9wsv

Cryo-EM structure of DAMGO-muOR-arrestin-1-Fab30 complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 138.6 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mu-type opioid receptor,Vasopressin V2 receptor

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 R； UniProt 342–371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Beta-arrestin-1 × 1 （P17870） Fab30 heavy chain × 1 Fab30 light chain × 1 DAMGO × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9WSV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4JQI Structure of active beta-arrestin1 bound to a G protein-coupled receptor phosphopeptide 提交 2013-03-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 V 343–371（29 aa）片段：unp residues 343-371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；17% PEG 3350, 0.1 M HEPES, 0.2 M L-proline , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.247
4JQI Structure of active beta-arrestin1 bound to a G protein-coupled receptor phosphopeptide 提交 2013-03-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 V 343–371（29 aa）片段：unp residues 343-371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PRO PROLINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；17% PEG 3350, 0.1 M HEPES, 0.2 M L-proline , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.247
6NI2 Stabilized beta-arrestin 1-V2T subcomplex of a GPCR-G protein-beta-arrestin mega-complex 提交 2018-12-26	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 V 343–368（26 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6U1N GPCR-Beta arrestin structure in lipid bilayer 提交 2019-08-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 343–371（29 aa）片段：M2 UNP residues 2-466 + V2 UNP residues 343-371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	2CU 3-amino-5-chloro-N-cyclopropyl-4-methyl-6-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-oxoethoxy]thieno[2,3-b]pyridine-2-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7BB6 AVP-V2R-Galphas-beta1-gamma2-Nb35 (L state) 提交 2020-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 3–371（369 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7BB7 AVP-V2R-Galphas-beta1-gamma2-Nb35(T state) 提交 2020-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 3–371（369 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7DW9 Cryo-EM structure of human V2 vasopressin receptor in complex with an Gs protein 提交 2021-01-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 R 1–371（371 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7KH0 Cryo-EM structure of the human arginine vasopressin AVP-vasopressin receptor V2R-Gs signaling complex 提交 2020-10-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 R 1–371（371 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7R0C Structure of the AVP-V2R-arrestin2-ScFv30 complex 提交 2022-02-01	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 4–371（368 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.73 Å
8GOC Structure of beta-arrestin2 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human Vasopressin V2 receptor, V2R 提交 2022-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 343–371（29 aa）链 U 343–371（29 aa）链 V 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 4.18 Å
8I10 Structure of beta-arrestin2 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human Vasopressin V2 receptor, V2R (Local refine) 提交 2023-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 343–371（29 aa）链 U 343–371（29 aa）链 V 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 3.96 Å
8JRU Cryo-EM structure of the glucagon receptor bound to beta-arrestin 1 in ligand-free state 提交 2023-06-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8JRV Cryo-EM structure of the glucagon receptor bound to glucagon and beta-arrestin 1 提交 2023-06-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8WRZ Cry-EM structure of cannabinoid receptor-beta-arrestin-1 complex 提交 2023-10-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 V 343–367（25 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	8D0 (6~{a}~{R},9~{R},10~{a}~{R})-9-(hydroxymethyl)-3-(8-isothiocyanato-2-methyl-octan-2-yl)-6,6-dimethyl-6~{a},7,8,9,10,10~{a}-hexahydrobenzo[c]chromen-1-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8WU1 Cryo-EM structure of CB1-beta-arrestin1 complex 提交 2023-10-19	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 342–371（30 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	KCA methyl N-{1-[(4-fluorophenyl)methyl]-1H-indazole-3-carbonyl}-3-methyl-L-valinate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BT8 Structure of Src in complex with beta-arrestin 1 revealing SH3 binding sites 提交 2024-05-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 V 343–371（29 aa）片段：UNP residues 343-371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
9CX3 Structure of SH3 domain of Src in complex with beta-arrestin 1 提交 2024-07-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 V 343–371（29 aa）片段：UNP residues 343-371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
9CX9 Structure of SH3 domain of Src in complex with beta-arrestin 1 提交 2024-07-31	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 V 343–371（29 aa）片段：UNP residues 343-371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
9HAP Cryo-EM structure of inactive human arginine-vasopressin (AVP) V2 receptor (V2R) with tolvaptan 提交 2024-11-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 4–371（368 aa）	未记录	A1IT8 (R)-Tolvaptan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9HB3 cryo-EM structure of inactive human arginine-vasopressin (AVP) V2 receptor (V2R) with Mambaquaretin1 K39A (MQK39A) 提交 2024-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 4–342（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9LY2 A Cryo-EM structure of LA-PTH-PTH1R-V2RT-Beta-arrestin1 complex (state 1 conformation) 提交 2025-02-19	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.04 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9LY3 A Cryo-EM structure of LA-PTH-PTH1R-V2RT-Beta-arrestin1 complex (state 2 conformation) 提交 2025-02-19	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.04 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9LZ2 Cryo-EM structure of PTH1R(V2RC)-beta-arrestin1 complex 提交 2025-02-21	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–368（26 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9U80 Cryo-EM structure of conivaptan-bound human vasopressin V2 receptor complex with Fab 提交 2025-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 R 35–234（200 aa）链 R 264–371（108 aa）	未记录	A1ECE Conivaptan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9U81 Cryo-EM structure of tolvaptan-bound human vasopressin V2 receptor complex with Fab 提交 2025-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 R 33–234（202 aa）链 R 264–371（108 aa）	未记录	A1ECF Tolvaptan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.08 Å
9UVV Cryo-EM structure of Vasopressin receptor 2 (V2R)-BRIL/anti BRIL SRP2070 Fab antibody complex with tolvaptan 提交 2025-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–236（236 aa）链 A 265–371（107 aa）	突变：M243W/H338I/R342L 突变：M243W/H338I/R342L	A1IT8 (R)-Tolvaptan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5	分辨率 3.02 Å
9UVW Cryo-EM structure of Vasopressin receptor 2 (V2R)-BRIL/anti BRIL SRP2070 Fab antibody complex with tolvaptan, focused on receptor 提交 2025-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–236（236 aa）链 A 265–371（107 aa）	突变：M243W/H338I/R342L 突变：M243W/H338I/R342L	A1IT8 (R)-Tolvaptan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5	分辨率 2.89 Å
9UVX Cryo-EM structure of Vasopressin receptor 2 (V2R)-BRIL/anti BRIL SRP2070 Fab antibody complex with OPC51803, focused on receptor 提交 2025-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–236（236 aa）链 A 265–371（107 aa）	突变：M243W/H338I/R342L 突变：M243W/H338I/R342L	A1L9O 2-[(5~{R})-1-(2-chloranyl-4-pyrrolidin-1-yl-phenyl)carbonyl-2,3,4,5-tetrahydro-1-benzazepin-5-yl]-~{N}-propan-2-yl-ethanamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5	分辨率 3.31 Å
9UVY Cryo-EM structure of Vasopressin receptor 2 (V2R)-ARK1 with tolvaptan 提交 2025-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–235（235 aa）链 A 266–371（106 aa）	未记录	A1IT8 (R)-Tolvaptan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5	分辨率 2.98 Å
9UYH Cryo-EM structure of the G protein-coupled receptor 1 (GPR1) bound to chemerin and beta-arrestin 1 (Conformation 1) 提交 2025-05-15	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9UYI Cryo-EM structure of the G protein-coupled receptor 1 (GPR1) bound to chemerin and beta-arrestin 1 (Conformation 2) 提交 2025-05-15	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9UYJ Cryo-EM structure of the G protein-coupled receptor 1 (GPR1) bound to chemerin and beta-arrestin 1 (Conformation 3) 提交 2025-05-15	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9UYL Cryo-EM structure of the G protein-coupled receptor 1 (GPR1) bound to chemerin and beta-arrestin 1 (Conformation 4) 提交 2025-05-15	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9UYM Composite map of the G protein-coupled receptor 1 (GPR1) bound to chemerin and beta-arrestin 2 提交 2025-05-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9UYN Cryo-EM structure of the G protein-coupled receptor 1 (GPR1) bound to beta-arrestin 1 in ligand-free state 提交 2025-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 343–371（29 aa）	突变：V143C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PAM PALMITOLEIC ACID × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9WSW Cryo-EM structure of endomorphin-1-muOR-Gz-scFv16 complex 提交 2025-09-15	突变/修饰不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 342–371（30 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9WSX Cryo-EM structure of endomorphin-1-muOR-arrestin2-Fab30 complex 提交 2025-09-15	当前字段一致	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 342–371（30 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å

共 36 个其他 PDB 条目、37 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	V2R_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 351–380； UniProt 342–371

Mu-type opioid receptor,Vasopressin V2 receptor

Homo sapiens

UniProt P42866

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 R； UniProt 6–352	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Beta-arrestin-1 × 1 （P17870） Fab30 heavy chain × 1 Fab30 light chain × 1 DAMGO × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9WSV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4DKL Crystal structure of the mu-opioid receptor bound to a morphinan antagonist 提交 2012-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 52–263（212 aa）片段：SEE REMARK 999 链 A 270–360（91 aa）片段：SEE REMARK 999	突变：D1020N, C1054T, C1097A 突变：D1020N, C1054T, C1097A	BF0 methyl 4-{[(5beta,6alpha)-17-(cyclopropylmethyl)-3,14-dihydroxy-4,5-epoxymorphinan-6-yl]amino}-4-oxobutanoate × 2 SO4 SULFATE ION × 24 CLR CHOLESTEROL × 2 MPG [(Z)-octadec-9-enyl] (2R)-2,3-bis(oxidanyl)propanoate × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 300 mM lithium sulfate, 7.5% DMSO, 30-38% PEG400 in monoolein:cholesterol mixed in a 10:1 ratio, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.275
5C1M Crystal structure of active mu-opioid receptor bound to the agonist BU72 提交 2015-06-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 52–347（296 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 2 VF1 (2R,3S,3aR,5aR,6R,11bR,11cS)-3a-methoxy-3,14-dimethyl-2-phenyl-2,3,3a,6,7,11c-hexahydro-1H-6,11b-(epiminoethano)-3,5a-methanonaphtho[2,1-g]indol-10-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.5；293 K；Reconstituted in 10:1 monoolein:cholesterol mix. Precipitant solution:15-25% PEG300, 100 mM HEPES pH 7.0-7.5, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.5-1.0% Polypropylene glycol P 400, 100-300 mM (NH4)2HPO4	分辨率 2.07 Å R-free 0.229
6DDE Mu Opioid Receptor-Gi Protein Complex 提交 2018-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 9–358（350 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions were made fresh. After buffer reconstitution, all buffers were filtered with 0.22um filter. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot 1 second before plunging	分辨率 3.50 Å
6DDF Mu Opioid Receptor-Gi Protein Complex 提交 2018-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 9–358（350 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solutions were made fresh. After buffer reconstitution, all buffers were filtered with 0.22um filter. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot 1 second before plunging	分辨率 3.50 Å
7SBF PZM21 bound Mu Opioid Receptor-Gi Protein Complex 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 73–398（326 aa）	未记录	8QY N-[(2S)-2-(dimethylamino)-3-(4-hydroxyphenyl)propyl]-N'-[(2S)-1-(thiophen-3-yl)propan-2-yl]urea × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7SCG FH210 bound Mu Opioid Receptor-Gi Protein Complex 提交 2021-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 9–358（350 aa）	未记录	8RI (2E)-N-[(2S)-2-(dimethylamino)-3-(4-hydroxyphenyl)propyl]-3-(naphthalen-1-yl)prop-2-enamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7T2G CryoEM structure of mu-opioid receptor - Gi protein complex bound to mitragynine pseudoindoxyl (MP) 提交 2021-12-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 73–398（326 aa）	未记录	EIG Mitragynine pseudoindoxyl × 1 CLR CHOLESTEROL × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7T2H CryoEM structure of mu-opioid receptor - Gi protein complex bound to lofentanil (LFT) 提交 2021-12-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 9–358（350 aa）	未记录	EID Lofentanil × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7U2K C6-guano bound Mu Opioid Receptor-Gi Protein Complex 提交 2022-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 9–358（350 aa）	未记录	KZR N-(6-carbamimidamidohexyl)-N-[1-(2-phenylethyl)piperidin-4-yl]propanamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7U2L C5guano-uOR-Gi-scFv16 提交 2022-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 9–358（350 aa）	未记录	L0X N-(5-carbamimidamidopentyl)-N-[1-(2-phenylethyl)piperidin-4-yl]propanamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
7UL4 CryoEM Structure of Inactive MOR Bound to Alvimopan and Mb6 提交 2022-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 6–398（393 aa）	未记录	NG0 N-[(2S)-2-{[(3R,4R)-4-(3-hydroxyphenyl)-3,4-dimethylpiperidin-1-yl]methyl}-3-phenylpropanoyl]glycine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8E0G Re-refined model of active mu-opioid receptor (PDB 5c1m) as an adduct with BU72 提交 2022-08-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 52–347（296 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7.5；293 K；Reconstituted in 10:1 monoolein:cholesterol mix, precipitant: 15-25% PEG300, 100 mM HEPES, pH 7.0-7.5, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.5-1.0% polypropylene glycol P400, 100-300 mM ammonium phosphate dibasic	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
8QOT Structure of the mu opioid receptor bound to the antagonist nanobody NbE 提交 2023-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 2–398（397 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BJK Inactive mu opioid receptor bound to Nb6, naloxone and NAM 提交 2024-04-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 R 6–398（393 aa）	未记录	A1APV Naloxone × 1 A1APU Nalpha-[({(1M)-1-[5-(benzyloxy)pyridin-3-yl]naphthalen-2-yl}sulfanyl)acetyl]-3-methoxy-N,4-dimethyl-L-phenylalaninamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.26 Å
9BQJ RO76 bound muOR-Gi1-scFv16 complex structure 提交 2024-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 D 9–358（350 aa）	未记录	A1AQ2 N-{[3-(hydroxymethyl)phenyl]methyl}-N-[1-(2-phenylethyl)piperidin-4-yl]propanamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9O36 CryoEM structure of mu-opioid receptor - Gi protein complex bound to fluornitrazene (FNZ) 提交 2025-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 6–398（393 aa）	未记录	A1B79 N,N-diethyl-2-(2-{[4-(2-fluoroethoxy)phenyl]methyl}-5-nitro-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-amine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
9ODE Structure of the MOR/Gi/Lofentanil Complex, Nucleotide Free 提交 2025-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 6–398（393 aa）	未记录	EID Lofentanil × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9ODF Structure of the MOR/Gi/Lofentanil Complex, GTP-bound G-Primed 提交 2025-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 6–398（393 aa）	未记录	EID Lofentanil × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9ODG Structure of the MOR/Gi/Lofentanil Complex, GTP-bound G-ACT-1 提交 2025-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 6–398（393 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
9ODJ Structure of the MOR/Gi/Mitragynine Pseudoindoxil Complex, GTP-bound G-Primed, AHD 3DVA Sorted 提交 2025-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 6–398（393 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1 EIG Mitragynine pseudoindoxyl × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9ODK Structure of the MOR/Gi/Mitragynine Pseudoindoxil Complex, GTP-bound G-ACT-2 提交 2025-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 6–398（393 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9ODL Structure of the MOR/Gi/Mitragynine Pseudoindoxil Complex, GTP-bound G-ACT-3 提交 2025-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 6–398（393 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 EIG Mitragynine pseudoindoxyl × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9ODM Structure of the MOR/Gi/DAMGO Complex, Nucleotide Free, Baseline 提交 2025-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 6–398（393 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9ODN Structure of the MOR/Gi/DAMGO Complex, GTP-Bound, G-Primed 提交 2025-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 6–398（393 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
9WSW Cryo-EM structure of endomorphin-1-muOR-Gz-scFv16 complex 提交 2025-09-15	突变/修饰不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 6–352（347 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9WSX Cryo-EM structure of endomorphin-1-muOR-arrestin2-Fab30 complex 提交 2025-09-15	当前字段一致	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 6–352（347 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å

共 26 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	OPRM_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 4–350； UniProt 6–352

Beta-arrestin-1

Bos taurus

UniProt P17870

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–393	未记录	Mu-type opioid receptor,Vasopressin V2 receptor × 1 （P42866,P30518） Fab30 heavy chain × 1 Fab30 light chain × 1 DAMGO × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9WSV	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1G4M CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE BETA-ARRESTIN 1 提交 2000-10-27	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–393（393 aa）片段：TRUNCATION MUTANT: 1-393	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å R-free 0.269
1G4M CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE BETA-ARRESTIN 1 提交 2000-10-27	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–393（393 aa）片段：TRUNCATION MUTANT: 1-393	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å R-free 0.269
1G4R CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE BETA-ARRESTIN 1 提交 2000-10-27	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–393（393 aa）片段：TRUNCATION MUTANT: 1-393	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å R-free 0.274
1JSY Crystal structure of bovine arrestin-2 提交 2001-08-19	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–418（418 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；magnesium formate, polypropylene glycol 400, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å R-free 0.238
1ZSH Crystal structure of bovine arrestin-2 in complex with inositol hexakisphosphate (IP6) 提交 2005-05-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–418（418 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；298 K；Magnesium Formate, HEPES, Polypropylene glycol 400, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å R-free 0.260
2WTR Full length Arrestin2 提交 2009-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–418（418 aa）	未记录	BA BARIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；CRYSTALS WERE GROWN USING THE HANGING-DROP METHOD IN A NEXTAL TRAY (QIAGEN) AT 277 K AGAINST A 1 ML RESERVOIR SOLUTION CONSISTING OF 12% (W/V) PEG 2000, 0.1M BACL2, 0.1 M TRIS-HCL PH7.5. THE HANGING DROP CONTAINED 2 MICROLITRES OF CONCENTRATED ARRESTIN2 PROTEIN (BETWEEN 9-11 MG/ML IN 0.1M TRIS-HCL PH 8.5) AND 2 MICROLITRES OF RESERVOIR SOLUTION.	分辨率 2.90 Å R-free 0.295
2WTR Full length Arrestin2 提交 2009-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–418（418 aa）	未记录	BA BARIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；CRYSTALS WERE GROWN USING THE HANGING-DROP METHOD IN A NEXTAL TRAY (QIAGEN) AT 277 K AGAINST A 1 ML RESERVOIR SOLUTION CONSISTING OF 12% (W/V) PEG 2000, 0.1M BACL2, 0.1 M TRIS-HCL PH7.5. THE HANGING DROP CONTAINED 2 MICROLITRES OF CONCENTRATED ARRESTIN2 PROTEIN (BETWEEN 9-11 MG/ML IN 0.1M TRIS-HCL PH 8.5) AND 2 MICROLITRES OF RESERVOIR SOLUTION.	分辨率 2.90 Å R-free 0.295
3GC3 Crystal Structure of Arrestin2S and Clathrin 提交 2009-02-21	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–385（385 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；100 mM bis_tris propane 4 -4.5 M ammonium acetate 4.5% ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.251
3GD1 Structure of an Arrestin/Clathrin complex reveals a novel clathrin binding domain that modulates receptor trafficking 提交 2009-02-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–393（393 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；293 K；100mM Bicine, 7% O-(2-aminopropyl)-O'-(2-methoxyethyl)polypropylene glycol 500, 6% polyethylene glycol 8000, 4% acetone, 1% ethylene glycol and 10 mM strontium chloride, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.50 Å R-free 0.254
3GD1 Structure of an Arrestin/Clathrin complex reveals a novel clathrin binding domain that modulates receptor trafficking 提交 2009-02-23	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1–393（393 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；293 K；100mM Bicine, 7% O-(2-aminopropyl)-O'-(2-methoxyethyl)polypropylene glycol 500, 6% polyethylene glycol 8000, 4% acetone, 1% ethylene glycol and 10 mM strontium chloride, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.50 Å R-free 0.254
6NI2 Stabilized beta-arrestin 1-V2T subcomplex of a GPCR-G protein-beta-arrestin mega-complex 提交 2018-12-26	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–393（393 aa）片段：UNP residues 6-361	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7DF9 Crystal of Arrestin2-V2Rpp-1-Fab30 complex 提交 2020-11-06	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–418（418 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；10% PEG 3350, 0.1M Succinic acid, pH 6.5-7.5, 0.2mM DMSO	分辨率 3.17 Å R-free 0.281
7DFA Crystal of Arrestin2-V2Rpp-4-Fab30 complex 提交 2020-11-06	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–418（418 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；10% PEG 3350, 0.1M Succinic acid, pH 6.5-7.5, 0.2mM DMSO	分辨率 2.54 Å R-free 0.280
7DFB Crystal of Arrestin2-V2Rpp-6-7-Fab30 complex 提交 2020-11-06	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–418（418 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；0% PEG 3350, 0.1M Succinic acid, pH 6.5-7.5, 0.2mM DMSO	分辨率 3.28 Å R-free 0.290
7DFC Crystal of Arrestin2-V2Rpp-3-Fab30 complex 提交 2020-11-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–418（418 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；289 K；15% PEG 3350, 0.1M HEPES, 0.2mM DMSO	分辨率 2.49 Å R-free 0.284
8J97 Structure of Muscarinic receptor (M2R) in complex with beta-arrestin1 (Local refine, cross-linked) 提交 2023-05-02	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 5–357（353 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8JAF Structure of Muscarinic receptor (M2R) in complex with beta-arrestin1 (Local Refine, non-cross linked) 提交 2023-05-05	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 5–362（358 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8TII Human ACKR3 phosphorylated by GRK2 in complex with Arrestin2 in nanodisc 提交 2023-07-19	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–418（418 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8TIO Human ACKR3 with C tail extended by 12 glycines phosphorylated by GRK5 in complex with Arrestin2 reconstructed without receptor/micelle 提交 2023-07-19	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–418（418 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8WU1 Cryo-EM structure of CB1-beta-arrestin1 complex 提交 2023-10-19	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–393（393 aa）	突变：R169E, I386A, V387A, F388A	KCA methyl N-{1-[(4-fluorophenyl)methyl]-1H-indazole-3-carbonyl}-3-methyl-L-valinate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9E82 ACKR3 phosphorylated by GRK5 in complex with arrestin2 and Fab7 提交 2024-11-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–418（418 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9LZ0 Cryo-EM structure of PTH1R-beta-arrestin1 complex in state 1 提交 2025-02-21	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–393（393 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9LZ1 Cryo-EM structure of PTH1R-beta-arrestin1 complex in state 2 提交 2025-02-21	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–393（393 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9LZ2 Cryo-EM structure of PTH1R(V2RC)-beta-arrestin1 complex 提交 2025-02-21	结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–393（393 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9UCO Cryo-EM structure of ADGRE1-beta arrestin1-scFv30 complex 提交 2025-04-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 1–376（376 aa）链 C 1–376（376 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.58 Å
9WSX Cryo-EM structure of endomorphin-1-muOR-arrestin2-Fab30 complex 提交 2025-09-15	当前字段一致	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 1–393（393 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å

共 23 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARRB1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–393； UniProt 1–393

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9wsv
沉积日期 deposition_date	2025-09-15
结构标题 title	Cryo-EM structure of DAMGO-muOR-arrestin-1-Fab30 complex
关键词 keywords	G-protein-coupled receptors, mu-opioid receptor, single particle, Cryo-EM, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	40.78 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	41.25 Å
零角强度 I(0) i0	174359000.00
分子量 molecular_weight	108610.0 kDa
排除体积 excluded_volume	136620 Å³
包络体积 envelope_volume	194420 Å³
水化壳体积 shell_volume	41782 Å³
包络直径 envelope_diameter	148.5 Å
壳层 Rg shell_rg	42.68 Å
包络 Rg envelope_rg	41.60 Å
形状 Rg shape_rg	41.27 Å
总 Rg total_rg	41.30 Å
总原子数 total_atoms	7635
残基数 n_residues	1017
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	138.6 Å
Rg (实空间) rg_real	41.04 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.44 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.7440e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.2370e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	40.78 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	174300000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8268
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	42.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.497
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.200
角度范围 angular_range	— – 0.1950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	11850000.0000
实空间数据点数 n_real_points	40
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.856; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.798; Smooth: 0.379

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Mu-type opioid receptor,Vasopressin V2 receptor
分子量 formula_weight	43316.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R
原子数 atom_count	7639

GPMGPGNISDCSDPLAPASCSPAPGSWLNLSHVDGNQSDPCGPNRTGLGGSHSLCPQTGSPSMVTAITIMALYSIVCVVGLFGNFLVMYVIVRYTKMKTATNIYIFNLALADALATSTLPFQSVNYLMGTWPFGNILCKIVISIDYYNMFTSIFTLCTMSVDRYIAVCHPVKALDFRTPRNAKIVNVCNWILSSAIGLPVMFMATTKYRQGSIDCTLTFSHPTWYWENLLKICVFIFAFIMPVLIITVCYGLMILRLKSVRMLSGSKEKDRNLRRITRMVLVVVAVFIVCWTPIHIYVIIKALITIPETTFQTVSWHFCIALGYTNSCLNPVLYAFLDENFKRCFREFCICARGRTPPSLGPQDESCTTASSSLAKDTSSLEVLFQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Beta-arrestin-1
分子量 formula_weight	44135.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVEPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCAFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIPPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIEKVQYAPERPGPQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYADICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEEPPHREVPEHETPVDTNLIELDTNDDDAAAEDFAR

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	domestic cattle
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Fab30 heavy chain
分子量 formula_weight	25333.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MEISEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNVYSSSIHWVRQAPGKGLEWVASISSYYGYTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSRQFWYSGLDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	synthetic construct
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	32630
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Fab30 light chain
分子量 formula_weight	23566.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MSDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSVSSAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASSLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYKYVPVTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDSQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	synthetic construct
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	32630
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DAMGO
分子量 formula_weight	513.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

YAGFX

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	233269

fit	/app/data/saxs_computation/ws/9wsv/9wsv.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ws/9wsv/9wsv.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ws/9wsv/9wsv.dat

Cryo-EM structure of DAMGO-muOR-arrestin-1-Fab30 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mu-type opioid receptor,Vasopressin V2 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Mu-type opioid receptor,Vasopressin V2 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Beta-arrestin-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)