|
1FFX
TUBULIN:STATHMIN-LIKE DOMAIN COMPLEX
提交 2000-07-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;PEG, pH 7.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.K
|
分辨率 3.95 Å
R-free 0.367
|
|
1IA0
KIF1A HEAD-MICROTUBULE COMPLEX STRUCTURE IN ATP-FORM
提交 2001-03-22
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TXL TAXOTERE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
buf1;pH 7.4;IMIDAZOLE 50 MM, MG-ACETATE 5 MM, EGTA 1 MM, K-ACETATE 50 MM, DTT 10 MM, PACLITAXEL 10 MICRO M
cryo-EM玻璃化条件
PLUNGED INTO ETHANE
X-ray结晶条件
polymerization of the microtubule;pH 6.8;296 K;pH 6.8, polymerization of the microtubule, temperature 296K
|
分辨率 15.00 Å
|
|
1SA0
TUBULIN-COLCHICINE: STATHMIN-LIKE DOMAIN COMPLEX
提交 2004-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
CN2 2-MERCAPTO-N-[1,2,3,10-TETRAMETHOXY-9-OXO-5,6,7,9-TETRAHYDRO-BENZO[A]HEPTALEN-7-YL]ACETAMIDE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;PEG, PIPES BUFFER, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.58 Å
R-free 0.249
|
|
1SA1
Tubulin-podophyllotoxin: stathmin-like domain complex
提交 2004-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 E
49–189(141 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
POD 9-HYDROXY-5-(3,4,5-TRIMETHOXYPHENYL)-5,8,8A,9-TETRAHYDROFURO[3',4':6,7]NAPHTHO[2,3-D][1,3]DIOXOL-6(5AH)-ONE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;291 K;PEG, PIPES BUFFER, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 4.20 Å
R-free 0.259
|
|
1TUB
TUBULIN ALPHA-BETA DIMER, ELECTRON DIFFRACTION
提交 1997-09-23
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–427(427 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TXL TAXOTERE × 1
|
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
X-ray结晶条件
TWO-DIMENSIONAL SHEETS ARE FORMED UNDER NORMAL POLYMERIZING CONDITIONS WITH THE ADDITION OF 1 MM ZNCL2
|
分辨率 3.70 Å
|
|
1TVK
The binding mode of epothilone A on a,b-tubulin by electron crystallography
提交 2004-06-29
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–427(427 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
EP EPOTHILONE A × 1
|
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 2.89 Å
R-free 0.321
|
|
2HXF
KIF1A head-microtubule complex structure in amppnp-form
提交 2006-08-03
|
构建体不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
IMIDAZOLE;pH 7.4;IMIDAZOLE
cryo-EM玻璃化条件
Ethan slash
|
分辨率 10.00 Å
|
|
2HXH
KIF1A head-microtubule complex structure in adp-form
提交 2006-08-03
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
imidazole;pH 7.4;imidazole
cryo-EM玻璃化条件
Ethan slash
|
分辨率 11.00 Å
|
|
2WBE
Kinesin-5-Tubulin Complex with AMPPNP
提交 2009-02-26
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
80MM PIPES, 150MM NACL, 7MM MGCL2, 1MM EGTA, 1MM BETA-MERCAPTOETHANOL;pH 6.8;80MM PIPES, 150MM NACL, 7MM MGCL2, 1MM EGTA, 1MM BETA-MERCAPTOETHANOL
cryo-EM玻璃化条件
ETHANE
|
分辨率 9.40 Å
|
|
3EDL
Kinesin13-Microtubule Ring complex
提交 2008-09-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 165
PDB 声明:165-meric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 33
MG MAGNESIUM ION × 99
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 66
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 66
TA1 TAXOL × 33
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 33
CN2 2-MERCAPTO-N-[1,2,3,10-TETRAMETHOXY-9-OXO-5,6,7,9-TETRAHYDRO-BENZO[A]HEPTALEN-7-YL]ACETAMIDE × 33
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM Pipes, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 2 mM AMP-PNP, 0.02 mM taxol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 28.00 Å
|
|
3EDL
Kinesin13-Microtubule Ring complex
提交 2008-09-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
CN2 2-MERCAPTO-N-[1,2,3,10-TETRAMETHOXY-9-OXO-5,6,7,9-TETRAHYDRO-BENZO[A]HEPTALEN-7-YL]ACETAMIDE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM Pipes, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 2 mM AMP-PNP, 0.02 mM taxol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 28.00 Å
|
|
3EDL
Kinesin13-Microtubule Ring complex
提交 2008-09-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
CN2 2-MERCAPTO-N-[1,2,3,10-TETRAMETHOXY-9-OXO-5,6,7,9-TETRAHYDRO-BENZO[A]HEPTALEN-7-YL]ACETAMIDE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM Pipes, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 2 mM AMP-PNP, 0.02 mM taxol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 28.00 Å
|
|
3J6E
Energy minimized average structure of Microtubules stabilized by GmpCpp
提交 2014-02-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:octadecameric
|
链 B
1–427(427 aa)
链 D
1–427(427 aa)
链 F
1–427(427 aa)
链 H
1–427(427 aa)
链 J
1–427(427 aa)
链 L
1–427(427 aa)
链 N
1–427(427 aa)
链 P
1–427(427 aa)
链 R
1–427(427 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
MG MAGNESIUM ION × 18
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
The grid was blotted for 2 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;The grid was blotted for 2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 4.70 Å
|
|
3J6F
Minimized average structure of GDP-bound dynamic microtubules
提交 2014-02-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:octadecameric
|
链 B
1–427(427 aa)
链 D
1–427(427 aa)
链 F
1–427(427 aa)
链 H
1–427(427 aa)
链 J
1–427(427 aa)
链 L
1–427(427 aa)
链 N
1–427(427 aa)
链 P
1–427(427 aa)
链 R
1–427(427 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
MG MAGNESIUM ION × 9
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
The grid was blotted for 2 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;The grid was blotted for 2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 4.90 Å
|
|
3J6G
Minimized average structure of microtubules stabilized by taxol
提交 2014-02-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:octadecameric
|
链 B
1–427(427 aa)
链 D
1–427(427 aa)
链 F
1–427(427 aa)
链 H
1–427(427 aa)
链 J
1–427(427 aa)
链 L
1–427(427 aa)
链 N
1–427(427 aa)
链 P
1–427(427 aa)
链 R
1–427(427 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
MG MAGNESIUM ION × 9
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9
TA1 TAXOL × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
The grid was blotted for 2 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;The grid was blotted for 2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 5.50 Å
|
|
3J6H
Nucleotide-free Kinesin motor domain complexed with GMPCPP-microtubule
提交 2014-02-21
|
构建体不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.10 Å
|
|
3J6P
Pseudo-atomic model of dynein microtubule binding domain-tubulin complex based on a cryoEM map
提交 2014-03-20
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 3.5 seconds before plunging;冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å
|
|
3J7I
Structure of alpha- and beta- tubulin in GMPCPP-microtubules
提交 2014-07-01
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.90 Å
|
|
3JAK
Cryo-EM structure of GTPgammaS-microtubule co-polymerized with EB3 (merged dataset with and without kinesin bound)
提交 2015-06-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.30 Å
|
|
3JAL
Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubule co-polymerized with EB3
提交 2015-06-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
3JAR
Cryo-EM structure of GDP-microtubule co-polymerized with EB3
提交 2015-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging/;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.40 Å
|
|
3JAS
Cryo-EM structure of dynamic GDP-microtubule (14 protofilaments) decorated with kinesin
提交 2015-06-19
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
3JAT
Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubule (14 protofilaments) decorated with kinesin
提交 2015-06-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 12
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
3JAW
Atomic model of a microtubule seam based on a cryo-EM reconstruction of the EB3-bound microtubule (merged dataset containing tubulin bound to GTPgammaS, GMPCPP, and GDP)
提交 2015-06-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
BRB80;pH 6.8;80 mM PIPES, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.05% Nonidet P-40
cryo-EM玻璃化条件
Blot once for 4 seconds before plunging.;90.4 K;冷冻剂 ETHANE;Blot once for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK II).
|
分辨率 3.90 Å
|
|
4ZHQ
Crystal structure of Tubulin-Stathmin-TTL-MMAE Complex
提交 2015-04-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 3
GOL GLYCEROL × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
4Q5 N-methyl-L-valyl-N-[(3R,4S,5S)-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-3-{[(1S,2R)-1-hydroxy-1-phenylpropan-2-yl]amino}-1-methoxy-2-methyl-3-oxopropyl]pyrrolidin-1-yl}-3-methoxy-5-methyl-1-oxoheptan-4-yl]-N-methyl-L-valinamide × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.7;293 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.55 Å
R-free 0.245
|
|
4ZI7
CRYSTAL STRUCTURE OF TUBULIN-STATHMIN-TTL-HTI286 COMPLEX
提交 2015-04-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 4
GOL GLYCEROL × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
4SL N,beta,beta-trimethyl-L-phenylalanyl-N-[(3S,4Z)-5-carboxy-2-methylhex-4-en-3-yl]-N,3-dimethyl-L-valinamide × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;PEG, glycerol, MES, CaCl2, MgCl2
|
分辨率 2.51 Å
R-free 0.239
|
|
4ZOL
Crystal Structure of Tubulin-Stathmin-TTL-Tubulysin M Complex
提交 2015-05-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 7
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
55Q (2R,4R)-4-{[(2-{(1R,3R)-1-(acetyloxy)-4-methyl-3-[methyl(N-{[(2S)-1-methylpiperidin-2-yl]carbonyl}-D-isoleucyl)amino]pentyl}-1,3-thiazol-4-yl)carbonyl]amino}-2-methyl-5-phenylpentanoic acid × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.7;293 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.232
|
|
5BMV
CRYSTAL STRUCTURE OF TUBULIN-STATHMIN-TTL-Vinblastine COMPLEX
提交 2015-05-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 3
GOL GLYCEROL × 7
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
VLB (2ALPHA,2'BETA,3BETA,4ALPHA,5BETA)-VINCALEUKOBLASTINE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;6% PEG, 5% glycerol, 0.1M MES, 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.235
|
|
5FNV
a new complex structure of tubulin with an alpha-beta unsaturated lactone
提交 2015-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
X3H PIRONETIN × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.7;0.1M MES PH6.7;6% PEG4000 ;5% GLYCEROL;30MM CACL2;30MM MGCL2
|
分辨率 2.61 Å
R-free 0.226
|
|
5JQG
An apo tubulin-RB-TTL complex structure used for side-by-side comparison
提交 2016-05-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 3
CL CHLORIDE ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.7;293 K;0.1M MES, 6% PEG4000, 5% Glycerol, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2
|
分辨率 2.24 Å
R-free 0.212
|
|
5KMG
Near-atomic cryo-EM structure of PRC1 bound to the microtubule
提交 2016-06-27
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 42
PDB 声明:42-meric
|
链 B
1–431(431 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14
MG MAGNESIUM ION × 14
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14
POU Peloruside A × 14
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot for 4 seconds, blot force 10
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5KMG
Near-atomic cryo-EM structure of PRC1 bound to the microtubule
提交 2016-06-27
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–431(431 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
POU Peloruside A × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot for 4 seconds, blot force 10
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5KMG
Near-atomic cryo-EM structure of PRC1 bound to the microtubule
提交 2016-06-27
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–431(431 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
POU Peloruside A × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot for 4 seconds, blot force 10
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5MM4
Ustilago maydis kinesin-5 motor domain in the AMPPNP state bound to microtubules
提交 2016-12-08
|
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–427(427 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å
|
|
5OAM
Molecular basis of human kinesin-8 function and inhibition
提交 2017-06-23
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
ZN ZINC ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å
|
|
5OCU
Molecular basis of human kinesin-8 function and inhibition
提交 2017-07-03
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
ZN ZINC ION × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.20 Å
|
|
5OGC
Molecular basis of human kinesin-8 function and inhibition
提交 2017-07-12
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
9V5 4-chloranyl-2-nitro-1-(phenylsulfonyl)benzene × 1
ZN ZINC ION × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å
|
|
5SYC
Near-atomic resolution cryo-EM reconstruction of peloruside-stabilized microtubule
提交 2016-08-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 52
PDB 声明:52-meric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26
MG MAGNESIUM ION × 26
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26
POU Peloruside A × 26
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5SYC
Near-atomic resolution cryo-EM reconstruction of peloruside-stabilized microtubule
提交 2016-08-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
POU Peloruside A × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5SYC
Near-atomic resolution cryo-EM reconstruction of peloruside-stabilized microtubule
提交 2016-08-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
POU Peloruside A × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5SYE
Near-atomic resolution cryo-EM reconstruction of doubly bound Taxol- and peloruside-stabilized microtubule
提交 2016-08-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 52
PDB 声明:156-meric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26
MG MAGNESIUM ION × 26
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26
TA1 TAXOL × 26
POU Peloruside A × 26
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5SYE
Near-atomic resolution cryo-EM reconstruction of doubly bound Taxol- and peloruside-stabilized microtubule
提交 2016-08-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
POU Peloruside A × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5SYE
Near-atomic resolution cryo-EM reconstruction of doubly bound Taxol- and peloruside-stabilized microtubule
提交 2016-08-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
POU Peloruside A × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5SYF
High-resolution cryo-EM reconstruction of Taxol-stabilized microtubule
提交 2016-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 52
PDB 声明:130-meric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26
MG MAGNESIUM ION × 26
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26
TA1 TAXOL × 26
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5SYF
High-resolution cryo-EM reconstruction of Taxol-stabilized microtubule
提交 2016-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5SYF
High-resolution cryo-EM reconstruction of Taxol-stabilized microtubule
提交 2016-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5SYG
Cryo-EM reconstruction of zampanolide-bound microtubule
提交 2016-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 52
PDB 声明:130-meric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 26
MG MAGNESIUM ION × 26
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 26
ZPN (2Z,4E)-N-[(S)-[(1S,2E,5S,8E,10Z,17S)-3,11-dimethyl-19-methylidene-7,13-dioxo-6,21-dioxabicyclo[15.3.1]henicosa-2,8,10-trien-5-yl](hydroxy)methyl]hexa-2,4-dienamide × 26
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5SYG
Cryo-EM reconstruction of zampanolide-bound microtubule
提交 2016-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ZPN (2Z,4E)-N-[(S)-[(1S,2E,5S,8E,10Z,17S)-3,11-dimethyl-19-methylidene-7,13-dioxo-6,21-dioxabicyclo[15.3.1]henicosa-2,8,10-trien-5-yl](hydroxy)methyl]hexa-2,4-dienamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5SYG
Cryo-EM reconstruction of zampanolide-bound microtubule
提交 2016-08-11
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ZPN (2Z,4E)-N-[(S)-[(1S,2E,5S,8E,10Z,17S)-3,11-dimethyl-19-methylidene-7,13-dioxo-6,21-dioxabicyclo[15.3.1]henicosa-2,8,10-trien-5-yl](hydroxy)methyl]hexa-2,4-dienamide × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds, blot force 10, before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 3.50 Å
|
|
5XXT
GDP-microtubule complexed with nucleotide-free KIF5C
提交 2017-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:octadecameric
|
链 B
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 D
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 F
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 H
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 J
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 L
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 N
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 P
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 R
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
MG MAGNESIUM ION × 9
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.35 Å
|
|
5XXV
GDP-microtubule complexed with KIF5C in AMPPNP state
提交 2017-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:octadecameric
|
链 B
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 D
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 F
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 H
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 J
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 L
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 N
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 P
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 R
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 9
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.46 Å
|
|
5XXW
GDP-microtubule complexed with KIF5C in ATP state
提交 2017-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:octadecameric
|
链 B
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 D
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 F
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 H
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 J
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 L
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 N
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 P
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 R
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
MG MAGNESIUM ION × 9
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.00 Å
|
|
5XXX
GMPCPP-microtubule complexed with nucleotide-free KIF5C
提交 2017-07-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 18
PDB 声明:octadecameric
|
链 B
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 D
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 F
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 H
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 J
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 L
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 N
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 P
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
链 R
2–427(426 aa)
片段:UNP residues 2-427
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
MG MAGNESIUM ION × 18
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.43 Å
|
|
6BJC
TPX2_mini decorated GMPCPP-microtubule
提交 2017-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 12
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot for 4 seconds before plunging
|
分辨率 3.30 Å
|
|
6CVJ
Model of synthetic tau (four tandem repeats of first repeat sequence) bound to the microtubule
提交 2018-03-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 120
PDB 声明:120-meric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 C
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 30
MG MAGNESIUM ION × 30
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 60
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash
|
分辨率 3.20 Å
|
|
6CVJ
Model of synthetic tau (four tandem repeats of first repeat sequence) bound to the microtubule
提交 2018-03-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 C
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash
|
分辨率 3.20 Å
|
|
6CVJ
Model of synthetic tau (four tandem repeats of first repeat sequence) bound to the microtubule
提交 2018-03-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 C
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash
|
分辨率 3.20 Å
|
|
6CVN
Model of synthetic tau (R2x4) bound to the microtubule
提交 2018-03-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 120
PDB 声明:120-meric
|
链 A
1–445(445 aa)
链 C
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 60
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 30
MG MAGNESIUM ION × 30
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash.
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6CVN
Model of synthetic tau (R2x4) bound to the microtubule
提交 2018-03-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–445(445 aa)
链 C
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash.
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6CVN
Model of synthetic tau (R2x4) bound to the microtubule
提交 2018-03-28
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
1–445(445 aa)
链 C
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;blot force 10 pN, 6 second blot time. used C-flat 1.2/1.3 holey grids. First 2 uL of microtubules were adhered to grid for 30 seconds, followed by 2 4 uL washes of tau with 30 second incubation for each wash.
|
分辨率 3.90 Å
|
|
6DPU
Undecorated GMPCPP microtubule
提交 2018-06-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 12
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 buffer (80 mM PIPES, pH 6.8, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2) supplemented with 1 mM GMPCPP, 1 mM DTT, and 0.05% Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.10 Å
|
|
6DPV
Undecorated GDP microtubule
提交 2018-06-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 buffer (80 mM PIPES pH 6.8, 1 mM EGTA, 1 mM MgCl2) supplemented with 1 mM GTP, 1 mM DTT, and 0.05% Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.30 Å
|
|
6DPW
Undecorated GTPgammaS microtubule
提交 2018-06-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;Modified BRB80 buffer (80 mM PIPES, pH 6.8, 1 mM EGTA, 0.2 mM MgCl2) supplemented with 1 mM GTPgammaS, 1 mM DTT, and 0.05% Nonident P-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot for 4 seconds before plunging.
|
分辨率 3.50 Å
|
|
6EVW
Cryo-EM structure of GMPCPP-microtubule co-polymerised with doublecortin
提交 2017-11-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 B
1–429(429 aa)
链 D
1–429(429 aa)
链 F
1–429(429 aa)
链 G
1–429(429 aa)
链 H
1–429(429 aa)
链 I
1–429(429 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 12
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å
|
|
6EVX
Cryo-EM structure of GDP.Pi-microtubule rapidly co-polymerised with doublecortin
提交 2017-11-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
PO4 PHOSPHATE ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å
|
|
6EVY
Cryo-EM structure of GTPgammaS-microtubule co-polymerised with doublecortin
提交 2017-11-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å
|
|
6EVZ
Cryo-EM structure of GDP-microtubule co-polymerised with doublecortin
提交 2017-11-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
6EW0
Cryo-EM structure of GDP-microtubule co-polymerised with doublecortin and supplemented with Taxol
提交 2017-11-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
TA1 TAXOL × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
6KIO
Complex of yeast cytoplasmic dynein MTBD-High and MT without DTT
提交 2019-07-19
|
构建体不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 b
2–427(426 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.94 Å
|
|
6KIQ
Complex of yeast cytoplasmic dynein MTBD-High and MT with DTT
提交 2019-07-19
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 b
2–427(426 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;DTT was added to the final concentration of 1 mM.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å
|
|
6LS4
A novel anti-tumor agent S-40 in complex with tubulin
提交 2020-01-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
GOL GLYCEROL × 1
S40 3-[(4-cyclopropylphenyl)sulfonylamino]-4-methyl-N-(pyridin-3-ylmethyl)benzamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;6% PEG 4000, 6% GLYCEROL, 30mM MAGNESIUM CHLORIDE, 30mM CALCIUM CHLORIDE, 3.3% Jeffamin M-600, 100mM MES
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.240
|
|
6MLQ
Cryo-EM structure of microtubule-bound Kif7 in the ADP state
提交 2018-09-27
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted from behind the grid for 2 seconds
|
分辨率 4.20 Å
|
|
6MLR
Cryo-EM structure of microtubule-bound Kif7 in the AMPPNP state
提交 2018-09-27
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted from behind the grid for 2 seconds
|
分辨率 4.20 Å
|
|
6MZE
Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays
提交 2018-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
链 K
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 3.60 Å
R-free 0.245
|
|
6MZE
Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays
提交 2018-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
|
链 P
1–445(445 aa)
链 R
1–445(445 aa)
链 W
1–445(445 aa)
链 Y
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 3.60 Å
R-free 0.245
|
|
6MZF
Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays
提交 2018-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
链 K
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 4.40 Å
R-free 0.252
|
|
6MZF
Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays
提交 2018-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:tetradecameric
|
链 P
1–445(445 aa)
链 R
1–445(445 aa)
链 W
1–445(445 aa)
链 Y
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 4.40 Å
R-free 0.252
|
|
6MZG
Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays
提交 2018-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 3.21 Å
R-free 0.234
|
|
6MZG
Structural Basis of Tubulin Recruitment and Assembly by Microtubule Polymerases with Tumor Overexpressed Gene (TOG) Domain Arrays
提交 2018-11-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 H
1–445(445 aa)
链 J
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;50 mM PIPES, 100 mM MgCl2 [pH 7.0], and 10-15% PEG-8000
|
分辨率 3.21 Å
R-free 0.234
|
|
6O2Q
Acetylated Microtubules
提交 2019-02-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 3.70 Å
|
|
6O2R
Deacetylated Microtubules
提交 2019-02-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 12
PDB 声明:dodecameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 3.30 Å
|
|
6O2S
Deacetylated Microtubules
提交 2019-02-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 104
PDB 声明:104-meric
|
链 1H
1–445(445 aa)
链 1O
1–445(445 aa)
链 1P
1–445(445 aa)
链 1Q
1–445(445 aa)
链 1R
1–445(445 aa)
链 1S
1–445(445 aa)
链 1T
1–445(445 aa)
链 1U
1–445(445 aa)
链 1V
1–445(445 aa)
链 1W
1–445(445 aa)
链 1X
1–445(445 aa)
链 1Y
1–445(445 aa)
链 1Z
1–445(445 aa)
链 2H
1–445(445 aa)
链 2O
1–445(445 aa)
链 2P
1–445(445 aa)
链 2Q
1–445(445 aa)
链 2R
1–445(445 aa)
链 2S
1–445(445 aa)
链 2T
1–445(445 aa)
链 2U
1–445(445 aa)
链 2V
1–445(445 aa)
链 2W
1–445(445 aa)
链 2X
1–445(445 aa)
链 2Y
1–445(445 aa)
链 2Z
1–445(445 aa)
链 3H
1–445(445 aa)
链 3O
1–445(445 aa)
链 3P
1–445(445 aa)
链 3Q
1–445(445 aa)
链 3R
1–445(445 aa)
链 3S
1–445(445 aa)
链 3T
1–445(445 aa)
链 3U
1–445(445 aa)
链 3V
1–445(445 aa)
链 3W
1–445(445 aa)
链 3X
1–445(445 aa)
链 3Y
1–445(445 aa)
链 3Z
1–445(445 aa)
链 4H
1–445(445 aa)
链 4O
1–445(445 aa)
链 4P
1–445(445 aa)
链 4Q
1–445(445 aa)
链 4R
1–445(445 aa)
链 4S
1–445(445 aa)
链 4T
1–445(445 aa)
链 4U
1–445(445 aa)
链 4V
1–445(445 aa)
链 4W
1–445(445 aa)
链 4X
1–445(445 aa)
链 4Y
1–445(445 aa)
链 4Z
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 52
MG MAGNESIUM ION × 52
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 52
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 4.00 Å
|
|
6O2T
Acetylated Microtubules
提交 2019-02-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 104
PDB 声明:104-meric
|
链 1H
1–445(445 aa)
链 1O
1–445(445 aa)
链 1P
1–445(445 aa)
链 1Q
1–445(445 aa)
链 1R
1–445(445 aa)
链 1S
1–445(445 aa)
链 1T
1–445(445 aa)
链 1U
1–445(445 aa)
链 1V
1–445(445 aa)
链 1W
1–445(445 aa)
链 1X
1–445(445 aa)
链 1Y
1–445(445 aa)
链 1Z
1–445(445 aa)
链 2H
1–445(445 aa)
链 2O
1–445(445 aa)
链 2P
1–445(445 aa)
链 2Q
1–445(445 aa)
链 2R
1–445(445 aa)
链 2S
1–445(445 aa)
链 2T
1–445(445 aa)
链 2U
1–445(445 aa)
链 2V
1–445(445 aa)
链 2W
1–445(445 aa)
链 2X
1–445(445 aa)
链 2Y
1–445(445 aa)
链 2Z
1–445(445 aa)
链 3H
1–445(445 aa)
链 3O
1–445(445 aa)
链 3P
1–445(445 aa)
链 3Q
1–445(445 aa)
链 3R
1–445(445 aa)
链 3S
1–445(445 aa)
链 3T
1–445(445 aa)
链 3U
1–445(445 aa)
链 3V
1–445(445 aa)
链 3W
1–445(445 aa)
链 3X
1–445(445 aa)
链 3Y
1–445(445 aa)
链 3Z
1–445(445 aa)
链 4H
1–445(445 aa)
链 4O
1–445(445 aa)
链 4P
1–445(445 aa)
链 4Q
1–445(445 aa)
链 4R
1–445(445 aa)
链 4S
1–445(445 aa)
链 4T
1–445(445 aa)
链 4U
1–445(445 aa)
链 4V
1–445(445 aa)
链 4W
1–445(445 aa)
链 4X
1–445(445 aa)
链 4Y
1–445(445 aa)
链 4Z
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 52
MG MAGNESIUM ION × 52
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 52
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;Contains 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH (stored at 4 degrees Celsius).
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted for 4 seconds at blot force 10.
|
分辨率 4.10 Å
|
|
6RZA
Cryo-EM structure of the human inner arm dynein DNAH7 microtubule binding domain bound to microtubules
提交 2019-06-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–426(426 aa)
链 D
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å
|
|
6RZB
Cryo-EM structure of mouse cytoplasmic dynein-1 microtubule binding domain bound to microtubules
提交 2019-06-13
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
6TA3
Human kinesin-5 motor domain in the GSK-1 state bound to microtubules (Conformation 1)
提交 2019-10-29
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–429(429 aa)
|
未记录
|
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
MZK 6-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
6TA4
Human kinesin-5 motor domain in the AMPPNP state bound to microtubules
提交 2019-10-29
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–429(429 aa)
|
未记录
|
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å
|
|
6TIW
Human kinesin-5 motor domain in the GSK state bound to microtubules (Conformation 2)
提交 2019-11-22
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–429(429 aa)
|
未记录
|
MZK 6-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-3,4-dihydro-1~{H}-quinolin-2-one × 1
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
6VPO
Cryo-EM structure of microtubule-bound KLP61F motor domain in the AMPPNP state
提交 2020-02-04
|
构建体不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å
|
|
6VPP
Cryo-EM structure of microtubule-bound KLP61F motor with tail domain in the nucleotide-free state
提交 2020-02-04
|
构建体不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å
|
|
6Y4M
Structure of Tubulin Tyrosine Ligase in Complex with Tb111
提交 2020-02-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
O9B (2~{R})-1-methylpiperidine-2-carboxylic acid × 1
O9H [(1~{R},3~{R})-1-acetyloxy-1-[4-methanoyl-5-(2-phenylmethoxyethyl)-2,3-dihydro-1,3-thiazol-2-yl]-4-methyl-pentan-3-yl]-methyl-azanium × 1
OH5 (2~{S},4~{R})-4-azanyl-2-methyl-5-phenyl-pentanoic acid × 1
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1
VAL VALINE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.03 M calcium chloride, 0.03 M magnesium chloride, 0.10 M MES pH 6.50, 3.20% w/v
PEG 4000, 5.00% w/v glycerol
|
分辨率 3.34 Å
R-free 0.234
|
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6Y4N
Structure of Tubulin Tyrosine Ligase in Complex with Tb116
提交 2020-02-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
O9B (2~{R})-1-methylpiperidine-2-carboxylic acid × 1
O9K [(1~{R},3~{R})-1-(4-methanoyl-1,3-thiazol-2-yl)-4-methyl-3-(methylamino)pentyl] ethanoate × 1
O9N methyl (2~{S},4~{S})-2,4-bis(azanyl)-5-phenyl-pentanoate × 1
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1
VAL VALINE × 1
P6S benzyl hydrogen carbonate × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;30 mM calcium chloride, 30 mM magnesium chloride, 0.10 M MES pH 6.0, 2.0% w/v PEG 4000, 5.0% w/v glycerol
|
分辨率 2.85 Å
R-free 0.220
|
|
6ZPI
Microtubule complexed with Kif15 motor domain. Symmetrised asymmetric unit
提交 2020-07-08
|
构建体不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–431(431 aa)
|
未记录
|
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å
|
|
7CBZ
Crystal structure of T2R-TTL-A31 complex
提交 2020-06-15
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 6
FUO 2-[5-[4-[2-[4-(2-cyclopropylethanoyl)piperazin-1-yl]ethoxy]phenyl]pyridin-2-yl]-N-(phenylmethyl)ethanamide × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG4000, 8% glycerol, 0.1 M
MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, and 30 mM MgCl2.
|
分辨率 2.61 Å
R-free 0.255
|
|
7DMZ
GMPCPP microtubule complex
提交 2020-12-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 C
1–445(445 aa)
链 E
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 2
TAJ taccalonolide AJ × 3
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 3
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å
|
|
7DN0
AJ-GMPCPP-MT-non-seam
提交 2020-12-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 E
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 4
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
TAJ taccalonolide AJ × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
7EMJ
Crystal structure of T2R-TTL-Barbigerone complex
提交 2021-04-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 6
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
J6L 8,8-dimethyl-3-(2,4,5-trimethoxyphenyl)pyrano[2,3-f]chromen-4-one × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1 M MES, 30 mM CaCl2 and 30 mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.33 Å
R-free 0.241
|
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7EXC
Crystal structure of T2R-TTL-1129A2 complex
提交 2021-05-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
JEL N-[[3-(1,3-benzodioxol-5-yloxy)phenyl]methyl]-9H-pyrido[3,4-b]indol-3-amine × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.39 Å
R-free 0.264
|
|
7L05
Complex of novel maytansinoid M24 bound to T2R-TTL (two tubulin alpha/beta heterodimers, RB3 stathmin-like domain, and tubulin tyrosine ligase)
提交 2020-12-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 4
CL CHLORIDE ION × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
XQ4 (1S,2R,3S,5S,6S,16E,18E,20R,21S)-11-chloro-21-hydroxy-12,20-dimethoxy-2,5,9,16-tetramethyl-8,23-dioxo-4,24-dioxa-9,22-diazatetracyclo[19.3.1.1~10,14~.0~3,5~]hexacosa-10(26),11,13,16,18-pentaen-6-yl (2S)-2-{methyl[3-(methylamino)propanoyl]amino}propanoate (non-preferred name) × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;PEG 3350, MES, CaCl2, MgCl2, glycerol
|
分辨率 2.21 Å
R-free 0.217
|
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7NB8
Plasmodium falciparum kinesin-5 motor domain without nucleotide, complexed with 14 protofilament microtubule.
提交 2021-01-25
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;3.5 uM microtubules were incubated to the grid and incubated for 30 seconds. The grid was blotted, then 40 uM kinesin motor domain added and incubated for 30 seconds. The grid was again blotted and 40 uM kinesin motor domain added for 30 seconds. Then the grid was blotted and plunge frozen.
|
分辨率 4.40 Å
|
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7NBA
Plasmodium falciparum kinesin-5 motor domain bound to AMPPNP, complexed with 14 protofilament microtubule.
提交 2021-01-25
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;5 uM microtubules were applied to the grid and incubated for 30 seconds. The grid was blotted, then 40 uM kinesin motor domain added, incubated for 30 seconds, then blotted. 40 uM Kinesin motor domain was again added, incubated for 40 seconds, blotted, then plunge frozen.
|
分辨率 4.00 Å
|
|
7PQC
tau-microtubule structural ensemble based on CryoEM data
提交 2021-09-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 15
PDB 声明:pentadecameric
|
链 A
1–445(445 aa)
链 C
1–445(445 aa)
链 E
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
链 K
1–445(445 aa)
链 M
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7
MG MAGNESIUM ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
7PQP
tau-microtubule structural ensemble based on CryoEM data
提交 2021-09-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 15
PDB 声明:pentadecameric
|
链 A
1–445(445 aa)
链 C
1–445(445 aa)
链 E
1–445(445 aa)
链 G
1–445(445 aa)
链 I
1–445(445 aa)
链 K
1–445(445 aa)
链 M
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7
MG MAGNESIUM ION × 7
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
7RS5
Cryo-EM structure of Kip3 (AMPPNP) bound to Taxol-Stabilized Microtubules
提交 2021-08-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 27
PDB 声明:27-meric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 J
1–445(445 aa)
链 M
1–445(445 aa)
链 O
1–445(445 aa)
链 Q
1–445(445 aa)
链 S
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
MG MAGNESIUM ION × 18
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9
TA1 TAXOL × 9
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;cryoEM buffer (50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM DTT supplemented with 2mM AMPPNP)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
7RS6
Cryo-EM structure of Kip3 (AMPPNP) bound to GMPCPP-Stabilized Microtubules
提交 2021-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 27
PDB 声明:27-meric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
链 J
1–445(445 aa)
链 M
1–445(445 aa)
链 O
1–445(445 aa)
链 Q
1–445(445 aa)
链 S
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
MG MAGNESIUM ION × 27
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 buffer (80 mM PIPES-KOH, pH 6.8; 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM DTT)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
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7RX0
Complex of AMPPNP-Kif7 and Gli2 Zinc-Finger domain bound to microtubules
提交 2021-08-20
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blotted from behind the grid for 2 seconds
|
分辨率 3.89 Å
|
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7SGS
Cryo-EM structure of full-length MAP7 bound to the microtubule
提交 2021-10-07
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 C
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
7U0F
HIV-1 Rev in complex with tubulin
提交 2022-02-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 150
PDB 声明:150-meric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å
|
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7U0F
HIV-1 Rev in complex with tubulin
提交 2022-02-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 10
PDB 声明:decameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å
|
|
7U0F
HIV-1 Rev in complex with tubulin
提交 2022-02-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 10
PDB 声明:decameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.53 Å
|
|
7X4N
Crystal Structure of C. elegans kinesin-4 KLP-12 complexed with tubulin and DARPin
提交 2022-03-03
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;ammonium acetate, HEPES, polyethylene glycol (PEG) 3350
|
分辨率 2.88 Å
R-free 0.296
|
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7YHN
ANTI-TUMOR AGENT Y48 IN COMPLEX WITH TUBULIN
提交 2022-07-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
IUK 4-methyl-3-[(4-methylphenyl)sulfonylamino]-~{N}-[(6-methylpyridin-3-yl)methyl]benzamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;6% PEG 4000, 8% GLYCEROL, 30MM MAGNESIUM CHLORIDE, 30MM CALCIUM CHLORIDE, 100MM MES
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.272
|
|
7YSN
Tubulin heterodimer structure of GMPCPP state in solution
提交 2022-08-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å
|
|
7YSO
Tubulin heterodimer structure of GDP-1 state in solution
提交 2022-08-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
7YSP
Tubulin heterodimer structure of GDP-2 state in solution
提交 2022-08-12
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å
|
|
7Z2A
P. berghei kinesin-8B motor domain in no nucleotide state bound to tubulin dimer
提交 2022-02-26
|
构建体不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 H
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å
|
|
7Z2B
P. berghei kinesin-8B motor domain in AMPPNP state bound to tubulin dimer
提交 2022-02-26
|
构建体不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 H
1–426(426 aa)
|
未记录
|
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
7Z2C
P. falciparum kinesin-8B motor domain in no nucleotide bound to tubulin dimer
提交 2022-02-26
|
构建体不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 H
1–426(426 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å
|
|
8JJB
Crystal structure of T2R-TTL-Y61 complex
提交 2023-05-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–431(431 aa)
链 D
1–431(431 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 6
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
USI ~{N}4-(1~{H}-indol-5-ylmethyl)-6-(3-methoxyphenyl)pyrimidine-2,4-diamine × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.68 Å
R-free 0.260
|
|
8JJC
Tubulin-Y62
提交 2023-05-30
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–431(431 aa)
链 D
1–431(431 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 6
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
UPO 4-(6,7-dimethoxy-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl)-6-(3-methoxyphenyl)pyrimidin-2-amine × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
CL CHLORIDE ION × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% poly(ethylene glycol) 4000, 8% glycerol, 0.1 M MES (pH 6.7), 30 mM CaCl2, 30 mM MgCl2
|
分辨率 2.76 Å
R-free 0.264
|
|
8QAU
Outer kinetochore Ndc80-Dam1 alpha/beta-tubulin complex
提交 2023-08-23
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å
|
|
8RC1
MAP7 MTBD (microtubule binding domain) decorated microtubule protofilament
提交 2023-12-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–430(430 aa)
链 D
1–430(430 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.5;80mM PIPES, 2mM MgCl2, 1mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Microtubules stabilised by MAP7 MTBD were applied to a glow discharged grid, incubated for 30 seconds at room temperature following which excess sample was wicked off and MAP7 MTBD was immediately added to the grid. After incubation for 60 seconds in a Vitrobot, excess liquid was blotted off and the grid was plunge frozen in liquid ethane.
|
分辨率 3.70 Å
|
|
8RHB
Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to AMPPNP, single-headed state
提交 2023-12-15
|
构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8RHH
Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to AMPPNP, two-headed state
提交 2023-12-15
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8RIK
Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to ADP, single-headed state
提交 2023-12-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 + 5 mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
8RIZ
Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to ADP, two-headed state
提交 2023-12-19
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 + 5mM ADP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å
|
|
8V4K
CCP5 in complex with microtubules class1
提交 2023-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
ZN ZINC ION × 1
GLU GLUTAMIC ACID × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
8V4L
CCP5 in complex with microtubules class2
提交 2023-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
GLU GLUTAMIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å
|
|
8V4M
CCP5 in complex with microtubules class3
提交 2023-11-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2
GLU GLUTAMIC ACID × 1
ZN ZINC ION × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
|
8X9P
HURP (428-534)-alpha-tubulin-beta-tubulin complex
提交 2023-11-30
|
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–427(427 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å
|
|
9DA8
Tau-Microtubule structure in the presence of ATP
提交 2024-08-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 A
1–445(445 aa)
链 C
1–445(445 aa)
链 K
1–445(445 aa)
链 M
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
TA1 TAXOL × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å
|
|
9DHZ
Cryo-EM structure of HURP bound to a microtubule
提交 2024-09-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 A
1–445(445 aa)
链 K
1–445(445 aa)
|
未记录
|
TA1 TAXOL × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9DI0
Cryo-EM structure of Kif18A bound to a microtubule
提交 2024-09-04
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 K
1–445(445 aa)
|
未记录
|
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 2
TA1 TAXOL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9DUQ
HURP(65-174) bound to GMPCPP-stabilized microtubule
提交 2024-10-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 27
PDB 声明:27-meric
|
链 B
1–427(427 aa)
链 D
1–427(427 aa)
链 F
1–427(427 aa)
链 H
1–427(427 aa)
链 J
1–427(427 aa)
链 L
1–427(427 aa)
链 N
1–427(427 aa)
链 P
1–427(427 aa)
链 R
1–427(427 aa)
|
未记录
|
G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9
MG MAGNESIUM ION × 18
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 (1X): 80 mM PIPES, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, pH 6.8 with KOH
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å
|
|
9DXC
Model of tubulin dimers used for determining the dimer rise in a taxol-stabilized microtubule-HURP complex
提交 2024-10-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9DXE
Model of tubulin dimers used for determining the dimer rise in a taxol-stabilized microtubule
提交 2024-10-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
|
9EDR
Tubulin Cofactors D,E,G,C and Tubulin complex -- TBCC N Terminus Bound to Tubulin
提交 2024-11-17
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:heptameric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
9EDS
Tubulin cofactors D,E,G,C bound to tubulin dimer -- TBCC N terminus unbound
提交 2024-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 7
PDB 声明:heptameric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å
|
|
9EDT
Tubulin cofactors D,E,G bound to tubulin dimer
提交 2024-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
9EEB
Tubulin cofactors D,E,G bound to tubulin dimer
提交 2024-11-18
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å
|
|
9GNQ
Microtubule-associated Kif5B IAK tail mutant bound to ADP
提交 2024-09-03
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;BRB80 + 5mM AMPPNP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.90 Å
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9IM5
Tubulin-RB3(MUT)-TTL-Y12
提交 2024-07-02
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
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未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 4
CA CALCIUM ION × 3
CL CHLORIDE ION × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2
A1L2T ~{N}4-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-6-(1~{H}-indol-4-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.86 Å
R-free 0.246
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9IMO
Crystal structure of Tubulin-RB3-TTL-Y12
提交 2024-07-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–431(431 aa)
链 D
1–431(431 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 3
A1L2T ~{N}4-(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)-6-(1~{H}-indol-4-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
|
分辨率 2.75 Å
R-free 0.255
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9KBW
CryoEM structure of microtubule bound with GAS2-GAR domain.
提交 2024-10-31
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 B
1–426(426 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8;80 mM PIPES, pH 6.8, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å
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9L7M
Nucleotide-free kinesin-1 motor domain bound to the microtubule
提交 2024-12-26
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 4
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.48 Å
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9N9E
Cryo-EM structure of the SAH domain of Caenorhabditis elegans ICP-1 bound to the paclitaxel-stabilized microtubule
提交 2025-02-10
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å
|
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9N9F
Cryo-EM structure of the SAH domain of human INCENP bound to the paclitaxel-stabilized microtubule
提交 2025-02-10
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–445(445 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
ZN ZINC ION × 2
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
TA1 TAXOL × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.91 Å
|
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9N9G
Cryo-EM structure of the human Hec1-Nuf2 dimer bound to the paclitaxel-stabilized microtubule
提交 2025-02-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 9
PDB 声明:nonameric
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链 B
1–445(445 aa)
链 b
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å
|
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9N9H
Cryo-EM structure of the Xenopus laevis mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) bound to the paclitaxel-stabilized microtubule
提交 2025-02-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 5
PDB 声明:pentameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 b
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 4
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
TA1 TAXOL × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å
|
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9N9I
Cryo-EM structure of the Xenopus laevis mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) bound to the paclitaxel-stabilized microtubule
提交 2025-02-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 9
PDB 声明:nonameric
|
链 3
1–445(445 aa)
链 B
1–445(445 aa)
链 C
1–445(445 aa)
链 b
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4
MG MAGNESIUM ION × 8
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
TA1 TAXOL × 4
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å
|
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9NNL
Bordetella filamentous hemagglutinin (FhaB) C-terminal domain bound to microtubules
提交 2025-03-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
链 F
1–445(445 aa)
链 H
1–445(445 aa)
|
未记录
|
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4
TA1 TAXOL × 4
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.42 Å
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9RPD
D. melanogaster Augmin TII N-clamp (GST-fusion) bound to a microtubule, well-defined subset of particles
提交 2025-06-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
|
Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 9
PDB 声明:nonameric
|
链 B
1–445(445 aa)
链 D
1–445(445 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.90 Å
|
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9T1D
Cryo-EM reconstruction of undecorated GDP microtubule
提交 2025-10-21
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
1–429(429 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 2.90 Å
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9U6A
Tubulin-DARPin D1 in complex with a flavone
提交 2025-03-22
|
构建体不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–431(431 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 2
A1L8X 3-methoxy-2-(4-methoxy-3-oxidanyl-phenyl)-5,7-bis(oxidanyl)chromen-4-one × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG 3000, ammonium sulfate, bis-tris methane
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分辨率 1.92 Å
R-free 0.224
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9U6D
Crystal structure of tubulin-RB3-TTL in complex with X8
提交 2025-03-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
|
链 B
1–431(431 aa)
链 D
1–431(431 aa)
|
未记录
|
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 6
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2
A1L8Z 2-[2-fluoranyl-4-[4-[2-[4-[(1~{R},2~{S})-2-fluoranylcyclopropyl]carbonylpiperazin-1-yl]ethoxy]phenyl]phenyl]-~{N}-(phenylmethyl)ethanamide × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
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分辨率 2.54 Å
R-free 0.238
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9U9Q
Tubulin-RB3-TTL in complex with C38
提交 2025-03-29
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 B
1–431(431 aa)
链 D
1–431(431 aa)
|
未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3
MG MAGNESIUM ION × 5
CA CALCIUM ION × 7
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
A1L80 2-(1-benzofuran-5-yl)-6-[2,6-bis(fluoranyl)-4-[3-(methylamino)propoxy]phenyl]-5-chloranyl-~{N}-[(2~{S})-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]-[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine × 2
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;6% PEG 4000, 5% glycerol, 0.1M MES, 30mM CaCl2, 30mM MgCl2, pH 6.7
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分辨率 2.93 Å
R-free 0.269
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9YMG
Human KIF18A-DARPin fusion protein bound to AMP-PNP and tubulin
提交 2025-10-09
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构建体不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–444(444 aa)
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未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 M ammonium nitrate, 0.1 M sodium acetate pH 5.6, 20% (w/v) PEG Smear Low (5% PEG 400, 5% PEG 500 MME, 5% PEG 600, 5% PEG 1000), 5% (v/v) ethylene glycol
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分辨率 2.41 Å
R-free 0.238
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9YMG
Human KIF18A-DARPin fusion protein bound to AMP-PNP and tubulin
提交 2025-10-09
|
构建体不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 E
1–444(444 aa)
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未记录
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GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1
MG MAGNESIUM ION × 3
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1
ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 M ammonium nitrate, 0.1 M sodium acetate pH 5.6, 20% (w/v) PEG Smear Low (5% PEG 400, 5% PEG 500 MME, 5% PEG 600, 5% PEG 1000), 5% (v/v) ethylene glycol
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分辨率 2.41 Å
R-free 0.238
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9YXQ
Cryo-EM structure of the Xenopus laevis mitotic centromere-associated kinesin (MCAK) bound to the paclitaxel-stabilized microtubule
提交 2025-10-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 14
PDB 声明:14-meric
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链 2
1–445(445 aa)
链 4
1–445(445 aa)
链 5
1–445(445 aa)
链 7
1–445(445 aa)
链 B
1–445(445 aa)
链 b
1–445(445 aa)
|
未记录
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MG MAGNESIUM ION × 11
GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6
GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6
TA1 TAXOL × 6
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å
|