9rpd

D. melanogaster Augmin TII N-clamp (GST-fusion) bound to a microtubule, well-defined subset of particles

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Augmin complex subunit dgt4

Drosophila melanogaster

UniProt Q9W4M8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 9 Augmin complex subunit dgt6 × 1 (Q9VAP2) Augmin complex subunit msd5,Green fluorescent protein,Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme × 1 (P08515,P42212,Q9W0G6) Tubulin beta chain × 2 (P02554) Tubulin alpha-1A chain × 4 (P02550) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 DGT4_DROME
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–108; UniProt 1–108

Augmin complex subunit dgt6

Drosophila melanogaster

UniProt Q9VAP2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 9 Augmin complex subunit dgt4 × 1 (Q9W4M8) Augmin complex subunit msd5,Green fluorescent protein,Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme × 1 (P08515,P42212,Q9W0G6) Tubulin beta chain × 2 (P02554) Tubulin alpha-1A chain × 4 (P02550) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DGT6_DROME
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–280; UniProt 1–280

Augmin complex subunit msd5,Green fluorescent protein,Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme

Schistosoma japonicum

UniProt P08515

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 9 Augmin complex subunit dgt4 × 1 (Q9W4M8) Augmin complex subunit dgt6 × 1 (Q9VAP2) Tubulin beta chain × 2 (P02554) Tubulin alpha-1A chain × 4 (P02550) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GST26_SCHJA
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 445–662; UniProt 1–218

Augmin complex subunit msd5,Green fluorescent protein,Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme

Schistosoma japonicum

UniProt P42212

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 9 Augmin complex subunit dgt4 × 1 (Q9W4M8) Augmin complex subunit dgt6 × 1 (Q9VAP2) Tubulin beta chain × 2 (P02554) Tubulin alpha-1A chain × 4 (P02550) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GFP_AEQVI
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 204–440; UniProt 2–238

Augmin complex subunit msd5,Green fluorescent protein,Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme

Schistosoma japonicum

UniProt Q9W0G6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 9 Augmin complex subunit dgt4 × 1 (Q9W4M8) Augmin complex subunit dgt6 × 1 (Q9VAP2) Tubulin beta chain × 2 (P02554) Tubulin alpha-1A chain × 4 (P02550) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MSD5_DROME
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–179; UniProt 1–179

Tubulin beta chain

物种未注明

UniProt P02554

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 9 Augmin complex subunit dgt4 × 1 (Q9W4M8) Augmin complex subunit dgt6 × 1 (Q9VAP2) Augmin complex subunit msd5,Green fluorescent protein,Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme × 1 (P08515,P42212,Q9W0G6) Tubulin alpha-1A chain × 4 (P02550) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TBB_PIG
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–445; UniProt 1–445 作者链 D; PDB构建体 1–445; UniProt 1–445

Tubulin alpha-1A chain

物种未注明

UniProt P02550

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 9 Augmin complex subunit dgt4 × 1 (Q9W4M8) Augmin complex subunit dgt6 × 1 (Q9VAP2) Augmin complex subunit msd5,Green fluorescent protein,Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme × 1 (P08515,P42212,Q9W0G6) Tubulin beta chain × 2 (P02554) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TBA1A_PIG
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 C; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 E; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 G; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9rpd
沉积日期 deposition_date2025-06-24
结构标题 titleD. melanogaster Augmin TII N-clamp (GST-fusion) bound to a microtubule, well-defined subset of particles
关键词 keywords;augmin, N-clamp, TII, microtubule, branching, nucleation, HAUS, HAUS augmin-like complex subunit, HAUS6, HAUS7, HAUS2, HAUS8, Dgt6, Msd5, Dgt4, Msd1, Drosophila melanogaster, complex, CH domain, calponin homology domain, CELL CYCLE, MAP, cell division ;; CELL CYCLE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9rpd__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9rpd__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9rpd__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)48.58 Å
Rg(电子密度)48.25 Å
总 Rg48.41 Å
原子数41510
残基数2772
排除体积386110 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9rpd__assembly_1__model_1 nonameric (9) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 引用文献 (1)