5gmk

Cryo-EM structure of the Catalytic Step I spliceosome (C complex) at 3.4 angstrom resolution

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 228.6 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pre-mRNA-splicing factor 8

物种未注明

UniProt P33334

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 A; UniProt 1–2413 未记录 Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 435 个其他 PDB 条目、443 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRP8_YEAST
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–2413; UniProt 1–2413

Pre-mRNA-splicing factor SNU114

物种未注明

UniProt P36048

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 C; UniProt 1–1008 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 23 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SN114_YEAST
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–1008; UniProt 1–1008

Pre-mRNA-splicing factor CWC21

物种未注明

UniProt Q03375

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 J; UniProt 1–135 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CWC21_YEAST
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–135; UniProt 1–135

Pre-mRNA-splicing factor PRP46

物种未注明

UniProt Q12417

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 O; UniProt 1–451 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRP46_YEAST
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 O; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451

Pre-mRNA-processing protein 45

物种未注明

UniProt P28004

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 P; UniProt 1–379 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRP45_YEAST
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–379; UniProt 1–379

Pre-mRNA-splicing factor SLT11

物种未注明

UniProt P38241

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 Q; UniProt 1–364 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SLT11_YEAST
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–364; UniProt 1–364

Pre-mRNA-splicing factor CWC2

物种未注明

UniProt Q12046

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 R; UniProt 1–339 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 18 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CWC2_YEAST
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–339; UniProt 1–339

Pre-mRNA-splicing factor CWC15

物种未注明

UniProt Q03772

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 S; UniProt 1–175 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CWC15_YEAST
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 S; PDB构建体 1–175; UniProt 1–175

Pre-mRNA-splicing factor BUD31

物种未注明

UniProt P25337

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 T; UniProt 1–157 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 17 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BUD31_YEAST
Isoform
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 T; PDB构建体 1–157; UniProt 1–157

Pre-mRNA-splicing factor CWC22

物种未注明

UniProt P53333

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 Z; UniProt 1–577 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CWC22_YEAST
Isoform
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 Z; PDB构建体 1–577; UniProt 1–577

Pre-mRNA-splicing factor CEF1

物种未注明

UniProt Q03654

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 c; UniProt 1–253 链 c; UniProt 482–587 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CEF1_YEAST
Isoform
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 c; PDB构建体 1–253; UniProt 1–253 作者链 c; PDB构建体 482–587; UniProt 482–587

Pre-mRNA-splicing factor CLF1

物种未注明

UniProt Q12309

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 d; UniProt 1–275 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CLF1_YEAST
Isoform
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 d; PDB构建体 1–275; UniProt 1–275

Protein CWC16

物种未注明

UniProt P28320

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 F; UniProt 1–278 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CWC16_YEAST
Isoform
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–278; UniProt 1–278

Pre-mRNA-splicing factor CWC25

物种未注明

UniProt P53854

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 G; UniProt 1–179 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CWC25_YEAST
Isoform
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–179; UniProt 1–179

Pre-mRNA-splicing factor ISY1

物种未注明

UniProt P21374

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 H; UniProt 1–235 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ISY1_YEAST
Isoform
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–235; UniProt 1–235

Pre-mRNA-splicing factor SYF2

物种未注明

UniProt P53277

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 I; UniProt 1–215 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SYF2_YEAST
Isoform
PDB实体 22
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–215; UniProt 1–215

Pre-mRNA-splicing factor SYF1

物种未注明

UniProt Q04048

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 v; UniProt 569–734 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SYF1_YEAST
Isoform
PDB实体 23
链与序列区间 作者链 v; PDB构建体 569–734; UniProt 569–734

Pre-mRNA-processing factor 17

物种未注明

UniProt P40968

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 n; UniProt 1–455 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRP17_YEAST
Isoform
PDB实体 24
链与序列区间 作者链 n; PDB构建体 1–455; UniProt 1–455

Pre-mRNA-processing factor 19

物种未注明

UniProt P32523

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 o; UniProt 1–503 链 p; UniProt 1–503 链 q; UniProt 1–503 链 r; UniProt 1–503 突变:Q315S, I317E Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 18 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRP19_YEAST
Isoform
PDB实体 25
链与序列区间 作者链 o; PDB构建体 1–503; UniProt 1–503 作者链 p; PDB构建体 1–503; UniProt 1–503 作者链 q; PDB构建体 1–503; UniProt 1–503 作者链 r; PDB构建体 1–503; UniProt 1–503

Pre-mRNA-splicing factor SNT309

物种未注明

UniProt Q06091

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 t; UniProt 1–175 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SN309_YEAST
Isoform
PDB实体 26
链与序列区间 作者链 t; PDB构建体 1–175; UniProt 1–175

Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B

物种未注明

UniProt P40018

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 k; UniProt 1–196 链 s; UniProt 1–196 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RSMB_YEAST
Isoform
PDB实体 27
链与序列区间 作者链 k; PDB构建体 1–196; UniProt 1–196 作者链 s; PDB构建体 1–196; UniProt 1–196

Small nuclear ribonucleoprotein E

物种未注明

UniProt Q12330

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 i; UniProt 1–94 链 u; UniProt 1–94 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RUXE_YEAST
Isoform
PDB实体 28
链与序列区间 作者链 i; PDB构建体 1–94; UniProt 1–94 作者链 u; PDB构建体 1–94; UniProt 1–94

Small nuclear ribonucleoprotein F

物种未注明

UniProt P54999

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 h; UniProt 1–86 链 w; UniProt 1–86 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 35 个其他 PDB 条目、38 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RUXF_YEAST
Isoform
PDB实体 29
链与序列区间 作者链 h; PDB构建体 1–86; UniProt 1–86 作者链 w; PDB构建体 1–86; UniProt 1–86

Small nuclear ribonucleoprotein G

物种未注明

UniProt P40204

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 j; UniProt 1–77 链 x; UniProt 1–77 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 34 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RUXG_YEAST
Isoform
PDB实体 30
链与序列区间 作者链 j; PDB构建体 1–77; UniProt 1–77 作者链 x; PDB构建体 1–77; UniProt 1–77

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3

物种未注明

UniProt P43321

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 l; UniProt 1–101 链 y; UniProt 1–101 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMD3_YEAST
Isoform
PDB实体 31
链与序列区间 作者链 l; PDB构建体 1–101; UniProt 1–101 作者链 y; PDB构建体 1–101; UniProt 1–101

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1

物种未注明

UniProt Q02260

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 m; UniProt 1–146 链 z; UniProt 1–146 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMD1_YEAST
Isoform
PDB实体 32
链与序列区间 作者链 m; PDB构建体 1–146; UniProt 1–146 作者链 z; PDB构建体 1–146; UniProt 1–146

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2

物种未注明

UniProt Q06217

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 e; UniProt 1–110 链 g; UniProt 1–110 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMD2_YEAST
Isoform
PDB实体 33
链与序列区间 作者链 e; PDB构建体 1–110; UniProt 1–110 作者链 g; PDB构建体 1–110; UniProt 1–110

;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ;

物种未注明

UniProt P40567

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 a; UniProt 1–111 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 (Q08963) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MSL1_YEAST
Isoform
PDB实体 34
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–111; UniProt 1–111

;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ;

物种未注明

UniProt Q08963

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 39 RNA 6 PDB 声明:45-meric(45) 与全部聚合物数一致 链 b; UniProt 1–238 未记录 Pre-mRNA-splicing factor 8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 U2 snRNA × 1 Intron_BPS × 1 5'-Exon × 1 ;5'-Splicing Site ; × 1 Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Protein CWC16 × 1 (P28320) Pre-mRNA-splicing factor CWC25 × 1 (P53854) Pre-mRNA-splicing factor ISY1 × 1 (P21374) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 (P40567) GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;The CEB buffer (10 mM Tris-HCl, pH 8.0, 75 mM NaCl, 1 mM Mg(OAc)2, 1 mM imidazole, 0.01% NP40, 1 mM TCEP, 0.5 mM EGTA) cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RU2A_YEAST
Isoform
PDB实体 35
链与序列区间 作者链 b; PDB构建体 1–238; UniProt 1–238

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5gmk

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5gmk
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5gmk
沉积日期 deposition_date2016-07-14
结构标题 titleCryo-EM structure of the Catalytic Step I spliceosome (C complex) at 3.4 angstrom resolution
关键词 keywordsRNA splicing, Spliceosome, Catalytic Step I, Intron lariat, RNA BINDING PROTEIN-RNA complex; RNA BINDING PROTEIN/RNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier84.78
回转半径 Rg (电子) rg_electron85.35
零角强度 I(0) i019178400000.00
分子量 molecular_weight1075500.0 kDa
排除体积 excluded_volume1302500 ų
包络体积 envelope_volume2583300 ų
水化壳体积 shell_volume247380 ų
包络直径 envelope_diameter292.9
壳层 Rg shell_rg82.54
包络 Rg envelope_rg88.03
形状 Rg shape_rg85.55
总 Rg total_rg84.68
总原子数 total_atoms75273
残基数 n_residues9397
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax228.6
Rg (实空间) rg_real81.20
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.72
I(0) (实空间) i0_real1.8350e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.2060e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal83.94
I(0) (倒空间) i0_reciprocal19130000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9135
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary88.9
偏度 Skewness skewness0.246
峰度 Kurtosis kurtosis-0.571
角度范围 angular_range— – 0.0900 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.8319
最高正则化参数 α highest_alpha1186000000.0000
实空间数据点数 n_real_points19
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.999; Stabil: 0.966; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.979; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (38)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 29 domains

SCOP 2.08 (10 domains)

结构域编号 domain_idd5gmka_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.7 — RNA-binding domain, RBD, aka RNA recognition motif (RRM)
家族 Family familyd.58.7.1 — Canonical RBD
结构域编号 domain_idd5gmkb_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
超家族 Superfamily superfamilyc.10.2 — L domain-like
家族 Family familyc.10.2.4 — U2A'-like
结构域编号 domain_idd5gmkd_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.8 — TPR-like
家族 Family familya.118.8.7 — HAT/Suf repeat
结构域编号 domain_idd5gmkf_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.395 — Pre-mRNA splicing factor Cwc16-like
超家族 Superfamily superfamilyd.395.1 — Pre-mRNA splicing factor Cwc16-like
家族 Family familyd.395.1.1 — Pre-mRNA splicing factor Cwc16-like
结构域编号 domain_idd5gmkg_
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.142 — Pre-mRNA splicing factor Cwc25-like
超家族 Superfamily superfamilyj.142.1 — Pre-mRNA splicing factor Cwc25-like
家族 Family familyj.142.1.1 — Pre-mRNA splicing factor Cwc25-like
结构域编号 domain_idd5gmkh_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.2 — Long alpha-hairpin
超家族 Superfamily superfamilya.2.15 — ISY1 domain-like
家族 Family familya.2.15.1 — ISY1 N-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd5gmki_
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.141 — Pre-mRNA splicing factor Syf2-like
超家族 Superfamily superfamilyj.141.1 — Pre-mRNA splicing factor Syf2-like
家族 Family familyj.141.1.1 — Pre-mRNA splicing factor Syf2-like
结构域编号 domain_idd5gmkn1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamilyb.69.4 — WD40 repeat-like
家族 Family familyb.69.4.1 — WD40-repeat
结构域编号 domain_idd5gmkn2
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.139 — Pre-mRNA splicing factor Prp17-like
超家族 Superfamily superfamilyj.139.1 — Pre-mRNA splicing factor Prp17-like
家族 Family familyj.139.1.1 — Pre-mRNA splicing factor Prp17-like
结构域编号 domain_idd5gmkv_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.118 — alpha-alpha superhelix
超家族 Superfamily superfamilya.118.8 — TPR-like
家族 Family familya.118.8.7 — HAT/Suf repeat

CATH v4.4 (19 domains)

结构域编号 domain_id5gmkO00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
结构域编号 domain_id5gmkZ01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily180
结构域编号 domain_id5gmka00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily330 — RRM (RNA recognition motif) domain
结构域编号 domain_id5gmke00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id5gmkg00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id5gmkh00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id5gmki00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id5gmkj00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id5gmkl00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id5gmkm00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id5gmkn00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
结构域编号 domain_id5gmkp01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)
结构域编号 domain_id5gmkq01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)
结构域编号 domain_id5gmkr01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)
结构域编号 domain_id5gmku00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id5gmkw00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id5gmkx00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id5gmky00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id5gmkz00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)