7sl3

Full-length insulin receptor bound with site 2 binding deficient mutant insulin (A-L13R) -- symmetric conformation

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 182.5 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Insulin receptor

Mus musculus

UniProt P15208

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–1372 链 B; UniProt 1–1372 未记录 Insulin B chain × 2 (P01308) Insulin A chain × 2 (P01308) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 INSR_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1372; UniProt 1–1372 作者链 B; PDB构建体 1–1372; UniProt 1–1372

Insulin B chain

Homo sapiens

UniProt P01308

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 25–54 链 D; UniProt 25–54 链 E; UniProt 90–110 链 F; UniProt 90–110 突变:L13R Insulin receptor × 2 (P15208) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 369 个其他 PDB 条目、583 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 INS_HUMAN
Isoform
PDB实体 2, 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–30; UniProt 25–54 作者链 D; PDB构建体 1–30; UniProt 25–54 作者链 E; PDB构建体 1–21; UniProt 90–110 作者链 F; PDB构建体 1–21; UniProt 90–110

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7sl3

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7sl3
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7sl3
沉积日期 deposition_date2021-10-22
结构标题 titleFull-length insulin receptor bound with site 2 binding deficient mutant insulin (A-L13R) -- symmetric conformation
关键词 keywordsinsulin receptor, site 1 binding deficient mutant insulin, SIGNALING PROTEIN, SIGNALING PROTEIN-HORMONE complex; SIGNALING PROTEIN/HORMONE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier53.06
回转半径 Rg (电子) rg_electron52.87
零角强度 I(0) i0590523000.00
分子量 molecular_weight199540.0 kDa
排除体积 excluded_volume248780 ų
包络体积 envelope_volume396480 ų
水化壳体积 shell_volume66535 ų
包络直径 envelope_diameter179.5
壳层 Rg shell_rg52.09
包络 Rg envelope_rg51.37
形状 Rg shape_rg52.88
总 Rg total_rg52.84
总原子数 total_atoms14016
残基数 n_residues1736
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax182.5
Rg (实空间) rg_real53.15
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.73
I(0) (实空间) i0_real5.9050e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.0610e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal52.96
I(0) (倒空间) i0_reciprocal590400000.0000
解质量估计 total_estimate0.8868
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary54.7
偏度 Skewness skewness0.264
峰度 Kurtosis kurtosis-0.673
角度范围 angular_range— – 0.1500 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha32940000.0000
实空间数据点数 n_real_points31
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.887; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.985; Smooth: 0.878

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id7sl3A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology20 — 24 nucleotide stem-loop, u2 snrnp hairpin iv. U2 a'; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Receptor L-domain
结构域编号 domain_id7sl3B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology20 — 24 nucleotide stem-loop, u2 snrnp hairpin iv. U2 a'; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Receptor L-domain

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)