SAXSdb — 8xp1

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar motor switch protein FliN

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Flagellar M-ring protein × 3 （P15928） Flagellar motor switch protein FliM × 3 （P26418） Flagellar motor switch protein FliG × 3 （P0A1J9） Chemotaxis protein CheY × 3 （P0A2D5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLIN_SALTY
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137 作者链 AA； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137 作者链 AB； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137 作者链 o； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137 作者链 p； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137 作者链 q； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137 作者链 u； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137 作者链 v； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137 作者链 w； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137

Flagellar M-ring protein

物种未注明

UniProt P15928

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Flagellar motor switch protein FliN × 9 （P26419） Flagellar motor switch protein FliM × 3 （P26418） Flagellar motor switch protein FliG × 3 （P0A1J9） Chemotaxis protein CheY × 3 （P0A2D5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLIF_SALTY
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–560； UniProt 1–560 作者链 D； PDB构建体 1–560； UniProt 1–560 作者链 E； PDB构建体 1–560； UniProt 1–560

Flagellar motor switch protein FliM

物种未注明

UniProt P26418

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Flagellar motor switch protein FliN × 9 （P26419） Flagellar M-ring protein × 3 （P15928） Flagellar motor switch protein FliG × 3 （P0A1J9） Chemotaxis protein CheY × 3 （P0A2D5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLIM_SALTY
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–334； UniProt 1–334 作者链 T； PDB构建体 1–334； UniProt 1–334 作者链 U； PDB构建体 1–334； UniProt 1–334

Flagellar motor switch protein FliG

物种未注明

UniProt P0A1J9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Flagellar motor switch protein FliN × 9 （P26419） Flagellar M-ring protein × 3 （P15928） Flagellar motor switch protein FliM × 3 （P26418） Chemotaxis protein CheY × 3 （P0A2D5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLIG_SALTY
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–331； UniProt 1–331 作者链 a； PDB构建体 1–331； UniProt 1–331 作者链 b； PDB构建体 1–331； UniProt 1–331

Chemotaxis protein CheY

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2

UniProt P0A2D5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Flagellar motor switch protein FliN × 9 （P26419） Flagellar M-ring protein × 3 （P15928） Flagellar motor switch protein FliM × 3 （P26418） Flagellar motor switch protein FliG × 3 （P0A1J9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CHEY_SALTY
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 h； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129 作者链 i； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129 作者链 j； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8xp1
沉积日期 deposition_date	2024-01-02
结构标题 title	Cryo-EM structure of the protomers of the C ring in the CW state
关键词 keywords	Flagellum, Flagellar motor, C ring, CheY, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8xp1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8xp1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8xp1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	57.17 Å
Rg（电子密度）	57.07 Å
总 Rg	57.30 Å
原子数	24297
残基数	3084
排除体积	436650 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8xp1__assembly_1__model_1`	21-meric （21）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Flagellar motor switch protein FliN
分子量 formula_weight	14801.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	9

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	0,o,u,AA,p,v,AB,q,w
原子数 atom_count	24297

MSDMNNPSDENTGALDDLWADALNEQKATTTKSAADAVFQQLGGGDVSGAMQDIDLIMDIPVKLTVELGRTRMTIKELLRLTQGSVVALDGLAGEPLDILINGYLIAQGEVVVVADKYGVRITDIITPSERMRRLSR

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Flagellar M-ring protein
分子量 formula_weight	61295.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,E

MSATASTATQPKPLEWLNRLRANPRIPLIVAGSAAVAIVVAMVLWAKTPDYRTLFSNLSDQDGGAIVAQLTQMNIPYRFANGSGAIEVPADKVHELRLRLAQQGLPKGGAVGFELLDQEKFGISQFSEQVNYQRALEGELARTIETLGPVKSARVHLAMPKPSLFVREQKSPSASVTVTLEPGRALDEGQISAVVHLVSSAVAGLPPGNVTLVDQSGHLLTQSNTSGRDLNDAQLKFANDVESRIQRRIEAILSPIVGNGNVHAQVTAQLDFANKEQTEEHYSPNGDASKATLRSRQLNISEQVGAGYPGGVPGALSNQPAPPNEAPIATPPTNQQNAQNTPQTSTSTNSNSAGPRSTQRNETSNYEVDRTIRHTKMNVGDIERLSVAVVVNYKTLADGKPLPLTADQMKQIEDLTREAMGFSDKRGDTLNVVNSPFSAVDNTGGELPFWQQQSFIDQLLAAGRWLLVLVVAWILWRKAVRPQLTRRVEEAKAAQEQAQVRQETEEAVEVRLSKDEQLQQRRANQRLGAEVMSQRIREMSDNDPRVVALVIRQWMSNDHE

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Flagellar motor switch protein FliM
分子量 formula_weight	37901.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S,T,U

MGDSILSQAEIDALLNGDSDTKDEPTPGIASDSDIRPYDPNTQRRVVRERLQALEIINERFARQFRMGLFNLLRRSPDITVGAIRIQPYHEFARNLPVPTNLNLIHLKPLRGTGLVVFSPSLVFIAVDNLFGGDGRFPTKVEGREFTHTEQRVINRMLKLALEGYSDAWKAINPLEVEYVRSEMQVKFTNITTSPNDIVVNTPFHVEIGNLTGEFNICLPFSMIEPLRELLVNPPLENSRHEDQNWRDNLVRQVQHSELELVANFADIPLRLSQILKLKPGDVLPIEKPDRIIAHVDGVPVLTSQYGTVNGQYALRVEHLINPILNSLNEEQPK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Flagellar motor switch protein FliG
分子量 formula_weight	36891.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z,a,b

MSNLSGTDKSVILLMTIGEDRAAEVFKHLSTREVQALSTAMANVRQISNKQLTDVLSEFEQEAEQFAALNINANEYLRSVLVKALGEERASSLLEDILETRDTTSGIETLNFMEPQSAADLIRDEHPQIIATILVHLKRSQAADILALFDERLRHDVMLRIATFGGVQPAALAELTEVLNGLLDGQNLKRSKMGGVRTAAEIINLMKTQQEEAVITAVREFDGELAQKIIDEMFLFENLVDVDDRSIQRLLQEVDSESLLIALKGAEPPLREKFLRNMSQRAADILRDDLANRGPVRLSQVENEQKAILLIVRRLAETGEMVIGSGEDTYV

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Chemotaxis protein CheY
分子量 formula_weight	14177.5 kDa
突变 mutation	D13K, Y106W
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	h,i,j

MADKELKFLVVDKFSTMRRIVRNLLKELGFNNVEEAEDGVDALNKLQAGGFGFIISDWNMPNMDGLELLKTIRADSAMSALPVLMVTAEAKKENIIAAAQAGASGWVVKPFTAATLEEKLNKIFEKLGM

来源 Source

来源生物 organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	99287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	956046

Cryo-EM structure of the protomers of the C ring in the CW state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar motor switch protein FliN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Flagellar M-ring protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Flagellar motor switch protein FliM

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Flagellar motor switch protein FliG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chemotaxis protein CheY

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8xp1__assembly_1__model_1

8xp1__assembly_1__model_1 | I(q)

8xp1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of the protomers of the C ring in the CW state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar motor switch protein FliN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Flagellar M-ring protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Flagellar motor switch protein FliM

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Flagellar motor switch protein FliG

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chemotaxis protein CheY

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8xp1__assembly_1__model_1

8xp1__assembly_1__model_1 | I(q)

8xp1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)