6znn

The pointed end complex of dynactin bound to Hook3

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ARP1 actin related protein 1 homolog A

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Actin, cytoplasmic 1 × 1 （Q6QAQ1） Arp11 × 1 （I3LHK5） Dynactin subunit 2 × 1 （A0A5G2QD80） putative Hook3 coiled coil × 2 Dynactin 6 × 1 （D0G6S1） Dynactin subunit 5 × 1 （A0A286ZK88） Hook3 × 1 Dynactin subunit 4 × 1 （A0A4X1TB62） Hook3 × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	F2Z5G5_PIG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376 作者链 I； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376

Actin, cytoplasmic 1

物种未注明

UniProt Q6QAQ1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 （F2Z5G5） Arp11 × 1 （I3LHK5） Dynactin subunit 2 × 1 （A0A5G2QD80） putative Hook3 coiled coil × 2 Dynactin 6 × 1 （D0G6S1） Dynactin subunit 5 × 1 （A0A286ZK88） Hook3 × 1 Dynactin subunit 4 × 1 （A0A4X1TB62） Hook3 × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ACTB_PIG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375

Arp11

物种未注明

UniProt I3LHK5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 （F2Z5G5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （Q6QAQ1） Dynactin subunit 2 × 1 （A0A5G2QD80） putative Hook3 coiled coil × 2 Dynactin 6 × 1 （D0G6S1） Dynactin subunit 5 × 1 （A0A286ZK88） Hook3 × 1 Dynactin subunit 4 × 1 （A0A4X1TB62） Hook3 × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I3LHK5_PIG
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–417； UniProt 1–417

Dynactin subunit 2

物种未注明

UniProt A0A5G2QD80

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 （F2Z5G5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （Q6QAQ1） Arp11 × 1 （I3LHK5） putative Hook3 coiled coil × 2 Dynactin 6 × 1 （D0G6S1） Dynactin subunit 5 × 1 （A0A286ZK88） Hook3 × 1 Dynactin subunit 4 × 1 （A0A4X1TB62） Hook3 × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A5G2QD80_PIG
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–405； UniProt 1–405

Dynactin 6

物种未注明

UniProt D0G6S1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 （F2Z5G5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （Q6QAQ1） Arp11 × 1 （I3LHK5） Dynactin subunit 2 × 1 （A0A5G2QD80） putative Hook3 coiled coil × 2 Dynactin subunit 5 × 1 （A0A286ZK88） Hook3 × 1 Dynactin subunit 4 × 1 （A0A4X1TB62） Hook3 × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	D0G6S1_PIG
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190

Dynactin subunit 5

物种未注明

UniProt A0A286ZK88

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 （F2Z5G5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （Q6QAQ1） Arp11 × 1 （I3LHK5） Dynactin subunit 2 × 1 （A0A5G2QD80） putative Hook3 coiled coil × 2 Dynactin 6 × 1 （D0G6S1） Hook3 × 1 Dynactin subunit 4 × 1 （A0A4X1TB62） Hook3 × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A286ZK88_PIG
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182

Dynactin subunit 4

物种未注明

UniProt A0A4X1TB62

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	ARP1 actin related protein 1 homolog A × 2 （F2Z5G5） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （Q6QAQ1） Arp11 × 1 （I3LHK5） Dynactin subunit 2 × 1 （A0A5G2QD80） putative Hook3 coiled coil × 2 Dynactin 6 × 1 （D0G6S1） Dynactin subunit 5 × 1 （A0A286ZK88） Hook3 × 1 Hook3 × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4X1TB62_PIG
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–467； UniProt 1–467

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6znn
沉积日期 deposition_date	2020-07-06
结构标题 title	The pointed end complex of dynactin bound to Hook3
关键词 keywords	Dynactin, Complex, Scaffold, Cytoskeleton, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6znn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6znn__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6znn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.86 Å
Rg（电子密度）	53.12 Å
总 Rg	52.95 Å
原子数	19457
残基数	2641
排除体积	344710 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6znn__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ARP1 actin related protein 1 homolog A
分子量 formula_weight	42670.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,I
原子数 atom_count	19457

MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Actin, cytoplasmic 1
分子量 formula_weight	41782.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Arp11
分子量 formula_weight	46250.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MPLYEGLGSGGEKTAVVIDLGEAFTKCGFAGETGPRCIIPSVIKKAGMPKPIKVVQYNINTEELYSYLKEFIHILYFRHLLVNPRDRRVVVIESVLCPSHFRETLTRVLFKYFEVPSVLLAPSHLMALLTLGINSAMVLDCGYRESLVLPIYEGIPVLNCWGALPLGGKALHKELETQLLEQCTVDTGAAKEQSLPSVMGSIPEGVLEDIKVRTCFVSDLTRGLKIQAAKFNIDGNTERPSPPPNVDYPLDGEKILHVLGSIRDSVVEILFEQDNEEKSVATLILDSLMQCPIDTRKQLAENLVIIGGTSMLPGFLHRLLAEIRYLVEKPKYKKTLGTKTFRIHTPPAKANCVAWLGGAIFGALQDILGSRSVSKEYYNQTGRIPDWCSLNNPPLEMVFDVGKSQPPLMKRAFSTEK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Dynactin subunit 2
分子量 formula_weight	44704.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MADPKYADLPGIARNEPDVYETSDLPEDDQAEFDAELEELTSTSVEHIIVNPNAAYDKFKDKRVGTKGLDFSDRIGKTKRTGYESGEYEMLGEGLGVKETPQQKYQRLLHEVQELTTEVEKIKMTVKESATEEKLTPVVLAKQLAALKQQLVASHLEKLLGPDAAINLTDPDGALAKRLLLQLEATKNTKGAGSGGKTTSGSPPDSSLVTYELHSRPEQDKFSQAAKVAELEKRLTELEATVRCDQDAQNPLSAGLQGACLMETVELLQAKVSALDLAVLDQVEARLQSVLGKVNEIAKHKASVEDADTQSKVHQLYETIQRWSPIASTLPELVQRLVTIKQLHEQAMQFGQLLTHLDTTQQMIACSLKDNATLLTQVQTTMRENLSTVEGNFANIDERMKKLGK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	putative Hook3 coiled coil
分子量 formula_weight	5805.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S,T

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Dynactin 6
分子量 formula_weight	20703.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MAEKTQKSVKIAPGAVVCVESEIRGDVTIGPRTVIHPKARIIAEAGPIVIGEGNLIEEQALIINAHPDNITPDAEDSEPKPMIIGTNNVFEVGCYSQAMKMGDNNVIESKAYVGRNVILTSGCIIGACCNLNTFEVIPENTVIYGADCLRRVQTERPQPQTLQLDFLMKILPNYHHLKKTMKGSSTPVKN

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Dynactin subunit 5
分子量 formula_weight	20150.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MELGELLYNKSEYIETASGNKVSRQSVLCGSQNIVLNGKTIVMNDCIIRGDLANVRVGRHCVVKSRSVIRPPFKKFSKGVAFFPLHIGDHVFIEEDCVVNAAQIGSYVHVGKNCVIGRRCVLKDCCKILDNTVLPPETVVPPFTVFSGCPGLFSGELPECTQELMIDVTKSYYQKFLPLTQV

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Hook3
分子量 formula_weight	7932.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Dynactin subunit 4
分子量 formula_weight	52920.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

MASLLQSERVLYLVQGEKKVRAPLSQLYFCRYCSELRSLECVSHEVDSHYCPSCLENMPSAEAKLKKNRCANCFDCPGCMHTLSTRATSISTQLPDDPAKTAVKKAYYLACGFCRWTSRDVGMADKSVASGGWQEPDHPHTQRMNKLIEYYQQLAQKEKVERDRKKLARRRNYMPLAFSQHTIHVVDKYGLGTRLQRPRAGTTITALAGLSLKEGEDQKEIKIEPAQAVDEVEPLPEDYYTRPVNLTEVTTLQQRLLQPDFQPICASQLYPRHKHLLIKRSLRCRQCEHNLSKPEFNPTSIKFKIQLVAVNYIPEVRIMSIPNLRYMKESQVLLTLTNPVENLTHVTLLECEEGDPDDTNSTAKVSVPPTELVLAGKDAAAEYDELAEPQDFPDDPDVVAFRKANKVGVFIKVTPQREEGDVTVCFKLKHDFKNLAAPIRPVEEADPGAEVSWLTQHVELSLGPLLP

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Hook3
分子量 formula_weight	7847.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	x

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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分辨率 resolution	4.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	57348

The pointed end complex of dynactin bound to Hook3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ARP1 actin related protein 1 homolog A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actin, cytoplasmic 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Arp11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dynactin subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dynactin 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dynactin subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dynactin subunit 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6znn__assembly_1__model_1

6znn__assembly_1__model_1 | I(q)

6znn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer