8t0a

Crystal structure of integrin beta-2 tail bound to the FERM-folded talin head domain with a Y270E mutation

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 106.2 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integrin beta-2,Talin-1

Mus musculus

UniProt P11835

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 750–759 突变:Y270E 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;300 K;PEG4000 15%, NaCl 0.1M, DTT 2mM 分辨率 2.14 Å R-free 0.230

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ITB2_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–11; UniProt 750–759

Integrin beta-2,Talin-1

Mus musculus

UniProt P26039

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–430 突变:Y270E 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;300 K;PEG4000 15%, NaCl 0.1M, DTT 2mM 分辨率 2.14 Å R-free 0.230

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 50 个其他 PDB 条目、70 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TLN1_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 12–411; UniProt 1–430

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8t0a

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8t0a
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8t0a
沉积日期 deposition_date2023-05-31
最后修订 last_revision2024-10-30
结构标题 titleCrystal structure of integrin beta-2 tail bound to the FERM-folded talin head domain with a Y270E mutation
关键词 keywordsTalin, integrin, Beta-2, CELL ADHESION; CELL ADHESION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier28.72
回转半径 Rg (电子) rg_electron28.25
零角强度 I(0) i030904600.00
分子量 molecular_weight43196.0 kDa
排除体积 excluded_volume54265 ų
包络体积 envelope_volume73115 ų
水化壳体积 shell_volume23718 ų
包络直径 envelope_diameter108.8
壳层 Rg shell_rg32.40
包络 Rg envelope_rg28.79
形状 Rg shape_rg28.23
总 Rg total_rg28.79
总原子数 total_atoms3034
残基数 n_residues378
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax106.2
Rg (实空间) rg_real28.97
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.29
I(0) (实空间) i0_real3.0900e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.4860e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal28.87
I(0) (倒空间) i0_reciprocal30900000.0000
解质量估计 total_estimate0.6044
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary25.1
偏度 Skewness skewness0.557
峰度 Kurtosis kurtosis-0.124
角度范围 angular_range— – 0.2750 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha6754000.0000
实空间数据点数 n_real_points56
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.663; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.156; Positv: 1.000; Valcen: 0.462; Smooth: 0.935

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)