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1xyr

Poliovirus 135S cell entry intermediate

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Genome polyprotein, Coat protein VP1

物种未注明

UniProt P03300

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 420 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 7 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 35 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 42 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
5 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 7 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1l1n 1l1n 1ra6 1ra7 1raj 1rdr 1tql 2bbp 2ijf 2ily 2ilz 2im0

共 32 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体
1ng7 2ijd 2ijd

共 3 个 assembly

同源四聚体
1hxs 1hxs 2plv 2plv 5z3q

共 5 个 assembly

其他同源多聚体
1hxs 1hxs 1hxs 1hxs 1pov 1pov 1pov 1pov 1pov 1pov 1xyr 1xyr

共 30 个 assembly，这里只显示前 12 个

异源或核酸复合物
1al2 1al2 1al2 1al2 1al2 1al2 1ar6 1ar6 1ar6 1ar6 1ar6 1ar6

共 181 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POLH_POL1M
Isoform —
PDB实体 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7
链与序列区间 作者链 1； PDB构建体 1–232； UniProt 649–880 作者链 2； PDB构建体 1–237； UniProt 96–332 作者链 3； PDB构建体 1–182； UniProt 390–571 作者链 5； PDB构建体 1–12； UniProt 341–352 作者链 6； PDB构建体 1–36； UniProt 354–389 作者链 7； PDB构建体 1–14； UniProt 81–94 作者链 8； PDB构建体 1–11； UniProt 620–630

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1xyr
沉积日期 deposition_date2004-11-10
结构标题 titlePoliovirus 135S cell entry intermediate
关键词 keywordsBETA BARREL, VIRAL CAPSID, CELL ENTRY INTERMEDIATE, Icosahedral virus, Virus; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1xyr__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1xyr__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1xyr__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）0.00 Å
Rg（电子密度）139.30 Å
总 Rg139.30 Å
原子数0
残基数0
排除体积5891400 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1xyr__assembly_1__model_1 420-MERIC （420） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1xyr__assembly_2__model_1 heptameric （7） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 1xyr__assembly_3__model_1 35-meric （35） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 1xyr__assembly_4__model_1 42-meric （42） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 1xyr__assembly_5__model_1 heptameric （7） 排除 — —
排除原因： 辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1xyr11
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.4 — Positive stranded ssRNA viruses
家族 Family familyb.121.4.1 — Picornaviridae-like VP (VP1, VP2, VP3 and VP4)
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7. 引用文献 (1)