1qo1

Molecular Architecture of the Rotary Motor in ATP Synthase from Yeast Mitochondria

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN

物种未注明

UniProt P19483

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	ATP SYNTHASE BETA CHAIN × 3 （P00829） ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN × 1 （P05631） ATP SYNTHASE DELTA CHAIN × 1 （P00832） ATP SYNTHASE PROTEIN 9 × 10 （P00844）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATP0_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 24–510； UniProt 67–553 作者链 B； PDB构建体 24–510； UniProt 67–553 作者链 C； PDB构建体 19–510； UniProt 62–553

ATP SYNTHASE BETA CHAIN

物种未注明

UniProt P00829

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN × 3 （P19483） ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN × 1 （P05631） ATP SYNTHASE DELTA CHAIN × 1 （P00832） ATP SYNTHASE PROTEIN 9 × 10 （P00844）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPB_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 13–479； UniProt 59–525 作者链 E； PDB构建体 13–478； UniProt 59–524 作者链 F； PDB构建体 13–478； UniProt 59–524

ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN

物种未注明

UniProt P05631

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN × 3 （P19483） ATP SYNTHASE BETA CHAIN × 3 （P00829） ATP SYNTHASE DELTA CHAIN × 1 （P00832） ATP SYNTHASE PROTEIN 9 × 10 （P00844）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPG_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–44； UniProt 26–69 作者链 G； PDB构建体 77–90； UniProt 102–115 作者链 G； PDB构建体 209–272； UniProt 234–297

ATP SYNTHASE DELTA CHAIN

物种未注明

UniProt P00832

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN × 3 （P19483） ATP SYNTHASE BETA CHAIN × 3 （P00829） ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN × 1 （P05631） ATP SYNTHASE PROTEIN 9 × 10 （P00844）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATPE_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 2–136； UniProt 2–136

ATP SYNTHASE PROTEIN 9

物种未注明

UniProt P00844

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN × 3 （P19483） ATP SYNTHASE BETA CHAIN × 3 （P00829） ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN × 1 （P05631） ATP SYNTHASE DELTA CHAIN × 1 （P00832）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATPL_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 L； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 M； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 N； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 O； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 P； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 Q； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 R； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 S； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 T； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1qo1
沉积日期 deposition_date	1999-11-01
结构标题 title	Molecular Architecture of the Rotary Motor in ATP Synthase from Yeast Mitochondria
关键词 keywords	ATP SYNTHASE, LOW RESOLUTION MODEL, C-ALPHA ONLY; ATP SYNTHASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1qo1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1qo1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1qo1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	59.22 Å
Rg（电子密度）	60.82 Å
总 Rg	60.67 Å
原子数	0
残基数	0
排除体积	522900 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1qo1__assembly_1__model_1`	octadecameric （18）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN
分子量 formula_weight	55301.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	3912

QKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKARRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTSIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQLVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCSMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGTMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLSRGVRLTELLKQGQYSPMAIEEQVAVIYAGVRGYLDKLEPSKITKFENAFLSHVISQHQALLGKIRTDGKISEESDAKLKEIVTNFLAGFEA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE BETA CHAIN
分子量 formula_weight	51757.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

AAQASPSPKAGATTGRIVAVIGAVVDVQFDEGLPPILNALEVQGRETRLVLEVAQHLGESTVRTIAMDGTEGLVRGQKVLDSGAPIRIPVGPETLGRIMNVIGEPIDERGPIKTKQFAAIHAEAPEFVEMSVEQEILVTGIKVVDLLAPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNVAKAHGGYSVFAGVGERTREGNDLYHEMIESGVINLKDATSKVALVYGQMNEPPGARARVALTGLTVAEYFRDQEGQDVLLFIDNIFRFTQAGSEVSALLGRIPSAVGYQPTLATDMGTMQERITTTKKGSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRAIAELGIYPAVDPLDSTSRIMDPNIVGSEHYDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLSQPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVAKADKLAEEHS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN
分子量 formula_weight	30185.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

ATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGVGSLALYEKADIKTPEDKKKHLIIGVSSDRGLCGAIHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSIIFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNASEMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAAL

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE DELTA CHAIN
分子量 formula_weight	14897.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

GSTYHLDVVSAEQQMFSGLVEKIQVTGSEGELGIYPGHAPLLTAIKPGMIRIVKQHGHEEFIYLSGGILEVQPGNVTVLADTAIRGQDLDEARAMEAKRKAEEHISSSHGDVDYAQASAELAKAIAQLRVIELTKKAM

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	ATP SYNTHASE PROTEIN 9
分子量 formula_weight	8259.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.1.34
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T

MENLNMDLLYMAAAVMMGLAAIGAAIGIGILGGKFLEGAARQPDLIPLLRTQFFIVMGLVDAIPMIAVGLGLYVMFAVA

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 18 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

结构域编号 domain_id	d1qo1a_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1b_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1c_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1d_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1e_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1f_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1g_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1j_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1k_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1l_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1m_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1n_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1o_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1p_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1q_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1r_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1s_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

结构域编号 domain_id	d1qo1t_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.3 — ATP synthase
超家族 Superfamily superfamily	i.3.1 — ATP synthase
家族 Family family	i.3.1.1 — ATP synthase

▶

晶胞边长 a length_a	135.900 Å
晶胞边长 b length_b	175.300 Å
晶胞边长 c length_c	139.200 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	91.60 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	20

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.900 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

Molecular Architecture of the Rotary Motor in ATP Synthase from Yeast Mitochondria

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE BETA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE DELTA CHAIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP SYNTHASE PROTEIN 9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1qo1__assembly_1__model_1

1qo1__assembly_1__model_1 | I(q)

1qo1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 18 domains

SCOP 2.08 (18 domains)

7. 引用文献 (4)