1ao6

CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN SERUM ALBUMIN

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 114.2 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SERUM ALBUMIN

物种未注明

UniProt P02768

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 25–609 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.5;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 22-25% PEG 3350, 50 MM POTASSIUM PHOSPHATE, PH 7.0-7.5. 分辨率 2.50 Å R-free 0.282
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 25–609 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.5;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 22-25% PEG 3350, 50 MM POTASSIUM PHOSPHATE, PH 7.0-7.5. 分辨率 2.50 Å R-free 0.282

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 187 个其他 PDB 条目、270 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ALBU_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–585; UniProt 25–609 作者链 B; PDB构建体 1–585; UniProt 25–609

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1ao6

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1ao6
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ao6
沉积日期 deposition_date1997-07-18
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN SERUM ALBUMIN
关键词 keywordsCARRIER PROTEIN, ALBUMIN; CARRIER PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier36.26
回转半径 Rg (电子) rg_electron35.44
零角强度 I(0) i0271966000.00
分子量 molecular_weight131410.0 kDa
排除体积 excluded_volume163980 ų
包络体积 envelope_volume224170 ų
水化壳体积 shell_volume52782 ų
包络直径 envelope_diameter120.3
壳层 Rg shell_rg42.13
包络 Rg envelope_rg34.55
形状 Rg shape_rg35.44
总 Rg total_rg35.91
总原子数 total_atoms9198
残基数 n_residues1156
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax114.2
Rg (实空间) rg_real36.15
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.70
I(0) (实空间) i0_real2.7200e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.2810e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal36.22
I(0) (倒空间) i0_reciprocal272000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8932
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary44.1
偏度 Skewness skewness0.242
峰度 Kurtosis kurtosis-0.378
角度范围 angular_range— – 0.2200 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha28140000.0000
实空间数据点数 n_real_points45
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.932; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.814

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 18 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd1ao6a1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.1 — Serum albumin-like
结构域编号 domain_idd1ao6a2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.1 — Serum albumin-like
结构域编号 domain_idd1ao6a3
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.1 — Serum albumin-like
结构域编号 domain_idd1ao6b1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.1 — Serum albumin-like
结构域编号 domain_idd1ao6b2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.1 — Serum albumin-like
结构域编号 domain_idd1ao6b3
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.1 — Serum albumin-like

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id1ao6A01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1ao6A02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1ao6A03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1ao6A04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1ao6A05
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1ao6A06
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1ao6B01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1ao6B02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1ao6B03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1ao6B04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1ao6B05
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1ao6B06
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10

8. 引用文献 (7)

9. 文件与曲线 (10)