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9ba2

Crystal structure of the binary complex of DCAF1 and WDR5

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 86.5 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DDB1- and CUL4-associated factor 1

Homo sapiens

UniProt Q9Y4B6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1080–1390 片段：residues 1080-1390 WD repeat-containing protein 5 × 1 （P61964） IMD IMIDAZOLE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.2 M imidazole, pH 7.4, 20% w/v polyethylene glycol 4,000 分辨率 2.97 Å R-free 0.266

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 9BA2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3WA0 Crystal structure of merlin complexed with DCAF1/VprBP 提交 2013-04-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1417–1506（90 aa） 片段：UNP residues 1417-1506
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；277 K；0.2M ammonium fluoride, 23% PEG 3350, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.31 Å R-free 0.264
3WA0 Crystal structure of merlin complexed with DCAF1/VprBP 提交 2013-04-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1417–1506（90 aa） 片段：UNP residues 1417-1506
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；277 K；0.2M ammonium fluoride, 23% PEG 3350, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.31 Å R-free 0.264
4CC9 Crystal structure of human SAMHD1 (amino acid residues 582-626) bound to Vpx isolated from sooty mangabey and human DCAF1 (amino acid residues 1058-1396) 提交 2013-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1058–1396（339 aa） 片段：RESIDUES 1058-1396
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2 M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1 M HEPES PH 7.5, 15% PEG 400
分辨率 2.47 Å R-free 0.216
4P7I Crystal structure of the Merlin FERM/DCAF1 complex 提交 2014-03-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 998–1058（61 aa） 片段：UNP residues 998-1058
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% Isopropanol and 5% PEG8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.256
4P7I Crystal structure of the Merlin FERM/DCAF1 complex 提交 2014-03-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 998–1058（61 aa） 片段：UNP residues 998-1058
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% Isopropanol and 5% PEG8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.256
4PXW Crystal structure of human DCAF1 WD40 repeats (Q1250L) 提交 2014-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1039–1401（363 aa）
突变：Q1250L UNX UNKNOWN LIGAND × 22 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；0.1 M sodium hepes, 0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 1.72 Å R-free 0.219
4PXW Crystal structure of human DCAF1 WD40 repeats (Q1250L) 提交 2014-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1039–1401（363 aa）
突变：Q1250L UNX UNKNOWN LIGAND × 23 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；0.1 M sodium hepes, 0.2 M lithium sulfate, 25% PEG3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
分辨率 1.72 Å R-free 0.219
4Z8L Crystal structure of DCAF1/SIV-MND VPX/MND SAMHD1 NTD ternary complex 提交 2015-04-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1057–1396（340 aa） 片段：UNP residues 1057-1396
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；1.6 M NaH2PO4, 0.4 M K2HPO4, 0.1 M Sodium Phosphate/Citrate buffer, pH 4.2
分辨率 2.60 Å R-free 0.228
4Z8L Crystal structure of DCAF1/SIV-MND VPX/MND SAMHD1 NTD ternary complex 提交 2015-04-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1057–1396（340 aa） 片段：UNP residues 1057-1396
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；1.6 M NaH2PO4, 0.4 M K2HPO4, 0.1 M Sodium Phosphate/Citrate buffer, pH 4.2
分辨率 2.60 Å R-free 0.228
5AJA Crystal structure of mandrill SAMHD1 (amino acid residues 1-114) bound to Vpx isolated from mandrill and human DCAF1 (amino acid residues 1058-1396) 提交 2015-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1058–1396（339 aa） 片段：WD40-REPEAT DOMAIN, RESIDUES 1058-1396
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.16 M TRISODIUM CITRATE-HCL PH 5.2, 4% PEG 6000
分辨率 2.65 Å R-free 0.227
5JK7 The X-ray structure of the DDB1-DCAF1-Vpr-UNG2 complex 提交 2016-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1045–1396（352 aa） 片段：UNP residues 1045-1396
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；289.15 K；100 mM Na Ctrate, pH 5.6, 11% PEG 20000
分辨率 3.49 Å R-free 0.206
5JK7 The X-ray structure of the DDB1-DCAF1-Vpr-UNG2 complex 提交 2016-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1045–1396（352 aa） 片段：UNP residues 1045-1396
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；289.15 K；100 mM Na Ctrate, pH 5.6, 11% PEG 20000
分辨率 3.49 Å R-free 0.206
6N45 Crystal structure of the cryptic polo box domain of human activated Plk4 variant 1 提交 2018-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1475–1507（33 aa）
链 B 1475–1507（33 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；4.3M Ammonium Acetate 0.1M BisTris propane pH 8.0
分辨率 2.64 Å R-free 0.314
6ZUE Crystal structure of human DDB1 bound to human DCAF1 (amino acid residues 1046-1396) 提交 2020-07-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1046–1396（351 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；100 mM Tri-Na citrate pH 5.5 18% PEG 1000
分辨率 3.09 Å R-free 0.279
6ZX9 Crystal structure of SIV Vpr,fused to T4 lysozyme, isolated from moustached monkey, bound to human DDB1 and human DCAF1 (amino acid residues 1046-1396) 提交 2020-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1046–1396（351 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 8 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；8-10% PEG 4000 (w/v), 200 mM MgCl2, 100 mM HEPES-NaOH, pH 7.0-8.2.
分辨率 2.52 Å R-free 0.260
7OKQ Cryo-EM Structure of the DDB1-DCAF1-CUL4A-RBX1 Complex 提交 2021-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：Hexadecameric
链 B 2–1507（1506 aa）
链 F 2–1507（1506 aa）
链 J 2–1507（1506 aa）
链 N 2–1507（1506 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.40 Å
7SSE Crystal structure of the WDR domain of human DCAF1 in complex with CYCA-117-70 提交 2021-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1077–1390（314 aa）
链 B 1077–1390（314 aa）
突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A B1I N-[(3R)-1-(3-fluorophenyl)piperidin-3-yl]-6-(morpholin-4-yl)pyrimidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；30% PEG3350 ,0.1M Ammonium Sulphate, 0.1M Bis-Tris pH5.5
分辨率 1.62 Å R-free 0.234
7UFV Crystal structure of the WDR domain of human DCAF1 in complex with OICR-6766 提交 2022-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1077–1390（314 aa）
突变：F1077A, R1079A N6O (3P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chlorophenyl)-3-oxopropyl]-3-(2-fluorophenyl)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；291 K；20% PEG3350, 0.2M Potassium Fluoride
分辨率 1.90 Å R-free 0.254
7UFV Crystal structure of the WDR domain of human DCAF1 in complex with OICR-6766 提交 2022-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1077–1390（314 aa）
突变：F1077A, R1079A N6O (3P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chlorophenyl)-3-oxopropyl]-3-(2-fluorophenyl)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；291 K；20% PEG3350, 0.2M Potassium Fluoride
分辨率 1.90 Å R-free 0.254
7V7B CryoEM structure of DDB1-VprBP complex in ARM-up conformation 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1507（1507 aa）
链 C 1–1507（1507 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7V7C CryoEM structure of DDB1-VprBP-Vpr-UNG2(94-313) complex 提交 2021-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–1507（1507 aa）
链 E 1–1507（1507 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8F8E Crystal structure of the WDR domain of human DCAF1 in complex with OICR-8268 compound 提交 2022-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1077–1390（314 aa）
突变：F1077A, R1079A XJI (3P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-3-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG3350, 0.2M di-Ammonium Citrate
分辨率 1.55 Å R-free 0.209
8F8E Crystal structure of the WDR domain of human DCAF1 in complex with OICR-8268 compound 提交 2022-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1077–1390（314 aa）
突变：F1077A, R1079A XJI (3P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-3-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG3350, 0.2M di-Ammonium Citrate
分辨率 1.55 Å R-free 0.209
8OG5 Crystal structure of human DCAF1 WD40 repeats (Q1250L) in complex with compound 1 提交 2023-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1039–1401（363 aa）
突变：Q1250L EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 LQH 5-(2-fluorophenyl)-2,3-dihydroimidazo[2,1-a]isoquinoline × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MES pH6.5, 2.13M Lithium acetate
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
8OG6 Crystal structure of human DCAF1 WD40 repeats (Q1250L) in complex with compound 1 提交 2023-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1039–1401（363 aa）
突变：Q1250L LQH 5-(2-fluorophenyl)-2,3-dihydroimidazo[2,1-a]isoquinoline × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M Tris pH 7.0, 2.13M Lithium acetate
分辨率 2.25 Å R-free 0.231
8OG7 Crystal structure of human DCAF1 WD40 repeats (Q1250L) in complex with compound 2 提交 2023-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1039–1401（363 aa）
突变：Q1250L ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 VMR (4~{R})-4-[3-(4-chloranylphenoxy)phenyl]pyrrolidin-2-imine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MES pH6.5, 2.13M Lithium acetate
分辨率 2.64 Å R-free 0.206
8OG8 Crystal structure of human DCAF1 WD40 repeats (Q1250L) in complex with compound 3 提交 2023-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1039–1401（363 aa）
突变：Q1250L VM8 5-(2-methyl-1-phenyl-propan-2-yl)imidazo[2,1-a]isoquinoline × 2 ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MES pH6.5, 2.13M Lithium acetate
分辨率 2.11 Å R-free 0.212
8OG9 Crystal structure of human DCAF1 WD40 repeats (Q1250L) in complex with compound 4 提交 2023-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1039–1401（363 aa）
突变：Q1250L VM3 5-[1-(4-chlorophenyl)cyclopropyl]imidazo[2,1-a]isoquinoline × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MES pH6.5, 2.13M Lithium acetate
分辨率 2.94 Å R-free 0.240
8OGA Crystal structure of human DCAF1 WD40 repeats (Q1250L) in complex with compound 6 提交 2023-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 1079–1393（315 aa）
突变：Q1250L EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 VLW 5-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopropyl]-8-(4-methylpiperazin-1-yl)-2,3-dihydroimidazo[2,1-a]isoquinoline × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Tris pH 7.5, 1.66M Lithium acetate
分辨率 2.20 Å R-free 0.209
8OGB Crystal structure of human DCAF1 WD40 repeats (Q1250L) in complex with compound 8 提交 2023-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1039–1401（363 aa）
突变：Q1250L EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 VN5 ~{N}'-[2-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopropyl]-7-(4-methylpiperazin-1-yl)quinazolin-4-yl]ethane-1,2-diamine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Tris pH 7.5, 2.13M Lithium acetate
分辨率 2.27 Å R-free 0.212
8OGC Crystal structure of human DCAF1 WD40 repeats (Q1250L) in complex with compound 11 提交 2023-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1039–1401（363 aa）
突变：Q1250L DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 VMZ 1-[4-[4-(2-azanylethylamino)-2-[1-(4-chlorophenyl)cyclopentyl]quinazolin-7-yl]piperazin-1-yl]ethanone × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Tris pH 7.5, 2.18M Lithium acetate
分辨率 2.09 Å R-free 0.202
8OO5 Crystal structure of human DCAF1 WD40 repeats (Q1250L) in complex with compound 13 提交 2023-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 P 1079–1393（315 aa）
突变：Q1250L VUF 1-[4-[4-(2-azanylethylamino)-2-[1-(4-chlorophenyl)cyclohexyl]quinazolin-7-yl]piperazin-1-yl]ethanone × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1.91M LiSO4, 0.1M Tris pH 7.5
分辨率 2.25 Å R-free 0.220
8OOD Crystal structure of human DCAF1 WD40 repeats (Q1250L) in complex with compound 15 提交 2023-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1039–1401（363 aa）
突变：Q1250L MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 VY3 ~{N}-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[3-[4-[4-(2-azanylethylamino)-2-[1-(4-chlorophenyl)cyclopentyl]quinazolin-7-yl]piperazin-1-yl]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]ethanamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；2.13M LiSO4, 0.1M Tris pH 7.5
分辨率 1.50 Å R-free 0.186
9B9H Crystal structure of the ternary complex of DCAF1 and WDR5 with PROTAC, OICR-40333 提交 2024-04-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1080–1390（311 aa） 片段：residues 1080-1390
未记录 A1AM2 N-{(1P)-5'-({(17E)-18-[(3P)-4-{[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]carbamoyl}-3-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrol-2-yl]-16-oxo-3,6,9,12-tetraoxa-15-azaoctadec-17-en-1-yl}carbamoyl)-2'-fluoro-4-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；5% w/v 1-ethyl-3-methylimidazolium ethyl sulfate, 15% w/v polyethylene glycol 20,000, pH 7.9
分辨率 2.06 Å R-free 0.229
9B9T Crystal structure of the ternary complex of DCAF1 and WDR5 with PROTAC, OICR-40407 提交 2024-04-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1080–1390（311 aa） 片段：residues 1080-1390
未记录 A1ANM N-{(1P)-5'-[(17-{(4P)-4-[(2P)-4-{[(1R)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]carbamoyl}-3-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrol-2-yl]-1H-pyrazol-1-yl}-16-oxo-3,6,9,12-tetraoxa-15-azaheptadecan-1-yl)carbamoyl]-2'-fluoro-4-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate trihydrate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate
分辨率 2.05 Å R-free 0.196
9B9W Crystal structure of the ternary complex of DCAF1 and WDR5 with PROTAC, OICR-40792 提交 2024-04-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1080–1390（311 aa） 片段：residues 1080-1390
未记录 A1ANN (4P)-N-[(1R)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-[(25E)-1-{(1P)-6-fluoro-3'-[4-fluoro-2-(trifluoromethyl)benzamido]-4'-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1,24-dioxo-5,8,11,14,17,20-hexaoxa-2,23-diazahexacos-25-en-26-yl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；35% v/v tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.92 Å R-free 0.183
9BHR Crystal structure of the WDR domain of human DCAF1 in complex with OICR-40155 compound 提交 2024-04-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1077–1390（314 aa）
未记录 A1API (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-{(1E)-3-[(2-methoxyethyl)amino]-3-oxoprop-1-en-1-yl}-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350, 0.2 M Magnesium formate
分辨率 1.62 Å R-free 0.187
9BHR Crystal structure of the WDR domain of human DCAF1 in complex with OICR-40155 compound 提交 2024-04-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1077–1390（314 aa）
未记录 A1API (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-{(1E)-3-[(2-methoxyethyl)amino]-3-oxoprop-1-en-1-yl}-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350, 0.2 M Magnesium formate
分辨率 1.62 Å R-free 0.187
9BHS Crystal structure of the WDR domain of human DCAF1 in complex with OICR-9939 compound 提交 2024-04-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1077–1390（314 aa）
未记录 A1APJ (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 UNL UNKNOWN LIGAND × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；30% PEG2000 Monoethyl Ether, 0.2 M Potassium Bromide
分辨率 1.43 Å R-free 0.170
9BHS Crystal structure of the WDR domain of human DCAF1 in complex with OICR-9939 compound 提交 2024-04-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1077–1390（314 aa）
未记录 A1APJ (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 UNL UNKNOWN LIGAND × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；30% PEG2000 Monoethyl Ether, 0.2 M Potassium Bromide
分辨率 1.43 Å R-free 0.170
9C1Q Crystal structure of the WDR domain of human DCAF1 in complex with OICR-39512 compound 提交 2024-05-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1077–1390（314 aa）
未记录 A1ATT (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-(3-methoxyprop-1-yn-1-yl)-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 4 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350, 0.2 M Magnesium formate
分辨率 1.80 Å R-free 0.191
9D4E Crystal structure of the human DCAF1 WDR domain in complex with OICR-41103 提交 2024-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1077–1390（314 aa）
未记录 A1A1Q (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-[(1E)-3-oxo-3-(piperidin-1-yl)prop-1-en-1-yl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% w/v PEG 3350, 0.2 M di-Ammonium Citrate
分辨率 1.70 Å R-free 0.206
9D4E Crystal structure of the human DCAF1 WDR domain in complex with OICR-41103 提交 2024-08-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1077–1390（314 aa）
未记录 A1A1Q (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-[(1E)-3-oxo-3-(piperidin-1-yl)prop-1-en-1-yl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% w/v PEG 3350, 0.2 M di-Ammonium Citrate
分辨率 1.70 Å R-free 0.206
9DLW Crystal structure of the ternary complex of DCAF1 and WDR5 with PROTAC, OICR-41114 提交 2024-09-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1080–1390（311 aa） 片段：residues 1080-1390
未记录 A1BAF N-{(1P)-5'-({(32E)-33-[(3P)-4-{[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]carbamoyl}-3-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrol-2-yl]-31-oxo-3,6,9,12,15,18,21,24,27-nonaoxa-30-azatritriacont-32-en-1-yl}carbamoyl)-2'-fluoro-4-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；294 K；1.8 M Sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic / pH 6.9
分辨率 2.07 Å R-free 0.242
9NSN Crystal structure of the ternary complex of DCAF1 and WDR5 with PROTAC, OICR-41059 提交 2025-03-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1080–1390（311 aa） 片段：residues 1080-1390
未记录 A1B0X N-{(1P)-5'-({(26E)-27-[(3P)-4-{[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]carbamoyl}-3-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrol-2-yl]-25-oxo-3,6,9,12,15,18,21-heptaoxa-24-azaheptacos-26-en-1-yl}carbamoyl)-2'-fluoro-4-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-6-oxo-4-(trifluoromethyl)-5,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；0.15 M cesium chloride, 15% PEG3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.234
9NSO Crystal structure of the ternary complex of DCAF1 and WDR5 with PROTAC, OICR-41060 提交 2025-03-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1080–1390（311 aa） 片段：residues 1080-1390
未记录 A1B0Y (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-[(34E)-1-{(1P)-6-fluoro-3'-[4-fluoro-2-(trifluoromethyl)benzamido]-4'-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1,33-dioxo-5,8,11,14,17,20,23,26,29-nonaoxa-2,32-diazapentatriacont-34-en-35-yl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 4.2, 0.4 M potassium phosphate dibasic, 1.6 M sodium phosphate monobasic monohydrate
分辨率 1.85 Å R-free 0.218
9PLY Crystal structure of the human DCAF1 WDR domain in complex with OICR-40156 提交 2025-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1077–1390（314 aa）
链 B 1077–1390（314 aa）
未记录 A1CI0 (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-{(1E)-3-[(3-methoxypropyl)amino]-3-oxoprop-1-en-1-yl}-1H-pyrrole-3-carboxamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3350, 0.2 M Magnesium formate
分辨率 1.40 Å R-free 0.174
9Y4Q Crystal structure of the human DCAF1 WDR domain in complex with OICR-40102 提交 2025-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1077–1390（314 aa）
链 B 1077–1390（314 aa）
未记录 A1CR9 (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-(pyrimidin-5-yl)-1H-pyrrole-3-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；3.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris Propane pH 7.0
分辨率 1.48 Å R-free 0.193
9Y76 Crystal structure of the human DCAF1 WDR domain in complex with OICR-40120 提交 2025-09-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1077–1390（314 aa）
未记录 A1CSX (4P,5M)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-{1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-1H-pyrazol-4-yl}-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350, 0.2 M magnesium formate
分辨率 1.56 Å R-free 0.208
9Y76 Crystal structure of the human DCAF1 WDR domain in complex with OICR-40120 提交 2025-09-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1077–1390（314 aa）
未记录 A1CSX (4P,5M)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-{1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-1H-pyrazol-4-yl}-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350, 0.2 M magnesium formate
分辨率 1.56 Å R-free 0.208
9YDG Crystal structure of the human DCAF1 WDR domain in complex with OICR-41074 提交 2025-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1080–1390（311 aa）
未记录 A1CU7 (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-[(1E)-3-(morpholin-4-yl)-3-oxoprop-1-en-1-yl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% w/v PEG 3350, 0.2 M Potassium Fluoride
分辨率 1.54 Å R-free 0.218
9YDG Crystal structure of the human DCAF1 WDR domain in complex with OICR-41074 提交 2025-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1080–1390（311 aa）
未记录 A1CU7 (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-[(1E)-3-(morpholin-4-yl)-3-oxoprop-1-en-1-yl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% w/v PEG 3350, 0.2 M Potassium Fluoride
分辨率 1.54 Å R-free 0.218
9YE4 Crystal structure of the human DCAF1 WDR domain in complex with OICR-41110 提交 2025-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1080–1390（311 aa）
未记录 A1CVQ (4P)-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-N-[(1S)-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-2-cyanoethyl]-5-[(1E)-3-oxo-3-(piperidin-1-yl)prop-1-en-1-yl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；25% w/v PEG 3350, 0.1 M Ammonium Sulphate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 1.74 Å R-free 0.224
9YE4 Crystal structure of the human DCAF1 WDR domain in complex with OICR-41110 提交 2025-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1080–1390（311 aa）
未记录 A1CVQ (4P)-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-N-[(1S)-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-2-cyanoethyl]-5-[(1E)-3-oxo-3-(piperidin-1-yl)prop-1-en-1-yl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；25% w/v PEG 3350, 0.1 M Ammonium Sulphate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
分辨率 1.74 Å R-free 0.224
9YV4 Crystal structure of the human DCAF1 WDR domain in complex with OICR-41109 提交 2025-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1080–1390（311 aa）
未记录 A1CY9 (4P)-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-N-[(1S)-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-2-cyanoethyl]-5-[(1E)-3-oxo-3-(pyrrolidin-1-yl)prop-1-en-1-yl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；25% w/v PEG 3350, 0.2 M Magnesium Chloride, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.194
9YV4 Crystal structure of the human DCAF1 WDR domain in complex with OICR-41109 提交 2025-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1080–1390（311 aa）
未记录 A1CY9 (4P)-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-N-[(1S)-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-2-cyanoethyl]-5-[(1E)-3-oxo-3-(pyrrolidin-1-yl)prop-1-en-1-yl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；25% w/v PEG 3350, 0.2 M Magnesium Chloride, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.194
9ZL9 Crystal structure of DCAF1 in complex with SDIPTAC C7 提交 2025-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1077–1390（314 aa）
链 B 1077–1390（314 aa）
链 C 1077–1390（314 aa）
链 D 1077–1390（314 aa）
链 E 1077–1390（314 aa）
链 F 1077–1390（314 aa）
突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A A1C24 (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrole-3-carboxamide × 4 A1C23 (4P,4'P)-5,5'-[(1E,30E)-3,29-dioxo-7,10,13,16,19,22,25-heptaoxa-4,28-diazahentriaconta-1,30-diene-1,31-diyl]bis{N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrole-3-carboxamide} × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；294.15 K；0.2 M sodium fluoride, 20% w/v PEG 3350, pH 7.3
分辨率 2.60 Å R-free 0.317
9ZLE Crystal structure of DCAF1 in complex with SDIPTAC C8 提交 2025-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1077–1390（314 aa）
链 B 1077–1390（314 aa）
链 C 1077–1390（314 aa）
链 D 1077–1390（314 aa）
链 E 1077–1390（314 aa）
链 F 1077–1390（314 aa）
突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A A1C24 (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrole-3-carboxamide × 4 A1C25 (4P,4'P)-5,5'-[(1E,33E)-3,32-dioxo-7,10,13,16,19,22,25,28-octaoxa-4,31-diazatetratriaconta-1,33-diene-1,34-diyl]bis{N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrole-3-carboxamide} × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；294.15 K；1.0 M ammonium tartrate dibasic, 0.1 M sodium acetate trihydrate, pH 4.6
分辨率 2.55 Å R-free 0.305
9ZLG Crystal structure of DCAF1 in complex with SDIPTAC C9 提交 2025-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1077–1390（314 aa）
链 B 1077–1390（314 aa）
链 C 1077–1390（314 aa）
链 D 1077–1390（314 aa）
链 E 1077–1390（314 aa）
链 F 1077–1390（314 aa）
链 G 1077–1390（314 aa）
链 H 1077–1390（314 aa）
突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A A1C24 (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrole-3-carboxamide × 4 A1C26 (4P,4'P)-5,5'-[(1E,36E)-3,35-dioxo-7,10,13,16,19,22,25,28,31-nonaoxa-4,34-diazaheptatriaconta-1,36-diene-1,37-diyl]bis{N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrole-3-carboxamide} × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294.15 K；5% w/v 1-ethyl-3-methylimidazolium acetate, 15% w/v PEG 20,000, pH 6.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.289
9ZLI Crystal structure of DCAF1 in complex with SDIPTAC C11 提交 2025-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1077–1390（314 aa）
链 B 1077–1390（314 aa）
链 C 1077–1390（314 aa）
链 D 1077–1390（314 aa）
链 E 1077–1390（314 aa）
链 F 1077–1390（314 aa）
突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 突变：F1077A, R1079A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.07 Å R-free 0.278

共 46 个其他 PDB 条目、60 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DCAF1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 28–338； UniProt 1080–1390

WD repeat-containing protein 5

Homo sapiens

UniProt P61964

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 24–334 未记录 DDB1- and CUL4-associated factor 1 × 1 （Q9Y4B6） IMD IMIDAZOLE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.2 M imidazole, pH 7.4, 20% w/v polyethylene glycol 4,000 分辨率 2.97 Å R-free 0.266

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9BA2 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
10TC Structure of WDR5 bound to RbBP5 (D376N) 提交 2026-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.15 M Ammonium citrate, 18% PEG3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
10TC Structure of WDR5 bound to RbBP5 (D376N) 提交 2026-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 31–334（304 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.15 M Ammonium citrate, 18% PEG3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
10TC Structure of WDR5 bound to RbBP5 (D376N) 提交 2026-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 31–334（304 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.15 M Ammonium citrate, 18% PEG3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
10TC Structure of WDR5 bound to RbBP5 (D376N) 提交 2026-02-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 31–334（304 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.15 M Ammonium citrate, 18% PEG3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
24XN Structure of WDR5 F263A variant in complex with MBD3C 提交 2026-03-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.15 ammonium sulfate, 0.1 M sodium HEPES, pH7.0, 20% w/v PEG 4000
分辨率 1.57 Å R-free 0.212
24XN Structure of WDR5 F263A variant in complex with MBD3C 提交 2026-03-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.15 ammonium sulfate, 0.1 M sodium HEPES, pH7.0, 20% w/v PEG 4000
分辨率 1.57 Å R-free 0.212
24XP Crystal structure of WDR5 F133A variant in complex with MBD3C 提交 2026-03-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 20% (w/v) PEG 4000
分辨率 1.30 Å R-free 0.180
24XP Crystal structure of WDR5 F133A variant in complex with MBD3C 提交 2026-03-23 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 20% (w/v) PEG 4000
分辨率 1.30 Å R-free 0.180
2CNX WDR5 and Histone H3 Lysine 4 dimethyl complex at 2.1 angstrom 提交 2006-05-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–334（315 aa） 片段：RESIDUES 20-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å R-free 0.223
2CO0 WDR5 and unmodified Histone H3 complex at 2.25 Angstrom 提交 2006-05-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–334（315 aa） 片段：RESIDUES 20-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.25 Å R-free 0.226
2CO0 WDR5 and unmodified Histone H3 complex at 2.25 Angstrom 提交 2006-05-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 20–334（315 aa） 片段：RESIDUES 20-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.25 Å R-free 0.226
2G99 Structural basis for the specific recognition of methylated histone H3 lysine 4 by the WD-40 protein WDR5 提交 2006-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 27–334（308 aa） 片段：residues 27-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 4000, 10% isopropanol, 0.1M HEPES, pH7.5 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.90 Å R-free 0.243
2G99 Structural basis for the specific recognition of methylated histone H3 lysine 4 by the WD-40 protein WDR5 提交 2006-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 27–334（308 aa） 片段：residues 27-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 4000, 10% isopropanol, 0.1M HEPES, pH7.5 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.90 Å R-free 0.243
2G9A Structural basis for the specific recognition of methylated histone H3 lysine 4 by the WD-40 protein WDR5 提交 2006-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 29–334（306 aa） 片段：;'residues 24-334 ;
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG, 0.2M ammonium acetate, 100mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.70 Å R-free 0.286
2GNQ Structure of wdr5 提交 2006-04-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–334（334 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；20%peg5k mme, bis-tris 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K
分辨率 1.80 Å R-free 0.192
2H13 Crystal structure of WDR5/histone H3 complex 提交 2006-05-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa） 片段：Residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；20-30% PEG3350, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.05 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.58 Å R-free 0.200
2H14 Crystal of WDR5 (apo-form) 提交 2006-05-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa） 片段：Residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；20-30% PEG 3350 0.1M Hepes 0.05M ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.48 Å R-free 0.197
2H68 Histone H3 recognition and presentation by the WDR5 module of the MLL1 complex 提交 2006-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Crystals were grown by hanging drop vapour equilibration in Nextal plates as follows: 1 ul of 10 15 mg ml-1 protein solution (10 mM Tris HCl (pH 7.4), 50 mM NaCl, and 10 mM 2-mercaptoethanol) were mixed with 1 ul of well solution composed of 50 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM potassium formate, and 10-20% (w/v) polyethylene glycol 3350 and equilibrated at room temperature overnight against 1 ml of well solution.
分辨率 1.79 Å R-free 0.192
2H68 Histone H3 recognition and presentation by the WDR5 module of the MLL1 complex 提交 2006-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 23–334（312 aa） 片段：residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Crystals were grown by hanging drop vapour equilibration in Nextal plates as follows: 1 ul of 10 15 mg ml-1 protein solution (10 mM Tris HCl (pH 7.4), 50 mM NaCl, and 10 mM 2-mercaptoethanol) were mixed with 1 ul of well solution composed of 50 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM potassium formate, and 10-20% (w/v) polyethylene glycol 3350 and equilibrated at room temperature overnight against 1 ml of well solution.
分辨率 1.79 Å R-free 0.192
2H6K Histone H3 recognition and presentation by the WDR5 module of the MLL1 complex 提交 2006-05-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Crystals were grown by hanging drop vapour equilibration in Nextal plates as follows: 1 ul of 10 15 mg ml-1 protein solution (10 mM Tris, HCl (pH 7.4), 50 mM NaCl, and 10 mM 2-mercaptoethanol) were mixed with 1 ul of well solution composed of 50 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM potassium formate, and 10-20% (w/v) polyethylene glycol 3350 and equilibrated at room temperature overnight against 1 ml of well solution.
分辨率 1.89 Å R-free 0.190
2H6K Histone H3 recognition and presentation by the WDR5 module of the MLL1 complex 提交 2006-05-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 23–334（312 aa） 片段：residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Crystals were grown by hanging drop vapour equilibration in Nextal plates as follows: 1 ul of 10 15 mg ml-1 protein solution (10 mM Tris, HCl (pH 7.4), 50 mM NaCl, and 10 mM 2-mercaptoethanol) were mixed with 1 ul of well solution composed of 50 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM potassium formate, and 10-20% (w/v) polyethylene glycol 3350 and equilibrated at room temperature overnight against 1 ml of well solution.
分辨率 1.89 Å R-free 0.190
2H6N Histone H3 recognition and presentation by the WDR5 module of the MLL1 complex 提交 2006-05-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Crystals were grown by hanging drop vapour equilibration in Nextal plates as follows: 1 ul of 10 15 mg ml-1 protein solution (10 mM Tris HCl (pH 7.4), 50 mM NaCl, and 10 mM 2-mercaptoethanol) were mixed with 1 ul of well solution composed of 50 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM potassium formate, and 10-20% (w/v) polyethylene glycol 3350 and equilibrated at room temperature overnight against 1 ml of well solution.
分辨率 1.50 Å R-free 0.198
2H6N Histone H3 recognition and presentation by the WDR5 module of the MLL1 complex 提交 2006-05-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 23–334（312 aa） 片段：residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Crystals were grown by hanging drop vapour equilibration in Nextal plates as follows: 1 ul of 10 15 mg ml-1 protein solution (10 mM Tris HCl (pH 7.4), 50 mM NaCl, and 10 mM 2-mercaptoethanol) were mixed with 1 ul of well solution composed of 50 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM potassium formate, and 10-20% (w/v) polyethylene glycol 3350 and equilibrated at room temperature overnight against 1 ml of well solution.
分辨率 1.50 Å R-free 0.198
2H6Q Histone H3 recognition and presentation by the WDR5 module of the MLL1 complex 提交 2006-06-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Crystals were grown by hanging drop vapour equilibration in Nextal plates as follows: 1 ul of 10 15 mg ml-1 protein solution (10 mM Tris HCl (pH 7.4), 50 mM NaCl, and 10 mM 2-mercaptoethanol) were mixed with 1 ul of well solution composed of 50 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM potassium formate, and 10-20% (w/v) polyethylene glycol 3350 and equilibrated at room temperature overnight against 1 ml of well solution.
分辨率 1.87 Å R-free 0.185
2H6Q Histone H3 recognition and presentation by the WDR5 module of the MLL1 complex 提交 2006-06-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 23–334（312 aa） 片段：residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 Crystals were grown by hanging drop vapour equilibration in Nextal plates as follows: 1 ul of 10 15 mg ml-1 protein solution (10 mM Tris HCl (pH 7.4), 50 mM NaCl, and 10 mM 2-mercaptoethanol) were mixed with 1 ul of well solution composed of 50 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM potassium formate, and 10-20% (w/v) polyethylene glycol 3350 and equilibrated at room temperature overnight against 1 ml of well solution.
分辨率 1.87 Å R-free 0.185
2H9L WDR5delta23 提交 2006-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；20% PEG 5000 MME, 0.1M Bis-Tris 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K
分辨率 1.75 Å R-free 0.201
2H9M WDR5 in complex with unmodified H3K4 peptide 提交 2006-06-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；300 K；20% PEG 3350, 0.2M di-Na Tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 1.90 Å R-free 0.257
2H9M WDR5 in complex with unmodified H3K4 peptide 提交 2006-06-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；300 K；20% PEG 3350, 0.2M di-Na Tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 1.90 Å R-free 0.257
2H9N WDR5 in complex with monomethylated H3K4 peptide 提交 2006-06-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；20% PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.00 Å R-free 0.279
2H9N WDR5 in complex with monomethylated H3K4 peptide 提交 2006-06-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；20% PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.00 Å R-free 0.279
2H9P WDR5 in complex with trimethylated H3K4 peptide 提交 2006-06-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；300 K；30% PEG4000, 0.2M Ammonium Acetate and 0.1M Na Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 1.91 Å R-free 0.203
2O9K WDR5 in Complex with Dimethylated H3K4 Peptide 提交 2006-12-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；300 K；20% PEG 5000 MME, 0.1M BIS-TRIS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 300K, pH 6.50
分辨率 1.90 Å R-free 0.226
2O9K WDR5 in Complex with Dimethylated H3K4 Peptide 提交 2006-12-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；300 K；20% PEG 5000 MME, 0.1M BIS-TRIS, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 300K, pH 6.50
分辨率 1.90 Å R-free 0.226
3EG6 Structure of WDR5 bound to MLL1 peptide 提交 2008-09-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：WD-repeat domain (UNP residues 23-334)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；298 K；30% PEG 3350, 30 mM (NH4)2SO4, 100 mM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.72 Å R-free 0.240
3EMH Structural basis of WDR5-MLL interaction 提交 2008-09-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 25–334（310 aa） 片段：UNP residues 25-334
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20 mM HEPES, 15-20% PEG 3350, 60mM Ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.37 Å R-free 0.200
3MXX Crystal structure of WDR5 mutant (S62A) 提交 2010-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa） 片段：RESIDUES 31-334
突变：S62A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；18% PEG 3350, 0.1M Hepes, 18mM (NH4)2SO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.05 Å R-free 0.239
3N0D Crystal structure of WDR5 mutant (W330F) 提交 2010-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa） 片段：RESIDUES 31-334
突变：W330F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；18% PEG 3350, 0.1M Hepes, 14mM (NH4)2SO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.233
3N0E Crystal structure of WDR5 mutant (W330Y) 提交 2010-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa） 片段：RESIDUES 31-334
突变：W330Y 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；18% PEG 3350, 0.1M Hepes, 14mM (NH4)2SO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.323
3P4F Structural and biochemical insights into MLL1 core complex assembly and regulation. 提交 2010-10-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 22–334（313 aa） 片段：unp residues 1-308
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；0.2 M ammonium citrate (buffered with hydrochloric acid/sodium hydroxide to pH 7.0) and 18% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.35 Å R-free 0.249
3PSL Fine-tuning the stimulation of MLL1 methyltransferase activity by a histone H3 based peptide mimetic 提交 2010-12-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–334（314 aa） 片段：WDR5 (unp residues 21-334)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；50 mM NaAcetate, 100 mM NH4 SO4 , and 20% PEG4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.205
3PSL Fine-tuning the stimulation of MLL1 methyltransferase activity by a histone H3 based peptide mimetic 提交 2010-12-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–334（314 aa） 片段：WDR5 (unp residues 21-334)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；50 mM NaAcetate, 100 mM NH4 SO4 , and 20% PEG4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.205
3SMR Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound 提交 2011-06-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 NP7 2-chloro-N-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；297 K；24% PEG3350,9.2M NH4 Acetate, 0.1 Bis Tris pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 1.82 Å R-free 0.206
3SMR Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound 提交 2011-06-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 NP7 2-chloro-N-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 UNX UNKNOWN LIGAND × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；297 K；24% PEG3350,9.2M NH4 Acetate, 0.1 Bis Tris pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 1.82 Å R-free 0.206
3SMR Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound 提交 2011-06-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 24–334（311 aa）
未记录 NP7 2-chloro-N-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 UNX UNKNOWN LIGAND × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；297 K；24% PEG3350,9.2M NH4 Acetate, 0.1 Bis Tris pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 1.82 Å R-free 0.206
3SMR Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound 提交 2011-06-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 24–334（311 aa）
未记录 NP7 2-chloro-N-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；297 K；24% PEG3350,9.2M NH4 Acetate, 0.1 Bis Tris pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 1.82 Å R-free 0.206
3UR4 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound 提交 2011-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 0BW methyl 3-[(3-methoxybenzoyl)amino]-4-(4-methylpiperazin-1-yl)benzoate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；297 K；22% PEG 3350,0.1M A.S. ,0.1M Bis Tris pH 6.0 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 1.80 Å R-free 0.213
3UR4 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound 提交 2011-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 0BW methyl 3-[(3-methoxybenzoyl)amino]-4-(4-methylpiperazin-1-yl)benzoate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；297 K；22% PEG 3350,0.1M A.S. ,0.1M Bis Tris pH 6.0 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
分辨率 1.80 Å R-free 0.213
3UVK Crystal structure of WDR5 in complex with the WDR5-interacting motif of MLL2 提交 2011-11-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–334（314 aa） 片段：UNP residues 21-334
未记录 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；323 K；0.1 M ammonium sulfate, 24% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 323K
分辨率 1.40 Å R-free 0.192
3UVL Crystal structure of WDR5 in complex with the WDR5-interacting motif of MLL3 提交 2011-11-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–334（314 aa） 片段：UNP residues 21-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；323 K；0.1 M ammonium acetate, 25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 323K
分辨率 2.20 Å R-free 0.220
3UVM Crystal structure of WDR5 in complex with the WDR5-interacting motif of MLL4 提交 2011-11-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–334（314 aa） 片段：UNP residues 21-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M ammonium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.57 Å R-free 0.198
3UVN Crystal structure of WDR5 in complex with the WDR5-interacting motif of SET1A 提交 2011-11-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–334（314 aa） 片段：UNP residues 21-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；25% PEG3350, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.79 Å R-free 0.230
3UVN Crystal structure of WDR5 in complex with the WDR5-interacting motif of SET1A 提交 2011-11-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 21–334（314 aa） 片段：UNP residues 21-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；25% PEG3350, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.79 Å R-free 0.230
3UVO Crystal structure of WDR5 in complex with the WDR5-interacting motif of SET1B 提交 2011-11-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–334（314 aa） 片段：UNP residues 21-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M ammonium sulfate, 25% PEG3350, 0.1 M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.20 Å R-free 0.219
4A7J Symmetric Dimethylation of H3 Arginine 2 is a Novel Histone Mark that Supports Euchromatin Maintenance 提交 2011-11-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–334（314 aa） 片段：RESIDUES 21-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1 M HEPES PH 7.5; 60 MM AMMONIUM SULPHATE; 30% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.222
4CY1 Crystal structure of the KANSL1-WDR5 complex. 提交 2014-04-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：RESIDUES 23-334
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；26% (W/V) PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M BIS-TRIS, PH 6.5.
分辨率 1.50 Å R-free 0.183
4CY1 Crystal structure of the KANSL1-WDR5 complex. 提交 2014-04-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 23–334（312 aa） 片段：RESIDUES 23-334
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；26% (W/V) PEG 3350, 0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M BIS-TRIS, PH 6.5.
分辨率 1.50 Å R-free 0.183
4CY2 Crystal structure of the KANSL1-WDR5-KANSL2 complex. 提交 2014-04-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：RESIDUES 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.9；20% (W/V) PEG 3350, 0.2 M POTASSIUM NITRATE, PH 6.9.
分辨率 2.00 Å R-free 0.222
4ERQ X-ray structure of WDR5-MLL2 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.3；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.3, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.91 Å R-free 0.200
4ERQ X-ray structure of WDR5-MLL2 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 23–334（312 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.3；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.3, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.91 Å R-free 0.200
4ERQ X-ray structure of WDR5-MLL2 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 23–334（312 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.3；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.3, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.91 Å R-free 0.200
4ERY X-ray structure of WDR5-MLL3 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.5；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.5, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.30 Å R-free 0.209
4ERZ X-ray structure of WDR5-MLL4 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.6；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.6, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.75 Å R-free 0.216
4ERZ X-ray structure of WDR5-MLL4 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 23–334（312 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.6；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.6, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.75 Å R-free 0.216
4ERZ X-ray structure of WDR5-MLL4 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 23–334（312 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.6；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.6, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.75 Å R-free 0.216
4ES0 X-ray structure of WDR5-SETd1b Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.6；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.6, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.82 Å R-free 0.242
4ESG X-ray structure of WDR5-MLL1 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.2；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.2, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.70 Å R-free 0.193
4ESG X-ray structure of WDR5-MLL1 Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 23–334（312 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.2；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.2, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.70 Å R-free 0.193
4EWR X-ray structure of WDR5-SETd1a Win motif peptide binary complex 提交 2012-04-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–334（312 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.6；294 K；PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.6, hanging drop, temperature 294K
分辨率 1.50 Å R-free 0.198
4GM3 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-101 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；25% PEG4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.39 Å R-free 0.226
4GM3 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-101 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；25% PEG4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.39 Å R-free 0.226
4GM3 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-101 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；25% PEG4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.39 Å R-free 0.226
4GM3 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-101 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；25% PEG4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.39 Å R-free 0.226
4GM3 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-101 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；25% PEG4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.39 Å R-free 0.226
4GM3 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-101 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；25% PEG4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.39 Å R-free 0.226
4GM3 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-101 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；25% PEG4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.39 Å R-free 0.226
4GM3 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-101 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；25% PEG4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.39 Å R-free 0.226
4GM8 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-102 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；30% PEG8000, 0.2 M ammonium sulfate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.249
4GM8 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-102 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；30% PEG8000, 0.2 M ammonium sulfate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.249
4GM8 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-102 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；30% PEG8000, 0.2 M ammonium sulfate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.249
4GM8 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-102 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；30% PEG8000, 0.2 M ammonium sulfate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.249
4GM9 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-401 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG4000, 0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.00K
分辨率 2.10 Å R-free 0.208
4GM9 Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-401 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；30% PEG4000, 0.2 M magnesium chloride, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.00K
分辨率 2.10 Å R-free 0.208
4GMB Crystal structure of human WD repeat domain 5 with compound MM-402 提交 2012-08-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa） 片段：UNP residues 22-334
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25% tert-butanol, 0.1 M Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.78 Å R-free 0.247
4IA9 Crystal structure of human WD REPEAT DOMAIN 5 in complex with 2-chloro-4-fluoro-3-methyl-N-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl]benzamide 提交 2012-12-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 IA9 2-chloro-4-fluoro-3-methyl-N-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 UNX UNKNOWN LIGAND × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；291 K；25% PEH 3500, 0.1 M Ammonium sulfate, 0.1 M BisTris pH5.5, vapor diffusion hanging drop, temperature 291K
分辨率 1.66 Å R-free 0.210
4O45 WDR5 in complex with influenza NS1 C-terminal tail 提交 2013-12-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 24-334
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；291 K；25% PEG3350, 0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris, pH 6.5, temperature 291K
分辨率 1.87 Å R-free 0.212
4QL1 Crystal structure of human WDR5 in complex with compound OICR-9429 提交 2014-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 35Q N-(4-(4-methylpiperazin-1-yl)-3'-(morpholinomethyl)-[1,1'-biphenyl]-3-yl)-6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4oAC, 0.1 M BisTris pH6.5, vapor diffusion hanging drop, temperature 291K
分辨率 1.50 Å R-free 0.227
4QL1 Crystal structure of human WDR5 in complex with compound OICR-9429 提交 2014-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 35Q N-(4-(4-methylpiperazin-1-yl)-3'-(morpholinomethyl)-[1,1'-biphenyl]-3-yl)-6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25% PEG 3350, 0.2 M NH4oAC, 0.1 M BisTris pH6.5, vapor diffusion hanging drop, temperature 291K
分辨率 1.50 Å R-free 0.227
4QQE Crystal structure of WDR5, WD repeat domain 5 in complex with compound SGC-DS-MT-0345 提交 2014-06-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 24-334
未记录 37F N-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-(quinolin-3-yl)phenyl]-6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 UNX UNKNOWN LIGAND × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；22% PEG3350, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.218
4Y7R Crystal structure of WDR5 in complex with MYC MbIIIb peptide 提交 2015-02-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Tris 7.0, 25% PEG 8K
分辨率 1.90 Å R-free 0.188
5EAL Crystal structure of human WDR5 in complex with compound 9h 提交 2015-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 5ML 3-methyl-~{N}-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-quinolin-3-yl-phenyl]benzamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；20% PEG 5K MME, 0.1 M BisTris pH6.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.211
5EAL Crystal structure of human WDR5 in complex with compound 9h 提交 2015-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 5ML 3-methyl-~{N}-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-quinolin-3-yl-phenyl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 UNX UNKNOWN LIGAND × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；20% PEG 5K MME, 0.1 M BisTris pH6.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.211
5EAM Crystal structure of human WDR5 in complex with compound 9o 提交 2015-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 5MN ~{N}-[5-(1~{H}-indol-5-yl)-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-3-methyl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25% PEG3350, 0.1M NH4SO4, 0.1 M BisTris pH6.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
5EAM Crystal structure of human WDR5 in complex with compound 9o 提交 2015-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 5MN ~{N}-[5-(1~{H}-indol-5-yl)-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-3-methyl-benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 14 SO4 SULFATE ION × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25% PEG3350, 0.1M NH4SO4, 0.1 M BisTris pH6.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
5EAP Crystal structure of human WDR5 in complex with compound 9e 提交 2015-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 5MO N-[5-(2,3-dihydro-1-benzofuran-5-yl)-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-3-methylbenzamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 UNX UNKNOWN LIGAND × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；28% PEG 2K MME, 0.1 M BisTris pH6.5
分辨率 1.73 Å R-free 0.241
5EAR Crystal structure of human WDR5 in complex with compound 9d 提交 2015-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 5MQ N-[5-(2,3-dihydro-1-benzofuran-7-yl)-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-3-methylbenzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；22% PEG 3350, 0.1M NH4SO4, 0.1 M BisTris pH5.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.185
5EAR Crystal structure of human WDR5 in complex with compound 9d 提交 2015-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 5MQ N-[5-(2,3-dihydro-1-benzofuran-7-yl)-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-3-methylbenzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；22% PEG 3350, 0.1M NH4SO4, 0.1 M BisTris pH5.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.185
5M23 Modulation of MLL1 Methyltransferase Activity 提交 2016-10-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 7DC 4-[(~{E})-[4-[[[(2~{S})-2-[[(2~{S})-2-[[(2~{S})-2-[[(2~{S})-2-azanyl-3-oxidanyl-propanoyl]amino]propanoyl]amino]-5-carbamimidamido-pentanoyl]amino]propanoyl]amino]methyl]phenyl]diazenyl]-~{N}-[(2~{S})-3-methyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD 0.02 M carboxylic acid 0.1 M bicine/Trizma base pH 8.5
分辨率 1.97 Å R-free 0.214
5M25 Modulation of MLL1 Methyltransferase Activity 提交 2016-10-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 7DU (2~{S})-2-[[(2~{S})-2-[[(2~{S})-2-azanyl-3-oxidanyl-propanoyl]amino]propanoyl]amino]-5-carbamimidamido-~{N}-[(2~{S})-1-[[4-[(~{E})-[4-(hydroxymethyl)phenyl]diazenyl]phenyl]methylamino]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]pentanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD 0.02 M carboxylic acid 0.1 M bicine/Trizma base pH 8.5
分辨率 2.43 Å R-free 0.248
5SXM WDR5 in complex with MLL Win motif peptidomimetic 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–334（312 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1M sodium citrate pH 5.6, 15% 2-propanol, and 17% PEG 4000, and 10mM ATP
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
5SXM WDR5 in complex with MLL Win motif peptidomimetic 提交 2016-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 23–334（312 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1M sodium citrate pH 5.6, 15% 2-propanol, and 17% PEG 4000, and 10mM ATP
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
5VFC WDR5 bound to inhibitor MM-589 提交 2017-04-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 9BA N-{(3R,6S,9S,12R)-6-ethyl-12-methyl-9-[3-(N'-methylcarbamimidamido)propyl]-2,5,8,11-tetraoxo-3-phenyl-1,4,7,10-tetraazacyclotetradecan-12-yl}-2-methylpropanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Na Bis-Tris pH 6.5, 26% PEG 8000 and 0.1 M ammonium sulfate
分辨率 1.64 Å R-free 0.174
6BYN Crystal structure of WDR5-Mb(S4) monobody complex 提交 2017-12-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 W 31–334（304 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；28% PEG3350, 0.1 M BisTris pH 5.5
分辨率 2.69 Å R-free 0.248
6D9X Discovery of Potent 2-Aryl-6,7-Dihydro-5HPyrrolo[ 1,2-a]imidazoles as WDR5 WIN-site Inhibitors Using Fragment-Based Methods and Structure-Based Design 提交 2018-04-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 FZM 2-phenyl-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-a]imidazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.83 Å R-free 0.241
6DAI Discovery of Potent 2-Aryl-6,7-Dihydro-5HPyrrolo[ 1,2-a]imidazoles as WDR5 WIN-site Inhibitors Using Fragment-Based Methods and Structure-Based Design 提交 2018-05-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 G2V 6-(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-a]imidazol-2-yl)-1-methylindoline × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.63 Å R-free 0.186
6DAK Discovery of Potent 2-Aryl-6,7-Dihydro-5HPyrrolo[ 1,2-a]imidazoles as WDR5 WIN-site Inhibitors Using Fragment-Based Methods and Structure-Based Design 提交 2018-05-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 G1Y N-{[3-(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-a]imidazol-2-yl)phenyl]methyl}benzamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.188
6DAR Discovery of Potent 2-Aryl-6,7-Dihydro-5HPyrrolo[ 1,2-a]imidazoles as WDR5 WIN-site Inhibitors Using Fragment-Based Methods and Structure-Based Design 提交 2018-05-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 G2J N-(cyclopropylmethyl)-N-{[3-(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-a]imidazol-2-yl)phenyl]methyl}-3-methoxybenzamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.88 Å R-free 0.195
6DAS Discovery of Potent 2-Aryl-6,7-Dihydro-5HPyrrolo[ 1,2-a]imidazoles as WDR5 WIN-site Inhibitors Using Fragment-Based Methods and Structure-Based Design 提交 2018-05-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 G2D N-[(1R)-6-(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-a]imidazol-2-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]-3-methoxy-4-methylbenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.222
6DAS Discovery of Potent 2-Aryl-6,7-Dihydro-5HPyrrolo[ 1,2-a]imidazoles as WDR5 WIN-site Inhibitors Using Fragment-Based Methods and Structure-Based Design 提交 2018-05-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 G2D N-[(1R)-6-(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[1,2-a]imidazol-2-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]-3-methoxy-4-methylbenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.222
6DY7 WDR5 in complex with a WIN site inhibitor 提交 2018-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 HH7 N-[3-(2,4-dichlorophenoxy)propyl]-1H-imidazol-2-amine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.199
6DYA WDR5 in complex with a WIN site inhibitor 提交 2018-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–334（305 aa）
未记录 HHM N-[(3,5-dichlorophenyl)methyl]-3-[(1H-imidazol-1-yl)methyl]benzamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 2.56 Å R-free 0.230
6E1Y Discovery of Potent 2-Aryl-6,7-Dihydro-5HPyrrolo[ 1,2-a]imidazoles as WDR5 WIN-site Inhibitors Using Fragment-Based Methods and Structure-Based Design 提交 2018-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 HLM N-[(1S)-1-(3-chlorophenyl)ethyl]-3-{[(4,5-dihydro-1H-imidazol-2-yl)amino]methyl}benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0 or Hepes pH 7.5, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.22 Å R-free 0.182
6E1Y Discovery of Potent 2-Aryl-6,7-Dihydro-5HPyrrolo[ 1,2-a]imidazoles as WDR5 WIN-site Inhibitors Using Fragment-Based Methods and Structure-Based Design 提交 2018-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 HLM N-[(1S)-1-(3-chlorophenyl)ethyl]-3-{[(4,5-dihydro-1H-imidazol-2-yl)amino]methyl}benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0 or Hepes pH 7.5, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.22 Å R-free 0.182
6E1Z Displacement of WDR5 from chromatin by a pharmacological WIN site inhibitor with picomolar affinity 提交 2018-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 HLP 5-[(1H-imidazol-1-yl)methyl]furan-2-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.10 Å R-free 0.163
6E1Z Displacement of WDR5 from chromatin by a pharmacological WIN site inhibitor with picomolar affinity 提交 2018-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 HLP 5-[(1H-imidazol-1-yl)methyl]furan-2-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.10 Å R-free 0.163
6E22 Displacement of WDR5 from chromatin by a pharmacological WIN site inhibitor with picomolar affinity 提交 2018-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 HLS 3-{[(4,5-dihydro-1H-imidazol-2-yl)amino]methyl}-N-[(3,5-dimethoxyphenyl)methyl]-4-fluorobenzamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0 or Hepes pH 7.5, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.180
6E22 Displacement of WDR5 from chromatin by a pharmacological WIN site inhibitor with picomolar affinity 提交 2018-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 HLS 3-{[(4,5-dihydro-1H-imidazol-2-yl)amino]methyl}-N-[(3,5-dimethoxyphenyl)methyl]-4-fluorobenzamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0 or Hepes pH 7.5, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.180
6E23 Displacement of WDR5 from chromatin by a pharmacological WIN site inhibitor with picomolar affinity 提交 2018-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 HLJ N-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-3-(6-fluoro-2-methylpyridin-3-yl)-5-{[(2E)-2-imino-3-methyl-2,3-dihydro-1H-imidazol-1-yl]methyl}benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0 or Hepes pH 7.5, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.66 Å R-free 0.209
6E23 Displacement of WDR5 from chromatin by a pharmacological WIN site inhibitor with picomolar affinity 提交 2018-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 HLJ N-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-3-(6-fluoro-2-methylpyridin-3-yl)-5-{[(2E)-2-imino-3-methyl-2,3-dihydro-1H-imidazol-1-yl]methyl}benzamide × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0 or Hepes pH 7.5, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350
分辨率 1.66 Å R-free 0.209
6IAM Modulating Protein-Protein Interactions with Visible Light Peptide Backbone Switches 提交 2018-11-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 29–334（306 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；10% (w/v) PEG20000, 20% (v/v) PEG550 MME, 0.02 M sodium formate, 0.02 M ammonium acetate, 0.02 M trisodium citrate, 0.02 M sodium potassium L-tartrate, 0.02 M sodium oxamate
分辨率 1.51 Å R-free 0.170
6KIU Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (3.2 angstrom) 提交 2019-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 R 1–334（334 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6KIV Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 R 1–334（334 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6KIW Cryo-EM structure of human MLL3-ubNCP complex (4.0 angstrom) 提交 2019-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 R 1–334（334 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6KIX Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode1 提交 2019-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 R 1–334（334 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 LYS LYSINE × 1 GLN GLUTAMINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6KIZ Cryo-EM structure of human MLL1-NCP complex, binding mode2 提交 2019-07-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 R 1–334（334 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6OFZ Crystal structure of human WDR5 提交 2019-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；295 K；100 mM Bis-Tris pH5.9, 32% PEG3350, 54.6 mM Ammonium Sulfate
分辨率 1.85 Å R-free 0.250
6OI0 Crystal structure of human WDR5 in complex with L-arginine 提交 2019-04-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 ARG ARGININE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；295 K；100 mM Bis-Tris pH 5.9; 32% PEG3350, 54.6 mM Ammonium Sulfate, 0.66 mM L-arginine
分辨率 1.92 Å R-free 0.201
6OI1 Crystal structure of human WDR5 in complex with monomethyl L-arginine 提交 2019-04-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 NMM (2S)-2-amino-5-[(N-methylcarbamimidoyl)amino]pentanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；295 K；100mM Bis-Tris pH 5.9, 32% PEG3350, 54.6 mM Ammonium Sulfate, 0.66 mM monomethyl L-arginine
分辨率 1.68 Å R-free 0.236
6OI2 Crystal structure of human WDR5 in complex with symmetric dimethyl-L-arginine 提交 2019-04-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 3 2MR N3, N4-DIMETHYLARGININE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；295 K；100 mM Bis-Tris pH5.9, 32% PEG3350, 54.6 mM Ammonium Sulfate, 0.66 mM symmetric dimethyl-L-arginine
分辨率 1.68 Å R-free 0.223
6OI3 Crystal structure of human WDR5 in complex with monomethyl H3R2 peptide 提交 2019-04-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；295 K；100 mM Bis-Tris pH 5.9, 32% PEG3350, 54.6 mM Ammonium Sulfate, 1.67 mM monomethyl H3R2 peptide
分辨率 1.66 Å R-free 0.202
6PG3 WDR5delta23 bound to (2-butyl-1H-imidazol-4-yl)methanol 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 OHJ (2-butyl-1H-imidazol-4-yl)methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.182 M ammonium fluoride, 0.1 M sodium cacodylate (pH 5.79), 22.1 %w/v PEG8000
分辨率 2.04 Å R-free 0.206
6PG3 WDR5delta23 bound to (2-butyl-1H-imidazol-4-yl)methanol 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 OHJ (2-butyl-1H-imidazol-4-yl)methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.182 M ammonium fluoride, 0.1 M sodium cacodylate (pH 5.79), 22.1 %w/v PEG8000
分辨率 2.04 Å R-free 0.206
6PG4 WDR5delta32 bound to (2-methyl-1H-imidazol-4-yl)methanol 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 32–334（303 aa）
未记录 OHG (2-methyl-1H-imidazol-4-yl)methanol × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.114 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris chloride (pH 6.11), 25.8 %w/v PEG8000
分辨率 1.60 Å R-free 0.176
6PG5 WDR5delta32 bound to benzyl (4-(5-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl)butyl)carbamate 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 32–334（303 aa）
未记录 OHV benzyl {4-[5-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl]butyl}carbamate × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.215 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate (pH 7.06), 25.6 %w/v PEG8000
分辨率 1.99 Å R-free 0.202
6PG6 WDR5delta23 bound to N-(4-(5-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl)butyl)acetamide 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 OH7 N-{4-[4-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl]butyl}acetamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.215 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate (pH 7.06), 25.6 %w/v PEG8000
分辨率 1.68 Å R-free 0.193
6PG6 WDR5delta23 bound to N-(4-(5-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl)butyl)acetamide 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 OH7 N-{4-[4-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl]butyl}acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.215 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium cacodylate (pH 7.06), 25.6 %w/v PEG8000
分辨率 1.68 Å R-free 0.193
6PG7 WDR5delta32 bound to (2-(3-methoxy-3-phenylpropyl)-1H-imidazol-4-yl)methanol 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 32–334（303 aa）
未记录 OH4 {2-[(3S)-3-methoxy-3-phenylpropyl]-1H-imidazol-4-yl}methanol × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.17 M ammonium sulfate, 0.1 bis-tris chloride (pH 6.3), 30.5 %w/v PEG4000
分辨率 2.45 Å R-free 0.243
6PG8 WDR5delta23 bound to (2-(3-phenylpropyl)-1H-imidazol-4-yl)methanol 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 OGY [2-(3-phenylpropyl)-1H-imidazol-4-yl]methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.179 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris chloride (pH 5.62), 28.6 %w/v PEG3350
分辨率 1.67 Å R-free 0.207
6PG8 WDR5delta23 bound to (2-(3-phenylpropyl)-1H-imidazol-4-yl)methanol 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 OGY [2-(3-phenylpropyl)-1H-imidazol-4-yl]methanol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.179 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris chloride (pH 5.62), 28.6 %w/v PEG3350
分辨率 1.67 Å R-free 0.207
6PG8 WDR5delta23 bound to (2-(3-phenylpropyl)-1H-imidazol-4-yl)methanol 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 22–334（313 aa）
未记录 OGY [2-(3-phenylpropyl)-1H-imidazol-4-yl]methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.179 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris chloride (pH 5.62), 28.6 %w/v PEG3350
分辨率 1.67 Å R-free 0.207
6PG8 WDR5delta23 bound to (2-(3-phenylpropyl)-1H-imidazol-4-yl)methanol 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 22–334（313 aa）
未记录 OGY [2-(3-phenylpropyl)-1H-imidazol-4-yl]methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.179 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris chloride (pH 5.62), 28.6 %w/v PEG3350
分辨率 1.67 Å R-free 0.207
6PG9 WDR5delta23 bound to N-(4-(5-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl)butyl)benzamide 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 OH1 N-{4-[4-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl]butyl}benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.182 M ammonium fluoride, 0.1 soidum cacodylate (pH 5.79), 22.1 %w/v PEG8000
分辨率 1.75 Å R-free 0.269
6PG9 WDR5delta23 bound to N-(4-(5-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl)butyl)benzamide 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 OH1 N-{4-[4-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl]butyl}benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.182 M ammonium fluoride, 0.1 soidum cacodylate (pH 5.79), 22.1 %w/v PEG8000
分辨率 1.75 Å R-free 0.269
6PGA WDR5delta32 bound to methyl (4-(4-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl)butyl)carbamate 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 32–334（303 aa）
未记录 OGM methyl {4-[5-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl]butyl}carbamate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.237 M ammonium sulfate, 0.1 M bis-tris chloride, 25.7 %w/v MPEG5000
分辨率 2.45 Å R-free 0.250
6PGB WDR5delta32 bound to N-(4-(5-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl)butyl)-2-phenylacetamide 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 32–334（303 aa） 片段：UNP residues 32-334
未记录 OJG N-{4-[5-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl]butyl}-2-phenylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.101 M ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 5.63, 25.8% w/v PEG4000
分辨率 1.73 Å R-free 0.217
6PGC WDR5delta32 bound to methyl benzyl(4-(4-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl)butyl)carbamate 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 32–334（303 aa） 片段：UNP residues 32-334
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 OJJ methyl benzyl{4-[4-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl]butyl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.237 M ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.92, 25.7% w/v MPEG5000
分辨率 1.81 Å R-free 0.248
6PGD WDR5delta32 bound to peptidomimetic 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 32–334（303 aa） 片段：UNP residues 32-334
未记录 OK4 N-acetyl-L-alanyl-5-[5-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl]-L-norvalyl-L-valinamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.233 M ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.02, 26% w/v PEG8000
分辨率 1.50 Å R-free 0.167
6PGE WDR5delta32 bound to ethyl 3-(4-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl)propanoate 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 32–334（303 aa） 片段：UNP residues 32-334
未记录 OJM ethyl 3-[4-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl]propanoate × 1 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.024 M ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 5.64, 26.3% w/v PEG4000
分辨率 1.76 Å R-free 0.213
6PGF WDR5delta32 bound to N-(4-(4-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl)butyl)acrylamide 提交 2019-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 32–334（303 aa） 片段：UNP residues 32-334
未记录 OJP N-{4-[4-(hydroxymethyl)-1H-imidazol-2-yl]butyl}prop-2-enamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；0.16 M ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris chloride, pH 6.1, 30.1% w/v PEG8000
分辨率 1.54 Å R-free 0.170
6PWV Cryo-EM structure of MLL1 core complex bound to the nucleosome 提交 2019-07-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
6PWW Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5 and WDR5 bound to the nucleosome 提交 2019-07-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6U5M Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 Q0S 5-bromo-2-hydroxy-N-[3-(methylsulfonyl)-5-(pentafluoro-lambda~6~-sulfanyl)phenyl]benzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, ammonium acetate, PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.186
6U5M Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 31–334（304 aa）
未记录 Q0S 5-bromo-2-hydroxy-N-[3-(methylsulfonyl)-5-(pentafluoro-lambda~6~-sulfanyl)phenyl]benzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, ammonium acetate, PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.186
6U5Y Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 Q0M 3-{[(5-bromo-3-chloro-2-hydroxyphenyl)sulfonyl]amino}-5-(1-cyanocyclobutyl)-2-hydroxy-N-methylbenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris pH 6.5, 0.2 M ammonium acetate, 28% PEG 3350
分辨率 1.53 Å R-free 0.177
6U5Y Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 31–334（304 aa）
未记录 Q0M 3-{[(5-bromo-3-chloro-2-hydroxyphenyl)sulfonyl]amino}-5-(1-cyanocyclobutyl)-2-hydroxy-N-methylbenzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris pH 6.5, 0.2 M ammonium acetate, 28% PEG 3350
分辨率 1.53 Å R-free 0.177
6U6W Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 Q0Y 5-bromo-N-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)-2-methoxybenzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, PEG3350
分辨率 1.20 Å R-free 0.179
6U6W Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 Q0Y 5-bromo-N-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)-2-methoxybenzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, PEG3350
分辨率 1.20 Å R-free 0.179
6U80 Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-09-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 Q1J 5-bromo-N-(4-hydroxy[1,1'-biphenyl]-3-yl)-2-methoxybenzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, Ammonium Acetate, PEG 3350
分辨率 1.55 Å R-free 0.203
6U80 Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-09-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 Q1J 5-bromo-N-(4-hydroxy[1,1'-biphenyl]-3-yl)-2-methoxybenzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, Ammonium Acetate, PEG 3350
分辨率 1.55 Å R-free 0.203
6U8B Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-09-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 Q1M 3-{[(5-bromo-2-methoxyphenyl)sulfonyl]amino}-5-chloro-2-hydroxybenzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, ammonium acetate, PEG 3350
分辨率 1.26 Å R-free 0.159
6U8B Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-09-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 Q1M 3-{[(5-bromo-2-methoxyphenyl)sulfonyl]amino}-5-chloro-2-hydroxybenzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, ammonium acetate, PEG 3350
分辨率 1.26 Å R-free 0.159
6U8L Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-09-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 Q1P 3-{[(5-bromo-2-hydroxyphenyl)sulfonyl]amino}-5-cyclopropyl-6-fluoro-2-hydroxybenzoic acid × 1 Q1S N-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl]isoquinolin-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, Ammonium acetate, PEG 3350
分辨率 1.57 Å R-free 0.176
6U8L Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-09-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 31–334（304 aa）
未记录 Q1P 3-{[(5-bromo-2-hydroxyphenyl)sulfonyl]amino}-5-cyclopropyl-6-fluoro-2-hydroxybenzoic acid × 1 Q1S N-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-5-nitrophenyl]isoquinolin-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, Ammonium acetate, PEG 3350
分辨率 1.57 Å R-free 0.176
6U8O Discovery and optimization of salicyclic acid-derived sulfonamide inhibitors of the WDR5:MYC protein-protein interaction 提交 2019-09-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 Q1G 5-bromo-N-[5-(1-cyanocyclobutyl)-2-hydroxyphenyl]-2-hydroxybenzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, ammonium acetate, PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.184
6UCS Discovery and Structure-Based optimization of potent and selective WDR5 inhibitors containing a dihydroisoquinolinone bicyclic core 提交 2019-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 Q41 2-amino-3-{[(5P)-2-[(3,5-dimethoxyphenyl)methyl]-5-(4-fluoro-2-methylphenyl)-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-7-yl]methyl}-1-methyl-1H-imidazol-3-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, Ammonium Acetate, PEG 3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.194
6UCS Discovery and Structure-Based optimization of potent and selective WDR5 inhibitors containing a dihydroisoquinolinone bicyclic core 提交 2019-09-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 Q41 2-amino-3-{[(5P)-2-[(3,5-dimethoxyphenyl)methyl]-5-(4-fluoro-2-methylphenyl)-1-oxo-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-7-yl]methyl}-1-methyl-1H-imidazol-3-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, Ammonium Acetate, PEG 3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.194
6UFX WD repeat-containing protein 5 complexed with N-[(3,5-dimethoxyphenyl)methyl]-4'-fluoro-5-{[(2E)-2-imino-3-methyl-2,3-dihydro-1H-imidazol-1-yl]methyl}-2'-methyl[1,1'-biphenyl]-3-carboxamide (compound 13) 提交 2019-09-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 32–334（303 aa） 片段：UNP residues 32-334
未记录 Q6S N-[(3,5-dimethoxyphenyl)methyl]-4'-fluoro-5-{[(2E)-2-imino-3-methyl-2,3-dihydro-1H-imidazol-1-yl]methyl}-2'-methyl[1,1'-biphenyl]-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Bis-Tris or HEPES or Tris-HCl, pH 6.0-8.0, 0.2 M ammonium acetate, 20-30% PEG3350
分辨率 2.02 Å R-free 0.208
6UHY WDR5 in complex with Myc site fragment inhibitor 提交 2019-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 Q8G 1-cyclohexyl-1H-benzimidazole-5-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350.
分辨率 1.26 Å R-free 0.181
6UHY WDR5 in complex with Myc site fragment inhibitor 提交 2019-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 31–334（304 aa）
未记录 Q8G 1-cyclohexyl-1H-benzimidazole-5-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 0.2 M ammonium acetate, 28% to 32% PEG3350.
分辨率 1.26 Å R-free 0.181
6UHZ WDR5 in complex with Myc site fragment inhibitor 提交 2019-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 Q8D 1-cyclohexyl-1H-benzotriazole-5-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 0.2 M ammonium acetate, 28% PEG3350
分辨率 1.26 Å R-free 0.176
6UHZ WDR5 in complex with Myc site fragment inhibitor 提交 2019-09-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 31–334（304 aa）
未记录 Q8D 1-cyclohexyl-1H-benzotriazole-5-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 0.2 M ammonium acetate, 28% PEG3350
分辨率 1.26 Å R-free 0.176
6UIF Discovery of fragment-inspired heterocyclic benzenesulfonmides as inhibitors of the WDR5-MYC interaction 提交 2019-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 Q8P 4-{[(5-bromo-3-chloro-2-hydroxyphenyl)sulfonyl]amino}-1-cyclopentyl-N-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, Ammonium acetate, PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.194
6UIF Discovery of fragment-inspired heterocyclic benzenesulfonmides as inhibitors of the WDR5-MYC interaction 提交 2019-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 31–334（304 aa）
未记录 Q8P 4-{[(5-bromo-3-chloro-2-hydroxyphenyl)sulfonyl]amino}-1-cyclopentyl-N-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, Ammonium acetate, PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.194
6UIK Discovery of fragment-inspired heterocyclic benzenesulfonmides as inhibitors of the WDR5-MYC interaction 提交 2019-10-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 Q8M 5-bromo-3-chloro-N-(1-cyclopentyl-1H-imidazol-4-yl)-2-hydroxybenzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris 6.5, 0.2 M Ammonium Acetate, 28% PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.182
6UIK Discovery of fragment-inspired heterocyclic benzenesulfonmides as inhibitors of the WDR5-MYC interaction 提交 2019-10-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 31–334（304 aa）
未记录 Q8M 5-bromo-3-chloro-N-(1-cyclopentyl-1H-imidazol-4-yl)-2-hydroxybenzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris 6.5, 0.2 M Ammonium Acetate, 28% PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.182
6UJ4 Discovery of fragment-inspired heterocyclic benzenesulfonmides as inhibitors of the WDR5-MYC interaction 提交 2019-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 Q8S 5-bromo-3-chloro-N-(1-cyclopentyl-2-methyl-1H-imidazol-4-yl)-2-hydroxybenzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris 6.5, 0.2 M Ammonium acetate, 28% PEG 3350
分辨率 1.53 Å R-free 0.177
6UJ4 Discovery of fragment-inspired heterocyclic benzenesulfonmides as inhibitors of the WDR5-MYC interaction 提交 2019-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 31–334（304 aa）
未记录 Q8S 5-bromo-3-chloro-N-(1-cyclopentyl-2-methyl-1H-imidazol-4-yl)-2-hydroxybenzene-1-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris 6.5, 0.2 M Ammonium acetate, 28% PEG 3350
分辨率 1.53 Å R-free 0.177
6UJH Discovery of fragment-inspired heterocyclic benzenesulfonamides as inhibitors of the WDR5-MYC interaction 提交 2019-10-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 QBS (2R)-2-(4-chlorophenyl)-3-oxobutanenitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes, 0.2 M ammonium acetate, 32% PEG3350
分辨率 1.49 Å R-free 0.169
6UJH Discovery of fragment-inspired heterocyclic benzenesulfonamides as inhibitors of the WDR5-MYC interaction 提交 2019-10-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 QBS (2R)-2-(4-chlorophenyl)-3-oxobutanenitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes, 0.2 M ammonium acetate, 32% PEG3350
分辨率 1.49 Å R-free 0.169
6UJJ Discovery of fragment-inspired heterocyclic benzenesulfonamides as inhibitors of the WDR5-MYC interaction 提交 2019-10-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 QBP 5-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-tetrazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Hepes, 0.2 M ammonium acetate, 32% PEG3350
分辨率 1.73 Å R-free 0.190
6UJL Discovery of fragment-inspired heterocyclic benzenesulfonamides as inhibitors of the WDR5-MYC interaction 提交 2019-10-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 QBM 6-methyl-3-(propylsulfanyl)-1,2,4-triazin-5-ol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Hepes, 0.2 M ammonium acetate, 32% PEG3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.183
6UOZ Discovery of fragment-inspired heterocyclic benzenesulfonmides as inhibitors of the WDR5-MYC interaction 提交 2019-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 31–334（304 aa）
链 B 31–334（304 aa）
未记录 QF1 5-bromo-3-chloro-N-[1-cyclopentyl-2-(methylsulfonyl)-1H-imidazol-4-yl]-2-hydroxybenzene-1-sulfonamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, ammonium acetate, PEG 3350
分辨率 1.53 Å R-free 0.169
6W5I Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class01) 提交 2020-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6W5M Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class02) 提交 2020-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
6W5N Cryo-EM structure of MLL1 in complex with RbBP5, WDR5, SET1, and ASH2L bound to the nucleosome (Class05) 提交 2020-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.00 Å
6WJQ Crystal structure of WDR5 in complex with the WIN peptide of PDPK1 提交 2020-04-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；PEG 3350, Ammonium Acetate, Bis-tris
分辨率 2.71 Å R-free 0.252
6WJQ Crystal structure of WDR5 in complex with the WIN peptide of PDPK1 提交 2020-04-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；PEG 3350, Ammonium Acetate, Bis-tris
分辨率 2.71 Å R-free 0.252
7AXP Structural characterisation of WDR5:CS-VIP8 interaction in cis state 2 提交 2020-11-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；10% (w/v) PEG20000, 20% (v/v) PEG550 MME, 0.02 M sodium formate, 0.02 M ammonium acetate, 0.02 M trisodium citrate, 0.02 M sodium potassium L-tartrate, 0.02 M sodium oxamate
分辨率 2.43 Å R-free 0.331
7AXQ Structure of the cryo-trapped WDR5:CS-VIP8 cocrystal after illumination at 405 nm and 180 K 提交 2020-11-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；10% (w/v) PEG20000, 20% (v/v) PEG550 MME, 0.02 M sodium formate, 0.02 M ammonium acetate, 0.02 M trisodium citrate, 0.02 M sodium potassium L-tartrate, 0.02 M sodium oxamate
分辨率 1.56 Å R-free 0.200
7AXS Structural characterisation of WDR5:CS-VIP8 interaction in cis state 1 提交 2020-11-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；10% (w/v) PEG20000, 20% (v/v) PEG550 MME, 0.02 M sodium formate, 0.02 M ammonium acetate, 0.02 M trisodium citrate, 0.02 M sodium potassium L-tartrate, 0.02 M sodium oxamate
分辨率 1.88 Å R-free 0.235
7AXU Structure of WDR5:CS-VIP8 cocrystal after illumination in situ 提交 2020-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；10% (w/v) PEG20000, 20% (v/v) PEG550 MME, 0.02 M sodium formate, 0.02 M ammonium acetate, 0.02 M trisodium citrate, 0.02 M sodium potassium L-tartrate, 0.02 M sodium oxamate
分辨率 1.68 Å R-free 0.193
7AXX Structure of WDR5:CS-VIP8 crystal after illumination at 405 nm and room temperature 提交 2020-11-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；10% (w/v) PEG20000, 20% (v/v) PEG550 MME, 0.02 M sodium formate, 0.02 M ammonium acetate, 0.02 M trisodium citrate, 0.02 M sodium potassium L-tartrate, 0.02 M sodium oxamate
分辨率 1.79 Å R-free 0.214
7BCY X-ray structure of WDR5delta24 bound to the Kaposi's sarcoma herpesvirus LANA win motif peptide 提交 2020-12-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 25–334（310 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；294 K；100 mM Bis-Tris pH 5.5, 50 mM (NH4)2SO4, 25% PEG3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.227
7BCY X-ray structure of WDR5delta24 bound to the Kaposi's sarcoma herpesvirus LANA win motif peptide 提交 2020-12-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 25–334（310 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；294 K；100 mM Bis-Tris pH 5.5, 50 mM (NH4)2SO4, 25% PEG3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.227
7BED X-ray structure of WDR5 bound to the WDR5 win motif peptide 提交 2020-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–334（334 aa）
链 B 1–334（334 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；294 K；26% PEG 3350, 100mM Bis-Tris pH 5.5, 50mM (NH4)2SO4,WDR5 at 14,65 mg/ml with 2:1 (protein:well) drop ratio.
分辨率 1.26 Å R-free 0.171
7CFP Crystal structure of WDR5 in complex with a H3Q5ser peptide 提交 2020-06-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–334（334 aa）
未记录 SRO SEROTONIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；0.1% Octylglucoside, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 22% PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.199
7CFQ Crystal structure of WDR5 in complex with H3K4me3Q5ser peptide 提交 2020-06-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–334（334 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SRO SEROTONIN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；295 K；0.15M ammonium sulfate, 0.1M MES pH 5.5, 25% PEG 4000, 2% PEG 3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.190
7DNO Characterization of Peptide Ligands Against WDR5 Isolated Using Phage Display Technique 提交 2020-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 24–334（311 aa）
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；0.1 M BisTris pH 6.0, 0.2M ammonium acetate, 20-30% PEG3350
分辨率 2.03 Å R-free 0.227
7JTO Crystal structure of Protac MS33 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 31–334（304 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 VKA 3-methyl-N-(11-{[2-(4-{[4'-(4-methylpiperazin-1-yl)-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-5,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}[1,1'-biphenyl]-3-yl]methyl}piperazin-1-yl)ethyl]amino}-11-oxoundecanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.1 M HEPES sodium, pH 7.5-8.0, 1.3-1.6 M sodium thiocyanate, 15-20% PEG3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.225
7JTP Crystal structure of Protac MS67 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X6M N-(6-fluoro-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}-4'-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-carbonyl)glycyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 30% PEG300
分辨率 2.12 Å R-free 0.224
7MBM Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode01 提交 2021-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.76 Å
7MBN Cryo-EM structure of MLL1-NCP (H3K4M) complex, mode02 提交 2021-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.02 Å
7Q2J Quaternary Complex of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC Homer 提交 2021-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 24–334（311 aa）
未记录 8KH N-[5-[4-[[5-[[(2S)-3,3-dimethyl-1-[(2S,4R)-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-5-oxidanylidene-pentyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-1H-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.50 Å R-free 0.293
7U9Y WDR5 bound to 2-(3,5-dimethoxybenzyl)-7-((2-methyl-1H-imidazol-1-yl)methyl)-5-(1-methyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroisoquinolin-1(2H)-one 提交 2022-03-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–334（305 aa）
未记录 BEN BENZAMIDINE × 1 M4U (5P)-2-[(3,5-dimethoxyphenyl)methyl]-7-[(2-methyl-1H-imidazol-1-yl)methyl]-5-[1-methyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]-3,4-dihydroisoquinolin-1(2H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；BIS-Tris, ammonium acetate, PEG 3350, benzamidine
分辨率 1.90 Å R-free 0.189
7UAS Discovery of Potent Orally Bioavailable WD Repeat Domain 5 (WDR5) Inhibitors Using a Pharmacophore-Based Optimization 提交 2022-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 MBU (5P)-2-[(S)-cyclopropyl(4-methylpyridin-2-yl)methyl]-5-[1-ethyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]-7-[(2-methyl-1H-imidazol-1-yl)methyl]-3,4-dihydroisoquinolin-1(2H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, Ammonium Acetate, PEG 3350
分辨率 1.81 Å R-free 0.175
7UAS Discovery of Potent Orally Bioavailable WD Repeat Domain 5 (WDR5) Inhibitors Using a Pharmacophore-Based Optimization 提交 2022-03-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 MBU (5P)-2-[(S)-cyclopropyl(4-methylpyridin-2-yl)methyl]-5-[1-ethyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]-7-[(2-methyl-1H-imidazol-1-yl)methyl]-3,4-dihydroisoquinolin-1(2H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；Bis-Tris, Ammonium Acetate, PEG 3350
分辨率 1.81 Å R-free 0.175
7UD5 Complex between MLL1-WRAD and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-03-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 L 2–334（333 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
7WVK Crystal structure of human WDR5 in complex with compound 19 提交 2022-02-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 6IQ 1-[2,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonylbenzimidazole × 1 GOL GLYCEROL × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.2 M NH4OAC, 30% PEG3350
分辨率 1.42 Å R-free 0.182
8BB2 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #2) 提交 2022-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 33–334（302 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 5 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
8BB3 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #1) 提交 2022-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 33–334（302 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 15 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-26% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES
分辨率 1.80 Å R-free 0.227
8BB4 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with C3 linker 提交 2022-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 Q 33–334（302 aa）
未记录 Q3R ~{N}-[5-[4-[[4-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-4-oxidanylidene-butyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.80 Å R-free 0.279
8BB5 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with Aryl linker 提交 2022-10-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 33–334（302 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 10 Q43 ~{N}-[5-[4-[[4-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethyl]phenyl]methylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；21% PEG 3350, 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.20 Å R-free 0.248
8DU4 Complex between RbBP5-WDR5 and an H2B-ubiquitinated nucleosome 提交 2022-07-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 L 2–334（333 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
8E9F WD repeat-containing protein 5 complexed with 4-(7-((1H-imidazol-1-yl)methyl)-5-(1-methyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl)-1-oxo-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl)-6-ethyl-N-methylquinoline-8-carboxamide (compound 10) 提交 2022-08-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 30–334（305 aa）
未记录 BEN BENZAMIDINE × 1 UY9 6-ethyl-4-[(5P)-7-[(1H-imidazol-1-yl)methyl]-5-[1-methyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]-1-oxo-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-N-methylquinoline-8-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；BIS-Tris, ammonium acetate, PEG 3350, benzamidine
分辨率 1.55 Å R-free 0.184
8F1G Crystal structure of human WDR5 in complex with compound WM662 提交 2022-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 X8N (2S)-2-({(2S)-3-(3'-chloro[1,1'-biphenyl]-4-yl)-1-oxo-1-[(1H-tetrazol-5-yl)amino]propan-2-yl}oxy)propanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH=7.4, 25 mM ammonium sulfate, 24% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.14 Å R-free 0.249
8F1G Crystal structure of human WDR5 in complex with compound WM662 提交 2022-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 X8N (2S)-2-({(2S)-3-(3'-chloro[1,1'-biphenyl]-4-yl)-1-oxo-1-[(1H-tetrazol-5-yl)amino]propan-2-yl}oxy)propanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH=7.4, 25 mM ammonium sulfate, 24% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.14 Å R-free 0.249
8F93 WDR5 covalently modified at Y228 by (R)-2-SF 提交 2022-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
链 B 22–334（313 aa）
未记录 XKN 3-ethynyl-5-{[(3R)-4-{1-[(2-methoxyphenyl)methyl]-1H-benzimidazole-5-carbonyl}-3-methylpiperazin-1-yl]methyl}benzene-1-sulfonyl fluoride × 2 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.5, 20% w/v PEG 8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.253
8F93 WDR5 covalently modified at Y228 by (R)-2-SF 提交 2022-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
链 B 22–334（313 aa）
未记录 XKN 3-ethynyl-5-{[(3R)-4-{1-[(2-methoxyphenyl)methyl]-1H-benzimidazole-5-carbonyl}-3-methylpiperazin-1-yl]methyl}benzene-1-sulfonyl fluoride × 2 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.5, 20% w/v PEG 8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.253
8G3C Crystal structure of human WDR5 in complex with N-[(2'-cyano[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]-3-hydroxy-6-methyl-4-oxo-4H-pyran-2-carboxamide (compound 1, WDR5-MYC PPI inhibitor) 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 YJN N-[(2'-cyano[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]-3-hydroxy-6-methyl-4-oxo-4H-pyran-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20% PEG3350, 0.2 M potassium acetate
分辨率 1.80 Å R-free 0.224
8G3E Crystal structure of human WDR5 in complex with (1M)-N-[(3,5-difluoro[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]-6-methyl-4-oxo-1-(pyridin-3-yl)-1,4-dihydropyridazine-3-carboxamide (compound 2, WDR5-MYC inhibitor) 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 YJR (1M)-N-[(3,5-difluoro[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]-6-methyl-4-oxo-1-(pyridin-3-yl)-1,4-dihydropyridazine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；23.5% PEG3350, 0.21 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5
分辨率 1.33 Å R-free 0.170
8G3E Crystal structure of human WDR5 in complex with (1M)-N-[(3,5-difluoro[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]-6-methyl-4-oxo-1-(pyridin-3-yl)-1,4-dihydropyridazine-3-carboxamide (compound 2, WDR5-MYC inhibitor) 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 YJR (1M)-N-[(3,5-difluoro[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]-6-methyl-4-oxo-1-(pyridin-3-yl)-1,4-dihydropyridazine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；23.5% PEG3350, 0.21 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5
分辨率 1.33 Å R-free 0.170
8HMX WDR5 in complex with histone H3Q5his peptide 提交 2022-12-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 31–334（304 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.5), 22% polyethylene glycol (PEG) 3350, and 0.1% n-Octyl-beta-D-glucoside
分辨率 1.70 Å R-free 0.193
8Q1N Cyclic peptide binder of the WBM-site of WDR5 提交 2023-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M Li3-Citrate, 20 w/v% PEG3350
分辨率 1.84 Å R-free 0.243
8Q1N Cyclic peptide binder of the WBM-site of WDR5 提交 2023-08-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M Li3-Citrate, 20 w/v% PEG3350
分辨率 1.84 Å R-free 0.243
8T5I Crystal structure of human WDR5 in complex with MR4397 提交 2023-06-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 ZHF N-[(2S)-1-(6,7-dihydrothieno[3,2-c]pyridin-5(4H)-yl)-1-oxopentan-2-yl]-3-[(1H-imidazol-1-yl)methyl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% PEG3350, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1M BTP pH 7.0
分辨率 1.70 Å R-free 0.232
8T5I Crystal structure of human WDR5 in complex with MR4397 提交 2023-06-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 ZHF N-[(2S)-1-(6,7-dihydrothieno[3,2-c]pyridin-5(4H)-yl)-1-oxopentan-2-yl]-3-[(1H-imidazol-1-yl)methyl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% PEG3350, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1M BTP pH 7.0
分辨率 1.70 Å R-free 0.232
8UJY Crystal structure of human WD repeat-containing protein 5 in complex with 4-(3,5-dimethoxybenzyl)-9-(4-fluoro-2-methylphenyl)-7-((2-imino-3-methyl-2,3-dihydro-1H-imidazol-1-yl)methyl)-3,4-dihydrobenzo[f][1,4]oxazepin-5(2H)-one (compound 8) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
链 B 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 VV3 (9P)-4-[(3,5-dimethoxyphenyl)methyl]-9-(4-fluoro-2-methylphenyl)-7-{[(2E)-2-imino-3-methyl-2,3-dihydro-1H-imidazol-1-yl]methyl}-3,4-dihydro-1,4-benzoxazepin-5(2H)-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Bis-Tris pH 7.0, 0.2 M ammonium acetate, 25% PEG3350
分辨率 2.01 Å R-free 0.232
8WXQ Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing MBD3C 提交 2023-10-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 18% PEG 600
分辨率 1.90 Å R-free 0.209
8WXQ Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing MBD3C 提交 2023-10-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 18% PEG 600
分辨率 1.90 Å R-free 0.209
8WXR Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing MBD3C F47A 提交 2023-10-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M potassium dihydrogen phosphate, 20% PEG 3350
分辨率 2.08 Å R-free 0.199
8WXR Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing MBD3C F47A 提交 2023-10-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M potassium dihydrogen phosphate, 20% PEG 3350
分辨率 2.08 Å R-free 0.199
8WXT Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing MBD3C R45E/V46G 提交 2023-10-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.2 M imidazole malate, pH 5.5, 33% PEG 600
分辨率 1.83 Å R-free 0.179
8WXU Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing MBD3C C44S/R45E/V46G 提交 2023-10-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M lithium chloride, 20% PEG 3350
分辨率 2.37 Å R-free 0.233
8WXV Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing SET1B 提交 2023-10-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 25% PEG 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.205
8WXV Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing SET1B 提交 2023-10-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 25% PEG 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.205
8WXX Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing SET1B E1750R/G1751V 提交 2023-10-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.5, 16% PEG 4000, 10% 2-propanol
分辨率 2.10 Å R-free 0.212
8WXX Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing SET1B E1750R/G1751V 提交 2023-10-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.5, 16% PEG 4000, 10% 2-propanol
分辨率 2.10 Å R-free 0.212
8X3R Crystal structure of human WDR5 in complex with WDR5 提交 2023-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–334（334 aa）
链 B 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M magnesium formate dihydrate, 15% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 1.76 Å R-free 0.205
8X3S Crystal structure of human WDR5 in complex with PTEN 提交 2023-11-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–334（314 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M HEPES at pH 7.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 1.87 Å R-free 0.259
9B9H Crystal structure of the ternary complex of DCAF1 and WDR5 with PROTAC, OICR-40333 提交 2024-04-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 A1AM2 N-{(1P)-5'-({(17E)-18-[(3P)-4-{[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]carbamoyl}-3-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrol-2-yl]-16-oxo-3,6,9,12-tetraoxa-15-azaoctadec-17-en-1-yl}carbamoyl)-2'-fluoro-4-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；5% w/v 1-ethyl-3-methylimidazolium ethyl sulfate, 15% w/v polyethylene glycol 20,000, pH 7.9
分辨率 2.06 Å R-free 0.229
9B9T Crystal structure of the ternary complex of DCAF1 and WDR5 with PROTAC, OICR-40407 提交 2024-04-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 A1ANM N-{(1P)-5'-[(17-{(4P)-4-[(2P)-4-{[(1R)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]carbamoyl}-3-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrol-2-yl]-1H-pyrazol-1-yl}-16-oxo-3,6,9,12-tetraoxa-15-azaheptadecan-1-yl)carbamoyl]-2'-fluoro-4-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.1 M sodium acetate trihydrate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate
分辨率 2.05 Å R-free 0.196
9B9W Crystal structure of the ternary complex of DCAF1 and WDR5 with PROTAC, OICR-40792 提交 2024-04-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 A1ANN (4P)-N-[(1R)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-[(25E)-1-{(1P)-6-fluoro-3'-[4-fluoro-2-(trifluoromethyl)benzamido]-4'-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1,24-dioxo-5,8,11,14,17,20-hexaoxa-2,23-diazahexacos-25-en-26-yl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；35% v/v tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.92 Å R-free 0.183
9D5Z Crystal structure of the human WDR5 in complex with LH168 compound 提交 2024-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 A1A16 (3P)-N-[(2S)-1-(6,7-dihydrothieno[3,2-c]pyridin-5(4H)-yl)-1-oxopentan-2-yl]-3-[1-ethyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]-5-[(1H-imidazol-1-yl)methyl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350, 0.2 M Ammonium formate
分辨率 1.70 Å R-free 0.189
9D5Z Crystal structure of the human WDR5 in complex with LH168 compound 提交 2024-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 24–334（311 aa） 片段：UNP residues 23-334
未记录 A1A16 (3P)-N-[(2S)-1-(6,7-dihydrothieno[3,2-c]pyridin-5(4H)-yl)-1-oxopentan-2-yl]-3-[1-ethyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]-5-[(1H-imidazol-1-yl)methyl]benzamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG3350, 0.2 M Ammonium formate
分辨率 1.70 Å R-free 0.189
9DLW Crystal structure of the ternary complex of DCAF1 and WDR5 with PROTAC, OICR-41114 提交 2024-09-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 A1BAF N-{(1P)-5'-({(32E)-33-[(3P)-4-{[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]carbamoyl}-3-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrol-2-yl]-31-oxo-3,6,9,12,15,18,21,24,27-nonaoxa-30-azatritriacont-32-en-1-yl}carbamoyl)-2'-fluoro-4-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；294 K；1.8 M Sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic / pH 6.9
分辨率 2.07 Å R-free 0.242
9IY5 WDR5 inhibitor complex 提交 2024-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；Bis-tris pH 5.5 25% PEG 4000
分辨率 1.80 Å R-free 0.255
9IY5 WDR5 inhibitor complex 提交 2024-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；Bis-tris pH 5.5 25% PEG 4000
分辨率 1.80 Å R-free 0.255
9J20 Structure of WDR5 in complex with KIF2A 提交 2024-08-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES (pH 7.5) and 18% PEG 600
分辨率 1.85 Å R-free 0.206
9J20 Structure of WDR5 in complex with KIF2A 提交 2024-08-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M HEPES (pH 7.5) and 18% PEG 600
分辨率 1.85 Å R-free 0.206
9JWV Structure of WDR5 Y191F in complex with WIN motif containing Kif2A 提交 2024-10-10 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
突变：Y191F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 18% PEG 600
分辨率 1.80 Å R-free 0.211
9JWV Structure of WDR5 Y191F in complex with WIN motif containing Kif2A 提交 2024-10-10 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
突变：Y191F 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M HEPES (pH 7.5), 18% PEG 600
分辨率 1.80 Å R-free 0.211
9KD4 Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing Kif2A 114-120 提交 2024-11-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium acetate pH=4, 15% PEG 4000
分辨率 1.64 Å R-free 0.204
9KD4 Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing Kif2A 114-120 提交 2024-11-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium acetate pH=4, 15% PEG 4000
分辨率 1.64 Å R-free 0.204
9KD5 Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing Kif2A S121G 提交 2024-11-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M imidazole malate, pH=5.5, 24% PEG 600
分辨率 1.80 Å R-free 0.216
9KD5 Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing Kif2A S121G 提交 2024-11-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M imidazole malate, pH=5.5, 24% PEG 600
分辨率 1.80 Å R-free 0.216
9KFM Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing EMBOW 提交 2024-11-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 5.5, 25% (w/v) PEG 4000
分辨率 1.80 Å R-free 0.201
9KFM Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing EMBOW 提交 2024-11-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 5.5, 25% (w/v) PEG 4000
分辨率 1.80 Å R-free 0.201
9KFN Structure of WDR5 in complex with mutated EMBOW T3V 提交 2024-11-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M imidazole malate, pH 8.5, 12.5 % (w/v) PEG 10000.
分辨率 2.80 Å R-free 0.241
9KFO Structure of WDR5 in complex with mutated EMBOW 提交 2024-11-06 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium HEPES, pH 7.0, 15 % (w/v) PEG 4000.
分辨率 2.20 Å R-free 0.190
9KQS Crystal structure of WDR5 in complex with peptide MRTEPRPPAP of EMBOW 提交 2024-11-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291.15 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.72 Å R-free 0.210
9L0T Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing RBM15 提交 2024-12-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M imidazole malate, pH 6.0, and 15 % (w/v) PEG 4000
分辨率 2.05 Å R-free 0.245
9L0T Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing RBM15 提交 2024-12-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M imidazole malate, pH 6.0, and 15 % (w/v) PEG 4000
分辨率 2.05 Å R-free 0.245
9L0V Structure of WDR5 in complex with WIN motif containing ZSCAN10 提交 2024-12-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M sodium citrate, pH 4.5, and 20 % (w/v) PEG 4000
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
9LWY Crystal structure of human WDR5 in complex with compound 4 提交 2025-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 A1EMB 4-[[2-(6-fluoranyl-2-methyl-pyridin-3-yl)-6-(5-methyl-1,3-thiazol-2-yl)pyridin-4-yl]methyl]-1-methyl-imidazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG3350, Bis-Tris, ammonium acetate
分辨率 1.55 Å R-free 0.191
9NCT Crystal Structure of WDR5 in complex with Triazole-Based Inhibitors 提交 2025-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 A1BW7 4-({6-cyclopropyl-8-[(2-methyl-1H-imidazol-1-yl)methyl]-4,5-dihydro-3H-naphtho[1,2-d][1,2,3]triazol-3-yl}methyl)-2-methoxybenzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；Ammonium Acetate, PEG 3350, Bis-TRS, TRIS, or HEPES
分辨率 2.11 Å R-free 0.228
9NCT Crystal Structure of WDR5 in complex with Triazole-Based Inhibitors 提交 2025-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 A1BW7 4-({6-cyclopropyl-8-[(2-methyl-1H-imidazol-1-yl)methyl]-4,5-dihydro-3H-naphtho[1,2-d][1,2,3]triazol-3-yl}methyl)-2-methoxybenzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；Ammonium Acetate, PEG 3350, Bis-TRS, TRIS, or HEPES
分辨率 2.11 Å R-free 0.228
9NCV Crystal Structure of WDR5 in complex with Triazole-Based Inhibitors 提交 2025-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 A1BW8 (6P)-6-[1-ethyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]-3-[(4-fluoro-3-methylphenyl)methyl]-8-[(2-methyl-1H-imidazol-1-yl)methyl]-4,5-dihydro-3H-naphtho[1,2-d][1,2,3]triazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；ammonium acetate, PEG3350, Bis-TRIS, TRIS, HEPES
分辨率 1.58 Å R-free 0.287
9NCV Crystal Structure of WDR5 in complex with Triazole-Based Inhibitors 提交 2025-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 A1BW8 (6P)-6-[1-ethyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]-3-[(4-fluoro-3-methylphenyl)methyl]-8-[(2-methyl-1H-imidazol-1-yl)methyl]-4,5-dihydro-3H-naphtho[1,2-d][1,2,3]triazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；ammonium acetate, PEG3350, Bis-TRIS, TRIS, HEPES
分辨率 1.58 Å R-free 0.287
9NCV Crystal Structure of WDR5 in complex with Triazole-Based Inhibitors 提交 2025-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 22–334（313 aa）
未记录 A1BW8 (6P)-6-[1-ethyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]-3-[(4-fluoro-3-methylphenyl)methyl]-8-[(2-methyl-1H-imidazol-1-yl)methyl]-4,5-dihydro-3H-naphtho[1,2-d][1,2,3]triazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；ammonium acetate, PEG3350, Bis-TRIS, TRIS, HEPES
分辨率 1.58 Å R-free 0.287
9NCV Crystal Structure of WDR5 in complex with Triazole-Based Inhibitors 提交 2025-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 22–334（313 aa）
未记录 A1BW8 (6P)-6-[1-ethyl-3-(trifluoromethyl)-1H-pyrazol-4-yl]-3-[(4-fluoro-3-methylphenyl)methyl]-8-[(2-methyl-1H-imidazol-1-yl)methyl]-4,5-dihydro-3H-naphtho[1,2-d][1,2,3]triazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；ammonium acetate, PEG3350, Bis-TRIS, TRIS, HEPES
分辨率 1.58 Å R-free 0.287
9NCW Crystal Structure of WDR5 in complex with Triazole-Based Inhibitors 提交 2025-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 A1BW9 1-{[(6P)-3-[(3,5-dimethoxyphenyl)methyl]-6-(4-fluoro-2-methylphenyl)-4,5-dihydro-3H-naphtho[1,2-d][1,2,3]triazol-8-yl]methyl}-3-methyl-1,3-dihydro-2H-imidazol-2-imine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；ammonium acetate, PEG 3350, Bis-TRIS, HEPES, TRIS
分辨率 1.58 Å R-free 0.275
9NCW Crystal Structure of WDR5 in complex with Triazole-Based Inhibitors 提交 2025-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 A1BW9 1-{[(6P)-3-[(3,5-dimethoxyphenyl)methyl]-6-(4-fluoro-2-methylphenyl)-4,5-dihydro-3H-naphtho[1,2-d][1,2,3]triazol-8-yl]methyl}-3-methyl-1,3-dihydro-2H-imidazol-2-imine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；ammonium acetate, PEG 3350, Bis-TRIS, HEPES, TRIS
分辨率 1.58 Å R-free 0.275
9NCW Crystal Structure of WDR5 in complex with Triazole-Based Inhibitors 提交 2025-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；ammonium acetate, PEG 3350, Bis-TRIS, HEPES, TRIS
分辨率 1.58 Å R-free 0.275
9NCW Crystal Structure of WDR5 in complex with Triazole-Based Inhibitors 提交 2025-02-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；ammonium acetate, PEG 3350, Bis-TRIS, HEPES, TRIS
分辨率 1.58 Å R-free 0.275
9NSN Crystal structure of the ternary complex of DCAF1 and WDR5 with PROTAC, OICR-41059 提交 2025-03-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 A1B0X N-{(1P)-5'-({(26E)-27-[(3P)-4-{[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]carbamoyl}-3-(4-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrrol-2-yl]-25-oxo-3,6,9,12,15,18,21-heptaoxa-24-azaheptacos-26-en-1-yl}carbamoyl)-2'-fluoro-4-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-6-oxo-4-(trifluoromethyl)-5,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；0.15 M cesium chloride, 15% PEG3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.234
9NSO Crystal structure of the ternary complex of DCAF1 and WDR5 with PROTAC, OICR-41060 提交 2025-03-17 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 A1B0Y (4P)-N-[(1S)-3-amino-1-(3-chloro-4-fluorophenyl)-3-oxopropyl]-4-(4-chloro-2-fluorophenyl)-5-[(34E)-1-{(1P)-6-fluoro-3'-[4-fluoro-2-(trifluoromethyl)benzamido]-4'-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1,33-dioxo-5,8,11,14,17,20,23,26,29-nonaoxa-2,32-diazapentatriacont-34-en-35-yl]-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 4.2, 0.4 M potassium phosphate dibasic, 1.6 M sodium phosphate monobasic monohydrate
分辨率 1.85 Å R-free 0.218
9UJR Crystal structure of WDR5 in complex with peptide Ac-MRT-NH2 提交 2025-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 30% v/v Jeffamine ED-2001 pH 7.0
分辨率 2.25 Å R-free 0.235
9UJZ Crystal structure of WDR5 in complex with peptide Ac-MRTEPRP-NH2 提交 2025-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 30% v/v Jeffamine ED-2001 pH 7.0
分辨率 2.46 Å R-free 0.229
9UK1 Crystal structure of WDR5 in complex with EMBOW 提交 2025-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Sodium tartrate dibasic dihydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350, pH7.3
分辨率 2.02 Å R-free 0.226
9UK3 Crystal structure of WDR5 in complex with peptide Ac-MRTEPRPPAP-NH2 提交 2025-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.69 Å R-free 0.200
9UK4 Crystal structure of WDR5 in complex with peptide Ac-ARA-NH2 提交 2025-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 30% v/v Jeffamine ED-2001 pH 7.0
分辨率 2.12 Å R-free 0.242
9UK7 Crystal structure of WDR5 in complex with peptide Ac-MRTEP-NH2 提交 2025-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.95 Å R-free 0.237
9UK7 Crystal structure of WDR5 in complex with peptide Ac-MRTEP-NH2 提交 2025-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.95 Å R-free 0.237
9UK7 Crystal structure of WDR5 in complex with peptide Ac-MRTEP-NH2 提交 2025-04-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 22–334（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.95 Å R-free 0.237
9UOJ WDR5 bound with P3 提交 2025-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–334（314 aa）
未记录 A1L9J ~{N}-[5-[2-fluoranyl-5-[4-[[4-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,1,3-benzoxadiazol-7-yl]amino]butylcarbamoyl]phenyl]-2-[(3~{R},5~{S})-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl]phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-1~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；30% (w/v) polyethylene glycol 5000, 0.2 M ammonium sulfate, and 0.1 M MES monohydrate (pH 6.5)
分辨率 1.82 Å R-free 0.254
9UXG Structure of WDR5 in complex with Peptide 2 提交 2025-05-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Sodium iodide, 0.1M Bis-tris propane pH 7.5, 20% w/v PEG 3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.243
9UXJ Structure of WDR5 in complex with Peptide 2_R4A 提交 2025-05-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M imidazole malate (pH 7.0), and 25 % w/v PEG 4000
分辨率 1.76 Å R-free 0.225
9UXM Structure of WDR5 in complex with Peptide 1 提交 2025-05-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M sodium fluoride, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.48 Å R-free 0.193
9VN5 Structure of WDR5 in complex with MBD3C R43K 提交 2025-06-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M imidazole malate (pH 8.5) and 7.5% w/v PEG 10,000
分辨率 1.90 Å R-free 0.231
9VN5 Structure of WDR5 in complex with MBD3C R43K 提交 2025-06-30 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 24–334（311 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M imidazole malate (pH 8.5) and 7.5% w/v PEG 10,000
分辨率 1.90 Å R-free 0.231
9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric
链 R 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å
9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric
链 R 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.63 Å
9YLY MLL4FC bound to a nucleosome with p53 RE 提交 2025-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 R 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.77 Å
9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 R 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.43 Å
9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 R 1–334（334 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.45 Å

共 198 个其他 PDB 条目、294 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 WDR5_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 19–329； UniProt 24–334

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9ba2

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9ba2
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9ba2
沉积日期 deposition_date2024-04-03
结构标题 titleCrystal structure of the binary complex of DCAF1 and WDR5
关键词 keywordsE3 ligase, adaptor, PROTAC, WDR, ternary complex, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier27.69 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron27.17 Å
零角强度 I(0) i076561000.00
分子量 molecular_weight68238.0 kDa
排除体积 excluded_volume85222 ų
包络体积 envelope_volume101330 ų
水化壳体积 shell_volume31405 ų
包络直径 envelope_diameter88.4 Å
壳层 Rg shell_rg34.32 Å
包络 Rg envelope_rg26.96 Å
形状 Rg shape_rg27.17 Å
总 Rg total_rg27.89 Å
总原子数 total_atoms4804
残基数 n_residues611
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax86.5 Å
Rg (实空间) rg_real27.69 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.48 Å
I(0) (实空间) i0_real7.6560e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.0080e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal27.69 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal76560000.0000
解质量估计 total_estimate0.9027
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary30.4 Å
偏度 Skewness skewness0.317
峰度 Kurtosis kurtosis-0.546
角度范围 angular_range— – 0.2850 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha15600000.0000
实空间数据点数 n_real_points58
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.933; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.937
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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8. 引用文献 (2)

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9. 文件与曲线 (10)