← 返回搜索
9ob1

S.c INO80 in complex with Yeast 0/80 nucleosome, Apo State

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 216.7 Å Quality: GOOD
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chromatin-remodeling ATPase INO80

物种未注明

UniProt P53115

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 18 DNA 2 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物数一致 链 Q； UniProt 1–1489 未记录 DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 OTHER 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9OB1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5NBN Crystal structure of the Arp4-N-actin-Arp8-Ino80HSA module of INO80 提交 2017-03-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 462–598（137 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 LAR LATRUNCULIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 18% (w/v) polyethylene glycol 3,350, latrunculin A solved in DMSO molar ration 1:1.5 (protein : latrunculin A)
分辨率 4.00 Å R-free 0.242
5NBN Crystal structure of the Arp4-N-actin-Arp8-Ino80HSA module of INO80 提交 2017-03-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 462–598（137 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 LAR LATRUNCULIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 18% (w/v) polyethylene glycol 3,350, latrunculin A solved in DMSO molar ration 1:1.5 (protein : latrunculin A)
分辨率 4.00 Å R-free 0.242
8A5A Structure of Arp4-Ies4-N-actin-Arp8-Ino80HSA subcomplex (A-module) of INO80 提交 2022-06-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 1–598（598 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8A5O Structure of Arp4-Ies4-N-actin-Arp8-Ino80HSA subcomplex (A-module) of S. cerevisiae INO80 提交 2022-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 1–598（598 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8ETS Class1 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Q 948–1432（485 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.04 Å
8ETU Class2 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Q 948–1432（485 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.80 Å
8ETW Class3 of INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Q 948–1432（485 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.64 Å
8EU9 Class1 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Q 948–1440（493 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.48 Å
8EUF Class2 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Q 1–1489（1489 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.41 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 Q 1–1489（1489 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.91 Å
9C9S S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 1 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 Q 1–1489（1489 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.09 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 Q 1–1489（1489 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.16 Å
9C9Z S.c INO80 in complex with Xenopus 0/80 nucleosome, INO80 Core 提交 2024-06-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Q 1–1489（1489 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.55 Å
9CAN S.c INO80 in complex with Xenopus 0/40 nucleosome 提交 2024-06-17 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 Q 1–1489（1489 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.30 Å
9CAT DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, INO80 Core Module 提交 2024-06-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Q 1–1489（1489 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.90 Å
9CB7 DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Ino80-Nucleosome 提交 2024-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 Q 1–1489（1489 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.04 Å
9CCD DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, INO80 core module 提交 2024-06-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Q 1–1489（1489 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.01 Å

共 16 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 INO80_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 1–1489； UniProt 1–1489

Actin-related protein 5

物种未注明

UniProt P53946

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 18 DNA 2 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物数一致 链 R； UniProt 1–755 未记录 DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 OTHER 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9OB1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8ETS Class1 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 R 12–755（744 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.04 Å
8ETU Class2 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 R 12–755（744 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.80 Å
8ETW Class3 of INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 R 12–755（744 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.64 Å
8EU9 Class1 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 R 1–755（755 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.48 Å
8EUF Class2 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 R 1–755（755 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.41 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 R 1–755（755 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.91 Å
9C9S S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 1 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 R 1–755（755 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.09 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 R 1–755（755 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.16 Å
9C9Z S.c INO80 in complex with Xenopus 0/80 nucleosome, INO80 Core 提交 2024-06-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 R 1–755（755 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.55 Å
9CAN S.c INO80 in complex with Xenopus 0/40 nucleosome 提交 2024-06-17 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 R 1–755（755 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.30 Å
9CAT DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, INO80 Core Module 提交 2024-06-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 R 1–755（755 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.90 Å
9CCD DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, INO80 core module 提交 2024-06-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 R 1–755（755 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.01 Å

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARP5_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 R； PDB构建体 1–755； UniProt 1–755

Chromatin-remodeling complex subunit IES6

物种未注明

UniProt P32617

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 18 DNA 2 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物数一致 链 S； UniProt 1–166 未记录 DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 OTHER 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9OB1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8ETS Class1 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 S 28–166（139 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.04 Å
8ETU Class2 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 S 28–166（139 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.80 Å
8ETW Class3 of INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 S 28–166（139 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.64 Å
8EU9 Class1 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 S 28–162（135 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.48 Å
8EUF Class2 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 S 1–166（166 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.41 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 S 1–166（166 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.91 Å
9C9S S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 1 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 S 1–166（166 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.09 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 S 1–166（166 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.16 Å
9C9Z S.c INO80 in complex with Xenopus 0/80 nucleosome, INO80 Core 提交 2024-06-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 S 1–166（166 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.55 Å
9CAN S.c INO80 in complex with Xenopus 0/40 nucleosome 提交 2024-06-17 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 S 1–166（166 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.30 Å
9CAT DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, INO80 Core Module 提交 2024-06-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 S 1–166（166 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.90 Å
9CCD DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, INO80 core module 提交 2024-06-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 S 1–166（166 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.01 Å

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IES6_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 S； PDB构建体 1–166； UniProt 1–166

RuvB-like protein 1

物种未注明

UniProt Q03940

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 18 DNA 2 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物数一致 链 T； UniProt 1–463 链 V； UniProt 1–463 链 X； UniProt 1–463 未记录 DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 OTHER 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9OB1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6GEJ Chromatin remodeller-nucleosome complex at 3.6 A resolution. 提交 2018-04-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GEN Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution. 提交 2018-04-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8ETS Class1 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 T 21–463（443 aa）
链 V 21–463（443 aa）
链 X 21–463（443 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.04 Å
8ETU Class2 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 T 21–463（443 aa）
链 V 21–463（443 aa）
链 X 21–463（443 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.80 Å
8ETW Class3 of INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 T 21–463（443 aa）
链 V 21–463（443 aa）
链 X 21–463（443 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.64 Å
8EU9 Class1 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 T 21–463（443 aa）
链 V 21–463（443 aa）
链 X 21–463（443 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.48 Å
8EUF Class2 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.41 Å
8QKU SWR1-nucleosome complex in configuration 1 提交 2023-09-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8QKV SWR1-nucleosome complex in configuration 2 提交 2023-09-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8QYV SWR1-hexasome complex 提交 2023-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QZ0 SWR1-hexasome-dimer complex 提交 2023-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.91 Å
9C9S S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 1 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.09 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.16 Å
9C9Z S.c INO80 in complex with Xenopus 0/80 nucleosome, INO80 Core 提交 2024-06-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.55 Å
9CAN S.c INO80 in complex with Xenopus 0/40 nucleosome 提交 2024-06-17 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.30 Å
9CAT DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, INO80 Core Module 提交 2024-06-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.90 Å
9CCD DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, INO80 core module 提交 2024-06-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.01 Å
9FBW SWR1 lacking Swc5 subunit in complex with hexasome 提交 2024-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 T 1–463（463 aa）
链 V 1–463（463 aa）
链 X 1–463（463 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RUVB1_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 T； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463 作者链 V； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463 作者链 X； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463

RuvB-like protein 2

物种未注明

UniProt Q12464

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 18 DNA 2 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物数一致 链 U； UniProt 1–471 链 W； UniProt 1–471 链 Y； UniProt 1–471 未记录 DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 OTHER 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9OB1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5OUN NMR solution structure of the external DII domain of Rvb2 from Saccharomyces cerevisiae 提交 2017-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 132–234（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] Rvb2DII, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
6GEJ Chromatin remodeller-nucleosome complex at 3.6 A resolution. 提交 2018-04-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 U 1–471（471 aa）
链 W 1–471（471 aa）
链 Y 1–471（471 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GEN Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution. 提交 2018-04-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 U 1–471（471 aa）
链 W 1–471（471 aa）
链 Y 1–471（471 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8ETS Class1 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 U 15–471（457 aa）
链 W 15–471（457 aa）
链 Y 15–471（457 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.04 Å
8ETU Class2 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 U 15–471（457 aa）
链 W 15–471（457 aa）
链 Y 15–471（457 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.80 Å
8ETW Class3 of INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 U 15–471（457 aa）
链 W 15–471（457 aa）
链 Y 15–471（457 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.64 Å
8EU9 Class1 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 U 15–460（446 aa）
链 W 15–460（446 aa）
链 Y 15–460（446 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.48 Å
8EUF Class2 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 U 1–460（460 aa）
链 W 1–460（460 aa）
链 Y 1–460（460 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.41 Å
8QKU SWR1-nucleosome complex in configuration 1 提交 2023-09-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 U 1–471（471 aa）
链 W 1–471（471 aa）
链 Y 1–471（471 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8QKV SWR1-nucleosome complex in configuration 2 提交 2023-09-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 U 1–471（471 aa）
链 W 1–471（471 aa）
链 Y 1–471（471 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8QYV SWR1-hexasome complex 提交 2023-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 U 1–471（471 aa）
链 W 1–471（471 aa）
链 Y 1–471（471 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QZ0 SWR1-hexasome-dimer complex 提交 2023-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 U 1–471（471 aa）
链 W 1–471（471 aa）
链 Y 1–471（471 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9B1D Cryo-EM structure of native SWR1 bound to DNA (composite structure) 提交 2024-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 F 1–471（471 aa）
链 H 1–471（471 aa）
链 J 1–471（471 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES pH 7.6, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 0.01% IGEPAL CA-630, 3.5% glycerol, and 0.25 mM TCEP, 1 mM ATP-gamma-s, 0.05% glutaraldehyde.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；6 second blot time and blot force of 12.
分辨率 3.30 Å
9B1E Cryo-EM structure of native SWR1 bound to nucleosome (composite structure) 提交 2024-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 F 1–471（471 aa）
链 H 1–471（471 aa）
链 J 1–471（471 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；80 nM SWR1, 160 nM nucleosomes, 1 mM ADP, 10 mM NaF, 8 mM BeCl2, 0.05% glutaraldehyde, 20 mM HEPES-KOH pH 7.6, 1.5 mM MgCl2, 0.25 mM TCEP, 0.01% IGEPAL CA-630, 1% glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 second blot time and blot force of 10.
分辨率 4.40 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 U 1–471（471 aa）
链 W 1–471（471 aa）
链 Y 1–471（471 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.91 Å
9C9S S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 1 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 U 1–471（471 aa）
链 W 1–471（471 aa）
链 Y 1–471（471 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.09 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15 构建体不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 U 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
链 W 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
链 Y 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.16 Å
9C9Z S.c INO80 in complex with Xenopus 0/80 nucleosome, INO80 Core 提交 2024-06-16 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 U 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
链 W 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
链 Y 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.55 Å
9CAN S.c INO80 in complex with Xenopus 0/40 nucleosome 提交 2024-06-17 构建体不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 U 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
链 W 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
链 Y 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.30 Å
9CAT DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, INO80 Core Module 提交 2024-06-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 U 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
链 W 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
链 Y 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.90 Å
9CCD DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, INO80 core module 提交 2024-06-21 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 U 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
链 W 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
链 Y 1–460（460 aa） 片段：residues 1-460
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.01 Å
9FBW SWR1 lacking Swc5 subunit in complex with hexasome 提交 2024-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 U 1–471（471 aa）
链 W 1–471（471 aa）
链 Y 1–471（471 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å

共 22 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RUVB2_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 U； PDB构建体 1–471； UniProt 1–471 作者链 W； PDB构建体 1–471； UniProt 1–471 作者链 Y； PDB构建体 1–471； UniProt 1–471

Ino eighty subunit 2

物种未注明

UniProt P40154

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 18 DNA 2 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物数一致 链 Z； UniProt 1–320 未记录 DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 OTHER 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9OB1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8ETS Class1 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Z 293–320（28 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.04 Å
8ETU Class2 of the INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Z 293–320（28 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.80 Å
8ETW Class3 of INO80-Hexasome complex 提交 2022-10-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Z 293–320（28 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.64 Å
8EU9 Class1 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Z 293–320（28 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.48 Å
8EUF Class2 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Z 1–320（320 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.41 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 Z 1–320（320 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.91 Å
9C9S S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 1 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 Z 1–320（320 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.09 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 Z 1–320（320 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.16 Å
9C9Z S.c INO80 in complex with Xenopus 0/80 nucleosome, INO80 Core 提交 2024-06-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Z 1–320（320 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.55 Å
9CAN S.c INO80 in complex with Xenopus 0/40 nucleosome 提交 2024-06-17 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 Z 1–320（320 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.30 Å
9CAT DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, INO80 Core Module 提交 2024-06-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Z 1–320（320 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.90 Å
9CB7 DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Ino80-Nucleosome 提交 2024-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 Z 1–320（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.04 Å
9CCD DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, INO80 core module 提交 2024-06-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Z 1–320（320 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.01 Å

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 IES2_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 Z； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320

Histone H3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P61830

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 18 DNA 2 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 1–136 链 E； UniProt 1–136 未记录 DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 OTHER 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9OB1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1ID3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE YEAST NUCLEOSOME CORE PARTICLE REVEALS FUNDAMENTAL DIFFERENCES IN INTER-NUCLEOSOME INTERACTIONS 提交 2001-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–135（135 aa）
链 E 1–135（135 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, Potassium chloride, cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 3.10 Å R-free 0.292
1QSN CRYSTAL STRUCTURE OF TETRAHYMENA GCN5 WITH BOUND COENZYME A AND HISTONE H3 PEPTIDE 提交 1999-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 10–20（11 aa） 片段：11 MER PEPTIDE (RESIDUES 9 - 19)
未记录 COA COENZYME A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；TRIS, AMMONIUM SULFATE, MANGANESE CHLORIDE, pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.00K
分辨率 2.20 Å R-free 0.266
2H2G The Structural Basis of Sirtuin substrate affinity 提交 2006-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 113–123（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；293.15 K；20% PEG, pH 9.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 7.5, temperature 293.15K
分辨率 1.63 Å R-free 0.226
2H2G The Structural Basis of Sirtuin substrate affinity 提交 2006-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 113–123（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；293.15 K；20% PEG, pH 9.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 7.5, temperature 293.15K
分辨率 1.63 Å R-free 0.226
2IDC Structure of the Histone H3-Asf1 Chaperone Interaction 提交 2006-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 122–135（14 aa） 片段：Asf1, residues 2-155 and H3, residues 121-134
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；Tris-HCl, Li2SO4, PEG 4000, glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.20 Å R-free 0.239
2JMJ NMR solution structure of the PHD domain from the yeast YNG1 protein in complex with H3(1-9)K4me3 peptide 提交 2006-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 2–10（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；20 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成 0.52 mM [U-15N] YNG1_PHD, 2.5 mM H3(1-9)K4me3, 2 mM DTT, 50 mM potassium chloride, 20 mM sodium phosphate, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.48 mM [U-13C; U-15N] YNG1_PHD, 2.5 mM H3(1-9)K4me3, 2 mM DTT, 50 mM potassium chloride, 20 mM sodium phosphate, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2RNW The Structural Basis for Site-Specific Lysine-Acetylated Histone Recognition by the Bromodomains of the Human Transcriptional Co-Activators PCAf and CBP 提交 2008-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–16（15 aa） 片段：UNP residues 2-16
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2RNX The Structural Basis for Site-Specific Lysine-Acetylated Histone Recognition by the Bromodomains of the HUman Transcriptional Co-Activators PCAF and CBP 提交 2008-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 32–43（12 aa） 片段：UNP residues 32-43
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] potassium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
3Q33 Structure of the Rtt109-AcCoA/Vps75 Complex and Implications for Chaperone-Mediated Histone Acetylation 提交 2010-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–14（14 aa） 片段：unp residues 1-14
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACO ACETYL COENZYME *A × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；298 K；10.0% (v/v) PEG 8000 8% (v/v) ethylene glycol 100 mM Hepes, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 7.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.255
4JJN Crystal structure of heterochromatin protein Sir3 in complex with a silenced yeast nucleosome 提交 2013-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–136（135 aa）
链 E 2–136（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.05 M sodium cacodylate, 32% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.09 Å R-free 0.255
4KUD Crystal structure of N-terminal acetylated Sir3 BAH domain D205N mutant in complex with yeast nucleosome core particle 提交 2013-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；289 K；16% PEG 400, 0.1M KCl, 0.01M CaCl2, 0.05M sodium citrate(pH4.8), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.20 Å R-free 0.237
4PSX Crystal structure of histone acetyltransferase complex 提交 2014-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 Y 2–16（15 aa） 片段：UNP residues 2-16
未记录 COA COENZYME A × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.2M potassium sodium tartrate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3,350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.51 Å R-free 0.223
4PSX Crystal structure of histone acetyltransferase complex 提交 2014-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 2–16（15 aa） 片段：UNP residues 2-16
未记录 COA COENZYME A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.2M potassium sodium tartrate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3,350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.51 Å R-free 0.223
5ZBA Crystal structure of Rtt109-Asf1-H3-H4-CoA complex 提交 2018-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–136（136 aa）
未记录 COA COENZYME A × 1 IOD IODIDE ION × 37 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；100mM sodium citrate, pH 5.0, 22% PEG 1500, 400mM sodium iodide
分辨率 3.50 Å R-free 0.294
5ZBB Crystal structure of Rtt109-Asf1-H3-H4 complex 提交 2018-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–136（136 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 23 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；100mM sodium citrate, pH 5.0, 22% PEG 1500, 400mM sodium iodide
分辨率 3.60 Å R-free 0.264
6GEJ Chromatin remodeller-nucleosome complex at 3.6 A resolution. 提交 2018-04-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–136（136 aa）
链 B 1–136（136 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GEN Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution. 提交 2018-04-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–136（136 aa）
链 B 1–136（136 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6J2P Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Spp1 in complex with H3K4me3 提交 2019-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2–8（7 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M ammonium sulfate, 20% PEG3350, 0.1 M HEPES ph 7.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.288
6J2P Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Spp1 in complex with H3K4me3 提交 2019-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 2–8（7 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M ammonium sulfate, 20% PEG3350, 0.1 M HEPES ph 7.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.288
6J2P Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Spp1 in complex with H3K4me3 提交 2019-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 2–8（7 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M ammonium sulfate, 20% PEG3350, 0.1 M HEPES ph 7.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.288
6J2P Crystal structure of Saccharomyces cerevisiae Spp1 in complex with H3K4me3 提交 2019-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 2–8（7 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M ammonium sulfate, 20% PEG3350, 0.1 M HEPES ph 7.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.288
6KMJ Crystal structure of Sth1 bromodomain in complex with H3K14Ac 提交 2019-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 7–22（16 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1% w/v tryptone, 1 mM sodium azide, 50 mM HEPES sodium pH 7.0, 20% w/v PEG 3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.188
7E9C Cryo-EM structure of the 1:1 Orc1 BAH domain in complex with nucleosome 提交 2021-03-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 A 1–134（134 aa）
链 E 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7E9F Cryo-EM structure of the 2:1 Orc1 BAH domain in complex with nucleosome 提交 2021-03-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–134（134 aa）
链 E 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7F4A Crystal structure of Taf14 YEATS domain in complex with H3K9bz peptide 提交 2021-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 6–14（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；289 K；48% PEG 600, 0.04M citric acid
分辨率 2.00 Å R-free 0.204
7F4E Crystal structure of Hst2 in complex with H3K9bz peptide 提交 2021-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 6–15（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；25% (w/v) PEG 1500, 0.1M MMT/Sodium hydroxide
分辨率 1.78 Å R-free 0.216
7K7G nucleosome and Gal4 complex 提交 2020-09-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7UQJ Cryo-EM structure of the S. cerevisiae chromatin remodeler Yta7 hexamer bound to ATPgS and histone H3 tail in state II 提交 2022-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–25（25 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；Solution was made fresh and detergent was added to solve preference orientation issue.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot 3S, blot forth 3
分辨率 3.00 Å
7XAY Crystal structure of Hat1-Hat2-Asf1-H3-H4 提交 2022-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 2–136（135 aa）
未记录 COA COENZYME A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；100 mM Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% PEG-3350, and 200 mM sodium nitrate
分辨率 3.30 Å R-free 0.256
7Z0O Structure of transcription factor UAF in complex with TBP and 35S rRNA promoter DNA 提交 2022-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–136（136 aa）
链 C 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8GHN Composite model of the yeast Hir Complex with Asf1/H3/H4 提交 2023-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric
链 M 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
8QKU SWR1-nucleosome complex in configuration 1 提交 2023-09-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–136（136 aa）
链 B 1–136（136 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8QKV SWR1-nucleosome complex in configuration 2 提交 2023-09-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–136（136 aa）
链 B 1–136（136 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8QYV SWR1-hexasome complex 提交 2023-10-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 A 1–136（136 aa）
链 B 1–136（136 aa）
突变：Q120M, K121P, K125Q 突变：Q120M, K121P, K125Q ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QZ0 SWR1-hexasome-dimer complex 提交 2023-10-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 A 1–136（136 aa）
链 B 1–136（136 aa）
突变：Q120M, K121P, K125Q 突变：Q120M, K121P, K125Q ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.91 Å
9C9S S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 1 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.09 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.16 Å
9CAU DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Nucleosome 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.18 Å
9CB7 DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Ino80-Nucleosome 提交 2024-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.04 Å
9FBW SWR1 lacking Swc5 subunit in complex with hexasome 提交 2024-05-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 A 1–136（136 aa）
链 B 1–136（136 aa）
突变：Q120M, K121P, K125Q 突变：Q120M, K121P, K125Q ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
9UUS The NuA3 histone acetyltransferase complex bound to acetyl-CoA and H3 tail 提交 2025-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 H 2–22（21 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ACO ACETYL COENZYME *A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å

共 37 个其他 PDB 条目、42 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H3_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 E； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

Histone H4

Xenopus laevis

UniProt P62798

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 18 DNA 2 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物数一致 链 B； UniProt 1–103 链 F； UniProt 1–103 未记录 DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 OTHER 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9OB1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8EUE Class1 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.48 Å
8EUJ Class2 of the INO80-Nucleosome complex 提交 2022-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.36 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H4_XENBO
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 F； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103

Histone H2A.1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P04911

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 18 DNA 2 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 1–132 链 G； UniProt 1–132 未记录 DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 OTHER 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9OB1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1ID3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE YEAST NUCLEOSOME CORE PARTICLE REVEALS FUNDAMENTAL DIFFERENCES IN INTER-NUCLEOSOME INTERACTIONS 提交 2001-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–131（131 aa）
链 G 1–131（131 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, Potassium chloride, cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 3.10 Å R-free 0.292
3T7K Complex structure of Rtt107p and phosphorylated histone H2A 提交 2011-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 125–132（8 aa） 片段：phosphorylated C-terminal peptide
链 D 125–132（8 aa） 片段：phosphorylated C-terminal peptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；283 K；14%(w/v) PEG 1500, 0.2M NaCl, 0.1M MES, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 2.03 Å R-free 0.258
3T7K Complex structure of Rtt107p and phosphorylated histone H2A 提交 2011-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 125–132（8 aa） 片段：phosphorylated C-terminal peptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；283 K；14%(w/v) PEG 1500, 0.2M NaCl, 0.1M MES, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 2.03 Å R-free 0.258
3T7K Complex structure of Rtt107p and phosphorylated histone H2A 提交 2011-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 125–132（8 aa） 片段：phosphorylated C-terminal peptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；283 K；14%(w/v) PEG 1500, 0.2M NaCl, 0.1M MES, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 2.03 Å R-free 0.258
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–132（132 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–132（132 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
5BT1 histone chaperone Hif1 playing with histone H2A-H2B dimer 提交 2015-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M Magnesium formate dihydrate, 15% PEG3350
分辨率 2.62 Å R-free 0.262
6GEJ Chromatin remodeller-nucleosome complex at 3.6 A resolution. 提交 2018-04-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–132（132 aa）
链 F 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GEN Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution. 提交 2018-04-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–132（132 aa）
链 F 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 g 17–121（105 aa）
链 i 17–118（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
7K78 antibody and nucleosome complex 提交 2020-09-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.10 Å
7K7G nucleosome and Gal4 complex 提交 2020-09-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7SSA Cryo-EM structure of pioneer factor Cbf1 bound to the nucleosome 提交 2021-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 2–132（131 aa）
链 G 2–132（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 c 1–132（132 aa）
链 g 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 c 1–132（132 aa）
链 g 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8QYV SWR1-hexasome complex 提交 2023-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 E 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QZ0 SWR1-hexasome-dimer complex 提交 2023-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 P 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.91 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.16 Å
9CAU DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Nucleosome 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.18 Å
9CB7 DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Ino80-Nucleosome 提交 2024-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.04 Å
9FBW SWR1 lacking Swc5 subunit in complex with hexasome 提交 2024-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 E 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å

共 20 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2A1_YEAST
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 G； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132

Histone H2B.1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P02293

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 18 DNA 2 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–131 链 H； UniProt 1–131 未记录 DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 OTHER 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9OB1 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2JSS NMR structure of chaperone Chz1 complexed with histone H2A.Z-H2B 提交 2007-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 37–131（95 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；308 K；离子强度（mmCIF原始值）200 mM KCl；压力 ambient
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-35%2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1 | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C;U-35%2H]/[U-100% 2H] Chz1/H2A.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100%15N;U-100% 2H] Chz1/H2a.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N;U-100%2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-10% 13C; U-100% 15N]/[U-100% 2H] Chz1/H2A.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 15N;U-100%2H]/[U-30%2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C;U-30%2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-13C; U-15N; U-2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 15N;U-30%2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C;U-35%2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 15N;U-100%2H]/[U-30%2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C;U-35%2H]/[U-100% 2H] Chz1/H2A.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 15N;U-30%2H]/[U-100% 2H] Chz1/H2A.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
分辨率未提供
4KUD Crystal structure of N-terminal acetylated Sir3 BAH domain D205N mutant in complex with yeast nucleosome core particle 提交 2013-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；289 K；16% PEG 400, 0.1M KCl, 0.01M CaCl2, 0.05M sodium citrate(pH4.8), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.20 Å R-free 0.237
4M6B Crystal structure of yeast Swr1-Z domain in complex with H2A.Z-H2B dimer 提交 2013-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 37–131（95 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% (w/v) PEG 2000 MME, 100 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM Calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.220
4M6B Crystal structure of yeast Swr1-Z domain in complex with H2A.Z-H2B dimer 提交 2013-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 37–131（95 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% (w/v) PEG 2000 MME, 100 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM Calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.220
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 31–131（101 aa） 片段：UNP residues 31-131
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 31–131（101 aa） 片段：UNP residues 31-131
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 31–131（101 aa） 片段：UNP residues 31-131
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 31–131（101 aa） 片段：UNP residues 31-131
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
5BT1 histone chaperone Hif1 playing with histone H2A-H2B dimer 提交 2015-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M Magnesium formate dihydrate, 15% PEG3350
分辨率 2.62 Å R-free 0.262
6AE8 Structure insight into histone chaperone Chz1-mediated H2A.Z recognition and replacement 提交 2018-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 37–131（95 aa） 片段：UNP residues 37-131, UNP residues 23-119
未记录 BCN BICINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；Bicine,1,4-Dioxane,PEG 20000
分辨率 1.65 Å R-free 0.216
6AE8 Structure insight into histone chaperone Chz1-mediated H2A.Z recognition and replacement 提交 2018-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 37–131（95 aa） 片段：UNP residues 37-131, UNP residues 23-119
未记录 BCN BICINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；Bicine,1,4-Dioxane,PEG 20000
分辨率 1.65 Å R-free 0.216
6GEJ Chromatin remodeller-nucleosome complex at 3.6 A resolution. 提交 2018-04-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GEN Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution. 提交 2018-04-27 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 h 36–129（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
7K78 antibody and nucleosome complex 提交 2020-09-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.10 Å
7K7G nucleosome and Gal4 complex 提交 2020-09-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7SSA Cryo-EM structure of pioneer factor Cbf1 bound to the nucleosome 提交 2021-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 2–131（130 aa）
链 H 2–131（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 d 1–131（131 aa）
链 h 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 d 1–131（131 aa）
链 h 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8QKU SWR1-nucleosome complex in configuration 1 提交 2023-09-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8QKV SWR1-nucleosome complex in configuration 2 提交 2023-09-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8QYV SWR1-hexasome complex 提交 2023-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 G 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QZ0 SWR1-hexasome-dimer complex 提交 2023-10-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 G 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
突变：S115C ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.91 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.16 Å
9CAU DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Nucleosome 提交 2024-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.18 Å
9CB7 DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Ino80-Nucleosome 提交 2024-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.04 Å
9FBW SWR1 lacking Swc5 subunit in complex with hexasome 提交 2024-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 G 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å

共 23 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2B1_YEAST
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131 作者链 H； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9ob1

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9ob1
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9ob1
沉积日期 deposition_date2025-04-21
结构标题 titleS.c INO80 in complex with Yeast 0/80 nucleosome, Apo State
关键词 keywordsChromatin Remodeler, nucleosome, DNA BINDING PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex; DNA BINDING PROTEIN/DNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier64.19 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron62.70 Å
零角强度 I(0) i05754970000.00
分子量 molecular_weight581310.0 kDa
排除体积 excluded_volume703880 ų
包络体积 envelope_volume1076300 ų
水化壳体积 shell_volume140340 ų
包络直径 envelope_diameter217.9 Å
壳层 Rg shell_rg66.57 Å
包络 Rg envelope_rg61.01 Å
形状 Rg shape_rg62.62 Å
总 Rg total_rg63.03 Å
总原子数 total_atoms40498
残基数 n_residues4704
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax216.7 Å
Rg (实空间) rg_real64.20 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.89 Å
I(0) (实空间) i0_real5.7550e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2470e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal64.14 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal5754000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8627
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary72.2 Å
偏度 Skewness skewness0.301
峰度 Kurtosis kurtosis-0.529
角度范围 angular_range— – 0.1200 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha381000000.0000
实空间数据点数 n_real_points25
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.865; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.620
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

▶

8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)