当前蛋白身份：Q12306
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11HK SARS-CoV-2 spike S2 trimer stabilized in the early fusion intermediate conformation (E-FICs-v3) bound to the VN01H1 Fab (Fab local refinement) 提交 2026-02-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–94（94 aa）
链 D
1–94（94 aa）
链 G
1–94（94 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 11HL SARS-CoV-2 spike S2 trimer stabilized in the early fusion intermediate conformation (E-FICs-v3) bound to the VN01H1 Fab (S2 local refinement) 提交 2026-02-24 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–94（94 aa）
链 B
1–94（94 aa）
链 C
1–94（94 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 11HN SARS-CoV-2 spike S2 trimer stabilized in the early fusion intermediate conformation (E-FICs-v3) bound to C77G12 (S2 local refinement) 提交 2026-02-24 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–94（94 aa）
链 B
1–94（94 aa）
链 C
1–94（94 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 11HW SARS-CoV-2 spike S2 trimer stabilized in the early fusion intermediate conformation (E-FICs-v3) bound to C77G12 (Fab local refinement) 提交 2026-02-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–94（94 aa）
链 B
1–94（94 aa）
链 G
1–94（94 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 1EUV X-RAY STRUCTURE OF THE C-TERMINAL ULP1 PROTEASE DOMAIN IN COMPLEX WITH SMT3, THE YEAST ORTHOLOG OF SUMO. 提交 2000-04-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
13–98（86 aa）
片段：SMT3 RESIDUES 13-98
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；0.1M MES pH6.5, 10% w/v polyethylene glycol 20000, 3% w/v 1,6-hexandiol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.251 |
| 1L2N Smt3 Solution Structure 提交 2002-02-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–101（101 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；压力 1
NMR样品组成
1 mM C13 and 15N Labelled | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2EKE Structure of a SUMO-binding-motif mimic bound to Smt3p-Ubc9p: conservation of a noncovalent Ubiquitin-like protein-E2 complex as a platform for selective interactions within a SUMO pathway 提交 2007-03-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
13–98（86 aa）
|
突变：thrombin site, Ubiquitin-like | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；18% PEG 3350, 0.2M magnesium chloride, 0.1M Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 2EKE Structure of a SUMO-binding-motif mimic bound to Smt3p-Ubc9p: conservation of a noncovalent Ubiquitin-like protein-E2 complex as a platform for selective interactions within a SUMO pathway 提交 2007-03-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
13–98（86 aa）
|
突变：thrombin site, Ubiquitin-like | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；18% PEG 3350, 0.2M magnesium chloride, 0.1M Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 3PGE Structure of sumoylated PCNA 提交 2010-11-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–98（98 aa）
片段：sumo-C fragment of PCNA
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；2.0M Ammonium Sulfate, 0.1M sodium Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 3QHT Crystal Structure of the Monobody ySMB-1 bound to yeast SUMO 提交 2011-01-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–98（97 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；292 K；14% PEG8000, 16% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.272 |
| 3QHT Crystal Structure of the Monobody ySMB-1 bound to yeast SUMO 提交 2011-01-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–98（97 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；292 K；14% PEG8000, 16% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.272 |
| 3TIX Crystal structure of the Chp1-Tas3 complex core 提交 2011-08-22 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
3–98（96 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN,N-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 4 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；290 K；microseeding in 0.95 M potassium sodium tartrate, 100 mM MES, 180 mM sodium thiocyanate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.243 |
| 3TIX Crystal structure of the Chp1-Tas3 complex core 提交 2011-08-22 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
3–98（96 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN,N-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 4 K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；290 K；microseeding in 0.95 M potassium sodium tartrate, 100 mM MES, 180 mM sodium thiocyanate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.243 |
| 3UF8 Crystal structure of a SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase with a G95A surface mutation from Burkholderia pseudomallei complexed with FK506 提交 2011-10-31 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
突变：G95A | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；290 K；Internal tracking number 226425. JCSG well A8. 0.2M Ammonium Formate, 20.0% w/v PEG3500, PEG400 Cryo. BupsA.00130.a.D242 PD00198 21.4mg/ml, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.183 |
| 3UQA Crystal structure of a SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase with surface mutation A54E from Burkholderia pseudomallei complexed with FK506 提交 2011-11-19 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
突变：A54E | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；290 K；Internal tracking number 226422. JCSG well A9. 0.2M Ammonium Chloride, 20.0% w/v PEG3500, 30% PEG400 Cryo. BupsA.00130.a.D220 PD00197 19.3mg/ml., pH 7.00, vapor diffusion, sitting drop, temperature 290K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.193 |
| 3UQB Crystal structure of a SMT Fusion PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE with surface mutation D44G from Burkholderia pseudomallei complexed with FK506 提交 2011-11-19 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
突变：D44G | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；290 K；Internal tracking number 226421. PACT well B6. 0.1M MIB Buffer pH 9.0, 25.0% w/v PEG1500, 30% PEG400 Cryo. BUPSA.00130.A.D214 PD00190/6 23.7mg/ml, vapor diffusion, sitting drop, temperature 290K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |
| 3V60 Structure of S. cerevisiae PCNA conjugated to SUMO on lysine 164 提交 2011-12-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
20–98（79 aa）
片段：unp resicues 20-98
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；4% PEG 8000, 500 mM LiSO4, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.249 |
| 3V61 Structure of S. cerevisiae PCNA conjugated to SUMO on lysine 164 提交 2011-12-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
20–98（79 aa）
片段：unp residues 20-98
|
未记录 | BA BARIUM ION × 13 NEQ N-ETHYLMALEIMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；21% MPD, 100 mM BaCl2, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.254 |
| 3V62 Structure of the S. cerevisiae Srs2 C-terminal domain in complex with PCNA conjugated to SUMO on lysine 164 提交 2011-12-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
20–98（79 aa）
片段：unp residues 20-98
|
突变：GSH from N-tag after thrombin cleavage, K19R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NEQ N-ETHYLMALEIMIDE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；279 K；1.9 M AMMONIUM SULFATE
4% PEG 400
100 mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.237 |
| 3V62 Structure of the S. cerevisiae Srs2 C-terminal domain in complex with PCNA conjugated to SUMO on lysine 164 提交 2011-12-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
20–98（79 aa）
片段：unp residues 20-98
|
突变：GSH from N-tag after thrombin cleavage, K19R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NEQ N-ETHYLMALEIMIDE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；279 K；1.9 M AMMONIUM SULFATE
4% PEG 400
100 mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.237 |
| 3VAW Crystal structure of a smt fusion peptidyl-prolyl cis-trans isomerase with surface mutation v3i from burkholderia pseudomallei complexed with fk506 提交 2011-12-29 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–99（87 aa）
片段：Q12306 RESIDUES 13-99, Q3JK38 RESIDUES 2-113
|
突变：V3I,V3I | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；290 K；Internal tracking number 226593. PACT well H3. 0.2M Sodium Iodide, 0.1M Bis-Tris Propane, pH 8.5, 20.0% w/v PEG3350, 30% PEG400 Cryo. BupsA.00130.a.D24 PD00194 19.6mg/ml., vapor diffusion, sitting drop, temperature 290K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.194 |
| 4FN2 Crystal structure of a SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase with surface mutation D44G from Burkholderia pseudomallei complexed with CJ37 提交 2012-06-19 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
突变：D44G | 854 ethyl (2S)-1-(benzylsulfonyl)piperidine-2-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Internal tracking number 233926b1. Puck VKT6-6, Morpheus well B1. 10% PEG 20,000, 20% PEG MME550, 0.03M Halides (NaF, NaBr, NaI), 0.1M MES/Imidazole pH 6.5, Direct Cryo. BupsA.00130.a.D214, 20.00 mg/ml, CJ37 (EBSI2854), vapor diffusion, sitting drop, temperature 295K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.224 |
| 4FN2 Crystal structure of a SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase with surface mutation D44G from Burkholderia pseudomallei complexed with CJ37 提交 2012-06-19 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
突变：D44G | 854 ethyl (2S)-1-(benzylsulfonyl)piperidine-2-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Internal tracking number 233926b1. Puck VKT6-6, Morpheus well B1. 10% PEG 20,000, 20% PEG MME550, 0.03M Halides (NaF, NaBr, NaI), 0.1M MES/Imidazole pH 6.5, Direct Cryo. BupsA.00130.a.D214, 20.00 mg/ml, CJ37 (EBSI2854), vapor diffusion, sitting drop, temperature 295K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.224 |
| 4G50 Crystal structure of a SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase with surface mutation D44G from Burkholderia pseudomallei complexed with CJ168 提交 2012-07-17 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
突变：D44G | 861 3-(3,4,5-trimethoxyphenyl)propyl (2S)-1-(benzylsulfonyl)piperidine-2-carboxylate × 1 FMT FORMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Internal tracking number 233897a9. Puck VKT6-9, JCSG_A8 optimization. 50mM Ammonium formate, 24.55% PEG 3,350, 10% ethylene glycol. BupsA.00130.a.D214, 20.00 mg/ml, CJ168 (EBSI2861), pH 7.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 295K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.219 |
| 4G50 Crystal structure of a SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase with surface mutation D44G from Burkholderia pseudomallei complexed with CJ168 提交 2012-07-17 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
突变：D44G | 861 3-(3,4,5-trimethoxyphenyl)propyl (2S)-1-(benzylsulfonyl)piperidine-2-carboxylate × 1 FMT FORMIC ACID × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Internal tracking number 233897a9. Puck VKT6-9, JCSG_A8 optimization. 50mM Ammonium formate, 24.55% PEG 3,350, 10% ethylene glycol. BupsA.00130.a.D214, 20.00 mg/ml, CJ168 (EBSI2861), pH 7.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 295K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.219 |
| 4GGQ Crystal structure of a SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase from Burkholderia pseudomallei complexed with CJ40 提交 2012-08-07 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 861 3-(3,4,5-trimethoxyphenyl)propyl (2S)-1-(benzylsulfonyl)piperidine-2-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Internal tracking number 235051a1. Puck IBH5-4, Morpheus well A1. 10% PEG 20,000, 20% PEG MME550, 0.03M Divalent Catios (MgCl2, CaCl2), 0.1M MES/Imidazole pH 6.5, Direct Cryo. BupsA.00130.a.D21, 20.00 mg/ml, CJ40 (EBSI2855), vapor diffusion, sitting drop, temperature 295K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.220 |
| 4GGQ Crystal structure of a SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase from Burkholderia pseudomallei complexed with CJ40 提交 2012-08-07 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 861 3-(3,4,5-trimethoxyphenyl)propyl (2S)-1-(benzylsulfonyl)piperidine-2-carboxylate × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Internal tracking number 235051a1. Puck IBH5-4, Morpheus well A1. 10% PEG 20,000, 20% PEG MME550, 0.03M Divalent Catios (MgCl2, CaCl2), 0.1M MES/Imidazole pH 6.5, Direct Cryo. BupsA.00130.a.D21, 20.00 mg/ml, CJ40 (EBSI2855), vapor diffusion, sitting drop, temperature 295K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.220 |
| 4GGQ Crystal structure of a SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase from Burkholderia pseudomallei complexed with CJ40 提交 2012-08-07 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
未记录 | 861 3-(3,4,5-trimethoxyphenyl)propyl (2S)-1-(benzylsulfonyl)piperidine-2-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Internal tracking number 235051a1. Puck IBH5-4, Morpheus well A1. 10% PEG 20,000, 20% PEG MME550, 0.03M Divalent Catios (MgCl2, CaCl2), 0.1M MES/Imidazole pH 6.5, Direct Cryo. BupsA.00130.a.D21, 20.00 mg/ml, CJ40 (EBSI2855), vapor diffusion, sitting drop, temperature 295K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.220 |
| 4GGQ Crystal structure of a SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase from Burkholderia pseudomallei complexed with CJ40 提交 2012-08-07 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
未记录 | 861 3-(3,4,5-trimethoxyphenyl)propyl (2S)-1-(benzylsulfonyl)piperidine-2-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Internal tracking number 235051a1. Puck IBH5-4, Morpheus well A1. 10% PEG 20,000, 20% PEG MME550, 0.03M Divalent Catios (MgCl2, CaCl2), 0.1M MES/Imidazole pH 6.5, Direct Cryo. BupsA.00130.a.D21, 20.00 mg/ml, CJ40 (EBSI2855), vapor diffusion, sitting drop, temperature 295K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.220 |
| 4GIV Crystal structure of a SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase with surface mutation D44G from Burkholderia pseudomallei complexed with CJ183 提交 2012-08-09 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
突变：D44G | 4GI 3-(pyridin-3-yl)propyl (2S)-1-[(3-nitrophenyl)sulfonyl]piperidine-2-carboxylate × 1 FMT FORMIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Internal tracking number 232625a12. Puck IBH5-9, JCSG_A8 optimization screen. 50mM Ammonium Formate, 30% PEG3,350, 25% ethylene glycol cryo-protected. BupsA.00130.a.D214, 20.00 mg/ml, CJ183 (EBSI2864), pH 7.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 295K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.262 |
| 4GIV Crystal structure of a SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase with surface mutation D44G from Burkholderia pseudomallei complexed with CJ183 提交 2012-08-09 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
13–98（86 aa）
片段：Q12306 residues 13-98, Q3JK38 residues 2-113
|
突变：D44G | 4GI 3-(pyridin-3-yl)propyl (2S)-1-[(3-nitrophenyl)sulfonyl]piperidine-2-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Internal tracking number 232625a12. Puck IBH5-9, JCSG_A8 optimization screen. 50mM Ammonium Formate, 30% PEG3,350, 25% ethylene glycol cryo-protected. BupsA.00130.a.D214, 20.00 mg/ml, CJ183 (EBSI2864), pH 7.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 295K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.262 |
| 5D6J Crystal structure of a mycobacterial protein 提交 2015-08-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
21–94（74 aa）
片段：UNP RESIDUES 21-94
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；281 K；0.2 M sodium malonate, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.206 |
| 5JNE E2-SUMO-Siz1 E3-SUMO-PCNA complex 提交 2016-04-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
20–98（79 aa）
片段：unp residues 167-445
链 C
19–98（80 aa）
|
突变：Siz1 C361D, Smt3 Delta N-terminus 1-18 突变：N-terminal 1-18 delete, K19R | ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 6LN ethane-1,2-dithiol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8.5), 5% PEG 10,000, 0.2 M NaCl, 10% glycerol, 3% dioxane
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.250 |
| 5JNE E2-SUMO-Siz1 E3-SUMO-PCNA complex 提交 2016-04-29 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
20–98（79 aa）
片段：unp residues 167-445
链 G
19–98（80 aa）
|
突变：Siz1 C361D, Smt3 Delta N-terminus 1-18 突变：N-terminal 1-18 delete, K19R | ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 6LN ethane-1,2-dithiol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8.5), 5% PEG 10,000, 0.2 M NaCl, 10% glycerol, 3% dioxane
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.250 |
| 5KLX Crystal Structure of SMT Fusion Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase from Burkholderia Pseudomallei Complexed with SF110 提交 2016-06-26 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
片段：UNP Q12306 residues 13-98,UNP Q3JK38 residues 2-113
|
未记录 | 6UO 2-[(2~{S})-1-(phenylmethyl)sulfonylpiperidin-2-yl]carbonyloxyethyl pyridine-3-carboxylate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IMD IMIDAZOLE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；BUPSA.00130.A.D21 (CID4597, SMT TAG ON, BATCH 1264062) AT 10.37MG/ML (IN 25MM TRIS, PH8.0, 200MM NACL, 1% GLYCEROL, 1MM TCEP BUFFER) WAS INCUBATED WITH 2MM SF110_S (BSI5665). CRYSTALS WERE PRODUCED BY SITTING DROP VAPOR IFFUSION WITH AN EQUAL VOLUME COMBINATION OF THE PROTEIN/LIGAND COMPLEX AND A SOLUTION CONTAINING 10% W/V PEG20,000, 20% V/V PEG MME 550, 0.03M MGCL2, 0.03M CACL2, 0.1M MES/IMIDAZOLE, PH6.5 (MORPHEUS A1). CRYSTAL TRACKING ID 273103A1, RVA0-10, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 289K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.256 |
| 5KLX Crystal Structure of SMT Fusion Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase from Burkholderia Pseudomallei Complexed with SF110 提交 2016-06-26 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
13–98（86 aa）
片段：UNP Q12306 residues 13-98,UNP Q3JK38 residues 2-113
|
未记录 | 6UO 2-[(2~{S})-1-(phenylmethyl)sulfonylpiperidin-2-yl]carbonyloxyethyl pyridine-3-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；BUPSA.00130.A.D21 (CID4597, SMT TAG ON, BATCH 1264062) AT 10.37MG/ML (IN 25MM TRIS, PH8.0, 200MM NACL, 1% GLYCEROL, 1MM TCEP BUFFER) WAS INCUBATED WITH 2MM SF110_S (BSI5665). CRYSTALS WERE PRODUCED BY SITTING DROP VAPOR IFFUSION WITH AN EQUAL VOLUME COMBINATION OF THE PROTEIN/LIGAND COMPLEX AND A SOLUTION CONTAINING 10% W/V PEG20,000, 20% V/V PEG MME 550, 0.03M MGCL2, 0.03M CACL2, 0.1M MES/IMIDAZOLE, PH6.5 (MORPHEUS A1). CRYSTAL TRACKING ID 273103A1, RVA0-10, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 289K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.256 |
| 5KLX Crystal Structure of SMT Fusion Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase from Burkholderia Pseudomallei Complexed with SF110 提交 2016-06-26 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
13–98（86 aa）
片段：UNP Q12306 residues 13-98,UNP Q3JK38 residues 2-113
|
未记录 | 6UO 2-[(2~{S})-1-(phenylmethyl)sulfonylpiperidin-2-yl]carbonyloxyethyl pyridine-3-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；BUPSA.00130.A.D21 (CID4597, SMT TAG ON, BATCH 1264062) AT 10.37MG/ML (IN 25MM TRIS, PH8.0, 200MM NACL, 1% GLYCEROL, 1MM TCEP BUFFER) WAS INCUBATED WITH 2MM SF110_S (BSI5665). CRYSTALS WERE PRODUCED BY SITTING DROP VAPOR IFFUSION WITH AN EQUAL VOLUME COMBINATION OF THE PROTEIN/LIGAND COMPLEX AND A SOLUTION CONTAINING 10% W/V PEG20,000, 20% V/V PEG MME 550, 0.03M MGCL2, 0.03M CACL2, 0.1M MES/IMIDAZOLE, PH6.5 (MORPHEUS A1). CRYSTAL TRACKING ID 273103A1, RVA0-10, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 289K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.256 |
| 5KLX Crystal Structure of SMT Fusion Peptidyl-Prolyl Cis-Trans Isomerase from Burkholderia Pseudomallei Complexed with SF110 提交 2016-06-26 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
13–98（86 aa）
片段：UNP Q12306 residues 13-98,UNP Q3JK38 residues 2-113
|
未记录 | 6UO 2-[(2~{S})-1-(phenylmethyl)sulfonylpiperidin-2-yl]carbonyloxyethyl pyridine-3-carboxylate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；BUPSA.00130.A.D21 (CID4597, SMT TAG ON, BATCH 1264062) AT 10.37MG/ML (IN 25MM TRIS, PH8.0, 200MM NACL, 1% GLYCEROL, 1MM TCEP BUFFER) WAS INCUBATED WITH 2MM SF110_S (BSI5665). CRYSTALS WERE PRODUCED BY SITTING DROP VAPOR IFFUSION WITH AN EQUAL VOLUME COMBINATION OF THE PROTEIN/LIGAND COMPLEX AND A SOLUTION CONTAINING 10% W/V PEG20,000, 20% V/V PEG MME 550, 0.03M MGCL2, 0.03M CACL2, 0.1M MES/IMIDAZOLE, PH6.5 (MORPHEUS A1). CRYSTAL TRACKING ID 273103A1, RVA0-10, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 289K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.256 |
| 5V8T Crystal structure of SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase from Burkholderia pseudomallei complexed with SF354 提交 2017-03-22 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–97（85 aa）
片段：unp residues 13-97; unp residues 2-113
|
未记录 | 8ZV 2-{[3,5-bis(2-methoxyethoxy)benzene-1-carbonyl]amino}ethyl (2S)-1-(benzylsulfonyl)piperidine-2-carboxylate × 1 FMT FORMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；BupsA.00130.a.D21 (CID4597, SMT tag on, Batch 776103) at 10.37mg/ml (in 25mM Tris, pH8.0, 200mM NaCl, 1% glycerol, 1mM TCEP buffer) was incubated with 2mM SF354 (BSI5672). Crystals were produced by sitting drop vapor diffusion with an equal volume combination of the protein/ligand complex and a solution containing 24.55% (w/v) PEG-3350, 50 mM ammonium formate (JCSG_A8 opt screen d7) and cryoprotected with 15% ethylene glycol. Crystal Tracking ID 274545d7, uxe3-7
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.221 |
| 5V8T Crystal structure of SMT fusion Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase from Burkholderia pseudomallei complexed with SF354 提交 2017-03-22 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
13–97（85 aa）
片段：unp residues 13-97; unp residues 2-113
|
未记录 | 8ZV 2-{[3,5-bis(2-methoxyethoxy)benzene-1-carbonyl]amino}ethyl (2S)-1-(benzylsulfonyl)piperidine-2-carboxylate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；289 K；BupsA.00130.a.D21 (CID4597, SMT tag on, Batch 776103) at 10.37mg/ml (in 25mM Tris, pH8.0, 200mM NaCl, 1% glycerol, 1mM TCEP buffer) was incubated with 2mM SF354 (BSI5672). Crystals were produced by sitting drop vapor diffusion with an equal volume combination of the protein/ligand complex and a solution containing 24.55% (w/v) PEG-3350, 50 mM ammonium formate (JCSG_A8 opt screen d7) and cryoprotected with 15% ethylene glycol. Crystal Tracking ID 274545d7, uxe3-7
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.221 |
| 5YC2 Crystal structure of inner membrane protein Bqt4 in complex with telomeric protein Rap1 提交 2017-09-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
20–92（73 aa）
|
突变：Q61E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5, 10% v/v 2-Propanol, 20% w/v Polyethyleneglycol 4000.
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.249 |
| 5YC2 Crystal structure of inner membrane protein Bqt4 in complex with telomeric protein Rap1 提交 2017-09-06 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
20–92（73 aa）
|
突变：Q61E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5, 10% v/v 2-Propanol, 20% w/v Polyethyleneglycol 4000.
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.249 |
| 5YCA Crystal structure of inner membrane protein Bqt4 in complex with LEM2 提交 2017-09-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
20–92（73 aa）
|
突变：Q61E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；289 K；1600 mM Sodium citrate tribasic
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.214 |
| 6CFP CRYSTAL STRUCTURE OF POLYMERASE ACID PROTEIN (PA) FROM INFLUENZA A VIRUS, WILSON-SMITH/1933 (H1N1) BOUND TO FRAGMENT HIT BSI-70565 1-{1-[4-FLUOROPHENYL)METHYL]-2-METHYL-1H-IMIDAZOL-4-YL}ETHAN-1-ONE 提交 2018-02-15 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
|
未记录 | EZS 1-{1-[(4-fluorophenyl)methyl]-2-methyl-1H-imidazol-4-yl}ethan-1-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；MOLECULAR DIMENSIONS MORPHEUS
SCREEN D10: 10% PEG 8000, 20% ETHYLENE GLYCOL; 20MM OF EACH 1,
6-HEXANEDIOL, 1-BUTANOL, 1,2-PROPANEDIOL, 2-PROPANOL, 1,4-
BUTANEDIOL, 1,3-PROPANEDIOL; 100MM TRIS/BICINE PH 8.5;
INVAA.07057.A.D15. AT 20.0 MG/ML, OVERNIGHT SOAK WITH 7 MM
BSI70565, DIRECT CRYO; tray 297881d10, puck WXU6-7
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.231 |
| 6O49 CRYSTAL STRUCTURE OF SMT FUSION PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE FROM BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI COMPLEXED WITH SF339 提交 2019-02-28 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
|
未记录 | LL7 (2~{S})-~{N}-[3-oxidanylidene-3-[(3,4,5-trimethoxyphenyl)amino]propyl]-1-(phenylmethyl)sulfonyl-piperidine-2-carboxamide × 1 CA CALCIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；BupsA.00130.a.D21 (CID4597, SMT tag on, Batch 1264062) at 10.37mg/ml (in 25mM Tris, pH8.0, 200mM NaCl, 1% glycerol, 1mM TCEP buffer) was incubated with 2mM SF339_S (BSI5671). Crystals were produced by sitting drop vapor diffusion with an equal volume combination of the protein/ligand complex and a solution containing 100 mM MES pH 6.0, 200 mM Calcium chloride dehydrate, 20% PEG6000 (PACT B11). Crystal Tracking ID 297348b11, izs6-2
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.211 |
| 6O49 CRYSTAL STRUCTURE OF SMT FUSION PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE FROM BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI COMPLEXED WITH SF339 提交 2019-02-28 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
13–98（86 aa）
|
未记录 | LL7 (2~{S})-~{N}-[3-oxidanylidene-3-[(3,4,5-trimethoxyphenyl)amino]propyl]-1-(phenylmethyl)sulfonyl-piperidine-2-carboxamide × 1 CA CALCIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；BupsA.00130.a.D21 (CID4597, SMT tag on, Batch 1264062) at 10.37mg/ml (in 25mM Tris, pH8.0, 200mM NaCl, 1% glycerol, 1mM TCEP buffer) was incubated with 2mM SF339_S (BSI5671). Crystals were produced by sitting drop vapor diffusion with an equal volume combination of the protein/ligand complex and a solution containing 100 mM MES pH 6.0, 200 mM Calcium chloride dehydrate, 20% PEG6000 (PACT B11). Crystal Tracking ID 297348b11, izs6-2
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.211 |
| 6O4A CRYSTAL STRUCTURE OF SMT FUSION PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE FROM BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI COMPLEXED WITH SF355 提交 2019-02-28 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 LLD 2-(pyridin-3-ylcarbonylamino)ethyl (2~{S})-1-(phenylmethyl)sulfonylpiperidine-2-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；BupsA.00130.a.D21 (CID4597, SMT tag on, Batch 1264062) at 10.37mg/ml (in 25mM Tris, pH8.0, 200mM NaCl, 1% glycerol, 1mM TCEP buffer) was incubated with 2mM SF355 (BSI5667). Crystals were produced by sitting drop vapor diffusion with an equal volume combination of the protein/ligand complex and a solution containing HamptonResearch PACT screen (B4): 25% PEG 1500, 100m MIB pH 7.0. The sample was cryoprotected with 15% ethylene glycol: Crystal tray ID 290655b4, puck ID PWP0-3
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 6O4A CRYSTAL STRUCTURE OF SMT FUSION PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE FROM BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI COMPLEXED WITH SF355 提交 2019-02-28 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
13–98（86 aa）
|
未记录 | LLD 2-(pyridin-3-ylcarbonylamino)ethyl (2~{S})-1-(phenylmethyl)sulfonylpiperidine-2-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；BupsA.00130.a.D21 (CID4597, SMT tag on, Batch 1264062) at 10.37mg/ml (in 25mM Tris, pH8.0, 200mM NaCl, 1% glycerol, 1mM TCEP buffer) was incubated with 2mM SF355 (BSI5667). Crystals were produced by sitting drop vapor diffusion with an equal volume combination of the protein/ligand complex and a solution containing HamptonResearch PACT screen (B4): 25% PEG 1500, 100m MIB pH 7.0. The sample was cryoprotected with 15% ethylene glycol: Crystal tray ID 290655b4, puck ID PWP0-3
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 6O4A CRYSTAL STRUCTURE OF SMT FUSION PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE FROM BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI COMPLEXED WITH SF355 提交 2019-02-28 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
13–98（86 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 LLD 2-(pyridin-3-ylcarbonylamino)ethyl (2~{S})-1-(phenylmethyl)sulfonylpiperidine-2-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；BupsA.00130.a.D21 (CID4597, SMT tag on, Batch 1264062) at 10.37mg/ml (in 25mM Tris, pH8.0, 200mM NaCl, 1% glycerol, 1mM TCEP buffer) was incubated with 2mM SF355 (BSI5667). Crystals were produced by sitting drop vapor diffusion with an equal volume combination of the protein/ligand complex and a solution containing HamptonResearch PACT screen (B4): 25% PEG 1500, 100m MIB pH 7.0. The sample was cryoprotected with 15% ethylene glycol: Crystal tray ID 290655b4, puck ID PWP0-3
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 6O4A CRYSTAL STRUCTURE OF SMT FUSION PEPTIDYL-PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE FROM BURKHOLDERIA PSEUDOMALLEI COMPLEXED WITH SF355 提交 2019-02-28 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
13–98（86 aa）
|
未记录 | LLD 2-(pyridin-3-ylcarbonylamino)ethyl (2~{S})-1-(phenylmethyl)sulfonylpiperidine-2-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；BupsA.00130.a.D21 (CID4597, SMT tag on, Batch 1264062) at 10.37mg/ml (in 25mM Tris, pH8.0, 200mM NaCl, 1% glycerol, 1mM TCEP buffer) was incubated with 2mM SF355 (BSI5667). Crystals were produced by sitting drop vapor diffusion with an equal volume combination of the protein/ligand complex and a solution containing HamptonResearch PACT screen (B4): 25% PEG 1500, 100m MIB pH 7.0. The sample was cryoprotected with 15% ethylene glycol: Crystal tray ID 290655b4, puck ID PWP0-3
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 6P81 Structure of DNA polymerase III, beta subunit/ beta sliding clamp from Klebsiella pneumoniae, expressed with an N-terminal His-Smt3 fusion tag, in complex with Griselimycin 提交 2019-06-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
片段：KlpnA.17987.a.EN11
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 PG5 1-METHOXY-2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY]-ETHANE × 1 ACT ACETATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；290 K；Microlytic MCSG-2, condition D4: 30% (V/V) PEG 300, 200mM Calcium acetate, 100mM sodium acetate / acetic acid pH 4.5:
KlpnA.17987.a.EN11.PD383542 at 20.95mg/ml + 2mM griselimycin: tray 309729 D4: cryo: direct: puck ECJ6-1.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.213 |
| 6Q2S Cryo-EM structure of RET/GFRa3/ARTN extracellular complex. The 3D refinement was applied with C2 symmetry. 提交 2019-08-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–98（98 aa）
链 B
1–98（98 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 CA CALCIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6RPQ Crystal structure of PhoCDC21-1 intein 提交 2019-05-14 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–98（97 aa）
|
突变：A101T, C112A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；tri-ammonium citrate
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.235 |
| 6UKM STING C-terminal Domain Complexed with Non-cyclic Dinucleotide Compound MSA-2 提交 2019-10-05 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–98（97 aa）
|
突变：G230A,R293Q | QAD 4-(5,6-dimethoxy-1-benzothiophen-2-yl)-4-oxobutanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；25% PEG 6000, 100 mM Tris, 200 mM NaCl, 2 mM DTT
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.192 |
| 6UKU STING C-terminal Domain Complexed with Non-cyclic Dinucleotide Compound 3 提交 2019-10-06 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–98（97 aa）
|
突变：G230A,R293Q | QAV 4,4'-[propane-1,3-diylbis(6-methoxy-1-benzothiene-5,2-diyl)]bis(4-oxobutanoic acid) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；25% PEG 6000, 100 mM Tris, 200 mM NaCl, 2 mM DTT
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.221 |
| 6UKV STING C-terminal Domain Complexed with Non-cyclic Dinucleotide Compound 9 提交 2019-10-06 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–98（97 aa）
链 B
2–98（97 aa）
|
突变：G230A,R293Q 突变：G230A,R293Q | QB1 4-[6-(3-{[2-(3-carboxypropanoyl)-6-methoxy-1-benzothiophen-5-yl]oxy}propoxy)-5-methoxy-1-benzothiophen-2-yl]-4-oxobutanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；25% PEG 6000, 100 mM Tris, 200 mM NaCl, 2 mM DTT
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.208 |
| 6UKW STING C-terminal Domain Complexed with Non-cyclic Dinucleotide Compound 10 提交 2019-10-06 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–98（97 aa）
链 B
2–98（97 aa）
|
突变：G230A,R293Q 突变：G230A,R293Q | QB7 4-[6-(3-{[2-(3-carboxypropanoyl)-4-fluoro-6-methoxy-1-benzothiophen-5-yl]oxy}propoxy)-5-methoxy-1-benzothiophen-2-yl]-4-oxobutanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；25% PEG 6000, 100 mM Tris, 200 mM NaCl, 2 mM DTT
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.241 |
| 6UKX STING C-terminal Domain Complexed with Non-cyclic Dinucleotide Compound 11 提交 2019-10-06 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–98（97 aa）
链 B
2–98（97 aa）
|
突变：G230A,R293Q 突变：G230A,R293Q | QBA 4,4'-{propane-1,3-diylbis[oxy(5-methoxy-1-benzothiene-6,2-diyl)]}bis(4-oxobutanoic acid) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；25% PEG 6000, 100 mM Tris, 200 mM NaCl, 2 mM DTT
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.217 |
| 6UKY STING C-terminal Domain Complexed with Non-cyclic Dinucleotide Compound 12 提交 2019-10-06 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–98（97 aa）
|
突变：G230A,R293Q | QBD 4-(6-{3-[2-(3-carboxypropanoyl)-6-methoxy-1-benzothiophen-4-yl]propyl}-5-methoxy-1-benzothiophen-2-yl)-4-oxobutanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；25% PEG 6000, 100 mM Tris, 200 mM NaCl, 2 mM DTT
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.227 |
| 6UKZ STING C-terminal Domain Complexed with Non-cyclic Dinucleotide Compound 6 提交 2019-10-06 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–98（97 aa）
链 B
2–98（97 aa）
|
突变：G230A,R293Q 突变：G230A,R293Q | QBG 4-[5-(2-{[2-(3-carboxypropanoyl)-4-fluoro-6-methoxy-1-benzothiophen-5-yl]oxy}ethoxy)-6-methoxy-1-benzothiophen-2-yl]-4-oxobutanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；25% PEG 6000, 100 mM Tris, 200 mM NaCl, 2 mM DTT
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.213 |
| 6UL0 STING C-terminal Domain Complexed with Non-cyclic Dinucleotide Compound 4 提交 2019-10-06 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–98（97 aa）
|
突变：G230A,R293Q | QBJ 4-{5-[(1Z)-3-{[2-(3-carboxypropanoyl)-6-methoxy-1-benzothiophen-5-yl]oxy}prop-1-en-1-yl]-6-methoxy-1-benzothiophen-2-yl}-4-oxobutanoic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；25% PEG 6000, 100 mM Tris, 200 mM NaCl, 2 mM DTT
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.242 |
| 6VEL Crystal Structure of Human E-cadherin bound by mouse monoclonal antibody 66E8Fab 提交 2020-01-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–98（98 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；290 K；A complex of HosaA.19747.a.KW2, MumuA.20194.a.LG23, and MumuA.20195.a.LH23 was crystallized at 10.4 mg/ml at 14C and mixed 1:1 with 12.5% (w/v) PEG 4000, 20% (v/v) 1,2,6-hexanetriol, 0.1M GlyGly/AMPD pH 8.5, 0.03M of each Lithium sulfate, Sodium sulfate, and Potassium sulfate. Tray 307437a10: puck ckt8-9.
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.236 |
| 6VW2 Cryo-EM structure of human islet amyloid polypeptide (hIAPP, or amylin) fibrils 提交 2020-02-18 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–97（97 aa）
链 B
1–97（97 aa）
链 C
1–97（97 aa）
链 D
1–97（97 aa）
链 E
1–97（97 aa）
链 F
1–97（97 aa）
链 G
1–97（97 aa）
链 H
1–97（97 aa）
链 I
1–97（97 aa）
链 J
1–97（97 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7LTO Nse5-6 complex 提交 2021-02-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–98（98 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7O2W Structure of the C9orf72-SMCR8 complex 提交 2021-03-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–96（95 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7P47 Structure of the E3 ligase Smc5/Nse2 in complex with Ubc9-SUMO thioester mimetic 提交 2021-07-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 D
1–98（98 aa）
链 E
1–98（98 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；311 K；12% PEG8000, 0.2M dimethyl-2-hydroxyethylammoniumpropane sulfonate (NDSB 211), 8% ethylene glycol, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 3.31 Å R-free 0.293 |
| 7P7I Native structure of N-acetylglucosamine kinase from Plesiomonas shigelloides 提交 2021-07-19 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–96（95 aa）
链 BBB
2–96（95 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 ZN ZINC ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；291 K；60 mM divalent cations; 0.1 M Tris/bicine pH 8.5; 12.5% each MPD, PEG 1K, PEG 3350.
condition A12 from Morpheus screen (Molecular Dimensions)
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.210 |
| 7P7W N-acetylglucosamine kinase from Plesiomonas shigelloides compexed with alpha-N-acetylglucosamine and ADP 提交 2021-07-20 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–96（95 aa）
链 BBB
2–96（95 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 3 IMD IMIDAZOLE × 4 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 2 ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 K POTASSIUM ION × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；291 K；120 mM alcohols; ; 0.1 M imidazole/MES pH 6.5; 30% each glycerol and PEG 4K
Condition A3 of Morpheus screen (Molecular dimensions). Crystal was soaked for 60 seconds in cryoprotectant containing 10 mM
ADP
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.211 |
| 7P9L N-acetylglucosamine kinase from Plesiomonas shigelloides compexed with alpha-N-acetylglucosamine-6-phosphate 提交 2021-07-27 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–96（95 aa）
链 BBB
2–96（95 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 7 4QY 2-acetamido-2-deoxy-6-O-phosphono-beta-D-glucopyranose × 2 ZN ZINC ION × 4 K POTASSIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；291 K；90 mM halogens; 0.1 M Tris/bicine pH 8.5; 30% each PEG 550 MME and PEG 20K,
condition B9 from Morpheus screen (Molecular Dimensions)
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.223 |
| 7P9P N-acetylglucosamine kinase from Plesiomonas shigelloides compexed with alpha-N-acetylglucosamine and AMP-PNP inhibitor 提交 2021-07-27 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–96（95 aa）
链 BBB
2–96（95 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；291 K；60 mM divalent cations; 0.1 M imidazole/MES pH 6.5; 30% each glycerol and PEG 4K. Condition A3 from Morpheus screen (Molecular Dimensions)
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.233 |
| 7P9Y N-acetylglucosamine kinase from Plesiomonas shigelloides compexed with alpha-N-acetylglucosamine 提交 2021-07-28 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–96（95 aa）
链 BBB
2–96（95 aa）
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 2 ZN ZINC ION × 4 K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；291 K；90 mM halogens; 0.1 M Na-HEPES/MOPS pH 7.5; 12.5% each MPD, PEG 1K, PEG 3350
Condition B8 of Morpheus screen (Molecular Dimensions)
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.250 |
| 7PA1 Structure of N-acetylglucosamine kinase from Plesiomonas shigelloides in complex with AMP-PNP in the absence of N-acetylglucoseamine substrate 提交 2021-07-28 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
2–96（95 aa）
链 BBB
2–96（95 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；291 K；0.09M NPS; 0.1 M Tris/bicine pH 8.5; 30% each PEG 550 MME and PEG 20K, condition C9 from Morpheus crystallisation screen (Molecular Dimensions).
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.252 |
| 7SDE Cryo-EM structure of Nse5/6 heterodimer 提交 2021-09-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–98（98 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7ZHS 3D reconstruction of the cylindrical assembly of DnaJA2 delta G/F by imposing D5 symmetry 提交 2022-04-07 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric（40） 与蛋白数一致 |
链 A
3–98（96 aa）
链 B
3–98（96 aa）
链 C
3–98（96 aa）
链 D
3–98（96 aa）
链 E
3–98（96 aa）
链 F
3–98（96 aa）
链 G
3–98（96 aa）
链 H
3–98（96 aa）
链 I
3–98（96 aa）
链 J
3–98（96 aa）
链 K
3–98（96 aa）
链 L
3–98（96 aa）
链 M
3–98（96 aa）
链 N
3–98（96 aa）
链 O
3–98（96 aa）
链 P
3–98（96 aa）
链 Q
3–98（96 aa）
链 R
3–98（96 aa）
链 S
3–98（96 aa）
链 T
3–98（96 aa）
链 U
3–98（96 aa）
链 V
3–98（96 aa）
链 W
3–98（96 aa）
链 X
3–98（96 aa）
链 Y
3–98（96 aa）
链 Z
3–98（96 aa）
链 a
3–98（96 aa）
链 b
3–98（96 aa）
链 c
3–98（96 aa）
链 d
3–98（96 aa）
链 e
3–98（96 aa）
链 f
3–98（96 aa）
链 g
3–98（96 aa）
链 h
3–98（96 aa）
链 i
3–98（96 aa）
链 j
3–98（96 aa）
链 k
3–98（96 aa）
链 l
3–98（96 aa）
链 m
3–98（96 aa）
链 n
3–98（96 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 80 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.90 Å |
| 7ZWL Crystal structure of human STING in complex with 3',3'-c-di-(2'F,2'd<carba>AMP) 提交 2022-05-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–98（97 aa）
|
未记录 | K43 9-[(1~{R},6~{R},8~{R},9~{S},10~{R},15~{R},17~{R},18~{S})-17-(6-aminopurin-9-yl)-9,18-bis(fluoranyl)-3,12-bis(oxidanyl)-3,12-bis(oxidanylidene)-2,4,11,13-tetraoxa-3$l^{5},12$l^{5}-diphosphatricyclo[13.3.0.0^{6,10}]octadecan-8-yl]purin-6-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Lithium acetate,
20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 8B7F Nuclease from C. glutamicum 提交 2022-09-29 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–98（97 aa）
链 B
2–98（97 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；10% (w/v) PEG 6K, 30% (v/v) ethanol and 10 mM sodium acetate
|
分辨率 4.60 Å R-free 0.311 |
| 8DMB Structure of Desulfovirgula thermocuniculi IsrB (DtIsrB) in complex with omega RNA and target DNA 提交 2022-07-08 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 P
1–98（98 aa）
|
突变：H584L | MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8R1F Monomeric E6AP-E6-p53 ternary complex 提交 2023-11-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–98（98 aa）
|
突变：C80S,C97S,C111S,C140S | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.67 Å |
| 8R1G Dimeric ternary structure of E6AP-E6-p53 提交 2023-11-01 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–98（98 aa）
链 E
1–98（98 aa）
|
突变：C80S,C97S,C111S,C140S 突变：C80S,C97S,C111S,C140S | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.99 Å |
| 8UZH SUMO fused Trehalose Synthase (TreS) of Mycobacterium tuberculosis 提交 2023-11-15 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–98（97 aa）
链 B
2–98（97 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.8 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium Citrate pH 5.0
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.290 |
| 8VQH CryoEM structure of BchN-BchB electron acceptor component protein of DPOR 提交 2024-01-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–96（96 aa）
链 D
1–96（96 aa）
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 CU COPPER (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8X7V Structure of human SCMC ternary complex 提交 2023-11-26 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–98（98 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 8X7W Structure of dimeric human SCMC complex 提交 2023-11-26 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–98（98 aa）
链 F
1–98（98 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 9E7U Cryo-EM structure of NOT1:NOT8:PieF 提交 2024-11-04 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–95（95 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9E7V Off-pathway Mycobacterium tuberculosis transcription initiation promoter complex (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA) 提交 2024-11-04 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–98（98 aa）
|
未记录 | POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9E7Y De Novo Mycobacterium tuberculosis transcription initiation promoter complex with 7-mer RNA and disordered Beta' Lid element (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA) 提交 2024-11-04 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–98（98 aa）
|
未记录 | POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9E84 De Novo Mycobacterium tuberculosis transcription initiation promoter complex with 6-mer RNA and disordered Sigma-A region 4 domain (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA) 提交 2024-11-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric（11） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–98（98 aa）
|
未记录 | POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9E85 De Novo Mycobacterium tuberculosis transcription initiation promoter complex with 6-mer RNA and closed Beta' clamp (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA) 提交 2024-11-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric（11） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–98（98 aa）
|
未记录 | POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9E86 De Novo Mycobacterium tuberculosis transcription initiation promoter complex with 5-mer RNA and open Beta' clamp (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA) 提交 2024-11-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric（11） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–98（98 aa）
|
未记录 | POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9E87 De Novo Mycobacterium tuberculosis transcription initiation pre-RPO promoter complex with open Beta' clamp (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA) 提交 2024-11-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–98（98 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9E88 De novo backtracked transcription elongation complex of Mycobacterium tuberculosis RNA polymerase on a linear DNA fragment (TEC-Backtracked) 提交 2024-11-05 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric（9） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–98（98 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9G8I Sumo-Darpin-A10-complex 提交 2024-07-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
21–95（75 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Bis-Tris pH 6.5, 23% (v/v) PEG 3350
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.301 |
| 9G8I Sumo-Darpin-A10-complex 提交 2024-07-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
21–95（75 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Bis-Tris pH 6.5, 23% (v/v) PEG 3350
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.301 |
| 9GAU Sumo-Darpin-C10-complex 提交 2024-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
21–96（76 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris. 16% (v/v)PEG 3350
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.288 |
| 9HDO The Human LINE-1 ORF2p target-primed reverse transcription complex 提交 2024-11-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–98（97 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 D3T 2',3'-DIDEOXY-THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 9HDP The Human LINE-1 ORF2p target-primed reverse transcription complex with the fingers domain in a closed conformation 提交 2024-11-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–98（97 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 D3T 2',3'-DIDEOXY-THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 9HDQ The Human LINE-1 ORF2p target-primed reverse transcription complex with the fingers domain in an open conformation 提交 2024-11-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–98（97 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.45 Å |
| 9HDR Human LINE-1 ORF2p target-primed reverse transcription complex with EN domain resolved 提交 2024-11-12 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：heptameric（7） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–98（97 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 D3T 2',3'-DIDEOXY-THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9HX5 Apo structure of SRSF6 RRM2 WT 提交 2025-01-07 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 8.5, 0.2 M Sodium sulfate, 20 % PEG 3350, 10 % Ethylene glycol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.258 |
| 9HX7 Structure of SRSF6 RRM2 WT with "GGA"-RNA 提交 2025-01-07 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
13–98（86 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 0.1 M NH4SO4, 0.1 M Na-Form, 25 % Smear Broad
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.250 |
| 9HX8 Apo structure of SRSF6 RRM2 W123A 提交 2025-01-07 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
13–98（86 aa）
|
突变：W123A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M Na-Citrate, 20 % PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.259 |
| 9IIS GDP-fucose pyrophosphorylase part of FKP with a SUMO tag 提交 2024-06-21 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–98（98 aa）
|
未记录 | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG 3350, ammonium acetate, HEPES
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.254 |
| 9KPZ Structure of TolQRA complex at pH 5.4 from E.coli 提交 2024-11-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 H
3–99（97 aa）
链 I
3–99（97 aa）
链 J
3–99（97 aa）
链 K
3–99（97 aa）
链 L
3–99（97 aa）
|
未记录 | 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9KQ0 Structure of TolQRA complex at pH 8.0 from E.coli 提交 2024-11-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 H
3–99（97 aa）
链 I
3–99（97 aa）
链 J
3–99（97 aa）
链 K
3–99（97 aa）
链 L
3–99（97 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9MB6 Cryo-EM structure of wild-type SaCas9-guide RNA-mismatched target DNA complex 提交 2025-03-15 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
3–98（96 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9MB7 Cryo-EM structure of eSaCas9-NNG-guide RNA-mismatched target DNA complex 提交 2025-03-15 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
3–98（96 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.88 Å |
| 9OIK Structure of S. Typhimurium 14028 Gifsy-1 prophage HepS bound to bacteriophage lambda J Tail Tip 提交 2025-05-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–98（98 aa）
链 D
1–98（98 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium Acetate, 16% PEG 4000, 0.1 M Tris pH 8.5
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.209 |
| 9OPR TMPRSS2 S441A in complex with the H1H7 Fab and anti-kappa light chain nanobody 提交 2025-05-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–94（94 aa）
|
突变：S441A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9SMX CM1-activated gTuRC in complex with nascent alpha-E254D mutant microtubules 提交 2025-09-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：73-meric（73） 与蛋白数一致 |
链 AC
2–99（98 aa）
链 CC
2–99（98 aa）
链 Cc
2–99（98 aa）
链 EC
2–99（98 aa）
链 Ec
2–99（98 aa）
链 GC
2–99（98 aa）
链 Gc
2–99（98 aa）
链 MC
2–99（98 aa）
链 Mc
2–99（98 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.67 Å |
| 9SYR Human quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatD 提交 2025-10-13 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 Nd
4–98（95 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 COA COENZYME A × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.55 Å |
| 9UT1 The helicase-primase complex from HHV1 bound with ssDNA and amenamevir 提交 2025-05-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
3–98（96 aa）
链 C
3–98（96 aa）
|
突变：R64T/R71E 突变：R64T/R71E | A1BXD Amenamevir × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 9UT3 The helicase module of the helicase-primase complex from HHV1 bound with ssDNA and amenamevir 提交 2025-05-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
3–98（96 aa）
|
突变：R64T/R71E | A1BXD Amenamevir × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.88 Å |
| 9UT4 The primase module of the helicase-primase complex from HHV1 bound with ssDNA and amenamevir 提交 2025-05-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3–98（96 aa）
链 C
3–98（96 aa）
|
突变：R64T/R71E 突变：R64T/R71E | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å |
| 9UT5 The helicase-primase complex from HHV1 bound with ssDNA and pritelivir 提交 2025-05-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
3–98（96 aa）
链 C
3–98（96 aa）
|
突变：R64T/R71E 突变：R64T/R71E | A1BXB Pritelivir × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.32 Å |
| 9UT6 The helicase module of the helicase-primase complex from HHV1 bound with ssDNA and pritelivir 提交 2025-05-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
3–98（96 aa）
|
突变：R64T/R71E | A1BXB Pritelivir × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 9UT7 The Primase module of the helicase-primase complex from HHV1 bound with ssDNA and pritelivir 提交 2025-05-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3–98（96 aa）
链 C
3–98（96 aa）
|
突变：R64T/R71E 突变：R64T/R71E | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 9Z3K SARS-CoV-2 S2 trimer stabilized in the early fusion intermediate conformation by circular permutation and clamping by gp41 (E-FICs-v1) 提交 2025-11-07 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–94（94 aa）
链 B
1–94（94 aa）
链 C
1–94（94 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |