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8x7g

Crystal structure of the ternary complex of GID4-PROTAC(NEP108)-BRD4(BD1).

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 68.7 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glucose-induced degradation protein 4 homolog

Homo sapiens

UniProt Q8IVV7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 124–289 未记录 Bromodomain-containing protein 4 × 1 （O60885） YAX 2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]-~{N}-[2-[2-[[2-[4-[2-(1~{H}-indol-2-ylmethylamino)ethanoylamino]cyclohexyl]-3~{H}-benzimidazol-5-yl]oxy]ethoxy]ethyl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% (v/v) polyethylene glycol 300, 30% (v/v) galactose 分辨率 2.70 Å R-free 0.266

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8X7G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6CCR Selenomethionyl derivative of a GID4 fragment 提交 2018-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 116–300（185 aa） 片段：residues 116-300
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 36 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；10% 2-propanol, 20% PEG4K and 0.1M Na-HEPES
分辨率 1.60 Å R-free 0.187
6CCT Fragment of GID4 in complex with a short peptide 提交 2018-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 124–289（166 aa） 片段：residues 124-289
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350, 2% Tacsimate pH 7.0 and 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.260
6CCU Complex between a GID4 fragment and a short peptide 提交 2018-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 116–300（185 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350 and 0.03M Citric acid
分辨率 1.75 Å R-free 0.236
6CD8 Complex of GID4 fragment with short peptide 提交 2018-02-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 124–289（166 aa） 片段：residues 124-289
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；30% PEG2000 and 0.1M KSCN
分辨率 1.60 Å R-free 0.224
6CD8 Complex of GID4 fragment with short peptide 提交 2018-02-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 124–289（166 aa） 片段：residues 124-289
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；30% PEG2000 and 0.1M KSCN
分辨率 1.60 Å R-free 0.224
6CD9 GID4 in complex with a peptide 提交 2018-02-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 124–289（166 aa） 片段：residues 124-289
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 46 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；24% PEG3350, 2.8% Tacsimate pH 7.0 and 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 1.55 Å R-free 0.193
6CDC GID4 in complex with a tetrapeptide 提交 2018-02-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 124–289（166 aa） 片段：residues 124-289
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；30%PEG3350, 0.2M NaCl and 0.1M Tris pH 8.5
分辨率 1.75 Å R-free 0.239
6CDG GID4 fragment in complex with a peptide 提交 2018-02-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 124–289（166 aa） 片段：residues 124-289
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350, 0.2M sodium bromide
分辨率 1.60 Å R-free 0.248
6WZX GID4 in complex with IGLWKS peptide 提交 2020-05-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；20% (w/v) PEG 3350 and 8% (v/v) Tacsimate pH 7.0
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6WZX GID4 in complex with IGLWKS peptide 提交 2020-05-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 124–289（166 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；20% (w/v) PEG 3350 and 8% (v/v) Tacsimate pH 7.0
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6WZZ GID4 in complex with VGLWKS peptide 提交 2020-05-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.03 M Citric acid, pH 7.6 and 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.220
7NSC Substrate receptor scaffolding module of human CTLH E3 ubiquitin ligase 提交 2021-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–300（300 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Q4Y human Gid4 bound to a Gly/N-peptide 提交 2021-11-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 100–300（201 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；18% PEG 3350, 0.2 M ammonium nitrate, 0.1 M Bis-Tris pH 7
分辨率 3.08 Å R-free 0.265
7Q4Y human Gid4 bound to a Gly/N-peptide 提交 2021-11-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 100–300（201 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；18% PEG 3350, 0.2 M ammonium nitrate, 0.1 M Bis-Tris pH 7
分辨率 3.08 Å R-free 0.265
7Q50 human Gid4 bound to a Phe/N-peptide 提交 2021-11-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 121–290（170 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.1 M Sodium malonate, 0.3% Jeffamine ED-2001 pH 7, 0.1 M HEPES pH 7
分辨率 3.16 Å R-free 0.293
7SLZ CRYSTAL STRUCTURE OF GID4 IN COMPLEX WITH BPF023596 提交 2021-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 9QU N-[(1s,4s)-4-(1H-benzimidazol-2-yl)cyclohexyl]-N~2~-[(1H-indol-2-yl)methyl]glycinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；35% PEG 3350, 0.2M CaAC
分辨率 1.97 Å R-free 0.246
7U3E GID4 in complex with compound 1 提交 2022-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 L4O tert-butyl (1S,4S)-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；17% PEG3350, 0.1 M Bis-tris, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 1.85 Å R-free 0.234
7U3E GID4 in complex with compound 1 提交 2022-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 124–289（166 aa）
未记录 L4O tert-butyl (1S,4S)-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptane-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；17% PEG3350, 0.1 M Bis-tris, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 1.85 Å R-free 0.234
7U3F GID4 in complex with compound 4 提交 2022-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 L5L (4R)-4-(4-methoxyphenyl)-4,5,6,7-tetrahydrothieno[3,2-c]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；15% PEG5000 MME, 0.1 M Bis-tris
分辨率 2.30 Å R-free 0.262
7U3G GID4 in complex with compound 67 提交 2022-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 L6F (1R)-1-phenyl-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-5-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-tris, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 2.24 Å R-free 0.240
7U3H GID4 in complex with compound 7 提交 2022-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 L6O (5R)-N-(4-fluorophenyl)-5-methyl-4,5-dihydro-1,3-thiazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；14% PEG3350, 0.1 M Bis-tris, 0.2 M ammonium formate
分辨率 1.80 Å R-free 0.224
7U3I GID4 in complex with compound 16 提交 2022-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 L5X 3-{[(5S)-5-methyl-4,5-dihydro-1,3-thiazol-2-yl]amino}phenol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；16% PEG3350, 0.1 M Bis-tris, 0.2 M ammonium formate
分辨率 1.99 Å R-free 0.230
7U3I GID4 in complex with compound 16 提交 2022-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 124–289（166 aa）
未记录 L5X 3-{[(5S)-5-methyl-4,5-dihydro-1,3-thiazol-2-yl]amino}phenol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；16% PEG3350, 0.1 M Bis-tris, 0.2 M ammonium formate
分辨率 1.99 Å R-free 0.230
7U3J GID4 in complex with compound 88 提交 2022-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 L6U (2S)-2-{[(2S)-2-({N-[(2,4-dimethoxyphenyl)methyl]glycyl}amino)-2-(thiophen-2-yl)acetyl]amino}-N-methyl-4-phenylbutanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；18% PEG6000, 0.1 M HEPES
分辨率 1.64 Å R-free 0.202
7U3K GID4 in complex with compound 89 提交 2022-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 L73 N-butylglycyl-4-tert-butyl-D-phenylalanyl-3-methoxy-N-methyl-L-phenylalaninamide × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；20% PEG6000, 0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.313
7U3L GID4 in complex with compound 91 提交 2022-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 L4X Nalpha-{(2R,4E)-2-[(N-benzylglycyl)amino]-5-phenylpent-4-enoyl}-N,4-dimethyl-L-phenylalaninamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 0.2 M sodium fluoride
分辨率 2.29 Å R-free 0.249
8V1P CRYSTAL STRUCTURE OF GID4 IN COMPLEX WITH UBF9092 提交 2023-11-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa） 片段：Residues 124-289
未记录 98C N,N~2~-bis[(4-methoxyphenyl)methyl]glycinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Tris-HCl 8.5, 30% PEG3350, 0.2 M MgCl2
分辨率 2.21 Å R-free 0.278
8X7H Crystal structure of the ternary complex of GID4-PROTAC(NEP162)-BRD4(BD1). 提交 2023-11-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 YBI ~{N}-[4-[6-[3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoyl]piperazin-1-yl]propoxy]-1~{H}-benzimidazol-2-yl]cyclohexyl]-2-(1~{H}-indol-2-ylmethylamino)ethanamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 10% (w/v) polyethylene glycol 10000
分辨率 2.90 Å R-free 0.301
8X7H Crystal structure of the ternary complex of GID4-PROTAC(NEP162)-BRD4(BD1). 提交 2023-11-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 124–289（166 aa）
未记录 YBI ~{N}-[4-[6-[3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoyl]piperazin-1-yl]propoxy]-1~{H}-benzimidazol-2-yl]cyclohexyl]-2-(1~{H}-indol-2-ylmethylamino)ethanamide × 1 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 10% (w/v) polyethylene glycol 10000
分辨率 2.90 Å R-free 0.301
8X7H Crystal structure of the ternary complex of GID4-PROTAC(NEP162)-BRD4(BD1). 提交 2023-11-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 124–289（166 aa）
未记录 YBI ~{N}-[4-[6-[3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoyl]piperazin-1-yl]propoxy]-1~{H}-benzimidazol-2-yl]cyclohexyl]-2-(1~{H}-indol-2-ylmethylamino)ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 10% (w/v) polyethylene glycol 10000
分辨率 2.90 Å R-free 0.301
8X7H Crystal structure of the ternary complex of GID4-PROTAC(NEP162)-BRD4(BD1). 提交 2023-11-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 124–289（166 aa）
未记录 YBI ~{N}-[4-[6-[3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoyl]piperazin-1-yl]propoxy]-1~{H}-benzimidazol-2-yl]cyclohexyl]-2-(1~{H}-indol-2-ylmethylamino)ethanamide × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 10% (w/v) polyethylene glycol 10000
分辨率 2.90 Å R-free 0.301
9OK4 GID4 in complex with CLEO4-88 and ACAA1 提交 2025-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 124–289（166 aa）
链 D 124–289（166 aa）
未记录 L6U (2S)-2-{[(2S)-2-({N-[(2,4-dimethoxyphenyl)methyl]glycyl}amino)-2-(thiophen-2-yl)acetyl]amino}-N-methyl-4-phenylbutanamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG3350, 0.1 M Tris pH 7.5 and 0.2 M NaF
分辨率 2.28 Å R-free 0.230
9QDX GID4 in complex with Compound 1 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 A1I6C ~{N}'-phenylpiperidine-1-carboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.26 Å R-free 0.296
9QDY GID4 in complex with Compound 9 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 A1I6B ~{N}-[3-fluoranyl-5-(5-methylfuran-2-yl)phenyl]-4-methyl-piperidine-1-carboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Na HEPES pH 7.0, 15% PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.254
9QDZ GID4 in complex with Compound 14 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 A1I6F ~{N}-[3-fluoranyl-5-(5-methyl-4-piperidin-1-ylcarbonyl-furan-2-yl)phenyl]-4,4-dimethyl-piperidine-1-carboximidamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292.15 K；0.1 M Na HEPES 7.5, 7.5% 2-propanol, 20% PEG 4000
分辨率 1.80 Å R-free 0.244
9QZG GID4 in complex with Compound 18 提交 2025-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 A1JCC ~{N}-[3-fluoranyl-5-[4-(4-methoxypiperidin-1-yl)carbonyl-5-methyl-furan-2-yl]phenyl]-4,4-dimethyl-piperidine-1-carboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Na HEPES pH 7.0,0.1 M lithium sulfate, 22.5% PEG 4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.336
9QZH GID4 in complex with Compound 33 提交 2025-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292.15 K；0.1 M Na HEPES pH 7.0,0.1 M lithium sulfate, 20% PEG 4000
分辨率 2.19 Å R-free 0.220
9QZH GID4 in complex with Compound 33 提交 2025-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 124–289（166 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292.15 K；0.1 M Na HEPES pH 7.0,0.1 M lithium sulfate, 20% PEG 4000
分辨率 2.19 Å R-free 0.220
9QZH GID4 in complex with Compound 33 提交 2025-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 124–289（166 aa）
未记录 A1JCD ~{N}-[3-fluoranyl-5-[4-[4-(methoxymethyl)piperidin-1-yl]carbonyl-5-methyl-furan-2-yl]phenyl]-4,4-dimethyl-piperidine-1-carboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292.15 K；0.1 M Na HEPES pH 7.0,0.1 M lithium sulfate, 20% PEG 4000
分辨率 2.19 Å R-free 0.220
9QZH GID4 in complex with Compound 33 提交 2025-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 124–289（166 aa）
未记录 A1JCD ~{N}-[3-fluoranyl-5-[4-[4-(methoxymethyl)piperidin-1-yl]carbonyl-5-methyl-furan-2-yl]phenyl]-4,4-dimethyl-piperidine-1-carboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292.15 K；0.1 M Na HEPES pH 7.0,0.1 M lithium sulfate, 20% PEG 4000
分辨率 2.19 Å R-free 0.220
9QZI GID4 in complex with Compound 21 提交 2025-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 124–289（166 aa）
未记录 A1JCE ~{N}-[3-fluoranyl-5-[4-[(3~{S})-3-[2-(2-methoxyethoxy)ethyl]piperidin-1-yl]carbonyl-5-methyl-furan-2-yl]phenyl]-4,4-dimethyl-piperidine-1-carboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Na HEPES pH 7.5,0.1 M lithium sulfate, 22.5% PEG 4000
分辨率 2.00 Å R-free 0.253

共 30 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 GID4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–167； UniProt 124–289

Bromodomain-containing protein 4

Homo sapiens

UniProt O60885

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 44–168 未记录 Glucose-induced degradation protein 4 homolog × 1 （Q8IVV7） YAX 2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]-~{N}-[2-[2-[[2-[4-[2-(1~{H}-indol-2-ylmethylamino)ethanoylamino]cyclohexyl]-3~{H}-benzimidazol-5-yl]oxy]ethoxy]ethyl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% (v/v) polyethylene glycol 300, 30% (v/v) galactose 分辨率 2.70 Å R-free 0.266

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8X7G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2I8N Solution structure of the second bromodomain of Brd4 提交 2006-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：C-terminal bromodomain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；293 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM Na2HPO4, 50mM NaCl；压力 1
NMR样品组成 1.0mM 15N, 13C-labeled BRD4 C-terminal domain, 20mM phosphate buffer(pH6.0), 50mM NaCl, 5mM EDTA, 10%(v/v)D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LSP solution structures of BRD4 second bromodomain with NF-kB-K310ac peptide 提交 2012-05-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–460（128 aa） 片段：second bromodomain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 100 mM sodium phosphate, 5 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 100 mM sodium phosphate, 5 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MJV Solution structures of second bromodomain of Brd4 with di-acetylated Twist peptide 提交 2014-01-16 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–460（128 aa） 片段：bromodomain 2 (UNP residues 333-460)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 5 mM [U-100% 2H] DTT, 100 mM sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 5 mM [U-100% 2H] DTT, 100 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2N3K Human Brd4 ET domain in complex with MLV Integrase C-term 提交 2015-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–678（79 aa） 片段：Brd4 ET domain (UNP residues 600-678)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.25；压力 ambient
NMR样品组成 0.4-0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Brd4 ET, 0.4-0.8 mM MLV IN EBM, 20 mM [U-2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 0.002 v/v sodium azide, 0.5 mM DSS, 2 mM [U-2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.4-0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Brd4 ET, 0.4-0.8 mM MLV IN EBM, 20 mM [U-2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 0.002 v/v sodium azide, 0.5 mM DSS, 2 mM [U-2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.4-0.8 mM [U-99% 15N] Brd4 ET, 0.4-0.8 mM MLV IN EBM, 20 mM [U-2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 0.002 v/v sodium azide, 0.5 mM DSS, 2 mM [U-2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.4-0.8 mM [U-99% 15N] Brd4 ET, 20 mM [U-2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 0.002 v/v sodium azide, 0.5 mM DSS, 2 mM [U-2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM MLV IN EBM, 0.5 mM DSS, 0.002 v/v sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2NCZ Solution NMR structures of BRD4 ET domain in complex with NSD3_1 peptide 提交 2016-04-18 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 601–683（83 aa） 片段：residues 601-683
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2ND0 Solution NMR structures of BRD4 ET domain with LANA peptide 提交 2016-04-18 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 601–683（83 aa） 片段：residues 601-683
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2ND1 Solution NMR structures of BRD4 ET domain in complex with NSD3_3 peptide 提交 2016-04-19 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 601–683（83 aa） 片段：residues 601-683
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2NNU Crystal Structure of the Papillomavirus DNA Tethering Complex E2:Brd4 提交 2006-10-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1343–1362（20 aa） 片段：C-terminal residues (1343-1362)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；100mM citrate, 1.8-2.0M Na-acetate, 10mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.59 Å R-free 0.233
2NNU Crystal Structure of the Papillomavirus DNA Tethering Complex E2:Brd4 提交 2006-10-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1343–1362（20 aa） 片段：C-terminal residues (1343-1362)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；100mM citrate, 1.8-2.0M Na-acetate, 10mM DTT, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.59 Å R-free 0.233
2OSS Crystal structure of the Bromo domain 1 in human Bromodomain Containing Protein 4 (BRD4) 提交 2007-02-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo domain 1
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M NaNO3, 20% PEG3350, 10% Ethylene glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.35 Å R-free 0.174
2OUO Crystal Structure of the Bromo domain 2 in human Bromodomain Containing Protein 4 (BRD4) 提交 2007-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 333–460（128 aa） 片段：Bromo domain 2
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1M MIB, 30% PEG 1000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.89 Å R-free 0.216
2YEL Crystal Structure of the First Bromodomain of Human Brd4 with the inhibitor GW841819X 提交 2011-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 WSH BENZYL [(4R)-1-METHYL-6-PHENYL-4H-[1,2,4]TRIAZOLO[4,3-A][1,4]BENZODIAZEPIN-4-YL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；17.5% PEG 3350, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M BIS TRIS PH 5.5.
分辨率 1.65 Å R-free 0.211
2YEM Crystal Structure of the Second Bromodomain of Human Brd4 with the inhibitor GW841819X 提交 2011-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 333–460（128 aa） 片段：C-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 333-460
未记录 WSH BENZYL [(4R)-1-METHYL-6-PHENYL-4H-[1,2,4]TRIAZOLO[4,3-A][1,4]BENZODIAZEPIN-4-YL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；2.5 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS PH 8.5.
分辨率 2.30 Å R-free 0.229
2YEM Crystal Structure of the Second Bromodomain of Human Brd4 with the inhibitor GW841819X 提交 2011-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 333–460（128 aa） 片段：C-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 333-460
未记录 WSH BENZYL [(4R)-1-METHYL-6-PHENYL-4H-[1,2,4]TRIAZOLO[4,3-A][1,4]BENZODIAZEPIN-4-YL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；2.5 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS PH 8.5.
分辨率 2.30 Å R-free 0.229
3MXF Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor JQ1 提交 2010-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 JQ1 (6S)-6-(2-tert-butoxy-2-oxoethyl)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6,7-dihydrothieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-10-ium × 1 IOD IODIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M NaI 0.1M BTProp pH 8.5 20% PEG3350 10% EtGhly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.60 Å R-free 0.184
3P5O Crystal Structure of the First Bromodomain of Human Brd4 in complex with IBET inhibitor 提交 2010-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：BROMO DOMAIN 1, UNP residues 44-168
未记录 EAM 2-[(4S)-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepin-4-yl]-N-ethylacetamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1M NaNO3, 20% PEG 3350, 10% ethylene glycol, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.60 Å R-free 0.185
3SVF Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a dihydro-quinazolin ligand 提交 2011-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 WDR (4S)-6-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-4-(2-hydroxyethoxy)-3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M Na(OAc), 0.1M BTProp, 20% PEG3350, 10% EtGly, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.98 Å R-free 0.227
3SVG Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a 3,5-dimethylisoxazol ligand 提交 2011-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ODR (1R)-1-[3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-ethoxyphenyl]ethanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M Na2SO4, 0.1M BTProp, 20% PEG 3350, 10% EtGly, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.68 Å R-free 0.215
3U5J Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with Alprazolam 提交 2011-10-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 08H 8-chloro-1-methyl-6-phenyl-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2M Na2SO4, 0.1M BTProp pH 6.5, 20% PEG3350, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.60 Å R-free 0.177
3U5K Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with Midazolam 提交 2011-10-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 08J 8-chloro-6-(2-fluorophenyl)-1-methyl-4H-imidazo[1,5-a][1,4]benzodiazepine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M MES pH 5.5, 0.1M MgCl, 15% PEG 6000, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.260
3U5K Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with Midazolam 提交 2011-10-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 42–168（127 aa）
未记录 08J 8-chloro-6-(2-fluorophenyl)-1-methyl-4H-imidazo[1,5-a][1,4]benzodiazepine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M MES pH 5.5, 0.1M MgCl, 15% PEG 6000, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.260
3U5K Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with Midazolam 提交 2011-10-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 42–168（127 aa）
未记录 08J 8-chloro-6-(2-fluorophenyl)-1-methyl-4H-imidazo[1,5-a][1,4]benzodiazepine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M MES pH 5.5, 0.1M MgCl, 15% PEG 6000, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.260
3U5K Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with Midazolam 提交 2011-10-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 42–168（127 aa）
未记录 08J 8-chloro-6-(2-fluorophenyl)-1-methyl-4H-imidazo[1,5-a][1,4]benzodiazepine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1M MES pH 5.5, 0.1M MgCl, 15% PEG 6000, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.260
3U5L Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a benzo-triazepine ligand (BzT-7) 提交 2011-10-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 08K 8-chloro-1,4-dimethyl-6-phenyl-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,3,4]benzotriazepine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.20M Na(malonate), 0.1M BTProp pH 7.5, 20.0% PEG 3350, 10.0% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.39 Å R-free 0.142
3UVW Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K5acK8ac) 提交 2011-11-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：unp residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；278 K；0.1M Tris, 20% MPD, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K, pH 8.0
分辨率 1.37 Å R-free 0.171
3UVX Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K12acK16ac) 提交 2011-11-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：unp residues 44-168
未记录 NA SODIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 FMT FORMIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；278 K；0.35M NaFortmate 20% PEG 3350 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
分辨率 1.91 Å R-free 0.219
3UVY Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K16acK20ac) 提交 2011-11-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；278 K；0.2M NaI, 0.1M BTProp, 20% PEG 3350, 10% EtGly, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
分辨率 2.02 Å R-free 0.258
3UW9 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K8acK12ac) 提交 2011-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：unp resideus 44-168
链 C 42–168（127 aa） 片段：unp resideus 44-168
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1M Tris, 0.3M LiCl 15% PEG6000, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K, pH 8.0
分辨率 2.30 Å R-free 0.257
3UW9 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K8acK12ac) 提交 2011-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 42–168（127 aa） 片段：unp resideus 44-168
链 D 42–168（127 aa） 片段：unp resideus 44-168
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1M Tris, 0.3M LiCl 15% PEG6000, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K, pH 8.0
分辨率 2.30 Å R-free 0.257
3ZYU Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with I-BET151(GSK1210151A) 提交 2011-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN (BD1), RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 1GH 7-(3,5-DIMETHYL-1,2-OXAZOL-4-YL)-8-METHOXY-1-[(1R)-1-(PYRIDIN-2-YL)ETHYL]-1H,2H,3H-IMIDAZO[4,5-C]QUINOLIN-2-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.50 Å R-free 0.201
3ZYU Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with I-BET151(GSK1210151A) 提交 2011-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN (BD1), RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 1GH 7-(3,5-DIMETHYL-1,2-OXAZOL-4-YL)-8-METHOXY-1-[(1R)-1-(PYRIDIN-2-YL)ETHYL]-1H,2H,3H-IMIDAZO[4,5-C]QUINOLIN-2-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.50 Å R-free 0.201
4A9L N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 1,3-DIMETHYL-6-(MORPHOLINE- 4-SULFONYL)-1,2,3,4-TETRAHYDROQUINAZOLIN-2-ONE 提交 2011-11-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 P9L 1,3-dimethyl-6-(morpholin-4-ylsulfonyl)-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 NO3 NITRATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；20-30% PEG 3350, 0.2 M NACL, 0.1 HEPES PH 8.5, 10% ETHYLGLYCOL.
分辨率 1.60 Å R-free 0.206
4BJX N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH GSK1324726A (I-BET726) 提交 2013-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 73B 4-[(2S,4R)-1-acetyl-4-[(4-chlorophenyl)amino]-2-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinolin-6-yl]benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；293 K；20% PEG3350, 0.2M NAK,TARTRATE, 0.1M BISTRISPROPANE PH 6.5, 20C
分辨率 1.59 Å R-free 0.185
4BW1 The first bromodomain of human BRD4 in complex with 3,5 dimethylisoxaxole ligand 提交 2013-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 42-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 S5B 4-[(2-tert-butylphenyl)amino]-7-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)quinoline-3-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；25% PEG1500, 0.1M SPG BUFFER PH6.0
分辨率 1.40 Å R-free 0.208
4BW2 The first bromodomain of human BRD4 in complex with 3,5 dimethylisoxaxole ligand 提交 2013-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 42-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 UTH 4-((2-(TERT-BUTYL)PHENYL)AMINO)-7-(3,5-dimethylisoxazol-4-yl)-1,8-naphthyridine-3-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1M MES PH8.6, 20% PEG6000, 0.2M MGCL2, pH 6.0
分辨率 1.92 Å R-free 0.222
4BW3 The first bromodomain of human BRD4 in complex with 3,5 dimethylisoxaxole ligand 提交 2013-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 9BM 4-((2-(tert-butyl)phenyl)amino)-7-(3,5-dimethylisoxazol-4-yl)-6-methoxy-1,5-naphthyridine-3-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；20% PEG3350, 0.2M NANO3, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH8.5
分辨率 1.50 Å R-free 0.231
4BW4 The first bromodomain of human BRD4 in complex with 3,5 dimethylisoxaxole ligand 提交 2013-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 9B6 7-(3,5-dimethylisoxazol-4-yl)-8-methoxy-1-(2-(trifluoromethoxy)phenyl)-1h-imidazo[4,5-c][1,5]naphthyridin-2(3h)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；0.1M TRIS PH8.0, 25% PE6000, 0.2M MGCL2
分辨率 1.67 Å R-free 0.220
4C66 Discovery of Epigenetic Regulator I-BET762: Lead Optimization to Afford a Clinical Candidate Inhibitor of the BET Bromodomains 提交 2013-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-167
未记录 H4C 4-(2-chlorophenyl)-2-ethyl-9-methyl-6,8-dihydrothieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-10-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 1M LICL, 0.1M NAAC (UNBUFFERED), 30% PEG6000
分辨率 1.87 Å R-free 0.266
4C67 Discovery of Epigenetic Regulator I-BET762: Lead Optimization to Afford a Clinical Candidate Inhibitor of the BET Bromodomains 提交 2013-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 L5S 13-methyl-7-phenyl-3-thia-1,8,11,12-tetraazatricyclo trideca-2(6),4,7,10,12-pentaene × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.2M CACL2, 0.1M MES PH6.5, 20% PEG6000
分辨率 1.55 Å R-free 0.186
4CL9 N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH I-BET295 提交 2014-01-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 IES propan-2-yl N-[(2S,4R)-1-ethanoyl-2-methyl-6-[4-[[8-(oxidanylamino)-8-oxidanylidene-octanoyl]amino]phenyl]-3,4-dihydro-2H-quinolin-4-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 25% PEG6000, 0.1M TRISHCL PH 8.0, 0.2M LICL
分辨率 1.40 Å R-free 0.199
4CLB N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH IBET-295 提交 2014-01-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 83T propan-2-yl N-[(2S,4R)-1-ethanoyl-2-methyl-6-[4-(methylaminomethyl)phenyl]-3,4-dihydro-2H-quinolin-4-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M BTP PH 8.5, 20% PEG3350, 0.2M NAF
分辨率 1.60 Å R-free 0.205
4DON Brd4 Bromodomain 1 complex with a fragment 3,4-Dihydro-3-methyl-2(1H)-quinazolinon 提交 2012-02-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa） 片段：Bromo 1 domain, UNP residues 44-166
未记录 3PF 3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Naformate, 10% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.52 Å R-free 0.218
4E96 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor PFi-1 提交 2012-03-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 0NS 2-methoxy-N-(3-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinazolin-6-yl)benzenesulfonamide × 1 NA SODIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M Na(malonate) 0.1M BTProp pH 8.5 20% PEG3350 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.92 Å R-free 0.285
4F3I Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with MS417 inhibitor 提交 2012-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 44-168)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 0S6 methyl [(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]acetate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；25% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.183
4GPJ Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a isoxazolylbenzimidazole ligand 提交 2012-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 0Q1 (1R)-6-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-phenyl-2,3-dihydro-1H-inden-1-ol × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.20M Na2SO4, 0.1M BTProp, 20.0% PEG 3350, 10.0% EtGly, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.60 Å R-free 0.204
4HBV Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a quinazolin ligand 提交 2012-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 15E 6-bromo-3-methyl-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2M NaNO3, 0.1M BTProp pH 6.5, 20% PEG3350, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.63 Å R-free 0.241
4HBW Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a quinazoline ligand 提交 2012-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 14Z N-ethyl-3-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinazoline-6-sulfonamide × 1 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.20M K3(cit), 0.1M BTProp pH 8.5, 20.0% PEG 3350, 10.0% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.69 Å R-free 0.228
4HBX Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a quinazolin ligand 提交 2012-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 14X 3-methyl-6-(pyrrolidin-1-ylsulfonyl)-3,4-dihydroquinazolin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 0.1M BTProp pH 7.5, 20% PEG3350, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.62 Å R-free 0.210
4HBY Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a quinazolin ligand 提交 2012-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 13F 3-methyl-2-oxo-N-phenyl-1,2,3,4-tetrahydroquinazoline-6-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M KSCN, 20% PEG3350, 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.59 Å R-free 0.239
4HXK Brd4 Bromodomain 1 complex with 6,7-DIHYDROTHIENO[3,2-C]PYRIDIN-5(4H)-YL(1H-IMIDAZOL-1-YL)METHANONE inhibitor 提交 2012-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 1AJ 6,7-dihydrothieno[3,2-c]pyridin-5(4H)-yl(1H-imidazol-1-yl)methanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Na formate, 10% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.61 Å R-free 0.203
4HXL Brd4 Bromodomain 1 complex with 3-CYCLOHEXYL-N-{3-(2-OXO-2,3-DIHYDRO-1,3-THIAZOL-4-YL)-5-[(THIOPHEN-2-YLSULFONYL)AMINO]PHENYL}PROPANAMIDE inhibitor 提交 2012-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 1A9 3-cyclohexyl-N-{3-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-thiazol-4-yl)-5-[(thiophen-2-ylsulfonyl)amino]phenyl}propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Na formate, 10% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.52 Å R-free 0.191
4HXM Brd4 Bromodomain 1 complex with N-{3-(2-OXO-2,3-DIHYDRO-1,3-THIAZOL-4-YL)-5-[(THIOPHEN-2-YLSULFONYL)AMINO]PHENYL}BUTANAMIDE inhibitor 提交 2012-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa）
未记录 1A8 N-{3-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-thiazol-4-yl)-5-[(thiophen-2-ylsulfonyl)amino]phenyl}butanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Na formate, 10% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.215
4HXN Brd4 Bromodomain 1 complex with 4-(2-FLUOROPHENYL)-1,3-THIAZOL-2(3H)-ONE inhibitor 提交 2012-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 1A7 4-(2-fluorophenyl)-1,3-thiazol-2(3H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Na formate, 10% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.49 Å R-free 0.213
4HXO Brd4 Bromodomain 1 complex with 3-{[(3-METHYL-1,2-OXAZOL-5-YL)METHYL]SULFANYL}[1,2,4]TRIAZOLO[4,3-A]PYRIDINE inhibitor 提交 2012-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 1A6 3-{[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)methyl]sulfanyl}[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Na formate, 10% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.76 Å R-free 0.229
4HXP Brd4 Bromodomain 1 complex with 4-(2-OXO-1,3-OXAZOLIDIN-3-YL)BENZAMIDE inhibitor 提交 2012-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa）
未记录 1A5 4-(2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Na formate, 10% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.73 Å R-free 0.193
4HXR Brd4 Bromodomain 1 complex with N-[3-(2-OXO-2,3-DIHYDRO-1,3-THIAZOL-4-YL)PHENYL]THIOPHENE-2-SULFONAMIDE inhibitor 提交 2012-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 1A4 N-[3-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-thiazol-4-yl)phenyl]thiophene-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Na formate, 10% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.53 Å R-free 0.199
4HXS Brd4 Bromodomain 1 complex with N-[3-(2-OXO-2,3-DIHYDRO-1,3-THIAZOL-4-YL)PHENYL]-1-PHENYLMETHANESULFONAMIDE inhibitor 提交 2012-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa）
未记录 1A3 N-[3-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-thiazol-4-yl)phenyl]-1-phenylmethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Na formate, 10% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.43 Å R-free 0.204
4IOO Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with N-methyltrimethylacetamide 提交 2013-01-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：first bromodomain (unp residues 44-168)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 BAE N-methyltrimethylacetamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；16% PEG 3350, 20% ethylene glycol, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 1.25 Å R-free 0.167
4IOQ Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with pyrrolidin-2-one 提交 2013-01-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：unp residues 44-168
未记录 BAQ pyrrolidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；16% PEG 3350, 20% ethylene glycol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 1.50 Å R-free 0.194
4IOR Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with DMSO 提交 2013-01-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：first bromodomain (unp residues 44-168)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；16% PEG 3350, 20% ethylene glycol, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 1.40 Å R-free 0.191
4J0R Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a 3,5-dimethylisoxazol ligand 提交 2013-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：unp residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 1H2 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]phenol × 1 IOD IODIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M NaI, 20% PEG3350, 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.72 Å R-free 0.220
4J0S Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a 3,5-dimethylisoxazol ligand 提交 2013-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：unp residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 1H3 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-[(S)-hydroxy(phenyl)methyl]phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M Na/KPO4, 20% PEG 3350, 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.84 Å R-free 0.226
4J3I X-ray crystal structure of bromodomain complex to 1.24 A resolution 提交 2013-02-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 1K0 2-[4-(2-hydroxyethoxy)-3,5-dimethylphenyl]-5,7-dimethoxyquinazolin-4(3H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；25% (W/V) PEG 3350, 0.1 M BIS-TRIS, 0.2 M LITHIUM SULFATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.24 Å R-free 0.145
4KV1 Crystal Structure of Brd4 Bromodomain 1 in Complex with Acetylated Rel Peptide 提交 2013-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 41–168（128 aa） 片段：UNP residues 41-168
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；273 K；20% PEG 3350, 0.2 M NaNO3, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K
分辨率 1.50 Å R-free 0.222
4KV1 Crystal Structure of Brd4 Bromodomain 1 in Complex with Acetylated Rel Peptide 提交 2013-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 41–168（128 aa） 片段：UNP residues 41-168
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；273 K；20% PEG 3350, 0.2 M NaNO3, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K
分辨率 1.50 Å R-free 0.222
4KV4 Brd4 Bromodomain 2 in Complex with Acetylated Rel Peptide 提交 2013-05-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 351–459（109 aa） 片段：UNP residues 351-459
未记录 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；2.5 M (NH4)2SO4, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 2.00 Å R-free 0.258
4LR6 Structure of BRD4 bromodomain 1 with a 3-methyl-4-phenylisoxazol-5-amine fragment 提交 2013-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 42-168)
未记录 FMT FORMIC ACID × 2 1XA 3-methyl-4-phenyl-1,2-oxazol-5-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；3.682 M Formate, 10% Glycerol, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 278K
分辨率 1.29 Å R-free 0.242
4LRG Structure of BRD4 bromodomain 1 with a dimethyl thiophene isoxazole azepine carboxamide 提交 2013-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 42-168)
未记录 1XB 2-[(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-[1,2]oxazolo[5,4-c]thieno[2,3-e]azepin-6-yl]acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；278 K；0.1M Bis-Tris pH 7.0, 150mM NaCl, 25% PEG3350. Cryo used: 23% Glycerol in well solution, temperature 278K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.21 Å R-free 0.288
4LYI Crystal Structure of apo-BRD4(1) 提交 2013-07-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：first bromodomain domain (UNP residues 44-168)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 IOD IODIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 21H oxydimethanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.3；293 K；bis tris propane, PEG 3350, NaI, ethylene glycol, pH 8.3, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 1.30 Å R-free 0.198
4LYS Crystal Structure of BRD4(1) bound to Colchiceine 提交 2013-07-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：FIRST BROMODOMAIN DOMAIN (UNP RESIDUES 44-168)
未记录 NA SODIUM ION × 2 2SJ N-[(7S)-10-hydroxy-1,2,3-trimethoxy-9-oxo-5,6,7,9-tetrahydrobenzo[a]heptalen-7-yl]acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；bis tris, PEG 3350, NaCl, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 1.83 Å R-free 0.267
4LYW Crystal Structure of BRD4(1) bound to inhibitor XD14 提交 2013-07-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：FIRST BROMODOMAIN DOMAIN (UNP RESIDUES 44-168)
未记录 21Q 4-acetyl-N-[5-(diethylsulfamoyl)-2-hydroxyphenyl]-3-ethyl-5-methyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；NaFormate, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.235
4LZR Crystal Structure of BRD4(1) bound to Colchicine 提交 2013-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：FIRST BROMODOMAIN DOMAIN (UNP RESIDUES 44-168)
未记录 LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；293 K；1.4 M Na-K-phosphate, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.85 Å R-free 0.243
4LZS Crystal Structure of BRD4(1) bound to inhibitor XD46 提交 2013-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：FIRST BROMODOMAIN DOMAIN (UNP RESIDUES 44-168)
未记录 L46 4-acetyl-3-ethyl-N,5-dimethyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；NaCitrate, PEG 3,350, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
4MEN Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a 5-methyl-triazolopyrimidine ligand 提交 2013-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：unp residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 25K N,5-dimethyl-N-(4-methylbenzyl)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.20M Na(malonate), 0.1M BTProp, 20.0% PEG 3350 10.0% EtGly, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.81 Å R-free 0.219
4MEO Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a 2-methyl-quinoline ligand 提交 2013-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：unp residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 25V N-[3-(2-methyl-1-oxidoquinolin-4-yl)phenyl]acetamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.20M LiCl, 0.1M TRIS, 20.0% PEG 6K, 10.0% EtGly, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.72 Å R-free 0.213
4MEP Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a 3-chloro-pyridone ligand 提交 2013-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：unp residues 44-168
未记录 24Y 3-chloro-5-[1-(3-methylpyridin-2-yl)-3-phenyl-1H-1,2,4-triazol-5-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.20M NaBr, 0.1M BTProp, 20.0% PEG 3350, 10.0% EtGly, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.85 Å R-free 0.235
4MEQ Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a 5-methyl-triazolopyrimidine ligand 提交 2013-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：unp residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 25O 5-methyl-7-phenyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.20M Na2SO4, 20.0% PEG 3350, 10.0% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.77 Å R-free 0.223
4MR3 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a quinazolinone ligand (RVX-OH) 提交 2013-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：unp residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 1K0 2-[4-(2-hydroxyethoxy)-3,5-dimethylphenyl]-5,7-dimethoxyquinazolin-4(3H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M NaBr, 0.1M BTProp, 20.0% PEG3350, 10% EtGly, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.68 Å R-free 0.185
4MR4 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a quinazolinone ligand (RVX-208) 提交 2013-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：unp residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 1K0 2-[4-(2-hydroxyethoxy)-3,5-dimethylphenyl]-5,7-dimethoxyquinazolin-4(3H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M Na2SO4, 20% PEG3350 10% EtGly, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.66 Å R-free 0.194
4NQM Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a triazolo-phthalazine ligand 提交 2013-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 Y1Z 2-chloro-N-[5-(3-methyl[1,2,4]triazolo[3,4-a]phthalazin-6-yl)-2-(morpholin-4-yl)phenyl]benzenesulfonamide × 1 SIN SUCCINIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1M SPG pH 8.0, 60.0% MPD, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.58 Å R-free 0.203
4NR8 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with an isoxazolyl-benzimidazole ligand 提交 2013-11-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 K POTASSIUM ION × 1 2LL 5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazole × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M NaI, 0.1M BTProp pH 8.5, 20.0% PEG 3350, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.64 Å R-free 0.246
4NUC Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with MS435 inhibitor 提交 2013-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain, residues 44-168
未记录 435 4-[(E)-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)diazenyl]-N-(pyridin-2-yl)benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；30% PEG 4000, 0.1 M Tris HCl pH 8.5, 0.2 M Magnesium Chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.40 Å R-free 0.186
4NUD Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with MS436 inhibitor 提交 2013-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain, residues 44-168
未记录 NUD 4-[(E)-(2-amino-4-hydroxy-5-methylphenyl)diazenyl]-N-(pyridin-2-yl)benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；30% PEG 4000, 0.1 M Tris HCl pH 8.5, 0.2 M Magnesium Chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.20 Å R-free 0.171
4NUE Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with MS267 inhibitor 提交 2013-12-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain, residues 44-168
未记录 NUE 4-[(E)-(2-amino-4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)diazenyl]-N-(pyridin-2-yl)benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；14% PEG 4,000, 0.2MgCl2, 0.1M Tris pH 8.5, 15% ethylene Glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.30 Å R-free 0.188
4O70 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with DINACICLIB 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 1QK 3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM DINACICLIB, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.55 Å R-free 0.234
4O70 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with DINACICLIB 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 1QK 3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM DINACICLIB, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.55 Å R-free 0.234
4O71 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with FLAVOPIRIDOL 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 CPB 2-(2-CHLORO-PHENYL)-5,7-DIHYDROXY-8-(3-HYDROXY-1-METHYL-PIPERIDIN-4-YL)-4H-BENZOPYRAN-4-ONE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM FLAVOPIRIDOL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.36 Å R-free 0.162
4O71 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with FLAVOPIRIDOL 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 CPB 2-(2-CHLORO-PHENYL)-5,7-DIHYDROXY-8-(3-HYDROXY-1-METHYL-PIPERIDIN-4-YL)-4H-BENZOPYRAN-4-ONE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM FLAVOPIRIDOL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.36 Å R-free 0.162
4O72 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with NU7441 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2R4 8-(dibenzo[b,d]thiophen-4-yl)-2-(morpholin-4-yl)-4H-chromen-4-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM NU7441, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.40 Å R-free 0.156
4O74 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with BI 2536 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 R78 4-{[(7R)-8-cyclopentyl-7-ethyl-5-methyl-6-oxo-5,6,7,8-tetrahydropteridin-2-yl]amino}-3-methoxy-N-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM BI2536, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.45 Å R-free 0.178
4O74 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with BI 2536 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 R78 4-{[(7R)-8-cyclopentyl-7-ethyl-5-methyl-6-oxo-5,6,7,8-tetrahydropteridin-2-yl]amino}-3-methoxy-N-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM BI2536, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.45 Å R-free 0.178
4O75 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with FOSTAMATINIB 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2RC [6-({5-fluoro-2-[(3,4,5-trimethoxyphenyl)amino]pyrimidin-4-yl}amino)-2,2-dimethyl-3-oxo-2,3-dihydro-4H-pyrido[3,2-b][1,4]oxazin-4-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM FOSTAMATINIB, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.55 Å R-free 0.199
4O76 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with TG101209 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 1M3 N-tert-butyl-3-[(5-methyl-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM TG101209, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.70 Å R-free 0.171
4O76 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with TG101209 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 1M3 N-tert-butyl-3-[(5-methyl-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM TG101209, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.70 Å R-free 0.171
4O76 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with TG101209 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 1M3 N-tert-butyl-3-[(5-methyl-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM TG101209, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.70 Å R-free 0.171
4O76 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with TG101209 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 1M3 N-tert-butyl-3-[(5-methyl-2-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM TG101209, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.70 Å R-free 0.171
4O77 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SB 202190 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2RE 4-[4-(4-fluorophenyl)-5-(pyridin-4-yl)-1H-imidazol-2-yl]phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM SB 202190, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.207
4O77 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SB 202190 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2RE 4-[4-(4-fluorophenyl)-5-(pyridin-4-yl)-1H-imidazol-2-yl]phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM SB 202190, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.00 Å R-free 0.207
4O78 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with GW612286X 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 SAV N~4~-(3-methyl-1H-indazol-6-yl)-N~2~-(3,4,5-trimethoxyphenyl)pyrimidine-2,4-diamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM GW612286X, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.34 Å R-free 0.144
4O7A Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SB-409514 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2RF 3-[(3-chloro-4-hydroxyphenyl)amino]-4-(3-chlorophenyl)-1H-pyrrole-2,5-dione × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM SB-409514, HANGING DROP, VAPOR-DIFFUSION, TEMPERATURE 291K
分辨率 1.34 Å R-free 0.174
4O7B Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SB-284847-BT 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2RJ 2-(2,3-dimethylphenoxy)-4-[4-(4-fluorophenyl)-1-(piperidin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]pyrimidine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM SB-284847-BT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.50 Å R-free 0.180
4O7C Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SB-614067-R 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2RK 4-[(5Z)-5-(1-nitroso-2,3-dihydro-5H-inden-5-ylidene)-2-(piperidin-4-yl)-3,5-dihydro-4H-imidazol-4-ylidene]-1,4-dihydropyridine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM SB-614067-R, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.55 Å R-free 0.190
4O7E Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SB-610251-B 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2RN 3-[2-phenyl-4-(pyridin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]phenol × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM SB-610251-B, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.85 Å R-free 0.210
4O7E Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SB-610251-B 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2RN 3-[2-phenyl-4-(pyridin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]phenol × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM SB-610251-B, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.85 Å R-free 0.210
4O7F Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SB-251527 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2RQ 4-[4-(4-fluorophenyl)-1-(piperidin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]-2-(2-methoxyphenoxy)pyrimidine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3350, 10% DMSO, 2 MM SB-251527, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.194
4O7F Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SB-251527 提交 2013-12-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2RQ 4-[4-(4-fluorophenyl)-1-(piperidin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]-2-(2-methoxyphenoxy)pyrimidine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3350, 10% DMSO, 2 MM SB-251527, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.194
4OGI Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor BI-2536 提交 2014-01-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 44-168)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 R78 4-{[(7R)-8-cyclopentyl-7-ethyl-5-methyl-6-oxo-5,6,7,8-tetrahydropteridin-2-yl]amino}-3-methoxy-N-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 M potassium citrate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 20.0% PEG3350, 10% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.73 Å R-free 0.214
4OGI Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor BI-2536 提交 2014-01-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 44-168)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 R78 4-{[(7R)-8-cyclopentyl-7-ethyl-5-methyl-6-oxo-5,6,7,8-tetrahydropteridin-2-yl]amino}-3-methoxy-N-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 M potassium citrate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 20.0% PEG3350, 10% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.73 Å R-free 0.214
4OGJ Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor TG-101348 提交 2014-01-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 44-168)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 2TA N-tert-butyl-3-{[5-methyl-2-({4-[2-(pyrrolidin-1-yl)ethoxy]phenyl}amino)pyrimidin-4-yl]amino}benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.20 M sodium potassium tartrate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 7.5, 20.0% PEG3350, 10% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.65 Å R-free 0.182
4OGJ Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor TG-101348 提交 2014-01-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 44-168)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 2TA N-tert-butyl-3-{[5-methyl-2-({4-[2-(pyrrolidin-1-yl)ethoxy]phenyl}amino)pyrimidin-4-yl]amino}benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.20 M sodium potassium tartrate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 7.5, 20.0% PEG3350, 10% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.65 Å R-free 0.182
4PCE Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with compound B13 提交 2014-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 2N0 1-benzyl-2-ethyl-1,5,6,7-tetrahydro-4H-indol-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2M Sodium Nitrate, 20% PEG 3350, 10% ethylene glycol
分辨率 1.29 Å R-free 0.164
4PCI Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with B16 提交 2014-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2NJ (4S)-1-methyl-4-phenyl-1,3,4,5-tetrahydro-2H-1,5-benzodiazepin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.20M Sodium Nitrate, 20% PEG 3350, 10% ethylene glycol
分辨率 1.25 Å R-free 0.169
4PS5 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with TG101348 提交 2014-03-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 2TA N-tert-butyl-3-{[5-methyl-2-({4-[2-(pyrrolidin-1-yl)ethoxy]phenyl}amino)pyrimidin-4-yl]amino}benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM TG101348, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.40 Å R-free 0.180
4PS5 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with TG101348 提交 2014-03-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 2TA N-tert-butyl-3-{[5-methyl-2-({4-[2-(pyrrolidin-1-yl)ethoxy]phenyl}amino)pyrimidin-4-yl]amino}benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM TG101348, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.40 Å R-free 0.180
4QB3 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with Olinone 提交 2014-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
突变：no 30M N-[4-(1-oxo-1,2,3,4-tetrahydro-5H-pyrido[4,3-b]indol-5-yl)butyl]acetamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；293 K；25% tert-Butanol, 0.1 M Tris pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 0.94 Å R-free 0.155
4QR3 Brd4 Bromodomain 1 complex with its novel inhibitors 提交 2014-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa） 片段：UNP residues 44-166
未记录 BNJ N-cyclopentyl-3-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-thiazol-4-yl)benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Naformate, 10% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.37 Å R-free 0.204
4QR4 Brd4 Bromodomain 1 complex with its novel inhibitors 提交 2014-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa） 片段：UNP residues 44-166
未记录 BNK 2-chloro-N-cyclopentyl-5-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-thiazol-4-yl)benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Naformate, 10% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.28 Å R-free 0.177
4QR5 Brd4 Bromodomain 1 complex with its novel inhibitors 提交 2014-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa） 片段：UNP residues 44-166
未记录 BNM N-[3-(cyclopentylsulfamoyl)-5-(2-oxo-2,3-dihydro-1,3-thiazol-4-yl)phenyl]cyclopropanecarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Naformate, 10% glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 1.41 Å R-free 0.194
4QZS Crystal structure of the first bromodomain of human 3-fluoro tyrosine-labeled brd4 in complex with jq1 提交 2014-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain residues 44-168
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） JQ1 (6S)-6-(2-tert-butoxy-2-oxoethyl)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6,7-dihydrothieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-10-ium × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES pH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM HEPES PH7.5, 0.1M AMMONIUM ACETATE 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM JQ1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.45 Å R-free 0.185
4UIX N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 7-(3,4-dimethoxyphenyl)-N-(1,1-dioxo-1-thian-4-yl)-5-methyl-4-oxo-4H,5H-thieno-3,2-c-pyridine-2- carboxamide 提交 2015-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 CA CALCIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 TVU N-[1,1-bis(oxidanylidene)thian-4-yl]-7-(3,4-dimethoxyphenyl)-5-methyl-4-oxidanylidene-thieno[3,2-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 293 K；0.2M CACL2, 0.1M HEPES, PEG 6K 20C
分辨率 1.58 Å R-free 0.238
4UIX N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 7-(3,4-dimethoxyphenyl)-N-(1,1-dioxo-1-thian-4-yl)-5-methyl-4-oxo-4H,5H-thieno-3,2-c-pyridine-2- carboxamide 提交 2015-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 CA CALCIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 TVU N-[1,1-bis(oxidanylidene)thian-4-yl]-7-(3,4-dimethoxyphenyl)-5-methyl-4-oxidanylidene-thieno[3,2-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 293 K；0.2M CACL2, 0.1M HEPES, PEG 6K 20C
分辨率 1.58 Å R-free 0.238
4UIX N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 7-(3,4-dimethoxyphenyl)-N-(1,1-dioxo-1-thian-4-yl)-5-methyl-4-oxo-4H,5H-thieno-3,2-c-pyridine-2- carboxamide 提交 2015-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 TVU N-[1,1-bis(oxidanylidene)thian-4-yl]-7-(3,4-dimethoxyphenyl)-5-methyl-4-oxidanylidene-thieno[3,2-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 293 K；0.2M CACL2, 0.1M HEPES, PEG 6K 20C
分辨率 1.58 Å R-free 0.238
4UIY N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH N-(1,1-dioxo-1-thian-4-yl)- 5-methyl-4-oxo-7-3-(trifluoromethyl)phenyl-4H,5H-thieno-3,2-c- pyridine-2-carboximidamide 提交 2015-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 5V2 N-[1,1-bis(oxidanylidene)thian-4-yl]-5-methyl-4-oxidanylidene-7-[3-(trifluoromethyl)phenyl]thieno[3,2-c]pyridine-2-carboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；20% PEG3350, 0.2M KSCN, 0.1M BTP PH 7.5
分辨率 1.30 Å R-free 0.185
4UIZ N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 7-(3,4-dimethoxyphenyl)-2-(4-methanesulfonylpiperazine-1-carbonyl)-5-methyl-4H,5H-thieno-3,2-c- pyridin-4-one 提交 2015-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 N1D 7-(3,4-dimethoxyphenyl)-5-methyl-2-(4-methylsulfonylpiperazin-1-yl)carbonyl-thieno[3,2-c]pyridin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1M BTP PH 6.5, 20% PEG3350, 0.2M NAFORMATE
分辨率 1.19 Å R-free 0.175
4UYD N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 1,3-dimethyl-2-oxo-2,3- dihydro-1H-1,3-benzodiazole-5-carboxamide 提交 2014-08-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–183（140 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 44-183
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 V1T 1,3-dimethyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 20% PEG3350, 0.2M NAAC
分辨率 1.37 Å R-free 0.188
4WHW Direct photocapture of bromodomains using tropolone chemical probes 提交 2014-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 3OT 2-methoxy-4-{1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-2-(2-phenylethyl)-1H-benzimidazol-5-yl}cyclohepta-2,4,6-trien-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；Screen using Hampton Research HT and Index kits
分辨率 1.34 Å R-free 0.201
4WIV Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a novel inhibitor UMB32 (N-TERT-BUTYL-2-[4-(3,5-DIMETHYL-1,2-OXAZOL-4-YL) PHENYL]IMIDAZO[1,2-A]PYRAZIN-3-AMINE) 提交 2014-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：unp residues 44-168
未记录 3P2 N-tert-butyl-2-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)phenyl]imidazo[1,2-a]pyrazin-3-amine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；295 K；Crystals of inhibitor-free BRD4-BD1 were first obtained in a drop with equal volumes of BD1 at 12 mg/ml and a precipitant solution containing 100mM sodium nitrate, 5% ethylene glycol, and 18% (w/v) PEG3350, as precipitant. Rod-like crystals were typically grown in 10 days reaching a maximal size of 0.05x0.05x0.4 mm3. Then, native crystals were transferred and soaked in 1 mM UMB32 in the same crystallization buffer for 7 days.
分辨率 1.56 Å R-free 0.201
4X2I Discovery of benzotriazolo diazepines as orally-active inhibitors of BET bromodomains: Crystal structure of BRD4 with CPI-13 提交 2014-11-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–166（125 aa） 片段：Bromo 1 domain (UNP residues 42-166)
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 3X0 (4R)-6-(4-chlorophenyl)-1,4-dimethyl-5,6-dihydro-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,5]benzodiazepine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；BRD4-BD1 protein at 1mM, 2.682 M Formate, 10% Glycerol, 0.1 M Tris-HCL pH 8.5
分辨率 1.20 Å R-free 0.187
4XY9 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a 2-amine-9H-purine ligand 提交 2015-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：UNP residues 42-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 43U 6-(5-bromo-2-methoxyphenyl)-9H-purin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.20M NaNO3, 20.0% PEG 3350, 10.0% EtGly
分辨率 1.83 Å R-free 0.206
4XYA Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a 2-amine-9H-purine ligand 提交 2015-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：UNP residues 42-168
未记录 43S 6-(5-bromo-1-benzofuran-7-yl)-9H-purin-2-amine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG3350, 10% ethylene glycol, 0.1M bis-tris-propane pH 8.5, 0.2M sodium sulfate
分辨率 2.05 Å R-free 0.207
4YH3 Crystal structure of human BRD4(1) in complex with 4-[(2E)-3-(4-methoxyphenyl)-2-phenylprop-2-enoyl]-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one (compound 19a) 提交 2015-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–170（127 aa） 片段：Bromodomain 1 (UNP residues 44-170)
未记录 Y80 4-[(2E)-3-(4-methoxyphenyl)-2-phenylprop-2-enoyl]-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；10% PEG3350, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.2 M L-proline, soaked in 20 mM ligand for 3 hours at room temperature
分辨率 1.60 Å R-free 0.199
4YH4 Crystal structure of human BRD4(1) in complex with 4-[(5-phenylpyridin-3-yl)carbonyl]-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one (compound 19d) 提交 2015-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–170（127 aa） 片段：Bromodomain 1 (UNP residues 44-170)
未记录 Y81 4-[(5-phenylpyridin-3-yl)carbonyl]-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M potassium thiocyanate, 20% w/v PEG3350, 0.6 mM ligand
分辨率 1.33 Å R-free 0.147
4Z1Q Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 bound to benzotriazolo-diazepine scaffold 提交 2015-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–167（126 aa）
未记录 558 5-[(4R)-6-(4-chlorophenyl)-1,4-dimethyl-5,6-dihydro-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,5]benzodiazepin-8-yl]pyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, and 25% polyethylene glycol (PEG) 3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.242
4Z1Q Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 bound to benzotriazolo-diazepine scaffold 提交 2015-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 42–167（126 aa）
未记录 558 5-[(4R)-6-(4-chlorophenyl)-1,4-dimethyl-5,6-dihydro-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,5]benzodiazepin-8-yl]pyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, and 25% polyethylene glycol (PEG) 3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.242
4Z1S Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 with benzotriazolo-diazepine scaffold 提交 2015-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–166（125 aa） 片段：UNP Residues 42-166
未记录 559 5-[(4S)-6-(4-chlorophenyl)-1,4-dimethyl-5,6-dihydro-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,5]benzodiazepin-8-yl]pyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium sodium tartrate and 20% PEG 3350
分辨率 1.06 Å R-free 0.220
4Z1S Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 with benzotriazolo-diazepine scaffold 提交 2015-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 42–166（125 aa） 片段：UNP Residues 42-166
未记录 559 5-[(4S)-6-(4-chlorophenyl)-1,4-dimethyl-5,6-dihydro-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,5]benzodiazepin-8-yl]pyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium sodium tartrate and 20% PEG 3350
分辨率 1.06 Å R-free 0.220
4Z93 BRD4 bromodomain 2 in complex with gamma-carboline-containing compound, number 18. 提交 2015-04-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 349–460（112 aa） 片段：bromodomain 2 (UNP residues 349-460)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4LD 1-(3-cyclopropyl-5-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-7-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-8-methoxy-5H-pyrido[4,3-b]indole × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；Peg 400, Imidizole, ATP
分辨率 1.27 Å R-free 0.184
4ZC9 Crystal Structure of the BRD4a/DB-2-190 complex 提交 2015-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：first Bromo domain (unp residues 42-167)
未记录 4MW 2-[(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]-N-(4-{[({2-[(3S)-2,6-dioxopiperidin-3-yl]-1,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}oxy)acetyl]amino}butyl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；15% PEG3350, 0.1 M Succinate
分辨率 0.99 Å R-free 0.146
4ZW1 Crystal structure of hBRD4 in complex with BL-BI06 reveals a novel synthesized inhibitor that induces Beclin1-independent/ATG5-dependent autophagic cell death in breast cancer 提交 2015-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 4V1 2-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)-7-methyl-5,6,7,8-tetrahydropyrido[4',3':4,5]thieno[2,3-d]pyrimidin-4(3H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2M ammonium phosphate dibasic, 20% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.249
5A5S NN-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 5-5-methoxypyridin-3-yl-3- methyl-8-piperidin-4-ylamino-1,2-dihydro-1,7-naphthyridin-2-one 提交 2015-06-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NP8 5-(5-methoxypyridin-3-yl)-3-methyl-8-[(piperidin-4-yl)amino]-1,2-dihydro-1,7-naphthyridin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2NAF, 20% PEG3350
分辨率 1.36 Å R-free 0.218
5A85 N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 8-(3R,4R)-3-(cyclohexylmethoxy)piperidin-4-ylamino-3-methyl-1,2-dihydro-1,7- naphthyridin-2-one 提交 2015-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 78J (3R,4R)-3-(cyclohexylmethoxy)piperidin-4-yl]amino}-3-methyl-1,2-dihydro-1,7-naphthyridin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M HEPES PH 7.0, 20% PEG 6000, 0.2M LICL
分辨率 1.72 Å R-free 0.236
5ACY N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 1-(2R,4S)-2-methyl-4-(phenylamino)-6-4-(piperidin-1-ylmethyl)phenyl-1,2,3,4- tetrahydroquinolin-1-yl-ethan-1-one 提交 2015-08-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 9S3 1-[(2S,4R)-2-methyl-4-(phenylamino)-6-[4-(piperidin-1-ylmethyl)phenyl]-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M MIB PH 4.0 25% PEG1500
分辨率 2.01 Å R-free 0.271
5ACY N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 1-(2R,4S)-2-methyl-4-(phenylamino)-6-4-(piperidin-1-ylmethyl)phenyl-1,2,3,4- tetrahydroquinolin-1-yl-ethan-1-one 提交 2015-08-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 9S3 1-[(2S,4R)-2-methyl-4-(phenylamino)-6-[4-(piperidin-1-ylmethyl)phenyl]-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M MIB PH 4.0 25% PEG1500
分辨率 2.01 Å R-free 0.271
5AD2 Bivalent binding to BET bromodomains 提交 2015-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：BROMODOMAIN 1, RESIDUES 44-168
未记录 ETU (3R)-4-(2-{4-[1-(3-chloro[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-yl)-4-piperidinyl]phenoxy}ethyl)-1,3-dimethyl-2-piperazinone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 NACL 0.2M, PEG 3350 5.9%W/V, EG 10%V/V, HEPES 0.1M PH 7.4
分辨率 2.01 Å R-free 0.236
5AD2 Bivalent binding to BET bromodomains 提交 2015-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：BROMODOMAIN 1, RESIDUES 44-168
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 NACL 0.2M, PEG 3350 5.9%W/V, EG 10%V/V, HEPES 0.1M PH 7.4
分辨率 2.01 Å R-free 0.236
5AD3 Bivalent binding to BET bromodomains 提交 2015-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：BROMODOMAIN 1, RESIDUES 44-168
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 PEG 4K 20%W/V, (NH4)2HPO4 0.2M
分辨率 1.49 Å R-free 0.308
5AD3 Bivalent binding to BET bromodomains 提交 2015-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：BROMODOMAIN 1, RESIDUES 44-168
未记录 K6K 3-methoxy-N-[2-[4-[1-(3-methoxy-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-yl)-4-piperidyl]phenoxy]ethyl]-N-methyl-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 PEG 4K 20%W/V, (NH4)2HPO4 0.2M
分辨率 1.49 Å R-free 0.308
5BT4 Crystal structure of BRD4 first bromodomain in complex with SGC-CBP30 chemical probe 提交 2015-06-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2LO 2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(2S)-2-(morpholin-4-yl)propyl]-1H-benzimidazole × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M succinic acid, 20% PEG 3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.214
5BT4 Crystal structure of BRD4 first bromodomain in complex with SGC-CBP30 chemical probe 提交 2015-06-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2LO 2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(2S)-2-(morpholin-4-yl)propyl]-1H-benzimidazole × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M succinic acid, 20% PEG 3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.214
5BT4 Crystal structure of BRD4 first bromodomain in complex with SGC-CBP30 chemical probe 提交 2015-06-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 2LO 2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(2S)-2-(morpholin-4-yl)propyl]-1H-benzimidazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M succinic acid, 20% PEG 3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.214
5CFW Selective pharmacological inhibition of the CREB binding protein bromodomain regulates inflammatory cytokines in macrophages and RGS4 in neurons 提交 2015-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 53W 5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-2-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]-1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-1H-benzimidazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350
分辨率 1.15 Å R-free 0.209
5COI Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with benzo[cd]indol-2(1H)-one ligand 提交 2015-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 44-168
未记录 55K 1-({[(1-ethyl-2-oxo-1,2-dihydrobenzo[cd]indol-6-yl)sulfonyl]amino}methyl)cyclopentanecarboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly, pH 7.5
分辨率 1.62 Å R-free 0.200
5CP5 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with benzo[cd]indol-2(1H)-one ligand 提交 2015-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 44-168
未记录 EB0 1-ethyl-N-(4-fluorophenyl)-2-oxo-1,2-dihydrobenzo[cd]indole-6-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350, 0.2M (NH4)2SO4, 0.1M HEPES, 10% EtGhly, pH7.5
分辨率 1.79 Å R-free 0.242
5CPE Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with benzo[cd]indol-2(1H)-one ligand 提交 2015-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 EB2 N-cycloheptyl-1-ethyl-2-oxo-1,2-dihydrobenzo[cd]indole-6-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES,10% EtGhly, pH7.2
分辨率 1.62 Å R-free 0.187
5CQT Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with benzo[cd]indol-2(1H)-one ligand 提交 2015-07-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 EB3 N-cyclohexyl-1-ethyl-2-oxo-1,2-dihydrobenzo[cd]indole-6-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly, pH 7.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.191
5CRM Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with benzo[cd]indol-2(1H)-one ligand 提交 2015-07-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 44-165
未记录 NO3 NITRATE ION × 2 EB5 N,1-diethyl-2-oxo-1,2-dihydrobenzo[cd]indole-6-sulfonamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly, PH 6.5
分辨率 1.99 Å R-free 0.201
5CRZ Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with benzo[cd]indol-2(1H)-one ligand 提交 2015-07-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NO3 NITRATE ION × 1 EB7 2-chloro-N-(1-ethyl-2-oxo-1,2-dihydrobenzo[cd]indol-6-yl)-4-fluorobenzenesulfonamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly, pH 8.0
分辨率 2.12 Å R-free 0.257
5CS8 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with benzo[cd]indol-2(1H)-one ligand 提交 2015-07-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, UNP residues 44-168
未记录 EB8 methyl 2-[(1-ethyl-2-oxo-1,2-dihydrobenzo[cd]indol-6-yl)sulfamoyl]benzoate × 1 NO3 NITRATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly, pH 8.3
分辨率 1.62 Å R-free 0.215
5CTL Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with benzo[cd]indol-2(1H)-one ligand 提交 2015-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, UNP residues 44-168
未记录 EB9 N-(1-ethyl-2-oxo-1,2-dihydrobenzo[cd]indol-6-yl)benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly,pH 7.0
分辨率 2.51 Å R-free 0.227
5CY9 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with benzo[cd]indol-2(1H)-one ligand 提交 2015-07-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 44-168
未记录 GOL GLYCEROL × 1 E0A N-(1-ethyl-2-oxo-1,2-dihydrobenzo[cd]indol-6-yl)butane-1-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaCl, 0.1M HEPES, 10% EtGhly,pH 7.8
分辨率 1.55 Å R-free 0.198
5D0C Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with benzo[cd]indol-2(1H)-one ligand 提交 2015-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 44-168
未记录 NO3 NITRATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 E0B N-[(1-acetylpiperidin-4-yl)methyl]-1-ethyl-2-oxo-1,2-dihydrobenzo[cd]indole-6-sulfonamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly,pH 7.5
分辨率 1.49 Å R-free 0.183
5D24 First bromodomain of BRD4 bound to inhibitor XD26 提交 2015-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 43–168（126 aa） 片段：UNP residues 43-168
突变：T43M L26 4-acetyl-N-[3-(2-amino-2-oxoethoxy)phenyl]-3-ethyl-5-methyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；ammonium acetate, (+/-)-2-Methyl-2,4-methylpentanediol, Bis-tris
分辨率 1.65 Å R-free 0.202
5D25 First bromodomain of BRD4 bound to inhibitor XD27 提交 2015-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 43–168（126 aa） 片段：UNP residues 43-168
突变：T43M 56M 4-acetyl-N-[5-(diethylsulfamoyl)-2-hydroxyphenyl]-3,5-dimethyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, Hepes
分辨率 1.70 Å R-free 0.196
5D26 First bromodomain of BRD4 bound to inhibitor XD28 提交 2015-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
突变：T43M L28 N~2~-[5-(diethylsulfamoyl)-2-hydroxyphenyl]-3-ethyl-5-methyl-1H-pyrrole-2,4-dicarboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, Hepes, magnesium chloride
分辨率 1.82 Å R-free 0.187
5D3H First bromodomain of BRD4 bound to inhibitor XD29 提交 2015-08-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 44-168
未记录 57G N-[5-(diethylsulfamoyl)-2-hydroxyphenyl]-3-ethyl-4-(hydroxyacetyl)-5-methyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, Bis-tris
分辨率 1.70 Å R-free 0.196
5D3J First bromodomain of BRD4 bound to inhibitor XD33 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 43–168（126 aa） 片段：UNP residues 43-168
突变：T43M L33 4-acetyl-N-[3-(diethylsulfamoyl)phenyl]-3-ethyl-5-methyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, Hepes, magnesium chloride
分辨率 1.70 Å R-free 0.206
5D3L First bromodomain of BRD4 bound to inhibitor XD35 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 42-168
突变：T43M 57F 4-acetyl-N-[5-(diethylsulfamoyl)-2-hydroxy-4-methylphenyl]-3-ethyl-5-methyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, Bis-tris, ammonium acetate
分辨率 1.50 Å R-free 0.201
5D3N First bromodomain of BRD4 bound to inhibitor XD40 提交 2015-08-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 43–168（126 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 44-168
未记录 L40 4-acetyl-3-ethyl-5-methyl-N-[2-methyl-5-(methylsulfamoyl)phenyl]-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Tacsimate
分辨率 2.15 Å R-free 0.235
5D3P First bromodomain of BRD4 bound to inhibitor XD41 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 42-168
突变：T43M 57E 1-[(4-acetyl-3-ethyl-5-methyl-1H-pyrrol-2-yl)carbonyl]-N-methyl-1H-indole-6-sulfonamide × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, Bis-Tris, lithium sulfate
分辨率 1.95 Å R-free 0.197
5D3R First bromodomain of BRD4 bound to inhibitor XD42 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 42-168
突变：T43M 57C 4-acetyl-N-[3-(azepan-1-ylsulfonyl)phenyl]-5-methyl-3-propyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, Bis-tris, sodium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
5D3S First bromodomain of BRD4 bound to inhibitor XD44 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 44-168
突变：T43M 579 4-acetyl-3-ethyl-N-[4-fluoro-3-(morpholin-4-ylsulfonyl)phenyl]-5-methyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, Bis-Tris
分辨率 1.75 Å R-free 0.195
5D3T First bromodomain of BRD4 bound to inhibitor XD47 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 42-168
突变：T43M 56Y 4-acetyl-N-(3-carbamoylbenzyl)-3-ethyl-N,5-dimethyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, succinic acid
分辨率 1.93 Å R-free 0.201
5DLX FIRST DOMAIN OF HUMAN BROMODOMAIN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR N-{3-[4-(3-chlorophenyl)piperazin-1-yl]propyl}-1-{3-methyl-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-yl}piperidine-4-carboxamide 提交 2015-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 42-168
未记录 5D2 N-{3-[4-(3-chlorophenyl)piperazin-1-yl]propyl}-1-(3-methyl[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-yl)piperidine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；Ratio 1:1 (protein:precipitant). 12 mg/mL Brd4_BD1 protein. Protein buffer 10 mM HEPES (pH 7.5) 150 mM NaCl. Precipitant agent 22 % (w/v) PEG 3350, 10% (w/v) ethylene glycol 30 % (w/v), 0.3 M NaFormate. 1.0 mM inhibitor (in DMSO) final concentration. Cryoprotection with 10 % (w/v) glycerol
分辨率 1.90 Å R-free 0.207
5DLZ FIRST DOMAIN OF HUMAN BROMODOMAIN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 4-[(1-methyl-2-oxo-1,2-dihydroquinolin-4-yl)oxy]-N-({1-[(3-methylphe methyl]piperidin-4-yl}methyl)butanamide 提交 2015-09-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 42-168
未记录 5D1 N-{[1-(3-methylbenzyl)piperidin-4-yl]methyl}-4-[(1-methyl-2-oxo-1,2-dihydroquinolin-4-yl)oxy]butanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；292 K；Ratio 1:1 (protein:precipitant) 12 mg/mL Brd4_BD1 protein. Protein buffer 10 mM HEPES (pH 7.5) 150 mM NaCl.Precipitant agent 22 % (w/v) PEG 3350, 10% (w/v) ethylene glycol 30 % (w/v), 0.3 M NaNO3. 5.0 mM inhibitor (in DMSO) final concentration. Cryoprotection with 10% (w/v) glycerol.
分辨率 1.70 Å R-free 0.334
5DW2 X-ray crystal structure of human BRD4(BD1) in complex with RVX297 to 1.12 A resolution 提交 2015-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–170（127 aa） 片段：UNP residues 44-170
未记录 5GD 2-{3,5-dimethyl-4-[2-(pyrrolidin-1-yl)ethoxy]phenyl}-5,7-dimethoxyquinazolin-4(3H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；30% PEG2000 MME, 0.1 M potassium thiocyanate
分辨率 1.12 Å R-free 0.151
5DX4 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with benzo[cd]indol-2(1H)-one ligand 提交 2015-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, UNP RESIDUES 44-168
未记录 E0C 5-bromo-N-(1-ethyl-2-oxo-1,2-dihydrobenzo[cd]indol-6-yl)-2-methoxybenzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly,pH 7.0
分辨率 2.30 Å R-free 0.239
5E0R Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with AYC 提交 2015-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 5J5 2-[(chloroacetyl)amino]-5-[(E)-(4-sulfophenyl)diazenyl]benzenesulfonic acid × 5 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.20M Sodium Nitrate, 20% PEG 3350, 10% ethylene glycol
分辨率 1.35 Å R-free 0.198
5EGU FIRST DOMAIN OF HUMAN BROMODOMAIN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 3-Butyl-8-(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-ylsulfanylmethyl)-7-ethyl-3,7-dihydropurine-2,6-dione 提交 2015-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 42-168
未记录 5NQ 3-butyl-8-[(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)sulfanylmethyl]-7-ethyl-purine-2,6-dione × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；Ratio 1:1 (protein:precipitant). 25 mg/mL BRD4_BD1 protein. 1.0 mM inhibitor (in DMSO) final concentration. Protein buffer: 0.01M HEPES (pH 7.5), 0.15M NaCl. Precipitant agent : 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Tris pH 8.5, 25% PEG3350. Cryoprotectant : 10% ethylene glycol.
分辨率 2.21 Å R-free 0.235
5EGU FIRST DOMAIN OF HUMAN BROMODOMAIN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 3-Butyl-8-(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-ylsulfanylmethyl)-7-ethyl-3,7-dihydropurine-2,6-dione 提交 2015-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 42-168
未记录 5NQ 3-butyl-8-[(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)sulfanylmethyl]-7-ethyl-purine-2,6-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；Ratio 1:1 (protein:precipitant). 25 mg/mL BRD4_BD1 protein. 1.0 mM inhibitor (in DMSO) final concentration. Protein buffer: 0.01M HEPES (pH 7.5), 0.15M NaCl. Precipitant agent : 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Tris pH 8.5, 25% PEG3350. Cryoprotectant : 10% ethylene glycol.
分辨率 2.21 Å R-free 0.235
5EGU FIRST DOMAIN OF HUMAN BROMODOMAIN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 3-Butyl-8-(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-ylsulfanylmethyl)-7-ethyl-3,7-dihydropurine-2,6-dione 提交 2015-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 42-168
未记录 5NQ 3-butyl-8-[(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)sulfanylmethyl]-7-ethyl-purine-2,6-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；Ratio 1:1 (protein:precipitant). 25 mg/mL BRD4_BD1 protein. 1.0 mM inhibitor (in DMSO) final concentration. Protein buffer: 0.01M HEPES (pH 7.5), 0.15M NaCl. Precipitant agent : 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Tris pH 8.5, 25% PEG3350. Cryoprotectant : 10% ethylene glycol.
分辨率 2.21 Å R-free 0.235
5EGU FIRST DOMAIN OF HUMAN BROMODOMAIN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 3-Butyl-8-(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-ylsulfanylmethyl)-7-ethyl-3,7-dihydropurine-2,6-dione 提交 2015-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 42-168
未记录 5NQ 3-butyl-8-[(6-butyl-5,7-dimethyl-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-2-yl)sulfanylmethyl]-7-ethyl-purine-2,6-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；Ratio 1:1 (protein:precipitant). 25 mg/mL BRD4_BD1 protein. 1.0 mM inhibitor (in DMSO) final concentration. Protein buffer: 0.01M HEPES (pH 7.5), 0.15M NaCl. Precipitant agent : 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Tris pH 8.5, 25% PEG3350. Cryoprotectant : 10% ethylene glycol.
分辨率 2.21 Å R-free 0.235
5EI4 First domain of human bromodomain BRD4 in complex with inhibitor 8-(5-Amino-1H-[1,2,4]triazol-3-ylsulfanylmethyl)-3-(4-chlorobenzyl)-7-ethyl-3,7-dihydropurine-2,6-dione 提交 2015-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 5NV 8-[(3-azanyl-1~{H}-1,2,4-triazol-5-yl)sulfanylmethyl]-3-[(4-chlorophenyl)methyl]-7-ethyl-purine-2,6-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；Ratio 1:1 (protein:precipitant). 12 mg/mL BRD4_BD1 protein. 2.5 mM inhibitor (in DMSO) final concentration. Protein buffer: 0.01M HEPES (pH 7.5), 0.15M NaCl. Precipitant agent : 0.3M Na Formate, 0.1M NaCl, 22% PEG3350, 10% ethylene glycol. Cryoprotectant : 10% ethylene glycol.
分辨率 1.05 Å R-free 0.192
5EIS FIRST DOMAIN OF HUMAN BROMODOMAIN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 3-(4-Chlorobenzyl)-7-ethyl-3,7-dihydropurine-2,6-dione 提交 2015-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
突变：NO 5OU 3-[(4-chlorophenyl)methyl]-7-ethyl-purine-2,6-dione × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；ratio 1:1 (protein:precipitant). 16 mg/mL Brd4_BD1 protein. 2.5 mM inhibitor (in DMSO) final concentration. Protein buffer: 0.1M HEPES (pH 7.5) 0.15 mM NaCl. Precipitant agent: 19% (w/v) PEG 3350, 0.25M ammonium sulfate, 0.1M Tris pH 8.5. Cryoprotectant: 10% (w/v) ethylene glycol
分辨率 1.60 Å R-free 0.219
5F5Z Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with MA2-014 提交 2015-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 5VY 2-methyl-~{N}-[3-[[5-methyl-2-[[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]propane-2-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM MA2-014
分辨率 1.76 Å R-free 0.204
5F60 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SG3-014 提交 2015-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 5VZ ~{N}-[2-chloranyl-5-[[5-methyl-2-[[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]-2-methyl-propane-2-sulfonamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM SG3-014
分辨率 1.35 Å R-free 0.171
5F61 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with MA4-022-1 提交 2015-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 5W0 ~{N}-[3-[[2-[[3-fluoranyl-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]-5-methyl-pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]-2-methyl-propane-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM MA4-022-1
分辨率 1.45 Å R-free 0.164
5F61 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with MA4-022-1 提交 2015-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 5W0 ~{N}-[3-[[2-[[3-fluoranyl-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]-5-methyl-pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]-2-methyl-propane-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM MA4-022-1
分辨率 1.45 Å R-free 0.164
5F62 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with MA4-022-2 提交 2015-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 5W1 ~{N}-[2-chloranyl-5-[[2-[[3-fluoranyl-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]-5-methyl-pyrimidin-4-yl]amino]phenyl]-2-methyl-propane-2-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM MA4-022-2
分辨率 1.35 Å R-free 0.183
5F63 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SG3-179 提交 2015-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 5W2 4-[[4-[[3-(~{tert}-butylsulfonylamino)-4-chloranyl-phenyl]amino]-5-methyl-pyrimidin-2-yl]amino]-2-fluoranyl-~{N}-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM SG3-179
分辨率 1.45 Å R-free 0.159
5FBX Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with PNZ5 isoxazole inhibitor 提交 2015-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：1st bromodomain, UNP residues 44-168
未记录 5W4 (3~{S})-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-2-methyl-3-phenyl-3~{H}-isoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277.15 K；20 % PEG 3350, 0.2 M zinc acetate, 0.1 M imidazole pH 7.8
分辨率 1.85 Å R-free 0.267
5H21 Trimethoxy-ring inhibitor in complex with the first bromodomain of BRD4 提交 2016-10-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-167
未记录 RMR 3,4,5-trimethoxy-~{N}-(2-thiophen-2-ylethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15% glycerol, 4M sodium formate
分辨率 1.59 Å R-free 0.190
5HCL Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with DMA 提交 2016-01-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-TERMINAL BROMODOMAIN, RESIDUES 44-168
未记录 5Y9 ~{N},~{N}-dimethylethanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.20M Sodium Nitrate, 20% PEG 3350, 10% ethylene glycol
分辨率 1.50 Å R-free 0.175
5HLS Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 bound to CPI-0610 提交 2016-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 62G CPI-0610 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；3.4-3.8 M sodium formate, 0.1 M Tris pH 7.8, and 10% glycerol
分辨率 2.18 Å R-free 0.277
5HM0 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 bound to benzoisoxazoloazepine 3 提交 2016-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 62V 6-(4-chlorophenyl)-1-methyl-4H-[1,2]oxazolo[5,4-d][2]benzazepine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；3.4-3.8 M sodium formate, 0.1 M Tris pH 7.8, and 10% glycerol.
分辨率 1.40 Å R-free 0.226
5HQ5 Crystal structure of fragment bound with Brd4 提交 2016-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 64Q 7-methyl-N-(o-tolyl)-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrimidin-5-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；3.6M Naformate, 10% glycerol
分辨率 1.60 Å R-free 0.187
5HQ6 Crystal structure of fragment bound with Brd4 提交 2016-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa） 片段：UNP residues 44-166
未记录 64R (2R)-2,6-dimethyl-2H-1,4-benzoxazin-3(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；3.6M Naformate, 10% glycerol
分辨率 1.95 Å R-free 0.204
5HQ7 Crystal structure of fragment bound with Brd4 提交 2016-01-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa） 片段：UNP residues 44-167
未记录 64S N-ethyl-6,7-dimethoxyquinazolin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；3.6M Naformate, 10% glycerol
分辨率 1.90 Å R-free 0.211
5I80 BRD4 in complex with Cpd2 (N,N-dimethyl-3-(6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)benzamide) 提交 2016-02-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–167（126 aa）
未记录 67B N,N-dimethyl-3-(6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；20% ethylene glycol, 0.1 M Bis-Tris pH 6.8, 20% polyethylene glycol (PEG) 3350
分辨率 1.45 Å R-free 0.202
5I88 BRD4 in complex with Cpd4 ((E)-3-(6-(but-2-en-1-yl)-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)-N,N-dimethylbenzamide) 提交 2016-02-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–167（126 aa）
未记录 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 69G 3-{6-[(2E)-but-2-en-1-yl]-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl}-N,N-dimethylbenzamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；277 K；20% ethylene glycol, 0.1 M Bis-Tris pH 6.8, 20% polyethylene glycol (PEG) 3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.202
5IGK Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with bromosporine (BSP) 提交 2016-02-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 BMF Bromosporine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M Na/K(tart), 0.1 M BTProp pH 8.5, 20% PEG3350, 10% EtGly
分辨率 1.70 Å R-free 0.200
5JWM Bivalent BET Bromodomain Inhibition 提交 2016-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 333–460（128 aa） 片段：unp residues 333-460
未记录 6ON 2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]-~{N}-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris (pH 5.5)
分辨率 1.71 Å R-free 0.168
5JWM Bivalent BET Bromodomain Inhibition 提交 2016-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 333–460（128 aa） 片段：unp residues 333-460
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；2M ammonium sulfate, 0.1M BisTris (pH 5.5)
分辨率 1.71 Å R-free 0.168
5KDH CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH A DIHYDROPYRIDOPYRIMIDINE SCAFFOLD INHIBITOR 提交 2016-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 6RX (5~{S})-1-ethyl-5-(4-methylphenyl)-8,9-dihydro-5~{H}-furo[3,4]pyrido[3,5-~{b}]pyrimidine-2,4,6-trione × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM INHIBITOR
分辨率 1.50 Å R-free 0.184
5KHM The first BET bromodomain of BRD4 bound to compound 13 in a bivalent manner 提交 2016-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
链 B 44–168（125 aa）
未记录 XNH (3~{R})-4-[2-[4-[1-(3-methoxy-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-yl)piperidin-4-yl]phenoxy]ethyl]-1,3-dimethyl-piperazin-2-one × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M tri-Potassium Citrate, 10% PEG 10K
分辨率 1.48 Å R-free 0.210
5KJ0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH DB-1-264-2 提交 2016-06-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 6TB 4-[[(7~{R})-8-cyclopentyl-7-ethyl-5-methyl-6-oxidanylidene-7~{H}-pteridin-2-yl]-methyl-amino]-3-methoxy-~{N}-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM DB-1-264-2
分辨率 1.51 Å R-free 0.170
5KU3 BRD4 bromodomain in complex with Cpd59 ((S)-1-(3-((2-fluoro-4-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl)amino)-1-(tetrahydrofuran-3-yl)-6,7-dihydro-1H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5(4H)-yl)ethanone) 提交 2016-07-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–167（126 aa） 片段：bromodomain (UNP residues 42-167)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 6XH 1-[3-[[2-fluoranyl-4-(1-methylpyrazol-4-yl)phenyl]amino]-1-[(3~{S})-oxolan-3-yl]-6,7-dihydro-4~{H}-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；287 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.8, 18% PEG 3350, 20% ethylene glycol
分辨率 1.14 Å R-free 0.182
5LJ1 N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 8-(((3R,4R,5S)-3-((4,4-difluorocyclohexyl)methoxy)-5-methoxypiperidin-4-yl)amino)-3-methyl-5-(5-methylpyridin-3-yl)-1,7-naphthyridin-2(1H)-one 提交 2016-07-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 6XX 8-(((3R,4R,5S)-3-((4,4-difluorocyclohexyl)methoxy)-5-methoxypiperidin-4-yl)amino)-3-methyl-5-(5-methylpyridin-3-yl)-1,7-naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2NaNO3, 20% PEG3350 at 20C
分辨率 1.90 Å R-free 0.237
5LJ2 N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 5-(5-aminopyridin-3-yl)-8-(((3R,4R)-3-((1,1-dioxidotetrahydro-2H-thiopyran-4-yl)methoxy)piperidin-4-yl)amino)-3-methyl-1,7-naphthyridin-2(1H)-one 提交 2016-07-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 6XW 5-(5-aminopyridin-3-yl)-8-(((3R,4R)-3-((1,1-dioxidotetrahydro-2H-thiopyran-4-yl)methoxy)piperidin-4-yl)amino)-3-methyl-1,7-naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 Tris pH 8.5, 0.2M Li2SO4, 20% v/v PEG400 at 20C
分辨率 1.19 Å R-free 0.208
5LRQ BRD4 in complex with ERK5 inhibitor XMD8-92 提交 2016-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–163（122 aa） 片段：UNP residues 42-163
未记录 4WG 2-{[2-ethoxy-4-(4-hydroxypiperidin-1-yl)phenyl]amino}-5,11-dimethyl-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；278 K；BRD4 10mg/ml 30w/v Jeffamine ED-2001 0.1M HEPES pH7.0
分辨率 1.70 Å R-free 0.233
5LUU Structure of the first bromodomain of BRD4 with a pyrazolo[4,3-c]pyridin fragment 提交 2016-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 77X 1-(3-phenyl-1,4,6,7-tetrahydropyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)propan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M Na2SO4 0.1M BTProp pH 8.5 20% PEG3350 10% EtGly
分辨率 1.61 Å R-free 0.206
5M39 Crystal structure of BRD4 BROMODOMAIN 1 IN COMPLEX WITH LIGAND 1 提交 2016-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 7EA 6-(3,4-dimethoxyphenyl)-3-methyl-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；27% PEG3350 0.2M Disodium malonate 0.01 M HEPES
分辨率 1.38 Å R-free 0.242
5M39 Crystal structure of BRD4 BROMODOMAIN 1 IN COMPLEX WITH LIGAND 1 提交 2016-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 42–168（127 aa）
未记录 7EA 6-(3,4-dimethoxyphenyl)-3-methyl-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；27% PEG3350 0.2M Disodium malonate 0.01 M HEPES
分辨率 1.38 Å R-free 0.242
5M3A Crystal structure of BRD4 BROMODOMAIN 1 IN COMPLEX WITH LIGAND 2 提交 2016-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 7E7 3-methyl-6-(1-methyl-5-phenoxy-pyrazol-4-yl)-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294 K；0.1M HEPES PEG3350 22% Di-Sodium malonate
分辨率 1.65 Å R-free 0.214
5MKZ N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 4-chloro-2-methyl-5-(((3-methylthiophen-2-yl)methyl)amino)pyridazin-3(2H)-one 提交 2016-12-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 RNK 4-chloranyl-2-methyl-5-[(3-methylthiophen-2-yl)methylamino]pyridazin-3-one × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium nitrate 0.1 M Bis Tris propane pH 6.5 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.62 Å R-free 0.169
5MLI N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 4-chloro-2-methyl-5-(methylamino)pyridazin-3(2H)-one 提交 2016-12-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 82I 4-chloranyl-2-methyl-5-(methylamino)pyridazin-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M SPG buffer pH 6 25% (w/v) PEG 1500
分辨率 1.63 Å R-free 0.190
5N2M Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a tetrahydroquinoline analogue 提交 2017-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 8J2 propan-2-yl ~{N}-[(2~{S},4~{R})-6-(3-acetamidophenyl)-1-ethanoyl-2-methyl-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-4-yl]carbamate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M NH4SO4, 25% PEG3350, 0.1M Tris pH 8.5
分辨率 1.54 Å R-free 0.230
5NNC Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H3K9ac/K14ac) 提交 2017-04-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.20M LiCl 0.1M TRIS pH 8.0 20.0% PEG 6K 10.0% EtGly
分辨率 2.22 Å R-free 0.265
5NNC Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H3K9ac/K14ac) 提交 2017-04-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.20M LiCl 0.1M TRIS pH 8.0 20.0% PEG 6K 10.0% EtGly
分辨率 2.22 Å R-free 0.265
5NND Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H3K9ac/K14ac) 提交 2017-04-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.20M Na(acetate) 0.1M BTProp pH 7.5 20.0% PEG 3350 10.0% EtGly
分辨率 1.82 Å R-free 0.285
5NND Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H3K9ac/K14ac) 提交 2017-04-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.20M Na(acetate) 0.1M BTProp pH 7.5 20.0% PEG 3350 10.0% EtGly
分辨率 1.82 Å R-free 0.285
5NNE Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated TOP2A peptide (K1201ac/K1204ac) 提交 2017-04-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350 10% ethylene glycol 0.2M sodium iodide
分辨率 1.15 Å R-free 0.164
5NNF Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with an acetylated BAZ1B peptide (K221ac) 提交 2017-04-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG3350 10% ethylene glycol 0.1M bis-tris-propane pH 8.5 0.02M sodium/potassium phosphate
分辨率 1.15 Å R-free 0.144
5NNG Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with an acetylated SRPK1 peptide (K585ac) 提交 2017-04-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；30% PEG1000 0.1M PCB pH 7.0
分辨率 1.20 Å R-free 0.158
5O97 Crystal structure of human BRD4(1) bromodomain in complex with JRMBR4106 提交 2017-06-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 9OE (5~{Z})-4-azanyl-5-[(3-methoxy-4-oxidanyl-phenyl)methylidene]-1,3-thiazol-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES, pH8.0, 30% PEG5000MME
分辨率 1.30 Å R-free 0.199
5OVB Crystal structure of human BRD4(1) bromodomain in complex with DR46 提交 2017-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 AY2 ~{N}-[3-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M TRIS, pH 8.5, 0.2 M Ca Acet, 25% PEG 2K MME
分辨率 1.95 Å R-free 0.193
5OVB Crystal structure of human BRD4(1) bromodomain in complex with DR46 提交 2017-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 AY2 ~{N}-[3-(5-ethanoyl-2-ethoxy-phenyl)-5-(1-methylpyrazol-3-yl)phenyl]furan-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M TRIS, pH 8.5, 0.2 M Ca Acet, 25% PEG 2K MME
分辨率 1.95 Å R-free 0.193
5OWM Crystal structure of human BRD4(1) bromodomain in complex with UT48 提交 2017-09-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 B0N [3-[(3-methylbenzotriazol-5-yl)methyl]phenyl]methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；HEPES, Sodium chloride
分辨率 1.50 Å R-free 0.197
5OWW Crystal structure of human BRD4(1) bromodomain in complex with UT22B 提交 2017-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo domain 1, UNP residues 44-168
未记录 B0Q ~{N}-(3-methylbenzotriazol-5-yl)-1-(phenylmethyl)imidazole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 10% v/v 2-Propanol, 20% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.50 Å R-free 0.203
5OWW Crystal structure of human BRD4(1) bromodomain in complex with UT22B 提交 2017-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：Bromo domain 1, UNP residues 44-168
未记录 B0Q ~{N}-(3-methylbenzotriazol-5-yl)-1-(phenylmethyl)imidazole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 10% v/v 2-Propanol, 20% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.50 Å R-free 0.203
5OWW Crystal structure of human BRD4(1) bromodomain in complex with UT22B 提交 2017-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa） 片段：Bromo domain 1, UNP residues 44-168
未记录 B0Q ~{N}-(3-methylbenzotriazol-5-yl)-1-(phenylmethyl)imidazole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 10% v/v 2-Propanol, 20% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.50 Å R-free 0.203
5OWW Crystal structure of human BRD4(1) bromodomain in complex with UT22B 提交 2017-09-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 44–168（125 aa） 片段：Bromo domain 1, UNP residues 44-168
未记录 B0Q ~{N}-(3-methylbenzotriazol-5-yl)-1-(phenylmethyl)imidazole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 10% v/v 2-Propanol, 20% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.50 Å R-free 0.203
5S9P CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH 9-benzyl-2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9H-carbazole-4-carboxamide 提交 2021-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 YW4 9-benzyl-2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9H-carbazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；1%(w/v) Tryptone, 50mM HEPES, pH 7.0, 20%(w/v) PEG3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.236
5S9P CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH 9-benzyl-2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9H-carbazole-4-carboxamide 提交 2021-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 YW4 9-benzyl-2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9H-carbazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；1%(w/v) Tryptone, 50mM HEPES, pH 7.0, 20%(w/v) PEG3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.236
5S9P CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH 9-benzyl-2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9H-carbazole-4-carboxamide 提交 2021-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 44–168（125 aa）
未记录 YW4 9-benzyl-2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9H-carbazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；1%(w/v) Tryptone, 50mM HEPES, pH 7.0, 20%(w/v) PEG3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.236
5S9P CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH 9-benzyl-2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9H-carbazole-4-carboxamide 提交 2021-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 44–168（125 aa）
未记录 YW4 9-benzyl-2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9H-carbazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；1%(w/v) Tryptone, 50mM HEPES, pH 7.0, 20%(w/v) PEG3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.236
5S9Q CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH 2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-9H-carbazole-4-carboxamide 提交 2021-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 YW7 2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-9H-carbazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；200mM Sodium Formate, pH 7.0, 20%(w/v) PEG3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.212
5S9Q CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH 2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-9H-carbazole-4-carboxamide 提交 2021-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 YW7 2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-9H-carbazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；200mM Sodium Formate, pH 7.0, 20%(w/v) PEG3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.212
5S9Q CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH 2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-9H-carbazole-4-carboxamide 提交 2021-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 44–168（125 aa）
未记录 YW7 2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-9H-carbazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；200mM Sodium Formate, pH 7.0, 20%(w/v) PEG3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.212
5S9Q CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH 2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-9H-carbazole-4-carboxamide 提交 2021-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 44–168（125 aa）
未记录 YW7 2-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-7-(2-hydroxypropan-2-yl)-9-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-9H-carbazole-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；200mM Sodium Formate, pH 7.0, 20%(w/v) PEG3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.212
5S9R CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH BMS-986158, 2-{3-(1,4-dimethyl-1H-1,2,3-triazol-5-yl)-5-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-5H-pyrido[3,2-b]indol-7-yl}propan-2-ol 提交 2021-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 YWA 2-{3-(1,4-dimethyl-1H-1,2,3-triazol-5-yl)-5-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-5H-pyrido[3,2-b]indol-7-yl}propan-2-ol × 1 IOD IODIDE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；100mM Bis-Tris Propane, pH 7.82, 200mM sodium iodide, 20%(w/v) PEG3350, 10% (v/v) ethylene glycol
分辨率 1.85 Å R-free 0.231
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 333–460（128 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–460（128 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
5TI2 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 7635936 提交 2016-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
突变：NONE 7CJ 3-fluoro-N-[3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]benzene-1-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM 7635936
分辨率 1.65 Å R-free 0.181
5TI3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 17503468 提交 2016-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
突变：NONE EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 7CG 2,5-dibromo-N-[3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]benzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM 17503468
分辨率 1.70 Å R-free 0.194
5TI4 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 8841871 提交 2016-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
突变：NONE 7CM 3-chloro-4-fluoro-N-[3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]benzene-1-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM 8841871
分辨率 1.62 Å R-free 0.185
5TI5 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 8841880 提交 2016-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
突变：NONE 7CN 3-bromo-N-[3-(2-oxo-2,3-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)phenyl]benzene-1-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM 8841880
分辨率 1.83 Å R-free 0.214
5TI6 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 8841881 提交 2016-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
突变：NONE 7CO 2,6-difluoro-N-[3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]benzene-1-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM 8841881
分辨率 1.70 Å R-free 0.186
5TI7 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR 17528462 提交 2016-10-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 7CQ 5-bromo-2-methoxy-N-(3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl)benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM 17528462
分辨率 1.65 Å R-free 0.192
5U28 BRD4 first bromodomain (BD1) in complex with dual PI3 kinase inhibitor SF2523 提交 2016-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–180（137 aa）
未记录 82V 3-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-5-(morpholin-4-yl)-7H-thieno[3,2-b]pyran-7-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SCN THIOCYANATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；40% PEG3350 (w/v) and 0.2 M potassium thiocyanate (pH 7.5)
分辨率 1.80 Å R-free 0.223
5U2C BRD4 second bromodomain (BD2) in complex with dual PI3 kinase (PI3K) inhibitor SF2558HA 提交 2016-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 342–460（119 aa）
未记录 82Y N-hydroxy-4-[5-(morpholin-4-yl)-7-oxo-7H-thieno[3,2-b]pyran-3-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；2.5 M ammonium sulfate in 100 mM TRIS (pH 7.5)
分辨率 3.30 Å R-free 0.296
5U2C BRD4 second bromodomain (BD2) in complex with dual PI3 kinase (PI3K) inhibitor SF2558HA 提交 2016-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 342–460（119 aa）
未记录 82Y N-hydroxy-4-[5-(morpholin-4-yl)-7-oxo-7H-thieno[3,2-b]pyran-3-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；2.5 M ammonium sulfate in 100 mM TRIS (pH 7.5)
分辨率 3.30 Å R-free 0.296
5U2E BRD4 first bromodomain (BD1) in complex with dual PI3 kinase (PI3K) inhibitor SF2535 提交 2016-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–180（139 aa）
未记录 837 ethyl 4-[5-(morpholin-4-yl)-7-oxo-7H-thieno[3,2-b]pyran-3-yl]benzoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG3350 (w/v), 0.2 M ammonium chloride, 0.1 M TRIS
分辨率 1.99 Å R-free 0.240
5U2E BRD4 first bromodomain (BD1) in complex with dual PI3 kinase (PI3K) inhibitor SF2535 提交 2016-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 42–180（139 aa）
未记录 837 ethyl 4-[5-(morpholin-4-yl)-7-oxo-7H-thieno[3,2-b]pyran-3-yl]benzoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG3350 (w/v), 0.2 M ammonium chloride, 0.1 M TRIS
分辨率 1.99 Å R-free 0.240
5U2F BRD4 first bromodomain (BD1) in complex with dual PI3 kinase (PI3K) inhibitor SF2558HA 提交 2016-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–180（139 aa）
未记录 82Y N-hydroxy-4-[5-(morpholin-4-yl)-7-oxo-7H-thieno[3,2-b]pyran-3-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG3350 (w/v), 0.2 M ammonium chloride, 0.1 M TRIS
分辨率 2.52 Å R-free 0.257
5U2F BRD4 first bromodomain (BD1) in complex with dual PI3 kinase (PI3K) inhibitor SF2558HA 提交 2016-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 42–180（139 aa）
未记录 82Y N-hydroxy-4-[5-(morpholin-4-yl)-7-oxo-7H-thieno[3,2-b]pyran-3-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；25% PEG3350 (w/v), 0.2 M ammonium chloride, 0.1 M TRIS
分辨率 2.52 Å R-free 0.257
5UEO BRD4_BD2_A-1395017 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 87G N-[4-(2,4-difluorophenoxy)-3-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)phenyl]ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.85 Å R-free 0.215
5UEO BRD4_BD2_A-1395017 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 87G N-[4-(2,4-difluorophenoxy)-3-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)phenyl]ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.85 Å R-free 0.215
5UEP BRD4_BD2_A-581577 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 88P ethyl 3-methyl-4-oxo-4,5,6,7-tetrahydro-2H-isoindole-1-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris 7.0
分辨率 1.77 Å R-free 0.219
5UEQ BRD4_BD2_A-1390146 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 87M N-[3-(7-methyl-1-oxo-2,6-dihydro-1H-pyrrolo[3,4-d]pyridazin-5-yl)-4-phenoxyphenyl]ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.70 Å R-free 0.217
5UER BRD4_BD2_A-1359930 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 87P N-[3-(3-methyl-4-oxo-4,5,6,7-tetrahydro-2H-isoindol-1-yl)-4-phenoxyphenyl]methanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.87 Å R-free 0.243
5UES BRD4_BD2_A-1344772 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 87S 5-[2-(4-chlorophenoxy)phenyl]-2-methyl-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.62 Å R-free 0.225
5UET BRD4_BD2_A-1308586 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 87V 2-methyl-5-phenyl-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 2.29 Å R-free 0.254
5UEU BRD4_BD2_A-1107604 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 0S6 methyl [(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]acetate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 2.26 Å R-free 0.221
5UEU BRD4_BD2_A-1107604 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 0S6 methyl [(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]acetate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 2.26 Å R-free 0.221
5UEV BRD4_BD2_A-556343 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 88Y 1-[5-(2-aminophenyl)-2-methyl-1H-pyrrol-3-yl]ethan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.94 Å R-free 0.237
5UEX BRD4_BD2_A-1497627 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 89D 17-{[ethyl(dihydroxy)-lambda~4~-sulfanyl]amino}-11,13-difluoro-2-methyl-6,7,8,9-tetrahydrodibenzo[4,5:7,8][1,6]dioxacyclododecino[3,2-c]pyridin-3(2H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100mM NaCl, 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol, Tris PH 7.0
分辨率 2.29 Å R-free 0.279
5UEY BRD4_BD2_A-1412838 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 88M 5-[2-(2,4-difluorophenoxy)-5-{[ethyl(dihydroxy)-lambda~4~-sulfanyl]amino}phenyl]-4-ethoxy-1-methylpyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 2.41 Å R-free 0.310
5UEZ BRD4_BD2_A-1342843 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 89G 5-methoxy-2-methyl-6-(2-phenoxyphenyl)pyridazin-3(2H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5mM DTT Crystallization : 15 %(v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.51 Å R-free 0.204
5UF0 BRD4_BD2-A-35165 提交 2017-01-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 89J 2-methyl-5-(methylamino)-6-phenylpyridazin-3(2H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；Protein buffer : PH 7.5 10 mM HEPES 100 mM NaCl 5mM DTT Crystallization : 15 %(V/V) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.35 Å R-free 0.201
5ULA Crystal Structure of the First Bromodomain of Human BRD4 in Complex With Cyclic Vinylogous Amide Inhibitor MS402 提交 2017-01-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 5MJ 3-chloranyl-~{N}-(4-methoxyphenyl)-4-[(2-methyl-3-oxidanylidene-cyclopenten-1-yl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4.3 M SODIUM CHLORIDE, 0.1 M HEPES PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.178
5ULA Crystal Structure of the First Bromodomain of Human BRD4 in Complex With Cyclic Vinylogous Amide Inhibitor MS402 提交 2017-01-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 5MJ 3-chloranyl-~{N}-(4-methoxyphenyl)-4-[(2-methyl-3-oxidanylidene-cyclopenten-1-yl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4.3 M SODIUM CHLORIDE, 0.1 M HEPES PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.178
5UOO BRD4 bromodomain 2 in complex with CD161 提交 2017-02-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 333–460（128 aa） 片段：UNP residues 333-460
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 8FV 7-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-6-methoxy-2-methyl-4-(quinolin-4-yl)-9H-pyrimido[4,5-b]indole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293.15 K；60% peg 400, 0.1M Imidizole, 5mM ATP
分辨率 1.69 Å R-free 0.196
5UVS BRD4_BD2_A-1406537 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 8O1 4-{2-[(cyclopropylmethyl)amino]-5-(ethylsulfonyl)phenyl}-6-methyl-1,6-dihydro-7H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-7-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 2.15 Å R-free 0.247
5UVT BRD4_BD2_A-1454056 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 8NV 7-(cyclopropylmethyl)-2-methyl-10-[(propan-2-yl)sulfonyl]-2,4,6,7-tetrahydro-3H-2,4,7-triazadibenzo[cd,f]azulen-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.67 Å R-free 0.193
5UVU BRD4_BD2_A-1461028 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 8O4 7-(cyclopropylmethyl)-2-methyl-10-[(methylsulfonyl)methyl]-2,4,6,7-tetrahydro-3H-2,4,7-triazadibenzo[cd,f]azulen-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 MM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol, Tris PH 7.0
分辨率 1.66 Å R-free 0.212
5UVV BRD4 Bromodomain 2 with A-1457066 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 8NS 7-(cyclopropylmethyl)-10-(ethylsulfonyl)-2-methyl-2,4,6,7-tetrahydro-3H-2,4,7-triazadibenzo[cd,f]azulen-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.301
5UVV BRD4 Bromodomain 2 with A-1457066 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 8NS 7-(cyclopropylmethyl)-10-(ethylsulfonyl)-2-methyl-2,4,6,7-tetrahydro-3H-2,4,7-triazadibenzo[cd,f]azulen-3-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.301
5UVW BRD4_Bromodomain1-A1376855 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 57–165（109 aa） 片段：residues 57-165
未记录 8NG N-[4-(2,4-difluorophenoxy)-3-(6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)phenyl]ethanesulfonamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 2.14 Å R-free 0.226
5UVW BRD4_Bromodomain1-A1376855 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 57–165（109 aa） 片段：residues 57-165
未记录 8NG N-[4-(2,4-difluorophenoxy)-3-(6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)phenyl]ethanesulfonamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 2.14 Å R-free 0.226
5UVW BRD4_Bromodomain1-A1376855 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 57–165（109 aa） 片段：residues 57-165
未记录 8NG N-[4-(2,4-difluorophenoxy)-3-(6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)phenyl]ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 2.14 Å R-free 0.226
5UVX BRD4 Bromodomain 2 with A-1359643 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 8NM N-[3-(6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)-4-phenoxyphenyl]methanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.53 Å R-free 0.197
5UVX BRD4 Bromodomain 2 with A-1359643 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 8NM N-[3-(6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)-4-phenoxyphenyl]methanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.53 Å R-free 0.197
5UVY BRD4 Bromodomain 2 with A-1349391 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 8NJ 6-methyl-4-(2-phenoxyphenyl)-1,6-dihydro-7H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-7-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 2.25 Å R-free 0.262
5UVY BRD4 Bromodomain 2 with A-1349391 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 8NJ 6-methyl-4-(2-phenoxyphenyl)-1,6-dihydro-7H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-7-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 2.25 Å R-free 0.262
5UVZ BRD4 Bromodomain 2 with A-1354689 提交 2017-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：residues 352-457
未记录 8NP 3-methyl-5-(2-phenoxyphenyl)pyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Protein Buffer : 10 mM HEPES PH 7.5 100 mM NaCl 5 mM DTT Crystallization : 15 % (v/v) Ethanol Tris PH 7.0
分辨率 1.63 Å R-free 0.225
5V67 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH Volasertib 提交 2017-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 IBI N-{trans-4-[4-(cyclopropylmethyl)piperazin-1-yl]cyclohexyl}-4-{[(7R)-7-ethyl-5-methyl-8-(1-methylethyl)-6-oxo-5,6,7,8-tetrahydropteridin-2-yl]amino}-3-methoxybenzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM Volasertib
分辨率 1.78 Å R-free 0.208
5VBO CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH LRRK2-IN-1 提交 2017-03-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 4K4 2-[(2-methoxy-4-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]carbonyl}phenyl)amino]-5,11-dimethyl-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 55MM HEPES PH 7.5, 15% Jeffamine ED-2001 pH 7.0, 10% DMSO, 1 MM LRRK2-IN-1
分辨率 1.30 Å R-free 0.164
5VBP CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH RO3280 提交 2017-03-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 79C 4-[(9-cyclopentyl-7,7-difluoro-5-methyl-6-oxo-6,7,8,9-tetrahydro-5H-pyrimido[4,5-b][1,4]diazepin-2-yl)amino]-3-methoxy-N-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM RO3280
分辨率 1.83 Å R-free 0.207
5VBP CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH RO3280 提交 2017-03-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 79C 4-[(9-cyclopentyl-7,7-difluoro-5-methyl-6-oxo-6,7,8,9-tetrahydro-5H-pyrimido[4,5-b][1,4]diazepin-2-yl)amino]-3-methoxy-N-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM RO3280
分辨率 1.83 Å R-free 0.207
5VOM Benzopiperazine BET bromodomain inhibitor in complex with BD1 of Brd4 提交 2017-05-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 9GY 3-[(2S)-1-acetyl-4-(furan-2-carbonyl)-2-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinoxalin-6-yl]-N-methylbenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；30% PEG 4000, 0.1 M MES pH 6.8
分辨率 1.67 Å R-free 0.218
5VOM Benzopiperazine BET bromodomain inhibitor in complex with BD1 of Brd4 提交 2017-05-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 9GY 3-[(2S)-1-acetyl-4-(furan-2-carbonyl)-2-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinoxalin-6-yl]-N-methylbenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；30% PEG 4000, 0.1 M MES pH 6.8
分辨率 1.67 Å R-free 0.218
5VZS BRD4-BD1 in complex with Cpd19 (3-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-N-methyl-1-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide) 提交 2017-05-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：BRD4 Bromodomain-1, UNP residues 42-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 9U4 3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-N-methyl-1-(oxan-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 1.71 Å R-free 0.226
5VZS BRD4-BD1 in complex with Cpd19 (3-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-N-methyl-1-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide) 提交 2017-05-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 42–168（127 aa） 片段：BRD4 Bromodomain-1, UNP residues 42-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 9U4 3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-N-methyl-1-(oxan-4-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 1.71 Å R-free 0.226
5W55 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor JWG048 提交 2017-06-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：residues 42-168
未记录 X30 11-ethyl-2-({2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]phenyl}amino)-5-methyl-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；100mM Sodium Nitrate, 5% Ethylene Glycol, 18% (w/v) PEG3350
分辨率 1.35 Å R-free 0.195
5WA5 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor XMD11-50 提交 2017-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：Bromodomain residues 42-168
未记录 4K4 2-[(2-methoxy-4-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]carbonyl}phenyl)amino]-5,11-dimethyl-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；100mM Sodium Nitrate, 5% Ethylene Glycol, 18% (w/v) PEG3350
分辨率 1.17 Å R-free 0.158
5WMA N-terminal bromodomain of BRD4 in complex with PLX5981 提交 2017-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-terminal bromodomain (UNP residues 44-168)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 6JC 5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 7.5-8.0, 11% PEG3350, 0.2 M sodium chloride, 20% ethylene glycol
分辨率 1.40 Å R-free 0.176
5WMD N-terminal bromodomain of BRD4 in complex with OTX-015 提交 2017-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-terminal bromodomain (UNP residues 44-168)
突变：D96A 6JE 2-[(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]-N-(4-hydroxyphenyl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, pH 7.5, 19% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate
分辨率 1.27 Å R-free 0.170
5WMG N-terminal bromodomain of BRD4 in complex with OTX-015 提交 2017-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：N-terminal bromodomain (UNP residues 44-168)
突变：D96A EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 6JF 4-{6-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1S)-1-(pyridin-2-yl)ethyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-3-yl}benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, pH 7.5, 19% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate
分辨率 1.19 Å R-free 0.146
5WUU Complex structure of the first bromodomain of BRD4 with an inhibitor that containing a 2H-chromen-2-one ring 提交 2016-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa） 片段：UNP RESIDUES 44-167
未记录 7UU ~{N}-methyl-~{N}-[3-[(2-oxidanylidenechromen-4-yl)amino]propyl]thiophene-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15% glycerol, 4M sodium formate
分辨率 1.72 Å R-free 0.205
5XHY BRD4 bound with compound Bdi1 提交 2017-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa）
未记录 8FC ~{N}-(4-cyclopropyl-1,3,3-trimethyl-2-oxidanylidene-quinoxalin-6-yl)-4-methyl-benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly, PH 6.5
分辨率 1.98 Å R-free 0.285
5XI2 BRD4 bound with compound Bdi2 提交 2017-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa） 片段：UNP residues 44-166
未记录 8F9 (3~{R})-4-cyclopropyl-1,3-dimethyl-6-[[(1~{S})-1-(4-methylphenyl)ethyl]amino]-3~{H}-quinoxalin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.5M NAFORMATE, 5% GLYCEROL
分辨率 1.91 Å R-free 0.237
5XI3 BRD4 bound with compound Bdi3 提交 2017-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa） 片段：UNP residues 44-166
未记录 8F6 (3~{R})-4-cyclopropyl-1,3-dimethyl-6-[[(1~{R})-1-phenylethyl]amino]-3~{H}-quinoxalin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.5M NAFORMATE, 5% GLYCEROL
分辨率 1.67 Å R-free 0.218
5XI4 BRD4 bound with compound Bdi4 提交 2017-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa） 片段：UNP residues 44-166
未记录 8F0 (3~{S})-4-cyclopropyl-1,3-dimethyl-6-[[(1~{S})-1-(4-methylphenyl)ethyl]amino]-3~{H}-quinoxalin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.3 M NAFORMATE, 10% GLYCEROL
分辨率 1.49 Å R-free 0.253
5Y1Y Complex structure of nitroxoline with the first bromodomain of BRD4 提交 2017-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa） 片段：UNP residues 44-167
未记录 HNQ 5-nitroquinolin-8-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15% glycerol, 4M sodium formate
分辨率 1.91 Å R-free 0.224
5Y8C Crystal Structure Analysis of the BRD4 提交 2017-08-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa） 片段：UNP residues 44-166
未记录 NO3 NITRATE ION × 2 8P9 5-chloranyl-2-methoxy-N-(6-methoxy-3-methyl-1,2-benzoxazol-5-yl)benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly,pH 8.2
分辨率 1.42 Å R-free 0.214
5Y8W Crystal Structure Analysis of the BRD4 提交 2017-08-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 8PU 5-bromanyl-2-methoxy-N-(3-methyl-6-oxidanyl-1,2-benzoxazol-5-yl)benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 NO3 NITRATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly,pH8.2
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
5Y8Y Crystal Structure Analysis of the BRD4 提交 2017-08-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 NO3 NITRATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 8PX 5-bromanyl-2-methoxy-N-(6-methoxy-3-methyl-1,2-benzoxazol-5-yl)benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly,pH7
分辨率 1.87 Å R-free 0.247
5Y8Z Crystal Structure Analysis of the BRD4 提交 2017-08-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 8Q3 5-bromanyl-N-(3,6-dimethyl-1,2-benzoxazol-5-yl)-2-methoxy-benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NO3 NITRATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly,pH7.2
分辨率 1.84 Å R-free 0.184
5Y93 Crystal Structure Analysis of the BRD4 提交 2017-08-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 8Q9 2-[[5-[(5-bromanyl-2-methoxy-phenyl)sulfonylamino]-3-methyl-1,2-benzoxazol-6-yl]oxy]-N-(2-morpholin-4-ylethyl)ethanamide × 1 NO3 NITRATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly,pH8.3
分辨率 1.62 Å R-free 0.210
5Y94 Crystal Structure Analysis of the BRD4 提交 2017-08-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 8QC 5-bromanyl-2-methoxy-N-[3-methyl-6-(methylamino)-1,2-benzoxazol-5-yl]benzenesulfonamide × 1 NO3 NITRATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；20% PEG3350, 0.2M NaNO3, 0.1M HEPES, 10% EtGhly,pH8.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.223
5YOU Crystal structure of BRD4-BD1 bound with hjp64 提交 2017-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
突变：T43M 8XX (3~{R})-4-cyclopropyl-~{N},1,3-trimethyl-~{N}-(4-methylphenyl)-2-oxidanylidene-3~{H}-quinoxaline-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Naformate, 10% glycerol
分辨率 1.50 Å R-free 0.248
5YOV Crystal structure of BRD4-BD1 bound with hjp126 提交 2017-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
突变：T43M 8XR (3~{R})-4-cyclopentyl-~{N}-(2,4-dimethylphenyl)-1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-3~{H}-quinoxaline-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.6M Naformate, 10% glycerol
分辨率 1.45 Å R-free 0.231
5YQX Crystal Structure Analysis of the BRD4 提交 2017-11-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 E0K (2R)-2-(cyclopropylmethyl)-7-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-4H-1,4-benzoxazin-3-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M HEPES pH 7.5, 20% PEG 3350, 10% EtGhly, 0.2M NaCl
分辨率 1.82 Å R-free 0.219
5Z1R Crystal Structure Analysis of the BRD4 提交 2017-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain
未记录 EFL 5-bromo-N-(2,2-dimethyl-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-7-yl)-2-methoxybenzene-1-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 1 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.1M HEPES, 10% EtGhly, PH8.2
分辨率 1.62 Å R-free 0.193
5Z1S Crystal Structure Analysis of the BRD4(1) 提交 2017-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain
未记录 EFM 5-bromo-2-methoxy-N-(6-methoxy-2,2-dimethyl-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-7-yl)benzene-1-sulfonamide × 1 NO3 NITRATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.1M HEPES, 10% EtGhly, PH7.0
分辨率 1.42 Å R-free 0.220
5Z1T Crystal Structure Analysis of the BRD4(1) 提交 2017-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain
未记录 EFN 5-bromo-N-(6-hydroxy-2,2-dimethyl-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-7-yl)-2-methoxybenzene-1-sulfonamide × 1 NO3 NITRATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.1M HEPES, 10% EtGhly, PH7.5
分辨率 1.42 Å R-free 0.211
5Z5T The first bromodomain of BRD4 with compound BDF-2141 提交 2018-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa） 片段：first bromodomain
未记录 96R 2-amino-4-(1H-imidazol-1-yl)quinolin-8-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15% glycerol, 4M sodium formate
分辨率 1.99 Å R-free 0.243
5Z5U The first bromodomain of BRD4 with compound BDF-2254 提交 2018-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa） 片段：first bromodomain
未记录 96U 2-amino-4-(1H-imidazol-1-yl)quinoline-6,8-diol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15% glycerol, 4M sodium formate
分辨率 1.63 Å R-free 0.215
5Z5V The first bromodomain of BRD4 with compound BDF-1253 提交 2018-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa） 片段：BD1 domain
未记录 96X N-{8-hydroxy-4-[(1H-imidazol-1-yl)methyl]quinolin-2-yl}acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15% glycerol, 4M sodium formate
分辨率 1.66 Å R-free 0.219
5Z8G BRD4 Bromodomain 1 with an inhibitor 提交 2018-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromodomain 1
未记录 99L 1-ethyl-6-[(3R)-3-oxidanylpiperidin-1-yl]sulfonyl-benzo[cd]indol-2-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；4M sodium formate, 15% glycerol
分辨率 1.70 Å R-free 0.211
5Z8R BRD4 Bromodomain 1 with an inhibitor 提交 2018-02-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromodomain 1
未记录 99O 1-ethyl-6-[(3S)-3-oxidanylpiperidin-1-yl]sulfonyl-benzo[cd]indol-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；4M sodium formate, 15% glycerol
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
5Z8Z BRD4 Bromodomain 1 with an inhibitor 提交 2018-02-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromodomain 1
未记录 99R 6-[(3S)-3-azanylpiperidin-1-yl]sulfonyl-1-ethyl-benzo[cd]indol-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；4M sodium formate, 15% glycerol
分辨率 1.80 Å R-free 0.238
5Z90 BRD4 Bromodomain 1 with an inhibitor 提交 2018-02-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromodomain 1
未记录 99U 1-ethyl-6-pyrrolidin-1-ylsulfonyl-benzo[cd]indol-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；4M sodium formate, 15% glycerol
分辨率 1.80 Å R-free 0.264
5Z9C Solution NMR structures of BRD4 first bromodomain with small compound MMQO 提交 2018-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 53–168（116 aa）
未记录 MQO 8-methoxy-6-methylquinolin-4(1H)-one × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）null；压力 1
NMR样品组成 100 mM NACL, 10 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5Z9K BRD4 Bromodomain 1 with an inhibitor 提交 2018-02-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromodomain 1
未记录 99X 1-ethyl-6-[(2R)-2-(hydroxymethyl)pyrrolidin-1-yl]sulfonyl-benzo[cd]indol-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；4M sodium formate, 15% glycerol
分辨率 1.89 Å R-free 0.258
6AFR Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with 5-((4-fluoro-1H-imidazol-1-yl)methyl)quinolin-8-ol 提交 2018-08-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 9E3 5-[(4-fluoranylimidazol-1-yl)methyl]quinolin-8-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；289.15 K；The protein was concentrated to 8-10 mg mL-1 in the buffer containing 20mM HEPES, pH7.4, 100mM NaCl and 1mM DTT. The apo crystals of BRD4_BD1 were harvested by using sitting drop vapor-diffusion method in 4M sodium formate and 15% glycerol at 289.15K. Then the apo crystals were soaked into reservoir solution containing 1mM compound for 7 days.
分辨率 2.00 Å R-free 0.268
6AJV Crystal structure of BRD4 in complex with isoliquiritigenin and DMSO (Cocktail No. 3) 提交 2018-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 3 HCC 2',4,4'-TRIHYDROXYCHALCONE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；4M sodium formate, 0.1M tris-HCl pH 8.0
分辨率 1.45 Å R-free 0.227
6AJW Crystal structure of BRD4 in complex with DMSO (Cocktail No. 4) 提交 2018-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；4M sodium formate, 0.1M tris-HCl pH 8
分辨率 1.40 Å R-free 0.228
6AJX Crystal structure of BRD4 in complex with isoliquiritigenin in the absence of DMSO 提交 2018-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 HCC 2',4,4'-TRIHYDROXYCHALCONE × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4M sodium formate, 0.1M tris-HCl pH 8
分辨率 1.89 Å R-free 0.237
6AJY Crystal structure of BRD4 in complex with 2',4'-dihydroxy-2-methoxychalcone 提交 2018-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 A0R 2',4'-dihydroxy-2-methoxychalcone × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；4M sodium formate, 0.1M tris-HCl pH 8
分辨率 1.60 Å R-free 0.220
6AJZ Joint nentron and X-ray structure of BRD4 in complex with colchicin 提交 2018-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 1 NA SODIUM ION × 1 实验方法未声明
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.9M sodium formate, 17mM Tris, 83mM Tris-HCl in D2O
分辨率未提供
6BN7 Crystal structure of DDB1-CRBN-BRD4(BD1) complex bound to dBET23 PROTAC. 提交 2017-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 42–168（127 aa）
突变：T43M ZN ZINC ION × 1 RN3 methyl {(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2-[(8-{[({2-[(3S)-2,6-dioxopiperidin-3-yl]-1,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}oxy)acetyl]amino}octyl)carbamoyl]-3,9-dimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl}acetate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；9% (w/v) PEG20K, 18% (v/v) PEG MME 550, 0.09M BICINE pH8.5, 9% Silver bullet B5 (0.33% w/v 2,7-Naphthalenedisulfonic acid disodium salt, 0.33% w/v Azelaic acid, 0.33% w/v trans-Cinnamic acid, 0.02 M HEPES sodium pH 6.8)
分辨率 3.50 Å R-free 0.256
6BN8 Crystal structure of DDB1-CRBN-BRD4(BD1) complex bound to dBET55 PROTAC. 提交 2017-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 42–168（127 aa）
突变：T43M, D145A ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；9% PEG20K, 18% PEG MME 550, 0.09M BICINE pH8.5, 9% Silver bullet G4 (0.16% w/v 3-Indolebutyric acid, 0.16% w/v Hexadecanedioic acid, 0.16% w/v Oxamic acid, 0.16% w/v Pyromellitic acid, 0.16% w/v Sebacic acid, 0.16% w/v Suberic acid, 0.02 M HEPES sodium pH 6.8)
分辨率 3.99 Å R-free 0.333
6BN9 Crystal structure of DDB1-CRBN-BRD4(BD1) complex bound to dBET70 PROTAC 提交 2017-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 42–168（127 aa） 片段：residues 42-168
突变：T43M ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；10% (w/v) PEG20K, 20% (v/v) PEG MME 550, 0.1M BICINE pH8.5, Silver Bullet F2 (0.2% w/v D-Fructose 1,6-bisphosphate trisodium salt hydrate, 0.2% w/v Glycerol phosphate disodium salt hydrate, 0.2% w/v L-O-Phosphoserine, 0.2% w/v O-Phospho-L-tyrosine, 0.2% w/v Phytic acid sodium salt hydrate, 0.02 M HEPES sodium pH 6.8)
分辨率 4.38 Å R-free 0.301
6BNB Crystal structure of DDB1-CRBN-BRD4(BD1) complex bound to dBET57 PROTAC 提交 2017-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 42–168（127 aa） 片段：residues 42-168
突变：T43M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.34M NaH2PO4, 0.33M K2HPO4
分辨率 6.34 Å R-free 0.381
6BNH Solution NMR structures of BRD4 ET domain with JMJD6 peptide 提交 2017-11-16 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 601–683（83 aa） 片段：ET domain residues 601-683
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 1
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM [U-100% 2H] DTT, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 10 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
6BOY Crystal structure of DDB1-CRBN-BRD4(BD1) complex bound to dBET6 PROTAC. 提交 2017-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 42–168（127 aa） 片段：residues 42-168
突变：T43M ZN ZINC ION × 1 RN6 2-[(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]-N-(8-{[({2-[(3S)-2,6-dioxopiperidin-3-yl]-1,3-dioxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}oxy)acetyl]amino}octyl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；9% (w/v) PEG20K, 18% (v/v) PEG MME 550, 0.09M BICINE pH8.5, 9% (v/v) Silver bullet D11 (0.25% w/v 2,6-Naphthalenedisulfonic acid disodium salt, 0.25% w/v 4-Aminobenzoic acid, 0.25% w/v 5-Sulfosalicylic acid dihydrate, 0.25% w/v Naphthalene-1,3,6-trisulfonic acid trisodium salt hydrate, 0.02 M HEPES sodium pH 6.8)
分辨率 3.33 Å R-free 0.234
6C7Q BRD4 BD2 in complex with compound CE277 提交 2018-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 333–460（128 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EO1 7-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-6-methoxy-2-methyl-N-(1-methyl-1H-indazol-3-yl)-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；50-75% peg 400, 0.1M Imidizole, pH 8.0
分辨率 1.51 Å R-free 0.225
6C7R BRD4 BD1 in complex with compound CF53 提交 2018-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–165（122 aa）
未记录 EO4 N-(3-cyclopropyl-1-methyl-1H-pyrazol-5-yl)-7-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-6-methoxy-2-methyl-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；20% peg 3350, 0.2M Potassium Chloride
分辨率 1.50 Å R-free 0.241
6CD4 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor JWG046 提交 2018-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：residues 44-168
未记录 EX1 2-({2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]phenyl}amino)-5-methyl-11-(propan-2-yl)-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；100mM Sodium Nitrate, 5% Ethylene Glycol, 18% (w/v) PEG3350
分辨率 1.23 Å R-free 0.168
6CD5 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor XMD17-26 提交 2018-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：residues 44-168
未记录 R4L 11-cyclopentyl-2-[[2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidin-1-yl]carbonyl-phenyl]amino]-5-methyl-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；100mM Sodium Nitrate, 5% Ethylene Glycol, 18% (w/v) PEG3350
分辨率 1.58 Å R-free 0.193
6CIS Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor JWG047 提交 2018-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa） 片段：residues 44-166
未记录 X26 11-cyclopentyl-5-methyl-2-({4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]-2-[(propan-2-yl)oxy]phenyl}amino)-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100mM Sodium Nitrate, 5% Ethylene Glycol, 18% (w/v) PEG3350
分辨率 1.51 Å R-free 0.216
6CIY Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor JWG069 提交 2018-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：residues 44-168
未记录 F3J 11-cyclobutyl-2-({2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]phenyl}amino)-5-methyl-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100mM Sodium Nitrate, 5% Ethylene Glycol, 18% (w/v) PEG3350
分辨率 1.68 Å R-free 0.207
6CJ1 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor JWG071 提交 2018-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa） 片段：residues 44-166
未记录 F2S 11-[(2R)-butan-2-yl]-2-({2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]phenyl}amino)-5-methyl-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 FND 11-[(2S)-butan-2-yl]-2-({2-methoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]phenyl}amino)-5-methyl-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NO3 NITRATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100mM Sodium Nitrate, 5% Ethylene Glycol, 18% (w/v) PEG3350
分辨率 1.53 Å R-free 0.192
6CJ2 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor JWG056 提交 2018-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–166（125 aa） 片段：residues 42-166
未记录 X27 2-{[3-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-5-methyl-11-(propan-2-yl)-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100mM Sodium Nitrate, 5% Ethylene Glycol, 18% (w/v) PEG3350
分辨率 1.47 Å R-free 0.214
6CKR Crystal Structure of BRD4 with QC4956 提交 2018-02-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 F5V N-{3-[2-methyl-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-4-yl]phenyl}methanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15% PEG3350, 50 mM HEPES, pH 7.5
分辨率 1.62 Å R-free 0.238
6CKR Crystal Structure of BRD4 with QC4956 提交 2018-02-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 F5V N-{3-[2-methyl-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-4-yl]phenyl}methanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15% PEG3350, 50 mM HEPES, pH 7.5
分辨率 1.62 Å R-free 0.238
6CKS Crystal Structure of BRD4 with QC4956 提交 2018-02-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 F5Y 4-[5-(ethylsulfonyl)-2-methoxyphenyl]-2-methyl-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)isoquinolin-1(2H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG6000, 50 mM TRIS, pH 7.7, 5% ethylene glycol
分辨率 1.72 Å R-free 0.211
6CZU BRD4(BD1) complexed with 3219 提交 2018-04-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–170（129 aa）
未记录 FP7 5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-({4-[(1R)-1-hydroxyethyl]phenyl}methyl)pyridin-2(1H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；297 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 25% PEG 3350
分辨率 1.47 Å R-free 0.194
6CZV BRD4(BD1) complexed with 2759 提交 2018-04-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–170（129 aa）
未记录 FOY 1-benzyl-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)pyridin-2(1H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；297 K；0.2 M Potassium Fluoride, 8% (w/v) PEG 3,350
分辨率 1.88 Å R-free 0.226
6DJC Crystal structure of human Bromodomain-containing protein 4 (BRD4) bromodomain with MS645 提交 2018-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–173（130 aa）
链 B 44–173（130 aa）
未记录 CF6 N,N'-(decane-1,10-diyl)bis{2-[(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]acetamide} × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 1.46 Å R-free 0.176
6DL2 BRD4 bromodomain 1 in complex with HYB157 提交 2018-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 GUJ 3-benzyl-2,9-dimethyl-4H,6H-thieno[2,3-e][1,2,4]triazolo[3,4-c][1,4]oxazepine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；16% Peg 3350, 0.2 M Potassium Chloride
分辨率 1.47 Å R-free 0.216
6DMJ A multiconformer ligand model of inhibitor 53W bound to CREB binding protein bromodomain 提交 2018-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 53W 5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-2-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]-1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-1H-benzimidazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350
分辨率 1.15 Å R-free 0.194
6DML A multiconformer ligand model of 3,5 dimethylisoxaxole bound to the bromodomain of human BRD4 提交 2018-06-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 9BM 4-((2-(tert-butyl)phenyl)amino)-7-(3,5-dimethylisoxazol-4-yl)-6-methoxy-1,5-naphthyridine-3-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG3350, 0.2M NANO3, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH8.5
分辨率 1.50 Å R-free 0.192
6DNE Crystal structure of human Bromodomain-containing protein 4 (BRD4) bromodomain with MS660 提交 2018-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–477（434 aa）
未记录 H1V N,N'-[ethane-1,2-diylbis(oxyethane-2,1-diyl)]bis{2-[(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]acetamide} × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；30% PEG 4000 0.1M TrisHCl pH8.5 0.2M Mg Chloride
分辨率 2.96 Å R-free 0.285
6DNE Crystal structure of human Bromodomain-containing protein 4 (BRD4) bromodomain with MS660 提交 2018-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–477（434 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；30% PEG 4000 0.1M TrisHCl pH8.5 0.2M Mg Chloride
分辨率 2.96 Å R-free 0.285
6DUV Crystal structure of the second bromodomain of human BRD4 in complex with MS417 inhibitor 提交 2018-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 347–458（112 aa） 片段：BRD4 second bromodomain
未记录 0S6 methyl [(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]acetate × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 10.5；290 K；2.0 Ammonium Sulfate, 0.2 M Lithium Sulfate, CAPS pH10.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.188
6DUV Crystal structure of the second bromodomain of human BRD4 in complex with MS417 inhibitor 提交 2018-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 347–458（112 aa） 片段：BRD4 second bromodomain
未记录 0S6 methyl [(6S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]acetate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 10.5；290 K；2.0 Ammonium Sulfate, 0.2 M Lithium Sulfate, CAPS pH10.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.188
6E4A Crystal structure of human BRD4(1) in complex with CN750 提交 2018-07-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–170（127 aa）
未记录 HRY 5-(4-{[(3-chlorophenyl)methyl]amino}-2-{4-[2-(dimethylamino)ethyl]piperazin-1-yl}quinazolin-6-yl)-1-methylpyridin-2(1H)-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；297 K；100 mM TrisHCl pH 8.5, 25% PEG 3350
分辨率 1.26 Å R-free 0.189
6E4A Crystal structure of human BRD4(1) in complex with CN750 提交 2018-07-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–170（127 aa）
未记录 HRY 5-(4-{[(3-chlorophenyl)methyl]amino}-2-{4-[2-(dimethylamino)ethyl]piperazin-1-yl}quinazolin-6-yl)-1-methylpyridin-2(1H)-one × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；297 K；100 mM TrisHCl pH 8.5, 25% PEG 3350
分辨率 1.26 Å R-free 0.189
6FFD Human BRD4 C-terminal bromodomain with 1-(4-(3-methylbenzyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl)ethanone 提交 2018-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 347–463（117 aa） 片段：UNP residues 347-463
未记录 D7T 1-(4-(3-methylbenzyl)-3,4-dihydroquinoxalin-1(2H)-yl)ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M morpheus buffer1, pH 6.5, 30% morpheus EDO_P8K, 0.12M Morpheus alchol mixture
分辨率 1.83 Å R-free 0.253
6FNX FIRST DOMAIN OF HUMAN BROMODOMAIN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR F1 提交 2018-02-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 DYZ 7-ethyl-3-(phenylmethyl)purine-2,6-dione × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；292 K；5mM of #F1 inhibitor (in DMSO) final concentration. Ratio 1:1 (protein:precipitant). 20mg/mL of BRD4(BD1) protein. 0.25M AmSO4; 0.1M NaCl; 0,1M Tris pH 8.5; 19% (w/v) PEG3350. Cryoprotectant: 10 % (w/v) ethylene glycol.
分辨率 1.19 Å R-free 0.276
6FO5 FIRST DOMAIN OF HUMAN BROMODOMAIN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR #17 提交 2018-02-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 DZH ~{N}-[[4-[[7-ethyl-2,6-bis(oxidanylidene)purin-3-yl]methyl]phenyl]methyl]-2-oxidanylidene-1,3,4,5-tetrahydro-1-benzazepine-7-sulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.5；292 K；2.5mM of #17 inhibitor (in DMSO) final concentration. Ratio 1:1 (protein:precipitant. 12mg/mL of BRD4(BD1) protein. Precipitant agent: 0.3M NaNO3; 0.1M NaCl; 22% (w/v) PEG3350; 10% (w/v) ethylene glycol. Cryoprotectant: 10 % (w/v) glycerol.
分辨率 0.95 Å R-free 0.154
6FSY Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a 3,5-dimethylisoxazol ligand 提交 2018-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 E5Q 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-[(~{R})-oxidanyl(pyridin-3-yl)methyl]phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；20 % PEG 3350 and 0.1 M citrate pH 5.5
分辨率 1.34 Å R-free 0.200
6FT3 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a 3,5-dimethylisoxazol ligand 提交 2018-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 E5T 3-[(~{R})-cyclopropyl(oxidanyl)methyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M K(citrate) 0.1 M cacodylate pH 6.5
分辨率 1.28 Å R-free 0.184
6FT4 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a 3,5-dimethylisoxazol ligand 提交 2018-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 E5W 3-[[4,4-bis(fluoranyl)piperidin-1-yl]methyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；30% PEG1000 0.1M MMT pH 6.0
分辨率 1.34 Å R-free 0.217
6G0D BRD4 (BD1) in complex with APSC-derived ligands (e.g. LY294002) 提交 2018-03-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：BD1
突变：T43M EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 LY2 2-MORPHOLIN-4-YL-7-PHENYL-4H-CHROMEN-4-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M sodium fluoride, 20 % (w/v) PEG 3350, cryo protection: 20% ethylene glycol
分辨率 1.31 Å R-free 0.236
6G0E BRD4 (BD1) in complex with APSC-derived ligands 提交 2018-03-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：BD1
突变：T43M EGN 4-[2-(4-cyclohexylpiperazin-4-ium-1-yl)-2-oxidanylidene-ethyl]sulfanyl-1-ethyl-quinolin-2-one × 1 FMT FORMIC ACID × 2 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；277 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6, 3.5 M sodium formate, cryo protection: 20% glycero
分辨率 1.61 Å R-free 0.261
6G0F BRD4 (BD1) in complex with docking-derived ligand 提交 2018-03-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：BD1
突变：T43M EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 EGH (4~{R})-4-(5-bromanyl-2-fluoranyl-phenyl)-5,6,7-trimethoxy-3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；1.6 M Tri-sodium citrate pH 6.5, cryo protection: 20% ethylene glycol
分辨率 1.62 Å R-free 0.229
6G0G BRD4 (BD1) in complex with APSC-derived ligands (e.g. sulfasalazine) 提交 2018-03-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：BD1
突变：T43M EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 FMT FORMIC ACID × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 SAS 2-HYDROXY-(5-([4-(2-PYRIDINYLAMINO)SULFONYL]PHENYL)AZO)BENZOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；0.1 M sodium acetate anhydrous pH 4.6 and 3.5 M sodium formate, cryo protection: 25% ethylene glycol
分辨率 1.48 Å R-free 0.220
6G0H BRD4 (BD1) in complex with APSC-derived ligands (e.g. SSLH01 a sulfasalazine derivate) 提交 2018-03-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：BD1
突变：T43M EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EGE 4-azanyl-2-oxidanyl-5-[(~{E})-[4-(pyridin-2-ylsulfamoyl)phenyl]diazenyl]benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；0.1 M sodium acetate anhydrous pH 4.6 and 3.5 M sodium formate, cryo protection: 25% ethylene glycol
分辨率 1.91 Å R-free 0.226
6G0O Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with an acetylated ATRX peptide (K1030ac/K1033ac) 提交 2018-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20.0 % PEG 6K 10.0 % EtGly 0.1 M HEPES pH 7.0 0.2 M LiCl
分辨率 1.40 Å R-free 0.166
6G0P Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with an acetylated E2F1 peptide (K117ac/K120ac) 提交 2018-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20.0 % PEG3350 10.0 % EtGly 0.2 M NaCHO
分辨率 1.30 Å R-free 0.147
6G0Q Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with an acetylated GATA1 peptide (K312ac/K315ac) 提交 2018-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；30.0% PEG 1k 0.1M SPG pH 8.0
分辨率 1.40 Å R-free 0.178
6G0R Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with an acetylated POLR2A peptide (K775ac/K778ac) 提交 2018-03-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20.0 % PEG 6K 10.0 % EtGly 0.1 M HEPES pH 7.0 0.1 M MgCl2
分辨率 1.25 Å R-free 0.175
6G0S Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with an acetylated SIRT7 peptide (K272ac/K275ac) 提交 2018-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 42–168（127 aa）
链 B 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；20.0 % PEG3350 10.0 % EtGly 0.1 M bis-tris-propane pH 8.5 0.2M NaOOCCH3
分辨率 1.48 Å R-free 0.209
6HDQ N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH : 8-(((1R,2R,3R,5S)-2-(2-(4,4-difluorocyclohexyl)ethyl)-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-yl)amino)-3-methyl-5-(5-methylpyridin-3-yl)-1,7-naphthyridin-2(1H)-one 提交 2018-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 FZE 8-(((1R,2R,3R,5S)-2-(2-(4,4-difluorocyclohexyl)ethyl)-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-yl)amino)-3-methyl-5-(5-methylpyridin-3-yl)-1,7-naphthyridin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；20% PEG6K, 0.2M LiCl, 0.1M tris pH8 at 20C
分辨率 1.70 Å R-free 0.241
6HOV Crystal Structure of BRD4 first bromodomain in complex with ferulic acid 提交 2018-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain (residues 44-168)
突变：First two residues SM derive from the expression tag EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 FER 3-(4-HYDROXY-3-METHOXYPHENYL)-2-PROPENOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；16% PEG 3350, 20% ethylene glycol
分辨率 1.85 Å R-free 0.216
6I7X Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with RT53 提交 2018-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 H7B 2-[(4~{S})-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4~{H}-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepin-4-yl]-1-[4-(dimethylamino)piperidin-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG3350 10% ethylene glycol 0.1M bis-tris-propane pH 8.5 0.02M sodium/potassium phosphate
分辨率 1.20 Å R-free 0.137
6I7Y Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with RT56 提交 2018-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 H7E [1-[4-[2-[(4~{S})-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4~{H}-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepin-4-yl]ethanoylamino]phenyl]piperidin-4-yl]-trimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350 10% ethylene glycol 0.1M bis-tris-propane pH 7.5 0.2M sodium sulfate
分辨率 1.00 Å R-free 0.131
6IN1 Crystal structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with 18-Crown-6 提交 2018-10-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 LOC N-[(7S)-1,2,3,10-tetramethoxy-9-oxo-6,7-dihydro-5H-benzo[d]heptalen-7-yl]ethanamide × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4 M sodium formate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.0
分辨率 1.50 Å R-free 0.188
6JI3 BRD4-BD1 bound with ligand 103 提交 2019-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa）
未记录 BW6 (3~{R})-4-cyclopropyl-1,3-dimethyl-6-(1~{H}-pyrrol-2-yl)-3~{H}-quinoxalin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；3.2-3.8 M NAFORMATE,10% GLYCEROL
分辨率 2.20 Å R-free 0.258
6JI4 brd4-bd1 bound with ligand 138 提交 2019-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa）
未记录 BOF (3R)-4-cyclopropyl-1,3-dimethyl-6-[5-methyl-4-(4-methylphenyl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；3.2-3.8 M NAFORMATE,10% GLYCEROL
分辨率 1.60 Å R-free 0.231
6JI5 brd4-bd1 bound with ligand 167 提交 2019-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa）
未记录 BQ0 (3R)-4-cyclopentyl-6-[1-(2,4-dimethylphenyl)-3-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-1,3-dimethyl-3,4-dihydroquinoxalin-2(1H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；293 K；3.2-3.8 M NAFORMATE,10% GLYCEROL
分辨率 2.00 Å R-free 0.262
6JJ3 BRD4 in complex with 138A 提交 2019-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 BS6 2-methoxy-N-[2-methyl-6-(4-methylpiperazin-1-yl)-3-oxidanylidene-2,7-diazatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaen-9-yl]benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；4.0M HCOONa
分辨率 1.72 Å R-free 0.305
6JJ5 BRD4 in complex with 259 提交 2019-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 C6X 3-((1-methyl-2-oxo-1,2,2a1,5a-tetrahydro-6H-pyrido[3',2':6,7]azepino[4,3,2-cd]isoindol-6-yl)methyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；4.0M HCOONa
分辨率 1.20 Å R-free 0.203
6JJ6 BRD4 in complex with 500 提交 2019-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 C89 1-methyl-6-(3-(4-methylpiperazine-1-carbonyl)benzyl)-1,2a1,5a,6-tetrahydro-2H-pyrido[3',2':6,7]azepino[4,3,2-cd]isoindol-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；4.0M HCOONa
分辨率 1.40 Å R-free 0.201
6JJB BRD4 in complex with ZZM1 提交 2019-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 BT0 2-methoxy-N-(1-methyl-2-oxidanylidene-benzo[cd]indol-6-yl)benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；4.0M HCOONa
分辨率 1.51 Å R-free 0.228
6KEC Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 (BD1) in complex with 4-ethoxy-5,16-dimethoxy-11-methyl-2-oxa-11-azatetracyclo[8.6.1.03,8.013,17]heptadeca-1(17),3,5,7,9,13,15-heptaen-12-one 提交 2019-07-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 D9C 4-ethoxy-5,16-dimethoxy-11-methyl-2-oxa-11-azatetracyclo[8.6.1.03,8.013,17]heptadeca-1(17),3,5,7,9,13,15-heptaen-12-one × 1 FMT FORMIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；287 K；6 M sodium formate, 10% glycerol
分辨率 1.35 Å R-free 0.201
6KED BRD4 Bromodomain1 with an inhibitor 提交 2019-07-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 D7R 6-[2-[2,4-bis(fluoranyl)phenoxy]-5-(methylsulfonylmethyl)pyridin-3-yl]-8-methyl-2H-pyrrolo[1,2-d][1,2,4]triazin-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；4M Sodium formate, 15% glycerol
分辨率 2.55 Å R-free 0.379
6KEE Crystal structure of BRD4 Bromodomain1 with an inhibitor 提交 2019-07-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 D7U 6-[2-[2,4-bis(fluoranyl)phenoxy]-5-(methylsulfonylmethyl)pyridin-3-yl]-8-methyl-2H-pyrrolo[1,2-a]pyrazin-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；4M Sodium Formate, 15% glycerol
分辨率 2.12 Å R-free 0.274
6KEF BRD4 Bromodomain1 with an inhibitor 提交 2019-07-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 D7X N-[3-(8-methyl-1-oxidanylidene-2H-pyrrolo[1,2-a]pyrazin-6-yl)-4-phenoxy-phenyl]methanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；4M Sodium Formate, 15% glycerol
分辨率 2.44 Å R-free 0.345
6KEG BRD4 Bromodomain1 with an inhibitor 提交 2019-07-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 D89 6-[2-[2,4-bis(fluoranyl)phenoxy]-5-(ethylsulfonylmethyl)pyridin-3-yl]-8-methyl-4H-pyrrolo[1,2-a]pyrazin-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；4M sodium formate, 15% glycerol
分辨率 2.23 Å R-free 0.330
6KEH Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 (BD1) in complex with 6,16-dimethoxy-11-methyl-2-oxa-11-azatetracyclo[8.6.1.03,8.013,17]heptadeca-1(17),3,5,7,9,13,15-heptaen-12-one 提交 2019-07-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 4 D6R 6,16-dimethoxy-11-methyl-2-oxa-11-azatetracyclo[8.6.1.03,8.013,17]heptadeca-1(17),3,5,7,9,13,15-heptaen-12-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；287 K；6 M Sodium formate, 10% Glycerol
分辨率 1.55 Å R-free 0.230
6KEI Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 (BD1) in complex with 16-methoxy-11-methyl-6-[(pyridin-2-yl)methoxy]-2-oxa-11-azatetracyclo[8.6.1.03,8.013,17]heptadeca-1(16),3,5,7,9,13(17),14-heptaen-12-one 提交 2019-07-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 D6U 16-methoxy-11-methyl-6-[(pyridin-2-yl)methoxy]-2-oxa-11-azatetracyclo[8.6.1.03,8.013,17]heptadeca-1(16),3,5,7,9,13(17),14-heptaen-12-one × 1 FMT FORMIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；287 K；6 M Sodium formate, 10% Glycerol
分辨率 1.45 Å R-free 0.231
6KEJ Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 (BD1) in complex with 6-[2-(diethylamino)ethoxy]-16-methoxy-11-methyl-2-oxa-11-azatetracyclo[8.6.1.03,8.013,17]heptadeca-1(17),3,5,7,9,13,15-heptaen-12-one 提交 2019-07-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 D7F 6-[2-(diethylamino)ethoxy]-16-methoxy-11-methyl-2-oxa-11-azatetracyclo[8.6.1.03,8.013,17]heptadeca-1(17),3,5,7,9,13,15-heptaen-12-one × 1 FMT FORMIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；287 K；6 M Sodium Formate, 10% Glycerol
分辨率 1.85 Å R-free 0.242
6KEK Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 (BD1) in complex with 6-hydroxy-16-methoxy-11-methyl-2-oxa-11-azatetracyclo[8.6.1.03,8.013,17]heptadeca-1(16),3,5,7,9,13(17),14-heptaen-12-one 提交 2019-07-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 7 D7L 6-hydroxy-16-methoxy-11-methyl-2-oxa-11-azatetracyclo[8.6.1.03,8.013,17]heptadeca-1(16),3,5,7,9,13(17),14-heptaen-12-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；287 K；6 M sodium formate, 10% glycerol
分辨率 1.55 Å R-free 0.232
6KO2 Crystal Structure of BRD4-Brmo2 in complex with H2A.ZK4acK7ac peptide 提交 2019-08-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 351–457（107 aa） 片段：Bromo2 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1M Amino acids, 0.1M Buffer System 3, 50% v/v Precipitant Mix 4 (morpheus)
分辨率 1.50 Å R-free 0.185
6LG4 crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with compound BDF-1024 提交 2019-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 EC0 7-chloranyl-5-nitro-quinolin-8-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15% glycerol, 4M sodium formate
分辨率 1.85 Å R-free 0.238
6LG5 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with compound BDF-1038 提交 2019-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 EC3 1-[(5-chloranyl-8-oxidanyl-quinolin-7-yl)methyl]pyrrolidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15% glycerol, 4M sodium formate
分辨率 1.83 Å R-free 0.202
6LG6 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with compound BDF-1021 提交 2019-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 EC9 N-[8-oxidanyl-4-(pyridin-2-ylamino)quinolin-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15% glycerol, 4M sodium formate
分辨率 1.98 Å R-free 0.278
6LG7 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with compound BDF-2030 提交 2019-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 ECF 2-azanyl-6-fluoranyl-4-imidazol-1-yl-quinolin-8-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15% glycerol, 4M sodium formate
分辨率 1.83 Å R-free 0.235
6LG8 crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with compound BDF-2138 提交 2019-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 ECR 2-azanyl-5-fluoranyl-4-imidazol-1-yl-quinolin-8-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15% glycerol, 4M sodium formate
分辨率 1.58 Å R-free 0.197
6LG9 crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with compound BDF-2143 提交 2019-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 ECU 2-azanyl-7-bromanyl-4-imidazol-1-yl-quinolin-8-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10-15% glycerol, 4M sodium formate
分辨率 1.81 Å R-free 0.243
6LIH BRD4 BD1 bound with compound 10 提交 2019-12-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa）
未记录 EDF (3~{R})-1,3-dimethyl-6-[(4-phenylpyrimidin-2-yl)amino]-4-propan-2-yl-3~{H}-quinoxalin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7；289 K；protein concentration 10 mg/ML, 2.8-3.8M sodium formate, 10% glycerol
分辨率 1.62 Å R-free 0.212
6LIM BRD4-BD1 bound with compound 40 提交 2019-12-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa）
未记录 EE9 (3~{R})-6-[(4-isoquinolin-4-ylpyrimidin-2-yl)amino]-1,3-dimethyl-4-propan-2-yl-3~{H}-quinoxalin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7；289 K；10mg/ml, 2.8-3.8M sodium formate, glycerol 10%
分辨率 1.76 Å R-free 0.235
6MAU Crystal structure of human BRD4(1) in complex with CN210 (compound 19) 提交 2018-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–170（127 aa）
未记录 JBS 1-(4-{6-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-4-[(3S)-3-phenylmorpholin-4-yl]quinazolin-2-yl}-1H-pyrazol-1-yl)-2-methylpropan-2-ol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；276 K；1.4 M Sodium/Potassium Phosphate pH 8.2
分辨率 2.11 Å R-free 0.253
6MH1 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH HU-10, A 1,4,5-Trisubstituted Imidazole Analogue 提交 2018-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain, residues 44-168
未记录 JQP N-(3,5-dimethylphenyl)-4-[4-(4-fluorophenyl)-1-(piperidin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]pyrimidin-2-amine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM HU-10
分辨率 1.60 Å R-free 0.202
6MH1 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH HU-10, A 1,4,5-Trisubstituted Imidazole Analogue 提交 2018-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain, residues 44-168
未记录 JQP N-(3,5-dimethylphenyl)-4-[4-(4-fluorophenyl)-1-(piperidin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]pyrimidin-2-amine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 MG/ML BRD4, 5MM HEPES PH 7.5, 50MM SODIUM CHLORIDE, 0.5MM DTT, 50MM TRIS PH8.5, 0.1M AMMONIUM, SULFATE, 12.5% PEG 3,350, 10% DMSO, 1 MM HU-10
分辨率 1.60 Å R-free 0.202
6MH7 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SKT-68, a 1,4,5-trisubstituted imidazole analogue 提交 2018-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 JQY N-(3,4-dimethylphenyl)-4-[4-(4-fluorophenyl)-1-(piperidin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]pyrimidin-2-amine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 mg/mL BRD4, 5 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 50 mM Tris, pH 8.5, 0.1 M ammonium sulfate, 12.5% PEG3350, 10% DMSO, 1 mM SKT-68
分辨率 1.74 Å R-free 0.185
6MH7 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SKT-68, a 1,4,5-trisubstituted imidazole analogue 提交 2018-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 JQY N-(3,4-dimethylphenyl)-4-[4-(4-fluorophenyl)-1-(piperidin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]pyrimidin-2-amine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；12.5 mg/mL BRD4, 5 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM sodium chloride, 0.5 mM DTT, 50 mM Tris, pH 8.5, 0.1 M ammonium sulfate, 12.5% PEG3350, 10% DMSO, 1 mM SKT-68
分辨率 1.74 Å R-free 0.185
6MNL NMR solution structures of second bromodomain of BRD4 with FOXO3a peptide 提交 2018-10-02 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–460（128 aa） 片段：Bromo 2 domain, residues 333-460
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 1
NMR样品组成 100 mM sodium chloride, 10 mM sodium phosphate, 2 mM [U-100% 2H] DTT, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 100 mM sodium chloride, 10 mM sodium phosphate, 2 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
6P05 Bromodomain-containing protein 4 (BRD4) bromodomain 1 (BD1) complexed with compound 27 提交 2019-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 YF2 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(1-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；16-18% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 0.2M LiSO4
分辨率 1.54 Å R-free 0.180
6PRT Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 with N-methylpyrrolidin-2-one (NMP) derivative 10 (methyl [(3R)-1-methyl-5-oxopyrrolidin-3-yl]acetate) 提交 2019-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 OWA methyl [(3R)-1-methyl-5-oxopyrrolidin-3-yl]acetate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M sodium nitrate, 35% PEG3350, 6% v/v ethylene glycol
分辨率 1.30 Å R-free 0.166
6PS9 Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 with N-methylpyrrolidin-2-one (NMP) derivative 17 (5-{2-[(3R)-1-methyl-5-oxopyrrolidin-3-yl]ethyl}-2,3,4,5-tetrahydro-1H-pyrido[4,3-b]indol-1-one) 提交 2019-07-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 Y17 5-{2-[(3R)-1-methyl-5-oxopyrrolidin-3-yl]ethyl}-2,3,4,5-tetrahydro-1H-pyrido[4,3-b]indol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M sodium nitrate, 35% PEG3350, 6% v/v ethylene glycol
分辨率 1.21 Å R-free 0.164
6PSB Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 with N-methylpyrrolidin-2-one (NMP) derivative 18 (5-{[(3R)-1-methyl-5-oxopyrrolidin-3-yl]methyl}-2,3,4,5-tetrahydro-1H-pyrido[4,3-b]indol-1-one) 提交 2019-07-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 Y18 5-{[(3R)-1-methyl-5-oxopyrrolidin-3-yl]methyl}-2,3,4,5-tetrahydro-1H-pyrido[4,3-b]indol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M sodium nitrate, 35% PEG3350, 6% v/v ethylene glycol
分辨率 1.59 Å R-free 0.209
6Q3Y Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor 16i 提交 2018-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 HG5 (7~{R})-2-[[2-ethoxy-4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]amino]-7-ethyl-5-methyl-8-(phenylmethyl)-7~{H}-pteridin-6-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；30% pentaerythritol ethoxylate 15/4, 0.05 ammonium sulfate, 0.1M bis-tris pH6.5
分辨率 1.20 Å R-free 0.176
6Q3Y Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor 16i 提交 2018-12-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 42–168（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 HG5 (7~{R})-2-[[2-ethoxy-4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]amino]-7-ethyl-5-methyl-8-(phenylmethyl)-7~{H}-pteridin-6-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；30% pentaerythritol ethoxylate 15/4, 0.05 ammonium sulfate, 0.1M bis-tris pH6.5
分辨率 1.20 Å R-free 0.176
6Q3Z Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor 16k 提交 2018-12-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 HG8 (7~{R})-2-[[2-ethoxy-4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]amino]-7-ethyl-5-methyl-8-[(4-methylthiophen-2-yl)methyl]-7~{H}-pteridin-6-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG3350, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M bis-tris pH6.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.231
6Q3Z Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor 16k 提交 2018-12-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 HG8 (7~{R})-2-[[2-ethoxy-4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]amino]-7-ethyl-5-methyl-8-[(4-methylthiophen-2-yl)methyl]-7~{H}-pteridin-6-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG3350, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M bis-tris pH6.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.231
6RWJ Crystal Structure of BRD4(1) bound to inhibitor BUG0 (6) 提交 2019-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：FIRST BROMODOMAIN (UNP RESIDUES 44-168)
未记录 KLK ~{N},3-dimethyl-4-oxidanylidene-5,6,7,8-tetrahydro-2~{H}-cyclohepta[c]pyrrole-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；TRIS, PEG3350, NaCl
分辨率 1.40 Å R-free 0.181
6S25 Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with a benzodiazepine ligand 提交 2019-06-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 KSZ ~{tert}-butyl ~{N}-[3-[2-[(4~{S})-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4~{H}-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepin-4-yl]ethanoylamino]propyl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG6000 10% ethylene glycol 0.2M lithium chloride
分辨率 1.10 Å R-free 0.145
6S4B Crystal Structure of BRD4(1) bound to inhibitor BUX1 (8) 提交 2019-06-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 1 KUH ~{N}-[5-(diethylsulfamoyl)-2-methoxy-phenyl]-3-methyl-4-oxidanylidene-5,6,7,8-tetrahydro-2~{H}-cyclohepta[c]pyrrole-1-carboxamide × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG3350, NaCl, CaCl2, HEPES
分辨率 1.60 Å R-free 0.195
6S6K Crystal Structure of BRD4(1) bound to inhibitor BUX2 (9) 提交 2019-07-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 KXK ~{N}-[5-(azepan-1-ylsulfonyl)-2-methoxy-phenyl]-3-methyl-4-oxidanylidene-5,6,7,8-tetrahydro-2~{H}-cyclohepta[c]pyrrole-1-carboxamide × 1 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES, PEG3350, NaCl
分辨率 1.40 Å R-free 0.158
6SA2 Crystal Structure of BRD4(1) bound to inhibitor BUX3 (10) 提交 2019-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 2 L25 ~{N}-(2-methoxy-5-morpholin-4-ylsulfonyl-phenyl)-3-methyl-4-oxidanylidene-5,6,7,8-tetrahydro-2~{H}-cyclohepta[c]pyrrole-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；MMW PEG, NaCl
分辨率 1.50 Å R-free 0.185
6SA3 Crystal Structure of BRD4(1) bound to inhibitor BUX4 (13) 提交 2019-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 L2N ~{N}-[2-methoxy-5-(4-methylpiperazin-1-yl)sulfonyl-phenyl]-3-methyl-4-oxidanylidene-5,6,7,8-tetrahydro-2~{H}-cyclohepta[c]pyrrole-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；NaCl, MMW PEG
分辨率 1.80 Å R-free 0.231
6SAH Crystal Structure of BRD4(1) bound to inhibitor BUX5 (11) 提交 2019-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 L2W ~{N}-(2-methoxy-5-piperidin-1-ylsulfonyl-phenyl)-3-methyl-4-oxidanylidene-5,6,7,8-tetrahydro-2~{H}-cyclohepta[c]pyrrole-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；Index D6, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.50 Å R-free 0.169
6SAJ Crystal Structure of BRD4(1) bound to inhibitor BUX6 (12) 提交 2019-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 3 L2Z ~{N}-[2-methoxy-5-(2-oxa-6-azaspiro[3.3]heptan-6-ylsulfonyl)phenyl]-3-methyl-4-oxidanylidene-5,6,7,8-tetrahydro-2~{H}-cyclohepta[c]pyrrole-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES, PEG3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.180
6SB8 Crystal Structure of BRD4(1) bound to inhibitor BUX14 (7) 提交 2019-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 L45 ~{N}-[5-(diethylsulfamoyl)-2-oxidanyl-phenyl]-3-methyl-4-oxidanylidene-5,6,7,8-tetrahydro-2~{H}-cyclohepta[c]pyrrole-1-carboxamide × 1 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；NaCl, PEG3350, HEPES
分辨率 1.50 Å R-free 0.207
6SE4 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with (+)-JD1, an Organometallic BET Bromodomain Inhibitor 提交 2019-07-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 L8W (+)-JD1 × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；60% MPD, 0.1M MIB pH 8.0
分辨率 1.38 Å R-free 0.179
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 333–460（128 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–460（128 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6SWN N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH iBET-BD1 (GSK778) 提交 2019-09-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 GLU GLUTAMIC ACID × 1 LWB 4-[2-(methoxymethyl)-1-[(1~{R})-1-phenylethyl]-8-[[(3~{S})-pyrrolidin-3-yl]methoxy]imidazo[4,5-c]quinolin-7-yl]-3,5-dimethyl-1,2-oxazole × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG3350, 0.2M NaI, 0.1M BTP, 20C
分辨率 1.28 Å R-free 0.212
6SWQ N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH iBET-BD2 (GSK046) 提交 2019-09-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 LW5 4-acetamido-3-fluoranyl-~{N}-(4-oxidanylcyclohexyl)-5-[(1~{S})-1-phenylethoxy]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；25%w/v PEG1500, 0.1M SPG buffer, pH 6
分辨率 1.60 Å R-free 0.184
6TPX N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 1-((1-acetylpiperidin-4-yl)methyl)-2-(4-hydroxy-3,5-dimethylphenyl)-N-methyl-1H-benzo[d]imidazole-5-carboxamide 提交 2019-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 NUW 2-(3,5-dimethyl-4-oxidanyl-phenyl)-1-[(1-ethanoylpiperidin-4-yl)methyl]-~{N}-methyl-benzimidazole-5-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG6000, 0.2M NH4Cl, 0.1M tris pH8
分辨率 1.48 Å R-free 0.181
6TPY N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 1,3-dimethyl-5-(1-((tetrahydro-2H-pyran-4-yl)methyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)pyridin-2(1H)-one 提交 2019-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NUB 1,3-dimethyl-5-[1-(oxan-4-ylmethyl)benzimidazol-2-yl]pyridin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M BTP pH8.5, 20% PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.255
6TPZ N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 5-(1-(1,3-dimethoxypropan-2-yl)-5-morpholino-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)-1,3-dimethylpyridin-2(1H)-one 提交 2019-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NV2 5-[1-(1,3-dimethoxypropan-2-yl)-5-morpholin-4-yl-benzimidazol-2-yl]-1,3-dimethyl-pyridin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；of 0.1 PCTP pH 8.0, 25% v/v PEG1500
分辨率 1.30 Å R-free 0.218
6U0D Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor ZL0590 提交 2019-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 POJ N-[4-({(2S)-2-[(morpholin-4-yl)methyl]pyrrolidin-1-yl}sulfonyl)phenyl]-N'-[4-(trifluoromethyl)phenyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM HEPES, 15% PEG 3350 at pH 7.5
分辨率 1.43 Å R-free 0.223
6U6K BRD4-BD1 in complex with the cyclic peptide 3.1_3 提交 2019-08-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MMT 7.0 25 % w/v PEG 1500
分辨率 1.70 Å R-free 0.218
6U6L BRD4-BD2 in complex with the cyclic peptide 3.1_2 提交 2019-08-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 347–464（118 aa）
未记录 NH2 AMINO GROUP × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v PEG3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.242
6U72 BRD4-BD1 in complex with the cyclic peptide 3.1_2_AcK5toA 提交 2019-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 42–168（127 aa）
链 B 42–168（127 aa）
未记录 NH2 AMINO GROUP × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；5% v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.1 M HEPES pH 7.5, 10% w/v Polyethylene glycol 10,000
分辨率 2.30 Å R-free 0.266
6U74 BRD4-BD1 in complex with the cyclic peptide 3.1_2 提交 2019-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 42–168（127 aa）
链 C 42–168（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 7.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.323
6U74 BRD4-BD1 in complex with the cyclic peptide 3.1_2 提交 2019-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 42–168（127 aa）
链 D 42–168（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium malonate dibasic monohydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 7.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.323
6U8G BRD4-BD2 in complex with the cyclic peptide 3.1_2_AcK7toA 提交 2019-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 42–168（127 aa）
链 C 42–168（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1.0 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-Tris pH 5.5, 1 % w/v PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.296
6U8G BRD4-BD2 in complex with the cyclic peptide 3.1_2_AcK7toA 提交 2019-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 42–168（127 aa）
链 D 42–168（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1.0 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-Tris pH 5.5, 1 % w/v PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.296
6U8I BRD4-BD2 in complex with the cyclic peptide 3.2_2 提交 2019-09-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 347–464（118 aa）
未记录 NH2 AMINO GROUP × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Sodium iodide, 0.1 M Bis-Tris propane 7.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.239
6U8M BRD4-BD1 in complex with the cyclic peptide 3.2_1 提交 2019-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 42–168（127 aa）
链 B 42–168（127 aa）
未记录 NH2 AMINO GROUP × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；2% v/v 1,4-Dioxane, 0.1 M Tris pH 8.0, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.95 Å R-free 0.200
6ULS BRD4-BD1 in complex with the a diacetylated-E2F1 peptide 提交 2019-10-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M MMT pH 7.0, 25% w/v PEG 1500
分辨率 1.50 Å R-free 0.204
6ULV BRD4-BD1 in complex with the cyclic peptide 4.2_1 提交 2019-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 42–168（127 aa） 片段：first bromodomain
链 C 42–168（127 aa） 片段：first bromodomain
未记录 IOD IODIDE ION × 4 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Sodium Iodide (150-250mM), PEG 3350 (15-25%) and 100mM Bis Tris Propane
分辨率 2.20 Å R-free 0.238
6ULV BRD4-BD1 in complex with the cyclic peptide 4.2_1 提交 2019-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 42–168（127 aa） 片段：first bromodomain
链 D 42–168（127 aa） 片段：first bromodomain
未记录 IOD IODIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Sodium Iodide (150-250mM), PEG 3350 (15-25%) and 100mM Bis Tris Propane
分辨率 2.20 Å R-free 0.238
6UVJ Cocrystal of BRD4(D1) with a methyl carbamate thiazepane inhibitor 提交 2019-11-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 QJ1 methyl (7S)-7-(thiophen-2-yl)-1,4-thiazepane-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.1 M bis-tris propane, 20 % PEG 3350
分辨率 1.38 Å R-free 0.197
6UVM Cocrystal of BRD4(D1) with a methyl carbamate thiazepane inhibitor 提交 2019-11-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 QJA 1-[(7S)-7-(thiophen-2-yl)-6,7-dihydro-1,4-thiazepin-4(5H)-yl]ethan-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；295 K；0.1 M bis-tris propane, 20% ethylene glycol, and 20% PEG3350
分辨率 1.51 Å R-free 0.218
6UWU Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor ZL0516 提交 2019-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 QKP 2-{4-[(2R)-2-hydroxy-3-(4-methylpiperazin-1-yl)propoxy]-3,5-dimethylphenyl}-5,7-dimethoxy-4H-1-benzopyran-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM sodium sulfate, 10% (v/v) ethylene glycol and 18% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.261
6UWX Cocrystal of BRD4(D1) with a ethyl carbamate thiazepane inhibitor 提交 2019-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 QKD ethyl (7S)-7-(thiophen-2-yl)-1,4-thiazepane-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.1 M bis-tris propane, 20 % PEG 3350
分辨率 1.31 Å R-free 0.192
6V0U Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to bromosporine 提交 2019-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 BMF Bromosporine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris (pH 8.5), and 25% PEG 3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.185
6V1K Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to BI7273 提交 2019-11-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 5SW 4-[4-[(dimethylamino)methyl]-3,5-dimethoxy-phenyl]-2-methyl-2,7-naphthyridin-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris (pH 8.5), and 25% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.214
6V1L Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to BI9564 提交 2019-11-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 5U6 4-[4-[(dimethylamino)methyl]-2,5-dimethoxy-phenyl]-2-methyl-2,7-naphthyridin-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris (pH 8.5), and 25% PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.224
6V1U Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to TP-472 提交 2019-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 QMG 3-(6-acetylpyrrolo[1,2-a]pyrimidin-8-yl)-N-cyclopropyl-4-methylbenzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris (pH 8.5), and 25% PEG 3350
分辨率 1.73 Å R-free 0.200
6VIW BRD4_Bromodomain1 complex with pyrrolopyridone compound 18 提交 2020-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 57–168（112 aa） 片段：Bromodomain 1
未记录 QYV 4-[2-(2,4-difluorophenoxy)-5-(methylsulfonyl)phenyl]-N-ethyl-6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；2.0 M Na Formate, 0.1M Tris pH 8.5
分辨率 2.43 Å R-free 0.232
6VIW BRD4_Bromodomain1 complex with pyrrolopyridone compound 18 提交 2020-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 57–168（112 aa） 片段：Bromodomain 1
未记录 QYV 4-[2-(2,4-difluorophenoxy)-5-(methylsulfonyl)phenyl]-N-ethyl-6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；2.0 M Na Formate, 0.1M Tris pH 8.5
分辨率 2.43 Å R-free 0.232
6VIW BRD4_Bromodomain1 complex with pyrrolopyridone compound 18 提交 2020-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 57–168（112 aa） 片段：Bromodomain 1
未记录 QYV 4-[2-(2,4-difluorophenoxy)-5-(methylsulfonyl)phenyl]-N-ethyl-6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；2.0 M Na Formate, 0.1M Tris pH 8.5
分辨率 2.43 Å R-free 0.232
6VIX BRD4_Bromodomain2 complex with pyrrolopyridone compound 18 提交 2020-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：Bromodomain 2
未记录 QYV 4-[2-(2,4-difluorophenoxy)-5-(methylsulfonyl)phenyl]-N-ethyl-6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；25% PEG 3350, 0.2M AmSO4, 0.1M Na Cacodylate, pH 5.5
分辨率 2.12 Å R-free 0.230
6VIX BRD4_Bromodomain2 complex with pyrrolopyridone compound 18 提交 2020-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 352–457（106 aa） 片段：Bromodomain 2
未记录 QYV 4-[2-(2,4-difluorophenoxy)-5-(methylsulfonyl)phenyl]-N-ethyl-6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；25% PEG 3350, 0.2M AmSO4, 0.1M Na Cacodylate, pH 5.5
分辨率 2.12 Å R-free 0.230
6VIX BRD4_Bromodomain2 complex with pyrrolopyridone compound 18 提交 2020-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 352–457（106 aa） 片段：Bromodomain 2
未记录 QYV 4-[2-(2,4-difluorophenoxy)-5-(methylsulfonyl)phenyl]-N-ethyl-6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；25% PEG 3350, 0.2M AmSO4, 0.1M Na Cacodylate, pH 5.5
分辨率 2.12 Å R-free 0.230
6VIX BRD4_Bromodomain2 complex with pyrrolopyridone compound 18 提交 2020-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 352–457（106 aa） 片段：Bromodomain 2
未记录 QYV 4-[2-(2,4-difluorophenoxy)-5-(methylsulfonyl)phenyl]-N-ethyl-6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；25% PEG 3350, 0.2M AmSO4, 0.1M Na Cacodylate, pH 5.5
分辨率 2.12 Å R-free 0.230
6VIZ BRD4_Bromodomain1 complex with pyrrolopyridone compound 27 提交 2020-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 57–168（112 aa） 片段：Bromodomain 1
未记录 QYY 4-[2-(2,6-dimethylphenoxy)-5-(ethylsulfonyl)phenyl]-N-ethyl-6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；2.0M Na Formate, 0.1M Bis-Tris Propane, pH 7.0
分辨率 2.39 Å R-free 0.217
6VIZ BRD4_Bromodomain1 complex with pyrrolopyridone compound 27 提交 2020-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 57–168（112 aa） 片段：Bromodomain 1
未记录 QYY 4-[2-(2,6-dimethylphenoxy)-5-(ethylsulfonyl)phenyl]-N-ethyl-6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；2.0M Na Formate, 0.1M Bis-Tris Propane, pH 7.0
分辨率 2.39 Å R-free 0.217
6VIZ BRD4_Bromodomain1 complex with pyrrolopyridone compound 27 提交 2020-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 57–168（112 aa） 片段：Bromodomain 1
未记录 QYY 4-[2-(2,6-dimethylphenoxy)-5-(ethylsulfonyl)phenyl]-N-ethyl-6-methyl-7-oxo-6,7-dihydro-1H-pyrrolo[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；2.0M Na Formate, 0.1M Bis-Tris Propane, pH 7.0
分辨率 2.39 Å R-free 0.217
6VUB Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 with N-methylpyrrolidin-2-one (NMP) derivative 5 (1-methyl-4-phenylpyrrolidin-2-one) 提交 2020-02-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 44-168)
未记录 RLG (4R)-1-methyl-4-phenylpyrrolidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M sodium nitrate, 35% PEG3350, 6% v/v ethylene glycol
分辨率 1.50 Å R-free 0.177
6VUC Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 with N-methylpyrrolidin-2-one (NMP) derivative 7b (1-methyl-4-(4-(piperidin-1-ylsulfonyl)phenyl)pyrrolidin-2-one) 提交 2020-02-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 44-168)
未记录 RLS (4R)-1-methyl-4-{4-[(piperidin-1-yl)sulfonyl]phenyl}pyrrolidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M sodium nitrate, 35% PEG3350, 6% v/v ethylene glycol
分辨率 1.55 Å R-free 0.211
6VUF Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 with N-methylpyrrolidin-2-one (NMP) derivative 7h (4-(1-methyl-5-oxopyrrolidin-3-yl)-N-propylbenzenesulfonamide) 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 44-168)
未记录 RLV 4-[(3R)-1-methyl-5-oxopyrrolidin-3-yl]-N-propylbenzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M sodium nitrate, 35% PEG3350, 6% v/v ethylene glycol
分辨率 1.59 Å R-free 0.269
6VUF Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 with N-methylpyrrolidin-2-one (NMP) derivative 7h (4-(1-methyl-5-oxopyrrolidin-3-yl)-N-propylbenzenesulfonamide) 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 44-168)
未记录 RLV 4-[(3R)-1-methyl-5-oxopyrrolidin-3-yl]-N-propylbenzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M sodium nitrate, 35% PEG3350, 6% v/v ethylene glycol
分辨率 1.59 Å R-free 0.269
6VUJ Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 with N-methylpyrrolidin-2-one (NMP) derivative 15c (N,N-diethyl-3',4'-dimethoxy-6-(1-methyl-5-oxopyrrolidin-3-yl)-[1,1'-biphenyl]-3-sulfonamide) 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 44-168)
未记录 NO3 NITRATE ION × 1 RLY N,N-diethyl-3',4'-dimethoxy-6-[(3S)-1-methyl-5-oxopyrrolidin-3-yl][1,1'-biphenyl]-3-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.2 M sodium nitrate, 35% PEG3350, 6% v/v ethylene glycol
分辨率 1.48 Å R-free 0.208
6WGX Cocrystal of BRD4(D1) with a selective inhibitor 提交 2020-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 U0D 4-(1-{1-[2-(dimethylamino)ethyl]piperidin-4-yl}-4-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-imidazol-5-yl)-N-(3,5-dimethylphenyl)pyrimidin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；NaI, pH 8.5, Bis-Tris propane, 20% (v/v) PEG 3350, ethylene glycol
分辨率 1.53 Å R-free 0.181
6WGX Cocrystal of BRD4(D1) with a selective inhibitor 提交 2020-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 U0D 4-(1-{1-[2-(dimethylamino)ethyl]piperidin-4-yl}-4-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-imidazol-5-yl)-N-(3,5-dimethylphenyl)pyrimidin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；NaI, pH 8.5, Bis-Tris propane, 20% (v/v) PEG 3350, ethylene glycol
分辨率 1.53 Å R-free 0.181
6WVX Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 with benzodiazepine inhibitor 提交 2020-05-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 UDV 6'-(4-chlorophenyl)-1'-methyl-8'-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)spiro[cyclopropane-1,4'-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepine] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.18 M Triammonium Citrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.55 Å R-free 0.246
6WVX Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 with benzodiazepine inhibitor 提交 2020-05-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 UDV 6'-(4-chlorophenyl)-1'-methyl-8'-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)spiro[cyclopropane-1,4'-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepine] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.18 M Triammonium Citrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.55 Å R-free 0.246
6WW8 BRD4 Bromodomain 1 in complex with triple CDK4/6-PI3K-BET inhibitor 提交 2020-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 43–180（138 aa）
未记录 YR0 7-cyclopentyl-N,N-dimethyl-2-({4-[5-(morpholin-4-yl)-7-oxo-7H-thieno[3,2-b]pyran-3-yl]phenyl}amino)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM Tris pH 8.5, 25%(w/v) PEG 3350, and 200 mM NH4Cl
分辨率 2.30 Å R-free 0.235
6X7B BRD4 Bromodomain 1 in complex with multi-action inhibitor SRX3212P 提交 2020-05-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–176（133 aa）
未记录 ZVP 7-[7-oxo-5-(piperazin-1-yl)-7H-thieno[3,2-b]pyran-3-yl]-N-[(pyridin-3-yl)methyl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4Cl, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.221
6X7B BRD4 Bromodomain 1 in complex with multi-action inhibitor SRX3212P 提交 2020-05-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–176（133 aa）
未记录 ZVP 7-[7-oxo-5-(piperazin-1-yl)-7H-thieno[3,2-b]pyran-3-yl]-N-[(pyridin-3-yl)methyl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4Cl, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.221
6X7C BRD4 Bromodomain 1 in complex with multi-action inhibitor SRX3212 提交 2020-05-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–176（133 aa）
未记录 KV9 7-[5-(morpholin-4-yl)-7-oxo-7H-thieno[3,2-b]pyran-3-yl]-N-[(pyridin-3-yl)methyl]-2,3-dihydro-1,4-benzodioxine-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；40% PEG 3350, 0.2 M Pottassium thiocyanate pH 7.5, and 4% 1,1,1,3,3,3-Hexafluoro-2-propanol
分辨率 2.70 Å R-free 0.257
6X7D BRD4 Bromodomain 1 in complex with multi-action inhibitor SF2523P 提交 2020-05-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–176（133 aa）
未记录 UT4 3-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-5-(piperazin-1-yl)-7H-thieno[3,2-b]pyran-7-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；2.5 M Ammonium Sulfate and 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.267
6X7D BRD4 Bromodomain 1 in complex with multi-action inhibitor SF2523P 提交 2020-05-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–176（133 aa）
未记录 UT4 3-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-5-(piperazin-1-yl)-7H-thieno[3,2-b]pyran-7-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；2.5 M Ammonium Sulfate and 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.267
6XUZ CRYSTAL STRUCTURE OF BRD4-BD1 WITH COMPOUND 4 提交 2020-01-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 O1W 6-[1-[(2~{S})-1-methoxypropan-2-yl]-6-[(3~{S})-3-methylmorpholin-4-yl]imidazo[4,5-c]pyridin-2-yl]-3-methyl-~{N}-propan-2-yl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-8-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；29% PEG 3350, 0.2 M disodium malonate, 0.1 M HEPES
分辨率 1.07 Å R-free 0.201
6XV3 CRYSTAL STRUCTURE OF BRD4-BD1 WITH COMPOUND 3 提交 2020-01-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 O2B 3-methyl-6-[6-[(3~{S})-3-methylmorpholin-4-yl]-1-[(1~{S})-1-phenylethyl]imidazo[4,5-c]pyridin-2-yl]-~{N}-propan-2-yl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-8-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；29 % PEG 3350, 0.2 M disodium malonate, 0.1 M HEPES
分辨率 1.47 Å R-free 0.290
6XV3 CRYSTAL STRUCTURE OF BRD4-BD1 WITH COMPOUND 3 提交 2020-01-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 O2B 3-methyl-6-[6-[(3~{S})-3-methylmorpholin-4-yl]-1-[(1~{S})-1-phenylethyl]imidazo[4,5-c]pyridin-2-yl]-~{N}-propan-2-yl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-8-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；29 % PEG 3350, 0.2 M disodium malonate, 0.1 M HEPES
分辨率 1.47 Å R-free 0.290
6XV3 CRYSTAL STRUCTURE OF BRD4-BD1 WITH COMPOUND 3 提交 2020-01-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa）
未记录 O2B 3-methyl-6-[6-[(3~{S})-3-methylmorpholin-4-yl]-1-[(1~{S})-1-phenylethyl]imidazo[4,5-c]pyridin-2-yl]-~{N}-propan-2-yl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-8-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；29 % PEG 3350, 0.2 M disodium malonate, 0.1 M HEPES
分辨率 1.47 Å R-free 0.290
6XV3 CRYSTAL STRUCTURE OF BRD4-BD1 WITH COMPOUND 3 提交 2020-01-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 44–168（125 aa）
未记录 O2B 3-methyl-6-[6-[(3~{S})-3-methylmorpholin-4-yl]-1-[(1~{S})-1-phenylethyl]imidazo[4,5-c]pyridin-2-yl]-~{N}-propan-2-yl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-8-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；29 % PEG 3350, 0.2 M disodium malonate, 0.1 M HEPES
分辨率 1.47 Å R-free 0.290
6XV7 CRYSTAL STRUCTURE OF BRD4-BD1 WITH COMPOUND 2 提交 2020-01-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 O2Q ~{N}-[[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]methyl]-~{N},3-dimethyl-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；29 % PEG 3350, 0.2 M disodium malonate, 0.1 M HEPES
分辨率 1.67 Å R-free 0.203
6XVC CRYSTAL STRUCTURE OF BRD4-BD1 WITH COMPOUND 1 提交 2020-01-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 O32 (4~{R})-4-[(1~{R})-1-[7-(3-methyl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-6-yl)quinolin-5-yl]oxyethyl]pyrrolidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；29 % PEG 3350, 0.2 M disodium malonate, 0.1 M HEPES
分辨率 1.10 Å R-free 0.198
6YIN Crystal structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with a benzo-diazepine ligand 提交 2020-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 OS8 (4~{R})-~{N}-[3-(7-methoxy-3,4-dihydro-2~{H}-quinolin-1-yl)propyl]-4-methyl-2-oxidanylidene-1,3,4,5-tetrahydro-1,5-benzodiazepine-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；30% PEG1000 0.1M MIB pH 7.0
分辨率 1.53 Å R-free 0.245
6YQN Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the dual inhibitor TW9 提交 2020-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 P8T ~{N}-(2-aminophenyl)-4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]t rideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/ml in 10 mM HEPES, pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, and 5% glycerol. 50 mM stock solution of TW12 in DMSO added to give a final inhibitor concentration 1.5 mM. Reservoir buffer: 24% PEG 3350, 0.1 M sodium formate, 15% ethylene glycol and 0.1 M bis-Tris-propane pH 7.3. Ratio protein/reservoir solution = 2:1
分辨率 1.05 Å R-free 0.176
6YQO Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the dual inhibitor TW12 提交 2020-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 P8Q (S)-N1-(4-(2-(4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl)acetamido)phenyl)-N8-hydroxyoctanediamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/ml in 10 mM HEPES, pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, and 5% glycerol. 50 mM stock solution of TW12 in DMSO added to give a final inhibitor concentration 1.5 mM. Reservoir buffer: 24% PEG 3350, 0.1 M sodium formate, 15% ethylene glycol and 0.1 M bis-Tris-propane pH 7.3. Ratio protein/reservoir solution = 2:1
分辨率 1.07 Å R-free 0.174
6YQP Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the dual inhibitor TW22 提交 2020-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 P8N (~{E})-3-[4-[[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6 ),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]methyl]phenyl]-~{N}-oxidanyl-prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/ml in 10 mM HEPES, pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, and 5% glycerol. 50 mM stock solution of TW22 in DMSO added to give a final inhibitor concentration 1.5 mM. Reservoir buffer: 24% PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 15 % ethylene glycol and 0.1 M bis-Tris-propane pH 7.9
分辨率 1.25 Å R-free 0.193
6YQZ N-terminal domain of BRD4 with biphenyl-methyamino-dimethylpyridazinone 提交 2020-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 P8W 2,4-dimethyl-5-[(2-phenylphenyl)methylamino]pyridazin-3-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；20%w/v PEG 3350, 0.2M sodium sulphate,0.1M bis-tris-propane (pH 6.5)
分辨率 1.39 Å R-free 0.204
6Z7G N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH N-(2-(1H-imidazol-4-yl)ethyl)-4-acetamido-3-(benzyloxy)benzamide 提交 2020-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 QB5 N-(2-(1H-imidazol-4-yl)ethyl)-4-acetamido-3-(benzyloxy)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2M BTP pH 6.5, 20% PEG3350, 0.2M NaKtartrate
分辨率 1.59 Å R-free 0.218
6Z7L N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 with GSK789 提交 2020-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 QAN (3~{R},4~{R})-~{N}-cyclohexyl-4-[[5-(furan-2-yl)-3-methyl-2-oxidanylidene-1~{H}-1,7-naphthyridin-8-yl]amino]-1-methyl-piperidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M MES pH 6.5, 15% v/v PEG400
分辨率 1.62 Å R-free 0.225
6Z7M N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 (3R,4R)-N-cyclohexyl-4-((3-methyl-2-oxo-1,2-dihydro-1,7-naphthyridin-8-yl)amino)piperidine-3-carboxamide 提交 2020-05-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 QAZ (3R,4R)-N-cyclohexyl-4-((3-methyl-2-oxo-1,2-dihydro-1,7-naphthyridin-8-yl)amino)piperidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M Hepes pH 7.0, 5% MgCl2, 20% PEG6K
分辨率 1.26 Å R-free 0.214
6ZB3 N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH GSK620 提交 2020-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 QCZ ~{N}5-cyclopropyl-~{N}3-methyl-2-oxidanylidene-1-(phenylmethyl)pyridine-3,5-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；30%w/v PEG3350, 0.1M NaAc, 0.1M MES, pH 6.5
分辨率 1.42 Å R-free 0.182
6ZCI Crystal structure of BRD4-BD1 in complex with NVS-BET-1 提交 2020-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 QFN (4~{R})-4-(4-chlorophenyl)-1-cyclopropyl-5-(1,5-dimethyl-6-oxidanylidene-pyridin-3-yl)-3-methyl-4~{H}-pyrrolo[3,4-c]pyrazol-6-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；20% PEG 3350, 200 mM Sodium Malonate pH 5.0
分辨率 1.98 Å R-free 0.274
6ZED CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX with compound F1 提交 2020-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 QGN 4,5-dimethyl-1~{H}-pyrazolo[3,4-c]pyridazin-3-amine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1M bis-tris-propane pH 6.5, 20% PEG3350, 0.2M sodium fluoride, 10% ethylene glycol
分辨率 1.08 Å R-free 0.143
6ZEL CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX with compound F5 提交 2020-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 QGQ 3,5-dimethyl-4-[(6-methylpyrimidin-4-yl)sulfanylmethyl]-1,2-oxazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M bis-tris-propane pH 7.9, 20% PEG3350, 0.2M sodium fluoride, 10% ethylene glycol
分辨率 1.12 Å R-free 0.147
6ZF9 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX with compound SSR4 提交 2020-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 QHE 3-ethyl-5-phenyl-[1,3]thiazolo[2,3-c][1,2,4]triazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；20% w/v MMW PgSm, 100mM MES pH 6, 150 mM Ammonium nitrate, 5% ethylene glycol
分辨率 1.20 Å R-free 0.148
7A9U N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH 3-(3-(but-3-yn-1-yl)-3H-diazirin-3-yl)-N-(3-methyl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-8-yl)propanamide 提交 2020-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 R5W 3-(3-(but-3-yn-1-yl)-3H-diazirin-3-yl)-N-(3-methyl-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyridin-8-yl)propanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG 3350 0.2M NaBr
分辨率 1.44 Å R-free 0.210
7AJN Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with a BzD ligand 提交 2020-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 RGW ~{N}-(1-adamantylmethyl)-2-[(7~{R},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；30% PEG1000 0.1M MIB pH 7.0
分辨率 1.48 Å R-free 0.190
7AQT NMR2 structure of BRD4-BD2 in complex with iBET-762 提交 2020-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 351–459（109 aa） 片段：BRD4-BD2
未记录 EAM 2-[(4S)-6-(4-chlorophenyl)-8-methoxy-1-methyl-4H-[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepin-4-yl]-N-ethylacetamide × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 350 uM U-[12C,2H],U-15N,[13C,1H]-Ile-d1, [13C,1H]-Leu-d1/2, [13C,1H]-Val-g1/2 ILV-BRD4-BD2, 50 mM Na2HPO4, 500 uM [U-2H] TCEP, 420 uM iBET-762, 100 % [U-2H] D2O, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
7AXR Crystal structure of BRD4(1) bound to the dual BET-HDAC inhibitor LSH24 提交 2020-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 S7T 4-acetyl-3-ethyl-N-(3-(3-(hydroxyamino)-3-oxopropyl)phenyl)-5-methyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；35% Tacsimate pH 7.0
分辨率 1.50 Å R-free 0.227
7B1T Crystal structure of BRD4(1) in complex with the inhibitor MPM6 提交 2020-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 SOK 3-(5-azanyl-2-chloranyl-phenyl)-1-methyl-4,7-dihydro-2~{H}-cyclohepta[c]pyrrol-8-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES, Sodium citrate tribasic dihydrate
分辨率 1.92 Å R-free 0.189
7C2Z Bromodomain-containing 4 BD1 in complex with 3',4',7,8-Tetrahydroxyflavone 提交 2020-05-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：BD1 domain
未记录 SQH 2-[3,4-bis(oxidanyl)phenyl]-7,8-bis(oxidanyl)chromen-4-one × 1 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；4.0M Sodium Formate
分辨率 1.30 Å R-free 0.193
7C6P Bromodomain-containing 4 BD2 in complex with 3',4',7,8- Tetrahydroxyflavonoid 提交 2020-05-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa）
未记录 SQH 2-[3,4-bis(oxidanyl)phenyl]-7,8-bis(oxidanyl)chromen-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；2. 20 % v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2000, 100 mM Tris PH8.5, 200 mM Trimethylamine N-oxide, 295K
分辨率 1.73 Å R-free 0.222
7DHS Crystal Structure Analysis of the BRD4 提交 2020-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
链 B 44–168（125 aa）
未记录 H8C 6-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(1R)-1-phenylethyl]benzo[cd]indol-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M HEPES, 0.2M NaNO3, 10% ethylene glycol, 20% PEG 3350, pH 6.5
分辨率 1.76 Å R-free 0.253
7EHW BRD4-BD1 in complex with LT-642-602 提交 2021-03-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 J4O 1-[4-ethyl-2-methyl-5-(6-morpholin-4-yl-1H-benzimidazol-2-yl)-1H-pyrrol-3-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；4 M sodium formate
分辨率 1.65 Å R-free 0.246
7EHY BRD4-BD1 in complex with LT-448-138 提交 2021-03-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 YD8 1-[2,4-dimethyl-5-[5-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-pyrrol-3-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；4 M sodium formate
分辨率 1.51 Å R-free 0.207
7EIG BRD4-BD1 in complex with LT-730-903 提交 2021-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 N03 1-[5-(5-azanyl-1H-benzimidazol-2-yl)-2-methyl-4-phenyl-1H-pyrrol-3-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；4 M sodium formate
分辨率 1.30 Å R-free 0.202
7EIK RD4-BD1 in complex with LT-872-297 提交 2021-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 J4R 1-[2-methyl-5-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-4-(1-methylpyrazol-4-yl)-1H-pyrrol-3-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；4 M sodium formate
分辨率 1.70 Å R-free 0.258
7EIL BRD4-BD1 in complex with LT-909-110 提交 2021-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 909 N-[4-[4-ethanoyl-5-methyl-2-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]-1H-pyrrol-3-yl]phenyl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；4M sodium formate
分辨率 1.70 Å R-free 0.212
7FH2 Crystal structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with 16D10 提交 2021-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 4JI N-[2-[2-[(E)-3-(2,5-dimethoxyphenyl)prop-2-enoyl]-4,5-dimethoxy-phenyl]ethyl]ethanamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；13.4 mg/mL BRD4-BD1, 0.5 mM 16D10, 20% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.49 Å R-free 0.292
7FH2 Crystal structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with 16D10 提交 2021-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 42–168（127 aa）
未记录 4JI N-[2-[2-[(E)-3-(2,5-dimethoxyphenyl)prop-2-enoyl]-4,5-dimethoxy-phenyl]ethyl]ethanamide × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；13.4 mg/mL BRD4-BD1, 0.5 mM 16D10, 20% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.49 Å R-free 0.292
7FH2 Crystal structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with 16D10 提交 2021-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 42–168（127 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；13.4 mg/mL BRD4-BD1, 0.5 mM 16D10, 20% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.49 Å R-free 0.292
7FH2 Crystal structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with 16D10 提交 2021-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 42–168（127 aa）
未记录 4JI N-[2-[2-[(E)-3-(2,5-dimethoxyphenyl)prop-2-enoyl]-4,5-dimethoxy-phenyl]ethyl]ethanamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；13.4 mg/mL BRD4-BD1, 0.5 mM 16D10, 20% PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.49 Å R-free 0.292
7JKW Bromodomain-containing protein 4 (BRD4) bromodomain 1 (BD1) complexed with ZN1-99 提交 2020-07-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 VCV N-(6-{5-[(azetidin-3-yl)amino]-1-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyridin-3-yl}-1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-1H-indol-4-yl)ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M LiSO4, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 16-20% PEG 4000
分辨率 1.20 Å R-free 0.185
7JKX Bromodomain-containing protein 4 (BRD4) bromodomain 1 (BD1) complexed with YF3-6 提交 2020-07-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 Y36 N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-[1-methyl-5-(methylamino)-6-oxo-1,6-dihydropyridin-3-yl]-1H-indol-4-yl}ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M LiSO4, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 16-20% PEG 4000
分辨率 1.20 Å R-free 0.209
7JKY Bromodomain-containing protein 4 (BRD4) bromodomain 1 (BD1) complexed with YF3-126 提交 2020-07-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 YF6 N-(1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-{1-methyl-6-oxo-5-[(piperidin-4-yl)amino]-1,6-dihydropyridin-3-yl}-1H-indol-4-yl)ethanesulfonamide × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.2M LiSO4, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 16-20% PEG 4000
分辨率 1.16 Å R-free 0.176
7JKZ Bromodomain-containing protein 4 (BRD4) bromodomain 2 (BD2) complexed with YF3-126 提交 2020-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 333–460（128 aa）
未记录 YF6 N-(1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-{1-methyl-6-oxo-5-[(piperidin-4-yl)amino]-1,6-dihydropyridin-3-yl}-1H-indol-4-yl)ethanesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；290 K；0.2 M (NH4)2SO4, 0.1M Na cacodylate pH 6.5, 30% PEG 8000
分辨率 2.49 Å R-free 0.212
7K6G Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to ERK5-IN-1 提交 2020-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 VYJ 11-cyclopentyl-2-({2-ethoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]phenyl}amino)-5-methyl-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium sulphate, 0.1 M Tris (pH 8.5), 25 % w/v PEG 3,350
分辨率 1.70 Å R-free 0.204
7K6G Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to ERK5-IN-1 提交 2020-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 VYJ 11-cyclopentyl-2-({2-ethoxy-4-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)piperidine-1-carbonyl]phenyl}amino)-5-methyl-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium sulphate, 0.1 M Tris (pH 8.5), 25 % w/v PEG 3,350
分辨率 1.70 Å R-free 0.204
7K6H Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to XMD8-92 提交 2020-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 4WG 2-{[2-ethoxy-4-(4-hydroxypiperidin-1-yl)phenyl]amino}-5,11-dimethyl-5,11-dihydro-6H-pyrimido[4,5-b][1,4]benzodiazepin-6-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.50 Å R-free 0.190
7KHH Ternary complex of VHL/BRD4-BD1/Compound9 (4-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-N-(11-(((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamoyl)pyrrolidin-1-yl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl)amino)-11-oxoundecyl)-10-methyl-7-((methylsulfonyl)methyl)-11-oxo-3,4,10,11-tetrahydro-1H-1,4,10-triazadibenzo[cd,f]azulene-6-carboxamide) 提交 2020-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 44–168（125 aa）
未记录 WEP N-[11-({7-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-2-methyl-10-[(methylsulfonyl)methyl]-3-oxo-3,4,6,7-tetrahydro-2H-2,4,7-triazadibenzo[cd,f]azulene-9-carbonyl}amino)undecanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；291 K；18% w/v PEG 8K, 10% v/v PEG 200, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 9.0
分辨率 2.28 Å R-free 0.229
7KHL BRD4-BD1 Compound6 (methyl 4-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-10-methyl-7-((methylsulfonyl)methyl)-11-oxo-3,4,10,11-tetrahydro-1H-1,4,10-triazadibenzo[cd,f]azulene-6-carboxylate) 提交 2020-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 WEM methyl 7-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-2-methyl-10-[(methylsulfonyl)methyl]-3-oxo-3,4,6,7-tetrahydro-2H-2,4,7-triazadibenzo[cd,f]azulene-9-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；291 K；14% w/v PEG 4K, 0.1 M Tris-HCl pH 8
分辨率 1.29 Å R-free 0.225
7KHL BRD4-BD1 Compound6 (methyl 4-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-10-methyl-7-((methylsulfonyl)methyl)-11-oxo-3,4,10,11-tetrahydro-1H-1,4,10-triazadibenzo[cd,f]azulene-6-carboxylate) 提交 2020-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；291 K；14% w/v PEG 4K, 0.1 M Tris-HCl pH 8
分辨率 1.29 Å R-free 0.225
7KO0 Crystal structure of the second bromodomain (BD2) of human BRD4 bound to SG3-179 提交 2020-11-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 349–460（112 aa）
未记录 5W2 4-[[4-[[3-(~{tert}-butylsulfonylamino)-4-chloranyl-phenyl]amino]-5-methyl-pyrimidin-2-yl]amino]-2-fluoranyl-~{N}-(1-methylpiperidin-4-yl)benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 20% PEG 3,350
分辨率 1.90 Å R-free 0.199
7L9M Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 in complex with bivalent inhibitor GXH-II-083 提交 2021-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
链 B 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 XR4 N,N'-[(1,19-dioxo-4,7,10,13,16-pentaoxanonadecane-1,19-diyl)di(piperidine-1,4-diyl)]bis(4-{[4-({3-[(tert-butylsulfonyl)amino]-4-chlorophenyl}amino)-5-methylpyrimidin-2-yl]amino}-2-fluorobenzamide) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Tris HCl pH 8.5, 25% PEG 3350
分辨率 1.45 Å R-free 0.202
7LA9 Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 (BRD4-1) in complex with bivalent inhibitor NC-III-49-1 提交 2021-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
链 D 44–168（125 aa）
未记录 XR7 N,N'-(oxybis{(ethane-2,1-diyl)oxyethane-2,1-diyloxy[3-(2-methyl-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-4-yl)-4,1-phenylene]})di(ethane-1-sulfonamide) × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 CL CHLORIDE ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.6), 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.208
7LA9 Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 (BRD4-1) in complex with bivalent inhibitor NC-III-49-1 提交 2021-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 44–168（125 aa）
链 F 44–168（125 aa）
未记录 XR7 N,N'-(oxybis{(ethane-2,1-diyl)oxyethane-2,1-diyloxy[3-(2-methyl-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-4-yl)-4,1-phenylene]})di(ethane-1-sulfonamide) × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.6), 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.208
7LA9 Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 (BRD4-1) in complex with bivalent inhibitor NC-III-49-1 提交 2021-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 44–168（125 aa）
链 E 44–168（125 aa）
未记录 XR7 N,N'-(oxybis{(ethane-2,1-diyl)oxyethane-2,1-diyloxy[3-(2-methyl-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-4-yl)-4,1-phenylene]})di(ethane-1-sulfonamide) × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.6), 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.208
7LH8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH INHIBITOR JJ-II-131 提交 2021-01-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 XZG (5R)-1-ethyl-5-(4-methylphenyl)-7-({1-[(4-nitrophenyl)methyl]piperidin-4-yl}methyl)-5,7,8,9-tetrahydro-1H-pyrrolo[3',4':5,6]pyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4,6(3H)-trione × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.75 Å R-free 0.212
7M16 Triazole-based BET family bromodomain inhibitor bound to BRD4(D1) 提交 2021-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 YNS 4-{5-[6-(3,5-dimethylanilino)pyridin-2-yl]-4-methyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl}piperidine-1-carboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M sodium nitrate, 20% (v/v) PEG 3350 and 10% ethylene glycol
分辨率 1.42 Å R-free 0.215
7MCE CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH 2-{(7P)-7-(1,4-dimethyl-1H-1,2,3-triazol-5-yl)-8-fluoro-5-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-5H-pyrido[3,2-b]indol-3-yl}propan-2-ol 提交 2021-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 YWY 2-{(7P)-7-(1,4-dimethyl-1H-1,2,3-triazol-5-yl)-8-fluoro-5-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-5H-pyrido[3,2-b]indol-3-yl}propan-2-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；60% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.288
7MCF CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH 2-{3-(1,4-dimethyl-1H-1,2,3-triazol-5-yl)-6-fluoro-5-[(S)-(3-fluoropyridin-2-yl)(oxan-4-yl)methyl]-5H-pyrido[3,2-b]indol-7-yl}propan-2-ol 提交 2021-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 YX4 2-{3-(1,4-dimethyl-1H-1,2,3-triazol-5-yl)-6-fluoro-5-[(S)-(3-fluoropyridin-2-yl)(oxan-4-yl)methyl]-5H-pyrido[3,2-b]indol-7-yl}propan-2-ol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris, PH 7.0, 100 mM NaCl, 30%(w/v) PEG 3000
分辨率 2.19 Å R-free 0.234
7MCF CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH 2-{3-(1,4-dimethyl-1H-1,2,3-triazol-5-yl)-6-fluoro-5-[(S)-(3-fluoropyridin-2-yl)(oxan-4-yl)methyl]-5H-pyrido[3,2-b]indol-7-yl}propan-2-ol 提交 2021-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；100 mM Tris, PH 7.0, 100 mM NaCl, 30%(w/v) PEG 3000
分辨率 2.19 Å R-free 0.234
7MLQ X-ray crystal structure of human BRD4(D1) in complex with 2-(4-{5-[6-(2,5-dibromophenoxy)pyridin-2-yl]-4-methyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl}piperidin-1-yl)-N,N-dimethylethan-1-amine (compound 26) 提交 2021-04-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZHV 2-(4-{5-[6-(2,5-dibromophenoxy)pyridin-2-yl]-4-methyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl}piperidin-1-yl)-N,N-dimethylethan-1-amine × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；NaI, pH 8.5, Bis-Tris propane, 20% (v/v) PEG 3350, ethylene glycol
分辨率 1.32 Å R-free 0.162
7MLR X-ray crystal structure of human BRD4(D1) in complex with 2-(4-{5-[6-(3,5-dimethylphenoxy)pyridin-2-yl]-4-methyl-1H-1,2,3-triazol-1- yl}piperidin-1-yl)-N,N-dimethylethan-1-amine (DW34) 提交 2021-04-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 ZHS 2-(4-{5-[6-(3,5-dimethylphenoxy)pyridin-2-yl]-4-methyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl}piperidin-1-yl)-N,N-dimethylethan-1-amine × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；NaI, pH 8.5, Bis-Tris propane, 20% (v/v) PEG 3350, ethylene glycol
分辨率 1.20 Å R-free 0.164
7MLS X-ray crystal structure of human BRD4(D1) in complex with 2-(2,5-dibromophenoxy)-6-[4-methyl-1-(piperidin-4-yl)-1H-1,2,3-triazol-5-yl]pyridine (compound 23) 提交 2021-04-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 ZHM 2-(2,5-dibromophenoxy)-6-[4-methyl-1-(piperidin-4-yl)-1H-1,2,3-triazol-5-yl]pyridine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；NaI, pH 8.5, Bis-Tris propane, 20% (v/v) PEG 3350, ethylene glycol
分辨率 1.26 Å R-free 0.146
7MR5 Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to GXH-II-052 提交 2021-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
链 B 44–168（125 aa）
未记录 ZMS N,N'-{oxybis[(ethane-2,1-diyl)oxy(1-oxoethane-2,1-diyl)piperidine-1,4-diyl]}bis{4-[(4-{4-chloro-3-[(2-methylpropane-2-sulfonyl)amino]anilino}-5-methylpyrimidin-2-yl)amino]-2-fluorobenzamide} × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4 000
分辨率 1.82 Å R-free 0.212
7MR6 Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to GXH-II-082 提交 2021-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
链 B 44–168（125 aa）
未记录 ZMV N,N'-[(1,16-dioxo-4,7,10,13-tetraoxahexadecane-1,16-diyl)di(piperidine-1,4-diyl)]bis{4-[(4-{4-chloro-3-[(2-methylpropane-2-sulfonyl)amino]anilino}-5-methylpyrimidin-2-yl)amino]-2-fluorobenzamide} × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.85 Å R-free 0.260
7MR7 Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to GXH-II-075 提交 2021-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
链 B 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ZN1 4-[(4-{4-chloro-3-[(2-methylpropane-2-sulfonyl)amino]anilino}-5-methylpyrimidin-2-yl)amino]-2-fluoro-N-[1-(14-{3-[(2-{3-fluoro-4-[(piperidin-4-yl)carbamoyl]anilino}-5-methylpyrimidin-4-yl)amino]-5-[(2-methylpropane-2-sulfonyl)amino]phenyl}-14-oxo-4,7,10-trioxa-13-azatetradecanan-1-oyl)piperidin-4-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Ammonium sulfate,0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.40 Å R-free 0.194
7MR8 Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to GXH-II-076 提交 2021-05-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 ZNJ N-{3-[(2-{3-fluoro-4-[(piperidin-4-yl)carbamoyl]anilino}-5-methylpyrimidin-4-yl)amino]-5-[(2-methylpropane-2-sulfonyl)amino]benzoyl}-L-glutamic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.20 Å R-free 0.177
7MR9 Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to NC-II-153 提交 2021-05-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 ZMM 2-methyl-4-[3-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]isoquinolin-1(2H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.19 Å R-free 0.185
7MRA Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to NC-II-259 提交 2021-05-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 ZMJ N-[3-(2-methyl-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-4-yl)phenyl]ethanesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.16 Å R-free 0.186
7MRB Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 bound to NC-III-53 提交 2021-05-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 N49 N-[4-(4-chlorophenoxy)-3-(2-methyl-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-4-yl)phenyl]ethanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.20 Å R-free 0.190
7O18 N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH I-BET282 提交 2021-03-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 UYK (R)-4-(8-methoxy-1-(1-methoxypropan-2-yl)-2-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-1H-imidazo[4,5-c]quinolin-7-yl)-3,5-dimethylisoxazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；200mM CaCl2, 25% OEG4K, 100mM Tris HCl, pH 8.5
分辨率 1.70 Å R-free 0.210
7OEO C-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 N-(2,2-diphenylethyl)-4-methoxy-3,5-dimethyl-N-(2-(methylamino)-2-oxoethyl)benzamide 提交 2021-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 347–463（117 aa） 片段：UNP residues 347-463
未记录 V9Z N-(2,2-diphenylethyl)-4-methoxy-3,5-dimethyl-N-[2-(methylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M Hepes pH7.5 and 20%w/v PEG1500
分辨率 1.51 Å R-free 0.229
7P6V N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH compound 3ag 提交 2021-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 5Z4 ethyl 2-(2-(4-azido-N-((2-(1,5-dimethyl-6-oxo-1,6-dihydropyridin-3-yl)-1-((tetrahydro-2H-pyran-4-yl)methyl)-1H-benzo[d]imidazol-6-yl)methyl)-2,3,5,6-tetrafluorobenzamido)acetamido)acetate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；25% w/v PEG1500, 0.1 SPG pH 5.0
分辨率 1.17 Å R-free 0.241
7P6W N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH compound 3bg 提交 2021-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 5YY ethyl 2-(2-(4-azido-N-((2-(1,5-dimethyl-6-oxo-1,6-dihydropyridin-3-yl)-1-((tetrahydro-2H-pyran-4-yl)methyl)-1H-benzo[d]imidazol-6-yl)methyl)benzamido)acetamido)acetate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；30%w/v PEG 4K, 0.2M Na Acet, 0.1M TRIS pH 8.5
分辨率 1.31 Å R-free 0.221
7P6Y N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH compound 5ef 提交 2021-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 5Z1 4-benzoyl-N-(2-(2-(2-((2-(1,5-dimethyl-6-oxo-1,6-dihydropyridin-3-yl)-1-((tetrahydro-2H-pyran-4-yl)methyl)-1H-benzo[d]imidazol-6-yl)(methyl)amino)ethoxy)ethoxy)ethyl)-N-(2-oxo-2-((2-(2-(prop-2-yn-1-yloxy)ethoxy)ethyl)amino)ethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 sodium citrate pH 5.6, 10% w/v PEG4K, 10% w/v propan-2-ol
分辨率 1.88 Å R-free 0.222
7P6Y N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH compound 5ef 提交 2021-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 BBB 44–168（125 aa）
未记录 5Z1 4-benzoyl-N-(2-(2-(2-((2-(1,5-dimethyl-6-oxo-1,6-dihydropyridin-3-yl)-1-((tetrahydro-2H-pyran-4-yl)methyl)-1H-benzo[d]imidazol-6-yl)(methyl)amino)ethoxy)ethoxy)ethyl)-N-(2-oxo-2-((2-(2-(prop-2-yn-1-yloxy)ethoxy)ethyl)amino)ethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 sodium citrate pH 5.6, 10% w/v PEG4K, 10% w/v propan-2-ol
分辨率 1.88 Å R-free 0.222
7Q3F Bromodomain-containing 4 BD1 in complex with the inhibitor CRCM5484 提交 2021-10-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 8M6 2-[[11-ethanoyl-4-(furan-2-ylmethyl)-3-oxidanylidene-8-thia-4,6,11-triazatricyclo[7.4.0.0^{2,7}]trideca-1(9),2(7),5-trien-5-yl]sulfanyl]-~{N}-(2-methylpyridin-3-yl)ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.3M NaNO3, 16% PEG3350, 5% Ethylene glycol
分辨率 1.21 Å R-free 0.224
7QDL N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 with I-BET567 提交 2021-11-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 AKQ (2S,4R)-1-acetyl-4-((5-chloropyrimidin-2-yl)amino)-2-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-6-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1M Bis-Tris prop pH7.5, 0.02M sodium potassium, 20% v/v PEG3350
分辨率 1.67 Å R-free 0.210
7R5B Crystal structure of BRD4(1) in complex with the inhibitor MPM2 提交 2022-02-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 I5K 1-(3-aminophenyl)-3-methyl-5,6,7,8-tetrahydro-2~{H}-cyclohepta[c]pyrrol-4-one × 1 BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.77 Å R-free 0.194
7R9C Cocrystal of BRD4(D1) with N,N-dimethyl-2-[(3R)-3-(5-{2-[2-methyl-5-(propan-2-yl)phenoxy]pyrimidin-4-yl}-4-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-imidazol-1-yl)pyrrolidin-1-yl]ethan-1-amine 提交 2021-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 2IR N,N-dimethyl-2-[(3R)-3-(5-{2-[2-methyl-5-(propan-2-yl)phenoxy]pyrimidin-4-yl}-4-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-imidazol-1-yl)pyrrolidin-1-yl]ethan-1-amine × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M bis-tris propane, 20 % PEG 3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.216
7REK Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 in complex with dual BRD4-JAK2 inhibitor MA9-086 提交 2021-07-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain residues 44-168
未记录 R6S N~4~-[1-(tert-butylsulfonyl)-2,3-dihydro-1H-indol-6-yl]-N~2~-[3-fluoro-4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-5-methylpyrimidine-2,4-diamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Ammonium sulphate, 0.15 M Sodium chloride, 0.1 M Tris (pH 8.5), 25 % w/v PEG 3,350
分辨率 1.20 Å R-free 0.191
7REK Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 in complex with dual BRD4-JAK2 inhibitor MA9-086 提交 2021-07-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain residues 44-168
未记录 R6S N~4~-[1-(tert-butylsulfonyl)-2,3-dihydro-1H-indol-6-yl]-N~2~-[3-fluoro-4-(1-methylpiperidin-4-yl)phenyl]-5-methylpyrimidine-2,4-diamine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Ammonium sulphate, 0.15 M Sodium chloride, 0.1 M Tris (pH 8.5), 25 % w/v PEG 3,350
分辨率 1.20 Å R-free 0.191
7REL Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 in complex with dual BRD4-JAK2 inhibitor MA9-060 提交 2021-07-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 4OW N-[2-chloro-5-({2-[3-fluoro-4-(1-methylpiperidin-4-yl)anilino]-5-methylpyrimidin-4-yl}amino)phenyl]-2-methylpropane-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Ammonium sulphate, 0.15 M Sodium chloride, 0.1 M Tris (pH 8.5), 25 % w/v PEG 3,350
分辨率 1.55 Å R-free 0.191
7REM Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 in complex with dual BRD4-JAK2 inhibitor PN1-050 提交 2021-07-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：Bromo 1 domain residues 44-168
未记录 4OF N-[2-chloro-5-({2-[3-fluoro-4-(1-methylpiperidin-4-yl)anilino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl}amino)phenyl]-2-methylpropane-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Ammonium sulphate, 0.15 M Sodium chloride, 0.1 M Tris (pH 8.5), 25 % w/v PEG 3,350
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
7RJO Crystal structure of human Bromodomain containing protein 4 (BRD4) in complex with hnRNPK 提交 2021-07-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；25% w/v PEG3350, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris
分辨率 1.38 Å R-free 0.198
7RJP Crystal structure of human Bromodomain containing protein 4 (BRD4) in complex with SHMT 提交 2021-07-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；25% w/v PEG3350, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris
分辨率 1.25 Å R-free 0.174
7RJQ Crystal structure of human Bromodomain containing protein 4 (BRD4) in complex with ILF3 提交 2021-07-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；3.0 M sodium chloride, 0.1 M HEPES
分辨率 1.72 Å R-free 0.223
7RJR Crystal structure of human Bromodomain containing protein 4 (BRD4) in complex with BCLTF1 提交 2021-07-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；30% w/v PEG4000, 0.2 M sodium acetate trihydrate, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 1.45 Å R-free 0.207
7RMD Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SJ001011461-1 提交 2021-07-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：UNP residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 5Z0 2-[(6S,10R)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]-N-(1,3,4-thiadiazol-2-yl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.8, 20% PEG3350, 15% ethylene glycol
分辨率 1.18 Å R-free 0.173
7RN2 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with SJ001010551-2 提交 2021-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：first bromodomain (UNP residues 44-168)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 5ZQ 2-[(6S,10S)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]-N-[(pyridin-2-yl)methyl]acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.8, 20% PEG3350, 15% ethylene glycol
分辨率 1.05 Å R-free 0.184
7RUH Bromodomain-containing protein 4 (BRD4) bromodomain 2 (BD2) complexed with XR844 提交 2021-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 333–460（128 aa） 片段：bromodomain 2 (UNP residues 333-460)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 7QZ N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(5-{[(2-fluorophenyl)carbamoyl]amino}-1-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}-2,2,2-trifluoroethane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 26% PEG2000 MME
分辨率 1.70 Å R-free 0.218
7RUI Bromodomain-containing protein 4 (BRD4) bromodomain 1 (BD1) complexed with XR844 提交 2021-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1 (UNP residues 44-168)
未记录 7QZ N-{1-[1,1-di(pyridin-2-yl)ethyl]-6-(5-{[(2-fluorophenyl)carbamoyl]amino}-1-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyridin-3-yl)-1H-indol-4-yl}-2,2,2-trifluoroethane-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；1.6 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.1 M sodium chloride
分辨率 1.35 Å R-free 0.190
7RXR Crystal Structure of BRD4(D1) with 4-[4-(4-bromophenyl)-1-(piperidin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]-N-(3,5-dimethylphenyl)pyrimidin-2-amine 提交 2021-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 7ZB 4-[4-(4-bromophenyl)-1-(piperidin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]-N-(3,5-dimethylphenyl)pyrimidin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 3350
分辨率 1.41 Å R-free 0.186
7RXR Crystal Structure of BRD4(D1) with 4-[4-(4-bromophenyl)-1-(piperidin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]-N-(3,5-dimethylphenyl)pyrimidin-2-amine 提交 2021-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 7ZB 4-[4-(4-bromophenyl)-1-(piperidin-4-yl)-1H-imidazol-5-yl]-N-(3,5-dimethylphenyl)pyrimidin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 3350
分辨率 1.41 Å R-free 0.186
7RXS Crystal of BRD4(D1) with 2-[(3S)-3-{5-[2-(3,5-dimethylphenoxy)pyrimidin-4-yl]-4-(4-iodophenyl)-1H-imidazol-1-yl}pyrrolidin-1-yl]ethan-1-amine 提交 2021-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 7ZT 2-[(3S)-3-{5-[2-(3,5-dimethylphenoxy)pyrimidin-4-yl]-4-(4-iodophenyl)-1H-imidazol-1-yl}pyrrolidin-1-yl]ethan-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 3350
分辨率 1.43 Å R-free 0.228
7RXT Crystal of BRD4(D1) with 2-[(3R)-3-{5-[2-(3,5-dimethylphenoxy)pyrimidin-4-yl]-4-(4-iodophenyl)-1H-imidazol-1-yl}pyrrolidin-1-yl]ethan-1-amine 提交 2021-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 7ZK 2-[(3R)-3-{5-[2-(3,5-dimethylphenoxy)pyrimidin-4-yl]-4-(4-iodophenyl)-1H-imidazol-1-yl}pyrrolidin-1-yl]ethan-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；PEG 3350
分辨率 1.68 Å R-free 0.238
7T3F Development of BRD4 inhibitors as arsenicals antidotes 提交 2021-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 EM0 4-fluoro-3-methyl-N-(3-methyl-2-oxo-1,2,3,4-tetrahydroquinazolin-6-yl)benzene-1-sulfonamide × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M HEPES, pH7.4
分辨率 1.28 Å R-free 0.145
7TUQ Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 in complex with monoacetylated SARS-CoV-2 E 提交 2022-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 42–180（139 aa） 片段：BD1 (UNP residues 42-180)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 12% glycerol
分辨率 2.68 Å R-free 0.276
7TUQ Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 in complex with monoacetylated SARS-CoV-2 E 提交 2022-02-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 42–180（139 aa） 片段：BD1 (UNP residues 42-180)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 8.5, 12% glycerol
分辨率 2.68 Å R-free 0.276
7TV0 Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 in complex with dual-acetylated SARS-CoV-2 E 提交 2022-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 42–180（139 aa） 片段：BD1 (UNP residues 42-180)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 mM Tris, pH 8.5, 12% glycerol
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
7TV0 Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 in complex with dual-acetylated SARS-CoV-2 E 提交 2022-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 42–180（139 aa） 片段：BD1 (UNP residues 42-180)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 mM Tris, pH 8.5, 12% glycerol
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
7TV0 Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 in complex with dual-acetylated SARS-CoV-2 E 提交 2022-02-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 42–180（139 aa） 片段：BD1 (UNP residues 42-180)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 mM Tris, pH 8.5, 12% glycerol
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
7TV0 Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 in complex with dual-acetylated SARS-CoV-2 E 提交 2022-02-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 42–180（139 aa） 片段：BD1 (UNP residues 42-180)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 mM Tris, pH 8.5, 12% glycerol
分辨率 2.60 Å R-free 0.292
7UGF First bromodomain of BRD4 liganded with BMS-536924 提交 2022-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 N6I (3M)-4-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]amino}-3-[4-methyl-6-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；0.2M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.45 Å R-free 0.190
7USJ BRD4-BD2 in complex with SF2523 提交 2022-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：BD2
未记录 82V 3-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-5-(morpholin-4-yl)-7H-thieno[3,2-b]pyran-7-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 28 % w/v PEG 3350
分辨率 2.08 Å R-free 0.265
7USJ BRD4-BD2 in complex with SF2523 提交 2022-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 352–457（106 aa） 片段：BD2
未记录 82V 3-(2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-6-yl)-5-(morpholin-4-yl)-7H-thieno[3,2-b]pyran-7-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 28 % w/v PEG 3350
分辨率 2.08 Å R-free 0.265
7USK BRD4-BD2 Ligand free 提交 2022-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 352–457（106 aa） 片段：BD2
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289.15 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 28 % w/v PEG 3350
分辨率 1.22 Å R-free 0.232
7UTY First bromodomain of BRD4 liganded with compound 2c 提交 2022-04-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 OFR prop-2-en-1-yl (5S)-1-ethyl-7-methyl-5-(4-methylphenyl)-2,4-dioxo-1,2,3,4,5,8-hexahydropyrido[2,3-d]pyrimidine-6-carboxylate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M TRIS pH 8.5, 25% PEG 3350
分辨率 1.55 Å R-free 0.244
7UZN CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX WITH BMT-206059 AKA 2-{(3M)-3-(1,4-DIMETHYL-1H-1,2,3-TRIAZOL-5-YL)-8-FLUORO-5-[(S)-(OXAN-4-YL)(PHENYL)METHYL]-5H-PYRIDO[3,2-b]INDOL-7-YL}PROPAN-2-OL, TRIPLY DEUTERATED ON THE 4-METHYL GROUP 提交 2022-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：first bromodomain
未记录 PQF 2-{(3M)-3-(1,4-dimethyl-1H-1,2,3-triazol-5-yl)-8-fluoro-5-[(S)-(oxan-4-yl)(phenyl)methyl]-5H-pyrido[3,2-b]indol-7-yl}propan-2-ol × 1 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM bis-tris propane, pH 8.5, 200 mM NaNO3, 20.5%(w/v) PEG 3350
分辨率 1.69 Å R-free 0.217
7V1U Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor ZJ12 提交 2021-08-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 5E3 ~{N}-(3-ethyl-6-methoxy-1,2-benzoxazol-5-yl)-2-methoxy-benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；30% PEG5000, 0.2M (NH4)2SO4, 0.1M MES monohydrate, PH6.5
分辨率 1.82 Å R-free 0.259
7V2J Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor 33 提交 2021-08-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 5FZ ~{N}-(3-ethyl-6-methoxy-1,2-benzoxazol-5-yl)-4-methoxy-benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；0.1 M TRIS HCl, pH 8.5, 8% PEG8000
分辨率 2.24 Å R-free 0.241
7W3D Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 (BD1) in complex with N2-(1,2,3-benzotriazol-5-yl)-N3-(dimethylsulfamoyl)-N6-[(2S)-1-methoxypropan-2-yl]pyridine-2,3,6-triamine 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 89T N2-(1,2,3-benzotriazol-5-yl)-N3-(dimethylsulfamoyl)-N6-[(2S)-1-methoxypropan-2-yl]pyridine-2,3,6-triamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；287 K；6M sodium formate, 10% glycerol
分辨率 1.98 Å R-free 0.325
7WJS Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor Y13157 提交 2022-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 JFL 2-(2-cyclobutyl-1~{H}-imidazol-5-yl)-7-[2-(4-fluoranyl-2,6-dimethyl-phenoxy)-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)phenyl]-5-methyl-furo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；1.5 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 2.73 Å R-free 0.215
7WJS Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor Y13157 提交 2022-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 JFL 2-(2-cyclobutyl-1~{H}-imidazol-5-yl)-7-[2-(4-fluoranyl-2,6-dimethyl-phenoxy)-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)phenyl]-5-methyl-furo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；1.5 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 2.73 Å R-free 0.215
7WJS Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor Y13157 提交 2022-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa）
未记录 JFL 2-(2-cyclobutyl-1~{H}-imidazol-5-yl)-7-[2-(4-fluoranyl-2,6-dimethyl-phenoxy)-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)phenyl]-5-methyl-furo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；1.5 M Lithium sulfate monohydrate, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 2.73 Å R-free 0.215
7WKY Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor Y13153 提交 2022-01-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 JFR 2-(2-cyclopentyl-1~{H}-imidazol-5-yl)-7-[2-(4-fluoranyl-2,6-dimethyl-phenoxy)-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)phenyl]-5-methyl-furo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 2.83 Å R-free 0.246
7WKY Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor Y13153 提交 2022-01-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 JFR 2-(2-cyclopentyl-1~{H}-imidazol-5-yl)-7-[2-(4-fluoranyl-2,6-dimethyl-phenoxy)-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)phenyl]-5-methyl-furo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 2.83 Å R-free 0.246
7WKY Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor Y13153 提交 2022-01-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa）
未记录 JFR 2-(2-cyclopentyl-1~{H}-imidazol-5-yl)-7-[2-(4-fluoranyl-2,6-dimethyl-phenoxy)-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)phenyl]-5-methyl-furo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0
分辨率 2.83 Å R-free 0.246
7WL4 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor SLP-50 提交 2022-01-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 JFU ~{N}-[2-ethyl-6-(4-methylpiperazin-1-yl)-3-oxidanylidene-2,7-diazatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaen-9-yl]-2,4-bis(fluoranyl)benzenesulfonamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Sodium chloride, 0.1 M BICINE pH 9.0, 20% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
分辨率 1.82 Å R-free 0.221
7WL4 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor SLP-50 提交 2022-01-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Sodium chloride, 0.1 M BICINE pH 9.0, 20% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
分辨率 1.82 Å R-free 0.221
7WL4 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor SLP-50 提交 2022-01-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa）
未记录 JFU ~{N}-[2-ethyl-6-(4-methylpiperazin-1-yl)-3-oxidanylidene-2,7-diazatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaen-9-yl]-2,4-bis(fluoranyl)benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Sodium chloride, 0.1 M BICINE pH 9.0, 20% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
分辨率 1.82 Å R-free 0.221
7WL4 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor SLP-50 提交 2022-01-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 44–168（125 aa）
未记录 JFU ~{N}-[2-ethyl-6-(4-methylpiperazin-1-yl)-3-oxidanylidene-2,7-diazatricyclo[6.3.1.0^{4,12}]dodeca-1(12),4,6,8,10-pentaen-9-yl]-2,4-bis(fluoranyl)benzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M Sodium chloride, 0.1 M BICINE pH 9.0, 20% v/v Polyethylene glycol monomethyl ether 550
分辨率 1.82 Å R-free 0.221
7WWZ BRD4-BD1 complexed with NEO2734 提交 2022-02-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 43–168（126 aa） 片段：bromodomain
未记录 7OW 1,3-dimethyl-5-[2-(oxan-4-yl)-3-[2-(trifluoromethyloxy)ethyl]benzimidazol-5-yl]pyridin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6；289 K；PEG3350, NaNO3, ethylene glycol
分辨率 1.16 Å R-free 0.191
7X6T Discovery of Selective BRD4 BD1 Inhibitor Based on [1,2,4] triazolo [4,3-b] pyridazine Scaffold 提交 2022-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–165（124 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 97F (2~{R})-2-[[3-methyl-6-(2-phenoxyphenyl)-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-8-yl]amino]propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.9M~3.9M sodium formate
分辨率 1.44 Å R-free 0.198
7YL2 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor Y07004 提交 2022-07-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 JCO N-(1-ethyl-2-oxidanylidene-3H-indol-5-yl)cyclohexanesulfonamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；0.2M Na2NO3, 0.1M HEPES, 20% PEG3350, 10% EtGhly, PH 7.8
分辨率 1.62 Å R-free 0.204
7YMG Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 (BD1) in complex with 2-({3-ethyl-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-yl}amino)-3-(1H-indol-3-yl)propan-1-ol 提交 2022-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 NA SODIUM ION × 1 JHO (2S)-2-[(3-ethyl-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-yl)amino]-3-(1H-indol-3-yl)propan-1-ol × 1 FMT FORMIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；287 K；Protein concentration 12 mg/mL Protein Stoarage buffer: 10mM HEPES pH 7.5, 500mM NaCl, 5% Glycerol, 10 mM DTT Reservoir solution: 5M sodium formate, 6% glycerol (Protein/reservoir= 1000nL/1000nL) co-crystallization: added 5 mM chemical and incubated overnight at 4 celsius.
分辨率 1.40 Å R-free 0.196
7YMG Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 (BD1) in complex with 2-({3-ethyl-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-yl}amino)-3-(1H-indol-3-yl)propan-1-ol 提交 2022-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 NA SODIUM ION × 1 JHO (2S)-2-[(3-ethyl-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-yl)amino]-3-(1H-indol-3-yl)propan-1-ol × 1 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；287 K；Protein concentration 12 mg/mL Protein Stoarage buffer: 10mM HEPES pH 7.5, 500mM NaCl, 5% Glycerol, 10 mM DTT Reservoir solution: 5M sodium formate, 6% glycerol (Protein/reservoir= 1000nL/1000nL) co-crystallization: added 5 mM chemical and incubated overnight at 4 celsius.
分辨率 1.40 Å R-free 0.196
7YQ9 Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 (BD1) in complex with N-[2-(1H-indol-3-yl)ethyl]-3-(trifluoromethyl)[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-amine 提交 2022-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 JLX N-[2-(1H-indol-3-yl)ethyl]-3-(trifluoromethyl)-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-amine × 1 FMT FORMIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；287 K；protein concentration 12 mg/mL Protein storage buffer: 10 mM HEPES pH 7.5, 500 mM NaCl, 5% glycerol 10 mM DTT Reservoir solution: 6M sodium formate, 6% glycerol Protein: reservoir solution=1:1 co-crystallization: added 5mM chemical and incubated overnight at 4 celsius
分辨率 1.50 Å R-free 0.201
7YQ9 Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 (BD1) in complex with N-[2-(1H-indol-3-yl)ethyl]-3-(trifluoromethyl)[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-amine 提交 2022-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 JLX N-[2-(1H-indol-3-yl)ethyl]-3-(trifluoromethyl)-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；287 K；protein concentration 12 mg/mL Protein storage buffer: 10 mM HEPES pH 7.5, 500 mM NaCl, 5% glycerol 10 mM DTT Reservoir solution: 6M sodium formate, 6% glycerol Protein: reservoir solution=1:1 co-crystallization: added 5mM chemical and incubated overnight at 4 celsius
分辨率 1.50 Å R-free 0.201
7ZE6 BRD4 in complex with FragLite10 提交 2022-03-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 1P8 6-bromo-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.04 Å R-free 0.233
7ZE7 BRD4 in complex with FragLite21 提交 2022-03-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 UUJ 5-bromo-2-hydroxybenzonitrile × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.23 Å R-free 0.236
7ZEF BRD4 in complex with FragLite22 提交 2022-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 UUG (4-bromo-2-methoxyphenyl)methanol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.12 Å R-free 0.233
7ZFN BRD4 in complex with FragLite24 提交 2022-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 IT4 4-bromanyl-2-oxidanyl-benzoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.12 Å R-free 0.244
7ZFS BRD4 in complex with FragLite32 提交 2022-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 IS0 4-bromanyl-1,2-dimethoxy-benzene × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.25 Å R-free 0.227
7ZFT BRD4 in complex with FragLite33 提交 2022-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 HWC 3-azanyl-5-bromanyl-1-methyl-pyridin-2-one × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.28 Å R-free 0.252
7ZFU BRD4 in complex with PepLite-Pro 提交 2022-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 IS6 (2R)-N-(3-bromanylprop-2-ynyl)-1-ethanoyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.29 Å R-free 0.204
7ZFV BRD4 in complex with PepLite-Ala 提交 2022-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 IJR (2~{S})-2-acetamido-~{N}-(3-bromanylprop-2-ynyl)propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.37 Å R-free 0.223
7ZFY BRD4 in complex with PepLite-Gly 提交 2022-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 ISK 2-acetamido-N-(3-bromanylprop-2-ynyl)ethanamide × 1 GOL GLYCEROL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.15 Å R-free 0.213
7ZFZ BRD4 in complex with PepLite-Val 提交 2022-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 IT8 (2R)-2-acetamido-N-(3-bromanylprop-2-ynyl)-3-methyl-butanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.08 Å R-free 0.236
7ZG1 BRD4 in complex with PepLite-Tyr 提交 2022-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 T9J Nalpha-acetyl-N-(3-bromoprop-2-yn-1-yl)-L-tyrosinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.16 Å R-free 0.250
7ZG2 BRD4 in complex with Acetyl-Lys 提交 2022-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 8WS (2S)-2,6-diacetamido-N-methyl-hexanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.18 Å R-free 0.231
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 333–460（128 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 333–460（128 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
8B5B Human BRD4 bromdomain 1 in complex with a H4 peptide containing acetyl lysine and ApmTri (H4K5acK8ApmTri) 提交 2022-09-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；200 mM sodium acetate trihydrate 100 mM Trishydrochloride pH 8.5 30% w/v PEG 4000
分辨率 1.92 Å R-free 0.246
8B5B Human BRD4 bromdomain 1 in complex with a H4 peptide containing acetyl lysine and ApmTri (H4K5acK8ApmTri) 提交 2022-09-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；200 mM sodium acetate trihydrate 100 mM Trishydrochloride pH 8.5 30% w/v PEG 4000
分辨率 1.92 Å R-free 0.246
8B5B Human BRD4 bromdomain 1 in complex with a H4 peptide containing acetyl lysine and ApmTri (H4K5acK8ApmTri) 提交 2022-09-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 44–168（125 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；200 mM sodium acetate trihydrate 100 mM Trishydrochloride pH 8.5 30% w/v PEG 4000
分辨率 1.92 Å R-free 0.246
8B5C Human BRD4 bromdomain 1 in complex with a H4 peptide containing ApmTri (H4K5/8ApmTri) 提交 2022-09-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；200 mM sodium acetate trihydrate 100 mM Trishydrochloride pH 8.5 30% w/v PEG 4000
分辨率 1.58 Å R-free 0.208
8B96 Crystal structure of the human BRD4-BD1 bromodomain in complex with the inhibitor CRCM5464 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 Q2F ~{N}-[[4-[[7-ethyl-2,6-bis(oxidanylidene)purin-3-yl]methyl]cyclohexyl]methyl]-3-fluoranyl-4-(oxan-4-yloxy)benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298.15 K；0.3M NaNO3, 16% PEG3350, 5% Ethylene Glycol
分辨率 1.34 Å R-free 0.195
8B98 Crystal structure of the human BRD4-BD1 bromodomain in complex with the inhibitor CRCM5483 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 Q2F ~{N}-[[4-[[7-ethyl-2,6-bis(oxidanylidene)purin-3-yl]methyl]cyclohexyl]methyl]-3-fluoranyl-4-(oxan-4-yloxy)benzenesulfonamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298.15 K；0.3M NaNO3, 18% PEG3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.200
8BDS Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 44–168（125 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.4M Ammonium Sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 1.72 Å R-free 0.197
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 333–460（128 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–460（128 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 333–460（128 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 333–460（128 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BEB Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 49 提交 2022-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 44–168（125 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 QIK (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]butylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.8M ammonium sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M bis-Tris pH5.5
分辨率 3.18 Å R-free 0.274
8C11 BRD4 in complex with 2-(2-(4-(3,5-dimethylisoxazol-4-yl)-1H-pyrazol-1-yl)acetamido)-N-ethylpropanamide 提交 2022-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 SY0 (2~{S})-2-[2-[4-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)pyrazol-1-yl]ethanoylamino]-~{N}-ethyl-propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Buffer system 3 (1 M Tris, 1 M BICINE, pH 8.5), 34-44% Precipitant Solution 3 (20% PEG 4000, 40%) and 60-80 mM Halogens Mix (NaF, NaBr and NaI) solution
分辨率 1.80 Å R-free 0.234
8CKF Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 L94C variant in complex with racemic 3,5-dimethylisoxazol ligand 提交 2023-02-15 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
突变：L94C E5Q 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-[(~{R})-oxidanyl(pyridin-3-yl)methyl]phenol × 1 V0R 3-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-5-[(~{S})-oxidanyl(pyridin-3-yl)methyl]phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.15 M Ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 1.88 Å R-free 0.260
8DYR BRD4-D1 in complex with BET inhibitor 提交 2022-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 U59 (4P,6P)-4-[2-(cyclopropylmethoxy)-5-(methanesulfonyl)phenyl]-6-[1-(2-fluoroethyl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl]-2-methylisoquinolin-1(2H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM Magnesium Chloride, 100 mM HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350
分辨率 1.47 Å R-free 0.197
8E17 BRD4-D1 in complex with BET inhibitor 提交 2022-08-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 U7R (4P,6M)-6-[1-(2-fluoroethyl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl]-4-[5-(methanesulfonyl)-2-methoxyphenyl]-2-methylisoquinolin-1(2H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；170 mM Sodium Acetate, 85 mM TRIS pH 8.5, 25% PEG 4000
分辨率 1.47 Å R-free 0.184
8E3W BRD4-D1 in complex with BET inhibitor 提交 2022-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 UHI (4P)-4-[2-(cyclopropylmethoxy)-5-(methanesulfonyl)phenyl]-2-methylisoquinolin-1(2H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；24.1% PEG 3350, 200 mM KCl
分辨率 1.47 Å R-free 0.192
8EAD Crystal structure of the first bromodomain (BD1) of human BRD4 in complex with dual BRD4-JAK2 inhibitor MA9-177 提交 2022-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 UY0 N-{2-chloro-5-[(5-methyl-2-{4-[2-(pyrrolidin-1-yl)ethoxy]anilino}pyrimidin-4-yl)amino]phenyl}-2-methylpropane-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Ammonium sulphate, 0.15 M Sodium chloride, 0.1 M Tris (pH 8.5), 25 % w/v PEG 3,350
分辨率 1.65 Å R-free 0.195
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 44–168（125 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 44–168（125 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 44–168（125 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 44–168（125 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 T 44–168（125 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 X 44–168（125 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8FVK First bromodomain of BRD4 liganded with CCS-1477 提交 2023-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Tris pH8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 1.53 Å R-free 0.189
8FVK First bromodomain of BRD4 liganded with CCS-1477 提交 2023-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Tris pH8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 1.53 Å R-free 0.189
8G46 Cryo-EM structure of DDB1deltaB-DDA1-DCAF16-BRD4(BD2)-MMH2 提交 2023-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 333–460（128 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 YK3 tert-butyl [(6S,10P)-4-{4-[(ethanesulfonyl)amino]phenyl}-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]acetate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4, 200 mM NaCl, 2 mM TCEP, 0.011% LMNG
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；detergent added directly before grid application
分辨率 2.20 Å
8GPZ Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 (BD1) in complex with C239-0012 提交 2022-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 2 NA SODIUM ION × 1 KC3 3-methyl-6-(4-methylpiperidin-1-yl)-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；6 M Sodium formate, 10% Glycerol
分辨率 1.53 Å R-free 0.212
8GQ0 Crystal structure of BRD4 bromodomain 1 (BD1) in complex with STL233497 提交 2022-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 4 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 KCL ~{N}-[2-(1~{H}-indol-3-yl)ethyl]-3-methyl-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；6 M Sodium formate, 10% Glycerol
分辨率 1.44 Å R-free 0.189
8IBQ Bromodomain and Extra-terminal Domain (BET) BRD4 提交 2023-02-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–165（122 aa）
未记录 OWO 7-[2-fluoranyl-3-(1,3,5-trimethylpyrazol-4-yl)phenyl]-1~{H}-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；3.6M Naformate 10% glycerol
分辨率 1.45 Å R-free 0.244
8IDH Bromodomain and Extra-terminal Domain (BET) BRD4 提交 2023-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 349–460（112 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） OWO 7-[2-fluoranyl-3-(1,3,5-trimethylpyrazol-4-yl)phenyl]-1~{H}-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.2M NaCl,0.1M bistris,18-28%PEG3350
分辨率 1.57 Å R-free 0.252
8K14 X-ray crystal structure of 18a in BRD4(1) 提交 2023-07-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 VFI 4-[8-methoxy-2-methyl-1-(1-phenylethyl)imidazo[4,5-c]quinolin-7-yl]-3,5-dimethyl-1,2-oxazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 2.0 M Ammonium sulfate
分辨率 1.28 Å R-free 0.174
8OV6 Ternary structure of intramolecular bivalent glue degrader IBG1 bound to BRD4 and DCAF16:DDB1deltaBPB 提交 2023-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 42–459（418 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 U79 methyl 2-[(9~{S})-7-[4-[4-[[4-[(3-cyano-4-methyl-1~{H}-indol-7-yl)sulfamoyl]phenyl]methylcarbamoyl]phenyl]phenyl]-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3.5 uL complex was dispensed onto the grid, allowed to disperse for 10 s, blotted for 3.5 s using blot force 3, then plunged into liquid ethane
分辨率 3.77 Å
8P9F Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the dual BET/HDAC inhibitor NB161 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 X9O ~{N}-(2-aminophenyl)-4-[2-(2-azanyl-5-methyl-4-oxidanyl-phenyl)hydrazinyl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 1 mM inhibitor NB161. Crystallization buffer: 25% PEG 3350, 0.15 M Na nitrate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 7.6. Vol ratio 1:1
分辨率 1.30 Å R-free 0.215
8P9G Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the dual BET/HDAC inhibitor NB390 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 X9K ~{N}-(2-aminophenyl)-4-[(~{E})-(6-methyl-7-oxidanyl-1~{H}-indol-4-yl)diazenyl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 1 mM inhibitor NB390. Crystallization buffer: 25% PEG 3350, 0.2 M Na formate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 7.9. Vol. ratio 1:1
分辨率 1.10 Å R-free 0.183
8P9H Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the dual BET/HDAC inhibitor NB437 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 X9C ~{N}-(2-aminophenyl)-2-(6-methyl-7-oxidanylidene-1~{H}-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)quinoline-6-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 1 mM inhibitor NB437. Reservoir buffer: 25% PEG 3350, 0.2 M Na nitrate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 7.9. Vol. ratio 1:2
分辨率 1.19 Å R-free 0.173
8P9I Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the dual BET/HDAC inhibitor NB462 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 X8T ~{N}-(2-aminophenyl)-4-(6-methyl-7-oxidanylidene-1~{H}-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 1 mM inhibitor NB462. Crystallization buffer: 24% PEG 3350, 0.15 M Na formate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 7.6. Vol. ratio 1:2
分辨率 1.23 Å R-free 0.193
8P9I Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the dual BET/HDAC inhibitor NB462 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 X8T ~{N}-(2-aminophenyl)-4-(6-methyl-7-oxidanylidene-1~{H}-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 1 mM inhibitor NB462. Crystallization buffer: 24% PEG 3350, 0.15 M Na formate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 7.6. Vol. ratio 1:2
分辨率 1.23 Å R-free 0.193
8P9J Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the dual BET/HDAC inhibitor NB500 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 X8O ~{N}-(2-aminophenyl)-5-(6-methyl-7-oxidanylidene-1~{H}-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)pyridine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 1 mM inhibitor NB500. Crystallization buffer: 25% PEG 3350, 0.1 M Na nitrate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 7.3. Vol ratio 1:1
分辨率 1.42 Å R-free 0.206
8P9K Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the dual BET/HDAC inhibitor NB503 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X9U ~{N}-(2-azanyl-5-phenyl-phenyl)-4-(6-methyl-7-oxidanylidene-1~{H}-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 1 mM inhibitor NB503. Crystallization buffer: 25% PEG 3350, 0.1 M Na malonate pH 7, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 7.3. Vol ratio 1:2
分辨率 1.25 Å R-free 0.175
8P9L Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the dual BET/HDAC inhibitor NB512 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 XA3 ~{N}-(2-azanyl-5-phenyl-phenyl)-5-(6-methyl-7-oxidanylidene-1~{H}-pyrrolo[2,3-c]pyridin-4-yl)pyridine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 1 mM inhibitor NB512. Reservoir buffer: 24% PEG 3350, 0.1 M Na/K Tartrate, 10% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 7.3. Vol ratio 1:2
分辨率 1.29 Å R-free 0.188
8PIQ Crystal Structure of BRD4-BD1 with BI894999 提交 2023-06-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 ZHO ~{N},3-dimethyl-6-[6-(4-methylpiperazin-1-yl)-1-(phenylmethyl)benzimidazol-2-yl]-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-8-amine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；100mM Imidazole pH 6.9 13.5% w/v PEG8000
分辨率 1.12 Å R-free 0.187
8PXA N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH (S)-5-(1-((1-(1-isopropylpiperidine-4-carbonyl)piperidin-3-yl)methyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)-1,3-dimethylpyridin-2(1H)-one 提交 2023-07-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–168（125 aa）
未记录 I0Z 1,3-dimethyl-5-[1-[[(3~{S})-1-(1-propan-2-ylpiperidin-4-yl)carbonylpiperidin-3-yl]methyl]benzimidazol-2-yl]pyridin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris pH8.5, 12% w/v PEG4K
分辨率 1.30 Å R-free 0.217
8PXM N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH (1R,1'R)-7,7'-(pentane-1,5-diylbis(oxy))bis(1,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[d]azepin-2-one) 提交 2023-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 ZTY (1R)-7-[5-[[(1R)-1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-1H-3-benzazepin-7-yl]oxy]pentoxy]-1,3-dimethyl-1H-3-benzazepin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris pH8.5, 0.2M lithium sulphate, 16% w/v PEG4K
分辨率 2.38 Å R-free 0.309
8PXM N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH (1R,1'R)-7,7'-(pentane-1,5-diylbis(oxy))bis(1,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[d]azepin-2-one) 提交 2023-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris pH8.5, 0.2M lithium sulphate, 16% w/v PEG4K
分辨率 2.38 Å R-free 0.309
8PXN N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH (1R,1'R)-7,7'-(ethane-1,2-diylbis(oxy))bis(1,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[d]azepin-2-one) 提交 2023-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZTT (1R)-7-[2-[[(1R)-1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-1H-3-benzazepin-7-yl]oxy]ethoxy]-1,3-dimethyl-1H-3-benzazepin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris pH8.5, 12% w/v 4K
分辨率 1.95 Å R-free 0.270
8PXN N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH (1R,1'R)-7,7'-(ethane-1,2-diylbis(oxy))bis(1,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[d]azepin-2-one) 提交 2023-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris pH8.5, 12% w/v 4K
分辨率 1.95 Å R-free 0.270
8PXN N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH (1R,1'R)-7,7'-(ethane-1,2-diylbis(oxy))bis(1,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[d]azepin-2-one) 提交 2023-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris pH8.5, 12% w/v 4K
分辨率 1.95 Å R-free 0.270
8PXN N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 WITH (1R,1'R)-7,7'-(ethane-1,2-diylbis(oxy))bis(1,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-benzo[d]azepin-2-one) 提交 2023-07-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZTT (1R)-7-[2-[[(1R)-1,3-dimethyl-2-oxidanylidene-1H-3-benzazepin-7-yl]oxy]ethoxy]-1,3-dimethyl-1H-3-benzazepin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；0.1M Tris pH8.5, 12% w/v 4K
分辨率 1.95 Å R-free 0.270
8Q34 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the ligand ZZ001229a 提交 2023-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–171（128 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 IX4 ~{N}-(1~{H}-imidazo[4,5-b]pyridin-2-ylmethyl)-3-(3-methyl-1,2-diazirin-3-yl)propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% PEG6000 -- 10% ethylene glycol -- 0.1M HEPES pH 7.0 -- 0.2M sodium chloride
分辨率 1.48 Å R-free 0.216
8Q34 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the ligand ZZ001229a 提交 2023-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–171（128 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 IX4 ~{N}-(1~{H}-imidazo[4,5-b]pyridin-2-ylmethyl)-3-(3-methyl-1,2-diazirin-3-yl)propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% PEG6000 -- 10% ethylene glycol -- 0.1M HEPES pH 7.0 -- 0.2M sodium chloride
分辨率 1.48 Å R-free 0.216
8Q34 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the ligand ZZ001229a 提交 2023-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–171（128 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 IX4 ~{N}-(1~{H}-imidazo[4,5-b]pyridin-2-ylmethyl)-3-(3-methyl-1,2-diazirin-3-yl)propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% PEG6000 -- 10% ethylene glycol -- 0.1M HEPES pH 7.0 -- 0.2M sodium chloride
分辨率 1.48 Å R-free 0.216
8Q34 Crystal structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the ligand ZZ001229a 提交 2023-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 44–171（128 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 IX4 ~{N}-(1~{H}-imidazo[4,5-b]pyridin-2-ylmethyl)-3-(3-methyl-1,2-diazirin-3-yl)propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% PEG6000 -- 10% ethylene glycol -- 0.1M HEPES pH 7.0 -- 0.2M sodium chloride
分辨率 1.48 Å R-free 0.216
8QAL Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with acetyl-pyrrole derivative compound 83 提交 2023-08-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
突变：First bromodomain (residues 1796-1899) GQX 2-[4-(3-methyl-4-oxidanylidene-2,5,6,7-tetrahydroisoindol-1-yl)-1,3-thiazol-2-yl]guanidine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；16% PEG 3350, 20% ethylene glycol
分辨率 1.30 Å R-free 0.171
8QAN Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with acetyl-pyrrole derivative compound 79 提交 2023-08-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
突变：First bromodomain (residues 1796-1899) GKI 1-[2-methyl-4-(3-methylbutyl)-5-(2-piperazin-1-yl-1,3-thiazol-4-yl)-1~{H}-pyrrol-3-yl]ethanone × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；16% PEG 3350, 20% ethylene glycol
分辨率 1.25 Å R-free 0.176
8QAP Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with acetyl-pyrrole derivative compound 2 提交 2023-08-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
突变：First bromodomain (residues 1796-1899) Q9U 2-[4-(3,6,6-trimethyl-4-oxidanylidene-5,7-dihydro-2~{H}-isoindol-1-yl)-1,3-thiazol-2-yl]guanidine × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；16% PEG 3350, 20% ethylene glycol
分辨率 1.40 Å R-free 0.186
8QAR Crystal Structure of the first bromodomain of BRD4 in complex with acetyl-pyrrole derivative compound 98 提交 2023-08-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
突变：First bromodomain (residues 1796-1899) GI0 3-methyl-1-[2-[4-[(4-methyl-1~{H}-pyrazol-3-yl)methyl]piperazin-1-yl]-1,3-thiazol-4-yl]-2,5,6,7-tetrahydroisoindol-4-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；16% PEG 3350, 20% ethylene glycol
分辨率 1.50 Å R-free 0.201
8R5H Ubiquitin ligation to neosubstrate by a cullin-RING E3 ligase & Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-VHL-MZ1 with trapped UBE2R2~donor UB-BRD4 BD2 提交 2023-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 346–460（115 aa）
突变：C356A C357A K368C C391A C429A ZN ZINC ION × 3 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.44 Å
8RQ9 Crystal structure of PROTAC CFT-1297 in complex with CRBN-midi and BRD4(BD2) 提交 2024-01-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 333–460（128 aa）
未记录 A1H2F (3~{S})-3-[7-[1-[7-[4-[6-(4-chlorophenyl)-1-methyl-spiro[[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepine-4,1'-cyclopropane]-8-yl]pyrazol-1-yl]heptyl]piperidin-4-yl]-3-oxidanylidene-1~{H}-isoindol-2-yl]piperidine-2,6-dione × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium citrate and 0.1 M Bis-Tris Propane pH 7.5
分辨率 2.91 Å R-free 0.293
8RQ9 Crystal structure of PROTAC CFT-1297 in complex with CRBN-midi and BRD4(BD2) 提交 2024-01-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 333–460（128 aa）
未记录 A1H2F (3~{S})-3-[7-[1-[7-[4-[6-(4-chlorophenyl)-1-methyl-spiro[[1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]benzodiazepine-4,1'-cyclopropane]-8-yl]pyrazol-1-yl]heptyl]piperidin-4-yl]-3-oxidanylidene-1~{H}-isoindol-2-yl]piperidine-2,6-dione × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium citrate and 0.1 M Bis-Tris Propane pH 7.5
分辨率 2.91 Å R-free 0.293
8RWZ Open non-crosslinked structure Brd4BD2-MZ1-(NEDD8)-CRL2VHL 提交 2024-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 347–460（114 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RX0 (NEDD8)-CRL2VHL-MZ1-Brd4BD2-Ub(G76S, K48C)-UBE2R1(C93K, S138C, C191S, C223S)-Ub 提交 2024-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 349–459（111 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8V92 BRD4 BD1 liganded with macrocyclic compound 2b (JJ-II-352A) 提交 2023-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1AAL (4bS)-1-ethyl-21-methyl-4b,11,12,22-tetrahydro-2H,10H,18H-dibenzo[13',14':6',7'][1,5,9]trioxacyclotetradecino[12',11':4,5]pyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4,20(1H,3H)-trione × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；50 mM Tris pH 8.5, 0.1 M ammonium sulfate, 12.5% PEG 3,350
分辨率 1.27 Å R-free 0.158
8V9F BRD4 BD1 liganded with macrocyclic compound 2d (JJ-II-363A) 提交 2023-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 YPB (4bS)-1-ethyl-7,20-dimethyl-4b,10,11,21-tetrahydro-2H,17H-dibenzo[12',13':5',6'][1,4,8]trioxacyclotridecino[11',10':4,5]pyrido[2,3-d]pyrimidine-2,4,19(1H,3H)-trione × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.22 Å R-free 0.200
8WIU Bromodomain and Extra-terminal Domain (BET) BRD4 提交 2023-09-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–165（124 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 WPR 7-[5-[1-(cyclopropylmethyl)-3,5-dimethyl-pyrazol-4-yl]pyridin-3-yl]-1~{H}-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 18-28% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.40 Å R-free 0.236
8WQO Crystal structure of BRD4-BD1 bound with DI106 提交 2023-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–165（124 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 X3L (3~{R})-6-[[4-(3,5-dimethyl-1~{H}-pyrazol-4-yl)pyrimidin-2-yl]amino]-1,3-dimethyl-4-propan-2-yl-3~{H}-quinoxalin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.4 M sodium formate and 10 % glycerol
分辨率 1.13 Å R-free 0.212
8WXY Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor 23 提交 2023-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 44–168（125 aa）
链 B 44–168（125 aa）
链 C 44–168（125 aa）
未记录 XGN 5-[2-(4-fluoranyl-2,6-dimethyl-phenoxy)-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)phenyl]-1-methyl-4-[(2-morpholin-4-yl-2-oxidanylidene-ethyl)amino]pyridin-2-one × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；277 K；1.8 M Sodium phosphate monobasic monohydrate, Potassium phosphate dibasic / pH 6.9
分辨率 2.87 Å R-free 0.249
8WY3 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor 21 提交 2023-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 44–168（125 aa）
链 B 44–168（125 aa）
链 C 44–168（125 aa）
未记录 XHE ~{N}-cyclopropyl-2-[[5-[2-(4-fluoranyl-2,6-dimethyl-phenoxy)-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)phenyl]-1-methyl-2-oxidanylidene-pyridin-4-yl]amino]ethanamide × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；2.0 M Sodium formate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 2.78 Å R-free 0.234
8WY7 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with the inhibitor 22 提交 2023-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 44–168（125 aa）
链 B 44–168（125 aa）
链 C 44–168（125 aa）
未记录 XHN 2-[[5-[2-(4-fluoranyl-2,6-dimethyl-phenoxy)-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)phenyl]-1-methyl-2-oxidanylidene-pyridin-4-yl]amino]-~{N}-(4-oxidanylcyclohexyl)ethanamide × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；2.0 M Sodium formate, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 2.83 Å R-free 0.281
8WYP High Resolution Crystal Structure of Brd4 BD-1 in Complex with a Novel Inhibitor Precursor 提交 2023-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–167（124 aa）
未记录 XUK 3-bromanylimidazo[1,2-a]pyridin-6-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；4.0 M sodium formate and 200 mM NDSB-201
分辨率 1.24 Å R-free 0.214
8X7H Crystal structure of the ternary complex of GID4-PROTAC(NEP162)-BRD4(BD1). 提交 2023-11-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 YBI ~{N}-[4-[6-[3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoyl]piperazin-1-yl]propoxy]-1~{H}-benzimidazol-2-yl]cyclohexyl]-2-(1~{H}-indol-2-ylmethylamino)ethanamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 10% (w/v) polyethylene glycol 10000
分辨率 2.90 Å R-free 0.301
8X7H Crystal structure of the ternary complex of GID4-PROTAC(NEP162)-BRD4(BD1). 提交 2023-11-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 44–168（125 aa）
未记录 YBI ~{N}-[4-[6-[3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoyl]piperazin-1-yl]propoxy]-1~{H}-benzimidazol-2-yl]cyclohexyl]-2-(1~{H}-indol-2-ylmethylamino)ethanamide × 1 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 10% (w/v) polyethylene glycol 10000
分辨率 2.90 Å R-free 0.301
8X7H Crystal structure of the ternary complex of GID4-PROTAC(NEP162)-BRD4(BD1). 提交 2023-11-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 44–168（125 aa）
未记录 YBI ~{N}-[4-[6-[3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoyl]piperazin-1-yl]propoxy]-1~{H}-benzimidazol-2-yl]cyclohexyl]-2-(1~{H}-indol-2-ylmethylamino)ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 10% (w/v) polyethylene glycol 10000
分辨率 2.90 Å R-free 0.301
8X7H Crystal structure of the ternary complex of GID4-PROTAC(NEP162)-BRD4(BD1). 提交 2023-11-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 44–168（125 aa）
未记录 YBI ~{N}-[4-[6-[3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoyl]piperazin-1-yl]propoxy]-1~{H}-benzimidazol-2-yl]cyclohexyl]-2-(1~{H}-indol-2-ylmethylamino)ethanamide × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 10% (w/v) polyethylene glycol 10000
分辨率 2.90 Å R-free 0.301
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 333–460（128 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 5 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 333–460（128 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8YME BRD4-BD1 in complex with N-cyclohexyl-1-methyl-6-{[5-methyl-7-(1-methylpyrazol-3-yl)-4-oxo-pyrazolo[4,3-c]pyridin-2-yl]methyl}azepan-1-ium-4-carboxamide 2,2,2-trifluoroacetate 提交 2024-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1LZZ (4R,6S)-N-cyclohexyl-1-methyl-6-[[5-methyl-7-(1-methylpyrazol-3-yl)-4-oxidanylidene-pyrazolo[4,3-c]pyridin-2-yl]methyl]azepane-4-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.1M Hepes pH 7.0, 5% MgCl2, 20% PEG 6000
分辨率 1.18 Å R-free 0.186
8YMF BRD4-BD1 in complex with 7-[2-(cyclopropylmethoxy)phenyl]-5-methyl-2-[(1-methylsulfonyl-4-piperidyl)methyl]pyrazolo[4,3-c]pyridin-4-one 提交 2024-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1LZB 7-[2-(cyclopropylmethoxy)phenyl]-5-methyl-2-[(1-methylsulfonylpiperidin-4-yl)methyl]pyrazolo[4,3-c]pyridin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.1M Hepes pH 7.0, 5% MgCl2, 20% PEG 6000
分辨率 1.01 Å R-free 0.171
8YMG BRD4-BD1 in complex with 7-[4-chloro-1-(tetrahydropyran-4-ylmethyl)imidazol-2-yl]-5-methyl-2-{[(2R)-2-methyl-4-methylsulfonyl-piperazin-1-yl]methyl}furo[3,2-c]pyridin-4-one 提交 2024-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1LZC 7-[4-chloro-1-(tetrahydropyran-4-ylmethyl)imidazol-2-yl]-5-methyl-2-{[(2R)-2-methyl-4-methylsulfonyl-piperazin-1-yl]methyl}furo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.1M Hepes pH 7.0, 5% MgCl2, 20% PEG 6000
分辨率 1.01 Å R-free 0.162
8YMH BRD4-BD1 in complex with 5-methyl-2-{[(2R)-2-methyl-4-methylsulfonyl-piperazin-1-yl]methyl}-7-(1-methylpyrazol-3-yl)furo[3,2-c]pyridin-4-one 提交 2024-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1LZE 5-methyl-2-{[(2R)-2-methyl-4-methylsulfonyl-piperazin-1-yl]methyl}-7-(1-methylpyrazol-3-yl)furo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.1M Hepes pH 7.0, 5% MgCl2, 20% PEG 6000
分辨率 1.04 Å R-free 0.208
8YMI BRD4-BD1 in complex with 2-{[(3S)-1-benzylpyrrolidin-3-yl]methyl}-5-methyl-7-(1-methylpyrazol-3-yl)pyrazolo[4,3-c]pyridin-4-one 提交 2024-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1LZF 2-{[(3S)-1-benzylpyrrolidin-3-yl]methyl}-5-methyl-7-(1-methylpyrazol-3-yl)pyrazolo[4,3-c]pyridin-4-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.1M Hepes pH 7.0, 5% MgCl2, 20% PEG 6000
分辨率 1.01 Å R-free 0.211
8ZM8 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 BD1 in complex with the inhibitor Y13221 提交 2024-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1L1X 2-[2-ethyl-4-(methoxymethyl)-1~{H}-imidazol-5-yl]-7-[2-(4-fluoranyl-2,6-dimethyl-phenoxy)-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)phenyl]-5-methyl-furo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.0 M Sodium phosphate monobasic monohydrate, Potassium phosphate dibasic / pH 8.2
分辨率 3.00 Å R-free 0.265
8ZM8 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 BD1 in complex with the inhibitor Y13221 提交 2024-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 A1L1X 2-[2-ethyl-4-(methoxymethyl)-1~{H}-imidazol-5-yl]-7-[2-(4-fluoranyl-2,6-dimethyl-phenoxy)-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)phenyl]-5-methyl-furo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.0 M Sodium phosphate monobasic monohydrate, Potassium phosphate dibasic / pH 8.2
分辨率 3.00 Å R-free 0.265
8ZM8 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 BD1 in complex with the inhibitor Y13221 提交 2024-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa）
未记录 A1L1X 2-[2-ethyl-4-(methoxymethyl)-1~{H}-imidazol-5-yl]-7-[2-(4-fluoranyl-2,6-dimethyl-phenoxy)-5-(2-oxidanylpropan-2-yl)phenyl]-5-methyl-furo[3,2-c]pyridin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.0 M Sodium phosphate monobasic monohydrate, Potassium phosphate dibasic / pH 8.2
分辨率 3.00 Å R-free 0.265
8ZMB Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 BD1 in complex with the inhibitor Y13195 提交 2024-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1L0Y 7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methyl-2-(2-phenyl-1H-imidazol-5-yl)furo[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 2.0 M Ammonium sulfate
分辨率 2.79 Å R-free 0.244
8ZMB Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 BD1 in complex with the inhibitor Y13195 提交 2024-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 A1L0Y 7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methyl-2-(2-phenyl-1H-imidazol-5-yl)furo[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 2.0 M Ammonium sulfate
分辨率 2.79 Å R-free 0.244
8ZMB Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 BD1 in complex with the inhibitor Y13195 提交 2024-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa）
未记录 A1L0Y 7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methyl-2-(2-phenyl-1H-imidazol-5-yl)furo[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 2.0 M Ammonium sulfate
分辨率 2.79 Å R-free 0.244
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 J 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 K 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 L 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 13 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 M 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 14 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 N 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 15 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 O 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 16 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 17 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 Q 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 18 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 R 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 19 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 S 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 20 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 T 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
8ZMQ Crystal Structure of the second bromodomain of human BRD4 BD2 in complex with the inhibitor Y13190 提交 2024-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 I 333–460（128 aa）
未记录 A1L12 2-(2-(adamantan-1-yl)-4-ethyl-1H-imidazol-5-yl)-7-(2-(4-fluoro-2,6-dimethylphenoxy)-5-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl)-5-methylfuro[3,2-c]pyridin-4(5H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.01 M Iron(III) chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 10% v/v Jeffamine M-600
分辨率 2.20 Å R-free 0.274
9C5V Cryo EM structure of a DCAF2:degrader:BRD4 ternary complex 提交 2024-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 49–170（122 aa）
未记录 A1AUO N-({4-[(4-{[1'-(chloroacetyl)-3'-oxo-3',4'-dihydro-1'H-spiro[cyclopentane-1,2'-quinoxalin]-6'-yl]oxy}piperidin-1-yl)methyl]phenyl}methyl)-2-[(6S,10P)-4-(4-chlorophenyl)-2,3,9-trimethyl-6H-thieno[3,2-f][1,2,4]triazolo[4,3-a][1,4]diazepin-6-yl]acetamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9F1J First bromodomain of BRD4 in complex with ISOX-DUAL based degrader 14 提交 2024-04-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 43–168（126 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 A1H84 N-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-4-yl]oxyethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]-4-[4-[2-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(2-morpholin-4-ylethyl)benzimidazol-2-yl]ethyl]phenoxy]butanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution:10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 1 mM degrader 14. Crystallization condition: 25% PEG 3350, 0.25 M sodium nitrate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 8.2.
分辨率 1.13 Å R-free 0.185
9F1K First bromodomain of BRD4 in complex with ISOX-DUAL based inhibitor 30 提交 2024-04-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 44-168
未记录 A1H81 2-[4-[2-[2-[2-[4-[3-(dimethylamino)propoxy]phenyl]ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)benzimidazol-1-yl]ethyl]piperazin-1-yl]-N-(2-methoxyethyl)ethanamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 2 mM inhibitor 30. Crystallization condition: 25% PEG 3350, 0.3 M sodium nitrate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 8.5.
分辨率 1.61 Å R-free 0.215
9F1L First bromodomain of BRD4 in complex with ISOX-DUAL based degrader 35 提交 2024-04-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 A1H83 N-[2-[2-[(3R)-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]-1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-4-yl]oxyethyl]-2-[4-[2-[2-[2-[4-[3-(dimethylamino)propoxy]phenyl]ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)benzimidazol-1-yl]ethyl]piperazin-1-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 1 mM degrader 35. Crystallization condition: 25% PEG 3350, 0.2 M sodium nitrate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 7.9.
分辨率 1.30 Å R-free 0.182
9F1M First bromodomain of BRD4 in complex with ISOX-DUAL based degrader 45 提交 2024-04-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 A1H80 1-[2-[7-[2-[4-[2-[2-[2-[4-[3-(dimethylamino)propoxy]phenyl]ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)benzimidazol-1-yl]ethyl]piperazin-1-yl]ethanoylamino]heptanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 2 mM degrader 45 Crystallization condition: 24% PEG 3350, 0.3 M sodium nitrate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 8.5.
分辨率 1.90 Å R-free 0.237
9F1M First bromodomain of BRD4 in complex with ISOX-DUAL based degrader 45 提交 2024-04-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1H80 1-[2-[7-[2-[4-[2-[2-[2-[4-[3-(dimethylamino)propoxy]phenyl]ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)benzimidazol-1-yl]ethyl]piperazin-1-yl]ethanoylamino]heptanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 2 mM degrader 45 Crystallization condition: 24% PEG 3350, 0.3 M sodium nitrate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 8.5.
分辨率 1.90 Å R-free 0.237
9F1M First bromodomain of BRD4 in complex with ISOX-DUAL based degrader 45 提交 2024-04-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1 A1H80 1-[2-[7-[2-[4-[2-[2-[2-[4-[3-(dimethylamino)propoxy]phenyl]ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)benzimidazol-1-yl]ethyl]piperazin-1-yl]ethanoylamino]heptanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 2 mM degrader 45 Crystallization condition: 24% PEG 3350, 0.3 M sodium nitrate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 8.5.
分辨率 1.90 Å R-free 0.237
9F1M First bromodomain of BRD4 in complex with ISOX-DUAL based degrader 45 提交 2024-04-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 44–168（125 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 A1H80 1-[2-[7-[2-[4-[2-[2-[2-[4-[3-(dimethylamino)propoxy]phenyl]ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)benzimidazol-1-yl]ethyl]piperazin-1-yl]ethanoylamino]heptanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution: 10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 2 mM degrader 45 Crystallization condition: 24% PEG 3350, 0.3 M sodium nitrate, 15% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 8.5.
分辨率 1.90 Å R-free 0.237
9F1N First bromodomain of BRD4 in complex with ISOX-DUAL based degrader 46 提交 2024-04-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 3 A1H9H (2S,4R)-1-[(2S)-2-[9-[2-[4-[2-[2-[2-[4-[3-(dimethylamino)propoxy]phenyl]ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)benzimidazol-1-yl]ethyl]piperazin-1-yl]ethanoylamino]nonanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-4H-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution:10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 2 mM degrader 46 Crystallization condition: 25% PEG 3350, 0.3 M sodium malonate pH 7, 10% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 8.5.
分辨率 1.71 Å R-free 0.232
9F1N First bromodomain of BRD4 in complex with ISOX-DUAL based degrader 46 提交 2024-04-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1H9H (2S,4R)-1-[(2S)-2-[9-[2-[4-[2-[2-[2-[4-[3-(dimethylamino)propoxy]phenyl]ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)benzimidazol-1-yl]ethyl]piperazin-1-yl]ethanoylamino]nonanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-4H-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution:10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 2 mM degrader 46 Crystallization condition: 25% PEG 3350, 0.3 M sodium malonate pH 7, 10% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 8.5.
分辨率 1.71 Å R-free 0.232
9F1N First bromodomain of BRD4 in complex with ISOX-DUAL based degrader 46 提交 2024-04-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 44–168（125 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 A1H9H (2S,4R)-1-[(2S)-2-[9-[2-[4-[2-[2-[2-[4-[3-(dimethylamino)propoxy]phenyl]ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)benzimidazol-1-yl]ethyl]piperazin-1-yl]ethanoylamino]nonanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-4H-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution:10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 2 mM degrader 46 Crystallization condition: 25% PEG 3350, 0.3 M sodium malonate pH 7, 10% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 8.5.
分辨率 1.71 Å R-free 0.232
9F1N First bromodomain of BRD4 in complex with ISOX-DUAL based degrader 46 提交 2024-04-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1H9H (2S,4R)-1-[(2S)-2-[9-[2-[4-[2-[2-[2-[4-[3-(dimethylamino)propoxy]phenyl]ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)benzimidazol-1-yl]ethyl]piperazin-1-yl]ethanoylamino]nonanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-4H-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein solution:10 mg/mL in 25 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 5% glycerol, 2 mM degrader 46 Crystallization condition: 25% PEG 3350, 0.3 M sodium malonate pH 7, 10% ethylene glycol, 0.1 M bis-tris propane pH 8.5.
分辨率 1.71 Å R-free 0.232
9FBY N-TERMINAL BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 with (5-(4-chloro-1-((tetrahydro-2H-pyran-4-yl)methyl)-1H-imidazol-2-yl)-1,3-dimethylpyridin-2(1H)-one 提交 2024-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1IB5 5-[4-chloranyl-1-(oxan-4-ylmethyl)imidazol-2-yl]-1,3-dimethyl-pyridin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M MMT(Malic acid, MES, Tris) pH9.0,25% w/v PEG1500
分辨率 1.85 Å R-free 0.219
9FWX Crystal structure of BRD4 BD1 with MEN1404BS. 提交 2024-07-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1IGX 3-methyl-~{N}-(2-phenylethyl)-[1,2,4]triazolo[4,3-b]pyridazin-6-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；16.5 % PEG 3350, 0.1 M sodium nitrate, 8 % ethylene glycol
分辨率 1.25 Å R-free 0.190
9FXP Crystal structure of BRD4 BD1 with DI00626383. 提交 2024-07-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 5WX 4-methoxy-1,2-benzoxazol-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16.5 % PEG 3350, 0.1 M sodium nitrate, 8 % ethylene glycol
分辨率 1.88 Å R-free 0.218
9HT0 A novel bottom-up approach to find lead-compounds in billion-sized libraries 提交 2024-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1IXD ~{N}-methyl-4-[5-(2-methyl-1-oxidanylidene-isoquinolin-4-yl)-3-(pyrazol-1-ylmethyl)-1,2,4-triazol-1-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292.15 K；Morpheus 0.09M Halogens, 0.1M Buffer System 2 pH6.5, 50% v/v Precipitant Mix 2
分辨率 1.33 Å R-free 0.208
9HT1 A novel bottom-up approach to find lead-compounds in billion-sized libraries 提交 2024-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283.15 K；Morpheus 0.1 Amino acids, 0.1M Buffer system 3 pH 8.5 50% v/v precipitant Mix 1
分辨率 1.94 Å R-free 0.222
9HT1 A novel bottom-up approach to find lead-compounds in billion-sized libraries 提交 2024-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 A1IXE 1-(2,8-dioxa-5-azaspiro[3.6]decan-5-yl)-2-[[5-methyl-4-(4-methylphenyl)-1,2,4-triazol-3-yl]sulfanyl]ethanone × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；283.15 K；Morpheus 0.1 Amino acids, 0.1M Buffer system 3 pH 8.5 50% v/v precipitant Mix 1
分辨率 1.94 Å R-free 0.222
9HT2 A novel bottom-up approach to find lead-compounds in billion-sized libraries 提交 2024-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1IXF methyl 2,2,6,6-tetramethyl-4-[[2-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)amino]-2-oxidanylidene-ethyl]amino]oxane-4-carboxylate × 1 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；283.15 K；Morpheus 0.09 M Halogens, 0.1M Buffer system 3 pH 8.5 50% v/v precipitant mix 1
分辨率 1.42 Å R-free 0.186
9IV5 BRD4 in complex with compound7 提交 2024-07-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 A1D95 7-[2-fluoranyl-5-(oxetan-3-ylmethoxy)-3-(1,3,5-trimethylpyrazol-4-yl)phenyl]-1~{H}-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；6 M sodium formate and 10 % glycerol
分辨率 1.59 Å R-free 0.247
9KEM Crystal structure of BRD4-BD1 in complex with H2AK5acK9ac 提交 2024-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 54–168（115 aa）
链 B 54–168（115 aa）
链 C 54–168（115 aa）
链 D 54–168（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.94 Å R-free 0.252
9KT2 The crystal structure of BD1 in complex with BDS4 提交 2024-12-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.15 M potassium bromide, 30% (v/v) PEG2000MME
分辨率 1.46 Å R-free 0.195
9MPD BRD4-BD1 in complex with cyclic peptide 4.1B 提交 2024-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 347–464（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.01 M Zinc chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000
分辨率 2.50 Å R-free 0.270
9MPD BRD4-BD1 in complex with cyclic peptide 4.1B 提交 2024-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 347–464（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.01 M Zinc chloride, 0.1 M HEPES pH 7.0, 20 % w/v PEG 6000
分辨率 2.50 Å R-free 0.270
9MPI BRD4-BD1 in complex with cyclic peptide 4.1A 提交 2024-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；0.2 M Sodium formate, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 2.87 Å R-free 0.325
9MXK BRD4-BD1 in complex with cyclic peptide 4.1C 提交 2025-01-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 42% v/v Polyethylene glycol 200
分辨率 1.73 Å R-free 0.213
9MXK BRD4-BD1 in complex with cyclic peptide 4.1C 提交 2025-01-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 42–168（127 aa）
未记录 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 42% v/v Polyethylene glycol 200
分辨率 1.73 Å R-free 0.213
9MXK BRD4-BD1 in complex with cyclic peptide 4.1C 提交 2025-01-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 42–168（127 aa）
未记录 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 42% v/v Polyethylene glycol 200
分辨率 1.73 Å R-free 0.213
9NN5 BET BRD4-BD1 in complex with peptide 9.2 提交 2025-03-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Ammonium chloride, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.47 Å R-free 0.193
9NNT BET BRD4-BD1 in complex with peptide 6.1 提交 2025-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 42–168（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Tris 8.0 Polyethylene glycol 400
分辨率 1.59 Å R-free 0.217
9NNT BET BRD4-BD1 in complex with peptide 6.1 提交 2025-03-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 42–168（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Tris 8.0 Polyethylene glycol 400
分辨率 1.59 Å R-free 0.217
9NNT BET BRD4-BD1 in complex with peptide 6.1 提交 2025-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 42–168（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Tris 8.0 Polyethylene glycol 400
分辨率 1.59 Å R-free 0.217
9QNV CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX with compound 2 提交 2025-03-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 A1I76 3-methyl-5-phenyl-[1,3]thiazolo[2,3-c][1,2,4]triazole × 1 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M bis-tris-propane pH 7.9, 20% PEG3350, 0.2M sodium fluoride, 10% ethylene glycol
分辨率 1.23 Å R-free 0.148
9QOB CRYSTAL STRUCTURE OF THE FIRST BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 IN COMPLEX with compound 4 提交 2025-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 43–168（126 aa） 片段：First bromodomain, UNP residues 44-168
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 A1I8D (5-phenyl-[1,3]thiazolo[2,3-c][1,2,4]triazol-3-yl)methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M bis-tris-propane pH 7.9, 20% PEG3350, 0.2M sodium fluoride, 10% ethylene glycol
分辨率 1.37 Å R-free 0.196
9QW8 FKBP12 in complex with bifunctional ligand 1ad and the first bromodomain of BRD4 提交 2025-04-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1JAZ ~{N}-[2-[2-[4-[[(1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-2-oxidanylidene-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-5-yl]methoxymethyl]-1,2,3-triazol-1-yl]ethoxy]ethyl]-2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22% PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.243
9QW8 FKBP12 in complex with bifunctional ligand 1ad and the first bromodomain of BRD4 提交 2025-04-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 A1JAZ ~{N}-[2-[2-[4-[[(1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-2-oxidanylidene-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-5-yl]methoxymethyl]-1,2,3-triazol-1-yl]ethoxy]ethyl]-2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22% PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.243
9R5N FKBP12 in complex with binfunctional ligand b3c and the first bromodomain of BRD4 提交 2025-05-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 A1JCU ~{tert}-butyl 2-[(9~{S})-7-[4-[3-[2-[2-[4-[(1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-2-oxidanylidene-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-5-yl]-1,2,3-triazol-1-yl]ethoxy]ethanoylamino]prop-1-ynyl]phenyl]-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.2M ammonium thiocyanate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.8
分辨率 3.00 Å R-free 0.312
9R5N FKBP12 in complex with binfunctional ligand b3c and the first bromodomain of BRD4 提交 2025-05-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 A1JCU ~{tert}-butyl 2-[(9~{S})-7-[4-[3-[2-[2-[4-[(1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-2-oxidanylidene-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-5-yl]-1,2,3-triazol-1-yl]ethoxy]ethanoylamino]prop-1-ynyl]phenyl]-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.2M ammonium thiocyanate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.8
分辨率 3.00 Å R-free 0.312
9RSC Ternary complex of an improved charged molecular glue degrader ZZ2-SO2H, BRD4(BD1) neosubstrate, and the CTLH E3 ligase receptor module YPEL5-WDR26 提交 2025-07-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 A1IL8 2,6-bis(chloranyl)-4-[[4-[(9S)-4,5,13-trimethyl-9-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-oxidanylidene-ethyl]-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-7-yl]phenyl]carbamoyl]benzenesulfinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.42 Å
9RSD Ternary complex of a charged molecular glue degrader ZZ1-SO2H, BRD4(BD1) neosubstrate, and the CTLH E3 ligase receptor module YPEL5-WDR26 提交 2025-07-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 44–168（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 A1IL9 2-chloranyl-4-[[4-[(9S)-4,5,13-trimethyl-9-[2-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]-2-oxidanylidene-ethyl]-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-7-yl]phenyl]carbamoyl]benzenesulfinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.38 Å
9SAF Ternary PROTAC-mediated complex of BRD4-BD1/CRBN/DDB1 and JQ1-AcQ bifunctional degrader 提交 2025-08-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 44–168（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1JM8 ~{N}-[(2~{S})-1-[[(3~{S})-2,6-bis(oxidanylidene)piperidin-3-yl]amino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-9-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanoylamino]nonanamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
9SAI Ternary PROTAC-mediated complex consisting of Cereblon, DDB1 and BRD4-BD1, non-covalently linked by JQ1-AcN 提交 2025-08-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 44–168（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 A1JM3 N-[(2S)-1-[[(3S)-2,5-bis(oxidanylidene)pyrrolidin-3-yl]amino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-9-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]nonanamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 0.25 mM TCEP, pH: 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.66 Å
9VCZ The crystal structure of BRD4-BD1 in complex with inhibitor 39b 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–168（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.50 Å R-free 0.197
9VQ1 NMR solution structures of BRD4 ET domain in complex with ASXL1 peptide 提交 2025-07-04 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 601–683（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 137 mM sodium chloride, 10 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 137 mM sodium chloride, 10 mM sodium phosphate, 2 mM DTT, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
9ZG4 5jc21/CG13250 bound to BRD4-BD1. 提交 2025-12-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–166（123 aa） 片段：residues 44-166
未记录 A1C14 (4P)-4-[4-(benzylamino)-2-oxo-1,2-dihydroquinolin-6-yl]-3,5-dimethyl-2H-1,2-oxazol-1-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Magnesium Formate and 15% PEG 3350.
分辨率 1.48 Å R-free 0.228
9ZG4 5jc21/CG13250 bound to BRD4-BD1. 提交 2025-12-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 44–168（125 aa） 片段：bromodomain 1
未记录 A1C14 (4P)-4-[4-(benzylamino)-2-oxo-1,2-dihydroquinolin-6-yl]-3,5-dimethyl-2H-1,2-oxazol-1-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Magnesium Formate and 15% PEG 3350.
分辨率 1.48 Å R-free 0.228
9ZYT Crystal Structure of BRD4 Bromodomain BD1 in Complex with Small Molecule PLX-3618 提交 2026-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 44–165（122 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1C4W PLX-3618 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.1；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.10 M Tris/HCl pH 8.10, 35.00% w/v PEG 3350
分辨率 1.66 Å R-free 0.202
9ZYT Crystal Structure of BRD4 Bromodomain BD1 in Complex with Small Molecule PLX-3618 提交 2026-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 BBB 44–165（122 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1C4W PLX-3618 × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.1；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.10 M Tris/HCl pH 8.10, 35.00% w/v PEG 3350
分辨率 1.66 Å R-free 0.202

共 601 个其他 PDB 条目、778 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BRD4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 2–126； UniProt 44–168

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8x7g

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8x7g
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8x7g
沉积日期 deposition_date2023-11-24
结构标题 titleCrystal structure of the ternary complex of GID4-PROTAC(NEP108)-BRD4(BD1).
关键词 keywordsPROTAC, CYTOSOLIC PROTEIN; CYTOSOLIC PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier24.98 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron24.68 Å
零角强度 I(0) i028633100.00
分子量 molecular_weight28883.0 kDa
排除体积 excluded_volume28729 ų
包络体积 envelope_volume47791 ų
水化壳体积 shell_volume17559 ų
包络直径 envelope_diameter87.9 Å
壳层 Rg shell_rg29.39 Å
包络 Rg envelope_rg24.96 Å
形状 Rg shape_rg24.49 Å
总 Rg total_rg25.49 Å
总原子数 total_atoms2244
残基数 n_residues270
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax68.7 Å
Rg (实空间) rg_real23.99 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.16 Å
I(0) (实空间) i0_real2.7500e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.1290e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal25.25 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal28630000.0000
解质量估计 total_estimate0.6486
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary20.7 Å
偏度 Skewness skewness0.441
峰度 Kurtosis kurtosis-0.674
角度范围 angular_range— – 0.3200 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha3.2130
最高正则化参数 α highest_alpha5215000.0000
实空间数据点数 n_real_points64
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.892; Stabil: 0.983; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.806; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)