9dgs

Dynactin and dynein tail region of dynein-dynactin complex on microtubules

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 294.6 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9dgs

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9dgs
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9dgs
沉积日期 deposition_date2024-09-03
结构标题 titleDynactin and dynein tail region of dynein-dynactin complex on microtubules
关键词 keywordsdynein, dynactin, microtubule, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron111.00
零角强度 I(0) i021256400000.00
分子量 molecular_weight1211700.0 kDa
排除体积 excluded_volume1502500 ų
包络体积 envelope_volume2783800 ų
水化壳体积 shell_volume235080 ų
包络直径 envelope_diameter457.4
壳层 Rg shell_rg87.16
包络 Rg envelope_rg107.80
形状 Rg shape_rg111.00
总 Rg total_rg111.20
总原子数 total_atoms85480
残基数 n_residues11583
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax294.6
Rg (实空间) rg_real100.70
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.35
I(0) (实空间) i0_real2.0260e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.4720e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal99.55
I(0) (倒空间) i0_reciprocal20660000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9181
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary105.2
偏度 Skewness skewness0.369
峰度 Kurtosis kurtosis-0.486
角度范围 angular_range— – 0.0700 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.6811
最高正则化参数 α highest_alpha547700000.0000
实空间数据点数 n_real_points15
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.028; Oscil: 0.996; Stabil: 0.983; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.008

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (16)

7. 引用文献 (2)

8. 文件与曲线 (10)