7z8m

The pointed end complex of dynactin bound to BICDR1

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dynactin subunit 2

物种未注明

UniProt A0A4X1W6J2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 9 BICD family-like cargo adapter 1 × 1 (A0JNT9) Dynactin 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Arp11 × 1 (I3LHK5) ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 (F2Z5G5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) ZINC ION × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A4X1W6J2_PIG
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–405; UniProt 1–405

BICD family-like cargo adapter 1

Mus musculus

UniProt A0JNT9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 9 Dynactin subunit 2 × 1 (A0A4X1W6J2) Dynactin 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Arp11 × 1 (I3LHK5) ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 (F2Z5G5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) ZINC ION × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 BICL1_MOUSE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 X; PDB构建体 1–577; UniProt 1–577

Dynactin 6

物种未注明

UniProt D0G6S1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 9 Dynactin subunit 2 × 1 (A0A4X1W6J2) BICD family-like cargo adapter 1 × 1 (A0JNT9) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Arp11 × 1 (I3LHK5) ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 (F2Z5G5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) ZINC ION × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 D0G6S1_PIG
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–190; UniProt 1–190

Dynactin subunit 4

物种未注明

UniProt A0A4X1TB62

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 9 Dynactin subunit 2 × 1 (A0A4X1W6J2) BICD family-like cargo adapter 1 × 1 (A0JNT9) Dynactin 6 × 1 (D0G6S1) Arp11 × 1 (I3LHK5) ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 (F2Z5G5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) ZINC ION × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A4X1TB62_PIG
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 Y; PDB构建体 1–467; UniProt 1–467

Arp11

物种未注明

UniProt I3LHK5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 9 Dynactin subunit 2 × 1 (A0A4X1W6J2) BICD family-like cargo adapter 1 × 1 (A0JNT9) Dynactin 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 (F2Z5G5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) ZINC ION × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 I3LHK5_PIG
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–417; UniProt 1–417

ARP1 actin related protein 1 homolog A

物种未注明

UniProt F2Z5G5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 9 Dynactin subunit 2 × 1 (A0A4X1W6J2) BICD family-like cargo adapter 1 × 1 (A0JNT9) Dynactin 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Arp11 × 1 (I3LHK5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) ZINC ION × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 F2Z5G5_PIG
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376 作者链 I; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376

Actin, cytoplasmic 1

物种未注明

UniProt Q6QAQ1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 9 Dynactin subunit 2 × 1 (A0A4X1W6J2) BICD family-like cargo adapter 1 × 1 (A0JNT9) Dynactin 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Arp11 × 1 (I3LHK5) ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 (F2Z5G5) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) ZINC ION × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ACTB_PIG
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375

Dynactin subunit 5

物种未注明

UniProt A0A286ZK88

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 9 Dynactin subunit 2 × 1 (A0A4X1W6J2) BICD family-like cargo adapter 1 × 1 (A0JNT9) Dynactin 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Arp11 × 1 (I3LHK5) ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 (F2Z5G5) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) ZINC ION × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A286ZK88_PIG
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 V; PDB构建体 1–182; UniProt 1–182

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7z8m
沉积日期 deposition_date2022-03-17
结构标题 titleThe pointed end complex of dynactin bound to BICDR1
关键词 keywordsDynein, dynactin, cargo transport, activating adaptor, cytoskeleton, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7z8m__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7z8m__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7z8m__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)51.17 Å
Rg(电子密度)51.71 Å
总 Rg51.66 Å
原子数17694
残基数2272
排除体积315970 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7z8m__assembly_1__model_1 nonameric (9) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id7z8mG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id7z8mH01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id7z8mI01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id7z8mJ01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id7z8mU01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture160 — 3 Solenoid
拓扑 Topology topology10 — UDP N-Acetylglucosamine Acyltransferase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hexapeptide repeat proteins
结构域编号 domain_id7z8mV01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture160 — 3 Solenoid
拓扑 Topology topology10 — UDP N-Acetylglucosamine Acyltransferase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hexapeptide repeat proteins
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7. 引用文献 (1)