9j0p

Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A8D1DPV6_PIG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1970； UniProt 1–1970

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

物种未注明

UniProt A0A4X1TVZ5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4X1TVZ5_PIG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1174； UniProt 78–1251

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

物种未注明

UniProt A0A481DF93

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A481DF93_PIG
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–271； UniProt 46–316

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4

物种未注明

UniProt A0A481BYI6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A481BYI6_PIG
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

DNA-directed RNA polymerase II subunit E

物种未注明

UniProt A0A4X1VTX4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4X1VTX4_PIG
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210

DNA-directed RNA polymerase II subunit F

物种未注明

UniProt A0A4X1VEK9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4X1VEK9_PIG
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

物种未注明

UniProt A0A4X1VKG7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4X1VKG7_PIG
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

物种未注明

UniProt I3LCB2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I3LCB2_PIG
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

物种未注明

UniProt P60899

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB9_PIG
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

物种未注明

UniProt A0A493TD97

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A493TD97_ANAPP
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a

物种未注明

UniProt F1RKE4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	F1RKE4_PIG
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

RPB12

物种未注明

UniProt A0A4X1TRS6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4X1TRS6_PIG
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58

Transcription elongation factor SPT4

Homo sapiens

UniProt P63272

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SPT4H_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 2–118； UniProt 1–117

Transcription elongation factor SPT5

Homo sapiens

UniProt O00267

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SPT5H_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–1087； UniProt 1–1087

Negative elongation factor A

Homo sapiens

UniProt Q9H3P2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NELFA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–528； UniProt 1–528

Negative elongation factor B

Homo sapiens

UniProt Q8WX92

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

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UniProt名称	NELFB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–580； UniProt 1–580

Negative elongation factor C/D

Homo sapiens

UniProt Q8IXH7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

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UniProt名称	NELFD_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	20
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–590； UniProt 1–590

Negative elongation factor E

Homo sapiens

UniProt P18615

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

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UniProt名称	NELFE_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	21
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 25–404； UniProt 1–380

Histone H3.3

Homo sapiens

UniProt P84243

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H33_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	22
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 e； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

Histone H4

Homo sapiens

UniProt P62805

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	23
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 f； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103

Histone H2A type 1-B/E

Homo sapiens

UniProt P04908

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2B type 1-J × 2 （P06899） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H2A1B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	24
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 g； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

Histone H2B type 1-J

Homo sapiens

UniProt P06899

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 26 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （A0A8D1DPV6） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A0A4X1TVZ5） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （A0A481BYI6） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 （A0A4X1VTX4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 （A0A4X1VEK9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （A0A4X1VKG7） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （A0A493TD97） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （F1RKE4） RPB12 × 1 （A0A4X1TRS6） Transcription elongation factor SPT4 × 1 （P63272） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （O00267） TEMPLATE DNA (191-MER) × 1 NON-TEMPLATE DNA (180-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ; × 1 Negative elongation factor A × 1 （Q9H3P2） Negative elongation factor B × 1 （Q8WX92） Negative elongation factor C/D × 1 （Q8IXH7） Negative elongation factor E × 1 （P18615） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 2 （P04908） ZINC ION × 9 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H2B1J_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	25
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126 作者链 h； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9j0p
沉积日期 deposition_date	2024-08-02
结构标题 title	Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc)
关键词 keywords	RNA polymerase, NELF, nucleosome, DNA, RNA, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9j0p__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9j0p__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9j0p__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	80.01 Å
Rg（电子密度）	78.05 Å
总 Rg	78.32 Å
原子数	59755
残基数	6889
排除体积	1042500 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9j0p__assembly_1__model_1`	29-meric （29）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (27)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit
分子量 formula_weight	217450.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	59755

MHGGGPPSGDSACPLRTIKRVQFGVLSPDELKRMSVTEGGIKYPETTEGGRPKLGGLMDPRQGVIERTGRCQTCAGNMTECPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEMDNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEPRYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAAHVIAEDVKLLQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNIDRLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWSTFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTKRDVFLERGEVMNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHINCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGILCKKSLGTSAGSLVHISYLEMGHDITRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSKTYQDIQNTIKKAKQDVIEVIEKAHNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQKSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKINISQVIAVVGQQNVEGKRIPFGFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVRNSINQVVQLRYGEDGLAGESVEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQNELEREFERMREDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRLPSDLHPIKVVEGVKELSKKLVIVNGDDPLSRQAQENATLLFNIHLRSTLCSRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKELINISKKPKTPSLTVFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMPDFDVARISPWLLRVELDRKHMTDRKLTMEQIAEKINAGFGDDLNCIFNDDNAEKLVLRIRIMNSDENKMQEEEEVVDKMDDDVFLRCIESNMLTDMTLQGIEQISKVYMHLPQTDNKKKIIITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEKDVDPVRTTSNDIVEIFTVLGIEAVRKALERELYHVISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGHLMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLMEAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPSPMGGISPAMTPWNQGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSAASDASGFSPGYSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit beta
分子量 formula_weight	134041.4 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MYDADEDMQYDEDDDEITPDLWQEACWIVISSYFDEKGLVRQQLDSFDEFIQMSVQRIVEDAPPIDLQAEAQHASGEVEEPPRYLLKFEQIYLSKPTHWERDGAPSPMMPNEARLRNLTYSAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLTDRDLCELNECPLDPGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRPTSTIWVSMLARGGQGAKKSAIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYDFEDPEMMEMVKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAKPGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPHVGVSDFCETKKAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGMFKNLLKEVRIYAQKFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLNRLTFASTLSHLRRLNSPIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAYISVGSQPSPILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLRRQMDIIVSEVSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKEREYNNYSWQDLVASGVVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHPSMILGVCASIIPFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHVLYYPQKPLVTTRSMEYLRFRELPAGINSIVAIASYTGYNQEDSVIMNRSAVDRGFFRSVFYRSYKEQESKKGFDQEEVFEKPTRETCQGMRHAIYDKLDDDGLIAPGVRVSGDDVIIGKTVTLPENEDELEGTNRRYTKRDCSTFLRTSETGIVDQVMVTLNQEGYKFCKIRVRSVRIPQIGDKFASRHGQKGTCGIQYRQEDMPFTCEGITPDIIINPHAIPSRMTIGHLIECLQGKVSANKGEIGDATPFNDAVNVQKISNLLSDYGYHLRGNEVLYNGFTGRKITSQIFIGPTYYQRLKHMVDDKIHSRARGPIQILNRQPMEGRSRDGGLRFGEMERDCQIAHGAAQFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIMAIANTRTHTYECRGCRNKTQISLVRMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3
分子量 formula_weight	30997.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MPYANQPTVRITELTDENVKFIIENTDLAVANSIRRVFIAEVPIIAIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLTSDDIVDKLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPSDYVEQDDILIVKLRKGQELRLRAYAKKGFGKEHAKWNPTAGVAFEYDPDNALRHTVYPKPEEWPKSEYSELDEDESQAPYDPNGKPERFYYNVESCGSLRPETIVLSALSGLKKKLSDLQTQLSHEIQSDV

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4
分子量 formula_weight	16331.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MAAGGSDPRAGDVEEDASQLIFPKEFETAETLLNSEVHMLLEHRKQQNESAEDEQELSEVFMKTLNYTARFSRFKNRETIASVRSLLLQKKLHKFELACLANLCPETAEESKALIPSLEGRFEDEELQQILDDIQTKRSFQY

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit E
分子量 formula_weight	24644.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MDDEEETYRLWKIRKTIMQLCHDRGYLVTQDELDQTLEEFKAQFGDKPSEGRPRRTDLTVLVAHNDDPTDQMFVFFPEEPKVGIKTIKVYCQRMQEENITRALIVVQQGMTPSAKQSLVDMAPKYILEQFLQQELLINITEHELVPEHVVMTKEEVTELLARYKLRENQLPRIQAGDPVARYFGIKRGQVVKIIRPSETAGRYITYRLVQ

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit F
分子量 formula_weight	14477.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSDNEDNFDGDDFDDVEEDEGLDDLENAEEEGQENVEILPSGERPQANQKRITTPYMTKYERARVLGTRALQIAMCAPVMVELEGETDPLLIAMKELKARKIPIIIRRYLPDGSYEDWGVDELIISD

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7
分子量 formula_weight	19314.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MFYHISLEHEILLHPRYFGPNLLNTVKQKLFTEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPFKGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTMDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIFAIGSLMDDYLGLVS

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
分子量 formula_weight	17162.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGDKFRLVIASTLYEDGTLDDGEYNPTDDRPSRADQFEYVMYGKVYRIEGDETSTEAATRLSAYVSYGGLLMRLQGDANNLHGFEVDSRVYLLMKKLAF

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
分子量 formula_weight	14541.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MEPDGTYEPGFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPRTEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEDAMRLYYVCTAPHCGHRWTE

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
分子量 formula_weight	7655.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MIIPVRCFTCGKIVGNKWEAYLGLLQAEYTEGDALDALGLKRYCCRRMLLAHVDLIEKLLNYAPLEK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a
分子量 formula_weight	13310.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MNAPPAFESFLLFEGEKKITINKDTKVPNACLFTINKEDHTLGNIIKSQLLKDPQVLFAGYKVPHPLEHKIIIRVQTTPDYSPQEAFTNAITDLISELSLLEERFRVAIKDKQEGIE

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	RPB12
分子量 formula_weight	7018.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MDTQKDVQPPKQQPMIYICGECHTENEIKSRDPIRCRECGYRIMYKKRTKRLVVFDAR

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Transcription elongation factor SPT4
分子量 formula_weight	13297.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

SMALETVPKDLRHLRACLLCSLVKTIDQFEYDGCDNCDAYLQMKGNREMVYDCTSSSFDGIIAMMSPEDSWVSKWQRVSNFKPGVYAVSVTGRLPQGIVRELKSRGVAYKSRDTAIKT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Transcription elongation factor SPT5
分子量 formula_weight	123297.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MSDSEDSNFSEEEDSERSSDGEEAEVDEERRSAAGSEKEEEPEDEEEEEEEEEYDEEEEEEDDDRPPKKPRHGGFILDEADVDDEYEDEDQWEDGAEDILEKEEIEASNIDNVVLDEDRSGARRLQNLWRDQREEELGEYYMKKYAKSSVGETVYGGSDELSDDITQQQLLPGVKDPNLWTVKCKIGEERATAISLMRKFIAYQFTDTPLQIKSVVAPEHVKGYIYVEAYKQTHVKQAIEGVGNLRLGYWNQQMVPIKEMTDVLKVVKEVANLKPKSWVRLKRGIYKDDIAQVDYVEPSQNTISLKMIPRIDYDRIKARMSLKDWFAKRKKFKRPPQRLFDAEKIRSLGGDVASDGDFLIFEGNRYSRKGFLFKSFAMSAVITEGVKPTLSELEKFEDQPEGIDLEVVTESTGKEREHNFQPGDNVEVCEGELINLQGKILSVDGNKITIMPKHEDLKDMLEFPAQELRKYFKMGDHVKVIAGRFEGDTGLIVRVEENFVILFSDLTMHELKVLPRDLQLCSETASGVDVGGQHEWGELVQLDPQTVGVIVRLERETFQVLNMYGKVVTVRHQAVTRKKDNRFAVALDSEQNNIHVKDIVKVIDGPHSGREGEIRHLFRSFAFLHCKKLVENGGMFVCKTRHLVLAGGSKPRDVTNFTVGGFAPMSPRISSPMHPSAGGQRGGFGSPGGGSGGMSRGRGRRDNELIGQTVRISQGPYKGYIGVVKDATESTARVELHSTCQTISVDRQRLTTVGSRRPGGMTSTYGRTPMYGSQTPMYGSGSRTPMYGSQTPLQDGSRTPHYGSQTPLHDGSRTPAQSGAWDPNNPNTPSRAEEEYEYAFDDEPTPSPQAYGGTPNPQTPGYPDPSSPQVNPQYNPQTPGTPAMYNTDQFSPYAAPSPQGSYQPSPSPQSYHQVAPSPAGYQNTHSPASYHPTPSPMAYQASPSPSPVGYSPMTPGAPSPGGYNPHTPGSGIEQNSSDWVTTDIQVKVRDTYLDTQVVGQTGVIRSVTGGMCSVYLKDSEKVVSISSEHLEPITPTKNNKVKVILGEDREATGVLLSIDGEDGIVRMDLDEQLKILNLRFLGKLLEAKETAAAKFERQHMDSSTSAA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	TEMPLATE DNA (191-MER)
分子量 formula_weight	60870.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	T

ATCAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACACCCAAGACACCAGGCACGAGACAGAAAAAAACAACGAAAACGGCCACCACCCAAACACACCAAACACAAGAGCTAATTGACTGACGTAAGC

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	NON-TEMPLATE DNA (180-MER)
分子量 formula_weight	61381.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	N

GCTTACGTCAGTCTGGCCATCTTTGTGTTTGGTGTGTTTGGGTGGTGGCCGTTTTCGTTGTTTTTTTCTGTCTCGTGCCTGGTGTCTTGGGTGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTGAT

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	;RNA (5'-R(PAPAPUPUPAPGPCPUPCPUPUPGPUPGPUPU)-3') ;
分子量 formula_weight	5038.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	P

AAUUAGCUCUUGUGUU

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Negative elongation factor A
分子量 formula_weight	57343.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MASMRESDTGLWLHNKLGATDELWAPPSIASLLTAAVIDNIRLCFHGLSSAVKLKLLLGTLHLPRRTVDEMKGALMEIIQLASLDSDPWVLMVADILKSFPDTGSLNLELEEQNPNVQDILGELREKVGECEASAMLPLECQYLNKNALTTLAGPLTPPVKHFQLKRKPKSATLRAELLQKSTETAQQLKRSAGVPFHAKGRGLLRKMDTTTPLKGIPKQAPFRSPTAPSVFSPTGNRTPIPPSRTLLRKERGVKLLDISELDMVGAGREAKRRRKTLDAEVVEKPAKEETVVENATPDYAAGLVSTQKLGSLNNEPALPSTSYLPSTPSVVPASSYIPSSETPPAPSSREASRPPEEPSAPSPTLPAQFKQRAPMYNSGLSPATPTPAAPTSPLTPTTPPAVAPTTQTPPVAMVAPQTQAPAQQQPKKNLSLTREQMFAAQEMFKTANKVTRPEKALILGFMAGSRENPCQEQGDVIQIKLSEHTEDLPKADGQGSTTMLVDTVFEMNYATGQWTRFKKYKPMTNVS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	Negative elongation factor B
分子量 formula_weight	65779.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MFAGLQDLGVANGEDLKETLTNCTEPLKAIEQFQTENGVLLPSLQSALPFLDLHGTPRLEFHQSVFDELRDKLLERVSAIASEGKAEERYKKLEDLLEKSFSLVKMPSLQPVVMCVMKHLPKVPEKKLKLVMADKELYRACAVEVKRQIWQDNQALFGDEVSPLLKQYILEKESALFSTELSVLHNFFSPSPKTRRQGEVVQRLTRMVGKNVKLYDMVLQFLRTLFLRTRNVHYCTLRAELLMSLHDLDVGEICTVDPCHKFTWCLDACIRERFVDSKRARELQGFLDGVKKGQEQVLGDLSMILCDPFAINTLALSTVRHLQELVGQETLPRDSPDLLLLLRLLALGQGAWDMIDSQVFKEPKMEVELITRFLPMLMSFLVDDYTFNVDQKLPAEEKAPVSYPNTLPESFTKFLQEQRMACEVGLYYVLHITKQRNKNALLRLLPGLVETFGDLAFGDIFLHLLTGNLALLADEFALEDFCSSLFDGFFLTASPRKENVHRHALRLLIHLHPRVAPSKLEALQKALEPTGQSGEAVKELYSQLGEKLEQLDHRKPSPAQAAETPALELPLPSVPAPAPL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	Negative elongation factor C/D
分子量 formula_weight	68547.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

MAGAVPGAIMDEDYYGSAAEWGDEADGGQQEDDSGEGEDDAEVQQECLHKFSTRDYIMEPSIFNTLKRYFQAGGSPENVIQLLSENYTAVAQTVNLLAEWLIQTGVEPVQVQETVENHLKSLLIKHFDPRKADSIFTEEGETPAWLEQMIAHTTWRDLFYKLAEAHPDCLMLNFTVKLISDAGYQGEITSVSTACQQLEVFSRVLRTSLATILDGGEENLEKNLPEFAKMVCHGEHTYLFAQAMMSVLAQEEQGGSAVRRIAQEVQRFAQEKGHDASQITLALGTAASYPRACQALGAMLSKGALNPADITVLFKMFTSMDPPPVELIRVPAFLDLFMQSLFKPGARINQDHKHKYIHILAYAASVVETWKKNKRVSINKDELKSTSKAVETVHNLCCNENKGASELVAELSTLYQCIRFPVVAMGVLKWVDWTVSEPRYFQLQTDHTPVHLALLDEISTCHQLLHPQVLQLLVKLFETEHSQLDVMEQLELKKTLLDRMVHLLSRGYVLPVVSYIRKCLEKLDTDISLIRYFVTEVLDVIAPPYTSDFVQLFLPILENDSIAGTIKTEGEHDPVTEFIAHCKSNFIMVNGSSGSSGLEVLFQGPHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	Negative elongation factor E
分子量 formula_weight	45852.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MDYKDDDDKLEVLFQGPGSSGSSGMLVIPPGLSEEEEALQKKFNKLKKKKKALLALKKQSSSSTTSQGGVKRSLSEQPVMDTATATEQAKQLVKSGAISAIKAETKNSGFKRSRTLEGKLKDPEKGPVPTFQPFQRSISADDDLQESSRRPQRKSLYESFVSSSDRLRELGPDGEEAEGPGAGDGPPRSFDWGYEERSGAHSSASPPRSRSRDRSHERNRDRDRDRERDRDRDRDRDRERDRDRDRDRDRDRERDRDRERDRDRDREGPFRRSDSFPERRAPRKGNTLYVYGEDMTPTLLRGAFSPFGNIIDLSMDPPRNCAFVTYEKMESADQAVAELNGTQVESVQLKVNIARKQPMLDAATGKSVWGSLAVQNSPKGCHRDKRTQIVYSDDVYKENLVDGF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 22 Entity 22 polymer

描述 description	Histone H3.3
分子量 formula_weight	15361.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,e

MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 23 Entity 23 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11394.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b,f

MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 24 Entity 24 polymer

描述 description	Histone H2A type 1-B/E
分子量 formula_weight	14165.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c,g

MSGRGKQGGKARAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYSERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 25 Entity 25 polymer

描述 description	Histone H2B type 1-J
分子量 formula_weight	13935.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d,h

MPEPAKSAPAPKKGSKKAVTKAQKKDGKKRKRSRKESYSIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMGIMNSFVNDIFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	22970

Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体