Alpha-synuclein
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 | 链 G； UniProt 1–140 链 H； UniProt 1–140 链 I； UniProt 1–140 链 J； UniProt 1–140 链 K； UniProt 1–140 链 L； UniProt 1–140 链 M； UniProt 1–140 链 N； UniProt 1–140 链 O； UniProt 1–140 链 P； UniProt 1–140 | 未记录 | 无其他共同聚合物 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；20 mM Tris, 150 mM NaCl, pH 7.5, 1 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE | 分辨率 3.13 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9QYN | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10XU Structure of amplified aSyn filament by using seed amplification assay (SAA) from MSA patient CSF. 提交 2026-02-11 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
35–101（67 aa）
链 B
35–101（67 aa）
链 C
35–101（67 aa）
链 D
35–101（67 aa）
链 E
35–101（67 aa）
链 U
35–101（67 aa）
链 W
35–101（67 aa）
链 X
35–101（67 aa）
链 Y
35–101（67 aa）
链 Z
35–101（67 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 1XQ8 Human micelle-bound alpha-synuclein 提交 2004-10-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4；298.2 K；离子强度（mmCIF原始值）115；压力 1
NMR样品组成
0.5 MM ALPHA-SYNUCLEIN 2H, 13C, 15N
|
分辨率未提供 |
| 2JN5 Solution Structure of a Dodecapeptide from Alpha-Synuclein Bound with Synphilin-1 提交 2006-12-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–12（12 aa）
片段：residues 1-12
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM entity, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.1 mM Synphilin-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KKW SLAS-micelle bound alpha-synuclein 提交 2009-06-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
实验方法未声明
NMR测量条件
pH 7.4；298.2 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 AMBIENT
NMR样品组成
0.75 MM [U-100% 13C, U-100% 15N, U-80% 2H] ALPHA-SYNUCLEIN, 75 MM SODIUM LAUROYL SARCOSINATE, 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2M55 NMR structure of the complex of an N-terminally acetylated alpha-synuclein peptide with calmodulin 提交 2013-02-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
1–19（19 aa）
片段：UNP residues 1-19
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.36；310 K；压力 ambient
NMR样品组成
600 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] calmodulin, 600 uM alpha-synuclein, 50 mM MES, 100 mM potassium chloride, 3 mM calcium ion, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
700 uM [U-13C; U-15N]-Met,Val,Phe,Gly,Leu,Ala alpha-synuclein, 700 uM calmodulin, 50 mM MES, 100 mM potassium chloride, 3 mM calcium ion, 0.1% sodium azide, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
150 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] calmodulin, 150 uM alpha-synuclein, 50 mM MES, 100 mM potassium chloride, 3 mM calcium ion, 10 mg/mL Pf1 phage, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N0A Atomic-resolution structure of alpha-synuclein fibrils 提交 2015-03-04 | 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7；压力 ambient
NMR样品组成
66% [U-100% 13C; U-100% 15N] alpha-synuclein, 34% H2O, Rehydrated Fibril | Rehydrated Fibril
NMR样品组成
66% [U-100% 13C 1,3-Glycerol; U-100% 15N] alpha-synuclein, 34% H2O, Rehydrated Fibril | Rehydrated Fibril
NMR样品组成
66% [U-100% 13C 2-Glycerol; U-100% 15N] alpha-synuclein, 34% H2O, Rehydrated Fibril | Rehydrated Fibril
NMR样品组成
66% [U-25% 13C; U-25% 15N] alpha-synuclein, 34% H2O, Rehydrated Fibril | Rehydrated Fibril
NMR样品组成
66% [U-25% 13C 1,3-Glycerol; natural abundance N][natural abundance C13, U-50% N15] alpha-synuclein, 34% H2O, Rehydrated Fibril | Rehydrated Fibril
NMR样品组成
66% [U-25% 13C 2-Glycerol; natural abundance N][natural abundance C13, U-50% N15] alpha-synuclein, 34% H2O, Rehydrated Fibril | Rehydrated Fibril
NMR样品组成
90% Adamantane, 10% KBr, Dry | Dry
|
分辨率未提供 |
| 2X6M Structure of a single domain camelid antibody fragment in complex with a C-terminal peptide of alpha-synuclein 提交 2010-02-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
132–140（9 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT OF ALPHA-SYNUCLEIN, RESIDUES 132-140
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；25% PEG6000, 100 MM HEPES PH 7.5, 100 MM LICL
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.203 |
| 3Q25 Crystal structure of human alpha-synuclein (1-19) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
1–19（19 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；2.2 M AMMONIUM SULFATE, 20% (w/v) GLYCEROL, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.196 |
| 3Q25 Crystal structure of human alpha-synuclein (1-19) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–19（19 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 20 GOL GLYCEROL × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；2.2 M AMMONIUM SULFATE, 20% (w/v) GLYCEROL, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.196 |
| 3Q26 Cyrstal structure of human alpha-synuclein (10-42) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
10–42（33 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；0.2M tri-lithium citrate, 2.2 M ammonium sulfate, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.183 |
| 3Q27 Cyrstal structure of human alpha-synuclein (32-57) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
32–57（26 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；290 K；0.1M bicine pH 9.0, 2.4 M ammonium sulfate, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.156 |
| 3Q28 Cyrstal structure of human alpha-synuclein (58-79) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
58–79（22 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；290 K；0.1M BICINE pH 9.0, 3.2 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.173 |
| 3Q29 Cyrstal structure of human alpha-synuclein (1-19) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–19（19 aa）
链 C
1–19（19 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 11 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；0.1M TRIS pH 8.0, 2.4 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.232 |
| 3Q29 Cyrstal structure of human alpha-synuclein (1-19) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–19（19 aa）
链 C
1–19（19 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 11 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；0.1M TRIS pH 8.0, 2.4 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.232 |
| 4BXL Structure of alpha-synuclein in complex with an engineered binding protein 提交 2013-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
35–56（22 aa）
片段：RESIDUES 35-56
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.07；压力 1.0
NMR测量条件
pH 7.4；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.07；压力 1.0
NMR样品组成
93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 4R0U Tgvtava, an amyloid forming segment from alpha synuclein, residues 72-78 提交 2014-08-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
72–78（7 aa）
片段：UNP RESIDUES 72-78
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M magnesium formate, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.217 |
| 4R0W Vvtgvta, an amyloid forming segment from alpha synuclein, residues 70-76 提交 2014-08-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
70–76（7 aa）
片段：UNP RESIDUES 70-76
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；isopropanol, sodium cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.274 |
| 4RIK Amyloid forming segment, AVVTGVTAV, from the NAC domain of Parkinson's disease protein alpha-synuclein, residues 69-77 提交 2014-10-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
69–77（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；273 K；0.9M Ammonium Phosphate, 0.1M Sodium Acetate, pH 4.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 273K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.221 |
| 4RIL Structure of the amyloid forming segment, GAVVTGVTAVA, from the NAC domain of Parkinson's disease protein alpha-synuclein, residues 68-78, determined by electron diffraction 提交 2014-10-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
68–78（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
X-ray结晶条件
batch crystallization；pH 4；310 K；1 mg of synthetic peptide GAVVTGVTAVA was dissolved in 1 ml of sterile water and shaken overnight in an orbital mixing plate, pH 4.0, batch crystallization, temperature 310K
|
分辨率 1.43 Å R-free 0.275 |
| 4ZNN MicroED structure of the segment, GVVHGVTTVA, from the A53T familial mutant of Parkinson's disease protein, alpha-synuclein residues 47-56 提交 2015-05-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
47–56（10 aa）
|
突变：A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7；310 K；1 mg of synthetic peptide GVVHGVTTVA was dissolved in 200 microliters of 50 mM phosphate buffer pH 7.0 and 0.1% w/v DMSO and shaken overnight in an orbital mixing plate
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.282 |
| 6A6B cryo-em structure of alpha-synuclein fiber 提交 2018-06-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 B
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 C
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 D
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 E
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 F
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 G
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 H
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 I
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 J
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 K
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 L
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 6CU7 Alpha Synuclein fibril formed by full length protein - Rod Polymorph 提交 2018-03-23 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force: 1
blot time: 4s
|
分辨率 3.50 Å |
| 6CU8 Alpha Synuclein fibril formed by full length protein - Twister Polymorph 提交 2018-03-23 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force: 1
blot time: 4s
|
分辨率 3.60 Å |
| 6H6B Structure of alpha-synuclein fibrils 提交 2018-07-26 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–121（121 aa）
链 B
1–121（121 aa）
链 C
1–121（121 aa）
链 D
1–121（121 aa）
链 E
1–121（121 aa）
链 F
1–121（121 aa）
链 G
1–121（121 aa）
链 H
1–121（121 aa）
链 I
1–121（121 aa）
链 J
1–121（121 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6I42 Structure of the alpha-Synuclein PreNAC/Cyclophilin A-complex 提交 2018-11-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
48–60（13 aa）
片段：UNP residues 48-60
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；1.93 M tri-ammonium citrate, pH 7.0
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.178 |
| 6L1T Cryo-EM structure of phosphorylated Tyr39 a-synuclein amyloid fibril 提交 2019-09-30 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 6L1U Cryo-EM structure of phosphorylated Tyr39 alpha-synuclein amyloid fibril 提交 2019-09-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 6L4S cryo-em structure of alpha-synuclein fiber mutation type E46K 提交 2019-10-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
45–99（55 aa）
链 B
45–99（55 aa）
链 C
45–99（55 aa）
链 D
45–99（55 aa）
链 E
45–99（55 aa）
链 F
45–99（55 aa）
|
突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 6LRQ Cryo-EM structure of A53T alpha-synuclein amyloid fibril 提交 2020-01-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 6OSJ Cryo-EM structure of the N-terminally acetylated full length alpha-synuclein fibrils (Ac1-140) 提交 2019-05-01 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6OSL Cryo-EM structure of the N-terminally acetylated C-terminal Alpha-synuclein truncation Ac1-122 提交 2019-05-01 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6OSM Cryo-EM structure of the N-terminally acetylated C-terminal Alpha-synuclein truncation Ac1-103 提交 2019-05-01 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6PEO Cryo-EM structure of alpha-synuclein H50Q Narrow Fibril 提交 2019-06-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6PES Cryo-EM structure of alpha-synuclein H50Q Wide Fibril 提交 2019-06-20 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 V
1–140（140 aa）
链 W
1–140（140 aa）
链 X
1–140（140 aa）
链 Y
1–140（140 aa）
链 Z
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6RT0 cryo-em structure of alpha-synuclein fibril polymorph 2A 提交 2019-05-22 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL aliquots were applied onto second glow-discharged 300 mesh copper Quantifoil grids R2 1
|
分辨率 3.10 Å |
| 6RTB cryo-em structure of alpha-synuclein fibril polymorph 2B 提交 2019-05-22 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL aliquots were applied onto second glow-discharged 300 mesh copper Quantifoil grids R2 1
|
分辨率 3.46 Å |
| 6SST cryo-em structure of alpha-synuclein fibril polymorph 2B 提交 2019-09-09 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL aliquots were applied onto second glow-discharged 300 mesh copper Quantifoil grids R2 1
|
分辨率 3.40 Å |
| 6SSX cryo-em structure of alpha-synuclein fibril polymorph 2A 提交 2019-09-09 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL aliquots were applied onto second glow-discharged 300 mesh copper Quantifoil grids R2 1
|
分辨率 2.98 Å |
| 6UFR Structure of recombinantly assembled E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2019-09-24 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 6XYO Multiple system atrophy Type I alpha-synuclein filament 提交 2020-01-30 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 6XYP Multiple system atrophy Type II-1 alpha-synuclein filament 提交 2020-01-30 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 6XYQ Multiple system atrophy Type II-2 alpha-synuclein filament 提交 2020-01-30 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 7C1D Cryo-EM structure of the hE46K cross-seeded hWT alpha-synuclein fibril 提交 2020-05-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7E0F CryoEM structure of G51D alpha-synuclein amyloid fibril 提交 2021-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
突变：G51D 突变：G51D 突变：G51D 突变：G51D 突变：G51D 突变：G51D | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.02 Å |
| 7L7H Alpha-synuclein fibrils 提交 2020-12-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7LC9 Cryo-EM structure of the N-terminal alpha-synuclein truncation 41-140 提交 2021-01-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
41–140（100 aa）
链 B
41–140（100 aa）
链 C
41–140（100 aa）
链 D
41–140（100 aa）
链 E
41–140（100 aa）
链 F
41–140（100 aa）
链 G
41–140（100 aa）
链 H
41–140（100 aa）
链 I
41–140（100 aa）
链 J
41–140（100 aa）
链 K
41–140（100 aa）
链 L
41–140（100 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7NCA Type 1A alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 2 提交 2021-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LMB vitrobot IV
|
分辨率 3.47 Å |
| 7NCA Type 1A alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 2 提交 2021-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LMB vitrobot IV
|
分辨率 3.47 Å |
| 7NCG Type 2A alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 2 提交 2021-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LMB vitrobot IV
|
分辨率 3.43 Å |
| 7NCG Type 2A alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 2 提交 2021-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LMB vitrobot IV
|
分辨率 3.43 Å |
| 7NCH Type 1B alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1 提交 2021-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LMB vitrobot IV
|
分辨率 3.84 Å |
| 7NCH Type 1B alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1 提交 2021-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LMB vitrobot IV
|
分辨率 3.84 Å |
| 7NCI Type 2B alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1 提交 2021-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LMB vitrobot IV
|
分辨率 3.55 Å |
| 7NCI Type 2B alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1 提交 2021-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LMB vitrobot IV
|
分辨率 3.55 Å |
| 7NCJ Type 2AB alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1 提交 2021-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LMB vitrobot IV
|
分辨率 4.23 Å |
| 7NCJ Type 2AB alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1 提交 2021-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LMB vitrobot IV
|
分辨率 4.23 Å |
| 7NCK Type 3 alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 5 提交 2021-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LMB vitrobot IV
|
分辨率 3.18 Å |
| 7OZG PMCA-amplified alpha-synuclein fibril polymorph, Parkinson's Disease patient-derived seeds 提交 2021-06-28 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7OZH PMCA-amplified alpha-synuclein fibril polymorph, Multiple System Atrophy patient-derived seeds 提交 2021-06-28 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.02 Å |
| 7STX Cryo-EM structure of human NatB in complex with CoA-Alpha-Synuclein 提交 2021-11-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
1–5（5 aa）
片段：UNP residues 1-5
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | COA COENZYME A × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 7UAK Structure of recombinantly assembled A53E alpha-synuclein fibrils 提交 2022-03-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
突变：A53E 突变：A53E 突变：A53E 突变：A53E 突变：A53E 突变：A53E | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
| 7V47 Type 1A alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a preclinical Parkinson's disease patient 提交 2021-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7V48 Type 1D alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a postmortal Parkinson's disease patient 提交 2021-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7V49 Type 4 alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a postmortal Parkinson's disease patient 提交 2021-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7V4A Heparin-induced alpha-synuclein fibrils polymorph 1 提交 2021-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7V4B Heparin-induced alpha-synuclein fibrils polymorph 3 提交 2021-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7V4C Heparin-induced alpha-synuclein fibrils polymorph 4 提交 2021-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7V4D Heparin-remodelled alpha-synuclein fibrils 提交 2021-08-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7WMM alpha-synuclein fibril-F0502B complex 提交 2022-01-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 1KI 2-bromanyl-4-[(~{E})-2-[6-[2-(2-fluoranylethoxy)ethyl-methyl-amino]-5-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl]ethenyl]phenol × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7WNZ CryoEM structure of human alpha-synuclein A53T fibril 提交 2022-01-20 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
36–100（65 aa）
链 B
36–100（65 aa）
链 C
36–100（65 aa）
链 D
36–100（65 aa）
链 E
36–100（65 aa）
链 F
36–100（65 aa）
链 G
36–100（65 aa）
链 H
36–100（65 aa）
链 I
36–100（65 aa）
链 J
36–100（65 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7WO0 CryoEM structure of human alpha-synuclein A53T fibril induced by calcium ions 提交 2022-01-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 A
35–99（65 aa）
链 B
35–99（65 aa）
链 C
35–99（65 aa）
链 D
35–99（65 aa）
链 E
35–99（65 aa）
链 F
35–99（65 aa）
链 G
35–99（65 aa）
链 O
35–99（65 aa）
链 P
35–99（65 aa）
链 Q
35–99（65 aa）
链 R
35–99（65 aa）
链 S
35–99（65 aa）
链 T
35–99（65 aa）
链 U
35–99（65 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7XJX The cryo-EM structure of Fe3+ induced alpha-syn fibril. 提交 2022-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7XO0 Minor polymorph inalpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a mid-to-late stage (mid-PD-1) Parkinson's disease patient 提交 2022-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7XO1 Major polymorph in alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a mid-to-late stage (mid-PD-1) Parkinson's disease patient 提交 2022-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7XO2 Minor polymorph in alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a mid-to-late stage (mid-PD-4) Parkinson's disease patient 提交 2022-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7XO3 Type 1C alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a mid-to-late stage (mid-PD-4) Parkinson's disease patient 提交 2022-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7YK2 Cryo-EM structure of Apo-alpha-syn fibril 提交 2022-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7YK8 Cryo-EM structure of dLAG3-alpha-syn fibril 提交 2022-07-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7YNF CCA-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | V79 copper;trisodium;18-(2-carboxylatoethyl)-20-(carboxylatomethyl)-12-ethenyl-7-ethyl-3,8,13,17-tetramethyl-17,18-dihydroporphyrin-21,23-diide-2-carboxylate × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7YNG CR-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7YNL EB-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
|
未记录 | IZ8 4-azanyl-6-[[4-[4-[(~{E})-(8-azanyl-1-oxidanyl-5,7-disulfo-naphthalen-2-yl)diazenyl]-3-methyl-phenyl]-2-methyl-phenyl]diazenyl]-5-oxidanyl-naphthalene-1,3-disulfonic acid × 16 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7YNM ThT-bound alpha-synuclein fibrils conformation 1 提交 2022-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7YNN ThT-bound alpha-synuclein fibrils conformation 2 提交 2022-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7YNO PiB-bound alpha-synuclein fibrils conformation 1 提交 2022-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | IZV 2-[4-(methylamino)phenyl]-1,3-benzothiazol-6-ol × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7YNP BF227-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | IZM 5-[(~{E})-2-(6-methoxy-1,3-benzoxazol-2-yl)ethenyl]-~{N},~{N}-dimethyl-1,3-thiazol-2-amine × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7YNQ PiB-bound alpha-synuclein fibrils conformation 2 提交 2022-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | IZV 2-[4-(methylamino)phenyl]-1,3-benzothiazol-6-ol × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7YNR C05-03-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7YNS SIL5-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7YNT pFTAA-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8A4L Lipidic alpha-synuclein fibril - polymorph L2A 提交 2022-06-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
链 P
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.68 Å |
| 8A9L Cryo-EM structure of alpha-synuclein filaments from Parkinson's disease and dementia with Lewy bodies 提交 2022-06-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：Trimeric |
链 A
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 8ADS Lipidic alpha-synuclein fibril - polymorph L2B 提交 2022-07-11 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |
| 8ADU Lipidic alpha-synuclein fibril - polymorph L1A 提交 2022-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å |
| 8ADV Lipidic alpha-synuclein fibril - polymorph L1B 提交 2022-07-11 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.98 Å |
| 8ADW Lipidic alpha-synuclein fibril - polymorph L1C 提交 2022-07-11 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 8AEX Lipidic alpha-synuclein fibril - polymorph L3A 提交 2022-07-14 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 8BQV Cryo-EM structure of alpha-synuclein singlet filament from Juvenile-onset synucleinopathy 提交 2023-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：Decameric |
链 A
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.00 Å |
| 8BQW Cryo-EM structure of alpha-synuclein filaments doublet from Juvenile-onset synucleinopathy 提交 2023-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：Eicosameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 8CE7 Type1 alpha-synuclein filament assembled in vitro by wild-type and mutant (7 residues insertion) protein 提交 2023-02-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：Hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8CEB Type2 alpha-synuclein filament assembled in vitro by wild-type and mutant (7 residues insertion) protein 提交 2023-02-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8CYR Alpha-synuclein fibril from spontaneous control 提交 2022-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8CYS CryoEM structures of amplified alpha-synuclein fibril class B type II with extended core from DLB case I 提交 2022-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8CYT CryoEM structures of amplified alpha-synuclein fibril class A type I with extended core from DLB case I 提交 2022-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8CYV CryoEM structures of amplified alpha-synuclein fibril class B mixed type I/II with extended core from DLB case II 提交 2022-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8CYW CryoEM structures of amplified alpha-synuclein fibril class B type I with compact core from DLB case III 提交 2022-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8CYX CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class A type I with compact core from DLB case III 提交 2022-05-24 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8CYY CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class B mixed type I/II with extended core from DLB case V 提交 2022-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8CZ0 CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class B type I with extended core from DLB case VII 提交 2022-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8CZ1 CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class B type II with extended core from DLB case VII 提交 2022-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8CZ2 CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class A type I with extended core from DLB case VII 提交 2022-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8CZ3 CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class B type I with extended core from DLB case X 提交 2022-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8CZ6 CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class A type I with extended core from DLB case X 提交 2022-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8FPT STRUCTURE OF ALPHA-SYNUCLEIN FIBRILS DERIVED FROM HUMAN LEWY BODY DEMENTIA TISSUE 提交 2023-01-05 | 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7.6；273 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NACL；压力 AMBIENT
NMR样品组成
66 % [U-100% 13C; U-100% 15N] ALPHA-SYNUCLEIN, 34% H2O | 34% H2O
NMR样品组成
66 % [U-100% 2H; U-100% 13C; U-100% 15N] ALPHA-SYNUCLEIN, 34% H2O, BACK-EXCHANGED IN 99.8% D2O | 34% H2O, BACK-EXCHANGED IN 99.8% D2O
NMR样品组成
20 % [U-25% 2-13C GLYCEROL; U-100% 15N] labelled ALPHA-SYNUCLEIN, 80 % ALPHA-SYNUCLEIN, H2O | H2O
|
分辨率未提供 |
| 8G0L Semi-synthetic CoA-alpha-Synuclein Constructs Trap N-terminal Acetyltransferase NatB for Binding Mechanism Studies 提交 2023-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
1–5（5 aa）
片段：UNP residues 1-5
|
未记录 | CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 8GF7 Cryo-EM structure of serine 87 O-GlcNAc-modified alpha-synuclein fibrils 提交 2023-03-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
7–96（90 aa）
链 B
7–96（90 aa）
链 C
7–96（90 aa）
链 D
7–96（90 aa）
链 E
7–96（90 aa）
链 F
7–96（90 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；normal PBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 8H03 Major polymorph in alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a preclinical Parkinson's disease patient 提交 2022-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8H04 Major polymorph in alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a postmortal Parkinson's disease patient 提交 2022-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8H05 Minor polymorph in alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a postmortal Parkinson's disease patient 提交 2022-09-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8HZB Formed alpha-synuclein fibrils after incubation with heparin for 1 hour (Hep-remod-1) 提交 2023-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8HZC Formed alpha-synuclein fibrils after incubation with heparin for 1 hour (Hep-remod-2) 提交 2023-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8HZS Formed alpha-synuclein fibrils after incubation with heparin for 3 days (Hep-remod-3) 提交 2023-01-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8JEX Cryo-EM structure of alpha-synuclein gS87 fibril 提交 2023-05-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 P
1–140（140 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8JEY Cryo-EM structure of alpha-synuclein pS87 fibril 提交 2023-05-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8JJV Structure of truncated form of nanobody in complex with alpha-synuclein peptide 提交 2023-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
43–56（14 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M BIS-TRIS pH 5.5, 2.0M ammonium sulfate
|
分辨率 1.23 Å R-free 0.170 |
| 8JLY Structure of nanobody in complex with alpha-synuclein peptide 提交 2023-06-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
43–56（14 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 2.0M ammonium sulfate
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.186 |
| 8OG0 Crystal structure of MJF14-6-4-2 Fab fragment in complex with epitope peptide 提交 2023-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 P
136–140（5 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；Sitting droplets were set up by mixing 1 ul of Fab fragments, 0.5 ul of peptide (1 mg/ml in 20 mM tris-HCl) and 1 ul crystallization buffer (24% PEG 6000, 0.1M Na-citrate pH 5.0).
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.231 |
| 8OQI Cryo-EM structure of the wild-type alpha-synuclein fibril. 提交 2023-04-12 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8PIX Cryo EM structure of the type 3C polymorph of alpha-synuclein at low pH. 提交 2023-06-22 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.41 Å |
| 8PJO Cryo EM structure of the type 3D polymorph of alpha-synuclein E46K mutant at low pH. 提交 2023-06-23 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K | CL CHLORIDE ION × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.31 Å |
| 8PK2 Cryo EM structure of the type 1m polymorph of alpha-synuclein 提交 2023-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 8PK4 Cryo EM structure of the type 5A polymorph of alpha-synuclein. 提交 2023-06-24 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8QPZ CryoEM structure of recombinant DeltaN7 alpha-synuclein in PBS 提交 2023-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric |
链 A
8–140（133 aa）
链 B
8–140（133 aa）
链 C
8–140（133 aa）
链 D
8–140（133 aa）
链 E
8–140（133 aa）
链 F
8–140（133 aa）
链 G
8–140（133 aa）
链 H
8–140（133 aa）
链 I
8–140（133 aa）
链 J
8–140（133 aa）
链 K
8–140（133 aa）
链 L
8–140（133 aa）
|
突变：deltaN7 (methionine kept for expression) 突变：deltaN7 (methionine kept for expression) 突变：deltaN7 (methionine kept for expression) 突变：deltaN7 (methionine kept for expression) 突变：deltaN7 (methionine kept for expression) 突变：deltaN7 (methionine kept for expression) 突变：deltaN7 (methionine kept for expression) 突变：deltaN7 (methionine kept for expression) 突变：deltaN7 (methionine kept for expression) 突变：deltaN7 (methionine kept for expression) 突变：deltaN7 (methionine kept for expression) 突变：deltaN7 (methionine kept for expression) | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 8.1 mM Na2HPO4 and 1.5 mM KH2PO4; pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 8RI9 Late alpha-Synuclein fibril structure from liquid-liquid phase separations. 提交 2023-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8RQM Alpha-synuclein amyloid fibrils 提交 2024-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8RRR Alpha-synuclein amyloid fibril 提交 2024-01-23 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8X7B ThT-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8X7L EB-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | IZ8 4-azanyl-6-[[4-[4-[(~{E})-(8-azanyl-1-oxidanyl-5,7-disulfo-naphthalen-2-yl)diazenyl]-3-methyl-phenyl]-2-methyl-phenyl]diazenyl]-5-oxidanyl-naphthalene-1,3-disulfonic acid × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8X7M CR-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | CGO sodium 3,3'-(1E,1'E)-biphenyl-4,4'-diylbis(diazene-2,1-diyl)bis(4-aminonaphthalene-1-sulfonate) × 16 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8X7O PiB-bound E46K mutanted alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-24 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K 突变：E46K | IZV 2-[4-(methylamino)phenyl]-1,3-benzothiazol-6-ol × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8X7P CCA-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | V79 copper;trisodium;18-(2-carboxylatoethyl)-20-(carboxylatomethyl)-12-ethenyl-7-ethyl-3,8,13,17-tetramethyl-17,18-dihydroporphyrin-21,23-diide-2-carboxylate × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8X7Q pFTAA-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 3LS 3''',4'-bis(carboxymethyl)-2,2':5',2'':5'',2''':5''',2''''-quinquethiophene-5,5''''-dicarboxylic acid × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8X7R C05-03-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | Y9W 2-[(~{E})-4-[6-(methylamino)pyridin-3-yl]but-1-en-3-ynyl]-1,3-benzothiazol-6-ol × 20 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8XWD Croy-EM structure of alpha synuclein fibril with EGCG 提交 2024-01-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | KDH (2R,3R)-5,7-dihydroxy-2-(3,4,5-trihydroxyphenyl)-3,4-dihydro-2H-chromen-3-yl 3,4,5-trihydroxybenzoate × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8Y2P The cryo-EM structure of a-synuclein fibril in Tris buffer. 提交 2024-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8Y2Q The cryo-EM structure of spermine induced a-synuclein fibril in Tris buffer. 提交 2024-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8ZLI BTA-2-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2024-05-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
45–99（55 aa）
链 B
45–99（55 aa）
链 C
45–99（55 aa）
链 D
45–99（55 aa）
链 E
45–99（55 aa）
链 F
45–99（55 aa）
链 I
45–99（55 aa）
链 J
45–99（55 aa）
链 K
45–99（55 aa）
链 L
45–99（55 aa）
|
未记录 | A1L13 ~{N},~{N}-dimethyl-4-(6-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl)aniline × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8ZLO F0502B-bound E46K alpha-synuclein fibril 提交 2024-05-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric |
链 A
45–99（55 aa）
链 B
45–99（55 aa）
链 C
45–99（55 aa）
链 D
45–99（55 aa）
链 E
45–99（55 aa）
链 F
45–99（55 aa）
链 G
45–99（55 aa）
链 H
45–99（55 aa）
链 I
45–99（55 aa）
链 J
45–99（55 aa）
链 O
45–99（55 aa）
链 T
45–99（55 aa）
|
未记录 | 1KI 2-bromanyl-4-[(~{E})-2-[6-[2-(2-fluoranylethoxy)ethyl-methyl-amino]-5-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl]ethenyl]phenol × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8ZLP apo WT polymorph 5a alpha-synuclein fibril 提交 2024-05-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–98（98 aa）
链 B
1–98（98 aa）
链 C
1–98（98 aa）
链 F
1–98（98 aa）
链 G
1–98（98 aa）
链 H
1–98（98 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8ZMY F0502B-bound WT polymorph 5a alpha-synuclein fibril 提交 2024-05-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric |
链 A
1–98（98 aa）
链 B
1–98（98 aa）
链 C
1–98（98 aa）
链 D
1–98（98 aa）
链 E
1–98（98 aa）
链 F
1–98（98 aa）
链 G
1–98（98 aa）
链 H
1–98（98 aa）
链 I
1–98（98 aa）
链 J
1–98（98 aa）
链 K
1–98（98 aa）
链 L
1–98（98 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 1KI 2-bromanyl-4-[(~{E})-2-[6-[2-(2-fluoranylethoxy)ethyl-methyl-amino]-5-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl]ethenyl]phenol × 15 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8ZVY Alpha-Synuclein with H2a-H2b dimer complex structure. 提交 2024-06-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
121–140（20 aa）
链 D
121–140（20 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；100 mM Tris pH 8.0 and 10% PEG 8000.
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.220 |
| 8ZWH Heparin bound E46K alpha-synuclein fibril 提交 2024-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 8ZWI Chondroitin sulfate bound alpha-synuclein fibril 提交 2024-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8ZWJ Polyadenylic acid bound alpha-synuclein fibril Polymorph 1 提交 2024-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8ZWK Polyadenylic acid bound alpha-synuclein fibril Polymorph 2 提交 2024-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9C5R Structure of recombinantly assembled alpha-synuclein variant fibrils 提交 2024-06-06 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.61 Å |
| 9CD9 Structure of type II-2 alpha-synuclein filament from multiple system atrophy 提交 2024-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric |
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
链 P
1–140（140 aa）
链 Q
1–140（140 aa）
链 R
1–140（140 aa）
链 S
1–140（140 aa）
链 T
1–140（140 aa）
链 U
1–140（140 aa）
链 V
1–140（140 aa）
链 W
1–140（140 aa）
链 X
1–140（140 aa）
链 Y
1–140（140 aa）
链 Z
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Wait time 30s, blot time 7.5s
|
分辨率 3.20 Å |
| 9CDA Structure of type I-2 alpha-synuclein filament from multiple system atrophy 提交 2024-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：18-meric |
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
链 P
1–140（140 aa）
链 Q
1–140（140 aa）
链 R
1–140（140 aa）
链 S
1–140（140 aa）
链 T
1–140（140 aa）
链 U
1–140（140 aa）
链 V
1–140（140 aa）
链 W
1–140（140 aa）
链 X
1–140（140 aa）
链 Y
1–140（140 aa）
链 Z
1–140（140 aa）
链 a
1–140（140 aa）
链 b
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Wait time 30s, blot time 7.5s
|
分辨率 3.30 Å |
| 9CK3 Cryo-EM structure of in-vitro alpha-synuclein fibril 提交 2024-07-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.04 Å |
| 9CKK Cryo-EM structure of acetylated alpha-synuclein A53T fibril - polymorph A 提交 2024-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.21 Å |
| 9CKL Cryo-EM structure of acetylated alpha-synuclein A53T fibril - polymorph B 提交 2024-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2；Dulbecco's Phosphate Buffered Saline without calcium chloride and magnesium chloride
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.68 Å |
| 9CX6 Cryo-EM filament structure in FTLD-synuclein 提交 2024-07-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric |
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9CX6 Cryo-EM filament structure in FTLD-synuclein 提交 2024-07-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9D5C Cryo-EM structure of serine 87 O-GlcNAc-modified alpha-synuclein fibrils 提交 2024-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–96（96 aa）
链 B
1–96（96 aa）
链 C
1–96（96 aa）
链 F
1–96（96 aa）
链 G
1–96（96 aa）
链 H
1–96（96 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；normal PBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 9E8U (Apo)Alpha-synuclein fibril structures from MSA patient brain 提交 2024-11-06 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30mM Tris-HCl, pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9E8V Complex fibril structure of MSA alpha-synuclein with CNS-11g at 4 hours 提交 2024-11-06 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | A1BGB 2-(4-benzyl-1-oxophthalazin-2(1H)-yl)-N-(2,6-dimethylphenyl)acetamide × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30mM Tris-HCl, pH 7.4, with 1% DMSO
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9E8W Complex fibril structure of MSA alpha-synuclein with CNS-11g at 6 hours 提交 2024-11-06 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | A1BGB 2-(4-benzyl-1-oxophthalazin-2(1H)-yl)-N-(2,6-dimethylphenyl)acetamide × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30mM Tris-HCl, pH 7.4, with 1% DMSO
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9E8X Complex fibril structure of MSA alpha-synuclein with CNS-11g at 10 hours 提交 2024-11-06 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | A1BGB 2-(4-benzyl-1-oxophthalazin-2(1H)-yl)-N-(2,6-dimethylphenyl)acetamide × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30mM Tris-HCl, pH 7.4, with 1% DMSO
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9E8Y Complex fibril structure of MSA alpha-synuclein with CNS-11g at 15 hours 提交 2024-11-06 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | A1BGB 2-(4-benzyl-1-oxophthalazin-2(1H)-yl)-N-(2,6-dimethylphenyl)acetamide × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；30mM Tris-HCl, pH 7.4, with 1% DMSO
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9E9X Cryo-EM structure of alpha-synuclein filaments derived from the temporal cortex of the case of atypical multiple system atrophy 提交 2024-11-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9EUU Structure of recombinant alpha-synuclein fibrils 1B capable of seeding GCIs in vivo 提交 2024-03-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：18-meric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
链 P
1–140（140 aa）
链 Q
1–140（140 aa）
链 R
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；NaCl 100 mM, TRIS 20mM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.93 Å |
| 9FYP Cryo EM structure of the type 3B polymorph of alpha-synuclein at low pH. 提交 2024-07-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
链 P
1–140（140 aa）
链 Q
1–140（140 aa）
链 R
1–140（140 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.23 Å |
| 9HC6 The L2A-I alpha-synuclein fibril in the presence of MODAG-005 (short incubation) 提交 2024-11-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 9HC7 The L2A-II alpha-synuclein fibril in the presence of MODAG-005 (short incubation) 提交 2024-11-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.85 Å |
| 9HC8 The L2C alpha-synuclein fibril in the presence of MODAG-005 (short incubation) 提交 2024-11-08 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.82 Å |
| 9HC9 The L2A-I alpha-synuclein fibril in the presence of MODAG-005 (long incubation) 提交 2024-11-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 9HCA The L2A-II alpha-synuclein fibril in the presence of MODAG-005 (long incubation) 提交 2024-11-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9HCB The L2C alpha-synuclein fibril in the presence of MODAG-005 (long incubation) 提交 2024-11-08 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 9HGR In vitro grown WT Alpha-Synuclein Fibrils 提交 2024-11-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9HGS In vitro grown G14R Alpha-Synuclein Fibrils 提交 2024-11-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9HXA In vitro grown K58N Alpha-Synuclein Fibrils 提交 2025-01-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9IC7 Cryo-EM structure of alpha-synuclein fibrils formed in artificial cerebrospinal fluid (aCSF) 提交 2025-02-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric |
链 a
1–140（140 aa）
链 b
1–140（140 aa）
链 c
1–140（140 aa）
链 d
1–140（140 aa）
链 e
1–140（140 aa）
链 f
1–140（140 aa）
链 g
1–140（140 aa）
链 h
1–140（140 aa）
链 i
1–140（140 aa）
链 j
1–140（140 aa）
链 k
1–140（140 aa）
链 l
1–140（140 aa）
链 m
1–140（140 aa）
链 n
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.33；Once all components were mixed together, the pH was adjusted by supplementing 1.6 microliters of 25% HCl to yield pH of 7.33.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9IJP Polyphosphate bound alpha-synuclein fibril 提交 2024-06-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | 7TT Tetraphosphate × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9JBY The cryo-EM structure of Ac-K58W_G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
37–98（62 aa）
链 B
37–98（62 aa）
链 C
37–98（62 aa）
链 D
37–98（62 aa）
链 E
37–98（62 aa）
链 F
37–98（62 aa）
|
突变：G51D,A53T,K58W 突变：G51D,A53T,K58W 突变：G51D,A53T,K58W 突变：G51D,A53T,K58W 突变：G51D,A53T,K58W 突变：G51D,A53T,K58W | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 9JC3 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T P1 a-syn fibril. 提交 2024-08-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
|
突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.39 Å |
| 9JC4 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T P2 a-syn fibril. 提交 2024-08-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
|
突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 9JC5 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T P3 a-syn fibril. 提交 2024-08-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 9JD7 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-08-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 9JD8 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T P5 a-syn fibril. 提交 2024-08-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
|
突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.86 Å |
| 9JDK The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T P6 a-syn fibril. 提交 2024-08-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
37–99（63 aa）
链 B
37–99（63 aa）
链 C
37–99（63 aa）
链 D
37–99（63 aa）
链 E
37–99（63 aa）
链 F
37–99（63 aa）
|
突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.32 Å |
| 9JE2 The cryo-EM structure of Ac-K58N_G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-09-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
|
突变：K58N,G51D,A53T 突变：K58N,G51D,A53T 突变：K58N,G51D,A53T 突变：K58N,G51D,A53T 突变：K58N,G51D,A53T 突变：K58N,G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.06 Å |
| 9JE4 The cryo-EM structure of Ac-E57A_G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-09-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
|
突变：E57A,G51D,A53T 突变：E57A,G51D,A53T 突变：E57A,G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 9JE6 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T low salt a-syn fibril. 提交 2024-09-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9JE7 The cryo-EM structure of Ac-E57Q_G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-09-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
|
突变：E57Q,G51D,A53T 突变：E57Q,G51D,A53T 突变：E57Q,G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 9JE8 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T 30days a-syn fibril. 提交 2024-09-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
|
突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9JI8 Cryo-EM structure of alpha-synuclein-H21 fibril 提交 2024-09-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric |
链 F
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 G
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 K
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 L
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 M
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
链 O
37–99（63 aa）
片段：UNP residues 37-99
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.85 Å |
| 9JKE The cryo-EM structure of Ac-K58W_G51DA53T P2 a-syn fibril. 提交 2024-09-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
37–98（62 aa）
链 B
37–98（62 aa）
链 C
37–98（62 aa）
链 D
37–98（62 aa）
链 E
37–98（62 aa）
链 F
37–98（62 aa）
|
突变：K58W,G51D,A53T 突变：K58W,G51D,A53T 突变：K58W,G51D,A53T 突变：K58W,G51D,A53T 突变：K58W,G51D,A53T 突变：K58W,G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9JO6 The complex of alpha-synuclein in the presence of PD6 提交 2024-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.5；283.15 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1627；压力 1
NMR测量条件
pH 7.5；283.15 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1627；压力 1
NMR样品组成
0.50 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] alpha-synuclein, 1.00 mM PD6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.20 mM alpha-synuclein, 0.40 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PD6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9K7Q Parkinson disease protein 7 (DJ-1) and Alpha-synuclein (Alpha-syn) complex 提交 2024-10-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 M
1–92（92 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M Sodium iodide, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350, pH 7.0
|
分辨率 4.58 Å R-free 0.222 |
| 9KA3 The cryo-EM structure of Ac-K58D_G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
突变：K58D,G51D,A53T 突变：K58D,G51D,A53T 突变：K58D,G51D,A53T 突变：K58D,G51D,A53T 突变：K58D,G51D,A53T 突变：K58D,G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å |
| 9KA4 The cryo-EM structure of MSA-like fold (P1) formed under the palette stratagy. 提交 2024-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.42 Å |
| 9KAL The cryo-EM structure of Ac-E57A_G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-10-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
|
突变：E57A,G51D,A53T 突变：E57A,G51D,A53T 突变：E57A,G51D,A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 9KC2 Cryo-EM structure of ZSQ07-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2024-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
|
未记录 | A1EFK 2-[(4~{E})-4-[(~{E})-3-(3-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl)prop-2-enylidene]quinolin-1-yl]ethanol × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9KCN Cryo-EM structure of FD4-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2024-11-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric |
链 L
37–140（104 aa）
链 M
37–140（104 aa）
链 N
37–140（104 aa）
链 P
37–140（104 aa）
链 Q
37–140（104 aa）
链 R
37–140（104 aa）
链 d
37–140（104 aa）
链 e
37–140（104 aa）
链 f
37–140（104 aa）
链 h
37–140（104 aa）
链 i
37–140（104 aa）
链 j
37–140（104 aa）
|
未记录 | A1EFL (2~{R})-1-fluoranyl-3-[[2-[(~{E})-2-[5-[6-(methylamino)pyridin-3-yl]pyridin-2-yl]ethenyl]-1,3-benzothiazol-6-yl]oxy]propan-2-ol × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9KCO Cryo-EM structure of FD4-bound alpha-synuclein MSA-like fibril 提交 2024-11-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
链 P
1–140（140 aa）
链 Q
1–140（140 aa）
|
突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T 突变：G51D,A53T | A1EFL (2~{R})-1-fluoranyl-3-[[2-[(~{E})-2-[5-[6-(methylamino)pyridin-3-yl]pyridin-2-yl]ethenyl]-1,3-benzothiazol-6-yl]oxy]propan-2-ol × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9KCP Cryo-EM structure of ACI-12589-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2024-11-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9M5K The cryo-EM structure of in situ amplified (ISA) alpha-synuclein fibrils from PD homogenate 提交 2025-03-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9M5L The cryo-EM structure of in situ amplified (ISA) alpha-synuclein fibrils from DLB homogenate 提交 2025-03-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å |
| 9O4B Cryo-EM structure of in-vitro alpha-synuclein fibril bound with Exemplar-6 PET-radioligand 提交 2025-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | A1B9H 2-(3,4-dimethylphenoxy)-N-[3-(4-fluorophenyl)-1,2-oxazol-5-yl]acetamide × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.59 Å |
| 9O9J Cryo-EM structure of alpha-synuclein filaments from Parkinson's disease with G51D mutaion in SNCA 提交 2025-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：20-meric |
链 A
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 9O9K Cryo-EM structure of alpha-synuclein filaments from Parkinson's disease with H50Q variant in SNCA 提交 2025-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric |
链 A
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9OBP Cryo-EM structure of alpha-synuclein filaments derived from the frontal cortex of the case of atypical multiple system atrophy 提交 2025-04-23 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 9QYL Alpha-synuclein fibril type 1A polymorph in the presence of ATP 提交 2025-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric |
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
链 P
1–140（140 aa）
链 Q
1–140（140 aa）
链 e
1–140（140 aa）
链 f
1–140（140 aa）
链 g
1–140（140 aa）
链 h
1–140（140 aa）
链 j
1–140（140 aa）
链 k
1–140（140 aa）
链 l
1–140（140 aa）
链 m
1–140（140 aa）
链 n
1–140（140 aa）
链 o
1–140（140 aa）
链 p
1–140（140 aa）
链 q
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM Tris, 150 mM NaCl, pH 7.5, 1 mM MgCl2, 1 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 9RB3 A53T alpha-synuclein fibril - Type 1 提交 2025-05-21 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9RB6 A53T alpha-synuclein fibril - Type 2 提交 2025-05-21 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.02 Å |
| 9RB7 Wild-type alpha-synuclein fibril - Type 1 提交 2025-05-21 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.45 Å |
| 9RB8 Wild-type alpha-synuclein fibril - Type 3-1 提交 2025-05-21 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.64 Å |
| 9RB9 Wild-type alpha-synuclein fibril - Type 3-2 提交 2025-05-21 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 9RBA Wild-type alpha-synuclein fibril - Type 4 提交 2025-05-21 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 9RBB Wild-type alpha-synuclein fibril - Type 5 提交 2025-05-21 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 9RZF Structure of in-vivo formed alpha-synuclein fibrils purified from a M83+/- mouse brain injected with recombinant 1B fibrils 提交 2025-07-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
37–97（61 aa）
链 B
37–97（61 aa）
链 C
37–97（61 aa）
链 D
37–97（61 aa）
链 E
37–97（61 aa）
链 F
37–97（61 aa）
|
突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T 突变：A53T | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9TPT Structure of recombinantly assembled E83Q alpha-synuclein fibrils 提交 2025-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric |
链 A
36–100（65 aa）
链 B
36–100（65 aa）
链 C
36–100（65 aa）
链 D
36–100（65 aa）
链 E
36–100（65 aa）
链 F
36–100（65 aa）
链 H
36–100（65 aa）
链 I
36–100（65 aa）
链 J
36–100（65 aa）
链 L
36–100（65 aa）
链 M
36–100（65 aa）
链 N
36–100（65 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9UF6 Cryo-EM structure of BA1-1-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
链 P
1–140（140 aa）
|
未记录 | A1EO7 (2~{E})-1-ethyl-2-[(~{E})-3-(1-ethylquinolin-1-ium-2-yl)prop-2-enylidene]quinoline × 24 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9UFD Cryo-EM structure of BA12-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
链 M
1–140（140 aa）
链 N
1–140（140 aa）
链 O
1–140（140 aa）
链 P
1–140（140 aa）
|
未记录 | A1EO8 (2~{Z})-3-ethyl-2-[(~{E})-3-(3-ethyl-1,3-benzothiazol-3-ium-2-yl)prop-2-enylidene]-1,3-benzothiazole × 36 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9UFF Cryo-EM structure of BA21-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | A1EO6 ~{N}-(1-ethyl-2-oxidanylidene-benzo[cd]indol-6-yl)-2,5-dimethoxy-benzamide × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9UFL Cryo-EM structure of BA22-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9UFS Cryo-EM structure of BA23-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9UFX Cryo-EM structure of HA11-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | A1EPA 2',4',5',7'-tetrakis(iodanyl)-3',6'-bis(oxidanyl)spiro[2-benzofuran-3,9'-xanthene]-1-one × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9UFY Cryo-EM structure of HA21-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | GO3 Gossypol × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9UG0 Cryo-EM structure of HA31-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | A1EPK 4-[(3~{R},5~{S})-3,5-dimethylpiperidin-1-yl]sulfonyl-~{N}'-(4-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl)benzohydrazide × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9UG1 Cryo-EM structure of HA32-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
链 K
1–140（140 aa）
链 L
1–140（140 aa）
|
未记录 | A1EPB 4-(3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-ylsulfonyl)-~{N}'-(4-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl)benzohydrazide × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9UJQ Cryo-EM structure of HQY1027-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9V6U The cryo-EM structure of FD4 bound Lewy fold fibril. 提交 2025-05-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric |
链 c
1–140（140 aa）
链 d
1–140（140 aa）
链 e
1–140（140 aa）
链 f
1–140（140 aa）
链 g
1–140（140 aa）
链 h
1–140（140 aa）
链 i
1–140（140 aa）
链 j
1–140（140 aa）
链 k
1–140（140 aa）
链 o
1–140（140 aa）
链 p
1–140（140 aa）
链 q
1–140（140 aa）
链 r
1–140（140 aa）
链 s
1–140（140 aa）
链 t
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.30 Å |
| 9V7C The cryo-EM structure of FD4_orientation2 bound Lewy fold fibril. 提交 2025-05-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric |
链 c
32–101（70 aa）
链 d
32–101（70 aa）
链 e
32–101（70 aa）
链 f
32–101（70 aa）
链 g
32–101（70 aa）
链 h
32–101（70 aa）
链 i
32–101（70 aa）
链 j
32–101（70 aa）
链 k
32–101（70 aa）
链 o
32–101（70 aa）
链 p
32–101（70 aa）
链 q
32–101（70 aa）
链 r
32–101（70 aa）
链 s
32–101（70 aa）
链 t
32–101（70 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.30 Å |
| 9Y0S CryoEM structure of alpha-synuclein fibril induced by psychosine 提交 2025-08-29 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
链 E
1–140（140 aa）
链 F
1–140（140 aa）
链 G
1–140（140 aa）
链 H
1–140（140 aa）
链 I
1–140（140 aa）
链 J
1–140（140 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å |
共 226 个其他 PDB 条目、234 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | SYUA_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 G； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 H； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 I； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 J； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 K； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 L； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 M； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 N； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 O； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 作者链 P； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140 |
