystal structure of the GluR2 A476E S673D Ligand Binding Core Mutant at 1.54 Angstroms Resolution 提交 2006-03-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–795（143 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–795（143 aa）
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–795（143 aa）
|
突变：A476E S673D 突变：A476E S673D 突变：A476E S673D 突变：A476E S673D 突变：A476E S673D 突变：A476E S673D | ZN ZINC ION × 5 GLU GLUTAMIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1 to 1 mixture of: Reservoir: 14% PEG 8K; 0.1M Na Acetate; 0.1 M Zn Acetate.
Protein: 10 mg/ml 0.01 M Na HEPES pH 7.0; 0.02 M NaCl; 0.01 M Na Glutamate; 0.001 M EDTA, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.227 |
| 2GFE Crystal structure of the GluR2 A476E S673D Ligand Binding Core Mutant at 1.54 Angstroms Resolution 提交 2006-03-21 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–795（143 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–795（143 aa）
|
突变：A476E S673D 突变：A476E S673D 突变：A476E S673D 突变：A476E S673D | ZN ZINC ION × 3 GLU GLUTAMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1 to 1 mixture of: Reservoir: 14% PEG 8K; 0.1M Na Acetate; 0.1 M Zn Acetate.
Protein: 10 mg/ml 0.01 M Na HEPES pH 7.0; 0.02 M NaCl; 0.01 M Na Glutamate; 0.001 M EDTA, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.227 |
| 2I3V Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: Structure of G725C mutant 提交 2006-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；0.1 M CACODYLATE, 18% PEG 8000, 0.2 M ZINC ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.281 |
| 2I3V Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: Structure of G725C mutant 提交 2006-08-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；0.1 M CACODYLATE, 18% PEG 8000, 0.2 M ZINC ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.281 |
| 2I3V Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: Structure of G725C mutant 提交 2006-08-21 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；0.1 M CACODYLATE, 18% PEG 8000, 0.2 M ZINC ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.281 |
| 2I3V Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: Structure of G725C mutant 提交 2006-08-21 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 D
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；0.1 M CACODYLATE, 18% PEG 8000, 0.2 M ZINC ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.281 |
| 2I3V Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: Structure of G725C mutant 提交 2006-08-21 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 D
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 D
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 7 GLU GLUTAMIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；0.1 M CACODYLATE, 18% PEG 8000, 0.2 M ZINC ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.281 |
| 2I3V Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: Structure of G725C mutant 提交 2006-08-21 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 D
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 D
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 GLU GLUTAMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；0.1 M CACODYLATE, 18% PEG 8000, 0.2 M ZINC ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.281 |
| 2I3V Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: Structure of G725C mutant 提交 2006-08-21 | Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 C
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 GLU GLUTAMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；0.1 M CACODYLATE, 18% PEG 8000, 0.2 M ZINC ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.281 |
| 2I3V Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: Structure of G725C mutant 提交 2006-08-21 | Assembly 8 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 D
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 D
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 GLU GLUTAMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；0.1 M CACODYLATE, 18% PEG 8000, 0.2 M ZINC ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.50
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.281 |
| 2I3W Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: Structure of S729C mutant 提交 2006-08-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
突变：G729C 突变：G729C | GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M CITRATE 20% PEG 3000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.284 |
| 2I3W Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: Structure of S729C mutant 提交 2006-08-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
突变：G729C 突变：G729C | GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M CITRATE 20% PEG 3000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.284 |
| 2I3W Measurement of conformational changes accompanying desensitization in an ionotropic glutamate receptor: Structure of S729C mutant 提交 2006-08-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 A
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
链 B
653–794（142 aa）
片段：LIGAND BINDING CORE (S1S2J)
|
突变：G729C 突变：G729C 突变：G729C 突变：G729C | GLU GLUTAMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M CITRATE 20% PEG 3000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.284 |
| 2P2A X-ray structure of the GluR2 ligand binding core (S1S2J) in complex with 2-Bn-tet-AMPA at 2.26A resolution 提交 2007-03-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：GluR2-Flop ligand-binding core (Residues 413-527, 653-796)
链 A
653–796（144 aa）
片段：GluR2-Flop ligand-binding core (Residues 413-527, 653-796)
链 B
413–527（115 aa）
片段：GluR2-Flop ligand-binding core (Residues 413-527, 653-796)
链 B
653–796（144 aa）
片段：GluR2-Flop ligand-binding core (Residues 413-527, 653-796)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 GLU GLUTAMIC ACID × 1 MP9 2-AMINO-3-[3-HYDROXY-5-(2-BENZYL-2H-5-TETRAZOLYL)-4-ISOXAZOLYL]-PROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；280 K；PEG4000, Sodium Acetate, Ammonium Sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.273 |
| 2XX7 Crystal structure of 1-(4-(1-pyrrolidinylcarbonyl)phenyl)-3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-indazole in complex with the ligand binding domain of the Rat GluA2 receptor and glutamate at 2.2A resolution. 提交 2010-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-795
链 A
653–795（143 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-795
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-795
链 C
653–795（143 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-795
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 1ND 1-[4-(1-PYRROLIDINYLCARBONYL)PHENYL]-3-(TRIFLUOROMETHYL)-4,5,6,7-TETRAHYDRO-1H-INDAZOLE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.218 |
| 2XX7 Crystal structure of 1-(4-(1-pyrrolidinylcarbonyl)phenyl)-3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-indazole in complex with the ligand binding domain of the Rat GluA2 receptor and glutamate at 2.2A resolution. 提交 2010-11-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-795
链 B
653–795（143 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-795
|
突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 1ND 1-[4-(1-PYRROLIDINYLCARBONYL)PHENYL]-3-(TRIFLUOROMETHYL)-4,5,6,7-TETRAHYDRO-1H-INDAZOLE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.218 |
| 2XX8 Crystal structure of N,N-dimethyl-4-(3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7- tetrahydro-1H-indazol-1-yl)benzamide in complex with the ligand binding domain of the Rat GluA2 receptor and glutamate at 2.2A resolution. 提交 2010-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 1NE N,N-DIMETHYL-4-[3-(TRIFLUOROMETHYL)-4,5,6,7-TETRAHYDRO-1H-INDAZOL-1-YL]BENZAMIDE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.55 Å R-free 0.212 |
| 2XX8 Crystal structure of N,N-dimethyl-4-(3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7- tetrahydro-1H-indazol-1-yl)benzamide in complex with the ligand binding domain of the Rat GluA2 receptor and glutamate at 2.2A resolution. 提交 2010-11-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
|
突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 1NE N,N-DIMETHYL-4-[3-(TRIFLUOROMETHYL)-4,5,6,7-TETRAHYDRO-1H-INDAZOL-1-YL]BENZAMIDE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.55 Å R-free 0.212 |
| 2XX9 Crystal structure of 1-((2-fluoro-4-(3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7- tetrahydro-1H-indazol-1-yl)phenyl)methyl)-2-pyrrolidinone in complex with the ligand binding domain of the Rat GluA2 receptor and glutamate at 2.2A resolution. 提交 2010-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
|
突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 1NF N,N-DIMETHYL-4-[3-(TRIFLUOROMETHYL)-4,5,6,7-TETRAHYDRO-1H-INDAZOL-1-YL]BENZAMIDE × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.97 Å R-free 0.224 |
| 2XX9 Crystal structure of 1-((2-fluoro-4-(3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7- tetrahydro-1H-indazol-1-yl)phenyl)methyl)-2-pyrrolidinone in complex with the ligand binding domain of the Rat GluA2 receptor and glutamate at 2.2A resolution. 提交 2010-11-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 1NF N,N-DIMETHYL-4-[3-(TRIFLUOROMETHYL)-4,5,6,7-TETRAHYDRO-1H-INDAZOL-1-YL]BENZAMIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.97 Å R-free 0.224 |
| 2XXH Crystal structure of 1-(4-(2-oxo-2-(1-pyrrolidinyl)ethyl)phenyl)-3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-indazole in complex with the ligand binding domain of the Rat GluA2 receptor and glutamate at 1.5A resolution. 提交 2010-11-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
|
突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 1NG 1-{4-[2-OXO-2-(1-PYRROLIDINYL)ETHYL]PHENYL}-3-( TRIFLUOROMETHYL)-4,5,6,7-TETRAHYDRO-1H-INDAZOLE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.50 Å R-free 0.218 |
| 2XXH Crystal structure of 1-(4-(2-oxo-2-(1-pyrrolidinyl)ethyl)phenyl)-3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-indazole in complex with the ligand binding domain of the Rat GluA2 receptor and glutamate at 1.5A resolution. 提交 2010-11-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 1NG 1-{4-[2-OXO-2-(1-PYRROLIDINYL)ETHYL]PHENYL}-3-( TRIFLUOROMETHYL)-4,5,6,7-TETRAHYDRO-1H-INDAZOLE × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.50 Å R-free 0.218 |
| 2XXI Crystal structure of 1-((4-(3-(trifluoromethyl)-6,7-dihydropyrano(4,3- c(pyrazol-1(4H)-yl)phenyl)methyl)-2-pyrrolidinone in complex with the ligand binding domain of the Rat GluA2 receptor and glutamate at 1.6A resolution. 提交 2010-11-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 C
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 JAC 1-({4-[3-(TRIFLUOROMETHYL)-6,7-DIHYDROPYRANO[4,3-C]PYRAZOL-1(4H)-YL]PHENYL}METHYL)-2-PYRROLIDINONE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.60 Å R-free 0.208 |
| 2XXI Crystal structure of 1-((4-(3-(trifluoromethyl)-6,7-dihydropyrano(4,3- c(pyrazol-1(4H)-yl)phenyl)methyl)-2-pyrrolidinone in complex with the ligand binding domain of the Rat GluA2 receptor and glutamate at 1.6A resolution. 提交 2010-11-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, RESIDUES 413-527,653-796
|
突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 JAC 1-({4-[3-(TRIFLUOROMETHYL)-6,7-DIHYDROPYRANO[4,3-C]PYRAZOL-1(4H)-YL]PHENYL}METHYL)-2-PYRROLIDINONE × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.60 Å R-free 0.208 |
| 3B6Q Crystal Structure of the GLUR2 Ligand Binding Core (S1S2J) Mutant T686A in Complex with Glutamate at 2.0 Resolution 提交 2007-10-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–796（144 aa）
|
突变：T686A 突变：T686A | SO4 SULFATE ION × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 0.15-0.2 M lithium sulfate, 18-21% PEG4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 3B6T Crystal Structure of the GLUR2 Ligand Binding Core (S1S2J) T686A Mutant in Complex with Quisqualate at 2.1 Resolution 提交 2007-10-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–796（144 aa）
|
突变：T686A 突变：T686A | SO4 SULFATE ION × 2 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 0.15-0.2 M lithium sulfate, 18-21% PEG4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.274 |
| 3B6W Crystal Structure of the GLUR2 Ligand Binding Core (S1S2J) T686S Mutant in Complex with Glutamate at 1.7 Resolution 提交 2007-10-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–796（144 aa）
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–796（144 aa）
|
突变：T686S 突变：T686S 突变：T686S 突变：T686S | SO4 SULFATE ION × 3 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 0.15-0.2 M lithium sulfate, 18-21% PEG4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.260 |
| 3B6W Crystal Structure of the GLUR2 Ligand Binding Core (S1S2J) T686S Mutant in Complex with Glutamate at 1.7 Resolution 提交 2007-10-29 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–796（144 aa）
链 D
413–527（115 aa）
链 D
653–796（144 aa）
|
突变：T686S 突变：T686S 突变：T686S 突变：T686S | SO4 SULFATE ION × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, 0.15-0.2 M lithium sulfate, 18-21% PEG4000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.260 |
| 3B7D Crystal structure of the GLUR2 ligand binding core (HS1S2J) in complex with CNQX at 2.5 A resolution 提交 2007-10-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–794（142 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–794（142 aa）
|
未记录 | CNI 7-nitro-2,3-dioxo-2,3-dihydroquinoxaline-6-carbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；40 mM Sodium citrate, 10 mM Ammonium sulfate, 1% PEG 400, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.283 |
| 3B7D Crystal structure of the GLUR2 ligand binding core (HS1S2J) in complex with CNQX at 2.5 A resolution 提交 2007-10-30 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–794（142 aa）
链 D
413–527（115 aa）
链 D
653–794（142 aa）
|
未记录 | CNI 7-nitro-2,3-dioxo-2,3-dihydroquinoxaline-6-carbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；40 mM Sodium citrate, 10 mM Ammonium sulfate, 1% PEG 400, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.283 |
| 3B7D Crystal structure of the GLUR2 ligand binding core (HS1S2J) in complex with CNQX at 2.5 A resolution 提交 2007-10-30 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
413–527（115 aa）
链 E
653–794（142 aa）
链 F
413–527（115 aa）
链 F
653–794（142 aa）
|
未记录 | CNI 7-nitro-2,3-dioxo-2,3-dihydroquinoxaline-6-carbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；40 mM Sodium citrate, 10 mM Ammonium sulfate, 1% PEG 400, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.283 |
| 3B7D Crystal structure of the GLUR2 ligand binding core (HS1S2J) in complex with CNQX at 2.5 A resolution 提交 2007-10-30 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
413–527（115 aa）
链 G
653–794（142 aa）
链 H
413–527（115 aa）
链 H
653–794（142 aa）
|
未记录 | CNI 7-nitro-2,3-dioxo-2,3-dihydroquinoxaline-6-carbonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；40 mM Sodium citrate, 10 mM Ammonium sulfate, 1% PEG 400, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.283 |
| 3BBR Crystal structure of the iGluR2 ligand binding core (S1S2J-N775S) in complex with a dimeric positive modulator as well as glutamate at 2.25 A resolution 提交 2007-11-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding core
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding core
链 B
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding core
链 B
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding core
|
突变：N775S 突变：N775S 突变：N775S 突变：N775S | SO4 SULFATE ION × 5 CL CHLORIDE ION × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 2 BHY N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dimethanesulfonamide × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；280 K；0.3M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate, 25% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.231 |
| 3BFT Structure of the ligand-binding core of GluR2 in complex with the agonist (S)-TDPA at 2.25 A resolution 提交 2007-11-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：residues 1-263
链 A
653–796（144 aa）
片段：residues 1-263
链 C
413–527（115 aa）
片段：residues 1-263
链 C
653–796（144 aa）
片段：residues 1-263
|
未记录 | S2P (2S)-2-amino-3-(4-hydroxy-1,2,5-thiadiazol-3-yl)propanoic acid × 2 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 2000, cacodylate, zinc acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.250 |
| 3BFT Structure of the ligand-binding core of GluR2 in complex with the agonist (S)-TDPA at 2.25 A resolution 提交 2007-11-23 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：residues 1-263
链 B
653–796（144 aa）
片段：residues 1-263
|
未记录 | S2P (2S)-2-amino-3-(4-hydroxy-1,2,5-thiadiazol-3-yl)propanoic acid × 2 ZN ZINC ION × 6 NA SODIUM ION × 2 CAC CACODYLATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 2000, cacodylate, zinc acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.250 |
| 3BFU Structure of the ligand-binding core of GluR2 in complex with the agonist (R)-TDPA at 1.95 A resolution 提交 2007-11-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：residues 1-263
链 A
653–796（144 aa）
片段：residues 1-263
|
未记录 | R2P (2R)-2-amino-3-(4-hydroxy-1,2,5-thiadiazol-3-yl)propanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 2000, cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.233 |
| 3BFU Structure of the ligand-binding core of GluR2 in complex with the agonist (R)-TDPA at 1.95 A resolution 提交 2007-11-23 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：residues 1-263
链 B
653–796（144 aa）
片段：residues 1-263
|
未记录 | R2P (2R)-2-amino-3-(4-hydroxy-1,2,5-thiadiazol-3-yl)propanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 2000, cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.233 |
| 3BFU Structure of the ligand-binding core of GluR2 in complex with the agonist (R)-TDPA at 1.95 A resolution 提交 2007-11-23 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
片段：residues 1-263
链 C
653–796（144 aa）
片段：residues 1-263
|
未记录 | R2P (2R)-2-amino-3-(4-hydroxy-1,2,5-thiadiazol-3-yl)propanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 2000, cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.233 |
| 3BFU Structure of the ligand-binding core of GluR2 in complex with the agonist (R)-TDPA at 1.95 A resolution 提交 2007-11-23 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
413–527（115 aa）
片段：residues 1-263
链 D
653–796（144 aa）
片段：residues 1-263
|
未记录 | R2P (2R)-2-amino-3-(4-hydroxy-1,2,5-thiadiazol-3-yl)propanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；PEG 2000, cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.233 |
| 3BKI Crystal Structure of the GluR2 ligand binding core (S1S2J) in complex with FQX at 1.87 Angstroms 提交 2007-12-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 P
413–527（115 aa）
链 P
653–796（144 aa）
|
未记录 | FQX [1,2,5]oxadiazolo[3,4-g]quinoxaline-6,7(5H,8H)-dione 1-oxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.221 |
| 3BKI Crystal Structure of the GluR2 ligand binding core (S1S2J) in complex with FQX at 1.87 Angstroms 提交 2007-12-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–796（144 aa）
|
未记录 | FQX [1,2,5]oxadiazolo[3,4-g]quinoxaline-6,7(5H,8H)-dione 1-oxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.221 |
| 3BKI Crystal Structure of the GluR2 ligand binding core (S1S2J) in complex with FQX at 1.87 Angstroms 提交 2007-12-06 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–796（144 aa）
|
未记录 | FQX [1,2,5]oxadiazolo[3,4-g]quinoxaline-6,7(5H,8H)-dione 1-oxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.221 |
| 3BKI Crystal Structure of the GluR2 ligand binding core (S1S2J) in complex with FQX at 1.87 Angstroms 提交 2007-12-06 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
413–527（115 aa）
链 D
653–796（144 aa）
|
未记录 | FQX [1,2,5]oxadiazolo[3,4-g]quinoxaline-6,7(5H,8H)-dione 1-oxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.221 |
| 3DP6 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to glutamate 提交 2008-07-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 A
653–796（144 aa）
片段：S1S2 binding domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；14-17% PEG 8000, 0.1-0.2 M Zn acetate, 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.50
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.244 |
| 3DP6 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to glutamate 提交 2008-07-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 B
653–796（144 aa）
片段：S1S2 binding domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；14-17% PEG 8000, 0.1-0.2 M Zn acetate, 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.50
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.244 |
| 3DP6 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to glutamate 提交 2008-07-07 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 C
653–796（144 aa）
片段：S1S2 binding domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；277 K；14-17% PEG 8000, 0.1-0.2 M Zn acetate, 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.50
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.244 |
| 3H03 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to UBP277 提交 2009-04-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 A
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 B
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 B
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | UBP 3-[3-(2-carboxyethyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl]-L-alanine × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-16% PEG8K, 0.1-0.15 M Zn acetate, 0.25 M ammonium sulfate, 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.258 |
| 3H03 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to UBP277 提交 2009-04-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 D
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 G
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 G
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | UBP 3-[3-(2-carboxyethyl)-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl]-L-alanine × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-16% PEG8K, 0.1-0.15 M Zn acetate, 0.25 M ammonium sulfate, 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.258 |
| 3H06 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to the willardiine antagonist, UBP282 提交 2009-04-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 G
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | VBP 4-({3-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxo-3,6-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15-17% PEG8K, 0.2 M Na acetate, 0.2 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3H06 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to the willardiine antagonist, UBP282 提交 2009-04-08 | Assembly 10 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 E
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 P
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 P
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | VBP 4-({3-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxo-3,6-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15-17% PEG8K, 0.2 M Na acetate, 0.2 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3H06 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to the willardiine antagonist, UBP282 提交 2009-04-08 | Assembly 11 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 G
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 J
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 J
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | VBP 4-({3-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxo-3,6-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15-17% PEG8K, 0.2 M Na acetate, 0.2 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3H06 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to the willardiine antagonist, UBP282 提交 2009-04-08 | Assembly 12 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 H
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 L
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 L
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | VBP 4-({3-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxo-3,6-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15-17% PEG8K, 0.2 M Na acetate, 0.2 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3H06 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to the willardiine antagonist, UBP282 提交 2009-04-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 B
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | VBP 4-({3-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxo-3,6-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15-17% PEG8K, 0.2 M Na acetate, 0.2 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3H06 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to the willardiine antagonist, UBP282 提交 2009-04-08 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 E
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | VBP 4-({3-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxo-3,6-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15-17% PEG8K, 0.2 M Na acetate, 0.2 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3H06 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to the willardiine antagonist, UBP282 提交 2009-04-08 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 H
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | VBP 4-({3-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxo-3,6-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15-17% PEG8K, 0.2 M Na acetate, 0.2 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3H06 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to the willardiine antagonist, UBP282 提交 2009-04-08 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 J
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 J
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | VBP 4-({3-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxo-3,6-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15-17% PEG8K, 0.2 M Na acetate, 0.2 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3H06 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to the willardiine antagonist, UBP282 提交 2009-04-08 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 L
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 L
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | VBP 4-({3-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxo-3,6-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15-17% PEG8K, 0.2 M Na acetate, 0.2 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3H06 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to the willardiine antagonist, UBP282 提交 2009-04-08 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 N
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 N
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | VBP 4-({3-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxo-3,6-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15-17% PEG8K, 0.2 M Na acetate, 0.2 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3H06 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to the willardiine antagonist, UBP282 提交 2009-04-08 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 P
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 P
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | VBP 4-({3-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxo-3,6-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15-17% PEG8K, 0.2 M Na acetate, 0.2 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3H06 Crystal structure of the binding domain of the AMPA subunit GluR2 bound to the willardiine antagonist, UBP282 提交 2009-04-08 | Assembly 9 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 B
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 N
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 N
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | VBP 4-({3-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-2,6-dioxo-3,6-dihydropyrimidin-1(2H)-yl}methyl)benzoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；15-17% PEG8K, 0.2 M Na acetate, 0.2 M Na cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.295 |
| 3H5V Crystal structure of the GluR2-ATD 提交 2009-04-22 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
0–383（384 aa）
片段：UNP residues 21-404
链 B
0–383（384 aa）
片段：UNP residues 21-404
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；14-16% PEG3350, 100mM TrisHCl, 10mM MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.235 |
| 3H5V Crystal structure of the GluR2-ATD 提交 2009-04-22 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
0–383（384 aa）
片段：UNP residues 21-404
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；14-16% PEG3350, 100mM TrisHCl, 10mM MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.235 |
| 3H5W Crystal structure of the GluR2-ATD in space group P212121 without solvent 提交 2009-04-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
0–383（384 aa）
片段：UNP residues 21-404
链 B
0–383（384 aa）
片段：UNP residues 21-404
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20% PEG3000, 100mM tri-sodium citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.291 |
| 3H6T Crystal structure of the iGluR2 ligand-binding core (S1S2J-N754S) in complex with glutamate and cyclothiazide at 2.25 A resolution 提交 2009-04-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
链 C
413–527（115 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
链 C
653–796（144 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
|
突变：N754S 突变：N754S 突变：N754S 突变：N754S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 2 ZN ZINC ION × 5 GOL GLYCEROL × 6 ACT ACETATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；279 K；25 % PEG 4000, 0.3 M Zinc acetate, 0.1 M Cacodylate pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.228 |
| 3H6T Crystal structure of the iGluR2 ligand-binding core (S1S2J-N754S) in complex with glutamate and cyclothiazide at 2.25 A resolution 提交 2009-04-24 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
|
突变：N754S 突变：N754S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 2 ZN ZINC ION × 10 GOL GLYCEROL × 6 CAC CACODYLATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；279 K；25 % PEG 4000, 0.3 M Zinc acetate, 0.1 M Cacodylate pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.228 |
| 3H6U Crystal structure of the iGluR2 ligand-binding core (S1S2J-N754S) in complex with glutamate and NS1493 at 1.85 A resolution 提交 2009-04-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
|
突变：N754S 突变：N754S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 NS3 (3S)-3-cyclopentyl-6-methyl-7-[(4-methylpiperazin-1-yl)sulfonyl]-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 2 SO4 SULFATE ION × 12 GOL GLYCEROL × 4 FLC CITRATE ANION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；279 K；25 % PEG 8000, 0.1 M Lithium sulfate, 0.1 M Phosphate-citrate pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.215 |
| 3H6V Crystal structure of the iGluR2 ligand-binding core (S1S2J-N754S) in complex with glutamate and NS5206 at 2.10 A resolution 提交 2009-04-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
链 B
413–527（115 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
|
突变：N754S 突变：N754S 突变：N754S 突变：N754S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 NS6 (3R)-3-cyclopentyl-7-[(4-methylpiperazin-1-yl)sulfonyl]-3,4-dihydro-2H-1,2-benzothiazine 1,1-dioxide × 2 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 7 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；279 K；20 % PEG 4000, 0.3 M Lithium sulfate, 0.1 M Phosphate-citrate pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.228 |
| 3H6W Crystal structure of the iGluR2 ligand-binding core (S1S2J-N754S) in complex with glutamate and NS5217 at 1.50 A resolution 提交 2009-04-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
|
突变：N754S 突变：N754S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 NS7 (3R)-3-cyclopentyl-6-methyl-7-[(4-methylpiperazin-1-yl)sulfonyl]-3,4-dihydro-2H-1,2-benzothiazine 1,1-dioxide × 2 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；20 % PEG 4000, 0.1 M Ammonium sulfate, 0.1 M Cacodylate pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.232 |
| 3H6W Crystal structure of the iGluR2 ligand-binding core (S1S2J-N754S) in complex with glutamate and NS5217 at 1.50 A resolution 提交 2009-04-24 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：iGluR2-flop ligand-binding core: UNP residues 413-796
|
突变：N754S 突变：N754S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 NS7 (3R)-3-cyclopentyl-6-methyl-7-[(4-methylpiperazin-1-yl)sulfonyl]-3,4-dihydro-2H-1,2-benzothiazine 1,1-dioxide × 2 SO4 SULFATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；20 % PEG 4000, 0.1 M Ammonium sulfate, 0.1 M Cacodylate pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.232 |
| 3HSY High resolution structure of a dimeric GluR2 N-terminal domain (NTD) 提交 2009-06-11 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
25–400（376 aa）
片段：N-terminal Domain, UNP residues 25-400
链 B
25–400（376 aa）
片段：N-terminal Domain, UNP residues 25-400
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；293 K；200mM ammonium phosphatre, 20% PEG3350, pH4.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.205 |
| 3IJO Crystal structure of the AMPA subunit GluR2 bound to the allosteric modulator, althiazide 提交 2009-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
链 B
653–794（142 aa）
链 E
414–527（114 aa）
链 E
653–794（142 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 B4D (3S)-6-chloro-3-[(prop-2-en-1-ylsulfanyl)methyl]-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine-7-sulfonamide 1,1-dioxide × 2 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18 PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 zinc acetate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 3IJO Crystal structure of the AMPA subunit GluR2 bound to the allosteric modulator, althiazide 提交 2009-08-04 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
414–527（114 aa）
链 H
653–794（142 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 B4D (3S)-6-chloro-3-[(prop-2-en-1-ylsulfanyl)methyl]-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine-7-sulfonamide 1,1-dioxide × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18 PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 zinc acetate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 3IJX Crystal structure of the AMPA subunit GluR2 bound to the allosteric modulator, hydrochlorothiazide 提交 2009-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
链 B
653–794（142 aa）
链 D
414–527（114 aa）
链 D
653–794（142 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 HCZ 6-chloro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine-7-sulfonamide 1,1-dioxide × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18 PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 zinc acetate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.257 |
| 3IJX Crystal structure of the AMPA subunit GluR2 bound to the allosteric modulator, hydrochlorothiazide 提交 2009-08-05 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
414–527（114 aa）
链 H
653–794（142 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 HCZ 6-chloro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine-7-sulfonamide 1,1-dioxide × 2 ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18 PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 zinc acetate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.257 |
| 3IK6 Crystal structure of the AMPA subunit GluR2 bound to the allosteric modulator, chlorothiazide 提交 2009-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 B
653–794（142 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 E
414–527（114 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 E
653–794（142 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 H
414–527（114 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 H
653–794（142 aa）
片段：S1S2 binding domain
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 3 HCZ 6-chloro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine-7-sulfonamide 1,1-dioxide × 3 ZN ZINC ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18 PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 zinc acetate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.245 |
| 3IL1 Crystal structure of the AMPA subunit GluR2 bound to the allosteric modulator, IDRA-21 提交 2009-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 B
653–794（142 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 E
414–527（114 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 E
653–794（142 aa）
片段：S1S2 binding domain
|
突变：N242S 突变：N242S 突变：N242S 突变：N242S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 3 B5D (3S)-7-chloro-3-methyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18 PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 zinc acetate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 3IL1 Crystal structure of the AMPA subunit GluR2 bound to the allosteric modulator, IDRA-21 提交 2009-08-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
414–527（114 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 H
653–794（142 aa）
片段：S1S2 binding domain
|
突变：N242S 突变：N242S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 4 B5D (3S)-7-chloro-3-methyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18 PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 zinc acetate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 3ILT Crystal structure of the AMPA subunit GluR2 bound to the allosteric modulator, trichlormethiazide 提交 2009-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 B
653–794（142 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 E
414–527（114 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 E
653–794（142 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 H
414–527（114 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 H
653–794（142 aa）
片段：S1S2 binding domain
|
突变：N242S 突变：N242S 突变：N242S 突变：N242S 突变：N242S 突变：N242S | GLU GLUTAMIC ACID × 3 ZN ZINC ION × 5 TRU 6-CHLORO-3-(DICHLOROMETHYL)-3,4-DIHYDRO-2H-1,2,4-BENZOTHIADIAZINE-7-SULFONAMIDE 1,1-DIOXIDE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18 PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 zinc acetate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.261 |
| 3ILU Crystal structure of the AMPA subunit GluR2 bound to the allosteric modulator, hydroflumethiazide 提交 2009-08-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 B
653–794（142 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 E
414–527（114 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 E
653–794（142 aa）
片段：S1S2 binding domain
|
突变：N242S 突变：N242S 突变：N242S 突变：N242S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 HFZ 6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine-7-sulfonamide 1,1-dioxide × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18 PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 zinc acetate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.226 |
| 3ILU Crystal structure of the AMPA subunit GluR2 bound to the allosteric modulator, hydroflumethiazide 提交 2009-08-07 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
414–527（114 aa）
片段：S1S2 binding domain
链 H
653–794（142 aa）
片段：S1S2 binding domain
|
突变：N242S 突变：N242S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 HFZ 6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine-7-sulfonamide 1,1-dioxide × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18 PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 zinc acetate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.226 |
| 3KG2 AMPA subtype ionotropic glutamate receptor in complex with competitive antagonist ZK 200775 提交 2009-10-28 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
片段：sequence database residues 25-847
链 B
25–847（823 aa）
片段：sequence database residues 25-847
链 C
25–847（823 aa）
片段：sequence database residues 25-847
链 D
25–847（823 aa）
片段：sequence database residues 25-847
|
突变：N241E, N385D, N392Q, K410A, E413A, M414A, E416A, and C589A 突变：N241E, N385D, N392Q, K410A, E413A, M414A, E416A, and C589A 突变：N241E, N385D, N392Q, K410A, E413A, M414A, E416A, and C589A 突变：N241E, N385D, N392Q, K410A, E413A, M414A, E416A, and C589A | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
277 K；Under paraffin oil, temperature 277K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.296 |
| 3KGC Isolated ligand binding domain dimer of GluA2 ionotropic glutamate receptor in complex with glutamate, LY 404187 and ZK 200775 提交 2009-10-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
414–527（114 aa）
片段：extracellular domains residues 414-527 and 653-795
链 A
654–795（142 aa）
片段：extracellular domains residues 414-527 and 653-795
链 B
414–527（114 aa）
片段：extracellular domains residues 414-527 and 653-795
链 B
654–795（142 aa）
片段：extracellular domains residues 414-527 and 653-795
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 2 LY7 N-[(2S)-2-(4'-cyanobiphenyl-4-yl)propyl]propane-2-sulfonamide × 1 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；19% PEG 4000, 0.3 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.224 |
| 3LSF Piracetam bound to the ligand binding domain of GluA2 提交 2010-02-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
链 B
653–794（142 aa）
链 E
414–527（114 aa）
链 E
653–794（142 aa）
|
突变：N242S 突变：N242S 突变：N242S 突变：N242S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 PZI 2-(2-oxopyrrolidin-1-yl)acetamide × 4 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18% PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.228 |
| 3LSF Piracetam bound to the ligand binding domain of GluA2 提交 2010-02-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
414–527（114 aa）
链 H
653–794（142 aa）
|
突变：N242S 突变：N242S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 PZI 2-(2-oxopyrrolidin-1-yl)acetamide × 4 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18% PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.228 |
| 3LSL Piracetam bound to the ligand binding domain of GluA2 (flop form) 提交 2010-02-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
414–527（114 aa）
链 A
653–794（142 aa）
链 D
414–527（114 aa）
链 D
653–794（142 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 PZI 2-(2-oxopyrrolidin-1-yl)acetamide × 6 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18% PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.263 |
| 3LSL Piracetam bound to the ligand binding domain of GluA2 (flop form) 提交 2010-02-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
414–527（114 aa）
链 G
653–794（142 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 PZI 2-(2-oxopyrrolidin-1-yl)acetamide × 6 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18% PEG8K, 0.1 M Na Cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.263 |
| 3M3L PEPA bound to the ligand binding domain of GluA2 (flop form) 提交 2010-03-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 A
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 D
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 D
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 P99 2-[2,6-difluoro-4-({2-[(phenylsulfonyl)amino]ethyl}sulfanyl)phenoxy]acetamide × 1 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG 8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.242 |
| 3M3L PEPA bound to the ligand binding domain of GluA2 (flop form) 提交 2010-03-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
414–527（114 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
链 G
653–794（142 aa）
片段：UNP residues 414-527, 652-794
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 P99 2-[2,6-difluoro-4-({2-[(phenylsulfonyl)amino]ethyl}sulfanyl)phenoxy]acetamide × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG 8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.242 |
| 3N6V Structure of the GluA2 NTD-dimer interface mutant, T78A 提交 2010-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
27–400（374 aa）
片段：N-terminal domain
链 B
27–400（374 aa）
片段：N-terminal domain
|
突变：T78A 突变：T78A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；100mM Tris, 200mM MgCl2, 20% PEG 8000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.265 |
| 3N6V Structure of the GluA2 NTD-dimer interface mutant, T78A 提交 2010-05-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
27–400（374 aa）
片段：N-terminal domain
链 D
27–400（374 aa）
片段：N-terminal domain
|
突变：T78A 突变：T78A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；100mM Tris, 200mM MgCl2, 20% PEG 8000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.265 |
| 3N6V Structure of the GluA2 NTD-dimer interface mutant, T78A 提交 2010-05-26 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
27–400（374 aa）
片段：N-terminal domain
链 F
27–400（374 aa）
片段：N-terminal domain
|
突变：T78A 突变：T78A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；100mM Tris, 200mM MgCl2, 20% PEG 8000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.265 |
| 3O28 Ligand-binding domain of GluA2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator 提交 2010-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413 to 527 and 653 to 796
链 A
653–795（143 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413 to 527 and 653 to 796
|
未记录 | O28 2-({[3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-indazol-1-yl]acetyl}amino)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophene-3-carboxamide × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GOL GLYCEROL × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；16% PEG 8000, 100mM Sodium Cacodylate pH 4.5, 50mM Lithium Sulphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 3O29 Ligand-binding domain of GluA2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator 提交 2010-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413 to 527 and 653 to 796
链 A
653–795（143 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413 to 527 and 653 to 796
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 8 O29 N-[2-(dimethylamino)ethyl]-2-({[3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-indazol-1-yl]acetyl}amino)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophene-3-carboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；12% PEG 4000, 100mM Sodium Cacodylate pH 4.5, 50mM Lithium Sulphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.250 |
| 3O2A Ligand-binding domain of GluA2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator 提交 2010-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413 to 527 and 653 to 796
链 A
653–795（143 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413 to 527 and 653 to 796
|
未记录 | O30 N-(3-aminopropyl)-2-({[3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-indazol-1-yl]acetyl}amino)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophene-3-carboxamide × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；18% PEG 4000, 100mM Sodium Cacodylate pH 4.5, 50mM Lithium Sulphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.217 |
| 3O2J Structure of the GluA2 NTD-dimer interface mutant, N54A 提交 2010-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
22–400（379 aa）
片段：N-terminal domain
链 B
22–400（379 aa）
片段：N-terminal domain
|
突变：N54A 突变：N54A | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；18% PEG 3350, 100mM sodium citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.247 |
| 3O6G Ligand-binding domain of GluA2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator 提交 2010-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413 to 527 and 653 to 796
链 A
653–795（143 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413 to 527 and 653 to 796
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 6 O27 N-[(3R)-pyrrolidin-3-yl]-2-({[3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-indazol-1-yl]acetyl}amino)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophene-3-carboxamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；17% PEG 4000, 100mM Sodium Cacodylate pH 4.0, 50mM Lithium Sulphate, 2.5% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.223 |
| 3O6H Ligand-binding domain of GluA2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator 提交 2010-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413 to 527 and 653 to 796
链 A
653–795（143 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413 to 527 and 653 to 796
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 6 O25 2-[({4-[(ethylamino)methyl]-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-1-yl}acetyl)amino]-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophene-3-carboxamide × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；18% PEG 4000, 100mM Sodium Cacodylate pH 4.0, 50mM Lithium Sulphate, 5% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.263 |
| 3O6I Ligand-binding domain of GluA2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator 提交 2010-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413 to 527 and 653 to 796
链 A
653–795（143 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413 to 527 and 653 to 796
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 O26 2-[({3-tert-butyl-4-[(methylamino)methyl]-1H-pyrazol-1-yl}acetyl)amino]-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophene-3-carboxamide × 2 SO4 SULFATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.3；277 K；18% PEG 4000, 50mM Lithium sulphate, 2.5% Glycerol, 100mM Sodium Cacodylate pH 4.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.247 |
| 3PD8 X-ray structure of the ligand-binding core of GluA2 in complex with (S)-7-HPCA at 2.5 A resolution 提交 2010-10-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-795
链 A
653–795（143 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-795
链 B
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-795
链 B
653–795（143 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-795
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 HA7 (7S)-3-hydroxy-4,5,6,7-tetrahydroisoxazolo[5,4-c]pyridine-7-carboxylic acid × 2 GOL GLYCEROL × 1 ACY ACETIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；280 K；PEG4000, zinc acetate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.261 |
| 3PD8 X-ray structure of the ligand-binding core of GluA2 in complex with (S)-7-HPCA at 2.5 A resolution 提交 2010-10-22 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-795
链 C
653–795（143 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-795
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 HA7 (7S)-3-hydroxy-4,5,6,7-tetrahydroisoxazolo[5,4-c]pyridine-7-carboxylic acid × 2 CAC CACODYLATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；280 K；PEG4000, zinc acetate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.261 |
| 3PD9 X-ray structure of the ligand-binding core of GluA2 in complex with (R)-5-HPCA at 2.1 A resolution 提交 2010-10-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-795
链 A
653–795（143 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-795
链 B
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-795
链 B
653–795（143 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-795
|
未记录 | HA5 (5R)-3-hydroxy-4,5,6,7-tetrahydroisoxazolo[5,4-c]pyridine-5-carboxylic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 5 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；280 K；PEG4000, ammonium sulfate, acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.233 |
| 3PMV Ligand-binding domain of GluA2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator 提交 2010-11-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, residues 413 to 527 and 653 to 796
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, residues 413 to 527 and 653 to 796
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 10 557 N-[(2S)-2-{4-[4-(hydroxymethyl)-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-1-yl]phenyl}propyl]propane-2-sulfonamide × 2 GOL GLYCEROL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；18% PEG 4000, 50mM Lithium Sulphate, 2.5% Glycerol, 100mM Sodium Cacodylate pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 3PMW Ligand-binding domain of GluA2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator 提交 2010-11-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, residues 413 to 527 and 653 to 796
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, residues 413 to 527 and 653 to 796
|
突变：S1-S2 fusion in which Gly118 and Thr119 replace a membrane-spanning region 突变：S1-S2 fusion in which Gly118 and Thr119 replace a membrane-spanning region | GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 14 GOL GLYCEROL × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 G69 N-[(2S)-5-{[4-(hydroxymethyl)-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-1-yl]methyl}-2,3-dihydro-1H-inden-2-yl]propane-2-sulfonami de × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；18% PEG 4000, 50mM Lithium Sulphate, 2.5% Glycerol, 100mM Sodium Cacodylate pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.313 |
| 3PMX Ligand-binding domain of GluA2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator 提交 2010-11-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, residues 413 to 527 and 653 to 796
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, residues 413 to 527 and 653 to 796
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 8 GOL GLYCEROL × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 808 N-[(2S)-5-{[5-(trifluoromethyl)furan-2-yl]methyl}-2,3-dihydro-1H-inden-2-yl]propane-2-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；18% PEG 4000, 50mM Lithium Sulphate, 2.5% Glycerol, 100mM Sodium Cacodylate pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.281 |
| 3RTF Chlorowillardiine bound to the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-05-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
未记录 | CWD 3-(5-chloro-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-L-alanine × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.203 |
| 3RTF Chlorowillardiine bound to the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-05-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 F
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
未记录 | CWD 3-(5-chloro-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-L-alanine × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.203 |
| 3RTW Nitrowillardiine bound to the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-05-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
未记录 | NWD 3-(5-nitro-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-L-alanine × 2 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.259 |
| 3RTW Nitrowillardiine bound to the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-05-04 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 F
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
未记录 | NWD 3-(5-nitro-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-L-alanine × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.259 |
| 3T93 Glutamate bound to a double cysteine mutant (A452C/S652C) of the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-08-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.229 |
| 3T93 Glutamate bound to a double cysteine mutant (A452C/S652C) of the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-08-02 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 F
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.229 |
| 3T96 Iodowillardiine bound to a double cysteine mutant (A452C/S652C) of the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-08-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C | IWD 2-AMINO-3-(5-IODO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.219 |
| 3T96 Iodowillardiine bound to a double cysteine mutant (A452C/S652C) of the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-08-02 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 F
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C | IWD 2-AMINO-3-(5-IODO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.219 |
| 3T9H Kainate bound to a double cysteine mutant (A452C/S652C) of the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-08-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.235 |
| 3T9H Kainate bound to a double cysteine mutant (A452C/S652C) of the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-08-02 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 F
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.235 |
| 3T9U CNQX bound to an oxidized double cysteine mutant (A452C/S652C) of the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-08-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 A
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C | CNI 7-nitro-2,3-dioxo-2,3-dihydroquinoxaline-6-carbonitrile × 2 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.219 |
| 3T9U CNQX bound to an oxidized double cysteine mutant (A452C/S652C) of the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-08-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 C
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C | CNI 7-nitro-2,3-dioxo-2,3-dihydroquinoxaline-6-carbonitrile × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.219 |
| 3T9V CNQX bound to a reduced double cysteine mutant (A452C/S652C) of the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-08-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 A
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C 突变：A473C/S673C | CNI 7-nitro-2,3-dioxo-2,3-dihydroquinoxaline-6-carbonitrile × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.238 |
| 3T9X Glutamate bound to a double cysteine mutant (V484C/E657C) of the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-08-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 F
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 F
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：V505C/E678C 突变：V505C/E678C 突变：V505C/E678C 突变：V505C/E678C | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.240 |
| 3T9X Glutamate bound to a double cysteine mutant (V484C/E657C) of the ligand binding domain of GluA2 提交 2011-08-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
414–527（114 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
653–794（142 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：V505C/E678C 突变：V505C/E678C | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14-15% PEG8000, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.240 |
| 3TDJ Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J-L483Y-N754S) in complex with glutamate and BPAM-97 at 1.95 A resolution 提交 2011-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413-527 and 653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413-527 and 653-796
链 B
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413-527 and 653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 413-527 and 653-796
|
突变：L483Y, N754S 突变：L483Y, N754S 突变：L483Y, N754S 突变：L483Y, N754S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 5 GOL GLYCEROL × 11 3TJ 4-ethyl-7-fluoro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；15.2% PEG4000, 0.3 M lithium sulfate and 0.1 M phosphate-citrate., pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.215 |
| 3TKD Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J-L483Y-N754S) in complex with glutamate and cyclothiazide at 1.45 A resolution 提交 2011-08-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain
链 A
653–795（143 aa）
片段：Ligand binding domain
链 B
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain
链 B
653–795（143 aa）
片段：Ligand binding domain
|
突变：L483Y, N754S 突变：L483Y, N754S 突变：L483Y, N754S 突变：L483Y, N754S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 2 SO4 SULFATE ION × 8 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；20% PEG4000, 0.3M ammonium sulfate, 0.1M phosphate-citrate pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.180 |
| 3TZA Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the antagonist (S)-2-amino-3-(2-(2-carboxyethyl)-5-chloro-4-nitrophenyl)propionic acid at 1.9A resolution 提交 2011-09-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP resiudes 413-527,UNP residues 653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP resiudes 413-527,UNP residues 653-796
链 B
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP resiudes 413-527,UNP residues 653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP resiudes 413-527,UNP residues 653-796
|
未记录 | TZG (S)-2-amino-3-(2-(2-carboxyethyl)-5-chloro-4-nitrophenyl)propionic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；15.2% PEG4000, 0.1M ammonium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.230 |
| 4FAT Ligand-binding domain of GluA2 (flip) ionotropic glutamate receptor in complex with an allosteric modulator 提交 2012-05-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：ligand binding domain
链 A
653–796（144 aa）
片段：ligand binding domain
|
突变：delta 528-652 突变：delta 528-652 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 496 2-({[4-(hydroxymethyl)-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-1-yl]acetyl}amino)-4,5,6,7-tetrahydro-1-benzothiophene-3-carboxamide × 2 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 8 LI LITHIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.1；298 K；18% PEG 4000, 50mM Lithium Sulphate, 100mM Sodium Cacodylate, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.209 |
| 4G8M Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the agonist CBG-IV at 2.05A resolution 提交 2012-07-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-796
链 B
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-796
|
未记录 | G8M (1S,2R)-2-[(S)-amino(carboxy)methyl]cyclobutanecarboxylic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 7 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；24.4% PEG4000, 0.3M lithium sulfate, 0.1M phosphate-citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.228 |
| 4G8M Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the agonist CBG-IV at 2.05A resolution 提交 2012-07-23 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-796
链 B
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：UNP residues 413-527, 653-796
|
未记录 | G8M (1S,2R)-2-[(S)-amino(carboxy)methyl]cyclobutanecarboxylic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 7 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；24.4% PEG4000, 0.3M lithium sulfate, 0.1M phosphate-citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.228 |
| 4GXS Ligand binding domain of GluA2 (AMPA/glutamate receptor) bound to (-)-kaitocephalin 提交 2012-09-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
片段：UNP Residues 652-794
链 B
653–794（142 aa）
片段：UNP Residues 652-794
链 D
414–527（114 aa）
片段：UNP Residues 652-794
链 D
653–794（142 aa）
片段：UNP Residues 652-794
|
未记录 | 0YS (5R)-2-[(1S,2R)-2-amino-2-carboxy-1-hydroxyethyl]-5-{(2S)-2-carboxy-2-[(3,5-dichloro-4-hydroxybenzoyl)amino]ethyl}-L-proline × 2 ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16-18% PEG 8K, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.225 |
| 4H8J Structure of GluA2-LBD in complex with MES 提交 2012-09-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 A
653–797（145 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
413–527（115 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
653–797（145 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；23-27% w/v PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, MES sodium, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.221 |
| 4H8J Structure of GluA2-LBD in complex with MES 提交 2012-09-22 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 C
653–797（145 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
413–527（115 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 D
653–797（145 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；23-27% w/v PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, MES sodium, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.221 |
| 4IGT Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the agonist ZA302 at 1.24A resolution 提交 2012-12-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand-binding domain, UNP RESIDUES 413-527, 653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand-binding domain, UNP RESIDUES 413-527, 653-796
|
未记录 | 3ZA (4R)-4-{3-[hydroxy(methyl)amino]-3-oxopropyl}-L-glutamic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 6 LI LITHIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；15.2% PEG 4000, 0.1M Li2SO4, 0.1M phosphate-citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.155 |
| 4ISU Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the antagonist (2R)-IKM-159 at 2.3A resolution. 提交 2013-01-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand-binding domain
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand-binding domain
链 C
413–527（115 aa）
片段：Ligand-binding domain
链 C
653–796（144 aa）
片段：Ligand-binding domain
|
未记录 | IKM (4aS,5aR,6R,8aS,8bS)-5a-(carboxymethyl)-8-oxo-2,4a,5a,6,7,8,8a,8b-octahydro-1H-pyrrolo[3',4':4,5]furo[3,2-b]pyridine-6-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；20% PEG4000, 0.1M Lithium sulfate, 0.1M phosphate-citrate pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 4ISU Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the antagonist (2R)-IKM-159 at 2.3A resolution. 提交 2013-01-17 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：Ligand-binding domain
链 B
653–796（144 aa）
片段：Ligand-binding domain
链 D
413–527（115 aa）
片段：Ligand-binding domain
链 D
653–796（144 aa）
片段：Ligand-binding domain
|
未记录 | IKM (4aS,5aR,6R,8aS,8bS)-5a-(carboxymethyl)-8-oxo-2,4a,5a,6,7,8,8a,8b-octahydro-1H-pyrrolo[3',4':4,5]furo[3,2-b]pyridine-6-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；20% PEG4000, 0.1M Lithium sulfate, 0.1M phosphate-citrate pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 4ISU Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the antagonist (2R)-IKM-159 at 2.3A resolution. 提交 2013-01-17 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand-binding domain
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand-binding domain
|
未记录 | IKM (4aS,5aR,6R,8aS,8bS)-5a-(carboxymethyl)-8-oxo-2,4a,5a,6,7,8,8a,8b-octahydro-1H-pyrrolo[3',4':4,5]furo[3,2-b]pyridine-6-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；20% PEG4000, 0.1M Lithium sulfate, 0.1M phosphate-citrate pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 4ISU Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the antagonist (2R)-IKM-159 at 2.3A resolution. 提交 2013-01-17 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
413–527（115 aa）
片段：Ligand-binding domain
链 D
653–796（144 aa）
片段：Ligand-binding domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；20% PEG4000, 0.1M Lithium sulfate, 0.1M phosphate-citrate pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 4ISU Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the antagonist (2R)-IKM-159 at 2.3A resolution. 提交 2013-01-17 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
片段：Ligand-binding domain
链 C
653–796（144 aa）
片段：Ligand-binding domain
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；20% PEG4000, 0.1M Lithium sulfate, 0.1M phosphate-citrate pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 4ISU Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the antagonist (2R)-IKM-159 at 2.3A resolution. 提交 2013-01-17 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：Ligand-binding domain
链 B
653–796（144 aa）
片段：Ligand-binding domain
|
未记录 | IKM (4aS,5aR,6R,8aS,8bS)-5a-(carboxymethyl)-8-oxo-2,4a,5a,6,7,8,8a,8b-octahydro-1H-pyrrolo[3',4':4,5]furo[3,2-b]pyridine-6-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；20% PEG4000, 0.1M Lithium sulfate, 0.1M phosphate-citrate pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 4IY5 Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (S1S2J-L483Y-N754S) in complex with glutamate and CX516 at 2.0 A resolution 提交 2013-01-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP RESIDUES 413-527, 653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP RESIDUES 413-527, 653-796
链 B
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP RESIDUES 413-527, 653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP RESIDUES 413-527, 653-796
|
突变：L94Y, N242S 突变：L94Y, N242S 突变：L94Y, N242S 突变：L94Y, N242S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 3 CX5 piperidin-1-yl(quinoxalin-6-yl)methanone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；24.4% PEG 4000, 0.3M lithium sulfate, 0.1M phosphate-citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.200 |
| 4IY6 Crystal structure of the GLUA2 ligand-binding domain (S1S2J-L483Y-N754S) in complex with glutamate and ME-CX516 at 1.72 A resolution 提交 2013-01-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP RESIDUES 413-527, 653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP RESIDUES 413-527, 653-796
|
突变：L94Y, N242S 突变：L94Y, N242S | MQR [(3R)-3-methylpiperidin-1-yl](quinoxalin-6-yl)methanone × 2 MQS [(3S)-3-methylpiperidin-1-yl](quinoxalin-6-yl)methanone × 4 GLU GLUTAMIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；15.2% PEG 4000, 0.3M lithium sulfate, 0.1M sodium acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.168 |
| 4L17 GluA2-L483Y-A665C ligand-binding domain in complex with the antagonist DNQX 提交 2013-06-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain (UNP residues 413-527, 653-796)
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain (UNP residues 413-527, 653-796)
链 C
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain (UNP residues 413-527, 653-796)
链 C
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain (UNP residues 413-527, 653-796)
|
突变：L94Y, A153C 突变：L94Y, A153C 突变：L94Y, A153C 突变：L94Y, A153C | DNQ 6,7-DINITROQUINOXALINE-2,3-DIONE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；19% PEG 1450, 0.3M lithium sulfate, 0.1M cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 4L17 GluA2-L483Y-A665C ligand-binding domain in complex with the antagonist DNQX 提交 2013-06-02 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain (UNP residues 413-527, 653-796)
链 E
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain (UNP residues 413-527, 653-796)
|
突变：L94Y, A153C 突变：L94Y, A153C | DNQ 6,7-DINITROQUINOXALINE-2,3-DIONE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；19% PEG 1450, 0.3M lithium sulfate, 0.1M cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 4L17 GluA2-L483Y-A665C ligand-binding domain in complex with the antagonist DNQX 提交 2013-06-02 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain (UNP residues 413-527, 653-796)
链 G
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain (UNP residues 413-527, 653-796)
|
突变：L94Y, A153C 突变：L94Y, A153C | DNQ 6,7-DINITROQUINOXALINE-2,3-DIONE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；19% PEG 1450, 0.3M lithium sulfate, 0.1M cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 4LZ5 Crystal structures of GLuR2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators 提交 2013-07-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
404–527（124 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 A
653–796（144 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 C
404–527（124 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 C
653–796（144 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：G389R,L390G,E391A 突变：G389R,L390G,E391A 突变：G389R,L390G,E391A 突变：G389R,L390G,E391A | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 2 1YV N-[(2R)-2-(4'-cyanobiphenyl-4-yl)propyl]propane-2-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1 uL 7 mg/mL protein in 10 mM (S)-Glu, 10 mM HEPES, pH 7.5, 20 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 150 uM ligand (from 30 mM DMSO stock) + 1 uL reservoir (10% PEG8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5), crystals appeared in 3-5 days, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.203 |
| 4LZ5 Crystal structures of GLuR2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators 提交 2013-07-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
404–527（124 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
653–796（144 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：G389R,L390G,E391A 突变：G389R,L390G,E391A | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 6 1YV N-[(2R)-2-(4'-cyanobiphenyl-4-yl)propyl]propane-2-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1 uL 7 mg/mL protein in 10 mM (S)-Glu, 10 mM HEPES, pH 7.5, 20 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 150 uM ligand (from 30 mM DMSO stock) + 1 uL reservoir (10% PEG8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5), crystals appeared in 3-5 days, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.203 |
| 4LZ7 Crystal structures of GLuR2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators 提交 2013-07-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
404–527（124 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 A
653–796（144 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 C
404–527（124 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 C
653–796（144 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：G389R,L390G,E391A 突变：G389R,L390G,E391A 突变：G389R,L390G,E391A 突变：G389R,L390G,E391A | ZN ZINC ION × 3 GLU GLUTAMIC ACID × 2 1YW N-({(5S)-3-[3-fluoro-4-(pyrrolidin-1-yl)phenyl]-4,5-dihydro-1,2-oxazol-5-yl}methyl)acetamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1 uL 7 mg/mL protein in 10 mM (S)-Glu, 10 mM HEPES, pH 7.5, 20 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 150 uM ligand (from 30 mM DMSO stock) + 1 uL reservoir (10% PEG8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5), crystals appeared in 3-5 days, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.240 |
| 4LZ7 Crystal structures of GLuR2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators 提交 2013-07-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
404–527（124 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
653–796（144 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：G389R,L390G,E391A 突变：G389R,L390G,E391A | ZN ZINC ION × 4 GLU GLUTAMIC ACID × 2 1YW N-({(5S)-3-[3-fluoro-4-(pyrrolidin-1-yl)phenyl]-4,5-dihydro-1,2-oxazol-5-yl}methyl)acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1 uL 7 mg/mL protein in 10 mM (S)-Glu, 10 mM HEPES, pH 7.5, 20 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 150 uM ligand (from 30 mM DMSO stock) + 1 uL reservoir (10% PEG8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5), crystals appeared in 3-5 days, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.240 |
| 4LZ8 Crystal structures of GLuR2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators 提交 2013-07-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
404–527（124 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 A
653–796（144 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 C
404–527（124 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 C
653–796（144 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：G389R,L390G,E391A 突变：G389R,L390G,E391A 突变：G389R,L390G,E391A 突变：G389R,L390G,E391A | GLU GLUTAMIC ACID × 2 1YX N-[(3S)-1-{2-fluoro-4-[(5S)-5-{[(propan-2-ylsulfonyl)amino]methyl}-4,5-dihydro-1,2-oxazol-3-yl]phenyl}pyrrolidin-3-yl]acetamide × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1 uL 7 mg/mL protein in 10 mM (S)-Glu, 10 mM HEPES, pH 7.5, 20 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 150 uM ligand (from 30 mM DMSO stock) + 1 uL reservoir (10% PEG8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5), crystals appeared in 3-5 days, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.232 |
| 4LZ8 Crystal structures of GLuR2 ligand-binding-domain in complex with glutamate and positive allosteric modulators 提交 2013-07-31 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
404–527（124 aa）
片段：SEE REMARK 999
链 B
653–796（144 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
突变：G389R,L390G,E391A 突变：G389R,L390G,E391A | GLU GLUTAMIC ACID × 2 1YX N-[(3S)-1-{2-fluoro-4-[(5S)-5-{[(propan-2-ylsulfonyl)amino]methyl}-4,5-dihydro-1,2-oxazol-3-yl]phenyl}pyrrolidin-3-yl]acetamide × 2 ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；1 uL 7 mg/mL protein in 10 mM (S)-Glu, 10 mM HEPES, pH 7.5, 20 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 150 uM ligand (from 30 mM DMSO stock) + 1 uL reservoir (10% PEG8000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 5.5), crystals appeared in 3-5 days, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.232 |
| 4N07 Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J-L483Y-N754S) in complex with glutamate and BPAM-344 at 1.87 A resolution 提交 2013-10-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：unp residues 413-527, unp reisdues 653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：unp residues 413-527, unp reisdues 653-796
|
突变：L504Y, N755S 突变：L504Y, N755S | 2J9 4-cyclopropyl-7-fluoro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 ACT ACETATE ION × 12 ZN ZINC ION × 8 CAC CACODYLATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16.5% PEG4000, 0.15 M zinc acetate, 0.1 M cacodylate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.211 |
| 4N07 Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J-L483Y-N754S) in complex with glutamate and BPAM-344 at 1.87 A resolution 提交 2013-10-01 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：unp residues 413-527, unp reisdues 653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：unp residues 413-527, unp reisdues 653-796
链 C
413–527（115 aa）
片段：unp residues 413-527, unp reisdues 653-796
链 C
653–796（144 aa）
片段：unp residues 413-527, unp reisdues 653-796
|
突变：L504Y, N755S 突变：L504Y, N755S 突变：L504Y, N755S 突变：L504Y, N755S | 2J9 4-cyclopropyl-7-fluoro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 ACT ACETATE ION × 7 ZN ZINC ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；16.5% PEG4000, 0.15 M zinc acetate, 0.1 M cacodylate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.211 |
| 4O3A Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain in complex with L-aspartate at 1.80 a resolution 提交 2013-12-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain (unp residues 413-527 and unp residues 653-736)
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain (unp residues 413-527 and unp residues 653-736)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 12 ASP ASPARTIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 6 ACT ACETATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；24.4 % PEG 4000, 0.1 M zinc acetate and 0.1 M sodium acetate., pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.188 |
| 4O3A Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain in complex with L-aspartate at 1.80 a resolution 提交 2013-12-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain (unp residues 413-527 and unp residues 653-736)
链 B
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain (unp residues 413-527 and unp residues 653-736)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 ASP ASPARTIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；24.4 % PEG 4000, 0.1 M zinc acetate and 0.1 M sodium acetate., pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.188 |
| 4O3A Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain in complex with L-aspartate at 1.80 a resolution 提交 2013-12-18 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain (unp residues 413-527 and unp residues 653-736)
链 C
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain (unp residues 413-527 and unp residues 653-736)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 ASP ASPARTIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 4 ACT ACETATE ION × 6 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；24.4 % PEG 4000, 0.1 M zinc acetate and 0.1 M sodium acetate., pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.188 |
| 4O3B Crystal structure of an open/closed glua2 ligand-binding domain dimer at 1.91 A resolution 提交 2013-12-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain (unp residues 413-527 and unp residues 653-736)
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain (unp residues 413-527 and unp residues 653-736)
链 B
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain (unp residues 413-527 and unp residues 653-736)
链 B
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain (unp residues 413-527 and unp residues 653-736)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 6 CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACT ACETATE ION × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；20% PEG 4000, 0.1 M lithium sulfate and 0.1 M phosphate-citrate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.178 |
| 4O3C Crystal structure of the GLUA2 ligand-binding domain in complex with L-aspartate at 1.50 A resolution 提交 2013-12-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain (unp residues 413-527 and unp residues 653-796)
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain (unp residues 413-527 and unp residues 653-796)
|
未记录 | ASP ASPARTIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 2 LI LITHIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；20% PEG 4000, 0.1 M lithium sulfate and 0.1 M phosphate-citrate., pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.158 |
| 4Q30 Nitrowillardiine bound to the ligand binding domain of GluA2 at pH 3.5 提交 2014-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
414–527（114 aa）
链 B
653–794（142 aa）
链 D
414–527（114 aa）
链 D
653–794（142 aa）
|
未记录 | NWD 3-(5-nitro-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-L-alanine × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；277 K；14-15% PEG 8K, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.230 |
| 4Q30 Nitrowillardiine bound to the ligand binding domain of GluA2 at pH 3.5 提交 2014-04-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
414–527（114 aa）
链 F
653–794（142 aa）
|
未记录 | NWD 3-(5-nitro-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-L-alanine × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；277 K；14-15% PEG 8K, 0.1 M sodium cacodylate, 0.1-0.15 M zinc acetate, 0.25 M ammonium sulfate, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.230 |
| 4U1O GluA2flip sLBD complexed with kainate and (R,R)-2b crystal form C 提交 2014-07-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–796（144 aa）
|
未记录 | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 1 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Na cacodylate, pH 6.5, 1.26 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.209 |
| 4U1W Full length GluA2-kainate-(R,R)-2b complex crystal form A 提交 2014-07-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES, pH 6.5, 6%PEG6K, 3% TMAO, 0.006M Taurine
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.316 |
| 4U1X Full length GluA2-kainate-(R,R)-2b complex crystal form B 提交 2014-07-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES, pH 6.2, 5.25% PEG6K, 3% TMAO, 0.006 M Taurine, 20 mM MnCl2
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.289 |
| 4U1Y Full length GluA2-FW-(R,R)-2b complex 提交 2014-07-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 FWD 2-AMINO-3-(5-FLUORO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 4 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M imidazole pH 6.2, 9% PEG1450, 3% TMAO
|
分辨率 3.90 Å R-free 0.303 |
| 4U1Z GluA2flip sLBD complexed with kainate and (R,R)-2b crystal form D 提交 2014-07-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–796（144 aa）
|
未记录 | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 1 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Na acetate, pH 4.5, 25% PEG3350
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.208 |
| 4U21 GluA2flip sLBD complexed with FW and (R,R)-2b crystal form E 提交 2014-07-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
654–796（143 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
654–796（143 aa）
|
突变：A796S 突变：A796S 突变：A796S 突变：A796S | FWD 2-AMINO-3-(5-FLUORO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 2 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；phosphate-citrate, pH 4.2, 0.2 M Li sulfate, 20% PEG1K
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.198 |
| 4U22 GluA2flip sLBD complexed with FW and (R,R)-2b crystal form D 提交 2014-07-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–796（144 aa）
|
突变：A796S 突变：A796S | FWD 2-AMINO-3-(5-FLUORO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 1 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Na acetate, pH 4.5, 20% PEG3K
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.217 |
| 4U23 GluA2flip sLBD complexed with FW and (R,R)-2b crystal form F 提交 2014-07-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–796（144 aa）
|
突变：A796S 突变：A796S | FWD 2-AMINO-3-(5-FLUORO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 1 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M bicine/Trizma base, pH 8.5, 0.09 M Morpheus nitrate-phosphate-sulfate, 10% w/v PEG8K, 20% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.250 |
| 4U2P Full-length AMPA subtype ionotropic glutamate receptor GluA2 in the apo state 提交 2014-07-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M MES, 5.8-6.2% PEG6000, 5% TMAO, 0.1-0.3 M sodium acetate
|
分辨率 3.24 Å R-free 0.288 |
| 4U2Q Full-length AMPA subtype ionotropic glutamate receptor GluA2 in complex with partial agonist kainate 提交 2014-07-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M MES, 4.8-5.3% PEG6000, 3.5% TMAO, 6 mM taurine
|
分辨率 3.52 Å R-free 0.318 |
| 4U2R Crystal structure of the GLUR2 ligand binding core (S1S2J, flip variant) in the apo state 提交 2014-07-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–796（144 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–796（144 aa）
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–796（144 aa）
链 D
413–527（115 aa）
链 D
653–796（144 aa）
|
突变：A796S,A796S 突变：A796S,A796S 突变：A796S,A796S 突变：A796S,A796S 突变：A796S,A796S 突变：A796S,A796S 突变：A796S,A796S 突变：A796S,A796S | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；17-20% PEG8000, 0.2M lithium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.232 |
| 4U2R Crystal structure of the GLUR2 ligand binding core (S1S2J, flip variant) in the apo state 提交 2014-07-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–796（144 aa）
|
突变：A796S,A796S 突变：A796S,A796S | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；17-20% PEG8000, 0.2M lithium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.232 |
| 4U2R Crystal structure of the GLUR2 ligand binding core (S1S2J, flip variant) in the apo state 提交 2014-07-17 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–796（144 aa）
|
突变：A796S,A796S 突变：A796S,A796S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；17-20% PEG8000, 0.2M lithium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.232 |
| 4U2R Crystal structure of the GLUR2 ligand binding core (S1S2J, flip variant) in the apo state 提交 2014-07-17 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–796（144 aa）
|
突变：A796S,A796S 突变：A796S,A796S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；17-20% PEG8000, 0.2M lithium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.232 |
| 4U2R Crystal structure of the GLUR2 ligand binding core (S1S2J, flip variant) in the apo state 提交 2014-07-17 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
413–527（115 aa）
链 D
653–796（144 aa）
|
突变：A796S,A796S 突变：A796S,A796S | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；17-20% PEG8000, 0.2M lithium sulfate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.232 |
| 4U4F Structure of GluA2* in complex with partial agonist (S)-5-Nitrowillardiine 提交 2014-07-23 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | NWD 3-(5-nitro-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-L-alanine × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；11-14% (w/v) PEG 3,000, 50 mM lithium sulfate, 0.1 M tricine
|
分辨率 4.79 Å R-free 0.262 |
| 4U4G Structure of GluA2* in complex with competitive antagonist ZK 200775 提交 2014-07-23 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
片段：UNP residues 25-847
链 B
25–847（823 aa）
片段：UNP residues 25-847
链 C
25–847（823 aa）
片段：UNP residues 25-847
链 D
25–847（823 aa）
片段：UNP residues 25-847
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；277 K；7-11% PEG 20,000, 0.1 M MES
|
分辨率 4.49 Å R-free 0.248 |
| 4U4S Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J-L483Y-N754S) in complex with glutamate and BPAM25 at 1.90 A resolution. 提交 2014-07-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：Dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, UNP residues 653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：UNP residues 413-527, UNP residues 653-796
链 B
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, UNP residues 653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：UNP residues 413-527, UNP residues 653-796
|
突变：yes 突变：yes 突变：yes 突变：yes | 3C1 4-ethyl-3,4-dihydro-2H-pyrido[4,3-e][1,2,4]thiadiazine 1,1-dioxide × 2 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 4 ACT ACETATE ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；22% PEG4000, 0.2 M ammoniumsulfate, 0.1 M phosphate-citrate.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.208 |
| 4U4X Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J-L483Y-N754S) in complex with glutamate and BPAM37 at 1.56 A resolution. 提交 2014-07-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：Dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, UNP residues 653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：UNP residues 413-527, UNP residues 653-796
链 B
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527, UNP residues 653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：UNP residues 413-527, UNP residues 653-796
|
突变：yes 突变：yes 突变：yes 突变：yes | 3C2 4-ethyl-3,4-dihydro-2H-pyrido[3,2-e][1,2,4]thiadiazine 1,1-dioxide × 2 SO4 SULFATE ION × 5 GLU GLUTAMIC ACID × 2 ACT ACETATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；24% PEG4000, 0.1 M ammoniumsulfate, 0.1 M phosphate-citrate
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.175 |
| 4U5B Crystal structure of GluA2 A622T, con-ikot-ikot snail toxin, partial agonist KA and postitive modulator (R,R)-2b complex 提交 2014-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–845（821 aa）
链 B
25–845（821 aa）
链 C
25–845（821 aa）
链 D
25–845（821 aa）
|
未记录 | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES pH 5.8-6.3, 0.1 M NaCl, 5%-6% PEG3350
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.261 |
| 4U5C Crystal structure of GluA2, con-ikot-ikot snail toxin, partial agonist FW and postitive modulator (R,R)-2b complex 提交 2014-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–845（821 aa）
链 B
25–845（821 aa）
链 C
25–845（821 aa）
链 D
25–845（821 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FWD 2-AMINO-3-(5-FLUORO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 4 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES pH 5.8-6.3, 0.1 M NaCl, 5%-6% PEG3350
|
分辨率 3.69 Å R-free 0.254 |
| 4U5D Crystal structure of GluA2, con-ikot-ikot snail toxin, partial agonist KA and postitive modulator (R,R)-2b complex 提交 2014-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–845（821 aa）
链 B
25–845（821 aa）
链 C
25–845（821 aa）
链 D
25–845（821 aa）
|
未记录 | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES pH 5.8-6.3, 0.1 M NaCl, 5%-6% PEG3350
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.297 |
| 4U5E Crystal structure of GluA2 T625G, con-ikot-ikot snail toxin, partial agonist KA and postitive modulator (R,R)-2b complex 提交 2014-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–845（821 aa）
链 B
25–845（821 aa）
链 C
25–845（821 aa）
链 D
25–845（821 aa）
|
未记录 | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES pH 5.8-6.3, 0.1 M NaCl, 5%-6% PEG3350
|
分辨率 3.51 Å R-free 0.276 |
| 4U5F Crystal structure of GluA2, con-ikot-ikot snail toxin, partial agonist KA and postitive modulator (R,R)-2b complex, GluA2cryst2 construct 提交 2014-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–848（824 aa）
链 B
25–848（824 aa）
链 C
25–848（824 aa）
链 D
25–848（824 aa）
|
未记录 | KAI 3-(CARBOXYMETHYL)-4-ISOPROPENYLPROLINE × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES pH 5.8-6.3, 0.1 M NaCl, 5%-6% PEG3350
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.286 |
| 4UQ6 Electron density map of GluA2em in complex with LY451646 and glutamate 提交 2014-06-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
22–847（826 aa）
片段：RESIDUES 22-847
链 B
22–847（826 aa）
片段：RESIDUES 22-847
链 C
22–847（826 aa）
片段：RESIDUES 22-847
链 D
22–847（826 aa）
片段：RESIDUES 22-847
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 12.80 Å |
| 4UQJ Cryo-EM density map of GluA2em in complex with ZK200775 提交 2014-06-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
22–847（826 aa）
片段：RESIDUES 22-847
链 B
22–847（826 aa）
片段：RESIDUES 22-847
链 C
22–847（826 aa）
片段：RESIDUES 22-847
链 D
22–847（826 aa）
片段：RESIDUES 22-847
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
150 MM NACL, 20 MM TRIS, 0.75 MM DDM, 0.12 MM CHS, 0.3 MM ZK200775；pH 8；150 MM NACL, 20 MM TRIS, 0.75 MM DDM, 0.12 MM CHS, 0.3 MM ZK200775
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 10.40 Å |
| 4UQK Electron density map of GluA2em in complex with quisqualate and LY451646 提交 2014-06-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
22–847（826 aa）
片段：RESIDUES 22-847
链 B
22–847（826 aa）
片段：RESIDUES 22-847
链 C
22–847（826 aa）
片段：RESIDUES 22-847
链 D
22–847（826 aa）
片段：RESIDUES 22-847
|
未记录 | QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 16.40 Å |
| 4X48 Crystal structure of GluR2 ligand-binding core 提交 2014-12-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, engineered single chain
链 A
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, engineered single chain
链 C
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, engineered single chain
链 C
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, engineered single chain
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 3 XPF N-{(3S,4S)-4-[4-(5-cyanothiophen-2-yl)phenoxy]tetrahydrofuran-3-yl}propane-2-sulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；The protein solution contained 7 mg/ml GluR2-S1S2J, 10mM (S)-Glu, 10mM HEPES (pH 7.5), 20mM NaCl and 1mM EDTA. Compound was added to a final concentration of 150micromolar from a 30mM DMSO stock. To this solution, an equal amount of reservoir solution containing 10% PEG 8000, 0.1 M ZnAc and 0.1M NaAc, pH 5.5 was added, and 2microlitre drops of this mixture were allowed to equilibrate by vapor diffusion over a 1mL reservoir. Crystals appeared in the drops in 3-5 days.
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.197 |
| 4X48 Crystal structure of GluR2 ligand-binding core 提交 2014-12-02 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：Ligand binding domain, engineered single chain
链 B
653–796（144 aa）
片段：Ligand binding domain, engineered single chain
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 4 XPF N-{(3S,4S)-4-[4-(5-cyanothiophen-2-yl)phenoxy]tetrahydrofuran-3-yl}propane-2-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；The protein solution contained 7 mg/ml GluR2-S1S2J, 10mM (S)-Glu, 10mM HEPES (pH 7.5), 20mM NaCl and 1mM EDTA. Compound was added to a final concentration of 150micromolar from a 30mM DMSO stock. To this solution, an equal amount of reservoir solution containing 10% PEG 8000, 0.1 M ZnAc and 0.1M NaAc, pH 5.5 was added, and 2microlitre drops of this mixture were allowed to equilibrate by vapor diffusion over a 1mL reservoir. Crystals appeared in the drops in 3-5 days.
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.197 |
| 4YMA Structure of the ligand-binding domain of GluA2 in complex with the antagonist CNG10109 提交 2015-03-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 4E5 (3R)-3-(3-carboxy-5-hydroxyphenyl)-L-proline × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；PEG4000, lithium sulfate, phosphate citrate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |
| 4YU0 Crystal structure of a tetramer of GluA2 TR mutant ligand binding domains bound with glutamate at 1.26 Angstrom resolution 提交 2015-03-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–796（144 aa）
|
突变：E713T, Y768R,E713T, Y768R 突变：E713T, Y768R,E713T, Y768R | GLU GLUTAMIC ACID × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.14 K；20% w/v PEG3350 and 200 mM (NH4)2HPO4
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.157 |
| 4YU0 Crystal structure of a tetramer of GluA2 TR mutant ligand binding domains bound with glutamate at 1.26 Angstrom resolution 提交 2015-03-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–796（144 aa）
|
突变：E713T, Y768R,E713T, Y768R 突变：E713T, Y768R,E713T, Y768R | GLU GLUTAMIC ACID × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.14 K；20% w/v PEG3350 and 200 mM (NH4)2HPO4
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.157 |
| 4Z0I Crystal structure of a tetramer of GluA2 ligand binding domains bound with glutamate at 1.45 Angstrom resolution 提交 2015-03-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–796（144 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.14 K；20% PEG 3350 and 200 mM KNO3
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.208 |
| 4Z0I Crystal structure of a tetramer of GluA2 ligand binding domains bound with glutamate at 1.45 Angstrom resolution 提交 2015-03-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–796（144 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277.14 K；20% PEG 3350 and 200 mM KNO3
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.208 |
| 5BUU Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (L483Y-N754S) in complex with glutamate and BPAM-321 at 2.07 A resolution 提交 2015-06-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527,UNP residues 653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：UNP residues 413-527,UNP residues 653-796
链 B
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527,UNP residues 653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：UNP residues 413-527,UNP residues 653-796
|
突变：L483Y, N754S,L483Y, N754S 突变：L483Y, N754S,L483Y, N754S 突变：L483Y, N754S,L483Y, N754S 突变：L483Y, N754S,L483Y, N754S | 4V6 (3R)-7-chloro-2,3,4-trimethyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；15.2 % PEG4000, 0.2 M ammonium-sulfate, 0.1 M phosphate-citrate
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.250 |
| 5CBR Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the antagonist (S)-2-amino-3-(3,4-dichloro-5-(5-hydroxypyridin-3-yl)phenyl)propanoic acid at 2.0A resolution 提交 2015-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
|
未记录 | 4ZK 3,4-dichloro-5-(5-hydroxypyridin-3-yl)-L-phenylalanine × 2 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 12 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；PEG4000, lithium sulfate and phosphate-citrate buffer pH 4.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.238 |
| 5CBS Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the antagonist (R)-2-amino-3-(3'-hydroxybiphenyl-3-yl)propanoic acid at 1.8A resolution 提交 2015-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527,UNP residues 653-797
链 A
653–797（145 aa）
片段：UNP residues 413-527,UNP residues 653-797
链 C
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527,UNP residues 653-797
链 C
653–797（145 aa）
片段：UNP residues 413-527,UNP residues 653-797
|
未记录 | E42 (R)-2-amino-3-(3'-hydroxybiphenyl-3-yl)propanoic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；PEG2000, lithium sulfate and phosphate-citrate buffer pH 4.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 5CBS Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the antagonist (R)-2-amino-3-(3'-hydroxybiphenyl-3-yl)propanoic acid at 1.8A resolution 提交 2015-07-01 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527,UNP residues 653-797
链 B
653–797（145 aa）
片段：UNP residues 413-527,UNP residues 653-797
链 D
413–527（115 aa）
片段：UNP residues 413-527,UNP residues 653-797
链 D
653–797（145 aa）
片段：UNP residues 413-527,UNP residues 653-797
|
未记录 | E42 (R)-2-amino-3-(3'-hydroxybiphenyl-3-yl)propanoic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；PEG2000, lithium sulfate and phosphate-citrate buffer pH 4.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 5ELV Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J-L504-N775) in complex with glutamate and BPAM-521 at 1.92 A resolution 提交 2015-11-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
片段：UNP residues, 413-527,UNP residue, 653-797
链 A
653–797（145 aa）
片段：UNP residues, 413-527,UNP residue, 653-797
链 B
413–527（115 aa）
片段：UNP residues, 413-527,UNP residue, 653-797
链 B
653–797（145 aa）
片段：UNP residues, 413-527,UNP residue, 653-797
|
突变：L504Y and N775S 突变：L504Y and N775S 突变：L504Y and N775S 突变：L504Y and N775S | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 3 ACT ACETATE ION × 9 5PX 4-Cyclopropyl-3,4-dihydro-7-hydroxy-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；20% PEG4000, 0.3 M lithium sulfate and 0.1 M phosphate-citrate
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.209 |
| 5FHM Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with (S)-2-Amino-3-(5-(2-(3-(aminomethyl)benzyl)-2H-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid at resolution 1.55 A resolution 提交 2015-12-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 5XP (2~{S})-3-[5-[2-[[3-(aminomethyl)phenyl]methyl]-1,2,3,4-tetrazol-5-yl]-3-oxidanyl-1,2-oxazol-4-yl]-2-azanyl-propanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 LI LITHIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；280 K；PEG4000
lithium sulfate
sodium acetate buffer pH 5.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.159 |
| 5FHN Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with (S)-2-Amino-3-(5-(2-(3-methylbenzyl)-2H-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid at 1.6 A resolution 提交 2015-12-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 1 5XO (S)-2-Amino-3-(5-(2-(3-methylbenzyl)-2H-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；18% PEG4000
0.1 M ammonium sulfate
0.1 M phosphate-citrate buffer pH 4.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.186 |
| 5FHO Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with (S)-2-Amino-3-(5-(2-(3-chlorobenzyl)-2H-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid at 2.3 A resolution 提交 2015-12-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 D
413–527（115 aa）
链 D
653–797（145 aa）
|
未记录 | 5XN (1S)-1-carboxy-2-(5-{2-[(3-chlorophenyl)methyl]-2H-tetrazol-5-yl}-3-oxo-2,3-dihydro-1,2-oxazol-4-yl)ethan-1-aminium × 2 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；280 K；PEG4000
ammonium sulfate
acetate buffer pH 5.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.216 |
| 5FHO Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with (S)-2-Amino-3-(5-(2-(3-chlorobenzyl)-2H-tetrazol-5-yl)-3-hydroxyisoxazol-4-yl)propanoic acid at 2.3 A resolution 提交 2015-12-22 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–797（145 aa）
|
未记录 | 5XN (1S)-1-carboxy-2-(5-{2-[(3-chlorophenyl)methyl]-2H-tetrazol-5-yl}-3-oxo-2,3-dihydro-1,2-oxazol-4-yl)ethan-1-aminium × 2 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；280 K；PEG4000
ammonium sulfate
acetate buffer pH 5.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.216 |
| 5FTH Crystal structure of the GluA2 K738M-T744K LBD in complex with glutamate (zinc form) 提交 2016-01-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
404–527（124 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 404-527,653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 404-527,653-796
链 B
404–527（124 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 404-527,653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 404-527,653-796
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；15% PEG 8,000, 200 MM ZN ACETATE, 100MM MES PH 6.0
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.283 |
| 5FTH Crystal structure of the GluA2 K738M-T744K LBD in complex with glutamate (zinc form) 提交 2016-01-13 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
404–527（124 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 404-527,653-796
链 C
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 404-527,653-796
|
突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；15% PEG 8,000, 200 MM ZN ACETATE, 100MM MES PH 6.0
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.283 |
| 5FTI Crystal structure of the GluA2 K738M-T744K LBD in complex with glutamate (lithium form) 提交 2016-01-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
404–527（124 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 404-527,653-796
链 A
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 404-527,653-796
|
突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 LI LITHIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；22% PEG 4,000, 200 MM LI SULPHATE, 100MM ACETATE PH 5.0
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.177 |
| 5FTI Crystal structure of the GluA2 K738M-T744K LBD in complex with glutamate (lithium form) 提交 2016-01-13 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
404–527（124 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 404-527,653-796
链 B
653–796（144 aa）
片段：LIGAND BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 404-527,653-796
|
突变：YES 突变：YES | GLU GLUTAMIC ACID × 2 LI LITHIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5；22% PEG 4,000, 200 MM LI SULPHATE, 100MM ACETATE PH 5.0
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.177 |
| 5FWX Crystal structure of the AMPA receptor GluA2/A4 N-terminal domain heterodimer 提交 2016-02-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
25–400（376 aa）
片段：RESIDUES 25-400
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
17% PEG 3350 WITH 0.1-0.35 M AMMONIUM SULPHATE
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.238 |
| 5FWX Crystal structure of the AMPA receptor GluA2/A4 N-terminal domain heterodimer 提交 2016-02-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
25–400（376 aa）
片段：RESIDUES 25-400
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
17% PEG 3350 WITH 0.1-0.35 M AMMONIUM SULPHATE
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.238 |
| 5FWY Crystal structure of the AMPA receptor GluA2/A3 N-terminal domain heterodimer 提交 2016-02-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
25–400（376 aa）
片段：RESIDUES 25-400
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
14-16 % PEG 3350, 0.27 M AMMONIUM SULPHATE AND 0.1 M BICINE PH 9
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.231 |
| 5FWY Crystal structure of the AMPA receptor GluA2/A3 N-terminal domain heterodimer 提交 2016-02-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
25–400（376 aa）
片段：RESIDUES 25-400
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
14-16 % PEG 3350, 0.27 M AMMONIUM SULPHATE AND 0.1 M BICINE PH 9
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.231 |
| 5IDE Cryo-EM structure of GluA2/3 AMPA receptor heterotetramer (model I) 提交 2016-02-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
23–883（861 aa）
链 C
23–883（861 aa）
|
突变：N292C 突变：N292C | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；25 mM Tris pH 7.4, 0.25 % DDM, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Incubated for 1 minute, blotted for 3 seconds
|
分辨率 8.25 Å |
| 5IDF Cryo-EM structure of GluA2/3 AMPA receptor heterotetramer (model II) 提交 2016-02-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
23–883（861 aa）
链 C
23–883（861 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；25 mM Tris pH 7.4, 0.25 % DDM, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Incubated for 1 minute, blotted for 3 seconds
|
分辨率 10.31 Å |
| 5JEI Crystal structure of the GluA2 LBD in complex with FW 提交 2016-04-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
|
突变：V154C,V154C 突变：V154C,V154C | FWD 2-AMINO-3-(5-FLUORO-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDRO-2H-PYRIMIDIN-1-YL)-PROPIONIC ACID × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 8 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 12 TOE 2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXYL × 4 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 4 ETE 2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；277 K；50.0 % v/v PEG 200, 200 mM Sodium Chloride, 100 mM Sodium/Potassium Phosphate pH 6.2
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.147 |
| 5KBS Cryo-EM structure of GluA2-0xSTZ at 8.7 Angstrom resolution 提交 2016-06-03 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L,N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L,N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L,N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L,N241E, V382L, G384E, N385D, V758L | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 blot force, 8.0 s blot time
|
分辨率 8.70 Å |
| 5KBT Cryo-EM structure of GluA2-1xSTZ complex at 6.4 Angstrom resolution 提交 2016-06-03 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 blot force, 8.0 s blot time
|
分辨率 6.40 Å |
| 5KBU Cryo-EM structure of GluA2-2xSTZ complex at 7.8 Angstrom resolution 提交 2016-06-03 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 blot force, 8.0 s blot time
|
分辨率 7.80 Å |
| 5KBV Cryo-EM structure of GluA2 bound to antagonist ZK200775 at 6.8 Angstrom resolution 提交 2016-06-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
突变：N241E, V382L,G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L,G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L,G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L,G384E, N385D, V758L | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot force 3, 8.0 s blot time
|
分辨率 6.80 Å |
| 5KK2 Architecture of fully occupied GluA2 AMPA receptor - TARP complex elucidated by single particle cryo-electron microscopy 提交 2016-06-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.30 Å |
| 5L1B AMPA subtype ionotropic glutamate receptor GluA2 in Apo state 提交 2016-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587,UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 A
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587,UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 B
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587,UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 B
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587,UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 C
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587,UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 C
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587,UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 D
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587,UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 D
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587,UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；8-11% (w/v) PEG 8,000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate (pH 6.3-6.7)
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.292 |
| 5L1E AMPA subtype ionotropic glutamate receptor GluA2 in complex with noncompetitive inhibitor CP465022 提交 2016-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 A
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 B
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 B
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 C
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 C
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 D
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 D
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 6ZQ 3-(2-chlorophenyl)-2-(2-{6-[(diethylamino)methyl]pyridin-2-yl}ethyl)-6-fluoroquinazolin-4(3H)-one × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；11-14% (w/v) PEG 6,000, 0.1 M ammonium phosphate and 0.1 M TRIS (pH 7.9-8.0)
|
分辨率 4.37 Å R-free 0.292 |
| 5L1F AMPA subtype ionotropic glutamate receptor GluA2 in complex with noncompetitive inhibitor Perampanel 提交 2016-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 A
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 B
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 B
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 C
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 C
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 D
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 D
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 6ZP 2-(6'-oxo-1'-phenyl[1',6'-dihydro[2,3'-bipyridine]]-5'-yl)benzonitrile × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；11-14% (w/v) PEG 6,000, 0.1 M ammonium phosphate and 0.1 M TRIS (pH 7.9-8.0)
|
分辨率 4.00 Å R-free 0.272 |
| 5L1G AMPA subtype ionotropic glutamate receptor GluA2 in complex with GYKI-Br 提交 2016-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 A
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 B
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 B
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 C
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 C
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 D
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 D
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 GYB (8R)-5-(4-amino-3-bromophenyl)-N,8-dimethyl-8,9-dihydro-2H,7H-[1,3]dioxolo[4,5-h][2,3]benzodiazepine-7-carboxamide × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；sodium acetate
|
分辨率 4.51 Å R-free 0.295 |
| 5L1H AMPA subtype ionotropic glutamate receptor GluA2 in complex with noncompetitive inhibitor GYKI53655 提交 2016-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 A
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 B
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 B
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 C
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 C
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 D
25–565（541 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
链 D
588–847（260 aa）
片段：UNP residues 25-847, with deletions of 397-398, 402-405, 566-587
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 GYK (8R)-5-(4-aminophenyl)-N,8-dimethyl-8,9-dihydro-2H,7H-[1,3]dioxolo[4,5-h][2,3]benzodiazepine-7-carboxamide × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；11-14% (w/v) PEG 6,000, 0.1 M ammonium phosphate and 0.1 M TRIS (pH 7.9-8.0)
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.292 |
| 5N6P AMPA receptor NTD mutant 提交 2017-02-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
25–400（376 aa）
|
突变：K73C D134C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；16-20% PEG3350, 200 mM sodium formate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.249 |
| 5NG9 Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with agonist CIP-AS at 1.15 A resolution. 提交 2017-03-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
|
未记录 | FLC CITRATE ANION × 4 LI LITHIUM ION × 2 8VN (3~{a}~{S},4~{S},6~{a}~{R})-4,5,6,6~{a}-tetrahydro-3~{a}~{H}-pyrrolo[3,4-d][1,2]oxazole-3,4-dicarboxylic acid × 2 8WQ (2~{S},3~{R},4~{R})-3-(carboxycarbonyl)-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxylic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；15.2% PEG4000, 0.1 M lithium sulfate, 0.1 M phosphate-citrate buffer
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.133 |
| 5NIH Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with agonist LM-12b at 1.3 A resolution. 提交 2017-03-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 8VE (3~{a}~{R},4~{S},6~{a}~{R})-1-methyl-4,5,6,6~{a}-tetrahydro-3~{a}~{H}-pyrrolo[3,4-c]pyrazole-3,4-dicarboxylic acid × 1 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；24.4% PEG4000, 0.3 M ammonium sulfate, 0.1 M phosphate-citrate buffer
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.158 |
| 5NIH Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with agonist LM-12b at 1.3 A resolution. 提交 2017-03-24 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 8VE (3~{a}~{R},4~{S},6~{a}~{R})-1-methyl-4,5,6,6~{a}-tetrahydro-3~{a}~{H}-pyrrolo[3,4-c]pyrazole-3,4-dicarboxylic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；24.4% PEG4000, 0.3 M ammonium sulfate, 0.1 M phosphate-citrate buffer
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.158 |
| 5NS9 Crystal structure of the GluA2 LBD (L483Y-N754S-L758V) in complex with glutamate 提交 2017-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 SO4 SULFATE ION × 6 NA SODIUM ION × 5 GLU GLUTAMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277.15 K；20% w/v PEG3350, 200mM Li2SO4
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.205 |
| 5O9A Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J-L504Y-N775S) in complex with glutamate and BPAM121 at 1.78 A resolution 提交 2017-06-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
突变：L504Y,N775S 突变：L504Y,N775S 突变：L504Y,N775S 突变：L504Y,N775S | SO4 SULFATE ION × 6 7M6 7-chloro-4-(2-fluoroethyl)-2,3-dihydro-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 2 CL CHLORIDE ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 GLU GLUTAMIC ACID × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；18% PEG4000, 0.23 M lithium sulfate, 0.1 M phosphate citrate pH 4.5
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.179 |
| 5O9A Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J-L504Y-N775S) in complex with glutamate and BPAM121 at 1.78 A resolution 提交 2017-06-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–797（145 aa）
链 D
413–527（115 aa）
链 D
653–797（145 aa）
|
突变：L504Y,N775S 突变：L504Y,N775S 突变：L504Y,N775S 突变：L504Y,N775S | SO4 SULFATE ION × 10 7M6 7-chloro-4-(2-fluoroethyl)-2,3-dihydro-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 2 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 2 CIT CITRIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；18% PEG4000, 0.23 M lithium sulfate, 0.1 M phosphate citrate pH 4.5
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.179 |
| 5OEW Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with glutamate and positive allosteric modulator BPAM538 提交 2017-07-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 9 ACT ACETATE ION × 2 9TE 4-cyclopropyl-7-(3-methoxyphenoxy)-2,3-dihydro-1$l^{6},2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；18% PEG4000, 0.23M lithium-sulfate, 0.1M phosphate-citrate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.189 |
| 5OEW Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with glutamate and positive allosteric modulator BPAM538 提交 2017-07-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–797（145 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 16 ACT ACETATE ION × 4 9TE 4-cyclopropyl-7-(3-methoxyphenoxy)-2,3-dihydro-1$l^{6},2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；18% PEG4000, 0.23M lithium-sulfate, 0.1M phosphate-citrate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.189 |
| 5VHW GluA2-0xGSG1L bound to ZK 提交 2017-04-13 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.80 Å |
| 5VHX GluA2-1xGSG1L bound to ZK 提交 2017-04-13 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
链 E
25–847（823 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.30 Å |
| 5VHY GluA2-2xGSG1L bound to ZK 提交 2017-04-13 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
链 E
25–847（823 aa）
链 F
25–847（823 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 5VHZ GluA2-2xGSG1L bound to L-Quisqualate 提交 2017-04-13 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
链 E
25–847（823 aa）
链 F
25–847（823 aa）
|
未记录 | QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.40 Å |
| 5VOT Structure of AMPA receptor-TARP complex 提交 2017-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å |
| 5VOU Structure of AMPA receptor-TARP complex 提交 2017-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.40 Å |
| 5VOV Structure of AMPA receptor-TARP complex 提交 2017-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 5WEK GluA2 bound to antagonist ZK and GSG1L in digitonin, state 1 提交 2017-07-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP D3Z7H4 residues 2-238 linked via LINKER GTG
链 B
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP D3Z7H4 residues 2-238 linked via LINKER GTG
链 C
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP D3Z7H4 residues 2-238 linked via LINKER GTG
链 D
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP D3Z7H4 residues 2-238 linked via LINKER GTG
|
突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 5WEL GluA2 bound to antagonist ZK and GSG1L in digitonin, state 2 提交 2017-07-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP D3Z7H4 residues 2-238 linked via LINKER GTG
链 B
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP D3Z7H4 residues 2-238 linked via LINKER GTG
链 C
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP D3Z7H4 residues 2-238 linked via LINKER GTG
链 D
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP D3Z7H4 residues 2-238 linked via LINKER GTG
|
突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 AJP Digitonin × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 5WEM GluA2 bound to GSG1L in digitonin, state 1 提交 2017-07-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847 and UNP D3Z7H4 residues 2-238 linked via LINKER GTG
链 B
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847 and UNP D3Z7H4 residues 2-238 linked via LINKER GTG
链 C
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847 and UNP D3Z7H4 residues 2-238 linked via LINKER GTG
链 D
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847 and UNP D3Z7H4 residues 2-238 linked via LINKER GTG
|
突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 5WEN GluA2 bound to GSG1L in digitonin, state 2 提交 2017-07-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
片段：UNP residues 25-847 and UNP residues 2-238 linked via LINKER GTG,UNP residues 25-847 and UNP residues 2-238 linked via LINKER GTG
链 B
25–847（823 aa）
片段：UNP residues 25-847 and UNP residues 2-238 linked via LINKER GTG,UNP residues 25-847 and UNP residues 2-238 linked via LINKER GTG
链 C
25–847（823 aa）
片段：UNP residues 25-847 and UNP residues 2-238 linked via LINKER GTG,UNP residues 25-847 and UNP residues 2-238 linked via LINKER GTG
链 D
25–847（823 aa）
片段：UNP residues 25-847 and UNP residues 2-238 linked via LINKER GTG,UNP residues 25-847 and UNP residues 2-238 linked via LINKER GTG
|
突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L,N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L,N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L,N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L,N241E, V382L, G384E, N385D, N392Q, V1151L | AJP Digitonin × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.80 Å |
| 5WEO Activated GluA2 complex bound to glutamate, cyclothiazide, and STZ in digitonin 提交 2017-07-10 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP O88602 2-208 linked via LINKER GT
链 B
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP O88602 2-208 linked via LINKER GT
链 C
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP O88602 2-208 linked via LINKER GT
链 D
25–847（823 aa）
片段：UNP P19491 residues 25-847, UNP O88602 2-208 linked via LINKER GT
|
突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L 突变：N241E, V382L, G384E, N385D, V758L | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6DLZ Open state GluA2 in complex with STZ after micelle signal subtraction 提交 2018-06-04 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6DM0 Open state GluA2 in complex with STZ and blocked by IEM-1460, after micelle signal subtraction 提交 2018-06-04 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 GZD N,N,N-trimethyl-5-({[(3s,5s,7s)-tricyclo[3.3.1.1~3,7~]decan-1-yl]methyl}amino)pentan-1-aminium × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6DM1 Open state GluA2 in complex with STZ and blocked by NASPM, after micelle signal subtraction 提交 2018-06-04 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 GYY N-[3-({4-[(3-aminopropyl)amino]butyl}amino)propyl]-2-(naphthalen-1-yl)acetamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6FAZ Crystal structure of the GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the positive allosteric modulator TDPAM01 at 1.4 A resolution. 提交 2017-12-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 GOL GLYCEROL × 5 CL CHLORIDE ION × 5 ACT ACETATE ION × 3 GLU GLUTAMIC ACID × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 D45 6,6'-(Ethane-1,2-diyl)bis(4-methyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；280 K；15% PEG4000, 0.3 M ammonium sulfate, 0.1 M phosphate-citrate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.168 |
| 6FQG GluA2(flop) G724C ligand binding core dimer bound to L-Glutamate (Form A) at 2.34 Angstrom resolution 提交 2018-02-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
突变：S729C 突变：S729C 突变：S729C 突变：S729C | GLU GLUTAMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；287 K；0.2M Ammonium chloride, 20% PEG 3350, 10uM ZK200775
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.231 |
| 6FQH GluA2(flop) S729C ligand binding core dimer bound to NBQX at 1.76 Angstrom resolution 提交 2018-02-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
400–527（128 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
400–527（128 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
突变：S729C,S729C 突变：S729C,S729C 突变：S729C,S729C 突变：S729C,S729C | E2Q 6-nitro-2,3-bis(oxidanylidene)-1,4-dihydrobenzo[f]quinoxaline-7-sulfonamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289 K；0.1M tri-sodium Citrate, 20% PEG 3000
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.224 |
| 6FQI GluA2(flop) G724C ligand binding core dimer bound to L-Glutamate (Form B) at 2.91 Angstrom resolution 提交 2018-02-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.16 M Calcium acetate, 0.08 M Sodium Cacodylate, 14.4% (w/v) PEG 8000, 20% (v/v) Glycerol, 1 mM glutamate
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.267 |
| 6FQJ GluA2(flop) G724C ligand binding core dimer bound to ZK200775 at 2.50 Angstrom resolution 提交 2018-02-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 H
413–527（115 aa）
链 H
653–797（145 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2M Ammonium Chloride, 20% PEG 3350, 10microM ZK200775.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.265 |
| 6FQJ GluA2(flop) G724C ligand binding core dimer bound to ZK200775 at 2.50 Angstrom resolution 提交 2018-02-14 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
链 G
413–527（115 aa）
链 G
653–797（145 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2M Ammonium Chloride, 20% PEG 3350, 10microM ZK200775.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.265 |
| 6FQJ GluA2(flop) G724C ligand binding core dimer bound to ZK200775 at 2.50 Angstrom resolution 提交 2018-02-14 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–797（145 aa）
链 E
413–527（115 aa）
链 E
653–797（145 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2M Ammonium Chloride, 20% PEG 3350, 10microM ZK200775.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.265 |
| 6FQJ GluA2(flop) G724C ligand binding core dimer bound to ZK200775 at 2.50 Angstrom resolution 提交 2018-02-14 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
413–527（115 aa）
链 D
653–797（145 aa）
链 F
413–527（115 aa）
链 F
653–797（145 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2M Ammonium Chloride, 20% PEG 3350, 10microM ZK200775.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.265 |
| 6FQK GluA2(flop) S729C ligand binding core dimer bound to ZK200775 at 1.98 Angstrom resolution 提交 2018-02-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
400–527（128 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
400–527（128 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2M Ammonium Chloride, 20% PEG 3350, 10microM ZK200775.
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.256 |
| 6GIV Structure of GluA2-N775S ligand-binding domain (S1S2J) in complex with glutamate and Rubidium Bromide at 1.75 A resolution 提交 2018-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
|
突变：N775S,N775S 突变：N775S,N775S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 6 BR BROMIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；18-24.4% PEG4000, 0.2-0.3 M Li2SO4, and 0.1 M cacodylate, pH 6.5
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.190 |
| 6GL4 Structure of GluA2o ligand-binding domain (S1S2J) in complex with glutamate and sodium bromide at 1.95 A resolution 提交 2018-05-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
652–797（146 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 BR BROMIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；25% PEG4000, 0.2M sodium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 5.5
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.199 |
| 6GL4 Structure of GluA2o ligand-binding domain (S1S2J) in complex with glutamate and sodium bromide at 1.95 A resolution 提交 2018-05-22 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
链 B
652–797（146 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 BR BROMIDE ION × 6 NA SODIUM ION × 4 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；25% PEG4000, 0.2M sodium sulfate, 0.1M sodium acetate pH 5.5
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.199 |
| 6HC9 STRUCTURE OF GLUA2 LIGAND-BINDING DOMAIN (S1S2J-L504Y-N775S) IN COMPLEX WITH GLUTAMATE AND TDPAM02 AT 2.4 A RESOLUTION. 提交 2018-08-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 7 GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 FXW 6,6'-(ETHANE-1,2-DIYL)BIS(4-CYCLOPROPYL-3,4-DIHYDRO-2H-1,2,4-BENZOTHIADIAZINE 1,1-DIOXIDE) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；20% PEG4000, 0.3 M lithium sulfate, 0.1 M phosphate citrate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 6HCA STRUCTURE OF GLUA2 LIGAND-BINDING DOMAIN (S1S1J) IN COMPLEX WITH POSITIVE ALLOSTERIC MODULATOR TDPAM02 AT 1.8 A RESOLUTION 提交 2018-08-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 7 CL CHLORIDE ION × 6 FXW 6,6'-(ETHANE-1,2-DIYL)BIS(4-CYCLOPROPYL-3,4-DIHYDRO-2H-1,2,4-BENZOTHIADIAZINE 1,1-DIOXIDE) × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；24% PEG4000, 0.3 M lithium sulfate, 0.1 M phosphate citrate
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.207 |
| 6HCB STRUCTURE OF GLUA2 LIGAND-BINDING DOMAIN (S1S2J-N775S) IN COMPLEX WITH GLUTAMATE AND TDPAM01 AT 1.9 A RESOLUTION. 提交 2018-08-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 9 GLU GLUTAMIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 D45 6,6'-(Ethane-1,2-diyl)bis(4-methyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；15% PEG4000, 0.1 M ammonium sulphate, 0.1 M phosphate citrate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.192 |
| 6HCC STRUCTURE OF GLUA2 LIGAND-BINDING DOMAIN (S1S2J-N775S) IN COMPLEX WITH GLUTAMATE AND TDPAM02 AT 1.6 A RESOLUTION. 提交 2018-08-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | FXW 6,6'-(ETHANE-1,2-DIYL)BIS(4-CYCLOPROPYL-3,4-DIHYDRO-2H-1,2,4-BENZOTHIADIAZINE 1,1-DIOXIDE) × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CL CHLORIDE ION × 3 ACT ACETATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；24% PEG4000, 0.3 M lithium sulfate, 0.1 M phosphate citrate
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.182 |
| 6HCH STRUCTURE OF GLUA2 LIGAND-BINDING DOMAIN (S1S2J-L504Y-N775S) IN COMPLEX WITH GLUTAMATE AND TDPAM01 AT 1.6 A RESOLUTION. 提交 2018-08-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 15 D45 6,6'-(Ethane-1,2-diyl)bis(4-methyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide) × 1 ACT ACETATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；15% PEG4000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.178 |
| 6HCH STRUCTURE OF GLUA2 LIGAND-BINDING DOMAIN (S1S2J-L504Y-N775S) IN COMPLEX WITH GLUTAMATE AND TDPAM01 AT 1.6 A RESOLUTION. 提交 2018-08-15 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–797（145 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 16 D45 6,6'-(Ethane-1,2-diyl)bis(4-methyl-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-dioxide) × 2 ACT ACETATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；15% PEG4000, 0.1 M zinc acetate, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.178 |
| 6NJL Architecture and subunit arrangement of native AMPA receptors 提交 2019-01-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 B
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.70 Å |
| 6NJM Architecture and subunit arrangement of native AMPA receptors 提交 2019-01-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 B
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 6NJN Architecture and subunit arrangement of native AMPA receptors 提交 2019-01-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 B
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 6O9G Open state GluA2 in complex with STZ and blocked by AgTx-636, after micelle signal subtraction 提交 2019-03-13 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 LU7 N~1~-{5-[(3-{[3-(L-arginylamino)propyl]amino}propyl)amino]pentyl}-N~2~-[(2,4-dihydroxyphenyl)acetyl]-L-aspartamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 6PEQ GluA2 in complex with its auxiliary subunit CNIH3 - map LBD-TMD-C3 - with antagonist ZK200775 -without NTD 提交 2019-06-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–868（868 aa）
链 B
1–868（868 aa）
链 C
1–868（868 aa）
链 D
1–868（868 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 PAM PALMITOLEIC ACID × 14 CLR CHOLESTEROL × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 6Q54 Structure of GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the agonist (S)-2-Amino-3-(1-ethyl-4-hydroxy-1H-1,2,3-triazol-5-yl)propanoic acid at 1.4 A resolution 提交 2018-12-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 HJ8 (2~{S})-2-azanyl-3-(3-ethyl-5-oxidanyl-1,2,3-triazol-4-yl)propanoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 CL CHLORIDE ION × 3 CIT CITRIC ACID × 1 LI LITHIUM ION × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；20% PEG4000, 0.3 M lithium sulfate, 0.1 M phosphate-citrate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.163 |
| 6Q60 Structure of GluA2 ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the agonist (S)-2-Amino-3-(2-methyl-5-hydroxy-2H-1,2,3-triazol-4-yl)propanoic acid at 1.55 A resolution 提交 2018-12-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
未记录 | HJH (2~{S})-2-azanyl-3-(2-methyl-5-oxidanyl-1,2,3-triazol-4-yl)propanoic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 12 CL CHLORIDE ION × 3 LI LITHIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；10% PEG4000, 0.1 M lithium sulfate, 0.1 M phosphate-citrate, pH 4.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.175 |
| 6QKC GluA1/2 In complex with auxiliary subunit gamma-8 提交 2019-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
链 D
1–860（860 aa）
|
未记录 | E2Q 6-nitro-2,3-bis(oxidanylidene)-1,4-dihydrobenzo[f]quinoxaline-7-sulfonamide × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM TRIS, pH 8, 150 mM NaCl and 0.1 % digitonin (w/v)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3uL on grid, 60 sec incubation and 4sec blotting time
|
分辨率 4.40 Å |
| 6QKZ Full length GluA1/2-gamma8 complex 提交 2019-01-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
22–860（839 aa）
链 D
22–860（839 aa）
|
未记录 | E2Q 6-nitro-2,3-bis(oxidanylidene)-1,4-dihydrobenzo[f]quinoxaline-7-sulfonamide × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM TRIS, pH 8, 150 mM NaCl and 0.1 % digitonin (w/v)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3uL on grid, 60 sec incubation and 4sec blotting time
|
分辨率 6.30 Å |
| 6RUQ Structure of GluA2cryst in complex the antagonist ZK200775 and the negative allosteric modulator GYKI53655 at 4.65 A resolution 提交 2019-05-28 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
突变：N235E, N385D, N392Q, K410A, R586Q, C589A 突变：N235E, N385D, N392Q, K410A, R586Q, C589A 突变：N235E, N385D, N392Q, K410A, R586Q, C589A 突变：N235E, N385D, N392Q, K410A, R586Q, C589A | GYK (8R)-5-(4-aminophenyl)-N,8-dimethyl-8,9-dihydro-2H,7H-[1,3]dioxolo[4,5-h][2,3]benzodiazepine-7-carboxamide × 4 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 6；279 K；0.1 M MES, 12 % PEG 20,000
|
分辨率 4.65 Å R-free 0.291 |
| 6U5S NTD of GluA2 in complex with CNIH3 - with antagonist ZK200775 - in pseudo-symmetric global conformation 提交 2019-08-28 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–868（868 aa）
链 B
1–868（868 aa）
链 C
1–868（868 aa）
链 D
1–868（868 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 6U6I NTD of GluA2 in complex with CNIH3 - with antagonist ZK200775 - in asymmetric global conformation 提交 2019-08-29 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–868（868 aa）
链 B
1–868（868 aa）
链 C
1–868（868 aa）
链 D
1–868（868 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 6UCB GluA2 in complex with its auxiliary subunit CNIH3 - with antagonist ZK200775, LBD, TMD, CNIH3, and lipids 提交 2019-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–868（868 aa）
链 B
1–868（868 aa）
链 C
1–868（868 aa）
链 D
1–868（868 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 8 PAM PALMITOLEIC ACID × 14 CLR CHOLESTEROL × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 6UD4 GluA2 in complex with its auxiliary subunit CNIH3 in AS map II - (LBD-TMD-C3(AS) II)- with antagonist ZK200775, without NTD 提交 2019-09-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–868（868 aa）
链 B
1–868（868 aa）
链 C
1–868（868 aa）
链 D
1–868（868 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 CLR CHOLESTEROL × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6UD8 GluA2 in complex with its auxiliary subunit CNIH3 - with antagonist ZK200775 提交 2019-09-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–868（868 aa）
链 B
1–868（868 aa）
链 C
1–868（868 aa）
链 D
1–868（868 aa）
|
未记录 | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 CLR CHOLESTEROL × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6XSR Crystal structure of GluA2 AMPA receptor in complex with trans-4-butylcyclohexane carboxylic acid (4-BCCA) inhibitor 提交 2020-07-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–838（814 aa）
链 B
25–838（814 aa）
链 C
25–838（814 aa）
链 D
25–838（814 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 V8G trans-4-butylcyclohexane-1-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；8-11% (w/v) PEG 8,000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate (pH 6.3-6.7) or 11-14% (w/v) PEG 6,000, 0.1 M ammonium phosphate and 0.1 M TRIS (pH 7.9-8.0)
|
分辨率 4.25 Å R-free 0.296 |
| 6YK2 Structure of the AMPA receptor GluA2o ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the compound (S)-1-[2'-Amino-2'-carboxyethyl]-5,7-dihydrothieno[3,4-d]pyrimidin- 2,4(1H,3H)-dione at resolution 1.60A 提交 2020-04-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 10 CGW (2~{S})-2-azanyl-3-[2,4-bis(oxidanylidene)-5,7-dihydrothieno[3,4-d]pyrimidin-1-yl]propanoic acid × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；15% PEG4000, 0.3M Lithium Sulfate, 0.1M acetate
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.163 |
| 6YK3 Structure of the AMPA receptor GluA2o ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the compound ( S) - 1- [2'-Amino-2'-carboxyethyl]-5 ,7- dihydropyrrolo[3,4-d]pyrimidin-2,4(1H,3H)-dione at resolution 1.20A 提交 2020-04-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 8 SO4 SULFATE ION × 8 PVQ (S)-1-[2'-Amino-2'-carboxyethyl]-5,7-dihydropyrrolo[3,4-d]pyrimidin-2,4(1H,3H)-dione × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；20% PEG4000, 0.3M ammonium sulfate, 0.1M acetate
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.140 |
| 6YK4 Structure of the AMPA receptor GluA2o ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the compound ( S) - 1- [2'-Amino-2'-carboxyethyl]-6-methyl-5 ,7- dihydropyrrolo[3,4-d]pyrimidin-2,4(1H,3H)-dione at resolution 1.00A 提交 2020-04-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 GOL GLYCEROL × 8 LI LITHIUM ION × 2 CG8 (2~{S})-2-azanyl-3-[6-methyl-2,4-bis(oxidanylidene)-5,7-dihydropyrrolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]propanoic acid × 2 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；15.2% PEG4000, 0.3M lithium sulfate, 0.1M acetate
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.120 |
| 6YK5 Structure of the AMPA receptor GluA2o ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the compound (S)-1-(2'-Amino-2'-carboxyethyl)-5,7-dihydrofuro[3,4-d]- pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione at resolution 1.15A 提交 2020-04-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 8 SO4 SULFATE ION × 12 LI LITHIUM ION × 2 PVK (S)-1-(2'-Amino-2'-carboxyethyl)-5,7-dihydrofuro[3,4-d]-pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；279 K；PEG4000, lithium sulfate, acetate
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.130 |
| 6YK6 Structure of the AMPA receptor GluA2o ligand-binding domain (S1S2J) in complex with the compound (S)-1-(2'-Amino-2'-carboxyethyl)furo[3,4-d]pyrimidin-2,4-dione at resolution 1.47A 提交 2020-04-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 GOL GLYCEROL × 6 LI LITHIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 OUB (S)-1-(2'-Amino-2'-carboxyethyl)furo[3,4-d]pyrimidin-2,4-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；279 K；24.4% PEG4000, 0.15M lithium sulfate, 0.1M phosphate-citrate
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.172 |
| 6ZYU Structure of the GluA2 ligand-binding domain (L483Y-N754S) in complex with glutamate and BPAM549 提交 2020-08-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
|
突变：L483Y,N754S 突变：L483Y,N754S | ZN ZINC ION × 4 CAC CACODYLATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 4 GLU GLUTAMIC ACID × 2 QSZ (4~{S})-4-cyclopropyl-7-fluoranyl-3,4-dihydro-2~{H}-thiochromene 1,1-dioxide × 2 QSW (4~{R})-4-cyclopropyl-7-fluoranyl-3,4-dihydro-2~{H}-thiochromene 1,1-dioxide × 2 GOL GLYCEROL × 6 CL CHLORIDE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；299 K；Zinc acetate, polyethylene glycol 4000, cacodylate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.187 |
| 6ZYU Structure of the GluA2 ligand-binding domain (L483Y-N754S) in complex with glutamate and BPAM549 提交 2020-08-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–797（145 aa）
|
突变：L483Y,N754S 突变：L483Y,N754S 突变：L483Y,N754S 突变：L483Y,N754S | ZN ZINC ION × 6 ACT ACETATE ION × 3 GLU GLUTAMIC ACID × 2 QSZ (4~{S})-4-cyclopropyl-7-fluoranyl-3,4-dihydro-2~{H}-thiochromene 1,1-dioxide × 2 QSW (4~{R})-4-cyclopropyl-7-fluoranyl-3,4-dihydro-2~{H}-thiochromene 1,1-dioxide × 2 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；299 K；Zinc acetate, polyethylene glycol 4000, cacodylate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.187 |
| 7OCA Resting state full-length GluA1/A2 heterotertramer in complex with TARP gamma 8 and CNIH2 提交 2021-04-26 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
链 D
1–860（860 aa）
|
未记录 | E2Q 6-nitro-2,3-bis(oxidanylidene)-1,4-dihydrobenzo[f]quinoxaline-7-sulfonamide × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 46 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7OCC NTD of resting state GluA1/A2 heterotertramer 提交 2021-04-26 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–860（860 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7OCC NTD of resting state GluA1/A2 heterotertramer 提交 2021-04-26 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7OCD Resting state GluA1/A2 heterotetramer in complex with auxiliary subunit TARP gamma 8 (LBD-TMD) 提交 2021-04-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
链 D
1–860（860 aa）
|
未记录 | E2Q 6-nitro-2,3-bis(oxidanylidene)-1,4-dihydrobenzo[f]quinoxaline-7-sulfonamide × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7OCE Resting state GluA1/A2 AMPA receptor in complex with TARP gamma 8 and CNIH2 (LBD-TMD) 提交 2021-04-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
链 D
1–860（860 aa）
|
未记录 | E2Q 6-nitro-2,3-bis(oxidanylidene)-1,4-dihydrobenzo[f]quinoxaline-7-sulfonamide × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 46 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7OCF Active state GluA1/A2 AMPA receptor in complex with TARP gamma 8 and CNIH2 (LBD-TMD) 提交 2021-04-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
链 D
1–860（860 aa）
|
未记录 | CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 26 GLU GLUTAMIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7QHB Active state of GluA1/2 in complex with TARP gamma 8, L-glutamate and CTZ 提交 2021-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
链 D
1–860（860 aa）
|
未记录 | PAM PALMITOLEIC ACID × 14 GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 79N (2S)-2,3-dihydroxypropyl (7Z)-hexadec-7-enoate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM TRIS
150 mM NaCl
0.02 % GDN
87 uM CTZ
100 mM L-Glu
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3-4 second blots
|
分辨率 3.50 Å |
| 7QHH Desensitized state of GluA1/2 AMPA receptor in complex with TARP-gamma 8 (TMD-LBD) 提交 2021-12-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
链 D
1–860（860 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 PAM PALMITOLEIC ACID × 10 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 79N (2S)-2,3-dihydroxypropyl (7Z)-hexadec-7-enoate × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM TRIS
150 mM NaCl
0.02 % GDN
87 uM CTZ
100 mM L-Glu
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3-4 second blots
|
分辨率 3.60 Å |
| 7RYY Structure of the complex of LBD-TMD part of AMPA receptor GluA2 with auxiliary subunit TARP gamma-5 bound to agonist glutamate 提交 2021-08-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；25 mM glutamate was added to the purified protein and incubated on ice for 30 min before sample preparation
|
分辨率 4.40 Å |
| 7RYZ Structure of the complex of LBD-TMD part of AMPA receptor GluA2 with auxiliary subunit GSG1L bound to agonist quisqualate 提交 2021-08-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；1mM Quisqualate was added to the purified protein and incubated on ice for 30 min before sample preparation
|
分辨率 4.15 Å |
| 7RZ4 Structure of the complex of AMPA receptor GluA2 with auxiliary subunit TARP gamma-5 bound to competitive antagonist ZK 200775 提交 2021-08-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；0.1mM ZK was added to the purified protein and incubated on ice for 30 min before sample preparation
|
分辨率 3.60 Å |
| 7RZ5 Structure of the complex of LBD-TMD part of AMPA receptor GluA2 with auxiliary subunit TARP gamma-5 bound to competitive antagonist ZK 200775 提交 2021-08-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；0.1mM ZK was added to the purified protein and incubated on ice for 30 min before sample preparation
|
分辨率 3.30 Å |
| 7RZ6 Structure of the complex of AMPA receptor GluA2 with auxiliary subunit TARP gamma-5 bound to agonist glutamate 提交 2021-08-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；25 mM glutamate was added to the purified protein and incubated on ice for 30 min before sample preparation
|
分辨率 4.40 Å |
| 7RZ7 Structure of the complex of AMPA receptor GluA2 with auxiliary subunit TARP gamma-5 bound to agonist Quisqualate 提交 2021-08-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；1 mM Quisqualate was added to the purified protein and incubated on ice for 30 min before sample preparation
|
分辨率 4.20 Å |
| 7RZ8 Structure of the complex of LBD-TMD part of AMPA receptor GluA2 with auxiliary subunit TARP gamma-5 bound to agonist quisqualate 提交 2021-08-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 22 QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；1 mM Quisqualate was added to the purified protein and incubated on ice for 30 min before sample preparation
|
分辨率 4.10 Å |
| 7RZ9 Structure of the complex of AMPA receptor GluA2 with auxiliary subunit GSG1L in the apo state 提交 2021-08-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.15 Å |
| 7RZA Structure of the complex of AMPA receptor GluA2 with auxiliary subunit GSG1L bound to agonist quisqualate 提交 2021-08-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；1mM Quisqualate was added to the purified protein and incubated on ice for 30 min before sample preparation
|
分辨率 4.26 Å |
| 7TNK Complex GNNN of AMPA-subtype iGluR GluA2 in complex with auxiliary subunit gamma2 (Stargazin) at low glutamate concentration (20 uM) in the presence of cyclothiazide (100 uM) 提交 2022-01-21 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 1 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7TNL Complex GNGN1 of AMPA-subtype iGluR GluA2 in complex with auxiliary subunit gamma2 (Stargazin) at low glutamate concentration (20 uM) in the presence of cyclothiazide (100 uM) 提交 2022-01-21 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.59 Å |
| 7TNM Complex GNGN2 of AMPA-subtype iGluR GluA2 in complex with auxiliary subunit gamma2 (Stargazin) at low glutamate concentration (20 uM) in the presence of cyclothiazide (100 uM) 提交 2022-01-21 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.74 Å |
| 7TNN Complex GGNN of AMPA-subtype iGluR GluA2 in complex with auxiliary subunit gamma2 (Stargazin) at low glutamate concentration (20 uM) in the presence of cyclothiazide (100 uM) 提交 2022-01-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å |
| 7TNO Complex GGGN of AMPA-subtype iGluR GluA2 in complex with auxiliary subunit gamma2 (Stargazin) at low glutamate concentration (20 uM) in the presence of cyclothiazide (100 uM) 提交 2022-01-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 3 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.02 Å |
| 7TNP Complex GGGG of AMPA-subtype iGluR GluA2 in complex with auxiliary subunit gamma2 (Stargazin) at low glutamate concentration (20 uM) in the presence of cyclothiazide (100 uM) 提交 2022-01-21 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.96 Å |
| 8AYL Resting state GluA1/A2 AMPA receptor in complex with TARP gamma 8 and ligand JNJ-61432059 提交 2022-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
链 D
1–860（860 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 PLM PALMITIC ACID × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 6 OIJ 5-[2-(4-fluorophenyl)-7-(4-oxidanylpiperidin-1-yl)pyrazolo[1,5-c]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydroindol-2-one × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8AYM Resting state GluA1/A2 AMPA receptor in complex with TARP gamma 8 and ligand JNJ-55511118 提交 2022-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
链 D
1–860（860 aa）
|
未记录 | XVD 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 PLM PALMITIC ACID × 14 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8AYN Resting state GluA1/A2 AMPA receptor in complex with TARP gamma 8 and ligand LY3130481 提交 2022-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
链 D
1–860（860 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 PLM PALMITIC ACID × 14 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 OLR 6-[(1~{S})-1-[1-[5-(2-hydroxyethyloxy)pyridin-2-yl]pyrazol-3-yl]ethyl]-3~{H}-1,3-benzothiazol-2-one × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8AYO Open state GluA1/A2 AMPA receptor in complex with TARP gamma 8 and ligand JNJ-61432059 提交 2022-09-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–860（860 aa）
链 D
1–860（860 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 PLM PALMITIC ACID × 10 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 2 OIJ 5-[2-(4-fluorophenyl)-7-(4-oxidanylpiperidin-1-yl)pyrazolo[1,5-c]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydroindol-2-one × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8C1R Resting state homomeric GluA2 F231A mutant AMPA receptor in complex with TARP gamma-2 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 PLM PALMITIC ACID × 7 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8C1S Transmembrane domain of resting state homomeric GluA2 F231A mutant AMPA receptor in complex with TARP gamma 2 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 6 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8FP4 GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 500mM NaCl, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-Na610) 提交 2023-01-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 B
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 C
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 D
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 8FP9 GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 10mM CaCl2, 150mM NaCl, 1mM MgCl2, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-CaNaMg) 提交 2023-01-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100 mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33 mM) were added before freezing. The 1 M L-glutamic acid stock solution was adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.44 Å |
| 8FPC Conformation 1 of the ligand binding domain (LBDconf1) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 10mM CaCl2, 150mM NaCl, 1mM MgCl2, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-CaNaMg) 提交 2023-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100 mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33 mM) were added before freezing. The 1 M L-glutamic acid stock solution was adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.78 Å |
| 8FPG GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 10mM CaCl2, 150mM NaCl, 1mM MgCl2, 330uM CTZ, and 100uM CNQX (Closed-CaNaMg) 提交 2023-01-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion | CL CHLORIDE ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；6-cyano-7-nitroquinoxaline-2,3-dione (CNQX, 0.1 mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33 mM) were added before freezing.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.32 Å |
| 8FPH Conformation 2 of the ligand binding domain (LBDconf2) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 10mM CaCl2, 150mM NaCl, 1mM MgCl2, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-CaNaMg) 提交 2023-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100 mM) and cyclothiazide (CTZ, 330 uM) were added before freezing. The 1 M L-glutamic acid stock solution was adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 8FPK LBD conformation 1 of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 10mM CaCl2, 150mM NaCl, 1mM MgCl2, 330uM CTZ, and 100uM CNQX (Closed-CaNaMg) 提交 2023-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion | Y4Y 6-(aminomethyl)-7-nitro-1,4-dihydroquinoxaline-2,3-dione × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；6-cyano-7-nitroquinoxaline-2,3-dione (CNQX, 0.1 mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33 mM) were added before freezing.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 8FPL LBD conformation 2 (LBDconf2) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 10mM CaCl2, 150mM NaCl, 1mM MgCl2, 330uM CTZ, and 100uM CNQX (Closed-CaNaMg) 提交 2023-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion 突变：FLAG epitope tag (DYKDDDDK) insertion | Y4Y 6-(aminomethyl)-7-nitro-1,4-dihydroquinoxaline-2,3-dione × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；6-cyano-7-nitroquinoxaline-2,3-dione (CNQX, final conc. 0.1mM) and cyclothiazide (CTZ, final conc. 0.33mM) was added before freezing.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å |
| 8FPS GluA2 flip Q isoform N619K mutant of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 10mM CaCl2, 150mM NaCl, 1mM MgCl2, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-CaNaMg/N619K) 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 B
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 C
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 D
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
|
突变：N619K 突变：N619K 突变：N619K 突变：N619K | CL CHLORIDE ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.38 Å |
| 8FPV LBD conformation 1 (LBDconf1) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 500mM NaCl, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-Na610) 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 8FPY LBD conformation 2 (LBDconf2) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 500mM NaCl, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-Na610) 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 8FPZ LBD conformation 3 (LBDconf3) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 500mM NaCl, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-Na610) 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8FQ1 GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma2, with 150mM CaCl2, 330uM CTZ, and 100mM L-glutamate (Open-Ca150) 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 B
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 C
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 D
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.59 Å |
| 8FQ2 LBD conformation 1 (LBDconf1) of GluA2 flip Q isoform N619K mutant of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 10mM CaCl2, 150mM NaCl, 1mM MgCl2, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-CaNaMg/N619K) 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 B
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 C
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 D
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
|
突变：N619K 突变：N619K 突变：N619K 突变：N619K | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 8FQ3 LBD conformation 2 (LBDconf2) of GluA2 flip Q isoform N619K mutant of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 10mM CaCl2, 150mM NaCl, 1mM MgCl2, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-CaNaMg/N619K) 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 B
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 C
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 D
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
|
突变：N619K 突变：N619K 突变：N619K 突变：N619K | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 8FQ5 GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma2, with 140mM NMDG, 330uM CTZ, and 100mM L-glutamate (Open-Na110) 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.34 Å |
| 8FQ6 LBD of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma2, with 150mM CaCl2, 330uM CTZ, and 100mM L-glutamate (Open-Ca150) 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 B
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 C
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 D
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 8FQ8 LBD conformation 1 (LBDconf1) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma2, with 140mM NMDG, 330uM CTZ, and 100mM L-glutamate (Open-Na110) 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) were added before freezing. The 1 M L-glutamic acid stock solution was adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 8FQA LBD conformation 2 (LBDconf2) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma2, with 140mM NMDG, 330uM CTZ, and 100mM L-glutamate (Open-Na110) 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 8FQB GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma2, with 10mM CaCl2, 140mM NMDG, 330uM CTZ, and 100mM L-glutamate (Open-Ca10) 提交 2023-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 B
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 C
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
链 D
1–883（883 aa）
片段：DYKDDDDK near the C-terminal is a FLAG epitope tag used for purification
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.36 Å |
| 8FQD LBD conformation 1 (LBDconf1) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma2, with 10mM CaCl2, 140mM NMDG, 330uM CTZ, and 100mM L-glutamate (Open-Ca10) 提交 2023-01-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8FQE LBD conformation 2 (LBDconf2) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma2, with 10mM CaCl2, 140mM NMDG, 330uM CTZ, and 100mM L-glutamate (Open-Ca10) 提交 2023-01-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 8FQF GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 150mM NaCl, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-Na260) 提交 2023-01-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.29 Å |
| 8FQG LBD conformation 1 (LBDconf1) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 150mM NaCl, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-Na260) 提交 2023-01-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8FQH LBD conformation 2 (LBDconf2) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 150mM NaCl, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-Na260) 提交 2023-01-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 8FR0 LBD conformation 3 (LBDconf3) of GluA2 flip Q isoform of AMPA receptor in complex with gain-of-function TARP gamma-2, with 150mM NaCl, 330uM CTZ, and 100mM glutamate (Open-Na260) 提交 2023-01-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；L-glutamic acid (100mM) and cyclothiazide (CTZ, 0.33mM) was added before freezing. The 1M L-glutamic acid stock solution is adjusted to pH 7.4 using NaOH.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 8P3Q Homomeric GluA2 flip R/G-unedited Q/R-edited F231A mutant in tandem with TARP gamma-2, desensitized conformation 3 提交 2023-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 7 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 8P3S Homomeric GluA2 flip R/G-unedited Q/R-edited F231A mutant in tandem with TARP gamma-2, desensitized conformation 2 提交 2023-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | PLM PALMITIC ACID × 7 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 8P3X Homomeric GluA2 flip R/G-edited Q/R-edited F231A mutant in tandem with TARP gamma-2, desensitized conformation 1 提交 2023-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
突变：F231A 突变：F231A 突变：F231A 突变：F231A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 8P3Y Homomeric GluA2 flip R/G-edited Q/R-edited F231A mutant in tandem with TARP gamma-2, desensitized conformation 3 提交 2023-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
突变：F231A 突变：F231A 突变：F231A 突变：F231A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.55 Å |
| 8P3Z Homomeric GluA2 flip R/G-edited Q/R-edited F231A mutant in tandem with TARP gamma-2, desensitized conformation 2 提交 2023-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
突变：F231A 突变：F231A 突变：F231A 突变：F231A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.46 Å |
| 8QEZ Crystal structure of the AMPA receptor GluA2-L504Y-N775S ligand binding domain in complex with L-glutamate and positive allosteric modulator BPAM395 at 1.55A resolution 提交 2023-09-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
413–527（115 aa）
链 A
653–797（145 aa）
链 B
413–527（115 aa）
链 B
653–797（145 aa）
|
突变：L504Y,N775S 突变：L504Y,N775S 突变：L504Y,N775S 突变：L504Y,N775S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 5 ACT ACETATE ION × 7 UF5 6-chloranyl-4-cyclopropyl-2,3-dihydrothieno[3,2-e][1,2,4]thiadiazine 1,1-dioxide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；15.2% PEG4000, 0.1M Zn Acetate, 0.1M Cacodylate pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.195 |
| 8QEZ Crystal structure of the AMPA receptor GluA2-L504Y-N775S ligand binding domain in complex with L-glutamate and positive allosteric modulator BPAM395 at 1.55A resolution 提交 2023-09-01 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
413–527（115 aa）
链 C
653–797（145 aa）
|
突变：L504Y,N775S 突变：L504Y,N775S | GLU GLUTAMIC ACID × 2 ZN ZINC ION × 4 ACT ACETATE ION × 2 UF5 6-chloranyl-4-cyclopropyl-2,3-dihydrothieno[3,2-e][1,2,4]thiadiazine 1,1-dioxide × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 6 CAC CACODYLATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；279 K；15.2% PEG4000, 0.1M Zn Acetate, 0.1M Cacodylate pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.195 |
| 8SS2 Structure of AMPA receptor GluA2 complex with auxiliary subunits TARP gamma-5 and cornichon-2 bound to competitive antagonist ZK and channel blocker spermidine (closed state) 提交 2023-05-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 26 CLR CHOLESTEROL × 2 AJP Digitonin × 2 SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；vitrification carried out in nitrogen atmosphere
|
分辨率 3.58 Å |
| 8SS3 Structure of LBD-TMD of AMPA receptor GluA2 in complex with auxiliary subunits TARP gamma-5 and cornichon-2 bound to competitive antagonist ZK and channel blocker spermidine (closed state) 提交 2023-05-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 50 CLR CHOLESTEROL × 4 AJP Digitonin × 6 SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；vitrification carried out in nitrogen atmosphere
|
分辨率 3.21 Å |
| 8SS4 Structure of LBD-TMD of AMPA receptor GluA2 in complex with auxiliary subunits TARP gamma-5 and cornichon-2 (apo state) 提交 2023-05-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；vitrification carried out in nitrogen atmosphere
|
分辨率 3.30 Å |
| 8SS5 Structure of LBD-TMD of AMPA receptor GluA2 in complex with auxiliary subunit TARP gamma-5 (apo state) 提交 2023-05-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；vitrification carried out in nitrogen atmosphere
|
分辨率 3.56 Å |
| 8SS6 Structure of AMPA receptor GluA2 complex with auxiliary subunits TARP gamma-5 and cornichon-2 bound to competitive antagonist ZK, channel blocker spermidine and antiepileptic drug perampanel (closed state) 提交 2023-05-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | 6ZP 2-(6'-oxo-1'-phenyl[1',6'-dihydro[2,3'-bipyridine]]-5'-yl)benzonitrile × 4 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 28 CLR CHOLESTEROL × 8 NA SODIUM ION × 1 SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；vitrification carried out in nitrogen atmosphere
|
分辨率 3.01 Å |
| 8SS7 Structure of AMPA receptor GluA2 complex with auxiliary subunits TARP gamma-5 and cornichon-2 bound to competitive antagonist ZK, channel blocker spermidine and antiepileptic drug perampanel (closed state) 提交 2023-05-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | 6ZP 2-(6'-oxo-1'-phenyl[1',6'-dihydro[2,3'-bipyridine]]-5'-yl)benzonitrile × 4 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 28 CLR CHOLESTEROL × 8 NA SODIUM ION × 1 SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；vitrification carried out in nitrogen atmosphere
|
分辨率 2.76 Å |
| 8SS8 Structure of AMPA receptor GluA2 complex with auxiliary subunit TARP gamma-5 bound to competitive antagonist ZK and antiepileptic drug perampanel (closed state) 提交 2023-05-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | 6ZP 2-(6'-oxo-1'-phenyl[1',6'-dihydro[2,3'-bipyridine]]-5'-yl)benzonitrile × 4 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 14 NA SODIUM ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；vitrification carried out in nitrogen atmosphere
|
分辨率 2.81 Å |
| 8SS9 Structure of LBD-TMD of AMPA receptor GluA2 in complex with auxiliary subunit TARP gamma-5 bound to competitive antagonist ZK and antiepileptic drug perampanel (closed state) 提交 2023-05-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | 6ZP 2-(6'-oxo-1'-phenyl[1',6'-dihydro[2,3'-bipyridine]]-5'-yl)benzonitrile × 4 ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 14 CLR CHOLESTEROL × 2 NA SODIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；vitrification carried out in nitrogen atmosphere
|
分辨率 2.72 Å |
| 8SSA Structure of AMPA receptor GluA2 complex with auxiliary subunits TARP gamma-5 and cornichon-2 bound to glutamate and channel blocker spermidine (desensitized state) 提交 2023-05-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 12 GLU GLUTAMIC ACID × 4 SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；vitrification carried out in nitrogen atmosphere
|
分辨率 3.88 Å |
| 8SSB Structure of LBD-TMD of AMPA receptor GluA2 in complex with auxiliary subunits TARP gamma-5 and cornichon-2 bound to glutamate and channel blocker spermidine (desensitized state) 提交 2023-05-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 28 GLU GLUTAMIC ACID × 4 SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；vitrification carried out in nitrogen atmosphere
|
分辨率 3.66 Å |
| 8VJ6 GluA2 bound to GYKI-52466 and Glutamate, Inhibited State 1 提交 2024-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–842（818 aa）
链 B
25–842（818 aa）
链 C
25–842（818 aa）
链 D
25–842（818 aa）
|
未记录 | A1AB5 4-[(5S,8R)-8-methyl-6,7,8,9-tetrahydro-2H,5H-[1,3]dioxolo[4,5-h][2,3]benzodiazepin-5-yl]aniline × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8VJ7 GluA2 bound to GYKI-52466 and Glutamate, Inhibited State 2 提交 2024-01-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–842（818 aa）
链 B
25–842（818 aa）
链 C
25–842（818 aa）
链 D
25–842（818 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 A1AB5 4-[(5S,8R)-8-methyl-6,7,8,9-tetrahydro-2H,5H-[1,3]dioxolo[4,5-h][2,3]benzodiazepin-5-yl]aniline × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.85 Å |
| 9B5Z GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH8, consensus structure of LBD-TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.71 Å |
| 9B60 GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH8, consensus structure of TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å |
| 9B61 GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH5, consensus structure of LBD-TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl.
4 micro litter of protein in buffer was mixed with 1 micro litter of 50mM citric acid buffer (the 50mM citric acid buffer was prepared by diluting 0.5M citric acid/sodium citrate buffer at pH4.0) immediately before applying the sample to the grid.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å |
| 9B63 GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH5, consensus structure of TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl.
4 micro litter of protein in buffer was mixed with 1 micro litter of 50mM citric acid buffer (the 50mM citric acid buffer was prepared by diluting 0.5M citric acid/sodium citrate buffer at pH4.0) immediately before applying the sample to the grid.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 9B64 GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH5, class23, structure of LBD-TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl.
4 micro litter of protein in buffer was mixed with 1 micro litter of 50mM citric acid buffer (the 50mM citric acid buffer was prepared by diluting 0.5M citric acid/sodium citrate buffer at pH4.0) immediately before applying the sample to the grid.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 9B67 GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH8, class1, structure of LBD-TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 9B68 GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH8, class1, structure of NTD 提交 2024-03-23 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9B69 GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH8, class12, structure of NTD 提交 2024-03-23 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 9B6A GluA2 flip Q in complex with TARPgamma2 at pH8, class12, structure of LBD-TMD-TARPgamma2 提交 2024-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–883（883 aa）
链 B
1–883（883 aa）
链 C
1–883（883 aa）
链 D
1–883（883 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；Tris adjusted to pH 8 using HCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 9DHP Resting state 1 of the GluA2-gamma2 complex 提交 2024-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
412–841（430 aa）
链 B
412–841（430 aa）
链 C
412–841（430 aa）
链 D
412–841（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.18 Å |
| 9DHQ Resting state 2 of the GluA2-gamma2 complex 提交 2024-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
412–841（430 aa）
链 B
412–841（430 aa）
链 C
412–841（430 aa）
链 D
412–841（430 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.78 Å |
| 9DHR Glutamate activated state of the GluA2-gamma2 complex 提交 2024-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
412–841（430 aa）
链 B
412–841（430 aa）
链 C
412–841（430 aa）
链 D
412–841（430 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 9DHS Desensitized state 1 of the GluA2-gamma2 complex 提交 2024-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
412–841（430 aa）
链 B
412–841（430 aa）
链 C
412–841（430 aa）
链 D
412–841（430 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.48 Å |
| 9DHT Desensitized state 2 of the GluA2-gamma2 complex 提交 2024-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
412–841（430 aa）
链 B
412–841（430 aa）
链 C
412–841（430 aa）
链 D
412–841（430 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.31 Å |
| 9E4Y GluA2-gamma2 complex bound to memantine, glutamate, and cyclothiazide 提交 2024-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
25–841（817 aa）
链 B
25–841（817 aa）
链 C
25–841（817 aa）
链 D
25–841（817 aa）
|
未记录 | 377 Memantine × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 9E4Z GluA2-gamma2 complex bound glutamate and cyclothiazide 提交 2024-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
25–841（817 aa）
链 B
25–841（817 aa）
链 C
25–841（817 aa）
链 D
25–841（817 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 CYZ CYCLOTHIAZIDE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9E9D Structure of full length AMPA receptor GluA2 and auxiliary subunit TARP gamma-2 in complex with anti-miR 17 oligonucleotide RGLS4326 提交 2024-11-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
未记录 | A1BX3 O-{[(1S,3S,4R,6S,7R)-7-{[(R)-{[(1R,3R,4R,6S,7R)-3-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-7-hydroxy-6-methyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-1-yl]methoxy}(sulfanyl)phosphoryl]oxy}-3-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-6-methyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-1-yl]methyl} O-[(2R,3S,4R,5S)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-4-methoxy-2-methyloxolan-3-yl] hydrogen (R)-phosphorothioate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å |
| 9E9E Structure of AMPA receptor GluA2 and auxiliary subunit TARP gamma-2 (LBD-TMD) in complex with anti-miR 17 oligonucleotide RGLS4326 提交 2024-11-08 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
25–847（823 aa）
链 B
25–847（823 aa）
链 C
25–847（823 aa）
链 D
25–847（823 aa）
|
突变：N48D 突变：N48D 突变：N48D 突变：N48D | A1BX3 O-{[(1S,3S,4R,6S,7R)-7-{[(R)-{[(1R,3R,4R,6S,7R)-3-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-7-hydroxy-6-methyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-1-yl]methoxy}(sulfanyl)phosphoryl]oxy}-3-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-6-methyl-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-1-yl]methyl} O-[(2R,3S,4R,5S)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-4-methoxy-2-methyloxolan-3-yl] hydrogen (R)-phosphorothioate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å |
| 9MRK Glutamate activated state of the GluA2-gamma2 complex prepared at 37 degrees C 提交 2025-01-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
412–841（430 aa）
链 B
412–841（430 aa）
链 C
412–841（430 aa）
链 D
412–841（430 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 9MRL Desensitized state 1 of the GluA2-gamma2 complex prepared at 37 degrees C 提交 2025-01-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
412–841（430 aa）
链 B
412–841（430 aa）
链 C
412–841（430 aa）
链 D
412–841（430 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.17 Å |
| 9MRM Desensitized state 2 of the GluA2-gamma2 complex prepared at 37 degrees C 提交 2025-01-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
412–841（430 aa）
链 B
412–841（430 aa）
链 C
412–841（430 aa）
链 D
412–841（430 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.52 Å |
| 9MRN Consensus glutamate activated state of the GluA2-gamma2 complex 提交 2025-01-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
412–841（430 aa）
链 B
412–841（430 aa）
链 C
412–841（430 aa）
链 D
412–841（430 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.46 Å |
| 9OVT Heteromeric GluA1/A2 in the inactive state, composite map of LBD-TMD 提交 2025-05-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
413–841（429 aa）
链 D
413–841（429 aa）
|
未记录 | ZK1 {[7-morpholin-4-yl-2,3-dioxo-6-(trifluoromethyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl]methyl}phosphonic acid × 4 NA SODIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；150 mM NaCl, 20 mM Tris-HCl pH 8.0, and 0.05% digitonin, 100 uM ZK-200775
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9OVU Composite map of GluA1/A2 in the activated state, in complex with positive allosteric modulator (R,R)-2b and agonist glutamate (ATD-LBD-TMD) 提交 2025-05-31 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–847（847 aa）
链 D
1–847（847 aa）
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未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 NA SODIUM ION × 1 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；150 mM NaCl, 20 mM Tris-HCl pH 8.0, and 0.05% digitonin, 500 uM (R,R)-2b, 1 mM glutamate
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |
| 9OVV Heteromeric GluA1/A2-CNIH1 in the activated state, composite map of LBD-TMD 提交 2025-05-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
413–840（428 aa）
链 D
413–840（428 aa）
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未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 16 FWF N,N'-[biphenyl-4,4'-diyldi(2R)propane-2,1-diyl]dipropane-2-sulfonamide × 2 NA SODIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；150 mM NaCl, 20 mM Tris-HCl pH 8.0, and 0.05% digitonin, 500 uM (R,R)-2b, 1 mM glutamate
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.76 Å |
| 9OVW Heteromeric GluA1/A2 in the desensitized state, composite map of ATD-LBD-TMD 提交 2025-05-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
25–841（817 aa）
链 D
25–841（817 aa）
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未记录 | QUS (S)-2-AMINO-3-(3,5-DIOXO-[1,2,4]OXADIAZOLIDIN-2-YL)-PROPIONIC ACID × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；150 mM NaCl, 20 mM Tris-HCl pH 8.0, and 0.05% digitonin, 1 mM quiqualate
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.91 Å |