当前蛋白身份:P37840 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
10XU Structure of amplified aSyn filament by using seed amplification assay (SAA) from MSA patient CSF. 提交 2026-02-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 35–101(67 aa)
链 B 35–101(67 aa)
链 C 35–101(67 aa)
链 D 35–101(67 aa)
链 E 35–101(67 aa)
链 U 35–101(67 aa)
链 W 35–101(67 aa)
链 X 35–101(67 aa)
链 Y 35–101(67 aa)
链 Z 35–101(67 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
1XQ8 Human micelle-bound alpha-synuclein 提交 2004-10-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4;298.2 K;离子强度(mmCIF原始值)115;压力 1
NMR样品组成 0.5 MM ALPHA-SYNUCLEIN 2H, 13C, 15N
分辨率未提供
2JN5 Solution Structure of a Dodecapeptide from Alpha-Synuclein Bound with Synphilin-1 提交 2006-12-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–12(12 aa) 片段:residues 1-12
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM entity, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.1 mM Synphilin-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2KKW SLAS-micelle bound alpha-synuclein 提交 2009-06-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 未声明
NMR测量条件 pH 7.4;298.2 K;离子强度(mmCIF原始值)0.05;压力 AMBIENT
NMR样品组成 0.75 MM [U-100% 13C, U-100% 15N, U-80% 2H] ALPHA-SYNUCLEIN, 75 MM SODIUM LAUROYL SARCOSINATE, 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2M55 NMR structure of the complex of an N-terminally acetylated alpha-synuclein peptide with calmodulin 提交 2013-02-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–19(19 aa) 片段:UNP residues 1-19
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CA CALCIUM ION × 4 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.36;310 K;压力 ambient
NMR样品组成 600 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] calmodulin, 600 uM alpha-synuclein, 50 mM MES, 100 mM potassium chloride, 3 mM calcium ion, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 700 uM [U-13C; U-15N]-Met,Val,Phe,Gly,Leu,Ala alpha-synuclein, 700 uM calmodulin, 50 mM MES, 100 mM potassium chloride, 3 mM calcium ion, 0.1% sodium azide, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 150 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] calmodulin, 150 uM alpha-synuclein, 50 mM MES, 100 mM potassium chloride, 3 mM calcium ion, 10 mg/mL Pf1 phage, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
2N0A Atomic-resolution structure of alpha-synuclein fibrils 提交 2015-03-04 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7;压力 ambient
NMR样品组成 66% [U-100% 13C; U-100% 15N] alpha-synuclein, 34% H2O, Rehydrated Fibril | Rehydrated Fibril
NMR样品组成 66% [U-100% 13C 1,3-Glycerol; U-100% 15N] alpha-synuclein, 34% H2O, Rehydrated Fibril | Rehydrated Fibril
NMR样品组成 66% [U-100% 13C 2-Glycerol; U-100% 15N] alpha-synuclein, 34% H2O, Rehydrated Fibril | Rehydrated Fibril
NMR样品组成 66% [U-25% 13C; U-25% 15N] alpha-synuclein, 34% H2O, Rehydrated Fibril | Rehydrated Fibril
NMR样品组成 66% [U-25% 13C 1,3-Glycerol; natural abundance N][natural abundance C13, U-50% N15] alpha-synuclein, 34% H2O, Rehydrated Fibril | Rehydrated Fibril
NMR样品组成 66% [U-25% 13C 2-Glycerol; natural abundance N][natural abundance C13, U-50% N15] alpha-synuclein, 34% H2O, Rehydrated Fibril | Rehydrated Fibril
NMR样品组成 90% Adamantane, 10% KBr, Dry | Dry
分辨率未提供
2X6M Structure of a single domain camelid antibody fragment in complex with a C-terminal peptide of alpha-synuclein 提交 2010-02-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 132–140(9 aa) 片段:C-TERMINAL FRAGMENT OF ALPHA-SYNUCLEIN, RESIDUES 132-140
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;25% PEG6000, 100 MM HEPES PH 7.5, 100 MM LICL
分辨率 1.62 Å R-free 0.203
3Q25 Crystal structure of human alpha-synuclein (1-19) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–19(19 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 10 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;290 K;2.2 M AMMONIUM SULFATE, 20% (w/v) GLYCEROL, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
分辨率 1.90 Å R-free 0.196
3Q25 Crystal structure of human alpha-synuclein (1-19) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–19(19 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 20 GOL GLYCEROL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;290 K;2.2 M AMMONIUM SULFATE, 20% (w/v) GLYCEROL, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
分辨率 1.90 Å R-free 0.196
3Q26 Cyrstal structure of human alpha-synuclein (10-42) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 10–42(33 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;290 K;0.2M tri-lithium citrate, 2.2 M ammonium sulfate, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
分辨率 1.54 Å R-free 0.183
3Q27 Cyrstal structure of human alpha-synuclein (32-57) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 32–57(26 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;290 K;0.1M bicine pH 9.0, 2.4 M ammonium sulfate, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
分辨率 1.30 Å R-free 0.156
3Q28 Cyrstal structure of human alpha-synuclein (58-79) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 58–79(22 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;290 K;0.1M BICINE pH 9.0, 3.2 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
分辨率 1.60 Å R-free 0.173
3Q29 Cyrstal structure of human alpha-synuclein (1-19) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–19(19 aa)
链 C 1–19(19 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;290 K;0.1M TRIS pH 8.0, 2.4 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
分辨率 2.30 Å R-free 0.232
3Q29 Cyrstal structure of human alpha-synuclein (1-19) fused to maltose binding protein (MBP) 提交 2010-12-19 Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–19(19 aa)
链 C 1–19(19 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;290 K;0.1M TRIS pH 8.0, 2.4 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion, hanging drop, temperature 290K
分辨率 2.30 Å R-free 0.232
4BXL Structure of alpha-synuclein in complex with an engineered binding protein 提交 2013-07-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 35–56(22 aa) 片段:RESIDUES 35-56
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4;303 K;离子强度(mmCIF原始值)0.07;压力 1.0
NMR测量条件 pH 7.4;303 K;离子强度(mmCIF原始值)0.07;压力 1.0
NMR样品组成 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
4R0U Tgvtava, an amyloid forming segment from alpha synuclein, residues 72-78 提交 2014-08-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 72–78(7 aa) 片段:UNP RESIDUES 72-78
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2M magnesium formate, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 1.38 Å R-free 0.217
4R0W Vvtgvta, an amyloid forming segment from alpha synuclein, residues 70-76 提交 2014-08-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 70–76(7 aa) 片段:UNP RESIDUES 70-76
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;isopropanol, sodium cacodylate, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.274
4RIK Amyloid forming segment, AVVTGVTAV, from the NAC domain of Parkinson's disease protein alpha-synuclein, residues 69-77 提交 2014-10-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 69–77(9 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;273 K;0.9M Ammonium Phosphate, 0.1M Sodium Acetate, pH 4.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 273K
分辨率 1.85 Å R-free 0.221
4RIL Structure of the amyloid forming segment, GAVVTGVTAVA, from the NAC domain of Parkinson's disease protein alpha-synuclein, residues 68-78, determined by electron diffraction 提交 2014-10-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 68–78(11 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
X-ray结晶条件 batch crystallization;pH 4;310 K;1 mg of synthetic peptide GAVVTGVTAVA was dissolved in 1 ml of sterile water and shaken overnight in an orbital mixing plate, pH 4.0, batch crystallization, temperature 310K
分辨率 1.43 Å R-free 0.275
4ZNN MicroED structure of the segment, GVVHGVTTVA, from the A53T familial mutant of Parkinson's disease protein, alpha-synuclein residues 47-56 提交 2015-05-05 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 47–56(10 aa)
突变:A53T 未记录非水小分子 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
X-ray结晶条件 BATCH MODE;pH 7;310 K;1 mg of synthetic peptide GVVHGVTTVA was dissolved in 200 microliters of 50 mM phosphate buffer pH 7.0 and 0.1% w/v DMSO and shaken overnight in an orbital mixing plate
分辨率 1.41 Å R-free 0.282
6A6B cryo-em structure of alpha-synuclein fiber 提交 2018-06-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 B 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 C 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 D 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 E 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 F 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 G 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 H 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 I 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 J 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 K 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 L 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
6CU7 Alpha Synuclein fibril formed by full length protein - Rod Polymorph 提交 2018-03-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force: 1 blot time: 4s
分辨率 3.50 Å
6CU8 Alpha Synuclein fibril formed by full length protein - Twister Polymorph 提交 2018-03-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force: 1 blot time: 4s
分辨率 3.60 Å
6H6B Structure of alpha-synuclein fibrils 提交 2018-07-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–121(121 aa)
链 B 1–121(121 aa)
链 C 1–121(121 aa)
链 D 1–121(121 aa)
链 E 1–121(121 aa)
链 F 1–121(121 aa)
链 G 1–121(121 aa)
链 H 1–121(121 aa)
链 I 1–121(121 aa)
链 J 1–121(121 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6I42 Structure of the alpha-Synuclein PreNAC/Cyclophilin A-complex 提交 2018-11-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 48–60(13 aa) 片段:UNP residues 48-60
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;1.93 M tri-ammonium citrate, pH 7.0
分辨率 1.38 Å R-free 0.178
6L1T Cryo-EM structure of phosphorylated Tyr39 a-synuclein amyloid fibril 提交 2019-09-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
6L1U Cryo-EM structure of phosphorylated Tyr39 alpha-synuclein amyloid fibril 提交 2019-09-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
6L4S cryo-em structure of alpha-synuclein fiber mutation type E46K 提交 2019-10-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 45–99(55 aa)
链 B 45–99(55 aa)
链 C 45–99(55 aa)
链 D 45–99(55 aa)
链 E 45–99(55 aa)
链 F 45–99(55 aa)
突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
6LRQ Cryo-EM structure of A53T alpha-synuclein amyloid fibril 提交 2020-01-16 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
6OSJ Cryo-EM structure of the N-terminally acetylated full length alpha-synuclein fibrils (Ac1-140) 提交 2019-05-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6OSL Cryo-EM structure of the N-terminally acetylated C-terminal Alpha-synuclein truncation Ac1-122 提交 2019-05-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6OSM Cryo-EM structure of the N-terminally acetylated C-terminal Alpha-synuclein truncation Ac1-103 提交 2019-05-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6PEO Cryo-EM structure of alpha-synuclein H50Q Narrow Fibril 提交 2019-06-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6PES Cryo-EM structure of alpha-synuclein H50Q Wide Fibril 提交 2019-06-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 V 1–140(140 aa)
链 W 1–140(140 aa)
链 X 1–140(140 aa)
链 Y 1–140(140 aa)
链 Z 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6RT0 cryo-em structure of alpha-synuclein fibril polymorph 2A 提交 2019-05-22 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;3 uL aliquots were applied onto second glow-discharged 300 mesh copper Quantifoil grids R2 1
分辨率 3.10 Å
6RTB cryo-em structure of alpha-synuclein fibril polymorph 2B 提交 2019-05-22 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;3 uL aliquots were applied onto second glow-discharged 300 mesh copper Quantifoil grids R2 1
分辨率 3.46 Å
6SST cryo-em structure of alpha-synuclein fibril polymorph 2B 提交 2019-09-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;3 uL aliquots were applied onto second glow-discharged 300 mesh copper Quantifoil grids R2 1
分辨率 3.40 Å
6SSX cryo-em structure of alpha-synuclein fibril polymorph 2A 提交 2019-09-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;3 uL aliquots were applied onto second glow-discharged 300 mesh copper Quantifoil grids R2 1
分辨率 2.98 Å
6UFR Structure of recombinantly assembled E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2019-09-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
6XYO Multiple system atrophy Type I alpha-synuclein filament 提交 2020-01-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
6XYP Multiple system atrophy Type II-1 alpha-synuclein filament 提交 2020-01-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
6XYQ Multiple system atrophy Type II-2 alpha-synuclein filament 提交 2020-01-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
7C1D Cryo-EM structure of the hE46K cross-seeded hWT alpha-synuclein fibril 提交 2020-05-03 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7E0F CryoEM structure of G51D alpha-synuclein amyloid fibril 提交 2021-01-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
突变:G51D 突变:G51D 突变:G51D 突变:G51D 突变:G51D 突变:G51D 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
7L7H Alpha-synuclein fibrils 提交 2020-12-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.00 Å
7LC9 Cryo-EM structure of the N-terminal alpha-synuclein truncation 41-140 提交 2021-01-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 41–140(100 aa)
链 B 41–140(100 aa)
链 C 41–140(100 aa)
链 D 41–140(100 aa)
链 E 41–140(100 aa)
链 F 41–140(100 aa)
链 G 41–140(100 aa)
链 H 41–140(100 aa)
链 I 41–140(100 aa)
链 J 41–140(100 aa)
链 K 41–140(100 aa)
链 L 41–140(100 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7NCA Type 1A alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 2 提交 2021-01-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LMB vitrobot IV
分辨率 3.47 Å
7NCA Type 1A alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 2 提交 2021-01-28 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LMB vitrobot IV
分辨率 3.47 Å
7NCG Type 2A alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 2 提交 2021-01-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LMB vitrobot IV
分辨率 3.43 Å
7NCG Type 2A alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 2 提交 2021-01-28 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LMB vitrobot IV
分辨率 3.43 Å
7NCH Type 1B alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1 提交 2021-01-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LMB vitrobot IV
分辨率 3.84 Å
7NCH Type 1B alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1 提交 2021-01-28 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LMB vitrobot IV
分辨率 3.84 Å
7NCI Type 2B alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1 提交 2021-01-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LMB vitrobot IV
分辨率 3.55 Å
7NCI Type 2B alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1 提交 2021-01-28 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LMB vitrobot IV
分辨率 3.55 Å
7NCJ Type 2AB alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1 提交 2021-01-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LMB vitrobot IV
分辨率 4.23 Å
7NCJ Type 2AB alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 1 提交 2021-01-28 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LMB vitrobot IV
分辨率 4.23 Å
7NCK Type 3 alpha-synuclein filament seeded in vitro by filaments purified from Multiple Systems Atrophy Case 5 提交 2021-01-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;LMB vitrobot IV
分辨率 3.18 Å
7OZG PMCA-amplified alpha-synuclein fibril polymorph, Parkinson's Disease patient-derived seeds 提交 2021-06-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7OZH PMCA-amplified alpha-synuclein fibril polymorph, Multiple System Atrophy patient-derived seeds 提交 2021-06-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
7STX Cryo-EM structure of human NatB in complex with CoA-Alpha-Synuclein 提交 2021-11-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 1–5(5 aa) 片段:UNP residues 1-5
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
7UAK Structure of recombinantly assembled A53E alpha-synuclein fibrils 提交 2022-03-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
突变:A53E 突变:A53E 突变:A53E 突变:A53E 突变:A53E 突变:A53E 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
7V47 Type 1A alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a preclinical Parkinson's disease patient 提交 2021-08-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7V48 Type 1D alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a postmortal Parkinson's disease patient 提交 2021-08-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7V49 Type 4 alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a postmortal Parkinson's disease patient 提交 2021-08-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7V4A Heparin-induced alpha-synuclein fibrils polymorph 1 提交 2021-08-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7V4B Heparin-induced alpha-synuclein fibrils polymorph 3 提交 2021-08-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7V4C Heparin-induced alpha-synuclein fibrils polymorph 4 提交 2021-08-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7V4D Heparin-remodelled alpha-synuclein fibrils 提交 2021-08-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7WMM alpha-synuclein fibril-F0502B complex 提交 2022-01-15 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 1KI 2-bromanyl-4-[(~{E})-2-[6-[2-(2-fluoranylethoxy)ethyl-methyl-amino]-5-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl]ethenyl]phenol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7WNZ CryoEM structure of human alpha-synuclein A53T fibril 提交 2022-01-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 36–100(65 aa)
链 B 36–100(65 aa)
链 C 36–100(65 aa)
链 D 36–100(65 aa)
链 E 36–100(65 aa)
链 F 36–100(65 aa)
链 G 36–100(65 aa)
链 H 36–100(65 aa)
链 I 36–100(65 aa)
链 J 36–100(65 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7WO0 CryoEM structure of human alpha-synuclein A53T fibril induced by calcium ions 提交 2022-01-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致
链 A 35–99(65 aa)
链 B 35–99(65 aa)
链 C 35–99(65 aa)
链 D 35–99(65 aa)
链 E 35–99(65 aa)
链 F 35–99(65 aa)
链 G 35–99(65 aa)
链 O 35–99(65 aa)
链 P 35–99(65 aa)
链 Q 35–99(65 aa)
链 R 35–99(65 aa)
链 S 35–99(65 aa)
链 T 35–99(65 aa)
链 U 35–99(65 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7XJX The cryo-EM structure of Fe3+ induced alpha-syn fibril. 提交 2022-04-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7XO0 Minor polymorph inalpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a mid-to-late stage (mid-PD-1) Parkinson's disease patient 提交 2022-04-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7XO1 Major polymorph in alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a mid-to-late stage (mid-PD-1) Parkinson's disease patient 提交 2022-04-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7XO2 Minor polymorph in alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a mid-to-late stage (mid-PD-4) Parkinson's disease patient 提交 2022-04-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7XO3 Type 1C alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a mid-to-late stage (mid-PD-4) Parkinson's disease patient 提交 2022-04-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7YK2 Cryo-EM structure of Apo-alpha-syn fibril 提交 2022-07-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7YK8 Cryo-EM structure of dLAG3-alpha-syn fibril 提交 2022-07-22 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7YNF CCA-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 V79 copper;trisodium;18-(2-carboxylatoethyl)-20-(carboxylatomethyl)-12-ethenyl-7-ethyl-3,8,13,17-tetramethyl-17,18-dihydroporphyrin-21,23-diide-2-carboxylate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7YNG CR-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7YNL EB-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
未记录 IZ8 4-azanyl-6-[[4-[4-[(~{E})-(8-azanyl-1-oxidanyl-5,7-disulfo-naphthalen-2-yl)diazenyl]-3-methyl-phenyl]-2-methyl-phenyl]diazenyl]-5-oxidanyl-naphthalene-1,3-disulfonic acid × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7YNM ThT-bound alpha-synuclein fibrils conformation 1 提交 2022-07-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7YNN ThT-bound alpha-synuclein fibrils conformation 2 提交 2022-07-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7YNO PiB-bound alpha-synuclein fibrils conformation 1 提交 2022-07-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 IZV 2-[4-(methylamino)phenyl]-1,3-benzothiazol-6-ol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7YNP BF227-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 IZM 5-[(~{E})-2-(6-methoxy-1,3-benzoxazol-2-yl)ethenyl]-~{N},~{N}-dimethyl-1,3-thiazol-2-amine × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7YNQ PiB-bound alpha-synuclein fibrils conformation 2 提交 2022-07-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 IZV 2-[4-(methylamino)phenyl]-1,3-benzothiazol-6-ol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7YNR C05-03-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7YNS SIL5-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7YNT pFTAA-bound alpha-synuclein fibrils 提交 2022-07-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8A4L Lipidic alpha-synuclein fibril - polymorph L2A 提交 2022-06-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
链 P 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
8A9L Cryo-EM structure of alpha-synuclein filaments from Parkinson's disease and dementia with Lewy bodies 提交 2022-06-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:Trimeric(3) 待复核
链 A 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.20 Å
8ADS Lipidic alpha-synuclein fibril - polymorph L2B 提交 2022-07-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8ADU Lipidic alpha-synuclein fibril - polymorph L1A 提交 2022-07-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
8ADV Lipidic alpha-synuclein fibril - polymorph L1B 提交 2022-07-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
8ADW Lipidic alpha-synuclein fibril - polymorph L1C 提交 2022-07-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
8AEX Lipidic alpha-synuclein fibril - polymorph L3A 提交 2022-07-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
8BQV Cryo-EM structure of alpha-synuclein singlet filament from Juvenile-onset synucleinopathy 提交 2023-01-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:Decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.00 Å
8BQW Cryo-EM structure of alpha-synuclein filaments doublet from Juvenile-onset synucleinopathy 提交 2023-01-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:Eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8CE7 Type1 alpha-synuclein filament assembled in vitro by wild-type and mutant (7 residues insertion) protein 提交 2023-02-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:Hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8CEB Type2 alpha-synuclein filament assembled in vitro by wild-type and mutant (7 residues insertion) protein 提交 2023-02-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8CYR Alpha-synuclein fibril from spontaneous control 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8CYS CryoEM structures of amplified alpha-synuclein fibril class B type II with extended core from DLB case I 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8CYT CryoEM structures of amplified alpha-synuclein fibril class A type I with extended core from DLB case I 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CYV CryoEM structures of amplified alpha-synuclein fibril class B mixed type I/II with extended core from DLB case II 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8CYW CryoEM structures of amplified alpha-synuclein fibril class B type I with compact core from DLB case III 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8CYX CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class A type I with compact core from DLB case III 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CYY CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class B mixed type I/II with extended core from DLB case V 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8CZ0 CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class B type I with extended core from DLB case VII 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8CZ1 CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class B type II with extended core from DLB case VII 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CZ2 CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class A type I with extended core from DLB case VII 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CZ3 CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class B type I with extended core from DLB case X 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8CZ6 CryoEM structure of amplified alpha-synuclein fibril class A type I with extended core from DLB case X 提交 2022-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Gibco Cat # 10010072
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8FPT STRUCTURE OF ALPHA-SYNUCLEIN FIBRILS DERIVED FROM HUMAN LEWY BODY DEMENTIA TISSUE 提交 2023-01-05 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 7.6;273 K;离子强度(mmCIF原始值)100 mM NACL;压力 AMBIENT
NMR样品组成 66 % [U-100% 13C; U-100% 15N] ALPHA-SYNUCLEIN, 34% H2O | 34% H2O
NMR样品组成 66 % [U-100% 2H; U-100% 13C; U-100% 15N] ALPHA-SYNUCLEIN, 34% H2O, BACK-EXCHANGED IN 99.8% D2O | 34% H2O, BACK-EXCHANGED IN 99.8% D2O
NMR样品组成 20 % [U-25% 2-13C GLYCEROL; U-100% 15N] labelled ALPHA-SYNUCLEIN, 80 % ALPHA-SYNUCLEIN, H2O | H2O
分辨率未提供
8G0L Semi-synthetic CoA-alpha-Synuclein Constructs Trap N-terminal Acetyltransferase NatB for Binding Mechanism Studies 提交 2023-01-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 1–5(5 aa) 片段:UNP residues 1-5
未记录 CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
8GF7 Cryo-EM structure of serine 87 O-GlcNAc-modified alpha-synuclein fibrils 提交 2023-03-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 7–96(90 aa)
链 B 7–96(90 aa)
链 C 7–96(90 aa)
链 D 7–96(90 aa)
链 E 7–96(90 aa)
链 F 7–96(90 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;normal PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8H03 Major polymorph in alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a preclinical Parkinson's disease patient 提交 2022-09-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8H04 Major polymorph in alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a postmortal Parkinson's disease patient 提交 2022-09-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8H05 Minor polymorph in alpha-synuclein fibril seeded by cerebrospinal fluid from a postmortal Parkinson's disease patient 提交 2022-09-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8HZB Formed alpha-synuclein fibrils after incubation with heparin for 1 hour (Hep-remod-1) 提交 2023-01-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8HZC Formed alpha-synuclein fibrils after incubation with heparin for 1 hour (Hep-remod-2) 提交 2023-01-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8HZS Formed alpha-synuclein fibrils after incubation with heparin for 3 days (Hep-remod-3) 提交 2023-01-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8JEX Cryo-EM structure of alpha-synuclein gS87 fibril 提交 2023-05-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 P 1–140(140 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8JEY Cryo-EM structure of alpha-synuclein pS87 fibril 提交 2023-05-16 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8JJV Structure of truncated form of nanobody in complex with alpha-synuclein peptide 提交 2023-05-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 43–56(14 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M BIS-TRIS pH 5.5, 2.0M ammonium sulfate
分辨率 1.23 Å R-free 0.170
8JLY Structure of nanobody in complex with alpha-synuclein peptide 提交 2023-06-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 43–56(14 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 2.0M ammonium sulfate
分辨率 1.29 Å R-free 0.186
8OG0 Crystal structure of MJF14-6-4-2 Fab fragment in complex with epitope peptide 提交 2023-03-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 P 136–140(5 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;293 K;Sitting droplets were set up by mixing 1 ul of Fab fragments, 0.5 ul of peptide (1 mg/ml in 20 mM tris-HCl) and 1 ul crystallization buffer (24% PEG 6000, 0.1M Na-citrate pH 5.0).
分辨率 1.71 Å R-free 0.231
8OQI Cryo-EM structure of the wild-type alpha-synuclein fibril. 提交 2023-04-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PIX Cryo EM structure of the type 3C polymorph of alpha-synuclein at low pH. 提交 2023-06-22 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.41 Å
8PJO Cryo EM structure of the type 3D polymorph of alpha-synuclein E46K mutant at low pH. 提交 2023-06-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K CL CHLORIDE ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.31 Å
8PK2 Cryo EM structure of the type 1m polymorph of alpha-synuclein 提交 2023-06-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
8PK4 Cryo EM structure of the type 5A polymorph of alpha-synuclein. 提交 2023-06-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
8QPZ CryoEM structure of recombinant DeltaN7 alpha-synuclein in PBS 提交 2023-10-03 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 A 8–140(133 aa)
链 B 8–140(133 aa)
链 C 8–140(133 aa)
链 D 8–140(133 aa)
链 E 8–140(133 aa)
链 F 8–140(133 aa)
链 G 8–140(133 aa)
链 H 8–140(133 aa)
链 I 8–140(133 aa)
链 J 8–140(133 aa)
链 K 8–140(133 aa)
链 L 8–140(133 aa)
突变:deltaN7 (methionine kept for expression) 突变:deltaN7 (methionine kept for expression) 突变:deltaN7 (methionine kept for expression) 突变:deltaN7 (methionine kept for expression) 突变:deltaN7 (methionine kept for expression) 突变:deltaN7 (methionine kept for expression) 突变:deltaN7 (methionine kept for expression) 突变:deltaN7 (methionine kept for expression) 突变:deltaN7 (methionine kept for expression) 突变:deltaN7 (methionine kept for expression) 突变:deltaN7 (methionine kept for expression) 突变:deltaN7 (methionine kept for expression) 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 8.1 mM Na2HPO4 and 1.5 mM KH2PO4; pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8RI9 Late alpha-Synuclein fibril structure from liquid-liquid phase separations. 提交 2023-12-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8RQM Alpha-synuclein amyloid fibrils 提交 2024-01-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8RRR Alpha-synuclein amyloid fibril 提交 2024-01-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8X7B ThT-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 TFX 2-[4-(dimethylamino)phenyl]-3,6-dimethyl-1,3-benzothiazol-3-ium × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8X7L EB-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 IZ8 4-azanyl-6-[[4-[4-[(~{E})-(8-azanyl-1-oxidanyl-5,7-disulfo-naphthalen-2-yl)diazenyl]-3-methyl-phenyl]-2-methyl-phenyl]diazenyl]-5-oxidanyl-naphthalene-1,3-disulfonic acid × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8X7M CR-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 CGO sodium 3,3'-(1E,1'E)-biphenyl-4,4'-diylbis(diazene-2,1-diyl)bis(4-aminonaphthalene-1-sulfonate) × 16 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8X7O PiB-bound E46K mutanted alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K 突变:E46K IZV 2-[4-(methylamino)phenyl]-1,3-benzothiazol-6-ol × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8X7P CCA-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 V79 copper;trisodium;18-(2-carboxylatoethyl)-20-(carboxylatomethyl)-12-ethenyl-7-ethyl-3,8,13,17-tetramethyl-17,18-dihydroporphyrin-21,23-diide-2-carboxylate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8X7Q pFTAA-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 3LS 3''',4'-bis(carboxymethyl)-2,2':5',2'':5'',2''':5''',2''''-quinquethiophene-5,5''''-dicarboxylic acid × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8X7R C05-03-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2023-11-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 Y9W 2-[(~{E})-4-[6-(methylamino)pyridin-3-yl]but-1-en-3-ynyl]-1,3-benzothiazol-6-ol × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8XWD Croy-EM structure of alpha synuclein fibril with EGCG 提交 2024-01-16 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 KDH (2R,3R)-5,7-dihydroxy-2-(3,4,5-trihydroxyphenyl)-3,4-dihydro-2H-chromen-3-yl 3,4,5-trihydroxybenzoate × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8Y2P The cryo-EM structure of a-synuclein fibril in Tris buffer. 提交 2024-01-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8Y2Q The cryo-EM structure of spermine induced a-synuclein fibril in Tris buffer. 提交 2024-01-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8ZLI BTA-2-bound E46K alpha-synuclein fibrils 提交 2024-05-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 45–99(55 aa)
链 B 45–99(55 aa)
链 C 45–99(55 aa)
链 D 45–99(55 aa)
链 E 45–99(55 aa)
链 F 45–99(55 aa)
链 I 45–99(55 aa)
链 J 45–99(55 aa)
链 K 45–99(55 aa)
链 L 45–99(55 aa)
未记录 A1L13 ~{N},~{N}-dimethyl-4-(6-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl)aniline × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8ZLO F0502B-bound E46K alpha-synuclein fibril 提交 2024-05-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 A 45–99(55 aa)
链 B 45–99(55 aa)
链 C 45–99(55 aa)
链 D 45–99(55 aa)
链 E 45–99(55 aa)
链 F 45–99(55 aa)
链 G 45–99(55 aa)
链 H 45–99(55 aa)
链 I 45–99(55 aa)
链 J 45–99(55 aa)
链 O 45–99(55 aa)
链 T 45–99(55 aa)
未记录 1KI 2-bromanyl-4-[(~{E})-2-[6-[2-(2-fluoranylethoxy)ethyl-methyl-amino]-5-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl]ethenyl]phenol × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8ZLP apo WT polymorph 5a alpha-synuclein fibril 提交 2024-05-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–98(98 aa)
链 B 1–98(98 aa)
链 C 1–98(98 aa)
链 F 1–98(98 aa)
链 G 1–98(98 aa)
链 H 1–98(98 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8ZMY F0502B-bound WT polymorph 5a alpha-synuclein fibril 提交 2024-05-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–98(98 aa)
链 B 1–98(98 aa)
链 C 1–98(98 aa)
链 D 1–98(98 aa)
链 E 1–98(98 aa)
链 F 1–98(98 aa)
链 G 1–98(98 aa)
链 H 1–98(98 aa)
链 I 1–98(98 aa)
链 J 1–98(98 aa)
链 K 1–98(98 aa)
链 L 1–98(98 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 1KI 2-bromanyl-4-[(~{E})-2-[6-[2-(2-fluoranylethoxy)ethyl-methyl-amino]-5-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl]ethenyl]phenol × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8ZVY Alpha-Synuclein with H2a-H2b dimer complex structure. 提交 2024-06-12 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 121–140(20 aa)
链 D 121–140(20 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;291.15 K;100 mM Tris pH 8.0 and 10% PEG 8000.
分辨率 1.72 Å R-free 0.220
8ZWH Heparin bound E46K alpha-synuclein fibril 提交 2024-06-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8ZWI Chondroitin sulfate bound alpha-synuclein fibril 提交 2024-06-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8ZWJ Polyadenylic acid bound alpha-synuclein fibril Polymorph 1 提交 2024-06-13 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8ZWK Polyadenylic acid bound alpha-synuclein fibril Polymorph 2 提交 2024-06-13 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:octameric(8) 与全部聚合物一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9C5R Structure of recombinantly assembled alpha-synuclein variant fibrils 提交 2024-06-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
9CD9 Structure of type II-2 alpha-synuclein filament from multiple system atrophy 提交 2024-06-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白数一致
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
链 P 1–140(140 aa)
链 Q 1–140(140 aa)
链 R 1–140(140 aa)
链 S 1–140(140 aa)
链 T 1–140(140 aa)
链 U 1–140(140 aa)
链 V 1–140(140 aa)
链 W 1–140(140 aa)
链 X 1–140(140 aa)
链 Y 1–140(140 aa)
链 Z 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Wait time 30s, blot time 7.5s
分辨率 3.20 Å
9CDA Structure of type I-2 alpha-synuclein filament from multiple system atrophy 提交 2024-06-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 18 PDB 声明:18-meric(18) 与蛋白数一致
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
链 P 1–140(140 aa)
链 Q 1–140(140 aa)
链 R 1–140(140 aa)
链 S 1–140(140 aa)
链 T 1–140(140 aa)
链 U 1–140(140 aa)
链 V 1–140(140 aa)
链 W 1–140(140 aa)
链 X 1–140(140 aa)
链 Y 1–140(140 aa)
链 Z 1–140(140 aa)
链 a 1–140(140 aa)
链 b 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Wait time 30s, blot time 7.5s
分辨率 3.30 Å
9CK3 Cryo-EM structure of in-vitro alpha-synuclein fibril 提交 2024-07-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.04 Å
9CKK Cryo-EM structure of acetylated alpha-synuclein A53T fibril - polymorph A 提交 2024-07-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.21 Å
9CKL Cryo-EM structure of acetylated alpha-synuclein A53T fibril - polymorph B 提交 2024-07-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2;Dulbecco's Phosphate Buffered Saline without calcium chloride and magnesium chloride
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
9CX6 Cryo-EM filament structure in FTLD-synuclein 提交 2024-07-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9CX6 Cryo-EM filament structure in FTLD-synuclein 提交 2024-07-30 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9D5C Cryo-EM structure of serine 87 O-GlcNAc-modified alpha-synuclein fibrils 提交 2024-08-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–96(96 aa)
链 B 1–96(96 aa)
链 C 1–96(96 aa)
链 F 1–96(96 aa)
链 G 1–96(96 aa)
链 H 1–96(96 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;normal PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
9E8U (Apo)Alpha-synuclein fibril structures from MSA patient brain 提交 2024-11-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;30mM Tris-HCl, pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9E8V Complex fibril structure of MSA alpha-synuclein with CNS-11g at 4 hours 提交 2024-11-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 A1BGB 2-(4-benzyl-1-oxophthalazin-2(1H)-yl)-N-(2,6-dimethylphenyl)acetamide × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;30mM Tris-HCl, pH 7.4, with 1% DMSO
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9E8W Complex fibril structure of MSA alpha-synuclein with CNS-11g at 6 hours 提交 2024-11-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 A1BGB 2-(4-benzyl-1-oxophthalazin-2(1H)-yl)-N-(2,6-dimethylphenyl)acetamide × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;30mM Tris-HCl, pH 7.4, with 1% DMSO
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9E8X Complex fibril structure of MSA alpha-synuclein with CNS-11g at 10 hours 提交 2024-11-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 A1BGB 2-(4-benzyl-1-oxophthalazin-2(1H)-yl)-N-(2,6-dimethylphenyl)acetamide × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;30mM Tris-HCl, pH 7.4, with 1% DMSO
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9E8Y Complex fibril structure of MSA alpha-synuclein with CNS-11g at 15 hours 提交 2024-11-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 A1BGB 2-(4-benzyl-1-oxophthalazin-2(1H)-yl)-N-(2,6-dimethylphenyl)acetamide × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;30mM Tris-HCl, pH 7.4, with 1% DMSO
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9E9X Cryo-EM structure of alpha-synuclein filaments derived from the temporal cortex of the case of atypical multiple system atrophy 提交 2024-11-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EUU Structure of recombinant alpha-synuclein fibrils 1B capable of seeding GCIs in vivo 提交 2024-03-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 18 PDB 声明:18-meric(18) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
链 P 1–140(140 aa)
链 Q 1–140(140 aa)
链 R 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;NaCl 100 mM, TRIS 20mM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 1.93 Å
9FYP Cryo EM structure of the type 3B polymorph of alpha-synuclein at low pH. 提交 2024-07-03 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
链 P 1–140(140 aa)
链 Q 1–140(140 aa)
链 R 1–140(140 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.23 Å
9HC6 The L2A-I alpha-synuclein fibril in the presence of MODAG-005 (short incubation) 提交 2024-11-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:15-meric(15) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
9HC7 The L2A-II alpha-synuclein fibril in the presence of MODAG-005 (short incubation) 提交 2024-11-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:15-meric(15) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
9HC8 The L2C alpha-synuclein fibril in the presence of MODAG-005 (short incubation) 提交 2024-11-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9HC9 The L2A-I alpha-synuclein fibril in the presence of MODAG-005 (long incubation) 提交 2024-11-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:15-meric(15) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
9HCA The L2A-II alpha-synuclein fibril in the presence of MODAG-005 (long incubation) 提交 2024-11-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:15-meric(15) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9HCB The L2C alpha-synuclein fibril in the presence of MODAG-005 (long incubation) 提交 2024-11-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9HGR In vitro grown WT Alpha-Synuclein Fibrils 提交 2024-11-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.70 Å
9HGS In vitro grown G14R Alpha-Synuclein Fibrils 提交 2024-11-20 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9HXA In vitro grown K58N Alpha-Synuclein Fibrils 提交 2025-01-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.70 Å
9IC7 Cryo-EM structure of alpha-synuclein fibrils formed in artificial cerebrospinal fluid (aCSF) 提交 2025-02-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 14 PDB 声明:14-meric(14) 与蛋白数一致
链 a 1–140(140 aa)
链 b 1–140(140 aa)
链 c 1–140(140 aa)
链 d 1–140(140 aa)
链 e 1–140(140 aa)
链 f 1–140(140 aa)
链 g 1–140(140 aa)
链 h 1–140(140 aa)
链 i 1–140(140 aa)
链 j 1–140(140 aa)
链 k 1–140(140 aa)
链 l 1–140(140 aa)
链 m 1–140(140 aa)
链 n 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.33;Once all components were mixed together, the pH was adjusted by supplementing 1.6 microliters of 25% HCl to yield pH of 7.33.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9IJP Polyphosphate bound alpha-synuclein fibril 提交 2024-06-25 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 7TT Tetraphosphate × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9JBY The cryo-EM structure of Ac-K58W_G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-08-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 37–98(62 aa)
链 B 37–98(62 aa)
链 C 37–98(62 aa)
链 D 37–98(62 aa)
链 E 37–98(62 aa)
链 F 37–98(62 aa)
突变:G51D,A53T,K58W 突变:G51D,A53T,K58W 突变:G51D,A53T,K58W 突变:G51D,A53T,K58W 突变:G51D,A53T,K58W 突变:G51D,A53T,K58W 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
9JC3 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T P1 a-syn fibril. 提交 2024-08-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.39 Å
9JC4 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T P2 a-syn fibril. 提交 2024-08-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9JC5 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T P3 a-syn fibril. 提交 2024-08-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9JD7 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-08-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.57 Å
9JD8 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T P5 a-syn fibril. 提交 2024-08-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.86 Å
9JDK The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T P6 a-syn fibril. 提交 2024-08-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 37–99(63 aa)
链 B 37–99(63 aa)
链 C 37–99(63 aa)
链 D 37–99(63 aa)
链 E 37–99(63 aa)
链 F 37–99(63 aa)
突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
9JE2 The cryo-EM structure of Ac-K58N_G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-09-02 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
突变:K58N,G51D,A53T 突变:K58N,G51D,A53T 突变:K58N,G51D,A53T 突变:K58N,G51D,A53T 突变:K58N,G51D,A53T 突变:K58N,G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
9JE4 The cryo-EM structure of Ac-E57A_G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-09-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
突变:E57A,G51D,A53T 突变:E57A,G51D,A53T 突变:E57A,G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9JE6 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T low salt a-syn fibril. 提交 2024-09-02 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9JE7 The cryo-EM structure of Ac-E57Q_G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-09-02 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
突变:E57Q,G51D,A53T 突变:E57Q,G51D,A53T 突变:E57Q,G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9JE8 The cryo-EM structure of Ac-G51DA53T 30days a-syn fibril. 提交 2024-09-02 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9JI8 Cryo-EM structure of alpha-synuclein-H21 fibril 提交 2024-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 F 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 G 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 K 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 L 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 M 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
链 O 37–99(63 aa) 片段:UNP residues 37-99
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
9JKE The cryo-EM structure of Ac-K58W_G51DA53T P2 a-syn fibril. 提交 2024-09-15 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 37–98(62 aa)
链 B 37–98(62 aa)
链 C 37–98(62 aa)
链 D 37–98(62 aa)
链 E 37–98(62 aa)
链 F 37–98(62 aa)
突变:K58W,G51D,A53T 突变:K58W,G51D,A53T 突变:K58W,G51D,A53T 突变:K58W,G51D,A53T 突变:K58W,G51D,A53T 突变:K58W,G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9JO6 The complex of alpha-synuclein in the presence of PD6 提交 2024-09-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5;283.15 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1627;压力 1
NMR测量条件 pH 7.5;283.15 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1627;压力 1
NMR样品组成 0.50 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] alpha-synuclein, 1.00 mM PD6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.20 mM alpha-synuclein, 0.40 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PD6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
9K7Q Parkinson disease protein 7 (DJ-1) and Alpha-synuclein (Alpha-syn) complex 提交 2024-10-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 M 1–92(92 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2 M Sodium iodide, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350, pH 7.0
分辨率 4.58 Å R-free 0.222
9KA3 The cryo-EM structure of Ac-K58D_G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-10-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
突变:K58D,G51D,A53T 突变:K58D,G51D,A53T 突变:K58D,G51D,A53T 突变:K58D,G51D,A53T 突变:K58D,G51D,A53T 突变:K58D,G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.72 Å
9KA4 The cryo-EM structure of MSA-like fold (P1) formed under the palette stratagy. 提交 2024-10-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
9KAL The cryo-EM structure of Ac-E57A_G51DA53T a-syn fibril. 提交 2024-10-29 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
突变:E57A,G51D,A53T 突变:E57A,G51D,A53T 突变:E57A,G51D,A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9KC2 Cryo-EM structure of ZSQ07-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2024-10-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
未记录 A1EFK 2-[(4~{E})-4-[(~{E})-3-(3-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl)prop-2-enylidene]quinolin-1-yl]ethanol × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9KCN Cryo-EM structure of FD4-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2024-11-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 L 37–140(104 aa)
链 M 37–140(104 aa)
链 N 37–140(104 aa)
链 P 37–140(104 aa)
链 Q 37–140(104 aa)
链 R 37–140(104 aa)
链 d 37–140(104 aa)
链 e 37–140(104 aa)
链 f 37–140(104 aa)
链 h 37–140(104 aa)
链 i 37–140(104 aa)
链 j 37–140(104 aa)
未记录 A1EFL (2~{R})-1-fluoranyl-3-[[2-[(~{E})-2-[5-[6-(methylamino)pyridin-3-yl]pyridin-2-yl]ethenyl]-1,3-benzothiazol-6-yl]oxy]propan-2-ol × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9KCO Cryo-EM structure of FD4-bound alpha-synuclein MSA-like fibril 提交 2024-11-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
链 P 1–140(140 aa)
链 Q 1–140(140 aa)
突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T 突变:G51D,A53T A1EFL (2~{R})-1-fluoranyl-3-[[2-[(~{E})-2-[5-[6-(methylamino)pyridin-3-yl]pyridin-2-yl]ethenyl]-1,3-benzothiazol-6-yl]oxy]propan-2-ol × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9KCP Cryo-EM structure of ACI-12589-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2024-11-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9M5K The cryo-EM structure of in situ amplified (ISA) alpha-synuclein fibrils from PD homogenate 提交 2025-03-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9M5L The cryo-EM structure of in situ amplified (ISA) alpha-synuclein fibrils from DLB homogenate 提交 2025-03-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
9O4B Cryo-EM structure of in-vitro alpha-synuclein fibril bound with Exemplar-6 PET-radioligand 提交 2025-04-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 A1B9H 2-(3,4-dimethylphenoxy)-N-[3-(4-fluorophenyl)-1,2-oxazol-5-yl]acetamide × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.59 Å
9O9J Cryo-EM structure of alpha-synuclein filaments from Parkinson's disease with G51D mutaion in SNCA 提交 2025-04-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:20-meric(20) 待复核
链 A 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
9O9K Cryo-EM structure of alpha-synuclein filaments from Parkinson's disease with H50Q variant in SNCA 提交 2025-04-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:15-meric(15) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9OBP Cryo-EM structure of alpha-synuclein filaments derived from the frontal cortex of the case of atypical multiple system atrophy 提交 2025-04-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9QYL Alpha-synuclein fibril type 1A polymorph in the presence of ATP 提交 2025-04-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
链 P 1–140(140 aa)
链 Q 1–140(140 aa)
链 e 1–140(140 aa)
链 f 1–140(140 aa)
链 g 1–140(140 aa)
链 h 1–140(140 aa)
链 j 1–140(140 aa)
链 k 1–140(140 aa)
链 l 1–140(140 aa)
链 m 1–140(140 aa)
链 n 1–140(140 aa)
链 o 1–140(140 aa)
链 p 1–140(140 aa)
链 q 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Tris, 150 mM NaCl, pH 7.5, 1 mM MgCl2, 1 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.08 Å
9QYN Alpha-synuclein K21A fibril type 1A polymorph in the presence of ATP 提交 2025-04-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
链 P 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Tris, 150 mM NaCl, pH 7.5, 1 mM MgCl2, 1 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.13 Å
9RB3 A53T alpha-synuclein fibril - Type 1 提交 2025-05-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9RB6 A53T alpha-synuclein fibril - Type 2 提交 2025-05-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
9RB7 Wild-type alpha-synuclein fibril - Type 1 提交 2025-05-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
9RB8 Wild-type alpha-synuclein fibril - Type 3-1 提交 2025-05-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
9RB9 Wild-type alpha-synuclein fibril - Type 3-2 提交 2025-05-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
9RBA Wild-type alpha-synuclein fibril - Type 4 提交 2025-05-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
9RBB Wild-type alpha-synuclein fibril - Type 5 提交 2025-05-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
9RZF Structure of in-vivo formed alpha-synuclein fibrils purified from a M83+/- mouse brain injected with recombinant 1B fibrils 提交 2025-07-15 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 37–97(61 aa)
链 B 37–97(61 aa)
链 C 37–97(61 aa)
链 D 37–97(61 aa)
链 E 37–97(61 aa)
链 F 37–97(61 aa)
突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 突变:A53T 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;50 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9TPT Structure of recombinantly assembled E83Q alpha-synuclein fibrils 提交 2025-12-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致
链 A 36–100(65 aa)
链 B 36–100(65 aa)
链 C 36–100(65 aa)
链 D 36–100(65 aa)
链 E 36–100(65 aa)
链 F 36–100(65 aa)
链 H 36–100(65 aa)
链 I 36–100(65 aa)
链 J 36–100(65 aa)
链 L 36–100(65 aa)
链 M 36–100(65 aa)
链 N 36–100(65 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9UF6 Cryo-EM structure of BA1-1-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
链 P 1–140(140 aa)
未记录 A1EO7 (2~{E})-1-ethyl-2-[(~{E})-3-(1-ethylquinolin-1-ium-2-yl)prop-2-enylidene]quinoline × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9UFD Cryo-EM structure of BA12-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
链 M 1–140(140 aa)
链 N 1–140(140 aa)
链 O 1–140(140 aa)
链 P 1–140(140 aa)
未记录 A1EO8 (2~{Z})-3-ethyl-2-[(~{E})-3-(3-ethyl-1,3-benzothiazol-3-ium-2-yl)prop-2-enylidene]-1,3-benzothiazole × 36 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9UFF Cryo-EM structure of BA21-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 A1EO6 ~{N}-(1-ethyl-2-oxidanylidene-benzo[cd]indol-6-yl)-2,5-dimethoxy-benzamide × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9UFL Cryo-EM structure of BA22-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9UFS Cryo-EM structure of BA23-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9UFX Cryo-EM structure of HA11-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 A1EPA 2',4',5',7'-tetrakis(iodanyl)-3',6'-bis(oxidanyl)spiro[2-benzofuran-3,9'-xanthene]-1-one × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9UFY Cryo-EM structure of HA21-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 GO3 Gossypol × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9UG0 Cryo-EM structure of HA31-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 A1EPK 4-[(3~{R},5~{S})-3,5-dimethylpiperidin-1-yl]sulfonyl-~{N}'-(4-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl)benzohydrazide × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9UG1 Cryo-EM structure of HA32-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-10 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
链 K 1–140(140 aa)
链 L 1–140(140 aa)
未记录 A1EPB 4-(3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-ylsulfonyl)-~{N}'-(4-methyl-1,3-benzothiazol-2-yl)benzohydrazide × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9UJQ Cryo-EM structure of HQY1027-bound alpha-synuclein fibril polymorph 6A6B 提交 2025-04-17 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9V6U The cryo-EM structure of FD4 bound Lewy fold fibril. 提交 2025-05-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致
链 c 1–140(140 aa)
链 d 1–140(140 aa)
链 e 1–140(140 aa)
链 f 1–140(140 aa)
链 g 1–140(140 aa)
链 h 1–140(140 aa)
链 i 1–140(140 aa)
链 j 1–140(140 aa)
链 k 1–140(140 aa)
链 o 1–140(140 aa)
链 p 1–140(140 aa)
链 q 1–140(140 aa)
链 r 1–140(140 aa)
链 s 1–140(140 aa)
链 t 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.30 Å
9V7C The cryo-EM structure of FD4_orientation2 bound Lewy fold fibril. 提交 2025-05-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致
链 c 32–101(70 aa)
链 d 32–101(70 aa)
链 e 32–101(70 aa)
链 f 32–101(70 aa)
链 g 32–101(70 aa)
链 h 32–101(70 aa)
链 i 32–101(70 aa)
链 j 32–101(70 aa)
链 k 32–101(70 aa)
链 o 32–101(70 aa)
链 p 32–101(70 aa)
链 q 32–101(70 aa)
链 r 32–101(70 aa)
链 s 32–101(70 aa)
链 t 32–101(70 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.30 Å
9Y0S CryoEM structure of alpha-synuclein fibril induced by psychosine 提交 2025-08-29 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 A 1–140(140 aa)
链 B 1–140(140 aa)
链 C 1–140(140 aa)
链 D 1–140(140 aa)
链 E 1–140(140 aa)
链 F 1–140(140 aa)
链 G 1–140(140 aa)
链 H 1–140(140 aa)
链 I 1–140(140 aa)
链 J 1–140(140 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.72 Å