9o2z

Autoinhibited BRAF:(14-3-3)2:MEK complex from Insect cells

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 119.7 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase B-raf

Homo sapiens

UniProt P15056

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–766 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 × 1 (Q02750) 14-3-3 protein zeta/delta × 2 (P63104) ZN ZINC ION × 2 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.83 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 122 个其他 PDB 条目、190 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BRAF_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–766; UniProt 1–766

Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1

Homo sapiens

UniProt Q02750

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–393 未记录 Serine/threonine-protein kinase B-raf × 1 (P15056) 14-3-3 protein zeta/delta × 2 (P63104) ZN ZINC ION × 2 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.83 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 92 个其他 PDB 条目、122 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MP2K1_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–393; UniProt 1–393

14-3-3 protein zeta/delta

Homo sapiens

UniProt P63104

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–245 链 D; UniProt 1–245 未记录 Serine/threonine-protein kinase B-raf × 1 (P15056) Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 × 1 (Q02750) ZN ZINC ION × 2 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.83 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 73 个其他 PDB 条目、88 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 1433Z_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–245; UniProt 1–245 作者链 D; PDB构建体 1–245; UniProt 1–245

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9o2z

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9o2z
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9o2z
沉积日期 deposition_date2025-04-04
结构标题 titleAutoinhibited BRAF:(14-3-3)2:MEK complex from Insect cells
关键词 keywords;B-Raf, MEK, 14-3-3, B-Raf complex, B-Raf monomer, Inactive B-Raf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, RBD, signaling protein, SIGNALING PROTEIN-TRANSFERASE complex ;; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier36.55
回转半径 Rg (电子) rg_electron36.15
零角强度 I(0) i0258253000.00
分子量 molecular_weight130250.0 kDa
排除体积 excluded_volume163350 ų
包络体积 envelope_volume214310 ų
水化壳体积 shell_volume49984 ų
包络直径 envelope_diameter122.0
壳层 Rg shell_rg42.01
包络 Rg envelope_rg35.66
形状 Rg shape_rg36.17
总 Rg total_rg36.48
总原子数 total_atoms9141
残基数 n_residues1147
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax119.7
Rg (实空间) rg_real36.57
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.80
I(0) (实空间) i0_real2.5830e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.2380e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal36.56
I(0) (倒空间) i0_reciprocal258300000.0000
解质量估计 total_estimate0.8878
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary41.7
偏度 Skewness skewness0.344
峰度 Kurtosis kurtosis-0.453
角度范围 angular_range— – 0.2150 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0002
最高正则化参数 α highest_alpha47830000.0000
实空间数据点数 n_real_points44
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.900; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.980; Smooth: 0.857

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)