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6qld

Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 220.4 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Inner kinetochore subunit MIF2

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P35201

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 284–305 未记录 DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2VPV Dimerization Domain of Mif2p 提交 2008-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 365–530（166 aa） 片段：DIMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 365-530
链 B 365–530（166 aa） 片段：DIMERIZATION DOMAIN, RESIDUES 365-530
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；HANGING DROP VAPOR FUSION FROM 3-4% (W/V) PEG 3000, 100 MM IMIDAZOLE (PH 8.0), AND 70-100 MM LI2SO4 OR NA2SO4
分辨率 2.70 Å R-free 0.242

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPC_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–22； UniProt 284–305

Inner kinetochore subunit MCM16

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q12262

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 H； UniProt 4–136 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6OUA Cryo-EM structure of the yeast Ctf3 complex 提交 2019-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–181（181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
6WUC The yeast Ctf3 complex with Cnn1-Wip1 提交 2020-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 1–181（181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
6YPC Crystal structure of the kinetochore subunits H/I/K/T/W penta-complex from S. cerevisiae at 2.9 angstroms 提交 2020-04-15 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 137–181（45 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1 M NaH2PO4 and 0.38M K2HPO4 with protein at 5.5 mg/ml
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
7L7Q Ctf3c with Ulp2-KIM 提交 2020-12-30 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–181（181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–181（181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 H 1–181（181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 H 1–181（181 aa）
链 HH 1–181（181 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPH_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–133； UniProt 4–136

Inner kinetochore subunit CTF3

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q12748

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 I； UniProt 321–728 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–733（733 aa）
链 Y 1–733（733 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6OUA Cryo-EM structure of the yeast Ctf3 complex 提交 2019-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 1–733（733 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 I 335–656（322 aa）
链 I 690–733（44 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
6WUC The yeast Ctf3 complex with Cnn1-Wip1 提交 2020-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 1–733（733 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
6YPC Crystal structure of the kinetochore subunits H/I/K/T/W penta-complex from S. cerevisiae at 2.9 angstroms 提交 2020-04-15 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1 M NaH2PO4 and 0.38M K2HPO4 with protein at 5.5 mg/ml
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
7L7Q Ctf3c with Ulp2-KIM 提交 2020-12-30 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 I 1–733（733 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 I 1–733（733 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 I 1–733（733 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 I 1–733（733 aa）
链 II 1–733（733 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPI_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–408； UniProt 321–728

Inner kinetochore subunit MCM22

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P47167

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 K； UniProt 7–128 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6OUA Cryo-EM structure of the yeast Ctf3 complex 提交 2019-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–239（239 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 K 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
6WUC The yeast Ctf3 complex with Cnn1-Wip1 提交 2020-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 1–239（239 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
6YPC Crystal structure of the kinetochore subunits H/I/K/T/W penta-complex from S. cerevisiae at 2.9 angstroms 提交 2020-04-15 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 131–239（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1 M NaH2PO4 and 0.38M K2HPO4 with protein at 5.5 mg/ml
分辨率 2.90 Å R-free 0.283
7L7Q Ctf3c with Ulp2-KIM 提交 2020-12-30 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 1–239（239 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–239（239 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 K 1–239（239 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 K 1–239（239 aa）
链 KK 1–239（239 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPK_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–122； UniProt 7–128

Inner kinetochore subunit IML3

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P38265

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 L； UniProt 2–242 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4IT3 Crystal Structure of Iml3 from S. cerevisiae 提交 2013-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；3.75 M sodium formate, 4% 2,5-diaminopentane, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
4JE3 An Iml3-Chl4 heterodimer links the core centromere to factors required for accurate chromosome segregation 提交 2013-02-26 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–242（242 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；0.35 M lithium citrate, pH 9, 25% w/v PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.28 Å R-free 0.211
4KR1 Crystal structure of the kinetechore protein Iml3 from budding yeast 提交 2013-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；285 K；3M Sodium formate, 100mM Cesium chloride, 3% PEG 4000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
分辨率 2.50 Å R-free 0.262
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 L 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
6QLF Structure of inner kinetochore CCAN complex with mask1 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 L 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 L 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 L 1–245（245 aa）
链 LL 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPL_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–241； UniProt 2–242

Inner kinetochore subunit CHL4

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P38907

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 N； UniProt 5–451 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4JE3 An Iml3-Chl4 heterodimer links the core centromere to factors required for accurate chromosome segregation 提交 2013-02-26 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 361–458（98 aa） 片段：UNP residues 361-458
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；0.35 M lithium citrate, pH 9, 25% w/v PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.28 Å R-free 0.211
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–458（458 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 N 1–458（458 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
6QLF Structure of inner kinetochore CCAN complex with mask1 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 N 1–458（458 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 N 1–458（458 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–458（458 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 N 1–458（458 aa）
链 NN 1–458（458 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPN_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–447； UniProt 5–451

Inner kinetochore subunit MCM21

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q06675

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 O； UniProt 153–364 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–368（368 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 O 1–368（368 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
6QLF Structure of inner kinetochore CCAN complex with mask1 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 O 1–368（368 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 O 1–368（368 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OVX Cryo-EM structure of yeast CENP-OPQU+ bound to the CENP-A N-terminus 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 O 1–368（368 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 O 1–368（368 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 O 1–368（368 aa）
链 OO 1–368（368 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPO_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 O； PDB构建体 1–212； UniProt 153–364

Inner kinetochore subunit CTF19

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q02732

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 P； UniProt 97–366 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–369（369 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 P 1–369（369 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
6QLF Structure of inner kinetochore CCAN complex with mask1 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 P 1–369（369 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 P 1–369（369 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OVX Cryo-EM structure of yeast CENP-OPQU+ bound to the CENP-A N-terminus 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 P 1–369（369 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 P 1–369（369 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 P 1–369（369 aa）
链 PP 1–369（369 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPP_YEAST
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 P； PDB构建体 1–270； UniProt 97–366

Inner kinetochore subunit OKP1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P53298

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 Q； UniProt 161–391 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–406（406 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 Q 161–406（246 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
6QLF Structure of inner kinetochore CCAN complex with mask1 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Q 1–406（406 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 Q 1–406（406 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OVX Cryo-EM structure of yeast CENP-OPQU+ bound to the CENP-A N-terminus 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 Q 1–406（406 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Q 1–406（406 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 Q 1–406（406 aa）
链 QQ 1–406（406 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8T0P Structure of Cse4 bound to Ame1 and Okp1 提交 2023-06-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 125–275（151 aa） 片段：residues 125-275
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；19% PEG 8000, 0.55 M Lithium sulfate
分辨率 1.73 Å R-free 0.236

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPQ_YEAST
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 1–231； UniProt 161–391

Inner kinetochore subunit AME1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P38313

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 U； UniProt 131–320 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 I 1–324（324 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 U 166–324（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
6QLF Structure of inner kinetochore CCAN complex with mask1 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 U 1–320（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 U 1–324（324 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OVX Cryo-EM structure of yeast CENP-OPQU+ bound to the CENP-A N-terminus 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 U 1–324（324 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 U 1–324（324 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 U 1–324（324 aa）
链 UU 1–324（324 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8T0P Structure of Cse4 bound to Ame1 and Okp1 提交 2023-06-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 125–231（107 aa） 片段：residues 125-231
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；19% PEG 8000, 0.55 M Lithium sulfate
分辨率 1.73 Å R-free 0.236

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPU_YEAST
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 U； PDB构建体 1–190； UniProt 131–320

Inner kinetochore subunit NKP1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q12493

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 Y； UniProt 2–238 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 G 1–238（238 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 Y 1–238（238 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
6QLF Structure of inner kinetochore CCAN complex with mask1 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Y 1–238（238 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 Y 1–238（238 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OVX Cryo-EM structure of yeast CENP-OPQU+ bound to the CENP-A N-terminus 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 Y 1–238（238 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Y 1–238（238 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 Y 1–238（238 aa）
链 YY 1–238（238 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NKP1_YEAST
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 Y； PDB构建体 1–237； UniProt 2–238

Inner kinetochore subunit NKP2

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q06162

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 Z； UniProt 3–153 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6NUW Yeast Ctf19 complex 提交 2019-02-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–153（153 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6QLE Structure of inner kinetochore CCAN complex 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 Z 1–153（153 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
6QLF Structure of inner kinetochore CCAN complex with mask1 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Z 1–153（153 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8OVW Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to centromeric DNA 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 Z 1–153（153 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OVX Cryo-EM structure of yeast CENP-OPQU+ bound to the CENP-A N-terminus 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 Z 1–153（153 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Z 1–153（153 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 Z 1–153（153 aa）
链 ZZ 1–153（153 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NKP2_YEAST
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 Z； PDB构建体 1–151； UniProt 3–153

Histone H3-like centromeric protein CSE4

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P36012

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 a； UniProt 137–226 链 e； UniProt 112–226 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2L5A Structural basis for recognition of centromere specific histone H3 variant by nonhistone Scm3 提交 2010-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 151–228（78 aa） 片段：Cse4(151-228), Scm3(93-172), H4(42-103)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.4；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.00；压力 ambient
NMR样品组成 0.8-1.0 mM [U-100% 15N] scCSH-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-100% 15N] scCSH-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-13C methyl; U-15N; U-2H] scCSH-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-13C ; U-15N; 35%-2H] scCSH-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-13C ; U-15N] scCSH-5, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM scCSH-6, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
6UPH Structure of a Yeast Centromeric Nucleosome at 2.7 Angstrom resolution 提交 2019-10-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–229（229 aa）
链 E 1–229（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 a 1–229（229 aa）
链 e 1–229（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 a 1–229（229 aa）
链 e 1–229（229 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8T0P Structure of Cse4 bound to Ame1 and Okp1 提交 2023-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 32–49（18 aa） 片段：residues 32-49
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；19% PEG 8000, 0.55 M Lithium sulfate
分辨率 1.73 Å R-free 0.236

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CENPA_YEAST
Isoform —
PDB实体 15, 18
链与序列区间 作者链 a； PDB构建体 1–90； UniProt 137–226 作者链 e； PDB构建体 1–115； UniProt 112–226

Histone H4

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P02309

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 b； UniProt 25–103 链 f； UniProt 25–103 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1E6I Bromodomain from GCN5 complexed with acetylated H4 peptide 提交 2000-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 16–30（15 aa） 片段：ACETYLATED TAIL, RESIDUES 16-30
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；2.2M AMMONIUM SULPHATE, 20% V/V GLYCEROL, 4MM DITHIOTHREITOL, 100 MM HEPES PH 7.5, 125MM NACL 5:1 PEPTIDE:PROTEIN
分辨率 1.87 Å R-free 0.209
1ID3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE YEAST NUCLEOSOME CORE PARTICLE REVEALS FUNDAMENTAL DIFFERENCES IN INTER-NUCLEOSOME INTERACTIONS 提交 2001-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–102（102 aa）
链 F 1–102（102 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, Potassium chloride, cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 3.10 Å R-free 0.292
1Q1A Structure of the yeast Hst2 protein deacetylase in ternary complex with 2'-O-acetyl ADP ribose and histone peptide 提交 2003-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 12–21（10 aa） 片段：Residues 12-21
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 OAD 2'-O-ACETYL ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；PEG 4K, , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
1SZC Structural basis for nicotinamide cleavage and ADP-ribose transfer by NAD+-dependent Sir2 histone/protein deacetylases 提交 2004-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 12–21（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 CNA CARBA-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；Ammonium Sulfate, Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.75 Å R-free 0.239
1SZC Structural basis for nicotinamide cleavage and ADP-ribose transfer by NAD+-dependent Sir2 histone/protein deacetylases 提交 2004-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 12–21（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 CNA CARBA-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 GOL GLYCEROL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；Ammonium Sulfate, Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.75 Å R-free 0.239
1SZD Structural basis for nicotinamide cleavage and ADP-ribose transfer by NAD+-dependent Sir2 histone/protein deacetylases 提交 2004-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 12–21（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；Ammonium Sulfate, Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.230
1SZD Structural basis for nicotinamide cleavage and ADP-ribose transfer by NAD+-dependent Sir2 histone/protein deacetylases 提交 2004-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 12–21（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 2 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；Ammonium Sulfate, Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.230
2E3K Crystal structure of the human Brd2 second bromodomain in complexed with the acetylated histone H4 peptide 提交 2006-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Q 1–15（15 aa） 片段：N-terminal H4 di-acetylated tail
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；PEG4000, Ammonium Acetate,, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.268
2E3K Crystal structure of the human Brd2 second bromodomain in complexed with the acetylated histone H4 peptide 提交 2006-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 1–15（15 aa） 片段：N-terminal H4 di-acetylated tail
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；PEG4000, Ammonium Acetate,, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.268
2H2H The Structural basis of sirtuin substrate specificity 提交 2006-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 75–85（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293.15 K；20 % PEG, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K, pH 9.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.239
2L5A Structural basis for recognition of centromere specific histone H3 variant by nonhistone Scm3 提交 2010-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–103（62 aa） 片段：Cse4(151-228), Scm3(93-172), H4(42-103)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.4；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.00；压力 ambient
NMR样品组成 0.8-1.0 mM [U-100% 15N] scCSH-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-100% 15N] scCSH-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-13C methyl; U-15N; U-2H] scCSH-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-13C ; U-15N; 35%-2H] scCSH-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-13C ; U-15N] scCSH-5, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM scCSH-6, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2QQF Hst2 bound to ADP-HPD and Acetylated histone H4 提交 2007-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 13–23（11 aa） 片段：SEQUENCE DATABASE RESIDUES 13-23
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；2.0 M Ammonium Sulfate, 100 mM Na citrate and 200 mM K/Na tartrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
2QQF Hst2 bound to ADP-HPD and Acetylated histone H4 提交 2007-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 13–23（11 aa） 片段：SEQUENCE DATABASE RESIDUES 13-23
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；2.0 M Ammonium Sulfate, 100 mM Na citrate and 200 mM K/Na tartrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
2QQG Hst2 bound to ADP-HPD, acetyllated histone H4 and nicotinamide 提交 2007-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 13–23（11 aa） 片段：sequence database residues 13-23
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 1 NCA NICOTINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；298 K；2.0 M Ammonium Sulfate, 100 mM Na citrate, pH 5.6, 200 mM K/Na tartrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 5.60
分辨率 2.05 Å R-free 0.245
2QQG Hst2 bound to ADP-HPD, acetyllated histone H4 and nicotinamide 提交 2007-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 13–23（11 aa） 片段：sequence database residues 13-23
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 2 NCA NICOTINAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；298 K；2.0 M Ammonium Sulfate, 100 mM Na citrate, pH 5.6, 200 mM K/Na tartrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 5.60
分辨率 2.05 Å R-free 0.245
3TO6 Crystal structure of yeast Esa1 HAT domain complexed with H4K16CoA bisubstrate inhibitor 提交 2011-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 12–23（12 aa） 片段：UNP residues 12-23
未记录 CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M sodium cacodylate, 1.6 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.10 Å R-free 0.232
4JJN Crystal structure of heterochromatin protein Sir3 in complex with a silenced yeast nucleosome 提交 2013-03-08 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.05 M sodium cacodylate, 32% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.09 Å R-free 0.255
4KUD Crystal structure of N-terminal acetylated Sir3 BAH domain D205N mutant in complex with yeast nucleosome core particle 提交 2013-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
突变：S2A 突变：S2A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；289 K；16% PEG 400, 0.1M KCl, 0.01M CaCl2, 0.05M sodium citrate(pH4.8), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.20 Å R-free 0.237
4PSX Crystal structure of histone acetyltransferase complex 提交 2014-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–49（48 aa） 片段：UNP residues 2-49
突变：I21V COA COENZYME A × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.2M potassium sodium tartrate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3,350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.51 Å R-free 0.223
4PSX Crystal structure of histone acetyltransferase complex 提交 2014-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 2–49（48 aa） 片段：UNP residues 2-49
突变：I21V COA COENZYME A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.2M potassium sodium tartrate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3,350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.51 Å R-free 0.223
4TWI The structure of Sir2Af1 bound to a succinylated histone peptide 提交 2014-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 9–21（13 aa） 片段：UNP residues 9-21
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris pH 8.5, 200 mM MgCl2, and 20% (w/v) PEG 8,000
分辨率 1.79 Å R-free 0.221
4TWJ The structure of Sir2Af2 bound to a myristoylated histone peptide 提交 2014-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 9–21（13 aa） 片段：UNP residues 9-21
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 ACT ACETATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；293 K；0.1 M Na-acetate pH 4.8, 14-18% (v/v) 2-propanol, and 14-15% (w/v) PEG 6,000
分辨率 1.65 Å R-free 0.205
5ZBA Crystal structure of Rtt109-Asf1-H3-H4-CoA complex 提交 2018-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–103（103 aa）
未记录 COA COENZYME A × 1 IOD IODIDE ION × 37 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；100mM sodium citrate, pH 5.0, 22% PEG 1500, 400mM sodium iodide
分辨率 3.50 Å R-free 0.294
5ZBB Crystal structure of Rtt109-Asf1-H3-H4 complex 提交 2018-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–103（103 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 23 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；100mM sodium citrate, pH 5.0, 22% PEG 1500, 400mM sodium iodide
分辨率 3.60 Å R-free 0.264
6GEJ Chromatin remodeller-nucleosome complex at 3.6 A resolution. 提交 2018-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GEN Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution. 提交 2018-04-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6RXJ Crystal structure of CobB wt in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 13–22（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 22% PEG3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.188
6RXJ Crystal structure of CobB wt in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 13–22（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 22% PEG3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.188
6RXK Crystal structure of CobB wt in complex with H4K16-Butyryl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 13–23（11 aa） 片段：H4K16Bu
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；22% PEG 3350 0.1M Bis-Tris 0.03 mM HCL
分辨率 1.35 Å R-free 0.188
6RXL Crystal structure of CobB wt in complex with H4K16-Crotonyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 13–23（11 aa） 片段：H4K16Ac
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Bis-Tris 22% PEG 3350 0.03 M HCl
分辨率 2.30 Å R-free 0.250
6RXM Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.03 HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
6RXM Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.03 HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
6RXM Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.03 HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
6RXM Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.03 HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
6RXM Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.03 HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
6RXM Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.03 HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
6RXO Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162A) in complex with H4K16-Buturyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 13–23（11 aa） 片段：H4K16Ac
突变：K16ALY 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.215
6RXO Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162A) in complex with H4K16-Buturyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 13–23（11 aa） 片段：H4K16Ac
突变：K16ALY 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.215
6RXP Crystal structure of CobB Ac2 (A76G,I131C,V162A) in complex with H4K16-Crotonyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.234
6RXP Crystal structure of CobB Ac2 (A76G,I131C,V162A) in complex with H4K16-Crotonyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.234
6RXQ Crystal structure of CobB Ac2 (A76G,I131C,V162A) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after soaking 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 mM Bis-Tris, 0.03M HCl, 23% PEG3350, soaked 36h with 1 mM NAD+
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXQ Crystal structure of CobB Ac2 (A76G,I131C,V162A) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after soaking 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 mM Bis-Tris, 0.03M HCl, 23% PEG3350, soaked 36h with 1 mM NAD+
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXQ Crystal structure of CobB Ac2 (A76G,I131C,V162A) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after soaking 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 mM Bis-Tris, 0.03M HCl, 23% PEG3350, soaked 36h with 1 mM NAD+
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXQ Crystal structure of CobB Ac2 (A76G,I131C,V162A) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after soaking 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 mM Bis-Tris, 0.03M HCl, 23% PEG3350, soaked 36h with 1 mM NAD+
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXR Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after co-crystallisation 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.02 M HCl, 22% PEG 3350, 1 mM NAD
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXR Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after co-crystallisation 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.02 M HCl, 22% PEG 3350, 1 mM NAD
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXR Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after co-crystallisation 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.02 M HCl, 22% PEG 3350, 1 mM NAD
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXR Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after co-crystallisation 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.02 M HCl, 22% PEG 3350, 1 mM NAD
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
7E9C Cryo-EM structure of the 1:1 Orc1 BAH domain in complex with nucleosome 提交 2021-03-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7E9F Cryo-EM structure of the 2:1 Orc1 BAH domain in complex with nucleosome 提交 2021-03-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7K78 antibody and nucleosome complex 提交 2020-09-22 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.10 Å
7K7G nucleosome and Gal4 complex 提交 2020-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XAY Crystal structure of Hat1-Hat2-Asf1-H3-H4 提交 2022-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 8–103（96 aa）
未记录 COA COENZYME A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；100 mM Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% PEG-3350, and 200 mM sodium nitrate
分辨率 3.30 Å R-free 0.256
7Z0O Structure of transcription factor UAF in complex with TBP and 35S rRNA promoter DNA 提交 2022-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8GHN Composite model of the yeast Hir Complex with Asf1/H3/H4 提交 2023-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric
链 N 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8QKU SWR1-nucleosome complex in configuration 1 提交 2023-09-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8QKV SWR1-nucleosome complex in configuration 2 提交 2023-09-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8QYV SWR1-hexasome complex 提交 2023-10-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QZ0 SWR1-hexasome-dimer complex 提交 2023-10-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 O 1–103（103 aa）
链 S 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9FBW SWR1 lacking Swc5 subunit in complex with hexasome 提交 2024-05-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å

共 43 个其他 PDB 条目、63 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H4_YEAST
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 b； PDB构建体 1–79； UniProt 25–103 作者链 f； PDB构建体 1–79； UniProt 25–103

Histone H2B.2

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P02294

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 d； UniProt 37–129 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.1 × 1 （P02293） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1ID3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE YEAST NUCLEOSOME CORE PARTICLE REVEALS FUNDAMENTAL DIFFERENCES IN INTER-NUCLEOSOME INTERACTIONS 提交 2001-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–130（130 aa）
链 H 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, Potassium chloride, cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 3.10 Å R-free 0.292
4JJN Crystal structure of heterochromatin protein Sir3 in complex with a silenced yeast nucleosome 提交 2013-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 2–131（130 aa）
链 H 2–131（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.05 M sodium cacodylate, 32% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.09 Å R-free 0.255
7E9C Cryo-EM structure of the 1:1 Orc1 BAH domain in complex with nucleosome 提交 2021-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7E9F Cryo-EM structure of the 2:1 Orc1 BAH domain in complex with nucleosome 提交 2021-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8F0X Cryo-EM structure of Kap114 bound to H2A-H2B 提交 2022-11-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–131（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris pH 7.5, 300 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP, and 0.1% NP-40
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
8F1E Cryo-EM structure of Kap114 bound to Gsp1 (RanGTP) and H2A-H2B 提交 2022-11-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–131（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 Q 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2B2_YEAST
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 d； PDB构建体 1–93； UniProt 37–129

Histone H2A.1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P04911

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 g； UniProt 17–121 链 i； UniProt 17–118 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2B.1 × 1 （P02293） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1ID3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE YEAST NUCLEOSOME CORE PARTICLE REVEALS FUNDAMENTAL DIFFERENCES IN INTER-NUCLEOSOME INTERACTIONS 提交 2001-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–131（131 aa）
链 G 1–131（131 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, Potassium chloride, cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 3.10 Å R-free 0.292
3T7K Complex structure of Rtt107p and phosphorylated histone H2A 提交 2011-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 125–132（8 aa） 片段：phosphorylated C-terminal peptide
链 D 125–132（8 aa） 片段：phosphorylated C-terminal peptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；283 K；14%(w/v) PEG 1500, 0.2M NaCl, 0.1M MES, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 2.03 Å R-free 0.258
3T7K Complex structure of Rtt107p and phosphorylated histone H2A 提交 2011-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 125–132（8 aa） 片段：phosphorylated C-terminal peptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；283 K；14%(w/v) PEG 1500, 0.2M NaCl, 0.1M MES, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 2.03 Å R-free 0.258
3T7K Complex structure of Rtt107p and phosphorylated histone H2A 提交 2011-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 125–132（8 aa） 片段：phosphorylated C-terminal peptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；283 K；14%(w/v) PEG 1500, 0.2M NaCl, 0.1M MES, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 2.03 Å R-free 0.258
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–132（132 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–132（132 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
5BT1 histone chaperone Hif1 playing with histone H2A-H2B dimer 提交 2015-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M Magnesium formate dihydrate, 15% PEG3350
分辨率 2.62 Å R-free 0.262
6GEJ Chromatin remodeller-nucleosome complex at 3.6 A resolution. 提交 2018-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–132（132 aa）
链 F 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GEN Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution. 提交 2018-04-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–132（132 aa）
链 F 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7K78 antibody and nucleosome complex 提交 2020-09-22 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.10 Å
7K7G nucleosome and Gal4 complex 提交 2020-09-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7SSA Cryo-EM structure of pioneer factor Cbf1 bound to the nucleosome 提交 2021-11-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 2–132（131 aa）
链 G 2–132（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 c 1–132（132 aa）
链 g 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 c 1–132（132 aa）
链 g 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8QYV SWR1-hexasome complex 提交 2023-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 E 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QZ0 SWR1-hexasome-dimer complex 提交 2023-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 P 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.91 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.16 Å
9CAU DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Nucleosome 提交 2024-06-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.18 Å
9CB7 DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Ino80-Nucleosome 提交 2024-06-18 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.04 Å
9FBW SWR1 lacking Swc5 subunit in complex with hexasome 提交 2024-05-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 E 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
9OB1 S.c INO80 in complex with Yeast 0/80 nucleosome, Apo State 提交 2025-04-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.20 Å

共 20 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2A1_YEAST
Isoform —
PDB实体 19, 21
链与序列区间 作者链 g； PDB构建体 1–105； UniProt 17–121 作者链 i； PDB构建体 1–102； UniProt 17–118

Histone H2B.1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P02293

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 h； UniProt 36–129 未记录 Inner kinetochore subunit MIF2 × 1 （P35201） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM16 × 1 （Q12262） Inner kinetochore subunit CTF3 × 1 （Q12748） DNA (125-MER) × 1 Inner kinetochore subunit MCM22 × 1 （P47167） Inner kinetochore subunit IML3 × 1 （P38265） Inner kinetochore subunit CHL4 × 1 （P38907） Inner kinetochore subunit MCM21 × 1 （Q06675） Inner kinetochore subunit CTF19 × 1 （Q02732） Inner kinetochore subunit OKP1 × 1 （P53298） Inner kinetochore subunit AME1 × 1 （P38313） Inner kinetochore subunit NKP1 × 1 （Q12493） Inner kinetochore subunit NKP2 × 1 （Q06162） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） Histone H3-like centromeric protein CSE4 × 1 （P36012） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2A.1 × 1 （P04911） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.15 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6QLD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2JSS NMR structure of chaperone Chz1 complexed with histone H2A.Z-H2B 提交 2007-07-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 37–131（95 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；308 K；离子强度（mmCIF原始值）200 mM KCl；压力 ambient
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-35%2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1 | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C;U-35%2H]/[U-100% 2H] Chz1/H2A.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100%15N;U-100% 2H] Chz1/H2a.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N;U-100%2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-10% 13C; U-100% 15N]/[U-100% 2H] Chz1/H2A.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 15N;U-100%2H]/[U-30%2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C;U-30%2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-13C; U-15N; U-2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 15N;U-30%2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C;U-35%2H]/[U-100% 2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 15N;U-100%2H]/[U-30%2H] H2A.Z-H2B/Chz1, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 13C;U-35%2H]/[U-100% 2H] Chz1/H2A.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
NMR样品组成 1.0~1.2 mM [U-100% 15N;U-30%2H]/[U-100% 2H] Chz1/H2A.Z-H2B, 25 mM MES, 200 mM KCl, 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O/100%D2O
分辨率未提供
4KUD Crystal structure of N-terminal acetylated Sir3 BAH domain D205N mutant in complex with yeast nucleosome core particle 提交 2013-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；289 K；16% PEG 400, 0.1M KCl, 0.01M CaCl2, 0.05M sodium citrate(pH4.8), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.20 Å R-free 0.237
4M6B Crystal structure of yeast Swr1-Z domain in complex with H2A.Z-H2B dimer 提交 2013-08-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 37–131（95 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% (w/v) PEG 2000 MME, 100 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM Calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.220
4M6B Crystal structure of yeast Swr1-Z domain in complex with H2A.Z-H2B dimer 提交 2013-08-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 37–131（95 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10% (w/v) PEG 2000 MME, 100 mM HEPES, pH 7.5, 50 mM Calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.220
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 31–131（101 aa） 片段：UNP residues 31-131
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 31–131（101 aa） 片段：UNP residues 31-131
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 31–131（101 aa） 片段：UNP residues 31-131
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 31–131（101 aa） 片段：UNP residues 31-131
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
5BT1 histone chaperone Hif1 playing with histone H2A-H2B dimer 提交 2015-06-02 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M Magnesium formate dihydrate, 15% PEG3350
分辨率 2.62 Å R-free 0.262
6AE8 Structure insight into histone chaperone Chz1-mediated H2A.Z recognition and replacement 提交 2018-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 37–131（95 aa） 片段：UNP residues 37-131, UNP residues 23-119
未记录 BCN BICINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；Bicine,1,4-Dioxane,PEG 20000
分辨率 1.65 Å R-free 0.216
6AE8 Structure insight into histone chaperone Chz1-mediated H2A.Z recognition and replacement 提交 2018-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 37–131（95 aa） 片段：UNP residues 37-131, UNP residues 23-119
未记录 BCN BICINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；Bicine,1,4-Dioxane,PEG 20000
分辨率 1.65 Å R-free 0.216
6GEJ Chromatin remodeller-nucleosome complex at 3.6 A resolution. 提交 2018-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GEN Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution. 提交 2018-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7K78 antibody and nucleosome complex 提交 2020-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.10 Å
7K7G nucleosome and Gal4 complex 提交 2020-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7SSA Cryo-EM structure of pioneer factor Cbf1 bound to the nucleosome 提交 2021-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 2–131（130 aa）
链 H 2–131（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 d 1–131（131 aa）
链 h 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 d 1–131（131 aa）
链 h 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8QKU SWR1-nucleosome complex in configuration 1 提交 2023-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8QKV SWR1-nucleosome complex in configuration 2 提交 2023-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8QYV SWR1-hexasome complex 提交 2023-10-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 G 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QZ0 SWR1-hexasome-dimer complex 提交 2023-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 G 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
突变：S115C ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.91 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.16 Å
9CAU DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Nucleosome 提交 2024-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.18 Å
9CB7 DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Ino80-Nucleosome 提交 2024-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.04 Å
9FBW SWR1 lacking Swc5 subunit in complex with hexasome 提交 2024-05-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 G 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
9OB1 S.c INO80 in complex with Yeast 0/80 nucleosome, Apo State 提交 2025-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.20 Å

共 23 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2B1_YEAST
Isoform —
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 h； PDB构建体 1–94； UniProt 36–129

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6qld

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6qld
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6qld
沉积日期 deposition_date2019-01-31
结构标题 titleStructure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex
关键词 keywordsinner kinetochore, DNA, nucleosome, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier62.71 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron62.47 Å
零角强度 I(0) i03012220000.00
分子量 molecular_weight417390.0 kDa
排除体积 excluded_volume504270 ų
包络体积 envelope_volume858040 ų
水化壳体积 shell_volume115360 ų
包络直径 envelope_diameter216.8 Å
壳层 Rg shell_rg64.03 Å
包络 Rg envelope_rg60.05 Å
形状 Rg shape_rg62.46 Å
总 Rg total_rg62.53 Å
总原子数 total_atoms29086
残基数 n_residues3405
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax220.4 Å
Rg (实空间) rg_real62.72 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error3.51 Å
I(0) (实空间) i0_real3.0120e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.4190e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal62.66 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3012000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8625
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary79.3 Å
偏度 Skewness skewness0.316
峰度 Kurtosis kurtosis-0.302
角度范围 angular_range— – 0.1250 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha194500000.0000
实空间数据点数 n_real_points26
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.826; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.733
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (21)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)