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7n9f

Structure of the in situ yeast NPC

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 474.6 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Nucleoporin NUP170

物种未注明

UniProt P38181

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 0； UniProt 1–1502 链 Y； UniProt 1–1502 未记录 Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 0； UniProt 1–1502 链 Y； UniProt 1–1502 未记录 Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 0； UniProt 1–1502 链 Y； UniProt 1–1502 未记录 Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3I5P Nup170(aa979-1502), S.cerevisiae 提交 2009-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 980–1502（523 aa） 片段：HELICAL DOMAIN (UNP residues 980-1502)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；289 K；0.2M AMMONIUM ACETATE, 0.1M TRIS-HCL, 8% PEG 3350, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.20 Å R-free 0.324
3I5Q Nup170(aa1253-1502) at 2.2 A, S.cerevisiae 提交 2009-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1253–1502（250 aa） 片段：C-terminal fragment (UNP residues 1253-1502)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M LITHIUM SULFATE, 0.1M TRIS-HCL, 50 mM NACL, 22% PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.20 Å R-free 0.272
3I5Q Nup170(aa1253-1502) at 2.2 A, S.cerevisiae 提交 2009-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1253–1502（250 aa） 片段：C-terminal fragment (UNP residues 1253-1502)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M LITHIUM SULFATE, 0.1M TRIS-HCL, 50 mM NACL, 22% PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.20 Å R-free 0.272
3I5Q Nup170(aa1253-1502) at 2.2 A, S.cerevisiae 提交 2009-07-06 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1253–1502（250 aa） 片段：C-terminal fragment (UNP residues 1253-1502)
链 B 1253–1502（250 aa） 片段：C-terminal fragment (UNP residues 1253-1502)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M LITHIUM SULFATE, 0.1M TRIS-HCL, 50 mM NACL, 22% PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.20 Å R-free 0.272
3I5Q Nup170(aa1253-1502) at 2.2 A, S.cerevisiae 提交 2009-07-06 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1253–1502（250 aa） 片段：C-terminal fragment (UNP residues 1253-1502)
链 B 1253–1502（250 aa） 片段：C-terminal fragment (UNP residues 1253-1502)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M LITHIUM SULFATE, 0.1M TRIS-HCL, 50 mM NACL, 22% PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.20 Å R-free 0.272
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric
链 0 1–1502（1502 aa）
链 Y 1–1502（1502 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 0 1–1502（1502 aa）
链 Y 1–1502（1502 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 0 1–1502（1502 aa）
链 Y 1–1502（1502 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7WOO Cryo-EM structure of the inner ring protomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–1502（1502 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7WOT Cryo-EM structure of the inner ring monomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 D 1–1502（1502 aa）
链 P 1–1502（1502 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 0 1–1502（1502 aa）
链 Y 1–1502（1502 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å

共 6 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU170_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 0； PDB构建体 1–1502； UniProt 1–1502 作者链 Y； PDB构建体 1–1502； UniProt 1–1502

Nucleoporin NUP157

物种未注明

UniProt P40064

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 1； UniProt 1–1391 链 Z； UniProt 1–1391 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 1； UniProt 1–1391 链 Z； UniProt 1–1391 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 1； UniProt 1–1391 链 Z； UniProt 1–1391 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4MHC Crystal Structure of a Nucleoporin 提交 2013-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 70–893（824 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 70-893)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；5% PEG 4,000, 0.1 M MES, pH 6.0, 0.05 M Magnesium chloride, 3% (v/v) 1,4-dioxane, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.231
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric
链 1 1–1391（1391 aa）
链 Z 1–1391（1391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 1 1–1391（1391 aa）
链 Z 1–1391（1391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 1 1–1391（1391 aa）
链 Z 1–1391（1391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7WOO Cryo-EM structure of the inner ring protomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–1391（1391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7WOT Cryo-EM structure of the inner ring monomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 C 1–1391（1391 aa）
链 O 1–1391（1391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 1 1–1391（1391 aa）
链 Z 1–1391（1391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å

共 5 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU157_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 1； PDB构建体 1–1391； UniProt 1–1391 作者链 Z； PDB构建体 1–1391； UniProt 1–1391

Nucleoporin NSP1

物种未注明

UniProt P14907

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–823 链 D； UniProt 1–823 链 G； UniProt 1–823 链 J； UniProt 1–823 链 y； UniProt 1–823 链 z； UniProt 1–823 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–823 链 D； UniProt 1–823 链 G； UniProt 1–823 链 J； UniProt 1–823 链 y； UniProt 1–823 链 z； UniProt 1–823 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–823 链 D； UniProt 1–823 链 G； UniProt 1–823 链 J； UniProt 1–823 链 y； UniProt 1–823 链 z； UniProt 1–823 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1O6O Importin Beta aa1-442 bound to five FxFG repeats from yeast Nsp1p. Second crystal form 提交 2002-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 497–608（112 aa） 片段：RESIDUES 497-608
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.9；1.2-1.28M AMMONIUM SULPHATE, 100MM AMMONIUM ACETATE, PH 5.9, 30MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.273
1O6O Importin Beta aa1-442 bound to five FxFG repeats from yeast Nsp1p. Second crystal form 提交 2002-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 497–608（112 aa） 片段：RESIDUES 497-608
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.9；1.2-1.28M AMMONIUM SULPHATE, 100MM AMMONIUM ACETATE, PH 5.9, 30MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.273
1O6O Importin Beta aa1-442 bound to five FxFG repeats from yeast Nsp1p. Second crystal form 提交 2002-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 497–608（112 aa） 片段：RESIDUES 497-608
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.9；1.2-1.28M AMMONIUM SULPHATE, 100MM AMMONIUM ACETATE, PH 5.9, 30MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.273
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric
链 A 1–823（823 aa）
链 D 1–823（823 aa）
链 G 1–823（823 aa）
链 J 1–823（823 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 A 1–823（823 aa）
链 D 1–823（823 aa）
链 G 1–823（823 aa）
链 J 1–823（823 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 A 1–823（823 aa）
链 D 1–823（823 aa）
链 G 1–823（823 aa）
链 J 1–823（823 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7WOO Cryo-EM structure of the inner ring protomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 I 1–823（823 aa）
链 L 1–823（823 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7WOT Cryo-EM structure of the inner ring monomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 I 1–823（823 aa）
链 L 1–823（823 aa）
链 U 1–823（823 aa）
链 X 1–823（823 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 A 1–823（823 aa）
链 D 1–823（823 aa）
链 G 1–823（823 aa）
链 J 1–823（823 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å

共 5 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NSP1_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–823； UniProt 1–823 作者链 D； PDB构建体 1–823； UniProt 1–823 作者链 G； PDB构建体 1–823； UniProt 1–823 作者链 J； PDB构建体 1–823； UniProt 1–823 作者链 y； PDB构建体 1–823； UniProt 1–823 作者链 z； PDB构建体 1–823； UniProt 1–823

Nucleoporin NUP57

物种未注明

UniProt P48837

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–541 链 E； UniProt 1–541 链 H； UniProt 1–541 链 K； UniProt 1–541 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–541 链 E； UniProt 1–541 链 H； UniProt 1–541 链 K； UniProt 1–541 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–541 链 E； UniProt 1–541 链 H； UniProt 1–541 链 K； UniProt 1–541 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric
链 B 1–541（541 aa）
链 E 1–541（541 aa）
链 H 1–541（541 aa）
链 K 1–541（541 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 B 1–541（541 aa）
链 E 1–541（541 aa）
链 H 1–541（541 aa）
链 K 1–541（541 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 B 1–541（541 aa）
链 E 1–541（541 aa）
链 H 1–541（541 aa）
链 K 1–541（541 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7WOO Cryo-EM structure of the inner ring protomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–541（541 aa）
链 K 1–541（541 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7WOT Cryo-EM structure of the inner ring monomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 H 1–541（541 aa）
链 K 1–541（541 aa）
链 T 1–541（541 aa）
链 W 1–541（541 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 B 1–541（541 aa）
链 E 1–541（541 aa）
链 H 1–541（541 aa）
链 K 1–541（541 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å

共 4 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP57_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–541； UniProt 1–541 作者链 E； PDB构建体 1–541； UniProt 1–541 作者链 H； PDB构建体 1–541； UniProt 1–541 作者链 K； PDB构建体 1–541； UniProt 1–541

Nucleoporin NUP49/NSP49

物种未注明

UniProt Q02199

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–472 链 F； UniProt 1–472 链 I； UniProt 1–472 链 L； UniProt 1–472 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–472 链 F； UniProt 1–472 链 I； UniProt 1–472 链 L； UniProt 1–472 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–472 链 F； UniProt 1–472 链 I； UniProt 1–472 链 L； UniProt 1–472 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric
链 C 1–472（472 aa）
链 F 1–472（472 aa）
链 I 1–472（472 aa）
链 L 1–472（472 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 C 1–472（472 aa）
链 F 1–472（472 aa）
链 I 1–472（472 aa）
链 L 1–472（472 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 C 1–472（472 aa）
链 F 1–472（472 aa）
链 I 1–472（472 aa）
链 L 1–472（472 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7WOO Cryo-EM structure of the inner ring protomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 G 1–472（472 aa）
链 J 1–472（472 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7WOT Cryo-EM structure of the inner ring monomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 G 1–472（472 aa）
链 J 1–472（472 aa）
链 S 1–472（472 aa）
链 V 1–472（472 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 C 1–472（472 aa）
链 F 1–472（472 aa）
链 I 1–472（472 aa）
链 L 1–472（472 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å

共 4 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP49_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472 作者链 F； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472 作者链 I； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472 作者链 L； PDB构建体 1–472； UniProt 1–472

Nucleoporin NUP192

物种未注明

UniProt P47054

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 M； UniProt 1–1683 链 O； UniProt 1–1683 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 M； UniProt 1–1683 链 O； UniProt 1–1683 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 M； UniProt 1–1683 链 O； UniProt 1–1683 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4IFQ Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae NUP192, residues 2 to 960 [ScNup192(2-960)] 提交 2012-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–960（959 aa） 片段：UNP residues 2-960
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 7 IOD IODIDE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Protein (20 mM Hepes, pH 8.0, 500 mM NaCl, 10% glycerol, 5mM DTT; Reservoir (10% PEG3350, 100mM pottasium iodide); Cryoprotection (30% PEG400 and 25% saturated ammonium sulfate), Vapor Diffusion, Sitting Drop, temperature 298K
分辨率 3.25 Å R-free 0.243
4IFQ Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae NUP192, residues 2 to 960 [ScNup192(2-960)] 提交 2012-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–960（959 aa） 片段：UNP residues 2-960
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 14 IOD IODIDE ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Protein (20 mM Hepes, pH 8.0, 500 mM NaCl, 10% glycerol, 5mM DTT; Reservoir (10% PEG3350, 100mM pottasium iodide); Cryoprotection (30% PEG400 and 25% saturated ammonium sulfate), Vapor Diffusion, Sitting Drop, temperature 298K
分辨率 3.25 Å R-free 0.243
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric
链 M 1–1683（1683 aa）
链 O 1–1683（1683 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 M 1–1683（1683 aa）
链 O 1–1683（1683 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 M 1–1683（1683 aa）
链 O 1–1683（1683 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7WOO Cryo-EM structure of the inner ring protomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–1683（1683 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7WOT Cryo-EM structure of the inner ring monomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 F 1–1683（1683 aa）
链 R 1–1683（1683 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 M 1–1683（1683 aa）
链 O 1–1683（1683 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å

共 5 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU192_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–1683； UniProt 1–1683 作者链 O； PDB构建体 1–1683； UniProt 1–1683

Nucleoporin NUP188

物种未注明

UniProt P52593

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 N； UniProt 1–1655 链 P； UniProt 1–1655 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 N； UniProt 1–1655 链 P； UniProt 1–1655 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 N； UniProt 1–1655 链 P； UniProt 1–1655 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric
链 X 1–1655（1655 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 X 1–1655（1655 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 X 1–1655（1655 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric
链 N 1–1655（1655 aa）
链 P 1–1655（1655 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 N 1–1655（1655 aa）
链 P 1–1655（1655 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 N 1–1655（1655 aa）
链 P 1–1655（1655 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7WO9 Cryo-EM structure of full-length Nup188 提交 2022-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–1655（1655 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7WOO Cryo-EM structure of the inner ring protomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–1655（1655 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7WOT Cryo-EM structure of the inner ring monomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 E 1–1655（1655 aa）
链 Q 1–1655（1655 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 N 1–1655（1655 aa）
链 P 1–1655（1655 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å

共 6 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU188_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–1655； UniProt 1–1655 作者链 P； PDB构建体 1–1655； UniProt 1–1655

Nucleoporin NIC96

物种未注明

UniProt P34077

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 Q； UniProt 1–839 链 R； UniProt 1–839 链 S； UniProt 1–839 链 T； UniProt 1–839 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 Q； UniProt 1–839 链 R； UniProt 1–839 链 S； UniProt 1–839 链 T； UniProt 1–839 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 Q； UniProt 1–839 链 R； UniProt 1–839 链 S； UniProt 1–839 链 T； UniProt 1–839 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2QX5 Structure of nucleoporin Nic96 提交 2007-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 186–839（654 aa） 片段：residues 186-839
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Potassium Thiocyanate, 1mM Cetyltrimethylammonium bromide, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.50 Å R-free 0.285
2QX5 Structure of nucleoporin Nic96 提交 2007-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 186–839（654 aa） 片段：residues 186-839
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Potassium Thiocyanate, 1mM Cetyltrimethylammonium bromide, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.50 Å R-free 0.285
2RFO Crystral Structure of the nucleoporin Nic96 提交 2007-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 189–839（651 aa） 片段：UNP residues 189-839
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；3-10% PEG3350, 0.1M BisTris pH6.5, 0.05M lithium sulfate, 3% 1,6-hexandiole, 0.01mM DTE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
2RFO Crystral Structure of the nucleoporin Nic96 提交 2007-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 189–839（651 aa） 片段：UNP residues 189-839
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；3-10% PEG3350, 0.1M BisTris pH6.5, 0.05M lithium sulfate, 3% 1,6-hexandiole, 0.01mM DTE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
6X07 Nic96 from S. cerevisiae bound by VHH-SAN12 提交 2020-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 186–839（654 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；8% PEG 8,000 and 0.1M tri-sodium citrate pH 5
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric
链 Q 1–839（839 aa）
链 R 1–839（839 aa）
链 S 1–839（839 aa）
链 T 1–839（839 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 Q 1–839（839 aa）
链 R 1–839（839 aa）
链 S 1–839（839 aa）
链 T 1–839（839 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 Q 1–839（839 aa）
链 R 1–839（839 aa）
链 S 1–839（839 aa）
链 T 1–839（839 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7WOO Cryo-EM structure of the inner ring protomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–839（839 aa）
链 Z 1–839（839 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7WOT Cryo-EM structure of the inner ring monomer of the Saccharomyces cerevisiae nuclear pore complex 提交 2022-01-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 A 1–839（839 aa）
链 M 1–839（839 aa）
链 N 1–839（839 aa）
链 Z 1–839（839 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 Q 1–839（839 aa）
链 R 1–839（839 aa）
链 S 1–839（839 aa）
链 T 1–839（839 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å

共 7 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NIC96_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 1–839； UniProt 1–839 作者链 R； PDB构建体 1–839； UniProt 1–839 作者链 S； PDB构建体 1–839； UniProt 1–839 作者链 T； PDB构建体 1–839； UniProt 1–839

Nucleoporin NUP53

物种未注明

UniProt Q03790

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 U； UniProt 1–475 链 W； UniProt 1–475 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 U； UniProt 1–475 链 W； UniProt 1–475 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 U； UniProt 1–475 链 W； UniProt 1–475 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3W3Y Crystal structure of Kap121p bound to Nup53p 提交 2012-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 401–448（48 aa） 片段：UNP residues 401-448
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1M HEPES, 10% 2-propanol, 24% PEG 20000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.297
5UAZ Crystal structure of the yeast nucleoporin 提交 2016-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 247–355（109 aa）
链 B 247–355（109 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% (wt/vol) PEG 3350 0.2 M Ammonium sulfate
分辨率 1.75 Å R-free 0.199
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric
链 U 1–475（475 aa）
链 W 1–475（475 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 U 1–475（475 aa）
链 W 1–475（475 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 U 1–475（475 aa）
链 W 1–475（475 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 U 1–475（475 aa）
链 W 1–475（475 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å

共 4 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP53_YEAST
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 U； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 W； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475

Nucleoporin ASM4

物种未注明

UniProt Q05166

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 V； UniProt 1–528 链 X； UniProt 1–528 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 V； UniProt 1–528 链 X； UniProt 1–528 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 V； UniProt 1–528 链 X； UniProt 1–528 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric
链 V 1–528（528 aa）
链 X 1–528（528 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 V 1–528（528 aa）
链 X 1–528（528 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
7N85 Inner ring spoke from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 V 1–528（528 aa）
链 X 1–528（528 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
8TJ5 Inner spoke ring of the yeast NPC 提交 2023-07-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric
链 V 1–528（528 aa）
链 X 1–528（528 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å

共 2 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP59_YEAST
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 V； PDB构建体 1–528； UniProt 1–528 作者链 X； PDB构建体 1–528； UniProt 1–528

Nucleoporin NUP82

物种未注明

UniProt P40368

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 u； UniProt 1–713 链 v； UniProt 1–713 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 u； UniProt 1–713 链 v； UniProt 1–713 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 u； UniProt 1–713 链 v； UniProt 1–713 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3PBP Structure of the yeast heterotrimeric Nup82-Nup159-Nup116 nucleoporin complex 提交 2010-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–452（452 aa） 片段：N-terminal domain (NTD), UNP residues 1-452
突变：C396S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 400, sodium cacodylate, lithium sulfate, 2,5-hexanediol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.272
3PBP Structure of the yeast heterotrimeric Nup82-Nup159-Nup116 nucleoporin complex 提交 2010-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–452（452 aa） 片段：N-terminal domain (NTD), UNP residues 1-452
突变：C396S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 400, sodium cacodylate, lithium sulfate, 2,5-hexanediol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.272
3PBP Structure of the yeast heterotrimeric Nup82-Nup159-Nup116 nucleoporin complex 提交 2010-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–452（452 aa） 片段：N-terminal domain (NTD), UNP residues 1-452
突变：C396S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 400, sodium cacodylate, lithium sulfate, 2,5-hexanediol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.272
3PBP Structure of the yeast heterotrimeric Nup82-Nup159-Nup116 nucleoporin complex 提交 2010-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–452（452 aa） 片段：N-terminal domain (NTD), UNP residues 1-452
突变：C396S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 400, sodium cacodylate, lithium sulfate, 2,5-hexanediol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.272
3TKN Structure of the Nup82-Nup159-Nup98 heterotrimer 提交 2011-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–452（452 aa） 片段：UNP residues 1-452
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；18.5% PEG3350, 100 mM potassium thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.40 Å R-free 0.285
3TKN Structure of the Nup82-Nup159-Nup98 heterotrimer 提交 2011-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–452（452 aa） 片段：UNP residues 1-452
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；18.5% PEG3350, 100 mM potassium thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.40 Å R-free 0.285
3TKN Structure of the Nup82-Nup159-Nup98 heterotrimer 提交 2011-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–452（452 aa） 片段：UNP residues 1-452
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；18.5% PEG3350, 100 mM potassium thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.40 Å R-free 0.285

共 2 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP82_YEAST
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 u； PDB构建体 1–713； UniProt 1–713 作者链 v； PDB构建体 1–713； UniProt 1–713

Nucleoporin NUP159

物种未注明

UniProt P40477

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 w； UniProt 1–1460 链 x； UniProt 1–1460 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 w； UniProt 1–1460 链 x； UniProt 1–1460 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 w； UniProt 1–1460 链 x； UniProt 1–1460 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1XIP Crystal Structure of the N-terminal Domain of Nup159 提交 2004-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–387（386 aa） 片段：N-terminal domain
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；292 K；PEG3350, ammonium acetate, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.50 Å R-free 0.249
3PBP Structure of the yeast heterotrimeric Nup82-Nup159-Nup116 nucleoporin complex 提交 2010-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1425–1460（36 aa） 片段：Tail, UNP residues 1425-1460
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 400, sodium cacodylate, lithium sulfate, 2,5-hexanediol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.272
3PBP Structure of the yeast heterotrimeric Nup82-Nup159-Nup116 nucleoporin complex 提交 2010-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1425–1460（36 aa） 片段：Tail, UNP residues 1425-1460
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 400, sodium cacodylate, lithium sulfate, 2,5-hexanediol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.272
3PBP Structure of the yeast heterotrimeric Nup82-Nup159-Nup116 nucleoporin complex 提交 2010-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 1425–1460（36 aa） 片段：Tail, UNP residues 1425-1460
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 400, sodium cacodylate, lithium sulfate, 2,5-hexanediol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.272
3PBP Structure of the yeast heterotrimeric Nup82-Nup159-Nup116 nucleoporin complex 提交 2010-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 1425–1460（36 aa） 片段：Tail, UNP residues 1425-1460
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；PEG 400, sodium cacodylate, lithium sulfate, 2,5-hexanediol, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.272
3RRM S. cerevisiae dbp5 l327v bound to nup159, gle1 h337r, ip6 and adp 提交 2011-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–387（386 aa） 片段：unp residues 2-387
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；20% PEG 3350, 200 mM KOAc, 20 mM sarcosine, 10 mM HEPES, 100 mM NaCl, 1 mM DTT, 0.5 mM IP6, 10 mM MgCl2, 1 mM ADP, 5% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.90 Å R-free 0.261
3TKN Structure of the Nup82-Nup159-Nup98 heterotrimer 提交 2011-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1425–1460（36 aa） 片段：UNP residues 1425-1460
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；18.5% PEG3350, 100 mM potassium thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.40 Å R-free 0.285
3TKN Structure of the Nup82-Nup159-Nup98 heterotrimer 提交 2011-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1425–1460（36 aa） 片段：UNP residues 1425-1460
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；18.5% PEG3350, 100 mM potassium thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.40 Å R-free 0.285
3TKN Structure of the Nup82-Nup159-Nup98 heterotrimer 提交 2011-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1425–1460（36 aa） 片段：UNP residues 1425-1460
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；18.5% PEG3350, 100 mM potassium thiocyanate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.40 Å R-free 0.285
4DS1 The Structure of a Yeast Dyn2-Nup159 Complex and the Molecular Basis for the Dynein Light Chain - Nuclear Pore Interaction 提交 2012-02-17 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1116–1126（11 aa） 片段：UNP residues 1116-1126
链 D 1116–1126（11 aa） 片段：UNP residues 1116-1126
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.3 M Ammonium acetate, 5% methyl pentanediol (v/v), 35% PEG 4000 (w/v), pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.85 Å R-free 0.187

共 5 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU159_YEAST
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 w； PDB构建体 1–1460； UniProt 1–1460 作者链 x； PDB构建体 1–1460； UniProt 1–1460

Nucleoporin NUP120

物种未注明

UniProt P35729

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 a； UniProt 1–1037 链 h； UniProt 1–1037 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 a； UniProt 1–1037 链 h； UniProt 1–1037 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 a； UniProt 1–1037 链 h； UniProt 1–1037 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3F7F Structure of Nup120 提交 2008-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–729（729 aa） 片段：UNP residues 1-729
突变：S207C HG MERCURY (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Succinic acid, PEG 3350, Sodium bromide, Ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3F7F Structure of Nup120 提交 2008-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–729（729 aa） 片段：UNP residues 1-729
突变：S207C HG MERCURY (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Succinic acid, PEG 3350, Sodium bromide, Ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3F7F Structure of Nup120 提交 2008-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–729（729 aa） 片段：UNP residues 1-729
突变：S207C HG MERCURY (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Succinic acid, PEG 3350, Sodium bromide, Ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3F7F Structure of Nup120 提交 2008-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–729（729 aa） 片段：UNP residues 1-729
突变：S207C HG MERCURY (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Succinic acid, PEG 3350, Sodium bromide, Ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3F7F Structure of Nup120 提交 2008-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–729（729 aa） 片段：UNP residues 1-729
链 B 1–729（729 aa） 片段：UNP residues 1-729
突变：S207C 突变：S207C HG MERCURY (II) ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Succinic acid, PEG 3350, Sodium bromide, Ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3F7F Structure of Nup120 提交 2008-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–729（729 aa） 片段：UNP residues 1-729
链 D 1–729（729 aa） 片段：UNP residues 1-729
突变：S207C 突变：S207C HG MERCURY (II) ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；Succinic acid, PEG 3350, Sodium bromide, Ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3H7N Structure of Nup120 提交 2009-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–729（729 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；Sodium citrate (tribasic dihydrate), Potassium thiocynate, PEG 2000 MME, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
3H7N Structure of Nup120 提交 2009-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–729（729 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；Sodium citrate (tribasic dihydrate), Potassium thiocynate, PEG 2000 MME, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
3H7N Structure of Nup120 提交 2009-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–729（729 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；Sodium citrate (tribasic dihydrate), Potassium thiocynate, PEG 2000 MME, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
3H7N Structure of Nup120 提交 2009-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–729（729 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；Sodium citrate (tribasic dihydrate), Potassium thiocynate, PEG 2000 MME, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
3HXR Nucleoporin Nup120 from S.cerevisiae (aa 1-757) 提交 2009-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–757（757 aa） 片段：UNP residues 1-757
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；15% PEG3350, 0.2M KSCN, 0.1M Tris-HCl pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.00 Å R-free 0.299
4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 2–1037（1036 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
分辨率 7.38 Å R-free 0.353
4XMN Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group P212121 提交 2015-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–1037（1037 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
分辨率 7.60 Å R-free 0.347
6X06 Nup120 (aa1-757) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN11 提交 2020-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–757（757 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；19% PEG 8,000, 0.1M magnesium chloride, 0.1M Tris/HCl pH 8.5
分辨率 4.27 Å R-free 0.359
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric
链 a 1–1037（1037 aa）
链 l 1–1037（1037 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 a 1–1037（1037 aa）
链 l 1–1037（1037 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 a 1–1037（1037 aa）
链 l 1–1037（1037 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
8TIE Double nuclear outer ring of Nup84-complexes from the yeast NPC 提交 2023-07-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 a 1–1037（1037 aa）
链 l 1–1037（1037 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å

共 8 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU120_YEAST
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 a； PDB构建体 1–1037； UniProt 1–1037 作者链 h； PDB构建体 1–1037； UniProt 1–1037

Nucleoporin NUP85

物种未注明

UniProt P46673

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 b； UniProt 1–744 链 i； UniProt 1–744 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 b； UniProt 1–744 链 i； UniProt 1–744 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 b； UniProt 1–744 链 i； UniProt 1–744 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3EWE Crystal Structure of the Nup85/Seh1 Complex 提交 2008-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–564（564 aa） 片段：UNP residues 1-564
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Sodium Citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.50 Å R-free 0.369
3EWE Crystal Structure of the Nup85/Seh1 Complex 提交 2008-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–564（564 aa） 片段：UNP residues 1-564
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Sodium Citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.50 Å R-free 0.369
3EWE Crystal Structure of the Nup85/Seh1 Complex 提交 2008-10-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–564（564 aa） 片段：UNP residues 1-564
链 D 1–564（564 aa） 片段：UNP residues 1-564
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Sodium Citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.50 Å R-free 0.369
3F3F Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21 提交 2008-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
链 D 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
链 G 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
链 H 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；298 K；PEG 10000, MES buffer, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.265
3F3G Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P212121 提交 2008-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
链 D 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
链 G 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
链 H 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Sodium citrate, Sodium chloride, Tris-HCl buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.75 Å R-free 0.272
3F3P Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21212 提交 2008-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
链 D 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 3350, Tacsimate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.281
3F3P Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21212 提交 2008-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
链 H 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 3350, Tacsimate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.281
3F3P Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21212 提交 2008-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
链 L 1–570（570 aa） 片段：UNP residues 1-570
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 3350, Tacsimate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.281
4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 44–744（701 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
分辨率 7.38 Å R-free 0.353
4XMN Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group P212121 提交 2015-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 73–743（671 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
分辨率 7.60 Å R-free 0.347
6X08 Nup85-Seh1 from S. cerevisiae bound by VHH-SAN2 提交 2020-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–564（564 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1M ammonium sulfate, di-sodium succinate pH 5.5, and the addition of 4% 1-propanol
分辨率 4.19 Å R-free 0.346
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric
链 b 1–744（744 aa）
链 m 1–744（744 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 b 1–744（744 aa）
链 m 1–744（744 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 b 1–744（744 aa）
链 m 1–744（744 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
8TIE Double nuclear outer ring of Nup84-complexes from the yeast NPC 提交 2023-07-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 b 1–744（744 aa）
链 m 1–744（744 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å

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UniProt名称 NUP85_YEAST
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 b； PDB构建体 1–744； UniProt 1–744 作者链 i； PDB构建体 1–744； UniProt 1–744

Nucleoporin 145c

物种未注明

UniProt P49687

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 c； UniProt 606–1317 链 j； UniProt 606–1317 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 c； UniProt 606–1317 链 j； UniProt 606–1317 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 c； UniProt 606–1317 链 j； UniProt 606–1317 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
链 C 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
链 F 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
链 G 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
链 C 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
链 G 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.15 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
链 C 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
链 F 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
链 G 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
链 C 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
链 G 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 731–1158（428 aa） 片段：Nucleoporin NUP145C
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 731–1158（428 aa） 片段：UNP residues 731-1158
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 731–1158（428 aa） 片段：UNP residues 731-1158
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 731–1158（428 aa） 片段：UNP residues 731-1158
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3JRO NUP84-NUP145C-SEC13 edge element of the NPC lattice 提交 2009-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 714–1160（447 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；1.15M sodium malonate, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 4.00 Å R-free 0.329
3JRP SEC13 with NUP145C (AA109-179) insertion blade 提交 2009-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 714–784（71 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；289 K；0.1M Tris, 22% PEG 4000, 0.25 M LiCl, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3KEP Crystal structure of the autoproteolytic domain from the nuclear pore complex component NUP145 from Saccharomyces cerevisiae 提交 2009-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 442–605（164 aa） 片段：residues 442 to 605
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES, 25% PEG 3350, 200mM NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.82 Å R-free 0.244
3KEP Crystal structure of the autoproteolytic domain from the nuclear pore complex component NUP145 from Saccharomyces cerevisiae 提交 2009-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 442–605（164 aa） 片段：residues 442 to 605
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；100mM HEPES, 25% PEG 3350, 200mM NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.82 Å R-free 0.244
3KES Crystal structure of the autoproteolytic domain from the nuclear pore complex component NUP145 from Saccharomyces cerevisiae in the Hexagonal, P61 space group 提交 2009-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 442–605（164 aa） 片段：residues 442 to 605
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；1600mM tri-sodium citrate dehydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 2.10 Å R-free 0.230
3KES Crystal structure of the autoproteolytic domain from the nuclear pore complex component NUP145 from Saccharomyces cerevisiae in the Hexagonal, P61 space group 提交 2009-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 442–605（164 aa） 片段：residues 442 to 605
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；1600mM tri-sodium citrate dehydrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 2.10 Å R-free 0.230
4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 680–1317（638 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
分辨率 7.38 Å R-free 0.353
4XMN Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group P212121 提交 2015-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 680–1317（638 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
分辨率 7.60 Å R-free 0.347
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric
链 c 606–1317（712 aa）
链 n 606–1317（712 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 c 606–1317（712 aa）
链 n 606–1317（712 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 c 606–1317（712 aa）
链 n 606–1317（712 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å

共 10 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 NU145_YEAST
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 c； PDB构建体 1–712； UniProt 606–1317 作者链 j； PDB构建体 1–712； UniProt 606–1317

Protein transport protein SEC13

物种未注明

UniProt Q04491

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 d； UniProt 1–297 链 k； UniProt 1–297 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 d； UniProt 1–297 链 k； UniProt 1–297 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 d； UniProt 1–297 链 k； UniProt 1–297 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2PM6 Crystal Structure of yeast Sec13/31 edge element of the COPII vesicular coat, native version 提交 2007-04-20 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–297（297 aa）
链 D 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；15% PEG 4000, 10% DMSO, 6% dioxanie, 0.1M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.45 Å R-free 0.301
2PM7 Crystal structure of yeast Sec13/31 edge element of the COPII vesicular coat, selenomethionine version 提交 2007-04-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–297（297 aa）
链 D 1–297（297 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；15% PEG 4000, 10% DMSO, 6% dioxane, 0.1M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.35 Å R-free 0.298
2PM9 Crystal structure of yeast Sec13/31 vertex element of the COPII vesicular coat 提交 2007-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；8% PEG 3350, 0.1M tri-sodium citrate, 10mM manganese chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.305
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–297（297 aa） 片段：UNP residues 1-297
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–297（297 aa） 片段：UNP residues 1-297
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–297（297 aa） 片段：UNP residues 1-297
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3JRO NUP84-NUP145C-SEC13 edge element of the NPC lattice 提交 2009-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–297（297 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；1.15M sodium malonate, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 4.00 Å R-free 0.329
3JRP SEC13 with NUP145C (AA109-179) insertion blade 提交 2009-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；289 K；0.1M Tris, 22% PEG 4000, 0.25 M LiCl, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.60 Å R-free 0.254
3MZK Sec13/Sec16 complex, S.cerevisiae 提交 2010-05-12 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–297（297 aa）
链 D 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；0.1mM bis-Tris propane, 0.2M NaBr, 12% polyethylene glycol 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.69 Å R-free 0.243
3MZL Sec13/Sec31 edge element, loop deletion mutant 提交 2010-05-12 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–297（297 aa）
链 C 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；289 K；0.1mM bis-Tris propane, 0.2M sodium citrate, 16% polyethylene glycol 3350, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.80 Å R-free 0.300
3MZL Sec13/Sec31 edge element, loop deletion mutant 提交 2010-05-12 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–297（297 aa）
链 G 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；289 K；0.1mM bis-Tris propane, 0.2M sodium citrate, 16% polyethylene glycol 3350, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.80 Å R-free 0.300
4BZJ The structure of the COPII coat assembled on membranes 提交 2013-07-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–292（291 aa）
链 F 2–292（291 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 HEPES, 50 MM KOAC, 1.2 MM MGCL2；pH 6.8；HEPES, 50 MM KOAC, 1.2 MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；ETHANE; HOMEMADE PLUNGER
分辨率 40.00 Å
4BZK The structure of the COPII coat assembled on membranes 提交 2013-07-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–297（297 aa）
链 F 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 HEPES, 50 MM KOAC, 1.2 MM MGCL2；pH 6.8；HEPES, 50 MM KOAC, 1.2 MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；ETHANE; HOMEMADE PLUNGER
分辨率 40.00 Å
4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
分辨率 7.38 Å R-free 0.353
4XMN Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group P212121 提交 2015-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 2–297（296 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
分辨率 7.60 Å R-free 0.347
6ZG5 COPII on membranes, outer coat right-handed rod, class1 提交 2020-06-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–297（297 aa）
链 F 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 40.00 Å
6ZG6 COPII on membranes, outer coat vertex 提交 2020-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–297（297 aa）
链 D 1–297（297 aa）
链 F 1–297（297 aa）
链 H 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å
6ZL0 COPII on membranes, outer coat left-handed rod 提交 2020-06-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–297（297 aa）
链 D 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 40.00 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric
链 d 1–297（297 aa）
链 o 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 d 1–297（297 aa）
链 o 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 d 1–297（297 aa）
链 o 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
8ADL Cryo-EM structure of the SEA complex 提交 2022-07-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 H 1–297（297 aa）
链 P 1–297（297 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
8TIE Double nuclear outer ring of Nup84-complexes from the yeast NPC 提交 2023-07-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 d 1–297（297 aa）
链 o 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 H 1–297（297 aa）
链 P 1–297（297 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å

共 19 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SEC13_YEAST
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 d； PDB构建体 1–297； UniProt 1–297 作者链 k； PDB构建体 1–297； UniProt 1–297

Nucleoporin SEH1

物种未注明

UniProt P53011

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 e； UniProt 1–349 链 l； UniProt 1–349 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 e； UniProt 1–349 链 l； UniProt 1–349 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 e； UniProt 1–349 链 l； UniProt 1–349 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3EWE Crystal Structure of the Nup85/Seh1 Complex 提交 2008-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–349（349 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Sodium Citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.50 Å R-free 0.369
3EWE Crystal Structure of the Nup85/Seh1 Complex 提交 2008-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–349（349 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Sodium Citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.50 Å R-free 0.369
3EWE Crystal Structure of the Nup85/Seh1 Complex 提交 2008-10-14 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–349（349 aa）
链 C 1–349（349 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；289 K；18% PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane, 0.2M Sodium Citrate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.50 Å R-free 0.369
3F3F Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21 提交 2008-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–349（349 aa）
链 B 1–349（349 aa）
链 E 1–349（349 aa）
链 F 1–349（349 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.1；298 K；PEG 10000, MES buffer, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.90 Å R-free 0.265
3F3G Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P212121 提交 2008-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–349（349 aa）
链 B 1–349（349 aa）
链 E 1–349（349 aa）
链 F 1–349（349 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；Sodium citrate, Sodium chloride, Tris-HCl buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.75 Å R-free 0.272
3F3P Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21212 提交 2008-10-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–349（349 aa）
链 B 1–349（349 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 3350, Tacsimate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.281
3F3P Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21212 提交 2008-10-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–349（349 aa）
链 F 1–349（349 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 3350, Tacsimate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.281
3F3P Crystal structure of the nucleoporin pair Nup85-Seh1, space group P21212 提交 2008-10-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 1–349（349 aa）
链 J 1–349（349 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 3350, Tacsimate pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.281
4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–349（349 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
分辨率 7.38 Å R-free 0.353
6X08 Nup85-Seh1 from S. cerevisiae bound by VHH-SAN2 提交 2020-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–349（349 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1M ammonium sulfate, di-sodium succinate pH 5.5, and the addition of 4% 1-propanol
分辨率 4.19 Å R-free 0.346
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric
链 e 1–349（349 aa）
链 p 1–349（349 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 e 1–349（349 aa）
链 p 1–349（349 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 e 1–349（349 aa）
链 p 1–349（349 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
8ADL Cryo-EM structure of the SEA complex 提交 2022-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 D 1–349（349 aa）
链 E 1–349（349 aa）
链 F 1–349（349 aa）
链 L 1–349（349 aa）
链 M 1–349（349 aa）
链 N 1–349（349 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9H5K Cryo-EM structure of the SEAC-EGOC supercomplex 提交 2024-10-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：32-meric
链 D 1–349（349 aa）
链 E 1–349（349 aa）
链 F 1–349（349 aa）
链 L 1–349（349 aa）
链 M 1–349（349 aa）
链 N 1–349（349 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å

共 9 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SEH1_YEAST
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 e； PDB构建体 1–349； UniProt 1–349 作者链 l； PDB构建体 1–349； UniProt 1–349

Nucleoporin NUP84

物种未注明

UniProt P52891

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 f； UniProt 1–726 链 m； UniProt 1–726 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 f； UniProt 1–726 链 m； UniProt 1–726 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 f； UniProt 1–726 链 m； UniProt 1–726 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–460（460 aa） 片段：UNP residues 1-460
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–460（460 aa） 片段：UNP residues 1-460
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3IKO Crystal structure of the heterotrimeric Sec13-Nup145C-Nup84 nucleoporin complex 提交 2009-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 1–460（460 aa） 片段：UNP residues 1-460
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 20000, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.273
3JRO NUP84-NUP145C-SEC13 edge element of the NPC lattice 提交 2009-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–424（424 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；295 K；1.15M sodium malonate, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 4.00 Å R-free 0.329
4XMM Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group C2 提交 2015-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–451（451 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
分辨率 7.38 Å R-free 0.353
4XMN Structure of the yeast coat nucleoporin complex, space group P212121 提交 2015-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 2–451（450 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；PEG 20000, ethanol, MES
分辨率 7.60 Å R-free 0.347
6X02 Nup84-Nup133 (aa521-1157) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN8 提交 2020-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–726（726 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；6% PEG 8,000, 30% ethylene glycol, 0.1M imidazole titrated with MES pH 6.5, 15mM sodium nitrate, 15mM sodium phosphate dibasic, 15mM ammonium sulfate
分辨率 6.38 Å R-free 0.324
6X03 Nup84-Nup133 (aa521-1157) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN8 and VHH-SAN9 提交 2020-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–726（726 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；6% PEG 8,000, 30% ethylene glycol, 0.1M imidazole titrated with MES pH 6.5, 15mM sodium nitrate, 15mM sodium phosphate dibasic, 15mM ammonium sulfate
分辨率 7.30 Å R-free 0.353
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric
链 f 1–726（726 aa）
链 q 1–726（726 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 f 1–726（726 aa）
链 q 1–726（726 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 f 1–726（726 aa）
链 q 1–726（726 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
8TIE Double nuclear outer ring of Nup84-complexes from the yeast NPC 提交 2023-07-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 f 1–726（726 aa）
链 q 1–726（726 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES,50mM Potassium acetate,20mM NaCl,2mM MgCl2,1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å

共 8 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP84_YEAST
Isoform —
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 f； PDB构建体 1–726； UniProt 1–726 作者链 m； PDB构建体 1–726； UniProt 1–726

Nucleoporin NUP133

物种未注明

UniProt P36161

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 g； UniProt 1–1157 链 n； UniProt 1–1157 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 48 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 g； UniProt 1–1157 链 n； UniProt 1–1157 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 g； UniProt 1–1157 链 n； UniProt 1–1157 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Dynein light chain 1, cytoplasmic × 6 （Q02647） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3KFO Crystal structure of the C-terminal domain from the nuclear pore complex component NUP133 from Saccharomyces cerevisiae 提交 2009-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 881–1157（277 aa） 片段：C-terminal domain, residues 881-1157
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20% PEG 3350, 200mM Potassium Thiocyanate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.90 Å R-free 0.245
6X02 Nup84-Nup133 (aa521-1157) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN8 提交 2020-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 521–1157（637 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；6% PEG 8,000, 30% ethylene glycol, 0.1M imidazole titrated with MES pH 6.5, 15mM sodium nitrate, 15mM sodium phosphate dibasic, 15mM ammonium sulfate
分辨率 6.38 Å R-free 0.324
6X03 Nup84-Nup133 (aa521-1157) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN8 and VHH-SAN9 提交 2020-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 521–1157（637 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；6% PEG 8,000, 30% ethylene glycol, 0.1M imidazole titrated with MES pH 6.5, 15mM sodium nitrate, 15mM sodium phosphate dibasic, 15mM ammonium sulfate
分辨率 7.30 Å R-free 0.353
6X04 Nup133 (aa55-481) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN5 提交 2020-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 55–481（427 aa）
链 C 55–481（427 aa）
链 E 55–481（427 aa）
链 G 55–481（427 aa）
链 I 55–481（427 aa）
链 K 55–481（427 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；15% PEG MME 2,000, 0.1M potassium chloride, 0.1M Tris/HCl pH 8
分辨率 2.68 Å R-free 0.261
6X05 Nup133 (aa55-481) from S. cerevisiae bound by VHH-SAN4 提交 2020-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 55–481（427 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；24% PEG 3,350, 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.219
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 136 PDB 声明：136-meric
链 g 1–1157（1157 aa）
链 r 1–1157（1157 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 g 1–1157（1157 aa）
链 r 1–1157（1157 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å
7N84 Double nuclear outer ring from the isolated yeast NPC 提交 2021-06-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 g 1–1157（1157 aa）
链 r 1–1157（1157 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.60 Å

共 6 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NU133_YEAST
Isoform —
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 g； PDB构建体 1–1157； UniProt 1–1157 作者链 n； PDB构建体 1–1157； UniProt 1–1157

Dynein light chain 1, cytoplasmic

物种未注明

UniProt Q02647

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 448 PDB 声明：448-meric（448） 与蛋白拷贝数一致 链 o； UniProt 1–92 链 p； UniProt 1–92 链 q； UniProt 1–92 链 r； UniProt 1–92 链 s； UniProt 1–92 链 t； UniProt 1–92 未记录 Nucleoporin NUP170 × 16 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 16 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 16 Nucleoporin NSP1 × 48 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 32 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 32 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 16 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 16 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 32 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 16 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 16 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 16 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 16 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 16 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 16 （P46673） Nucleoporin 145c × 16 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 16 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 16 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 16 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 16 （P36161） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 o； UniProt 1–92 链 p； UniProt 1–92 链 q； UniProt 1–92 链 r； UniProt 1–92 链 s； UniProt 1–92 链 t； UniProt 1–92 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric（56） 与蛋白拷贝数一致 链 o； UniProt 1–92 链 p； UniProt 1–92 链 q； UniProt 1–92 链 r； UniProt 1–92 链 s； UniProt 1–92 链 t； UniProt 1–92 未记录 Nucleoporin NUP170 × 2 （P38181） Nucleoporin NUP157 × 2 （P40064） orphans bound to Nup192 NTD × 2 Nucleoporin NSP1 × 6 （P14907） Nucleoporin NUP57 × 4 （P48837） Nucleoporin NUP49/NSP49 × 4 （Q02199） Nucleoporin NUP192 × 2 （P47054） Nucleoporin NUP188 × 2 （P52593） Nucleoporin NIC96 × 4 （P34077） Nucleoporin NUP53 × 2 （Q03790） Nucleoporin ASM4 × 2 （Q05166） Nucleoporin NUP82 × 2 （P40368） Nucleoporin NUP159 × 2 （P40477） Nucleoporin NUP120 × 2 （P35729） Nucleoporin NUP85 × 2 （P46673） Nucleoporin 145c × 2 （P49687） Protein transport protein SEC13 × 2 （Q04491） Nucleoporin SEH1 × 2 （P53011） Nucleoporin NUP84 × 2 （P52891） Nucleoporin NUP133 × 2 （P36161） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；A custom-built vitrification device (Max Planck Institute for Biochemistry, Munich) 分辨率 37.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7N9F Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4DS1 The Structure of a Yeast Dyn2-Nup159 Complex and the Molecular Basis for the Dynein Light Chain - Nuclear Pore Interaction 提交 2012-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–92（92 aa）
链 C 1–92（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.3 M Ammonium acetate, 5% methyl pentanediol (v/v), 35% PEG 4000 (w/v), pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.85 Å R-free 0.187
4HT6 The Structure of a Yeast Dynein Dyn2-Pac11 Complex and Effect on Single Molecule Dynein Motor Activity 提交 2012-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–92（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；0.4M sodium phosphate monobasic, 0.1M 1,6-hexanediol, 25% PEG 3350 (w/v), pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.212
4HT6 The Structure of a Yeast Dynein Dyn2-Pac11 Complex and Effect on Single Molecule Dynein Motor Activity 提交 2012-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–92（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；0.4M sodium phosphate monobasic, 0.1M 1,6-hexanediol, 25% PEG 3350 (w/v), pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.212
4HT6 The Structure of a Yeast Dynein Dyn2-Pac11 Complex and Effect on Single Molecule Dynein Motor Activity 提交 2012-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–92（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；0.4M sodium phosphate monobasic, 0.1M 1,6-hexanediol, 25% PEG 3350 (w/v), pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.212
4HT6 The Structure of a Yeast Dynein Dyn2-Pac11 Complex and Effect on Single Molecule Dynein Motor Activity 提交 2012-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–92（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；0.4M sodium phosphate monobasic, 0.1M 1,6-hexanediol, 25% PEG 3350 (w/v), pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.212

共 2 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DYL1_YEAST
Isoform —
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 o； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92 作者链 p； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92 作者链 q； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92 作者链 r； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92 作者链 s； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92 作者链 t； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7n9f

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7n9f
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7n9f
沉积日期 deposition_date2021-06-17
结构标题 titleStructure of the in situ yeast NPC
关键词 keywordsNPC, nucleocytoplasmic transport, TRANSLOCASE; TRANSLOCASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier— Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron176.30 Å
零角强度 I(0) i0115941000000.00
分子量 molecular_weight3015900.0 kDa
排除体积 excluded_volume3810100 ų
包络体积 envelope_volume10279000 ų
水化壳体积 shell_volume532230 ų
包络直径 envelope_diameter714.4 Å
壳层 Rg shell_rg129.30 Å
包络 Rg envelope_rg173.70 Å
形状 Rg shape_rg176.40 Å
总 Rg total_rg176.00 Å
总原子数 total_atoms212962
残基数 n_residues27071
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax474.6 Å
Rg (实空间) rg_real164.50 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.95 Å
I(0) (实空间) i0_real1.1020e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.8700e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal142.10 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal100000000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9129
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary158.2 Å
偏度 Skewness skewness0.253
峰度 Kurtosis kurtosis-0.695
角度范围 angular_range— – 0.0450 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.9329
最高正则化参数 α highest_alpha5983000000.0000
实空间数据点数 n_real_points10
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.269; Oscil: 0.998; Stabil: 0.976; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.944; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (21)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)