8wu1

Cryo-EM structure of CB1-beta-arrestin1 complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 139.4 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-arrestin-1

Bos taurus

UniProt P17870

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–393 突变:R169E, I386A, V387A, F388A Fab30 heavy chain × 1 Fab30 light chain × 1 Cannabinoid receptor 1,Vasopressin V2 receptor × 1 (P21554,P30518) KCA methyl N-{1-[(4-fluorophenyl)methyl]-1H-indazole-3-carbonyl}-3-methyl-L-valinate × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 23 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARRB1_BOVIN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–393; UniProt 1–393

Cannabinoid receptor 1,Vasopressin V2 receptor

Homo sapiens

UniProt P21554

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 R; UniProt 1–413 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) Beta-arrestin-1 × 1 (P17870) Fab30 heavy chain × 1 Fab30 light chain × 1 KCA methyl N-{1-[(4-fluorophenyl)methyl]-1H-indazole-3-carbonyl}-3-methyl-L-valinate × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 30 个其他 PDB 条目、30 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CNR1_HUMAN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–413; UniProt 1–413

Cannabinoid receptor 1,Vasopressin V2 receptor

Homo sapiens

UniProt P30518

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 R; UniProt 342–371 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) Beta-arrestin-1 × 1 (P17870) Fab30 heavy chain × 1 Fab30 light chain × 1 KCA methyl N-{1-[(4-fluorophenyl)methyl]-1H-indazole-3-carbonyl}-3-methyl-L-valinate × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 36 个其他 PDB 条目、37 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 V2R_HUMAN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 414–443; UniProt 342–371

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8wu1

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8wu1
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8wu1
沉积日期 deposition_date2023-10-19
结构标题 titleCryo-EM structure of CB1-beta-arrestin1 complex
关键词 keywordscannabinoid receptor, arrestin, biased signal, class A GPCR, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier40.45
回转半径 Rg (电子) rg_electron40.91
零角强度 I(0) i0157119000.00
分子量 molecular_weight102810.0 kDa
排除体积 excluded_volume129280 ų
包络体积 envelope_volume185200 ų
水化壳体积 shell_volume40860 ų
包络直径 envelope_diameter149.4
壳层 Rg shell_rg41.56
包络 Rg envelope_rg41.35
形状 Rg shape_rg40.94
总 Rg total_rg40.87
总原子数 total_atoms7250
残基数 n_residues1008
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax139.4
Rg (实空间) rg_real40.79
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.65
I(0) (实空间) i0_real1.5710e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.1000e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal40.45
I(0) (倒空间) i0_reciprocal157100000.0000
解质量估计 total_estimate0.6025
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary39.3
偏度 Skewness skewness0.580
峰度 Kurtosis kurtosis-0.045
角度范围 angular_range— – 0.1950 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha11640000.0000
实空间数据点数 n_real_points40
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.799; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.107; Positv: 1.000; Valcen: 0.741; Smooth: 0.369

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)