Engulfment and cell motility protein 1
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–727 链 D; UniProt 1–727 | 未记录 | Dedicator of cytokinesis protein 5 × 2 (Q9H7D0) Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 × 2 (P63000) | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 4.23 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 8ZJK | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2RQR The solution structure of human DOCK2 SH3 domain - ELMO1 peptide chimera complex 提交 2009-10-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
697–722(26 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120;压力 ambient
NMR样品组成
1mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 20mM [U-2H] TRIS-2, 100mM sodium chloride-3, 0.02% sodium azide-4, 1mM [U-2H] DTT-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2VSZ Crystal Structure of the ELMO1 PH domain 提交 2008-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
532–675(144 aa)
片段:PLECKSTRIN HOMOLOGY DOMAIN, RESIDUES 532-675
链 B
532–675(144 aa)
片段:PLECKSTRIN HOMOLOGY DOMAIN, RESIDUES 532-675
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.75;2.1 M SODIUM MALONATE [PH 6.75]
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.239 |
| 3A98 Crystal structure of the complex of the interacting regions of DOCK2 and ELMO1 提交 2009-10-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
532–727(196 aa)
片段:C-terminal domains, PH domain, residues 532-727
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;12% PEG 3350, 0.1M di-ammonium hydrogen citrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.268 |
| 3A98 Crystal structure of the complex of the interacting regions of DOCK2 and ELMO1 提交 2009-10-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
532–727(196 aa)
片段:C-terminal domains, PH domain, residues 532-727
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;12% PEG 3350, 0.1M di-ammonium hydrogen citrate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.268 |
| 6JPP Solution structure of ELMO1 RBD 提交 2019-03-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–113(113 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Elmo1 RBD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6TGB CryoEM structure of the binary DOCK2-ELMO1 complex 提交 2019-11-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 B
1–727(727 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |
| 6TGC CryoEM structure of the ternary DOCK2-ELMO1-RAC1 complex. 提交 2019-11-15 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 B
1–727(727 aa)
链 E
1–727(727 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7DPA Cryo-EM structure of the human ELMO1-DOCK5-Rac1 complex 提交 2020-12-18 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
1–727(727 aa)
链 F
1–727(727 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7Y4A Crystal structure of human ELMO1 RBD-RhoG complex 提交 2022-06-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–82(82 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.91 M potassium phosphate dibasic and 0.49 M sodium phosphate monobasic monohydrate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.235 |
| 7Y4A Crystal structure of human ELMO1 RBD-RhoG complex 提交 2022-06-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1–82(82 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.91 M potassium phosphate dibasic and 0.49 M sodium phosphate monobasic monohydrate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.235 |
| 7Y4A Crystal structure of human ELMO1 RBD-RhoG complex 提交 2022-06-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 F
1–82(82 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.91 M potassium phosphate dibasic and 0.49 M sodium phosphate monobasic monohydrate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.235 |
| 7Y4A Crystal structure of human ELMO1 RBD-RhoG complex 提交 2022-06-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 H
1–82(82 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.91 M potassium phosphate dibasic and 0.49 M sodium phosphate monobasic monohydrate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.235 |
| 8JHK Cryo-EM structure of the DOCK5/ELMO1 complex, focused on one protomer 提交 2023-05-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–727(727 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.76 Å |
| 8XM7 Cryo-EM structure of the RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 complex: RhoG/DOCK5/ELMO1 focused map 提交 2023-12-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–727(727 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.91 Å |
| 8ZJ2 Cryo-EM structure of the RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 complex 提交 2024-05-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–727(727 aa)
链 E
1–727(727 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.66 Å |
| 8ZJI Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 1) 提交 2024-05-15 | 当前字段一致 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–727(727 aa)
链 D
1–727(727 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.23 Å |
| 8ZJJ Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 2) 提交 2024-05-15 | 当前字段一致 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–727(727 aa)
链 D
1–727(727 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.23 Å |
| 8ZJL Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 4) 提交 2024-05-15 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–727(727 aa)
链 D
1–727(727 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.31 Å |
| 8ZJM Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 5) 提交 2024-05-15 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–727(727 aa)
链 D
1–727(727 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.52 Å |
| 9LX0 DOCK5/ELMO1 complex with RhoG and Rac1 on lipid membrane 提交 2025-02-17 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–727(727 aa)
链 E
1–727(727 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.98 Å |
| 9LXH DOCK5/ELMO1 complex with RhoG and Rac1 on lipid membrane 提交 2025-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–727(727 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.52 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | ELMO1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 7–733; UniProt 1–727 作者链 D; PDB构建体 7–733; UniProt 1–727 |