当前蛋白身份：P21306
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2HLD Crystal structure of yeast mitochondrial F1-ATPase 提交 2006-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 I
1–61（61 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% glycerol, 4% methanol, 0.05M sodium acetate, 0.5mM nickel sulphate, 0.5mM AMP/PNP, 0.025 mM ADP, 2mM magnesium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 2HLD Crystal structure of yeast mitochondrial F1-ATPase 提交 2006-07-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 R
1–61（61 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% glycerol, 4% methanol, 0.05M sodium acetate, 0.5mM nickel sulphate, 0.5mM AMP/PNP, 0.025 mM ADP, 2mM magnesium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 2HLD Crystal structure of yeast mitochondrial F1-ATPase 提交 2006-07-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 1
1–61（61 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% glycerol, 4% methanol, 0.05M sodium acetate, 0.5mM nickel sulphate, 0.5mM AMP/PNP, 0.025 mM ADP, 2mM magnesium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.244 |
| 2WPD The Mg.ADP inhibited state of the yeast F1c10 ATP synthase 提交 2009-08-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric（19） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
片段：RESIDUES 2-62
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.1 M HEPES/HCL PH 7.5, 12% PEG MME 5000, 100 MM SODIUM CHLORIDE MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION CONTAINING 0.64 MM DDM, 25 MM TRIS/HCL PH 8.0, 100 MM SODIUM CHLORIDE, 25 MM TREHALOSE, 0.5 MM EDTA, 0.02% SODIUM AZIDE, 2 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 0.66 MM ADP, 0.1 MM DCCD, 2.5 MM DTT, 0.5 MM PMSF
|
分辨率 3.43 Å R-free 0.297 |
| 3FKS Yeast F1 ATPase in the absence of bound nucleotides 提交 2008-12-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
片段：UNP residues 2-62
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；277 K；6.25% PEG 6000, 10% Glycerol, 4% Methanol, 0.05M Sodium acetate, 0.5mM Nickel sulfate, 2 mM Sodium pyrophosphate, 2mM Magnesium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.59 Å R-free 0.306 |
| 3FKS Yeast F1 ATPase in the absence of bound nucleotides 提交 2008-12-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 R
2–62（61 aa）
片段：UNP residues 2-62
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；277 K；6.25% PEG 6000, 10% Glycerol, 4% Methanol, 0.05M Sodium acetate, 0.5mM Nickel sulfate, 2 mM Sodium pyrophosphate, 2mM Magnesium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.59 Å R-free 0.306 |
| 3FKS Yeast F1 ATPase in the absence of bound nucleotides 提交 2008-12-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 1
2–62（61 aa）
片段：UNP residues 2-62
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；277 K；6.25% PEG 6000, 10% Glycerol, 4% Methanol, 0.05M Sodium acetate, 0.5mM Nickel sulfate, 2 mM Sodium pyrophosphate, 2mM Magnesium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 3.59 Å R-free 0.306 |
| 3OE7 Structure of four mutant forms of yeast f1 ATPase: gamma-I270T 提交 2010-08-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-62
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, PH 7.3, VAPOR DIFFUSION SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.245 |
| 3OE7 Structure of four mutant forms of yeast f1 ATPase: gamma-I270T 提交 2010-08-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 R
2–62（61 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-62
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, PH 7.3, VAPOR DIFFUSION SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.245 |
| 3OE7 Structure of four mutant forms of yeast f1 ATPase: gamma-I270T 提交 2010-08-12 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 1
2–62（61 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-62
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, PH 7.3, VAPOR DIFFUSION SITTING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.245 |
| 3OEE Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: alpha-F405S 提交 2010-08-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-62
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.259 |
| 3OEE Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: alpha-F405S 提交 2010-08-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 R
2–62（61 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-62
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.259 |
| 3OEE Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: alpha-F405S 提交 2010-08-12 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 1
2–62（61 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-62
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.259 |
| 3OEH Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: beta-V279F 提交 2010-08-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-62
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.270 |
| 3OEH Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: beta-V279F 提交 2010-08-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 R
2–62（61 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-62
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.270 |
| 3OEH Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: beta-V279F 提交 2010-08-12 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 1
2–62（61 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-62
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.270 |
| 3OFN Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: alpha-N67I 提交 2010-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-62
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.276 |
| 3OFN Structure of four mutant forms of yeast F1 ATPase: alpha-N67I 提交 2010-08-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 R
2–62（61 aa）
片段：UNP RESIDUES 2-62
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；277 K；5.5% PEG 6000, 10% GLYCEROL, 4% METHANOL, 0.05M SODIUM ACETATE, 0.5MM NICKEL SULPHATE, 0.5MM AMP/PNP, 0.025 MM ADP, 2MM MAGNESIUM CHLORIDE, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.276 |
| 3ZIA The structure of F1-ATPase from Saccharomyces cerevisiae inhibited by its regulatory protein IF1 提交 2013-01-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 S
2–62（61 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 7.5；296 K；ACTIVE F1-ATPASE (12 MG/ML) WAS EXCHANGED ON A DESALTING COLUMN INTO CRYSTALLISATION BUFFER, PREPARED IN D2O CONSISTING OF 100 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 7.5, 100 MM SUCROSE, 1 MM ADP AND 10 MM MAGNESIUM SULPHATE. THEN THE ENZYME WAS INHIBITED AT 23C WITH A 4-FOLD MOLAR EXCESS OF YI1-53 (MUTATION E21A) IN THE PRESENCE OF 1 MM ATP AND 2 MM MAGNESIUM SULPHATE. FURTHER PORTIONS (5 UL OF A NEUTRALISED STOCK SOLUTION CONTAINING 200 MM ATP AND 400 MM MAGNESIUM SULPHATE/ML PROTEIN SOLUTION) WERE ADDED AFTER 5 AND 10 MIN. MORE THAN 95% OF THE ATP HYDROLYSIS ACTIVITY OF THE ENZYME WAS INHIBITED. SODIUM-POTASSIUM TARTRATE WAS ADDED TO 100 MM, AND THE CONCENTRATION OF THE PROTEIN SOLUTION WAS ADJUSTED TO 10 MG/ML WITH CRYSTALLISATION BUFFER. CRYSTALS WERE GROWN AT 23C IN 72 WELL MICRO-BATCH PLATES UNDER FILTERED PARAFFIN OIL. THE CRYSTALLISATION DROPS (4 UL) CONTAINED A 1:1 MIXTURE OF PROTEIN SOLUTION AND PRECIPITANT SOLUTION (20%-26% POLYETHYLENE GLYCOL 3000 AND 600 MM NACL PREPARED IN D2O).
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.262 |
| 3ZIA The structure of F1-ATPase from Saccharomyces cerevisiae inhibited by its regulatory protein IF1 提交 2013-01-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 7.5；296 K；ACTIVE F1-ATPASE (12 MG/ML) WAS EXCHANGED ON A DESALTING COLUMN INTO CRYSTALLISATION BUFFER, PREPARED IN D2O CONSISTING OF 100 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 7.5, 100 MM SUCROSE, 1 MM ADP AND 10 MM MAGNESIUM SULPHATE. THEN THE ENZYME WAS INHIBITED AT 23C WITH A 4-FOLD MOLAR EXCESS OF YI1-53 (MUTATION E21A) IN THE PRESENCE OF 1 MM ATP AND 2 MM MAGNESIUM SULPHATE. FURTHER PORTIONS (5 UL OF A NEUTRALISED STOCK SOLUTION CONTAINING 200 MM ATP AND 400 MM MAGNESIUM SULPHATE/ML PROTEIN SOLUTION) WERE ADDED AFTER 5 AND 10 MIN. MORE THAN 95% OF THE ATP HYDROLYSIS ACTIVITY OF THE ENZYME WAS INHIBITED. SODIUM-POTASSIUM TARTRATE WAS ADDED TO 100 MM, AND THE CONCENTRATION OF THE PROTEIN SOLUTION WAS ADJUSTED TO 10 MG/ML WITH CRYSTALLISATION BUFFER. CRYSTALS WERE GROWN AT 23C IN 72 WELL MICRO-BATCH PLATES UNDER FILTERED PARAFFIN OIL. THE CRYSTALLISATION DROPS (4 UL) CONTAINED A 1:1 MIXTURE OF PROTEIN SOLUTION AND PRECIPITANT SOLUTION (20%-26% POLYETHYLENE GLYCOL 3000 AND 600 MM NACL PREPARED IN D2O).
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.262 |
| 4B2Q Model of the yeast F1Fo-ATP synthase dimer based on subtomogram average 提交 2012-07-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric（46） 与蛋白数一致 |
链 I
2–60（59 aa）
片段：RESIDUES 2-60
链 i
2–60（59 aa）
片段：RESIDUES 2-60
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4；pH 7.4；250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, TEMPERATURE- 100, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, METHOD- SINGLE SIDE MANUAL BLOTTING FOR 5 SECONDS.,
|
分辨率 37.00 Å |
| 6CP3 Monomer yeast ATP synthase (F1Fo) reconstituted in nanodisc with inhibitor of oligomycin bound. 提交 2018-03-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6CP6 Monomer yeast ATP synthase (F1Fo) reconstituted in nanodisc. 提交 2018-03-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7MD2 The F1 region of ammocidin-bound Saccharomyces cerevisiae ATP synthase 提交 2021-04-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 H
2–62（61 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZHD (3~{E},5~{Z},7~{E},9~{R},10~{S},11~{E},13~{E},15~{E},17~{R},18~{S},20~{S})-20-[(1~{R})-1-[(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-5-[(2~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-5-[(2~{S},4~{R},5~{R},6~{R})-4,6-dimethyl-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-6-methyl-4-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-3-methoxy-6-(3-methoxypropyl)-5-methyl-2,4-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]ethyl]-5,18-dimethoxy-3,7,9,11,13,15-hexamethyl-10-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R},6~{S})-6-methyl-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-17-oxidanyl-1-oxacycloicosa-3,5,7,11,13,15-hexaen-2-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7MD3 The F1 region of apoptolidin-bound Saccharomyces cerevisiae ATP synthase 提交 2021-04-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 H
2–62（61 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZH7 (3~{E},5~{E},7~{E},9~{R},10~{R},11~{E},13~{E},17~{S},18~{S},20~{S})-18-methoxy-20-[(~{R})-[(2~{R},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-[(2~{R})-3-methoxy-2-[(2~{R},4~{S},5~{S},6~{S})-5-[(2~{S},4~{R},5~{R},6~{R})-4-methoxy-6-methyl-5-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-4,6-dimethyl-4-oxidanyl-oxan-2-yl]oxy-propyl]-3,5-dimethyl-2,4-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]-oxidanyl-methyl]-10-[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{R},6~{S})-5-methoxy-6-methyl-3,4-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,5,7,9,13-pentamethyl-17-oxidanyl-1-oxacycloicosa-3,5,7,11,13-pentaen-2-one × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7TJY Yeast ATP synthase State 1catalytic(a) without exogenous ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7TJZ Yeast ATP synthase State 1catalytic(b) without exogenous ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7TK0 Yeast ATP synthase State 1catalytic(c) without exogenous ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7TK1 Yeast ATP synthase State 1catalytic(d) without exogenous ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TK2 Yeast ATP synthase State 1binding(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 7TK3 Yeast ATP synthase State 1binding(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.30 Å |
| 7TK4 Yeast ATP synthase State 1binding(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 7TK5 Yeast ATP synthase State 1binding(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.80 Å |
| 7TK6 Yeast ATP synthase State 1catalytic(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 7TK7 Yeast ATP synthase State 1catalytic(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.70 Å |
| 7TK8 Yeast ATP synthase State 1catalytic(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 7TK9 Yeast ATP synthase State 1catalytic(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.00 Å |
| 7TKA Yeast ATP synthase State 1catalytic(e) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKB Yeast ATP synthase State 1catalytic(f) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.30 Å |
| 7TKC Yeast ATP synthase State 1catalytic(g) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 5.80 Å |
| 7TKD Yeast ATP synthase State 1catalytic(h) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 7TKE Yeast ATP synthase State 2binding(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKF Yeast ATP synthase State 2binding(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKG Yeast ATP synthase State 2catalytic(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7TKH Yeast ATP synthase State 2catalytic(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7TKI Yeast ATP synthase State 2catalytic(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKJ Yeast ATP synthase State 2catalytic(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.50 Å |
| 7TKK Yeast ATP synthase State 2catalytic(e) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.30 Å |
| 7TKL Yeast ATP synthase State 3binding(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.40 Å |
| 7TKM Yeast ATP synthase State 3binding(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7TKN Yeast ATP synthase State 3binding(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKO Yeast ATP synthase State 3catalytic(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 7TKP Yeast ATP synthase State 3catalytic(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 7TKQ Yeast ATP synthase State 3catalytic(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7TKR Yeast ATP synthase State 3catalytic(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 7TKS Yeast ATP synthase State 3catalytic(e) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–62（61 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.50 Å |
| 8F29 Yeast ATP synthase in conformation-1 at pH 6 提交 2022-11-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–60（59 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8F39 Yeast ATP synthase in conformation-2, at pH 6 提交 2022-11-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–60（59 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8FKJ Yeast ATP Synthase in conformation-3, at pH 6 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–60（59 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8FL8 Yeast ATP Synthase structure in presence of MgATP 提交 2022-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 I
2–60（59 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |