21vv

Cryo-EM structure of ncBAF bound to the nucleosome

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H3

Xenopus laevis

UniProt A0A310TTQ1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Histone H4 × 2 (P62799) Histone H2A × 2 (Q6AZJ8) Histone H2B × 2 (A0A8J0U496) B-cell CLL/lymphoma 7 protein family member A × 1 (Q4VC05) DNA (167-MER) × 1 DNA (167-MER) × 1 SMARCA4 isoform 2 × 1 (Q9HBD4) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A310TTQ1_XENLA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–135; UniProt 2–136 作者链 E; PDB构建体 1–135; UniProt 2–136

Histone H4

Xenopus laevis

UniProt P62799

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Histone H3 × 2 (A0A310TTQ1) Histone H2A × 2 (Q6AZJ8) Histone H2B × 2 (A0A8J0U496) B-cell CLL/lymphoma 7 protein family member A × 1 (Q4VC05) DNA (167-MER) × 1 DNA (167-MER) × 1 SMARCA4 isoform 2 × 1 (Q9HBD4) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 H4_XENLA
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–102; UniProt 2–103 作者链 F; PDB构建体 1–102; UniProt 2–103

Histone H2A

Xenopus laevis

UniProt Q6AZJ8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Histone H3 × 2 (A0A310TTQ1) Histone H4 × 2 (P62799) Histone H2B × 2 (A0A8J0U496) B-cell CLL/lymphoma 7 protein family member A × 1 (Q4VC05) DNA (167-MER) × 1 DNA (167-MER) × 1 SMARCA4 isoform 2 × 1 (Q9HBD4) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 Q6AZJ8_XENLA
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 G; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130

Histone H2B

Xenopus laevis

UniProt A0A8J0U496

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Histone H3 × 2 (A0A310TTQ1) Histone H4 × 2 (P62799) Histone H2A × 2 (Q6AZJ8) B-cell CLL/lymphoma 7 protein family member A × 1 (Q4VC05) DNA (167-MER) × 1 DNA (167-MER) × 1 SMARCA4 isoform 2 × 1 (Q9HBD4) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A8J0U496_XENLA
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–125; UniProt 2–126 作者链 H; PDB构建体 1–125; UniProt 2–126

B-cell CLL/lymphoma 7 protein family member A

Homo sapiens

UniProt Q4VC05

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Histone H3 × 2 (A0A310TTQ1) Histone H4 × 2 (P62799) Histone H2A × 2 (Q6AZJ8) Histone H2B × 2 (A0A8J0U496) DNA (167-MER) × 1 DNA (167-MER) × 1 SMARCA4 isoform 2 × 1 (Q9HBD4) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 BCL7A_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–210; UniProt 1–210

SMARCA4 isoform 2

Homo sapiens

UniProt Q9HBD4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Histone H3 × 2 (A0A310TTQ1) Histone H4 × 2 (P62799) Histone H2A × 2 (Q6AZJ8) Histone H2B × 2 (A0A8J0U496) B-cell CLL/lymphoma 7 protein family member A × 1 (Q4VC05) DNA (167-MER) × 1 DNA (167-MER) × 1 Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 Q9HBD4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 11–1689; UniProt 1–1679

Actin, cytoplasmic 1

Homo sapiens

UniProt P60709

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Histone H3 × 2 (A0A310TTQ1) Histone H4 × 2 (P62799) Histone H2A × 2 (Q6AZJ8) Histone H2B × 2 (A0A8J0U496) B-cell CLL/lymphoma 7 protein family member A × 1 (Q4VC05) DNA (167-MER) × 1 DNA (167-MER) × 1 SMARCA4 isoform 2 × 1 (Q9HBD4) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ACTB_HUMAN
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375

Actin-like protein 6A

Homo sapiens

UniProt O96019

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 12 DNA 2 Histone H3 × 2 (A0A310TTQ1) Histone H4 × 2 (P62799) Histone H2A × 2 (Q6AZJ8) Histone H2B × 2 (A0A8J0U496) B-cell CLL/lymphoma 7 protein family member A × 1 (Q4VC05) DNA (167-MER) × 1 DNA (167-MER) × 1 SMARCA4 isoform 2 × 1 (Q9HBD4) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (P60709) BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ACL6A_HUMAN
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–429; UniProt 1–429

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id21vv
沉积日期 deposition_date2025-12-31
结构标题 titleCryo-EM structure of ncBAF bound to the nucleosome
关键词 keywordsChromatin remodeling complex, ncBAF complex, nucleosome, SMARCA4, BCL7, ARP, NUCLEAR PROTEIN/DNA, NUCLEAR PROTEIN-DNA complex; NUCLEAR PROTEIN/DNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

21vv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

21vv__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

21vv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)51.28 Å
Rg(电子密度)50.73 Å
总 Rg50.95 Å
原子数23276
残基数2479
排除体积397410 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 21vv__assembly_1__model_1 14-meric (14) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

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7. 引用文献 (1)