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1lm8

Structure of a HIF-1a-pVHL-ElonginB-ElonginC Complex

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 89.5 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ELONGIN B

Homo sapiens

UniProt Q15370

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–118 未记录 ELONGIN C × 1 （Q15369） Von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 （P40337） Hypoxia-inducible factor 1 alpha × 1 （Q16665） X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6.5；pH 6.5 分辨率 1.85 Å R-free 0.236

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1LM8 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa） 片段：RESIDUES 1-120
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa） 片段：RESIDUES 1-120
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa） 片段：RESIDUES 1-120
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa） 片段：RESIDUES 1-120
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
2C9W CRYSTAL STRUCTURE OF SOCS-2 IN COMPLEX WITH ELONGIN-B AND ELONGIN-C AT 1.9A RESOLUTION 提交 2005-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 NI NICKEL (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；2M AMSO4 0.2M NACL, 0.1M CACODYLATE PH 6.5 300 NL SITTING DROPS AT 4 DEGREES
分辨率 1.90 Å R-free 0.225
2IZV CRYSTAL STRUCTURE OF SOCS-4 IN COMPLEX WITH ELONGIN-B AND ELONGIN-C AT 2.55A RESOLUTION 提交 2006-07-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；150 UL SITTING DROP 2M NACL 10% PEK6K
分辨率 2.55 Å R-free 0.223
2JZ3 SOCS box elonginBC ternary complex 提交 2007-12-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient
NMR样品组成 1mM [U-100% 13C; U-100% 15N] socs box; 1mM elonginB; 1mM elonginC; 50mM potassium chloride; 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MA9 HIV-1 Vif SOCS-box and Elongin BC solution structure 提交 2013-07-01 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Vif SOCS, 0.2 mM Elongin B, 0.2 mM Elongin C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM Vif SOCS, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin B, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM Vif SOCS, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin B, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3DCG Crystal Structure of the HIV Vif BC-box in Complex with Human ElonginB and ElonginC 提交 2008-06-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.1M Tris HCl pH 7.0, 40% PEG 350 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.232
3DCG Crystal Structure of the HIV Vif BC-box in Complex with Human ElonginB and ElonginC 提交 2008-06-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.1M Tris HCl pH 7.0, 40% PEG 350 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.232
3ZKJ Crystal Structure of Ankyrin Repeat and Socs Box-Containing Protein 9 (Asb9) in Complex with Elonginb and Elonginc 提交 2013-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–118（118 aa） 片段：RESIDUES 221-338
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2M NA2SO4, 0.1M BTPROP 6.5, 20% PEG 3350, 10% ETGLY
分辨率 2.58 Å R-free 0.265
3ZKJ Crystal Structure of Ankyrin Repeat and Socs Box-Containing Protein 9 (Asb9) in Complex with Elonginb and Elonginc 提交 2013-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–118（118 aa） 片段：RESIDUES 221-338
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2M NA2SO4, 0.1M BTPROP 6.5, 20% PEG 3350, 10% ETGLY
分辨率 2.58 Å R-free 0.265
3ZNG Ankyrin repeat and SOCS-box protein 9 (ASB9) in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2013-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–118（118 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M BIS-TRIS PROPANE, PH 6.7, 0.2 M SODIUM MALONATE, 22% PEG 3350, 10% ETHYLENE GLYCOL
分辨率 2.85 Å R-free 0.242
3ZNG Ankyrin repeat and SOCS-box protein 9 (ASB9) in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2013-02-14 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M BIS-TRIS PROPANE, PH 6.7, 0.2 M SODIUM MALONATE, 22% PEG 3350, 10% ETHYLENE GLYCOL
分辨率 2.85 Å R-free 0.242
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
4AJY von Hippel-Lindau protein-ElonginB-ElonginC complex, bound to Hif1- alpha peptide 提交 2012-02-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M K PHOSPHATE PH 6.6 0.2 M (NH4)2SO4 20% PEG MME 5000 5 MM DTT
分辨率 1.73 Å R-free 0.232
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 3 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
未记录 X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
未记录 X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ARG ARGININE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa） 片段：RESIDUES 1-104
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 X 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 4 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 e 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 J 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 P 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 W 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 g 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 m 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 s 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 y 1–102（102 aa） 片段：UNP residues 1-102
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4WQO Structure of VHL-EloB-EloC-Cul2 提交 2014-10-22 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；4M Na formate
分辨率 3.20 Å R-free 0.249
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 N 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Q 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5N4W Crystal structure of the Cul2-Rbx1-EloBC-VHL ubiquitin ligase complex 提交 2017-02-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；0.1 M Tris pH 7.6, 0.15 M ammonium sulphate, 15% polyethyleneglycol 4000 and 3% 1,4-dioxane or 4% acetonitrile. The sample was crystallised in the presence of a 19-mer peptide mimicking the substrate HIF-1alpha - residues 559-577 (DEALAPYIPMDDDFQLRSF, with the mutations L559D and M561A and P564 is hydroxyproline).
分辨率 3.90 Å R-free 0.346
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–104（104 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
6BVB Crystal structure of HIF-2alpha-pVHL-elongin B-elongin C 提交 2017-12-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；26% (v/v) PEG-3350, 0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris. 7 mg/mL protein complex.
分辨率 2.00 Å R-free 0.235
6C5X Crystal Structure of SOCS1 in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2018-01-17 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；18% PEG3350, 200 mM sodium fluoride, 100 mM Tris, pH 7.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.271
6C5X Crystal Structure of SOCS1 in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2018-01-17 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；18% PEG3350, 200 mM sodium fluoride, 100 mM Tris, pH 7.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.271
6FMI pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-Hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)acetamide (ligand 2) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV2 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
6FMI pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-Hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)acetamide (ligand 2) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV2 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6GFX pVHL:EloB:EloC in complex with modified HIF-1a CODD peptide containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 13a) 提交 2018-05-02 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20-22% PEG MME 5000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M potassium phosphate, 10 mM DTT
分辨率 1.83 Å R-free 0.212
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 2 F4E methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 F4E methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMR pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；0.1 M K phosphate pH 6.6, 0.2 M AS, 20% PEG MME 5000, 5% DTT
分辨率 1.75 Å R-free 0.235
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） F7B 6-chloranyl-2,3-dihydrothiochromen-4-one × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） F7B 6-chloranyl-2,3-dihydrothiochromen-4-one × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6HAX Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；13% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 8.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.268
6HAX Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；13% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 8.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.268
6HAY Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 FX8 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.75
分辨率 2.24 Å R-free 0.223
6HAY Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
未记录 FX8 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.75
分辨率 2.24 Å R-free 0.223
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6I4X Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with erythropoietin receptor peptide 提交 2018-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Sodium cacodylate, ethanol, HEPES, magnesium chloride
分辨率 2.69 Å R-free 0.235
6I5J Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 2.80 Å R-free 0.264
6I5J Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 2.80 Å R-free 0.264
6I5N Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 1.98 Å R-free 0.226
6I5N Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CO COBALT (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 1.98 Å R-free 0.226
6I7Q Structure of pVHL-elongin B-elongin C (VCB) in complex with hydroxylated-HIF-2alpha (523-542) in the C2221 form 提交 2018-11-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；0.1M Cacodyl-Na pH 5.8, 0.1M Mg formate, 50 mM Cystamine, 22 % PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.237
6I7R Structure of pVHL-elongin B-elongin C (VCB) in complex with hydroxylated-HIF-2alpha (523-542) in the P43212 form 提交 2018-11-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.8；293 K；0.1M Cacodyl-Na pH 5.8, 0.1M Mg Formate, 50mM Cystamine, 22% PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.203
6P59 Crystal structure of SIVrcm Vif-CBFbeta-ELOB-ELOC complex 提交 2019-05-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 W 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；MES (pH 6), PEG 6000, Dichloromethane
分辨率 2.94 Å R-free 0.268
6P59 Crystal structure of SIVrcm Vif-CBFbeta-ELOB-ELOC complex 提交 2019-05-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；MES (pH 6), PEG 6000, Dichloromethane
分辨率 2.94 Å R-free 0.268
6R6H Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 P 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5 100 mM NaCl 0.5 mM DTT 1% glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 8.40 Å
6R7F Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 P 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCL 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
6R7H Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 P 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCl 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.80 Å
6R7I Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 P 1–106（106 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
6R7N Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 P 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCl 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–104（104 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6V9H Ankyrin repeat and SOCS-box protein 9 (ASB9), ElonginB (ELOB), and ElonginC (ELOC) bound to its substrate Brain-type Creatine Kinase (CKB) 提交 2019-12-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4 second blot, blot force 20
分辨率 4.10 Å
6ZHC PROTAC6 mediated complex of VHL:EloB:EloC and Bcl-xL 提交 2020-06-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 BBB 1–107（107 aa）
未记录 QL8 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]-5-[3-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[3-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]prop-1-ynyl]phenoxy]propyl]-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 GOL GLYCEROL × 9 IOD IODIDE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.2 M Potassium iodide, 0.1 M MES pH 6.5, 23% PEG 4000
分辨率 1.92 Å R-free 0.196
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7JTO Crystal structure of Protac MS33 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 VKA 3-methyl-N-(11-{[2-(4-{[4'-(4-methylpiperazin-1-yl)-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-5,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}[1,1'-biphenyl]-3-yl]methyl}piperazin-1-yl)ethyl]amino}-11-oxoundecanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.1 M HEPES sodium, pH 7.5-8.0, 1.3-1.6 M sodium thiocyanate, 15-20% PEG3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.225
7JTP Crystal structure of Protac MS67 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X6M N-(6-fluoro-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}-4'-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-carbonyl)glycyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 30% PEG300
分辨率 2.12 Å R-free 0.224
7KHH Ternary complex of VHL/BRD4-BD1/Compound9 (4-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-N-(11-(((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamoyl)pyrrolidin-1-yl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl)amino)-11-oxoundecyl)-10-methyl-7-((methylsulfonyl)methyl)-11-oxo-3,4,10,11-tetrahydro-1H-1,4,10-triazadibenzo[cd,f]azulene-6-carboxamide) 提交 2020-10-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–118（118 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） WEP N-[11-({7-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-2-methyl-10-[(methylsulfonyl)methyl]-3-oxo-3,4,6,7-tetrahydro-2H-2,4,7-triazadibenzo[cd,f]azulene-9-carbonyl}amino)undecanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；291 K；18% w/v PEG 8K, 10% v/v PEG 200, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 9.0
分辨率 2.28 Å R-free 0.229
7M6T Crystal structure of SOCS2/ElonginB/ElonginC bound to a non-canonical peptide that enhances phospho-peptide binding 提交 2021-03-26 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；2M ammonium sulphate Bis-Tris pH6.5
分辨率 3.19 Å R-free 0.267
7PI4 FAK Protac GSK215 in complex with FAK and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2021-08-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 BBB 1–105（105 aa）
未记录 7QB (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-(4-(3-methoxy-4-((4-((2-(methylcarbamoyl)phenyl)amino)-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)amino)phenyl)piperazin-1-yl)acetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-((S)-1-(4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.05M CaCl, 0.1M MES pH 6.5, 45%v/v, PEG200
分辨率 2.24 Å R-free 0.251
7PLO H. sapiens replisome-CUL2/LRR1 complex 提交 2021-09-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 P 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7Q2J Quaternary Complex of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC Homer 提交 2021-10-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 8KH N-[5-[4-[[5-[[(2S)-3,3-dimethyl-1-[(2S,4R)-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-5-oxidanylidene-pentyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-1H-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.50 Å R-free 0.293
7S4E Crystal Structure of ligand ACBi1 in complex with bromodomain of human Smarca2 and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2021-09-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 NA SODIUM ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 87A N-(1-fluorocyclopropane-1-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{[2-{2-[4-({4-[3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)phenoxy]ethoxy}-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-4-hydroxy-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.85；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.85, 13% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 2.25 Å R-free 0.259
7S4E Crystal Structure of ligand ACBi1 in complex with bromodomain of human Smarca2 and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2021-09-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 87A N-(1-fluorocyclopropane-1-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{[2-{2-[4-({4-[3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)phenoxy]ethoxy}-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-4-hydroxy-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.85；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.85, 13% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 2.25 Å R-free 0.259
7UPN Maedi visna virus Vif in complex with CypA and E3 ubiquitin ligase 提交 2022-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 1–118（118 aa）
链 I 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7Z6L Crystal structure of PROTAC 5 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 IEI (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[3-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]propoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；33% (v/v) glycerol ethoxylate, 0.2 M ammonium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5
分辨率 2.24 Å R-free 0.232
7Z76 Crystal structure of compound 10 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 7 IFJ (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[(2~{R})-1-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]propan-2-yl]oxy-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；14.5 % PEG 3350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 5.8, 100 mM sodium iodide
分辨率 1.32 Å R-free 0.202
7Z77 Crystal structure of compound 6 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 IFF (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-4-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]butyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20 % PEG 3350, 0.1 M BIS_TRIS propane pH 7.5, 200 mM sodium formate
分辨率 1.97 Å R-free 0.251
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–118（118 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–118（118 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLN Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 11 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 JI9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-methyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-bicine, PEG8K (9-14%), ethylene glycol (26-20%) with seeding
分辨率 2.60 Å R-free 0.334
7ZLO Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 12 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 JI0 [4-[(2~{S})-3-[(3-ethyl-4-fluoranyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-Bicine, PEG 8K(9-14%), Ethylene glycol (26-20%)
分辨率 2.22 Å R-free 0.250
7ZLP Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 9 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 JHR [4-[(2~{S})-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-[(4-fluorophenyl)methylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-bicine pH(6.5-7), PEG 8K(9-14%), Ethylene glycol (26-20%)
分辨率 1.94 Å R-free 0.240
7ZLR Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-Bicine, PEG8K (9-14%), Ethylene glycol (26-20%) with seeding
分辨率 2.01 Å R-free 0.255
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–118（118 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–118（118 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
8BB2 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #2) 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 5 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
8BB3 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #1) 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 15 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-26% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES
分辨率 1.80 Å R-free 0.227
8BB4 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with C3 linker 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 1–104（104 aa）
未记录 Q3R ~{N}-[5-[4-[[4-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-4-oxidanylidene-butyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.80 Å R-free 0.279
8BB5 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with Aryl linker 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 10 Q43 ~{N}-[5-[4-[[4-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethyl]phenyl]methylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；21% PEG 3350, 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.20 Å R-free 0.248
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDO VCB in complex with compound 21 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-~{N}-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM Compound soak
分辨率 2.80 Å R-free 0.321
8BDO VCB in complex with compound 21 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-~{N}-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM Compound soak
分辨率 2.80 Å R-free 0.321
8BDS Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.4M Ammonium Sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 1.72 Å R-free 0.197
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–104（104 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–104（104 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BEB Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 49 提交 2022-10-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 QIK (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]butylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.8M ammonium sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M bis-Tris pH5.5
分辨率 3.18 Å R-free 0.274
8C13 Crystal structure of pVHL:ElonginC:ElonginB complex bound to PROTAC JW48 提交 2022-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–118（118 aa）
未记录 SYF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[3-[2-[2-[2-(acetamidomethyl)-4-(6,7-dihydro-5~{H}-pyrrolo[1,2-a]imidazol-2-yl)phenoxy]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；18% PEG 3350, HEPES pH7
分辨率 2.30 Å R-free 0.261
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQK pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 30) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–104（104 aa）
链 D 1–104（104 aa）
链 G 1–104（104 aa）
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VYQ (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[2-methyl-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate,10 mM DTT
分辨率 2.62 Å R-free 0.290
8CQL pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-N-((S)-1-(5-Fluoro-2-methoxy-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxypyrrolidine-2-carboxamide (Compound 33) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–104（104 aa）
链 D 1–104（104 aa）
链 G 1–104（104 aa）
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VH3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[5-fluoranyl-2-methoxy-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.38 Å R-free 0.275
8CX0 Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC monomeric complex 提交 2022-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8CX1 Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC dimeric complex in State 1 提交 2022-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–118（118 aa）
链 I 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8CX2 Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC dimeric complex in State 2 提交 2022-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–118（118 aa）
链 I 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EBN Structure of KLHDC2-EloB/C tetrameric assembly 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–104（104 aa）
链 E 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；% PEG3350, 0.2 M KSCN, 0.1 M Tris, 0.1M Na/K Tartrate, 2.5% MPD, pH =6.8
分辨率 2.60 Å R-free 0.250
8EI3 Crystal structure of VHL in complex with H313, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris pH7.0, 20% w/v PEG 1000
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
8EI3 Crystal structure of VHL in complex with H313, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris pH7.0, 20% w/v PEG 1000
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–118（118 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 1–118（118 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 M 1–118（118 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 U 1–118（118 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8FVI Human APOBEC3H bound to HIV-1 Vif in complex with CBF-beta, ELOB, ELOC, and CUL5 提交 2023-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 y 1–102（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
8FVJ Dimeric form of HIV-1 Vif in complex with human CBF-beta, ELOB, ELOC, and CUL5 提交 2023-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 3 1–102（102 aa）
链 8 1–102（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8FY0 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-xL) 提交 2023-01-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CAD CACODYLIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 5.5, 0.2 M Sodium chloride, 6-8% PEG 8000 and 4% tert-Butanediol
分辨率 2.94 Å R-free 0.241
8FY1 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-2) 提交 2023-01-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.56 Å R-free 0.250
8FY2 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/WH244/BCL-2) 提交 2023-01-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 YFH N-({4-[2-(4-{[(4R)-4'-chloro-4-methyl-6-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-[(1R,4R)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-5-yl]-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}-2,3,4,5-tetrahydro[1,1'-biphenyl]-4-yl]methyl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4S)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.98 Å R-free 0.279
8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
8G1Q Co-crystal structure of Compound 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 YHB N-(2-{4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}pyridine-4-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG 300 0.1M Bis-Tris 6.5
分辨率 3.73 Å R-free 0.326
8IJ1 Protomer 1 and 2 of the asymmetry trimer of the Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B ubiquitin ligase complex 提交 2023-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 1–104（104 aa）
链 G 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8JAL Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGP degron (dimer) 提交 2023-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8JAQ Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGP degron (tetramer) 提交 2023-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
8JAR Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGPAA degron (dimer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8JAS Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGPAA degron (tetramer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8JAU Structure of CRL2APPBP2 bound with the C-degron of MRPL28 (dimer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
8JAV Structure of CRL2APPBP2 bound with the C-degron of MRPL28 (tetramer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8JE1 An asymmetry dimer of the Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B ubiquitin ligase complexed with BEX2 提交 2023-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 1–104（104 aa）
链 G 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8JE2 Cryo-EM structure of neddylated Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B complexed with FNIP1-FLCN 提交 2023-05-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 Q 1–118（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8OKX Structure of cGAS in complex with SPSB3-ELOBC 提交 2023-03-29 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
8OL1 cGAS-Nucleosome in complex with SPSB3-ELOBC (composite structure) 提交 2023-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 N 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8P0F Crystal structure of the VCB complex with compound 1. 提交 2023-05-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–104（104 aa）
未记录 WBN (3~{R},5~{R})-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-5-oxidanyl-2-oxidanylidene-1-pyridin-2-yl-piperidine-3-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30 % PEG
分辨率 1.98 Å R-free 0.257
8P0F Crystal structure of the VCB complex with compound 1. 提交 2023-05-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–104（104 aa）
未记录 WBN (3~{R},5~{R})-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-5-oxidanyl-2-oxidanylidene-1-pyridin-2-yl-piperidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30 % PEG
分辨率 1.98 Å R-free 0.257
8PC2 SelDeg51 in complex with FKBP51FK1 domain and pVHL:EloB:EloC 提交 2023-06-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 XZW [(1~{R})-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[4-[[1-[3-[2-[[[(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]methyl]-5-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]propyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]phenyl]propyl] (2~{S})-1-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)ethanoyl]piperidine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；15% PEG3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5 and 10% glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.261
8PC2 SelDeg51 in complex with FKBP51FK1 domain and pVHL:EloB:EloC 提交 2023-06-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–104（104 aa）
未记录 XZW [(1~{R})-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[4-[[1-[3-[2-[[[(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]methyl]-5-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]propyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]phenyl]propyl] (2~{S})-1-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)ethanoyl]piperidine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；15% PEG3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5 and 10% glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.261
8PQL K48-linked ubiquitin chain formation with a cullin-RING E3 ligase and Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-FEM1C with trapped UBE2R2-donor UB-acceptor UB-SIL1 peptide 提交 2023-07-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.76 Å
8Q7R Ubiquitin ligation to substrate by a cullin-RING E3 ligase & Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-FEM1C with trapped UBE2R2~donor UB-Sil1 peptide 提交 2023-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 U9O 5-azanyl-1-oxidanyl-pentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.71 Å
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QU8 PROTAC-mediated complex of KRAS with VHL/Elongin-B/Elongin-C/Cullin-2/Rbx1 提交 2023-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 2–118（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
未记录 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
突变：delta 105-118 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
突变：delta 105-118 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
突变：delta 105-118 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
突变：delta 105-118 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8R5H Ubiquitin ligation to neosubstrate by a cullin-RING E3 ligase & Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-VHL-MZ1 with trapped UBE2R2~donor UB-BRD4 BD2 提交 2023-11-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.44 Å
8RWZ Open non-crosslinked structure Brd4BD2-MZ1-(NEDD8)-CRL2VHL 提交 2024-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–104（104 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RX0 (NEDD8)-CRL2VHL-MZ1-Brd4BD2-Ub(G76S, K48C)-UBE2R1(C93K, S138C, C191S, C223S)-Ub 提交 2024-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 C 1–104（104 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SH2 KLHDC2 in complex with EloB and EloC 提交 2023-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–104（104 aa）
链 G 1–104（104 aa）
链 I 1–104（104 aa）
链 K 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
8SZK The cryo-EM structure of PPP2R5A/HIV-1 Vif/CBFb/EloB/EloC complex 提交 2023-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
8VL9 Crystal structure of EloBC-VHL-CDO1 complex bound to compound 8 molecular glue 提交 2024-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 A1ACI N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[(4P)-4-(1H-pyrazol-3-yl)naphthalen-1-yl]methyl}-L-prolinamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 FE2 FE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2M SODIUM CITRATE, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.216
8VLB Crystal structure of EloBC-VHL-CDO1 complex bound to compound 4 molecular glue 提交 2024-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 FE2 FE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2M SODIUM CITRATE, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.258
8WDK The complex structure of Cul2-VCB-Protac-Wee1 提交 2023-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 W6U (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-dimethyl-2-[3-[4-[4-[4-[[3-oxidanylidene-1-[6-(2-oxidanylpropan-2-yl)pyridin-2-yl]-2-prop-2-enyl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-yl]amino]phenyl]piperazin-1-yl]butoxy]propanoylamino]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
8WQA Cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 1) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
8WQB Cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 2) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 D 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
8WQC cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CDK5R1 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–118（118 aa）
链 I 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8WQE Cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CUX1 (conformation 1) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
8WQF cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CUX1 (conformation 2) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 D 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8WQG cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 1) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–118（118 aa）
链 I 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8WQH cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 2) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–118（118 aa）
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8Y1U Crystal structure of ASB7-Elongin B/C bound to the LZTS1-degron 提交 2024-01-25 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M DL-Malic acid pH7.0, 10% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.243
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 5 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
9BID human ZYG11B and EloginB/C complex 提交 2024-04-23 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.99 Å
9BIE human ZYG11B ElonginB/C complex binding to SARS-CoV2 Orf10 protein 提交 2024-04-23 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9BJ8 human CRL2-ZYG11B complex 提交 2024-04-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
9BJ9 Human CRL-2 ZYG11B binding to human NLRP1 Gly/N degron 提交 2024-04-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 TFA trifluoroacetic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 TFA trifluoroacetic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BOL Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1ARP (4R)-1-[(2S)-2-(4-cyclopropyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 1.99 Å R-free 0.248
9BOL Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1ARP (4R)-1-[(2S)-2-(4-cyclopropyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 1.99 Å R-free 0.248
9D1I Structure of Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%PEG5KMME, 0.1M HEPES pH=7.0, 5% Tascsimate pH=7.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.189
9D1Y Structure of G75R Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%PEG5KMME, 5% Tacsimate pH=7.0, 0.1M HEPES pH=7.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.216
9D1Z Structure of G75Q Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%%KMME, 5% Tacsimate pH=7.0, 0.1M HEPES 7.0
分辨率 1.88 Å R-free 0.190
9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5 8% w/v PEG 8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.286
9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–104（104 aa）
未记录 A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5 8% w/v PEG 8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.286
9D8P Focused map of Cryo-EM structure of Ubiquitin C-degron bound to KLHDC10-EloB/C 提交 2024-08-19 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9DTX Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRG1 (SMARCA4) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 0.2 M potassium thiocyanate, 20% w/v PEG3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.232
9DTY Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric
链 D 1–104（104 aa）
链 H 1–104（104 aa）
链 L 1–104（104 aa）
链 P 1–104（104 aa）
链 T 1–104（104 aa）
链 X 1–104（104 aa）
链 b 1–104（104 aa）
链 f 1–104（104 aa）
链 j 1–104（104 aa）
链 n 1–104（104 aa）
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 10 CIT CITRIC ACID × 5 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.26；291 K；2% v/v Tacsimate, pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.26, 11.36% w/v PEG3350, 0.1 M barium chloride dihydrate
分辨率 3.19 Å R-free 0.285
9E9V Structural Insights into HIV-1 Vif-Mediated Ubiquitination and Degradation of APOBEC3H 提交 2024-11-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：13-meric
链 m 1–102（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9EQJ Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-39 提交 2024-03-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1H6O (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[cis-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 NaCl, 0.1M HEPES pH 7.5, and 25% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
9EQJ Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-39 提交 2024-03-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1H6O (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[cis-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 NaCl, 0.1M HEPES pH 7.5, and 25% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
9EQM Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-21 提交 2024-03-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1H9F (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[trans-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.285 M sodium acetate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, and 5.9% PEG3350
分辨率 2.19 Å R-free 0.264
9GIO Crystal structure of the VHL-EloC-EloB complex with a covalent compound bound to C77 of VHL. 提交 2024-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 A1IMD N-[2-(dimethylsulfamoyl)-5-[(1-methylpyrazol-4-yl)methoxy]phenyl]propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；12 % PEG8000 and 100 mM MES buffer (pH 6.5).
分辨率 1.49 Å R-free 0.233
9H30 VHL:ElonginC:ElonginB-PROTAC4 complex 提交 2024-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1ISE N-[5-(1-{2-[4-({[(1S,2R,3S,5S,6S,16E,18E,20R,21S)-11-chloro-21-hydroxy-12,20-dimethoxy-2,5,9,16-tetramethyl-8,23-dioxo-4,24-dioxa-9,22-diazatetracyclo[19.3.1.1~10,14~.0~3,5~]hexacosa-10(26),11,13,16,18-pentaen-6-yl]oxy}carbonyl)phenyl]ethyl}-1H-1,2,3-triazol-4-yl)pentanoyl]-3-methyl-D-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.7；277 K；9-11% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.7
分辨率 2.50 Å R-free 0.250
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYN CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P1 提交 2025-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1IYO (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[4-[(6-bromanyl-3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,2-a]quinazolin-2-yl)methyl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M K2HPO4 16 % PEG 8000 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.262
9HYN CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P1 提交 2025-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1IYO (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[4-[(6-bromanyl-3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,2-a]quinazolin-2-yl)methyl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M K2HPO4 16 % PEG 8000 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.262
9HYO CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P4 提交 2025-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 A1IYN (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[7-(5-bromanyl-4-oxidanylidene-2,3-dihydro-1,3-benzoxazin-2-yl)-4-[cyclopropyl(methyl)amino]-5,6,8,9-tetrahydropyrimido[4,5-d]azepin-2-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0 8% ethylene glycol 14% PEG 8K
分辨率 3.74 Å R-free 0.348
9HYP CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P5 提交 2025-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 A1IYM (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[4-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]butoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；28% PEG 3350 0.2 M potassium thiocyanate 0.1 M Bis-Tris Propane pH 7.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2Z 7-Hydroxy-4-methoxymethylcoumarin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9J63 Cryo-EM structure of neddylated Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B homodimer 提交 2024-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–104（104 aa）
链 G 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
9J64 Cryo-EM structure of neddylated Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B homodimer complexed with FNIP1 degron 提交 2024-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9J77 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B (dimer 1) 提交 2024-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 D 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9J78 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B (dimer 2) 提交 2024-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 D 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.88 Å
9J79 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B bound with TOM20(tetramer) 提交 2024-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 H 1–118（118 aa）
链 M 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–118（118 aa）
未记录 A1L66 ASP3082 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 O 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9LAF Crystal structure of Elongin BC-EPOP peptide 提交 2025-01-02 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；15% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 10,000
分辨率 2.14 Å R-free 0.231
9LK2 monomeric ZYG11B-EloB-EloC + substrate peptide GYIND 提交 2025-01-15 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9LK6 dimeric ZYG11B-EloB-EloC + substrate peptide GYIND 提交 2025-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–118（118 aa）
链 E 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
9LKY Dimer of CRL2-FEM1B bound with PLD6 提交 2025-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric
链 D 1–118（118 aa）
链 H 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 T 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 X 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 b 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 f 1–104（104 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9N88 PROTAC-induced IRE1 ternary complex 提交 2025-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 68–73（6 aa） 片段：68-73
链 H 68–73（6 aa） 片段：68-73
未记录 A1BWF 3-methyl-N-(5-{4-[(1r,4S)-4-{[7-oxo-8-(propan-2-yl)-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl]amino}cyclohexyl]piperazin-1-yl}pentanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；I used 0.5 mM BS3 for crosslinking the protein complex, then diluted it to 0.05 mM for grid preparation.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；7 force; 2 s blot time.
分辨率 2.60 Å
9OGB Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to yeast RAN-GTP and human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 V6A selinexor, bound form × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
9OGC Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-185 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 K85 propan-2-yl 3-{3-[3-methoxy-5-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-1,2,4-triazol-1-yl}propanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9OGD Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to human ASB8(R197A)-ELOB/C 提交 2025-04-30 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 V6A selinexor, bound form × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.49 Å
9OGE Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-127 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 A1CBC propan-2-yl 3-[3-(3-chlorophenyl)-1H-1,2,4-triazol-1-yl]propanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9OGF Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-UTSW1 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–118（118 aa）
未记录 A1CBB propan-2-yl 3-(3-phenyl-1H-1,2,4-triazol-1-yl)propanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.21 Å
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBJ 1-(propan-2-yl)-4-[(pyridin-2-yl)methyl]piperazine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBM 2-(5-amino-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBM 2-(5-amino-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OMA Cryo-EM structure of PCMTD1-ELOBC-CUL5-RBX2 (CRL5-PCMTD1) 提交 2025-05-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9OMF Cryo-EM structure of neddylated PCMTD1-ELOBC-CUL5-RBX2 (N8-CRL5-PCMTD1) 提交 2025-05-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.72 Å
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–104（104 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–104（104 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–104（104 aa）
未记录 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 2 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–104（104 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–104（104 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9RWZ ZSWIM8-CUL3 complex bound to AGO2-miR-7-CYRANO 提交 2025-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 B 1–118（118 aa）
链 C 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；25 mM HEPES, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP, pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–104（104 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–104（104 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–104（104 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 1–104（104 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SV3 Local refinement of EloB/EloC/VHL/CV2a/14-3-3zeta/ERa from pose 1 提交 2025-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–104（104 aa）
未记录 A1JQT ~{N}'-[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]-~{N}-[(2~{S})-2-[(1~{E},3~{R},4~{S},8~{R},9~{R},10~{R},11~{S},14~{S})-14-(methoxymethyl)-3,10-dimethyl-8-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(2-methylbut-3-en-2-yloxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,9-bis(oxidanyl)-6-tricyclo[9.3.0.0^{3,7}]tetradeca-1,6-dienyl]propyl]tridecanediamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9T32 The Cullin 2 RING VHL E3 ligase dimerised by the homoPROTAC CM11 提交 2025-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 A1JTC (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
9T7V Structure of LRRC58-EloB/C-CDO1 in complex with NEDD8-CUL5-RBX2-ARIH2-Ub 提交 2025-11-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 I 1–118（118 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9UA3 Cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-FEM1C-ELOB-ELOC 提交 2025-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 C 1–118（118 aa）
链 G 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å

共 228 个其他 PDB 条目、478 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ELOB_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

ELONGIN C

Homo sapiens

UniProt Q15369

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 17–112 未记录 ELONGIN B × 1 （Q15370） Von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 （P40337） Hypoxia-inducible factor 1 alpha × 1 （Q16665） X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6.5；pH 6.5 分辨率 1.85 Å R-free 0.236

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1LM8 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–112（112 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–112（112 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–112（112 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–112（112 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
2C9W CRYSTAL STRUCTURE OF SOCS-2 IN COMPLEX WITH ELONGIN-B AND ELONGIN-C AT 1.9A RESOLUTION 提交 2005-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 NI NICKEL (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；2M AMSO4 0.2M NACL, 0.1M CACODYLATE PH 6.5 300 NL SITTING DROPS AT 4 DEGREES
分辨率 1.90 Å R-free 0.225
2IZV CRYSTAL STRUCTURE OF SOCS-4 IN COMPLEX WITH ELONGIN-B AND ELONGIN-C AT 2.55A RESOLUTION 提交 2006-07-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；150 UL SITTING DROP 2M NACL 10% PEK6K
分辨率 2.55 Å R-free 0.223
2MA9 HIV-1 Vif SOCS-box and Elongin BC solution structure 提交 2013-07-01 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 19–109（91 aa） 片段：UNP residues 19-109
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Vif SOCS, 0.2 mM Elongin B, 0.2 mM Elongin C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM Vif SOCS, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin B, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM Vif SOCS, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin B, 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Elongin C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3DCG Crystal Structure of the HIV Vif BC-box in Complex with Human ElonginB and ElonginC 提交 2008-06-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：UNP residues 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.1M Tris HCl pH 7.0, 40% PEG 350 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.232
3DCG Crystal Structure of the HIV Vif BC-box in Complex with Human ElonginB and ElonginC 提交 2008-06-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 17–112（96 aa） 片段：UNP residues 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.1M Tris HCl pH 7.0, 40% PEG 350 MME, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.232
3ZKJ Crystal Structure of Ankyrin Repeat and Socs Box-Containing Protein 9 (Asb9) in Complex with Elonginb and Elonginc 提交 2013-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2M NA2SO4, 0.1M BTPROP 6.5, 20% PEG 3350, 10% ETGLY
分辨率 2.58 Å R-free 0.265
3ZKJ Crystal Structure of Ankyrin Repeat and Socs Box-Containing Protein 9 (Asb9) in Complex with Elonginb and Elonginc 提交 2013-01-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2M NA2SO4, 0.1M BTPROP 6.5, 20% PEG 3350, 10% ETGLY
分辨率 2.58 Å R-free 0.265
3ZNG Ankyrin repeat and SOCS-box protein 9 (ASB9) in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2013-02-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M BIS-TRIS PROPANE, PH 6.7, 0.2 M SODIUM MALONATE, 22% PEG 3350, 10% ETHYLENE GLYCOL
分辨率 2.85 Å R-free 0.242
3ZNG Ankyrin repeat and SOCS-box protein 9 (ASB9) in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2013-02-14 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M BIS-TRIS PROPANE, PH 6.7, 0.2 M SODIUM MALONATE, 22% PEG 3350, 10% ETHYLENE GLYCOL
分辨率 2.85 Å R-free 0.242
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa） 片段：17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
4AJY von Hippel-Lindau protein-ElonginB-ElonginC complex, bound to Hif1- alpha peptide 提交 2012-02-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–96（96 aa） 片段：17-112
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M K PHOSPHATE PH 6.6 0.2 M (NH4)2SO4 20% PEG MME 5000 5 MM DTT
分辨率 1.73 Å R-free 0.232
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 ACT ACETATE ION × 3 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 18–112（95 aa） 片段：RESIDUES 18-112
未记录 ACT ACETATE ION × 1 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 18–112（95 aa） 片段：RESIDUES 18-112
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 18–112（95 aa） 片段：RESIDUES 18-112
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 18–112（95 aa） 片段：RESIDUES 18-112
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 17-112
未记录 TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 1-96
未记录 X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 1-96
未记录 X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 1-96
未记录 X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa） 片段：RESIDUES 1-96
未记录 X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–96（96 aa）
未记录 QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–96（96 aa）
未记录 QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ARG ARGININE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–96（96 aa）
未记录 QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–96（96 aa）
未记录 QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Y 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 5 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 T 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 12 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Q 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 Z 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 h 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 n 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 t 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4N9F Crystal structure of the Vif-CBFbeta-CUL5-ElOB-ElOC pentameric complex 提交 2013-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 z 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.22M potassium sulfate, 18% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 3350, 100mM Tris HCl, pH 8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 3.30 Å R-free 0.324
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 E 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 H 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
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4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 K 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
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4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
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4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
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4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
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4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
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4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
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分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4WQO Structure of VHL-EloB-EloC-Cul2 提交 2014-10-22 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa） 片段：UNP residues 17-112
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；4M Na formate
分辨率 3.20 Å R-free 0.249
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 O 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5BO4 Structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B from DMSO-treated crystals 提交 2015-05-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；291 K；PEG 3350, CaOAc, Sodium cacodylate, Glycerol
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5N4W Crystal structure of the Cul2-Rbx1-EloBC-VHL ubiquitin ligase complex 提交 2017-02-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；0.1 M Tris pH 7.6, 0.15 M ammonium sulphate, 15% polyethyleneglycol 4000 and 3% 1,4-dioxane or 4% acetonitrile. The sample was crystallised in the presence of a 19-mer peptide mimicking the substrate HIF-1alpha - residues 559-577 (DEALAPYIPMDDDFQLRSF, with the mutations L559D and M561A and P564 is hydroxyproline).
分辨率 3.90 Å R-free 0.346
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
6BVB Crystal structure of HIF-2alpha-pVHL-elongin B-elongin C 提交 2017-12-12 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；26% (v/v) PEG-3350, 0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris. 7 mg/mL protein complex.
分辨率 2.00 Å R-free 0.235
6C5X Crystal Structure of SOCS1 in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2018-01-17 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；18% PEG3350, 200 mM sodium fluoride, 100 mM Tris, pH 7.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.271
6C5X Crystal Structure of SOCS1 in complex with ElonginB and ElonginC 提交 2018-01-17 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；18% PEG3350, 200 mM sodium fluoride, 100 mM Tris, pH 7.5
分辨率 3.10 Å R-free 0.271
6FMI pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-Hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)acetamide (ligand 2) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 DV2 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
6FMI pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-Hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)acetamide (ligand 2) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 DV2 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6GFX pVHL:EloB:EloC in complex with modified HIF-1a CODD peptide containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 13a) 提交 2018-05-02 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20-22% PEG MME 5000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M potassium phosphate, 10 mM DTT
分辨率 1.83 Å R-free 0.212
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 2 F4E methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 F4E methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–111（95 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–111（95 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMR pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；0.1 M K phosphate pH 6.6, 0.2 M AS, 20% PEG MME 5000, 5% DTT
分辨率 1.75 Å R-free 0.235
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 F7B 6-chloranyl-2,3-dihydrothiochromen-4-one × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–111（95 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 F7B 6-chloranyl-2,3-dihydrothiochromen-4-one × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6HAX Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；13% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 8.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.268
6HAX Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；13% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 8.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.268
6HAY Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 FX8 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.75
分辨率 2.24 Å R-free 0.223
6HAY Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 FX8 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.75
分辨率 2.24 Å R-free 0.223
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6I4X Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with erythropoietin receptor peptide 提交 2018-11-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Sodium cacodylate, ethanol, HEPES, magnesium chloride
分辨率 2.69 Å R-free 0.235
6I5J Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 2.80 Å R-free 0.264
6I5J Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 2.80 Å R-free 0.264
6I5N Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 1.98 Å R-free 0.226
6I5N Crystal structure of SOCS2:Elongin C:Elongin B in complex with growth hormone receptor peptide 提交 2018-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 CO COBALT (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；Sodium cacodylate, cobalt chloride, MES, ammonium sulphate
分辨率 1.98 Å R-free 0.226
6I7R Structure of pVHL-elongin B-elongin C (VCB) in complex with hydroxylated-HIF-2alpha (523-542) in the P43212 form 提交 2018-11-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 16–112（97 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.8；293 K；0.1M Cacodyl-Na pH 5.8, 0.1M Mg Formate, 50mM Cystamine, 22% PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.203
6P59 Crystal structure of SIVrcm Vif-CBFbeta-ELOB-ELOC complex 提交 2019-05-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 Z 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；MES (pH 6), PEG 6000, Dichloromethane
分辨率 2.94 Å R-free 0.268
6P59 Crystal structure of SIVrcm Vif-CBFbeta-ELOB-ELOC complex 提交 2019-05-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；MES (pH 6), PEG 6000, Dichloromethane
分辨率 2.94 Å R-free 0.268
6R7F Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 Q 1–112（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCL 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
6R7H Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 Q 1–112（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCl 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.80 Å
6R7N Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 Q 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCl 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6V9H Ankyrin repeat and SOCS-box protein 9 (ASB9), ElonginB (ELOB), and ElonginC (ELOC) bound to its substrate Brain-type Creatine Kinase (CKB) 提交 2019-12-13 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4 second blot, blot force 20
分辨率 4.10 Å
6ZHC PROTAC6 mediated complex of VHL:EloB:EloC and Bcl-xL 提交 2020-06-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 CCC 17–112（96 aa）
未记录 QL8 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]-5-[3-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[3-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]prop-1-ynyl]phenoxy]propyl]-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 GOL GLYCEROL × 9 IOD IODIDE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.2 M Potassium iodide, 0.1 M MES pH 6.5, 23% PEG 4000
分辨率 1.92 Å R-free 0.196
7JTO Crystal structure of Protac MS33 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 1–96（96 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 VKA 3-methyl-N-(11-{[2-(4-{[4'-(4-methylpiperazin-1-yl)-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-5,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}[1,1'-biphenyl]-3-yl]methyl}piperazin-1-yl)ethyl]amino}-11-oxoundecanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.1 M HEPES sodium, pH 7.5-8.0, 1.3-1.6 M sodium thiocyanate, 15-20% PEG3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.225
7JTP Crystal structure of Protac MS67 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 1–96（96 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X6M N-(6-fluoro-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}-4'-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-carbonyl)glycyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 30% PEG300
分辨率 2.12 Å R-free 0.224
7KHH Ternary complex of VHL/BRD4-BD1/Compound9 (4-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-N-(11-(((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamoyl)pyrrolidin-1-yl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl)amino)-11-oxoundecyl)-10-methyl-7-((methylsulfonyl)methyl)-11-oxo-3,4,10,11-tetrahydro-1H-1,4,10-triazadibenzo[cd,f]azulene-6-carboxamide) 提交 2020-10-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 WEP N-[11-({7-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-2-methyl-10-[(methylsulfonyl)methyl]-3-oxo-3,4,6,7-tetrahydro-2H-2,4,7-triazadibenzo[cd,f]azulene-9-carbonyl}amino)undecanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；291 K；18% w/v PEG 8K, 10% v/v PEG 200, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 9.0
分辨率 2.28 Å R-free 0.229
7M6T Crystal structure of SOCS2/ElonginB/ElonginC bound to a non-canonical peptide that enhances phospho-peptide binding 提交 2021-03-26 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；281 K；2M ammonium sulphate Bis-Tris pH6.5
分辨率 3.19 Å R-free 0.267
7PLO H. sapiens replisome-CUL2/LRR1 complex 提交 2021-09-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 R 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 SO4 SULFATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7Q2J Quaternary Complex of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC Homer 提交 2021-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 8KH N-[5-[4-[[5-[[(2S)-3,3-dimethyl-1-[(2S,4R)-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-5-oxidanylidene-pentyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-1H-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.50 Å R-free 0.293
7S4E Crystal Structure of ligand ACBi1 in complex with bromodomain of human Smarca2 and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2021-09-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 NA SODIUM ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 87A N-(1-fluorocyclopropane-1-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{[2-{2-[4-({4-[3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)phenoxy]ethoxy}-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-4-hydroxy-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.85；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.85, 13% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 2.25 Å R-free 0.259
7S4E Crystal Structure of ligand ACBi1 in complex with bromodomain of human Smarca2 and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2021-09-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 87A N-(1-fluorocyclopropane-1-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{[2-{2-[4-({4-[3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)phenoxy]ethoxy}-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-4-hydroxy-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.85；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.85, 13% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 2.25 Å R-free 0.259
7UPN Maedi visna virus Vif in complex with CypA and E3 ubiquitin ligase 提交 2022-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7Z6L Crystal structure of PROTAC 5 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 IEI (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[3-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]propoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；33% (v/v) glycerol ethoxylate, 0.2 M ammonium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5
分辨率 2.24 Å R-free 0.232
7Z76 Crystal structure of compound 10 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 7 IFJ (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[(2~{R})-1-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]propan-2-yl]oxy-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；14.5 % PEG 3350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 5.8, 100 mM sodium iodide
分辨率 1.32 Å R-free 0.202
7Z77 Crystal structure of compound 6 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 IFF (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-4-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]butyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20 % PEG 3350, 0.1 M BIS_TRIS propane pH 7.5, 200 mM sodium formate
分辨率 1.97 Å R-free 0.251
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 17–112（96 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLM Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound MN551 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 17–112（96 aa）
未记录 JIH [4-[(2~{S})-3-[[3-(2-chloranylethanoylamino)phenyl]methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350 with seeding
分辨率 1.79 Å R-free 0.217
7ZLN Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 11 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 JI9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-methyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-bicine, PEG8K (9-14%), ethylene glycol (26-20%) with seeding
分辨率 2.60 Å R-free 0.334
7ZLO Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 12 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 JI0 [4-[(2~{S})-3-[(3-ethyl-4-fluoranyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-Bicine, PEG 8K(9-14%), Ethylene glycol (26-20%)
分辨率 2.22 Å R-free 0.250
7ZLP Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 9 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 JHR [4-[(2~{S})-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-[(4-fluorophenyl)methylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-bicine pH(6.5-7), PEG 8K(9-14%), Ethylene glycol (26-20%)
分辨率 1.94 Å R-free 0.240
7ZLR Crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM Tris-Bicine, PEG8K (9-14%), Ethylene glycol (26-20%) with seeding
分辨率 2.01 Å R-free 0.255
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 17–112（96 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZLS co-crystal structure of SOCS2:ElonginB:ElonginC in complex with compound 13 提交 2022-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 17–112（96 aa）
未记录 JH9 [4-[(2~{S})-3-[(4-fluoranyl-3-prop-2-enyl-phenyl)methylamino]-2-[2-(4-fluorophenyl)ethanoylamino]-3-oxidanylidene-propyl]phenyl] dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M Bis-Tris propane 6.5, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.238
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
8BB2 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #2) 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 16–112（97 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 5 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
8BB3 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #1) 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 16–112（97 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 15 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-26% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES
分辨率 1.80 Å R-free 0.227
8BB4 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with C3 linker 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 O 16–112（97 aa）
未记录 Q3R ~{N}-[5-[4-[[4-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-4-oxidanylidene-butyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.80 Å R-free 0.279
8BB5 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with Aryl linker 提交 2022-10-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 16–112（97 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 10 Q43 ~{N}-[5-[4-[[4-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethyl]phenyl]methylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；21% PEG 3350, 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.20 Å R-free 0.248
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
链 K 17–112（96 aa）
未记录 QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDO VCB in complex with compound 21 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 QFF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-~{N}-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM Compound soak
分辨率 2.80 Å R-free 0.321
8BDO VCB in complex with compound 21 提交 2022-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 QFF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-~{N}-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM Compound soak
分辨率 2.80 Å R-free 0.321
8BDS Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.4M Ammonium Sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 1.72 Å R-free 0.197
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BEB Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 49 提交 2022-10-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 QIK (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]butylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.8M ammonium sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M bis-Tris pH5.5
分辨率 3.18 Å R-free 0.274
8C13 Crystal structure of pVHL:ElonginC:ElonginB complex bound to PROTAC JW48 提交 2022-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–112（112 aa）
未记录 SYF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[3-[2-[2-[2-(acetamidomethyl)-4-(6,7-dihydro-5~{H}-pyrrolo[1,2-a]imidazol-2-yl)phenoxy]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；18% PEG 3350, HEPES pH7
分辨率 2.30 Å R-free 0.261
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQK pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 30) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 17–112（96 aa）
链 E 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
链 K 17–112（96 aa）
未记录 VYQ (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[2-methyl-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate,10 mM DTT
分辨率 2.62 Å R-free 0.290
8CQL pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-N-((S)-1-(5-Fluoro-2-methoxy-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxypyrrolidine-2-carboxamide (Compound 33) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 17–112（96 aa）
链 E 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
链 K 17–112（96 aa）
未记录 VH3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[5-fluoranyl-2-methoxy-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.38 Å R-free 0.275
8CX0 Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC monomeric complex 提交 2022-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric
链 E 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8CX1 Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC dimeric complex in State 1 提交 2022-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–112（112 aa）
链 J 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8CX2 Cryo-EM structure of human APOBEC3G/HIV-1 Vif/CBFbeta/ELOB/ELOC dimeric complex in State 2 提交 2022-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–112（112 aa）
链 J 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8EBN Structure of KLHDC2-EloB/C tetrameric assembly 提交 2022-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 16–112（97 aa）
链 F 16–112（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；% PEG3350, 0.2 M KSCN, 0.1 M Tris, 0.1M Na/K Tartrate, 2.5% MPD, pH =6.8
分辨率 2.60 Å R-free 0.250
8EI3 Crystal structure of VHL in complex with H313, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris pH7.0, 20% w/v PEG 1000
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
8EI3 Crystal structure of VHL in complex with H313, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris pH7.0, 20% w/v PEG 1000
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 17–112（96 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 N 17–112（96 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 R 17–112（96 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 17–112（96 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8FVI Human APOBEC3H bound to HIV-1 Vif in complex with CBF-beta, ELOB, ELOC, and CUL5 提交 2023-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 z 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
8FVJ Dimeric form of HIV-1 Vif in complex with human CBF-beta, ELOB, ELOC, and CUL5 提交 2023-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 4 17–112（96 aa）
链 9 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8FY0 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-xL) 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–96（96 aa）
未记录 CAD CACODYLIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 5.5, 0.2 M Sodium chloride, 6-8% PEG 8000 and 4% tert-Butanediol
分辨率 2.94 Å R-free 0.241
8FY1 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-2) 提交 2023-01-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.56 Å R-free 0.250
8FY2 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/WH244/BCL-2) 提交 2023-01-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 YFH N-({4-[2-(4-{[(4R)-4'-chloro-4-methyl-6-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-[(1R,4R)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-5-yl]-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}-2,3,4,5-tetrahydro[1,1'-biphenyl]-4-yl]methyl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4S)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.98 Å R-free 0.279
8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–112（112 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–112（112 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
8G1Q Co-crystal structure of Compound 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 YHB N-(2-{4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}pyridine-4-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG 300 0.1M Bis-Tris 6.5
分辨率 3.73 Å R-free 0.326
8IJ1 Protomer 1 and 2 of the asymmetry trimer of the Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B ubiquitin ligase complex 提交 2023-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 C 16–112（97 aa）
链 H 16–112（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8JAL Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGP degron (dimer) 提交 2023-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 1–112（112 aa）
链 H 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8JAQ Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGP degron (tetramer) 提交 2023-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 D 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
链 N 17–112（96 aa）
链 T 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
8JAR Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGPAA degron (dimer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8JAS Structure of CRL2APPBP2 bound with RxxGPAA degron (tetramer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric
链 D 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
链 N 17–112（96 aa）
链 T 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8JAU Structure of CRL2APPBP2 bound with the C-degron of MRPL28 (dimer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
8JAV Structure of CRL2APPBP2 bound with the C-degron of MRPL28 (tetramer) 提交 2023-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 D 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
链 N 17–112（96 aa）
链 T 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8JE1 An asymmetry dimer of the Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B ubiquitin ligase complexed with BEX2 提交 2023-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 C 16–112（97 aa）
链 H 16–112（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
8JE2 Cryo-EM structure of neddylated Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B complexed with FNIP1-FLCN 提交 2023-05-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 16–112（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 O 1–112（112 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 O 1–112（112 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 O 1–112（112 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8OKX Structure of cGAS in complex with SPSB3-ELOBC 提交 2023-03-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
8OL1 cGAS-Nucleosome in complex with SPSB3-ELOBC (composite structure) 提交 2023-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 M 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8P0F Crystal structure of the VCB complex with compound 1. 提交 2023-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 WBN (3~{R},5~{R})-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-5-oxidanyl-2-oxidanylidene-1-pyridin-2-yl-piperidine-3-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30 % PEG
分辨率 1.98 Å R-free 0.257
8P0F Crystal structure of the VCB complex with compound 1. 提交 2023-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 WBN (3~{R},5~{R})-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-5-oxidanyl-2-oxidanylidene-1-pyridin-2-yl-piperidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30 % PEG
分辨率 1.98 Å R-free 0.257
8PC2 SelDeg51 in complex with FKBP51FK1 domain and pVHL:EloB:EloC 提交 2023-06-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 XZW [(1~{R})-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[4-[[1-[3-[2-[[[(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]methyl]-5-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]propyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]phenyl]propyl] (2~{S})-1-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)ethanoyl]piperidine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；15% PEG3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5 and 10% glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.261
8PC2 SelDeg51 in complex with FKBP51FK1 domain and pVHL:EloB:EloC 提交 2023-06-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 XZW [(1~{R})-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[4-[[1-[3-[2-[[[(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]methyl]-5-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]propyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]phenyl]propyl] (2~{S})-1-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)ethanoyl]piperidine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；15% PEG3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5 and 10% glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.261
8PQL K48-linked ubiquitin chain formation with a cullin-RING E3 ligase and Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-FEM1C with trapped UBE2R2-donor UB-acceptor UB-SIL1 peptide 提交 2023-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：nonameric
链 D 1–112（112 aa）
未记录 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.76 Å
8Q7R Ubiquitin ligation to substrate by a cullin-RING E3 ligase & Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-FEM1C with trapped UBE2R2~donor UB-Sil1 peptide 提交 2023-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–112（112 aa）
未记录 U9O 5-azanyl-1-oxidanyl-pentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.71 Å
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QU8 PROTAC-mediated complex of KRAS with VHL/Elongin-B/Elongin-C/Cullin-2/Rbx1 提交 2023-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 2–112（111 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
突变：delta 1-16 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
突变：delta 1-16 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
突变：delta 1-16 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
突变：delta 1-16 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8R5H Ubiquitin ligation to neosubstrate by a cullin-RING E3 ligase & Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-VHL-MZ1 with trapped UBE2R2~donor UB-BRD4 BD2 提交 2023-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.44 Å
8RX0 (NEDD8)-CRL2VHL-MZ1-Brd4BD2-Ub(G76S, K48C)-UBE2R1(C93K, S138C, C191S, C223S)-Ub 提交 2024-02-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 D 17–112（96 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SH2 KLHDC2 in complex with EloB and EloC 提交 2023-04-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
链 J 17–112（96 aa）
链 L 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
8SZK The cryo-EM structure of PPP2R5A/HIV-1 Vif/CBFb/EloB/EloC complex 提交 2023-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
8VL9 Crystal structure of EloBC-VHL-CDO1 complex bound to compound 8 molecular glue 提交 2024-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 A1ACI N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[(4P)-4-(1H-pyrazol-3-yl)naphthalen-1-yl]methyl}-L-prolinamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 FE2 FE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2M SODIUM CITRATE, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.216
8VLB Crystal structure of EloBC-VHL-CDO1 complex bound to compound 4 molecular glue 提交 2024-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 FE2 FE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2M SODIUM CITRATE, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.258
8WDK The complex structure of Cul2-VCB-Protac-Wee1 提交 2023-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–96（96 aa）
未记录 W6U (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-dimethyl-2-[3-[4-[4-[4-[[3-oxidanylidene-1-[6-(2-oxidanylpropan-2-yl)pyridin-2-yl]-2-prop-2-enyl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-yl]amino]phenyl]piperazin-1-yl]butoxy]propanoylamino]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
8WQA Cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 1) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
8WQB Cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 2) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 C 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
8WQC cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CDK5R1 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8WQE Cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CUX1 (conformation 1) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
8WQF cryo-EM structure of CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CUX1 (conformation 2) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 C 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8WQG cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 1) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8WQH cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-ELOB-ELOC-FEM1B bound with the C-degron of CCDC89 (conformation 2) 提交 2023-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 17–112（96 aa）
链 I 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8Y1U Crystal structure of ASB7-Elongin B/C bound to the LZTS1-degron 提交 2024-01-25 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M DL-Malic acid pH7.0, 10% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.243
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 5 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
9BID human ZYG11B and EloginB/C complex 提交 2024-04-23 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.99 Å
9BIE human ZYG11B ElonginB/C complex binding to SARS-CoV2 Orf10 protein 提交 2024-04-23 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9BJ8 human CRL2-ZYG11B complex 提交 2024-04-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
9BJ9 Human CRL-2 ZYG11B binding to human NLRP1 Gly/N degron 提交 2024-04-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 TFA trifluoroacetic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 TFA trifluoroacetic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BOL Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-05-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1ARP (4R)-1-[(2S)-2-(4-cyclopropyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 1.99 Å R-free 0.248
9BOL Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-05-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1ARP (4R)-1-[(2S)-2-(4-cyclopropyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 1.99 Å R-free 0.248
9D1I Structure of Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 16–112（97 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%PEG5KMME, 0.1M HEPES pH=7.0, 5% Tascsimate pH=7.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.189
9D1Y Structure of G75R Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 16–112（97 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%PEG5KMME, 5% Tacsimate pH=7.0, 0.1M HEPES pH=7.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.216
9D1Z Structure of G75Q Ubiquitin bound to KLHDC3-EloB/C 提交 2024-08-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%%KMME, 5% Tacsimate pH=7.0, 0.1M HEPES 7.0
分辨率 1.88 Å R-free 0.190
9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5 8% w/v PEG 8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.286
9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5 8% w/v PEG 8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.286
9D8P Focused map of Cryo-EM structure of Ubiquitin C-degron bound to KLHDC10-EloB/C 提交 2024-08-19 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–112（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9DTX Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRG1 (SMARCA4) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 0.2 M potassium thiocyanate, 20% w/v PEG3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.232
9DTY Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric
链 C 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
链 K 17–112（96 aa）
链 O 17–112（96 aa）
链 S 17–112（96 aa）
链 W 17–112（96 aa）
链 a 17–112（96 aa）
链 e 17–112（96 aa）
链 i 17–112（96 aa）
链 m 17–112（96 aa）
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 10 CIT CITRIC ACID × 5 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.26；291 K；2% v/v Tacsimate, pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.26, 11.36% w/v PEG3350, 0.1 M barium chloride dihydrate
分辨率 3.19 Å R-free 0.285
9E9V Structural Insights into HIV-1 Vif-Mediated Ubiquitination and Degradation of APOBEC3H 提交 2024-11-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：13-meric
链 n 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9EQJ Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-39 提交 2024-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1H6O (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[cis-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 NaCl, 0.1M HEPES pH 7.5, and 25% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
9EQJ Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-39 提交 2024-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1H6O (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[cis-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 NaCl, 0.1M HEPES pH 7.5, and 25% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
9EQM Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-21 提交 2024-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1H9F (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[trans-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.285 M sodium acetate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, and 5.9% PEG3350
分辨率 2.19 Å R-free 0.264
9H30 VHL:ElonginC:ElonginB-PROTAC4 complex 提交 2024-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 A1ISE N-[5-(1-{2-[4-({[(1S,2R,3S,5S,6S,16E,18E,20R,21S)-11-chloro-21-hydroxy-12,20-dimethoxy-2,5,9,16-tetramethyl-8,23-dioxo-4,24-dioxa-9,22-diazatetracyclo[19.3.1.1~10,14~.0~3,5~]hexacosa-10(26),11,13,16,18-pentaen-6-yl]oxy}carbonyl)phenyl]ethyl}-1H-1,2,3-triazol-4-yl)pentanoyl]-3-methyl-D-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.7；277 K；9-11% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.7
分辨率 2.50 Å R-free 0.250
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYN CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P1 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1IYO (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[4-[(6-bromanyl-3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,2-a]quinazolin-2-yl)methyl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M K2HPO4 16 % PEG 8000 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.262
9HYN CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P1 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1IYO (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[4-[(6-bromanyl-3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,2-a]quinazolin-2-yl)methyl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M K2HPO4 16 % PEG 8000 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.262
9HYO CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P4 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 A1IYN (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[7-(5-bromanyl-4-oxidanylidene-2,3-dihydro-1,3-benzoxazin-2-yl)-4-[cyclopropyl(methyl)amino]-5,6,8,9-tetrahydropyrimido[4,5-d]azepin-2-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0 8% ethylene glycol 14% PEG 8K
分辨率 3.74 Å R-free 0.348
9HYP CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P5 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 A1IYM (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[4-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]butoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；28% PEG 3350 0.2 M potassium thiocyanate 0.1 M Bis-Tris Propane pH 7.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1L2Z 7-Hydroxy-4-methoxymethylcoumarin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9J63 Cryo-EM structure of neddylated Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B homodimer 提交 2024-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 16–112（97 aa）
链 F 16–112（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
9J64 Cryo-EM structure of neddylated Cul2-Rbx1-EloBC-FEM1B homodimer complexed with FNIP1 degron 提交 2024-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 16–112（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9J77 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B (dimer 1) 提交 2024-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 C 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9J78 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B (dimer 2) 提交 2024-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 C 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.88 Å
9J79 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B bound with TOM20(tetramer) 提交 2024-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：19-meric
链 F 17–112（96 aa）
链 L 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1L66 ASP3082 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 N 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9LAF Crystal structure of Elongin BC-EPOP peptide 提交 2025-01-02 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；15% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 10,000
分辨率 2.14 Å R-free 0.231
9LK2 monomeric ZYG11B-EloB-EloC + substrate peptide GYIND 提交 2025-01-15 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–112（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9LK6 dimeric ZYG11B-EloB-EloC + substrate peptide GYIND 提交 2025-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–112（112 aa）
链 F 1–112（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
9LKY Dimer of CRL2-FEM1B bound with PLD6 提交 2025-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric
链 C 17–112（96 aa）
链 G 17–112（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 O 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 S 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 W 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 a 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 e 17–112（96 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9N88 PROTAC-induced IRE1 ternary complex 提交 2025-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 17–110（94 aa）
链 G 17–110（94 aa）
未记录 A1BWF 3-methyl-N-(5-{4-[(1r,4S)-4-{[7-oxo-8-(propan-2-yl)-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl]amino}cyclohexyl]piperazin-1-yl}pentanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；I used 0.5 mM BS3 for crosslinking the protein complex, then diluted it to 0.05 mM for grid preparation.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；7 force; 2 s blot time.
分辨率 2.60 Å
9OGB Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to yeast RAN-GTP and human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 V6A selinexor, bound form × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
9OGC Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-185 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 K85 propan-2-yl 3-{3-[3-methoxy-5-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-1,2,4-triazol-1-yl}propanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9OGD Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to human ASB8(R197A)-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 V6A selinexor, bound form × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.49 Å
9OGE Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-127 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 A1CBC propan-2-yl 3-[3-(3-chlorophenyl)-1H-1,2,4-triazol-1-yl]propanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9OGF Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with KPT-UTSW1 and bound to human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 17–112（96 aa） 片段：residues 17-112
未记录 A1CBB propan-2-yl 3-(3-phenyl-1H-1,2,4-triazol-1-yl)propanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.21 Å
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1CBJ 1-(propan-2-yl)-4-[(pyridin-2-yl)methyl]piperazine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1CBM 2-(5-amino-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1CBM 2-(5-amino-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OMA Cryo-EM structure of PCMTD1-ELOBC-CUL5-RBX2 (CRL5-PCMTD1) 提交 2025-05-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9OMF Cryo-EM structure of neddylated PCMTD1-ELOBC-CUL5-RBX2 (N8-CRL5-PCMTD1) 提交 2025-05-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.72 Å
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 2 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 17–112（96 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9RWZ ZSWIM8-CUL3 complex bound to AGO2-miR-7-CYRANO 提交 2025-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 D 1–112（112 aa）
链 E 1–112（112 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；25 mM HEPES, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP, pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 17–112（96 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 17–112（96 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 17–112（96 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SV3 Local refinement of EloB/EloC/VHL/CV2a/14-3-3zeta/ERa from pose 1 提交 2025-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 17–112（96 aa）
未记录 A1JQT ~{N}'-[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]-~{N}-[(2~{S})-2-[(1~{E},3~{R},4~{S},8~{R},9~{R},10~{R},11~{S},14~{S})-14-(methoxymethyl)-3,10-dimethyl-8-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(2-methylbut-3-en-2-yloxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,9-bis(oxidanyl)-6-tricyclo[9.3.0.0^{3,7}]tetradeca-1,6-dienyl]propyl]tridecanediamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9T32 The Cullin 2 RING VHL E3 ligase dimerised by the homoPROTAC CM11 提交 2025-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 G 17–111（95 aa）
链 J 17–111（95 aa）
未记录 A1JTC (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
9T7V Structure of LRRC58-EloB/C-CDO1 in complex with NEDD8-CUL5-RBX2-ARIH2-Ub 提交 2025-11-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 O 1–112（112 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
9UA3 Cryo-EM structure of neddylated CUL2-RBX1-FEM1C-ELOB-ELOC 提交 2025-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 D 17–112（96 aa）
链 H 17–112（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å

共 220 个其他 PDB 条目、467 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ELOC_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–96； UniProt 17–112

Von Hippel-Lindau disease tumor suppressor

Homo sapiens

UniProt P40337

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 V； UniProt 54–213 未记录 ELONGIN B × 1 （Q15370） ELONGIN C × 1 （Q15369） Hypoxia-inducible factor 1 alpha × 1 （Q16665） X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6.5；pH 6.5 分辨率 1.85 Å R-free 0.236

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1LM8 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 52–213（162 aa） 片段：residues 52-213
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 52–213（162 aa） 片段：residues 52-213
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
1VCB THE VHL-ELONGINC-ELONGINB STRUCTURE 提交 1999-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.7；10-15% PEG 2000, 200MM MAGNESIUM ACETATE, 100MM SODIUM CACODYLATE PH 5.7
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRC pVHL54-213-EloB-EloC complex (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE bound 提交 2011-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 L8B (4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-N-[4-(1,3-OXAZOL-5-YL)BENZYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1.M NA CITRATE PH 5.6, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50.MM DTT.
分辨率 2.90 Å R-free 0.350
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZRF pVHL54-213-EloB-EloC complex_apo 提交 2011-06-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 5MM DTT.
分辨率 2.80 Å R-free 0.320
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTC pVHL54-213-EloB-EloC complex _ (2S,4R)-N-((1,1'-biphenyl)-4-ylmethyl)- 4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2- carboxamide 提交 2011-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 TR0 (4R)-N-(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50MM DTT.
分辨率 2.65 Å R-free 0.317
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZTD pVHL54-213-EloB-EloC complex _ methyl 4-(((2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3- methylisoxazol-5-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)methyl)benzoate 提交 2011-07-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 ZTD METHYL 4-[({(4R)-4-HYDROXY-1-[(3-METHYLISOXAZOL-5-YL)ACETYL]-L-PROLYL}AMINO)METHYL]BENZOATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.79 Å R-free 0.309
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：PVHL54-213, RESIDUES 54-213
未记录 GOL GLYCEROL × 1 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：PVHL54-213, RESIDUES 54-213
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：PVHL54-213, RESIDUES 54-213
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3ZUN pVHL54-213-EloB-EloC complex_(2S,4R)-4-hydroxy-1-(2-(3-methylisoxazol- 5-yl)acetyl)-N-(4-nitrobenzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2011-07-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：PVHL54-213, RESIDUES 54-213
未记录 ZUN (4R)-4-hydroxy-1-[(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)acetyl]-N-[(4-nitrophenyl)methyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.8, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG 8000, 50 MM DTT.
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
4AJY von Hippel-Lindau protein-ElonginB-ElonginC complex, bound to Hif1- alpha peptide 提交 2012-02-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 214–373（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M K PHOSPHATE PH 6.6 0.2 M (NH4)2SO4 20% PEG MME 5000 5 MM DTT
分辨率 1.73 Å R-free 0.232
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 3 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AWJ pVHL:EloB:EloC complex, in complex with capped Hydroxyproline 提交 2012-06-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 V6F (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-N-methyl-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.1 M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 ACT ACETATE ION × 1 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B95 pVHL-EloB-EloB-EloC complex_(2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-08-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
未记录 UCK (2S,4R)-1-(2-chlorophenyl)carbonyl-N-[(4-chlorophenyl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CITRATE PH 5.7, 0.2 M MG ACETATE, 15 % PEG8000, 50MM DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4B9K pVHL-ELOB-ELOC complex_(2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide bound 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TG0 (2S,4R)-1-(3-amino-2-methylbenzoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 6.0, 0.2 M MG ACTETATE, 15% PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 214-373
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 214-373
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 214-373
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKS von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 214-373
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） X6C (2S,4R)-1-ethanoyl-N-[[4-(1,3-oxazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYALATE PH 6.0, 0.2M MG ACETATE, 15%PEG3350, 5MM DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.225
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ARG ARGININE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4BKT von Hippel Lindau protein:ElonginB:ElonginC complex, in complex with (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide 提交 2013-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa） 片段：RESIDUES 54-213
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QD0 (2S,4R)-N-methyl-1-[2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)ethanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1M NA CACODYLATE PH 6.0, 0.2 M MG ACETATE, 15% PEG3350, 5 MM DTT
分辨率 2.35 Å R-free 0.228
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9C pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(oxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 2) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JG (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9D pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methyloxazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JK (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9E pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 4) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JT (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9F pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 5) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JU (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9G pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(3-methyl-4-(thiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JV (4R)-1-(3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-[3-methyl-4-(1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9H pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 7) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9I pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((2S,4R)-1-acetyl-4-hydroxypyrrolidine-2-carbonyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JS (4R)-1-acetyl-4-hydroxy-L-prolyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9J pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-4-methylpentanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 13) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JH N-acetyl-L-leucyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.265
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9K pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3-phenylpropanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 14) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JO N-acetyl-L-phenylalanyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.260
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4W9L pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-((S)-2-acetamido-3,3-dimethylbutanamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 15) 提交 2014-08-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：Trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 3JJ N-acetyl-3-methyl-L-valyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
4WQO Structure of VHL-EloB-EloC-Cul2 提交 2014-10-22 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–213（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；298 K；4M Na formate
分辨率 3.20 Å R-free 0.249
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5LLI pVHL:EloB:EloC in complex with VH298 提交 2016-07-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6Z3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-cyanocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
5N4W Crystal structure of the Cul2-Rbx1-EloBC-VHL ubiquitin ligase complex 提交 2017-02-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 V 54–213（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；0.1 M Tris pH 7.6, 0.15 M ammonium sulphate, 15% polyethyleneglycol 4000 and 3% 1,4-dioxane or 4% acetonitrile. The sample was crystallised in the presence of a 19-mer peptide mimicking the substrate HIF-1alpha - residues 559-577 (DEALAPYIPMDDDFQLRSF, with the mutations L559D and M561A and P564 is hydroxyproline).
分辨率 3.90 Å R-free 0.346
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVV pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-hydroxyacetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BT (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(2-oxidanylethanoylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.245
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVW pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BW (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVX pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 10) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4YY N-[(1-fluorocyclopropyl)carbonyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVY pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-acetamidopropanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl) pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 11) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.90 Å R-free 0.269
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NVZ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetylcyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 16) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BN (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-ethanoylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW0 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-acetamidocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 17) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BK (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-acetamidocyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW1 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclobutanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 18) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9BH (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclobutylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.238
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5NW2 pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-3,3-dimethyl-2-(oxetane-3-carboxamido)butanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 19) 提交 2017-05-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 9B8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-3,3-dimethyl-2-(oxetan-3-ylcarbonylamino)butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
5T35 The PROTAC MZ1 in complex with the second bromodomain of Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2016-08-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 54–213（160 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；293 K；PEG 8000, Sodium citrate
分辨率 2.70 Å R-free 0.231
6BVB Crystal structure of HIF-2alpha-pVHL-elongin B-elongin C 提交 2017-12-12 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；26% (v/v) PEG-3350, 0.2 M Li2SO4, 0.1 M Bis-Tris. 7 mg/mL protein complex.
分辨率 2.00 Å R-free 0.235
6FMI pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-Hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)acetamide (ligand 2) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV2 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
6FMI pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-Hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-oxopropan-2-yl)acetamide (ligand 2) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV2 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.80 Å R-free 0.256
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMJ pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-Acetamidopropanethioyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl) benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 3) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV5 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-acetamidopropanethioyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.45 Å R-free 0.265
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6FMK pVHL:EloB:EloC in complex with N-((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamothioyl) pyrrolidin-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)acetamide (ligand 4) 提交 2018-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–204（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DV8 ~{N}-[(2~{S})-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamothioyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-sulfanylidene-propan-2-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.260
6GFX pVHL:EloB:EloC in complex with modified HIF-1a CODD peptide containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 13a) 提交 2018-05-02 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；20-22% PEG MME 5000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M potassium phosphate, 10 mM DTT
分辨率 1.83 Å R-free 0.212
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFY pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3R,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14a) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXH (2~{R},3~{R},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.70 Å R-free 0.258
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GFZ pVHL:EloB:EloC in complex with modified VH032 containing (3S,4S)-3-fluoro-4-hydroxyproline (ligand 14b) 提交 2018-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EXE (2~{R},3~{S},4~{S})-1-[(2~{S})-2-acetamido-3,3-dimethyl-butanoyl]-3-fluoranyl-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；291 K；PEG 3350, MgOAc, Sodium cacodylate, DTT
分辨率 2.30 Å R-free 0.245
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 2 F4E methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMN pVHL:EloB:EloC in complex with methyl 4H-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 提交 2018-05-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 F4E methyl 4~{H}-furo[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMQ pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ACT ACETATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.75 Å R-free 0.279
6GMR pVHL:EloB:EloC in complex with (4-(1H-pyrrol-1-yl)phenyl)methanol 提交 2018-05-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 1–160（160 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 F4K (4-pyrrol-1-ylphenyl)methanol × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；290 K；0.1 M K phosphate pH 6.6, 0.2 M AS, 20% PEG MME 5000, 5% DTT
分辨率 1.75 Å R-free 0.235
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） F7B 6-chloranyl-2,3-dihydrothiochromen-4-one × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6GMX pVHL:EloB:EloC in complex with 6-chlorothiochroman-4-one 提交 2018-05-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） F7B 6-chloranyl-2,3-dihydrothiochromen-4-one × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；0.1 M Na cacodylate pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 15% PEG3350, 5mM DTT
分辨率 2.53 Å R-free 0.361
6HAX Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；13% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 8.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.268
6HAX Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；13% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 8.0
分辨率 2.35 Å R-free 0.268
6HAY Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 FX8 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.75
分辨率 2.24 Å R-free 0.223
6HAY Crystal structure of PROTAC 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-08-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 FX8 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；18% (w/v) PEG 3350, 0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.75
分辨率 2.24 Å R-free 0.223
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 8–156（149 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6HR2 Crystal structure of PROTAC 2 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2018-09-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 8–156（149 aa）
未记录 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；20% (w/v) PEG1500, 0.1 M MIB Buffer, pH 6.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.236
6I7Q Structure of pVHL-elongin B-elongin C (VCB) in complex with hydroxylated-HIF-2alpha (523-542) in the C2221 form 提交 2018-11-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 1–160（160 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；0.1M Cacodyl-Na pH 5.8, 0.1M Mg formate, 50 mM Cystamine, 22 % PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.237
6I7R Structure of pVHL-elongin B-elongin C (VCB) in complex with hydroxylated-HIF-2alpha (523-542) in the P43212 form 提交 2018-11-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 1–160（160 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.8；293 K；0.1M Cacodyl-Na pH 5.8, 0.1M Mg Formate, 50mM Cystamine, 22% PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.203
6R6H Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 V 7–154（148 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5 100 mM NaCl 0.5 mM DTT 1% glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 8.40 Å
6R7F Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 V 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5 100 mM NaCL 0.5 mM DTT 1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6SIS Crystal structure of macrocyclic PROTAC 1 in complex with the second bromodomain of human Brd4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2019-08-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 54–213（160 aa）
未记录 LFE ~{N}-[(5~{S},7~{R},11~{S},23~{S})-11-~{tert}-butyl-34-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-7-oxidanyl-4,10,13-tris(oxidanylidene)-15,18,21,25,28,31-hexaoxa-3,9,12-triazatricyclo[30.4.0.0^{5,9}]hexatriaconta-1(32),33,35-trien-23-yl]-2-[(7~{S},9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,10,12-tetraen-9-yl]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% (w/v) PEG 8000, 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 0.1 M MgCl2
分辨率 3.50 Å R-free 0.247
6ZHC PROTAC6 mediated complex of VHL:EloB:EloC and Bcl-xL 提交 2020-06-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 AAA 59–213（155 aa）
未记录 QL8 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]-5-[3-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[3-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]prop-1-ynyl]phenoxy]propyl]-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 GOL GLYCEROL × 9 IOD IODIDE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.2 M Potassium iodide, 0.1 M MES pH 6.5, 23% PEG 4000
分辨率 1.92 Å R-free 0.196
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 55–213（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 55–213（159 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 55–213（159 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7CJB VHL recognizes hydroxyproline in RIPK1 提交 2020-07-09 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 M 55–213（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；289 K；sodium cacodylate pH 6.5, 100 mM magnesium acetate, 15%(w/v) PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.259
7JTO Crystal structure of Protac MS33 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 1–160（160 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 VKA 3-methyl-N-(11-{[2-(4-{[4'-(4-methylpiperazin-1-yl)-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-5,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}[1,1'-biphenyl]-3-yl]methyl}piperazin-1-yl)ethyl]amino}-11-oxoundecanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.1 M HEPES sodium, pH 7.5-8.0, 1.3-1.6 M sodium thiocyanate, 15-20% PEG3350
分辨率 1.70 Å R-free 0.225
7JTP Crystal structure of Protac MS67 in complex with the WD repeat-containing protein 5 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2020-08-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 1–160（160 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X6M N-(6-fluoro-3'-{[6-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,6-dihydropyridine-3-carbonyl]amino}-4'-[(3R,5S)-3,4,5-trimethylpiperazin-1-yl][1,1'-biphenyl]-3-carbonyl)glycyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 30% PEG300
分辨率 2.12 Å R-free 0.224
7KHH Ternary complex of VHL/BRD4-BD1/Compound9 (4-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-N-(11-(((S)-1-((2S,4R)-4-hydroxy-2-((4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)carbamoyl)pyrrolidin-1-yl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl)amino)-11-oxoundecyl)-10-methyl-7-((methylsulfonyl)methyl)-11-oxo-3,4,10,11-tetrahydro-1H-1,4,10-triazadibenzo[cd,f]azulene-6-carboxamide) 提交 2020-10-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 55–213（159 aa）
未记录 WEP N-[11-({7-(3,5-difluoropyridin-2-yl)-2-methyl-10-[(methylsulfonyl)methyl]-3-oxo-3,4,6,7-tetrahydro-2H-2,4,7-triazadibenzo[cd,f]azulene-9-carbonyl}amino)undecanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；291 K；18% w/v PEG 8K, 10% v/v PEG 200, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 9.0
分辨率 2.28 Å R-free 0.229
7PI4 FAK Protac GSK215 in complex with FAK and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2021-08-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 AAA 59–213（155 aa）
未记录 7QB (2S,4R)-4-hydroxy-1-((S)-2-(2-(4-(3-methoxy-4-((4-((2-(methylcarbamoyl)phenyl)amino)-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl)amino)phenyl)piperazin-1-yl)acetamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-N-((S)-1-(4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.05M CaCl, 0.1M MES pH 6.5, 45%v/v, PEG200
分辨率 2.24 Å R-free 0.251
7Q2J Quaternary Complex of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC Homer 提交 2021-10-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 8KH N-[5-[4-[[5-[[(2S)-3,3-dimethyl-1-[(2S,4R)-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-5-oxidanylidene-pentyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-1H-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.50 Å R-free 0.293
7S4E Crystal Structure of ligand ACBi1 in complex with bromodomain of human Smarca2 and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2021-09-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 NA SODIUM ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 87A N-(1-fluorocyclopropane-1-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{[2-{2-[4-({4-[3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)phenoxy]ethoxy}-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-4-hydroxy-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.85；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.85, 13% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 2.25 Å R-free 0.259
7S4E Crystal Structure of ligand ACBi1 in complex with bromodomain of human Smarca2 and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2021-09-08 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 87A N-(1-fluorocyclopropane-1-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-N-{[2-{2-[4-({4-[3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}methyl)phenoxy]ethoxy}-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-4-hydroxy-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.85；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.85, 13% PEG 3350, 0.2 M sodium formate
分辨率 2.25 Å R-free 0.259
7Z6L Crystal structure of PROTAC 5 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 IEI (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[3-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]propoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；33% (v/v) glycerol ethoxylate, 0.2 M ammonium chloride, 0.1 M HEPES, pH 7.5
分辨率 2.24 Å R-free 0.232
7Z76 Crystal structure of compound 10 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 7 IFJ (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[(2~{R})-1-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]propan-2-yl]oxy-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；293 K；14.5 % PEG 3350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 5.8, 100 mM sodium iodide
分辨率 1.32 Å R-free 0.202
7Z77 Crystal structure of compound 6 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2022-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 IFF (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-4-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]butyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20 % PEG 3350, 0.1 M BIS_TRIS propane pH 7.5, 200 mM sodium formate
分辨率 1.97 Å R-free 0.251
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
7ZNT CRYSTAL STRUCTURE OF AT7 IN COMPLEX WITH THE SECOND BROMODOMAIN OF HUMAN BRD4 AND PVHL:ELONGINC:ELONGINB 提交 2022-04-22 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 IZR (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-[6-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]hexylsulfanyl]-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；10% (W/V) PEG 8000, 0.1 M TRIS-HCL (PH REMARK 280 7.5) AND 0.1 M MGCL2,
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
8BB2 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #2) 提交 2022-10-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 5 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES 6.8
分辨率 2.05 Å R-free 0.237
8BB3 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with PEG linker (conformation #1) 提交 2022-10-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 15 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 Q3X ~{N}-[5-[4-[2-[2-[2-[2-[3-[[3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanylidene-4-(trifluoromethyl)-3~{H}-pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-26% PEG 3350 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES
分辨率 1.80 Å R-free 0.227
8BB4 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with C3 linker 提交 2022-10-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 54–213（160 aa）
未记录 Q3R ~{N}-[5-[4-[[4-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-4-oxidanylidene-butyl]carbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；21-28% PEG 3350 0.4 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.80 Å R-free 0.279
8BB5 Structure of human WDR5 and pVHL:ElonginC:ElonginB bound to PROTAC with Aryl linker 提交 2022-10-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 10 Q43 ~{N}-[5-[4-[[4-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethyl]phenyl]methylcarbamoyl]phenyl]-2-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-6-oxidanyl-4-(trifluoromethyl)pyridine-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；21% PEG 3350, 0.4-1 M KSCN 0.1 M HEPES pH 6.8
分辨率 2.20 Å R-free 0.248
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDI VCB in complex with compound 32 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF7 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-3-(methylamino)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM compound soak
分辨率 2.11 Å R-free 0.270
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDJ VCB in complex with compound 30 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE0 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[4-chloranyl-2-(2-methoxyethoxy)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1 mM Compound soak
分辨率 2.02 Å R-free 0.239
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDL VCB in complex with compound 27 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QF3 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, compound soaked at 1mM
分辨率 2.29 Å R-free 0.275
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDM VCB in complex with compound 26 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QE9 (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-(2-methoxyethoxy)-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.02 Å R-free 0.255
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDN VCB in complex with compound 23 提交 2022-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFR (2~{R})-3-methyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[(5~{R})-5-methyl-5-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-4~{H}-1,2,4-oxadiazol-3-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, soaked with 1mM compound
分辨率 2.76 Å R-free 0.263
8BDO VCB in complex with compound 21 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-~{N}-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM Compound soak
分辨率 2.80 Å R-free 0.321
8BDO VCB in complex with compound 21 提交 2022-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） QFF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-~{N}-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10-20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 1mM Compound soak
分辨率 2.80 Å R-free 0.321
8BDS Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.4M Ammonium Sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M HEPES pH 7.5
分辨率 1.72 Å R-free 0.197
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDT Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 51 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 54–213（160 aa）
未记录 QLX (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2M sodium malonate dibasic monohydrate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BDX Ternary complex between VCB, BRD4-BD2 and PROTAC 48 提交 2022-10-20 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 54–213（160 aa）
未记录 QIY (2S,4R)-N-[(1S)-1-(4-chlorophenyl)-3-[2-[2-[2-[2-[2-[(9S)-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8$l^{5},11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethylamino]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2R)-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.02M sodium/potassium phosphate, 0.1M bis-Tris propane pH 7.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.258
8BEB Ternary complex between VCB, BRD4-BD1 and PROTAC 49 提交 2022-10-21 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 QIK (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-3-[4-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]butylamino]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-3-oxidanylidene-propyl]-1-[(2~{R})-3-methyl-2-(3-methyl-1,2-oxazol-5-yl)butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；1.8M ammonium sulfate, 4% (w/v) glycerol, 0.1M bis-Tris pH5.5
分辨率 3.18 Å R-free 0.274
8C13 Crystal structure of pVHL:ElonginC:ElonginB complex bound to PROTAC JW48 提交 2022-12-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 1–160（160 aa）
未记录 SYF (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[3-[2-[2-[2-(acetamidomethyl)-4-(6,7-dihydro-5~{H}-pyrrolo[1,2-a]imidazol-2-yl)phenoxy]ethoxy]ethoxy]propanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；18% PEG 3350, HEPES pH7
分辨率 2.30 Å R-free 0.261
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQE pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 37) 提交 2023-03-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VFO (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-7-fluoranyl-6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, pH 6.0-6.3, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.85 Å R-free 0.297
8CQK pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-((S)-1-(2-methyl-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)pyrrolidine-2-carboxamide (Compound 30) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 54–213（160 aa）
链 F 54–213（160 aa）
链 I 54–213（160 aa）
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VYQ (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[2-methyl-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate, 15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate,10 mM DTT
分辨率 2.62 Å R-free 0.290
8CQL pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-N-((S)-1-(5-Fluoro-2-methoxy-4-(4-methylthiazol-5-yl)phenyl)ethyl)-1-((S)-2-(1-fluorocyclopropane-1-carboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxypyrrolidine-2-carboxamide (Compound 33) 提交 2023-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 54–213（160 aa）
链 F 54–213（160 aa）
链 I 54–213（160 aa）
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） VH3 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[5-fluoranyl-2-methoxy-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15-20% polyethylene glycol 3350, 0.2 M magnesium acetate, 10 mM DTT
分辨率 2.38 Å R-free 0.275
8EI3 Crystal structure of VHL in complex with H313, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris pH7.0, 20% w/v PEG 1000
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
8EI3 Crystal structure of VHL in complex with H313, a Helicon Polypeptide 提交 2022-09-14 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Tris pH7.0, 20% w/v PEG 1000
分辨率 3.49 Å R-free 0.285
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 54–213（160 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 54–213（160 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 O 54–213（160 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 S 54–213（160 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8EWV DNA-encoded library (DEL)-enabled discovery of proximity inducing small molecules 提交 2022-10-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 W 54–213（160 aa）
未记录 X5K N-{3-[1-(4-{[3-(cyclopropylamino)-3-oxopropyl](methyl)amino}-6-{methyl[(1,3,5-trimethyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)piperidin-4-yl]propanoyl}-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.2 M NA2MALON, 20 %W/V PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.324
8FY0 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-xL) 提交 2023-01-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 CAD CACODYLIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 5.5, 0.2 M Sodium chloride, 6-8% PEG 8000 and 4% tert-Butanediol
分辨率 2.94 Å R-free 0.241
8FY1 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-2) 提交 2023-01-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.56 Å R-free 0.250
8FY2 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/WH244/BCL-2) 提交 2023-01-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 YFH N-({4-[2-(4-{[(4R)-4'-chloro-4-methyl-6-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-[(1R,4R)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-5-yl]-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}-2,3,4,5-tetrahydro[1,1'-biphenyl]-4-yl]methyl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4S)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.98 Å R-free 0.279
8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 56–213（158 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
8G1P Co-crystal structure of Compound 11 in complex with the bromodomain of human SMARCA2 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 56–213（158 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 FWZ (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[4-[[4-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl]methyl]phenyl]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2M Sodium Chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.270
8G1Q Co-crystal structure of Compound 1 in complex with the bromodomain of human SMARCA4 and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 56–213（158 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 YHB N-(2-{4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}pyridine-4-carbonyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG 300 0.1M Bis-Tris 6.5
分辨率 3.73 Å R-free 0.326
8P0F Crystal structure of the VCB complex with compound 1. 提交 2023-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 WBN (3~{R},5~{R})-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-5-oxidanyl-2-oxidanylidene-1-pyridin-2-yl-piperidine-3-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30 % PEG
分辨率 1.98 Å R-free 0.257
8P0F Crystal structure of the VCB complex with compound 1. 提交 2023-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 WBN (3~{R},5~{R})-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-5-oxidanyl-2-oxidanylidene-1-pyridin-2-yl-piperidine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30 % PEG
分辨率 1.98 Å R-free 0.257
8PC2 SelDeg51 in complex with FKBP51FK1 domain and pVHL:EloB:EloC 提交 2023-06-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 XZW [(1~{R})-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[4-[[1-[3-[2-[[[(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]methyl]-5-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]propyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]phenyl]propyl] (2~{S})-1-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)ethanoyl]piperidine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；15% PEG3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5 and 10% glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.261
8PC2 SelDeg51 in complex with FKBP51FK1 domain and pVHL:EloB:EloC 提交 2023-06-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 XZW [(1~{R})-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[4-[[1-[3-[2-[[[(2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-2-yl]carbonylamino]methyl]-5-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenoxy]propyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]phenyl]propyl] (2~{S})-1-[(2~{S})-2-cyclohexyl-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)ethanoyl]piperidine-2-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；15% PEG3350, 0.2 M tri-sodium citrate, 0.1 M HEPES-NaOH pH 7.5 and 10% glycol
分辨率 2.80 Å R-free 0.261
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJR BRG1 bromodomain in complex with VBC via compound 17 提交 2023-09-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 VLH (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[4-[(1R,5S)-3-[3-azanyl-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]pyridin-2-yl]oxycyclobutyl]oxypiperidin-1-yl]ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；27 mM HEPES pH 6.8, 73 mM HEPES pH 8.6, 1.0 M NaI
分辨率 3.17 Å R-free 0.278
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QJS VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 155 提交 2023-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 VL6 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 3.19 Å R-free 0.274
8QU8 PROTAC-mediated complex of KRAS with VHL/Elongin-B/Elongin-C/Cullin-2/Rbx1 提交 2023-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–213（212 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–213（213 aa）
未记录 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QVU Crystal Structure of ligand ACBI3 in complex with KRAS G12D C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB complex 提交 2023-10-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–213（213 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 WYL (2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2,3-triazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-oxidanyl-ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 8000, 0.2 M lithium chloride, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.287
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
突变：Delta 1-53 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW6 Crystal Structure of compound 3 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
突变：Delta 1-53 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X4R (2S,4R)-1-[(2S)-2-[6-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]hexanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM sodium citrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 8.5, 20% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.295
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
突变：Delta 1-53 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8QW7 Crystal Structure of compound 4 in complex with KRAS G12V C118S GDP and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2023-10-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
突变：Delta 1-53 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；200 mM Lithium sulfate monohydrate, 100 mM BIS-TRIS propane pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.273
8R5H Ubiquitin ligation to neosubstrate by a cullin-RING E3 ligase & Cdc34: NEDD8-CUL2-RBX1-ELOB/C-VHL-MZ1 with trapped UBE2R2~donor UB-BRD4 BD2 提交 2023-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 1–160（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 SY8 5-azanylpentan-2-one × 1 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.44 Å
8RWZ Open non-crosslinked structure Brd4BD2-MZ1-(NEDD8)-CRL2VHL 提交 2024-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8RX0 (NEDD8)-CRL2VHL-MZ1-Brd4BD2-Ub(G76S, K48C)-UBE2R1(C93K, S138C, C191S, C223S)-Ub 提交 2024-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 B 1–160（160 aa）
未记录 759 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoylamino]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-2,3-dihydro-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8VL9 Crystal structure of EloBC-VHL-CDO1 complex bound to compound 8 molecular glue 提交 2024-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 A1ACI N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[(4P)-4-(1H-pyrazol-3-yl)naphthalen-1-yl]methyl}-L-prolinamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 FE2 FE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2M SODIUM CITRATE, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.216
8VLB Crystal structure of EloBC-VHL-CDO1 complex bound to compound 4 molecular glue 提交 2024-01-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 FE2 FE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；0.2M SODIUM CITRATE, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.258
8WDK The complex structure of Cul2-VCB-Protac-Wee1 提交 2023-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 V 59–213（155 aa）
未记录 W6U (2S,4R)-1-[(2S)-3,3-dimethyl-2-[3-[4-[4-[4-[[3-oxidanylidene-1-[6-(2-oxidanylpropan-2-yl)pyridin-2-yl]-2-prop-2-enyl-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-6-yl]amino]phenyl]piperazin-1-yl]butoxy]propanoylamino]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 55–213（159 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 5 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8YMB The crystal structure of SHD931 in complex with Brd4-BD2 and VCB 提交 2024-03-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 55–213（159 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 A1LY0 SHD931 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；1500 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris base/ Hydrochloric acid, pH 8.5, 12% (v/v) Glycerol
分辨率 2.95 Å R-free 0.270
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZV8 Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_2 (D7) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2C 4-(hydroxymethyl)-7-oxidanyl-chromen-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.46 Å R-free 0.287
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
8ZVJ Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_1(DE22) 提交 2024-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2D ethyl 7-oxidanyl-2-oxidanylidene-chromene-4-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K, 0.1 M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2 M Mg acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TFA trifluoroacetic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BJU Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-04-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） TFA trifluoroacetic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 2.47 Å R-free 0.256
9BOL Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-05-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1ARP (4R)-1-[(2S)-2-(4-cyclopropyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 1.99 Å R-free 0.248
9BOL Crystal structure of the complex between VHL, ElonginB, ElonginC, and compound 5 提交 2024-05-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1ARP (4R)-1-[(2S)-2-(4-cyclopropyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 mM sodium cacodylate pH 5.7, 15% PEG8000, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT
分辨率 1.99 Å R-free 0.248
9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5 8% w/v PEG 8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.286
9D4B Discovery of SMD-3236, a Potent, Highly Selective and Efficacious SMARCA2 Degrader for the Treatment of SMARC4-Deficient Human Cancers 提交 2024-08-12 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 A1A1U (4R)-1-[(2S)-2-{4-[(1S,4S)-4-({4-[(12'S)-4'-chloro-5'-oxo-5'H-spiro[cyclohexane-1,7'-indolo[1,2-a]quinazolin]-10'-yl]piperidin-1-yl}methyl)cyclohexyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[(1R)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)ethyl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；281.15 K；0.25 M Calcium acetate 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5 8% w/v PEG 8000
分辨率 3.30 Å R-free 0.286
9DTX Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRG1 (SMARCA4) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 8.5, 0.2 M potassium thiocyanate, 20% w/v PEG3350
分辨率 2.11 Å R-free 0.232
9DTY Crystal structure of PRT3789 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2024-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric
链 B 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 F 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 J 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 N 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 R 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 V 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 Z 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 d 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 h 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
链 l 54–213（160 aa） 片段：UNP residues 54-213
未记录 A1BB4 (4R)-4-hydroxy-1-[(2R)-2-(3-{[(2S)-1-{(3R)-3-[(2M,6aS,11S)-2-(2-hydroxyphenyl)-5,6,6a,7,9,10-hexahydro-8H-pyrazino[1',2':4,5]pyrazino[2,3-c]pyridazin-8-yl]pyrrolidin-1-yl}propan-2-yl]oxy}-1,2-oxazol-5-yl)-3-methylbutanoyl]-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 10 CIT CITRIC ACID × 5 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.26；291 K；2% v/v Tacsimate, pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate, pH 5.26, 11.36% w/v PEG3350, 0.1 M barium chloride dihydrate
分辨率 3.19 Å R-free 0.285
9EQJ Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-39 提交 2024-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1H6O (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[cis-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 NaCl, 0.1M HEPES pH 7.5, and 25% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
9EQJ Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-39 提交 2024-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1H6O (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[cis-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 NaCl, 0.1M HEPES pH 7.5, and 25% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
9EQM Crystal structure of pVHL:EloB:EloC in complex with MP-1-21 提交 2024-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1H9F (2S,4R)-1-[(2R)-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3-methyl-3-[[trans-4-(morpholin-4-ylmethyl)cyclohexyl]methylsulfanyl]butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.285 M sodium acetate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, and 5.9% PEG3350
分辨率 2.19 Å R-free 0.264
9GIO Crystal structure of the VHL-EloC-EloB complex with a covalent compound bound to C77 of VHL. 提交 2024-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–160（160 aa）
未记录 3JF N-acetyl-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)benzyl]-L-prolinamide × 1 A1IMD N-[2-(dimethylsulfamoyl)-5-[(1-methylpyrazol-4-yl)methoxy]phenyl]propanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；12 % PEG8000 and 100 mM MES buffer (pH 6.5).
分辨率 1.49 Å R-free 0.233
9H30 VHL:ElonginC:ElonginB-PROTAC4 complex 提交 2024-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 A1ISE N-[5-(1-{2-[4-({[(1S,2R,3S,5S,6S,16E,18E,20R,21S)-11-chloro-21-hydroxy-12,20-dimethoxy-2,5,9,16-tetramethyl-8,23-dioxo-4,24-dioxa-9,22-diazatetracyclo[19.3.1.1~10,14~.0~3,5~]hexacosa-10(26),11,13,16,18-pentaen-6-yl]oxy}carbonyl)phenyl]ethyl}-1H-1,2,3-triazol-4-yl)pentanoyl]-3-methyl-D-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.7；277 K；9-11% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate and 0.1 M sodium cacodylate, pH 5.7
分辨率 2.50 Å R-free 0.250
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYB CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P3 提交 2025-01-09 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 A1IYB (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{R})-2-[2-[4-[4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-10-[[(2~{S})-oxolan-2-yl]methoxy]-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl]piperidin-1-yl]ethoxy]-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-1-[(2~{S})-2-[[1-(dimethylamino)cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Bis-Tris propane, 20 % PEG 3350, 0.2 M tri-sodium citrate
分辨率 2.84 Å R-free 0.265
9HYN CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P1 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1IYO (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[4-[(6-bromanyl-3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,2-a]quinazolin-2-yl)methyl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M K2HPO4 16 % PEG 8000 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.262
9HYN CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P1 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1IYO (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[4-[(6-bromanyl-3-methyl-5-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,2-a]quinazolin-2-yl)methyl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M K2HPO4 16 % PEG 8000 0.2 M sodium chloride
分辨率 2.37 Å R-free 0.262
9HYO CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P4 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 A1IYN (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[2-[2-[2-[4-[7-(5-bromanyl-4-oxidanylidene-2,3-dihydro-1,3-benzoxazin-2-yl)-4-[cyclopropyl(methyl)amino]-5,6,8,9-tetrahydropyrimido[4,5-d]azepin-2-yl]piperazin-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0 8% ethylene glycol 14% PEG 8K
分辨率 3.74 Å R-free 0.348
9HYP CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMARCA2-VCB-COMPLEX WITH PROTAC P5 提交 2025-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 54–213（160 aa）
未记录 A1IYM (2~{S},4~{R})-~{N}-[[2-[4-[4-(4-bromanyl-7-cyclopentyl-5-oxidanylidene-6~{H}-benzimidazolo[1,2-a]quinazolin-9-yl)piperidin-1-yl]butoxy]-4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；28% PEG 3350 0.2 M potassium thiocyanate 0.1 M Bis-Tris Propane pH 7.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9IPW Crystal structure of VHL-EloB-EloC in complex with a fragment compound 7HC_5(D3) 提交 2024-07-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1L2Z 7-Hydroxy-4-methoxymethylcoumarin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；12% PEG 8K,0.1M Na cacodylate-HCl pH 6.0, 0.2M Mg acetate, 5mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 54–213（160 aa）
未记录 A1L66 ASP3082 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9L6F Crystal structure of KRas G12D (GDP) in complex with ASP3082 提交 2024-12-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 M 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；bis-tris propane, sodium formate, PEG3350
分辨率 3.18 Å R-free 0.305
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 N 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 R 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 Z 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9MR9 Crystal structure of AU-15330 in complex with the bromodomain of human BRM (SMARCA2) and pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-01-07 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 d 54–213（160 aa）
未记录 A1BNT N-({4-[(6M)-3-amino-6-(2-hydroxyphenyl)pyridazin-4-yl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.05~0.2 M sodium formate, 0.1 M HEPES, pH 7.5~8.5, 10%~24% w/v PEG3350
分辨率 3.30 Å R-free 0.275
9N88 PROTAC-induced IRE1 ternary complex 提交 2025-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 61–207（147 aa）
链 F 61–207（147 aa）
未记录 A1BWF 3-methyl-N-(5-{4-[(1r,4S)-4-{[7-oxo-8-(propan-2-yl)-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl]amino}cyclohexyl]piperazin-1-yl}pentanoyl)-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl}-L-prolinamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2；I used 0.5 mM BS3 for crosslinking the protein complex, then diluted it to 0.05 mM for grid preparation.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；7 force; 2 s blot time.
分辨率 2.60 Å
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIM The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 9 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBI 1-[5-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.61 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIN The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 13 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBJ 1-(propan-2-yl)-4-[(pyridin-2-yl)methyl]piperazine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.41 Å R-free 0.283
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIO The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragments 9 and 14 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1CBL 1-[(2-fluorophenyl)methyl]-4-(propan-2-yl)piperazine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 A1CBK 1-[6-[oxidanyl(oxidanylidene)-$l^{4}-azanyl]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.30 Å R-free 0.249
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 A1CBM 2-(5-amino-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9OIQ The von Hippel Lindau-ElonginB-ElonginC (VCB) complex with fragment 15 提交 2025-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 A1CBM 2-(5-amino-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.5, 0.2 M magnesium acetate, 5 mM DTT and 14-20% PEG8000
分辨率 2.66 Å R-free 0.275
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE4 VCB in complex with VHL-binding compound 114 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I57 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.28 Å R-free 0.301
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9QE5 VCB in complex with VHL-binding compound 82 提交 2025-03-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1I58 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-1-(1-fluoranylcyclopropyl)carbonylpiperidin-2-yl]carbonyl-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；277 K；0.1 M sodium cacodylate pH 5.7, 0.2 M magnesium acetate, 12% (w/v) PEG 3350, 5 mM DTT
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RK8 Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12V C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 54–213（160 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Tris pH 7.0, 0.2 M MgCl2, 10%w/v PEG 8000
分辨率 2.63 Å R-free 0.263
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKC Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12D C118S GDP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 54–213（160 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Na2SO4, 15% w/v PEG 3,350, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.79
分辨率 2.19 Å R-free 0.275
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKE Crystal Structure of compound 1-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 54–213（160 aa）
未记录 X53 (2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[(3S)-4-[4-[5-[(4S)-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5H-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.3 M trisodium citrate, 20% PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.286
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 2 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKJ Crystal Structure of compound 3-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 54–213（160 aa）
未记录 A1JH1 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[[1-[4-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]butanoyl]cyclopropyl]carbonylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M Bis Tris pH 7.3, 0.167 M trisodium citrate, 17%(w/v) PEG 3350
分辨率 2.89 Å R-free 0.288
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9RKN Crystal Structure of ACBI4-mediated ternary complex of KRAS G12R GCP with pVHL:ElonginC:ElonginB 提交 2025-06-13 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 54–213（160 aa）
未记录 A1JHI (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[(5~{S})-5-[3-[(3~{S})-4-[4-[5-[(4~{S})-2-azanyl-3-cyano-4-methyl-6,7-dihydro-5~{H}-1-benzothiophen-4-yl]-1,2,4-oxadiazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1,4-diazepan-1-yl]propyl]-4,5,6,7-tetrahydrobenzotriazol-1-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1-methylindazol-6-yl)methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.14 M Ammonium sulfate, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1M BIS-TRIS pH 5.8
分辨率 2.85 Å R-free 0.275
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNO VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 59 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 A1JO9 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[6-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)pyridin-3-yl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.298
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNP VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 60 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 A1JO8 (2~{S},4~{R})-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-~{N}-[(1~{S})-1-[4-(2-methylimidazol-1-yl)phenyl]ethyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 54–213（160 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 54–213（160 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 54–213（160 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SNQ VHL/Elongin B/Elongin C complex with compound 61 提交 2025-09-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 L 54–213（160 aa）
未记录 A1JO1 (2~{S},4~{R})-~{N}-[(1~{S})-1-(4-cyanophenyl)ethyl]-1-[(2~{R})-2-[3-[2-(2-methoxyethoxy)ethoxy]-1,2-oxazol-5-yl]-3-methyl-butanoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM Sodium Citrate pH 6.0, 200 mM Magnesium Acetate, 50 mM DTT, 14% PEG 8000
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
9SV3 Local refinement of EloB/EloC/VHL/CV2a/14-3-3zeta/ERa from pose 1 提交 2025-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 54–213（160 aa）
未记录 A1JQT ~{N}'-[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]-~{N}-[(2~{S})-2-[(1~{E},3~{R},4~{S},8~{R},9~{R},10~{R},11~{S},14~{S})-14-(methoxymethyl)-3,10-dimethyl-8-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(2-methylbut-3-en-2-yloxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-4,9-bis(oxidanyl)-6-tricyclo[9.3.0.0^{3,7}]tetradeca-1,6-dienyl]propyl]tridecanediamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9T32 The Cullin 2 RING VHL E3 ligase dimerised by the homoPROTAC CM11 提交 2025-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 C 62–202（141 aa）
链 H 62–202（141 aa）
未记录 A1JTC (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-2-oxidanylidene-ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å

共 141 个其他 PDB 条目、363 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VHL_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 V； PDB构建体 1–160； UniProt 54–213

Hypoxia-inducible factor 1 alpha

物种未注明

UniProt Q16665

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 556–575 片段：Residues 556-575 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ELONGIN B × 1 （Q15370） ELONGIN C × 1 （Q15369） Von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 （P40337） X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6.5；pH 6.5 分辨率 1.85 Å R-free 0.236

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1LM8 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1H2K Factor Inhibiting HIF-1 alpha in complex with HIF-1 alpha fragment peptide 提交 2002-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 S 786–826（41 aa） 片段：C-TERMINAL TRANSACTIVATION DOMAIN FRAGMENT, RESIDUES 786-826
未记录 FE2 FE (II) ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 2 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.2M AMMONIUM SULPHATE, 4% PEG400, 0.1M HEPES PH7.5, ARGON ATMOSPHERE, 11MG/ML PROTEIN WITH 1MM FE(II), 2.5MM NOG AND 2.5MM PEPTIDE, pH 7.50
分辨率 2.15 Å R-free 0.213
1H2L Factor Inhibiting HIF-1 alpha in complex with HIF-1 alpha fragment peptide 提交 2002-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 S 786–826（41 aa） 片段：C-TERMINAL TRANSACTIVATION DOMAIN FRAGMENT, RESIDUES 786-826
未记录 FE2 FE (II) ION × 2 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.2M AMMONIUM SULPHATE, 4% PEG400, 0.1M HEPES PH7.5, ARGON ATMOSPHERE, 11MG/ML PROTEIN WITH 1MM FE(II), 2.5MM AKG AND 2.5MM PEPTIDE, pH 7.50
分辨率 2.25 Å R-free 0.217
1H2M Factor Inhibiting HIF-1 alpha in complex with HIF-1 alpha fragment peptide 提交 2002-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 S 775–826（52 aa） 片段：C-TERMINAL TRANSACTIVATION DOMAIN FRAGMENT, RESIDUES 775-826
未记录 ZN ZINC ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 2 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；1.2M AMMONIUM SULPHATE, 4% PEG400, 0.1M HEPES PH7.5, 11MG/ML PROTEIN WITH 1MM ZN(II), 2.5MM NOG AND 2.5MM PEPTIDE, pH 7.50
分辨率 2.50 Å R-free 0.225
1L3E NMR Structures of the HIF-1alpha CTAD/p300 CH1 Complex 提交 2002-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 785–826（42 aa） 片段：C-terminal transactivation domain (CTAD)
未记录 ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N,13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 90% D2O, 10% H2O
NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N,13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 99.9% D2O
NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 90% D2O, 10% H2O
NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 99.9% D2O
NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex 10% U-13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT | 99.9% D2O
分辨率未提供
1L8C STRUCTURAL BASIS FOR HIF-1ALPHA/CBP RECOGNITION IN THE CELLULAR HYPOXIC RESPONSE 提交 2002-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 776–826（51 aa） 片段：CTAD (C-Terminal activation) domain, Residues 776-826
未记录 ZN ZINC ION × 3 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）2.0 Millimolar；压力 Ambient
NMR样品组成 1MM 13C, 15N-TAZ1, 2MM HIF-1a
NMR样品组成 1MM 13C, 15N-HIF-1a, 2MM TAZ1
NMR样品组成 10MM D-TRIS, 10MM D-DTT, 0.02% NAN3, 0.5MM ZnSO4
分辨率未提供
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 549–582（34 aa） 片段：residues 549-582
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
1LQB Crystal structure of a hydroxylated HIF-1 alpha peptide bound to the pVHL/elongin-C/elongin-B complex 提交 2002-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 549–582（34 aa） 片段：residues 549-582
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；HEPES, PEG2000 monomethylester, ammonium sulfate, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.277
2ILM Factor Inhibiting HIF-1 Alpha D201A Mutant in Complex with FE(II), Alpha-Ketoglutarate and HIF-1 Alpha 35mer 提交 2006-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 S 786–826（41 aa） 片段：CTAD
未记录 FE2 FE (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 BCT BICARBONATE ION × 2 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；1.6M AMMONIUM SULPHATE, 6% PEG400, 0.1M HEPES PH7.5 ARGON ATMOSPHERE, 14MG/ML PROTEIN WITH 1MM FE(II)SO4, 1MM ALPHA-KETOGLUTARATE, 1MM HIF-1ALPHA PEPTIDE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298.0K, pH 7.50
分辨率 2.30 Å R-free 0.267
3HQR PHD2:Mn:NOG:HIF1-alpha substrate complex 提交 2009-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 558–574（17 aa） 片段：C-terminal degradation domain, residues 558-574
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200mM MgCl2, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.248
3HQU PHD2:Fe:UN9:partial HIF1-alpha substrate complex 提交 2009-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 S 558–574（17 aa） 片段：C-terminal degradation domain, residues 558-574
未记录 FE2 FE (II) ION × 1 UN9 N-[(1-CHLORO-4-HYDROXYISOQUINOLIN-3-YL)CARBONYL]GLYCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 6.5；298 K；1.6M AMMONIUM SULFATE, 4% DIOXANE, 0.1M MES PH6.5, ARGON ATMOSPHERE, 20MG/ML PROTEIN WITH 1MM FE(II)SO4, 10MM HIF1A-CODD-OH PEPTIDE, hanging drop, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.222
4AJY von Hippel-Lindau protein-ElonginB-ElonginC complex, bound to Hif1- alpha peptide 提交 2012-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 559–577（19 aa） 片段：RESIDUES 559-577
突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M K PHOSPHATE PH 6.6 0.2 M (NH4)2SO4 20% PEG MME 5000 5 MM DTT
分辨率 1.73 Å R-free 0.232
4H6J Identification of Cys 255 in HIF-1 as a novel site for development of covalent inhibitors of HIF-1 /ARNT PasB domain protein-protein interaction. 提交 2012-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 238–348（111 aa） 片段：PAS-B DOMAIN, UNP residues 238-348
突变：R245E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20% PEG 8000, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris pH 8.5 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.52 Å R-free 0.248
5JWP Crystal structure of human FIH D201E variant in complex with Zn, alpha-ketoglutarate, and HIF1 alpha peptide. 提交 2016-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 788–806（19 aa） 片段：UNP residues 11-29
未记录 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Hepes, 1.6mM ammonium sulfate, 3% PEG 400
分辨率 2.10 Å R-free 0.209
5L9B HIF PROLYL HYDROXYLASE 2 (PHD2/ EGLN1) IN COMPLEX WITH 2-OXOGLUTARATE (2OG) AND HIF-1ALPHA CODD (556-574) 提交 2016-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 556–574（19 aa） 片段：UNP residues 556-574
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.186
5L9B HIF PROLYL HYDROXYLASE 2 (PHD2/ EGLN1) IN COMPLEX WITH 2-OXOGLUTARATE (2OG) AND HIF-1ALPHA CODD (556-574) 提交 2016-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 556–574（19 aa） 片段：UNP residues 556-574
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 25% w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.186
5L9V HIF prolyl hydroxylase 2 (PHD2-R281C/P317C) cross-linked to HIF-1alpha NODD-L397C/D412C and N-oxalylglycine (NOG) (complex-1) 提交 2016-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 395–413（19 aa） 片段：N-TERMINAL OXYGEN DEPENDENT DEGRADATION DOMAIN (NODD), UNP RESIDUES 395-413
突变：L397C, D412C MN MANGANESE (II) ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M ammonium chloride, 20 % w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 1.83 Å R-free 0.190
5L9V HIF prolyl hydroxylase 2 (PHD2-R281C/P317C) cross-linked to HIF-1alpha NODD-L397C/D412C and N-oxalylglycine (NOG) (complex-1) 提交 2016-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 395–413（19 aa） 片段：N-TERMINAL OXYGEN DEPENDENT DEGRADATION DOMAIN (NODD), UNP RESIDUES 395-413
突变：L397C, D412C MN MANGANESE (II) ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M ammonium chloride, 20 % w/v polyethylene glycol 3350
分辨率 1.83 Å R-free 0.190
5LA9 HIF prolyl hydroxylase 2 (PHD2-R281C/V314C) cross-linked to HIF-1alpha NODD-L397C/D412C and N-oxalylglycine (NOG) (complex-2) 提交 2016-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 395–413（19 aa） 片段：N-TERMINAL OXYGEN DEPENDENT DEGRADATION DOMAIN (NODD), UNP residues 395-413
突变：L397C, D412C MN MANGANESE (II) ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 2.0 M ammonium sulfate
分辨率 2.81 Å R-free 0.279
5LA9 HIF prolyl hydroxylase 2 (PHD2-R281C/V314C) cross-linked to HIF-1alpha NODD-L397C/D412C and N-oxalylglycine (NOG) (complex-2) 提交 2016-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 395–413（19 aa） 片段：N-TERMINAL OXYGEN DEPENDENT DEGRADATION DOMAIN (NODD), UNP residues 395-413
突变：L397C, D412C MN MANGANESE (II) ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 2.0 M ammonium sulfate
分辨率 2.81 Å R-free 0.279
5LAS HIF prolyl hydroxylase 2 (PHD2-R281C/P317C/R396T) cross-linked to HIF-1alpha NODD-L397C/D412C and N-oxalylglycine (NOG) (complex-3) 提交 2016-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 395–413（19 aa） 片段：N-TERMINAL OXYGEN DEPENDENT DEGRADATION DOMAIN (NODD), UNP RESIDUES 395-413;
链 D 395–413（19 aa） 片段：N-TERMINAL OXYGEN DEPENDENT DEGRADATION DOMAIN (NODD), UNP RESIDUES 395-413;
突变：L397C, D412C 突变：L397C, D412C MN MANGANESE (II) ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M citrate pH 5.0, 20 % w/v polyethylene glycol 6000
分辨率 2.10 Å R-free 0.221
6YW3 HIF PROLYL HYDROXYLASE 2 (PHD2/ EGLN1) in complex with N-Oxalyl Glycine (NOG), HIF-1ALPHA CODD (556-574) and a RaPID-derived cyclic peptide 3C (14-mer) 提交 2020-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 S 556–574（19 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；Sample: 1.0 mM cPHD2, 1.5 mM MnCl2, 2.0 mM compound, 1.0 mM 3C, 2.0 mM CODD; Reservoir: 19-23% w/v polyethylene glycol 3350, 0.25 M lithium sulfate, 2 mM MnCl2; Sitting drop (2 ul), protein-to-well ratio, 1:1
分辨率 2.28 Å R-free 0.208
7LVS The CBP TAZ1 Domain in Complex with a CITED2-HIF-1-Alpha Fusion Peptide 提交 2021-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 796–826（31 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 6.87, 28% PEG 4000
分辨率 2.02 Å R-free 0.241
7QGS Crystal structure of p300 CH1 domain in complex with CITIF (a CITED2-HIF-1alpha hybrid) 提交 2021-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 792–826（35 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M HEPES pH 6.5, PEG 6K 35%
分辨率 2.00 Å R-free 0.245
8HE0 Crystal structure of importin-alpha1 bound to the HIF-1alpha nuclear localization signal (wild-type) 提交 2022-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 717–757（41 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；tri-sodium citrate, HEPES, DTT
分辨率 1.80 Å R-free 0.198
9OFU Dimer of HIF-1a-ARNT Heterodimers Complexed on 52-bp HRE/HAS 提交 2025-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 3–361（359 aa）
链 C 3–361（359 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50mM HEPES, 150mM NaCl, 5mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å

共 21 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HIF1A_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–20； UniProt 556–575

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1lm8

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1lm8
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1lm8
沉积日期 deposition_date2002-04-30
结构标题 titleStructure of a HIF-1a-pVHL-ElonginB-ElonginC Complex
关键词 keywordsREGULATION, tumor suppressor, oxygen sensing, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier25.45 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron24.51 Å
零角强度 I(0) i027801500.00
分子量 molecular_weight40941.0 kDa
排除体积 excluded_volume51458 ų
包络体积 envelope_volume63555 ų
水化壳体积 shell_volume22548 ų
包络直径 envelope_diameter91.1 Å
壳层 Rg shell_rg30.68 Å
包络 Rg envelope_rg24.61 Å
形状 Rg shape_rg24.52 Å
总 Rg total_rg25.23 Å
总原子数 total_atoms2883
残基数 n_residues358
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax89.5 Å
Rg (实空间) rg_real25.51 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.83 Å
I(0) (实空间) i0_real2.7800e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.6580e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal25.49 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal27800000.0000
解质量估计 total_estimate0.8697
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary26.0 Å
偏度 Skewness skewness0.382
峰度 Kurtosis kurtosis-0.364
角度范围 angular_range— – 0.3100 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha4130000.0000
实空间数据点数 n_real_points63
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.801; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.902; Smooth: 0.997
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1lm8b_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family familyd.15.1.1 — Ubiquitin-related
结构域编号 domain_idd1lm8c_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.42 — POZ domain
超家族 Superfamily superfamilyd.42.1 — POZ domain
家族 Family familyd.42.1.1 — BTB/POZ domain
结构域编号 domain_idd1lm8v_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.3 — Prealbumin-like
超家族 Superfamily superfamilyb.3.3 — VHL
家族 Family familyb.3.3.1 — VHL

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1lm8B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1
结构域编号 domain_id1lm8C00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
结构域编号 domain_id1lm8V01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology750 — Elongin C; Chain C, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — von Hippel-Lindau disease tumour suppressor, alpha domain
结构域编号 domain_id1lm8V02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily780 — von Hippel-Lindau disease tumour suppressor, beta domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)