6bk8

S. cerevisiae spliceosomal post-catalytic P complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 227.3 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pre-mRNA-splicing factor Prp8

物种未注明

UniProt P33334

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 A; UniProt 1–2413 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 435 个其他 PDB 条目、443 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 PRP8_YEAST
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–2413; UniProt 1–2413

Pre-mRNA-splicing factor SNU114

物种未注明

UniProt P36048

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 B; UniProt 1–1008 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 23 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 SN114_YEAST
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–1008; UniProt 1–1008

Pre-mRNA-splicing factor PRP46

物种未注明

UniProt Q12417

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 D; UniProt 1–451 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 PRP46_YEAST
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451

Pre-mRNA-processing protein 45

物种未注明

UniProt P28004

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 E; UniProt 1–379 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 PRP45_YEAST
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–379; UniProt 1–379

Pre-mRNA-splicing factor SLT11

物种未注明

UniProt P38241

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 F; UniProt 1–364 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SLT11_YEAST
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–364; UniProt 1–364

Pre-mRNA-splicing factor CWC2

物种未注明

UniProt Q12046

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 G; UniProt 1–339 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 18 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 CWC2_YEAST
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–339; UniProt 1–339

Pre-mRNA-splicing factor CWC15

物种未注明

UniProt Q03772

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 H; UniProt 1–175 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CWC15_YEAST
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–175; UniProt 1–175

Pre-mRNA-splicing factor BUD31

物种未注明

UniProt P25337

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 I; UniProt 1–157 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 17 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BUD31_YEAST
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–157; UniProt 1–157

Pre-mRNA-splicing factor CWC21

物种未注明

UniProt Q03375

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 K; UniProt 1–135 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CWC21_YEAST
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–135; UniProt 1–135

Pre-mRNA-splicing factor CWC22

物种未注明

UniProt P53333

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 L; UniProt 1–577 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CWC22_YEAST
Isoform
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–577; UniProt 1–577

Pre-mRNA-processing factor Prp17

物种未注明

UniProt P40968

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 M; UniProt 1–455 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRP17_YEAST
Isoform
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–455; UniProt 1–455

Pre-mRNA-splicing factor Prp18

物种未注明

UniProt P33411

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 N; UniProt 1–251 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRP18_YEAST
Isoform
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–251; UniProt 1–251

Pre-mRNA-splicing factor SLU7

物种未注明

UniProt Q02775

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 O; UniProt 1–382 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SLU7_YEAST
Isoform
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 O; PDB构建体 1–382; UniProt 1–382

Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22

物种未注明

UniProt P24384

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 P; UniProt 1–1145 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRP22_YEAST
Isoform
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–1145; UniProt 1–1145

Pre-mRNA-splicing factor SYF2

物种未注明

UniProt P53277

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 R; UniProt 1–215 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SYF2_YEAST
Isoform
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–215; UniProt 1–215

Pre-mRNA-splicing factor CEF1

物种未注明

UniProt Q03654

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 S; UniProt 1–590 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CEF1_YEAST
Isoform
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 S; PDB构建体 1–590; UniProt 1–590

Pre-mRNA-splicing factor CLF1

物种未注明

UniProt Q12309

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 T; UniProt 1–687 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CLF1_YEAST
Isoform
PDB实体 22
链与序列区间 作者链 T; PDB构建体 1–687; UniProt 1–687

Pre-mRNA-splicing factor SYF1

物种未注明

UniProt Q04048

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 U; UniProt 1–859 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SYF1_YEAST
Isoform
PDB实体 23
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–859; UniProt 1–859

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2

物种未注明

UniProt Q06217

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 a; UniProt 1–110 链 q; UniProt 1–110 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMD2_YEAST
Isoform
PDB实体 26
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–110; UniProt 1–110 作者链 q; PDB构建体 1–110; UniProt 1–110

Small nuclear ribonucleoprotein F

物种未注明

UniProt P54999

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 b; UniProt 1–86 链 m; UniProt 1–86 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 35 个其他 PDB 条目、38 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RUXF_YEAST
Isoform
PDB实体 27
链与序列区间 作者链 b; PDB构建体 1–86; UniProt 1–86 作者链 m; PDB构建体 1–86; UniProt 1–86

Small nuclear ribonucleoprotein E

物种未注明

UniProt Q12330

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 c; UniProt 1–94 链 l; UniProt 1–94 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RUXE_YEAST
Isoform
PDB实体 28
链与序列区间 作者链 c; PDB构建体 1–94; UniProt 1–94 作者链 l; PDB构建体 1–94; UniProt 1–94

Small nuclear ribonucleoprotein G

物种未注明

UniProt P40204

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 d; UniProt 1–77 链 n; UniProt 1–77 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 34 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RUXG_YEAST
Isoform
PDB实体 29
链与序列区间 作者链 d; PDB构建体 1–77; UniProt 1–77 作者链 n; PDB构建体 1–77; UniProt 1–77

Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B

物种未注明

UniProt P40018

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 f; UniProt 1–196 链 k; UniProt 1–196 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RSMB_YEAST
Isoform
PDB实体 30
链与序列区间 作者链 f; PDB构建体 1–196; UniProt 1–196 作者链 k; PDB构建体 1–196; UniProt 1–196

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3

物种未注明

UniProt P43321

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 g; UniProt 1–101 链 o; UniProt 1–101 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMD3_YEAST
Isoform
PDB实体 31
链与序列区间 作者链 g; PDB构建体 1–101; UniProt 1–101 作者链 o; PDB构建体 1–101; UniProt 1–101

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1

物种未注明

UniProt Q02260

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 h; UniProt 1–146 链 p; UniProt 1–146 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMD1_YEAST
Isoform
PDB实体 32
链与序列区间 作者链 h; PDB构建体 1–146; UniProt 1–146 作者链 p; PDB构建体 1–146; UniProt 1–146

Lea1

物种未注明

UniProt P40567

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 r; UniProt 1–111 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MSL1_YEAST
Isoform
PDB实体 33
链与序列区间 作者链 r; PDB构建体 1–111; UniProt 1–111

Msl1

物种未注明

UniProt Q08963

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 s; UniProt 1–238 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RU2A_YEAST
Isoform
PDB实体 34
链与序列区间 作者链 s; PDB构建体 1–238; UniProt 1–238

Pre-mRNA-processing factor Prp19

物种未注明

UniProt P32523

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 u; UniProt 1–503 链 v; UniProt 1–503 链 w; UniProt 1–503 链 x; UniProt 1–503 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-splicing factor SNT309 × 1 (Q06091) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 18 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PRP19_YEAST
Isoform
PDB实体 35
链与序列区间 作者链 u; PDB构建体 1–503; UniProt 1–503 作者链 v; PDB构建体 1–503; UniProt 1–503 作者链 w; PDB构建体 1–503; UniProt 1–503 作者链 x; PDB构建体 1–503; UniProt 1–503

Pre-mRNA-splicing factor SNT309

物种未注明

UniProt Q06091

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 41 RNA 5 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物数一致 链 y; UniProt 1–175 未记录 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA (34-MER) × 1 RNA (59-MER) × 1 Pre-mRNA-splicing factor Prp8 × 1 (P33334) Pre-mRNA-splicing factor SNU114 × 1 (P36048) Pre-mRNA-splicing factor PRP46 × 1 (Q12417) Pre-mRNA-processing protein 45 × 1 (P28004) Pre-mRNA-splicing factor SLT11 × 1 (P38241) Pre-mRNA-splicing factor CWC2 × 1 (Q12046) Pre-mRNA-splicing factor CWC15 × 1 (Q03772) Pre-mRNA-splicing factor BUD31 × 1 (P25337) Pre-mRNA-splicing factor CWC21 × 1 (Q03375) Pre-mRNA-splicing factor CWC22 × 1 (P53333) Pre-mRNA-processing factor Prp17 × 1 (P40968) Pre-mRNA-splicing factor Prp18 × 1 (P33411) Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 (Q02775) Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP22 × 1 (P24384) Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 (P53277) Pre-mRNA-splicing factor CEF1 × 1 (Q03654) Pre-mRNA-splicing factor CLF1 × 1 (Q12309) Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 (Q04048) Unknown protein fragment × 1 Unknown protein fragment × 1 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 (Q06217) Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 (P54999) Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 (Q12330) Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 (P40204) Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B × 2 (P40018) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 (P43321) Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 (Q02260) Lea1 × 1 (P40567) Msl1 × 1 (Q08963) Pre-mRNA-processing factor Prp19 × 4 (P32523) MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SN309_YEAST
Isoform
PDB实体 36
链与序列区间 作者链 y; PDB构建体 1–175; UniProt 1–175

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6bk8

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6bk8
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6bk8
沉积日期 deposition_date2017-11-07
结构标题 titleS. cerevisiae spliceosomal post-catalytic P complex
关键词 keywordspre-mRNA splicing, spliceosome, post-catalytic, P complex, RNA BINDING PROTEIN; RNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier84.85
回转半径 Rg (电子) rg_electron84.36
零角强度 I(0) i023700400000.00
分子量 molecular_weight1181100.0 kDa
排除体积 excluded_volume1423200 ų
包络体积 envelope_volume2770100 ų
水化壳体积 shell_volume263700 ų
包络直径 envelope_diameter311.2
壳层 Rg shell_rg84.77
包络 Rg envelope_rg86.42
形状 Rg shape_rg84.59
总 Rg total_rg83.65
总原子数 total_atoms82745
残基数 n_residues10643
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax227.3
Rg (实空间) rg_real81.27
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.59
I(0) (实空间) i0_real2.2620e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.8700e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal84.42
I(0) (倒空间) i0_reciprocal23670000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9131
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary101.0
偏度 Skewness skewness0.217
峰度 Kurtosis kurtosis-0.571
角度范围 angular_range— – 0.0900 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.9191
最高正则化参数 α highest_alpha1958000000.0000
实空间数据点数 n_real_points19
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.999; Stabil: 0.966; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.976; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (40)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 15 domains

CATH v4.4 (15 domains)

结构域编号 domain_id6bk8N00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology940 — RNA Binding Protein, Prp18; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Functional domain of the splicing factor Prp18
结构域编号 domain_id6bk8a00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id6bk8b00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id6bk8c00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id6bk8d00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id6bk8g00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id6bk8l00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id6bk8m00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id6bk8n00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id6bk8o00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id6bk8q00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100
结构域编号 domain_id6bk8r00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily330 — RRM (RNA recognition motif) domain
结构域编号 domain_id6bk8u01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
结构域编号 domain_id6bk8w01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
结构域编号 domain_id6bk8x01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Herpes Virus-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Zinc/RING finger domain, C3HC4 (zinc finger)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)