7y8r

The nucleosome-bound human PBAF complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 252.6 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H3

Homo sapiens

UniProt A0A2U3ZMZ6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 A; UniProt 2–136 链 E; UniProt 2–136 未记录 Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A2U3ZMZ6_ODORO
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–135; UniProt 2–136 作者链 E; PDB构建体 1–135; UniProt 2–136

Histone H4

Homo sapiens

UniProt H3A5H1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 B; UniProt 2–103 链 F; UniProt 2–103 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H3A5H1_LATCH
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–102; UniProt 2–103 作者链 F; PDB构建体 1–102; UniProt 2–103

Histone H2A type 1-C

Homo sapiens

UniProt Q93077

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 C; UniProt 2–130 链 G; UniProt 2–130 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2A1C_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130 作者链 G; PDB构建体 1–129; UniProt 2–130

Histone H2B

Homo sapiens

UniProt S9WX78

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 D; UniProt 2–126 链 H; UniProt 2–126 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 S9WX78_CAMFR
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–125; UniProt 2–126 作者链 H; PDB构建体 1–125; UniProt 2–126

Transcription activator BRG1

Homo sapiens

UniProt P51532

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 I; UniProt 1–1647 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 25 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMCA4_HUMAN
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–1647; UniProt 1–1647

ACTB protein (Fragment)

Homo sapiens

UniProt A0A7K5XZZ2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 J; UniProt 1–375 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A7K5XZZ2_9CHAR
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375

Actin-like protein 6A

Homo sapiens

UniProt O96019

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 K; UniProt 1–429 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 24 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACL6A_HUMAN
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–429; UniProt 1–429

AT-rich interactive domain-containing protein 2

Homo sapiens

UniProt Q68CP9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 L; UniProt 1–1835 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARID2_HUMAN
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–1835; UniProt 1–1835

SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1

Homo sapiens

UniProt Q12824

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 M; UniProt 1–385 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SNF5_HUMAN
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–385; UniProt 1–385

SWI/SNF complex subunit SMARCC2

Homo sapiens

UniProt Q8TAQ2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 N; UniProt 1–1214 链 O; UniProt 1–1214 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMRC2_HUMAN
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–1214; UniProt 1–1214 作者链 O; PDB构建体 1–1214; UniProt 1–1214

SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1

Homo sapiens

UniProt Q96GM5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 P; UniProt 1–515 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMRD1_HUMAN
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–515; UniProt 1–515

SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1

Homo sapiens

UniProt Q969G3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 Q; UniProt 1–411 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMCE1_HUMAN
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–411; UniProt 1–411

PHD finger protein 10

Homo sapiens

UniProt Q8WUB8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 R; UniProt 1–498 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PHF10_HUMAN
Isoform
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–498; UniProt 1–498

Bromodomain-containing protein 7

Homo sapiens

UniProt Q9NPI1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 S; UniProt 1–651 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Unkown × 1 Protein polybromo-1 × 1 (Q86U86) Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BRD7_HUMAN
Isoform
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 S; PDB构建体 1–651; UniProt 1–651

Protein polybromo-1

Homo sapiens

UniProt Q86U86

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 25 DNA 2 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 链 U; UniProt 1–1597 未记录 Histone H3 × 2 (A0A2U3ZMZ6) Histone H4 × 2 (H3A5H1) Histone H2A type 1-C × 2 (Q93077) Histone H2B × 2 (S9WX78) Unknown × 1 Transcription activator BRG1 × 1 (P51532) ACTB protein (Fragment) × 1 (A0A7K5XZZ2) Actin-like protein 6A × 1 (O96019) AT-rich interactive domain-containing protein 2 × 1 (Q68CP9) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 × 1 (Q12824) SWI/SNF complex subunit SMARCC2 × 2 (Q8TAQ2) Unknown × 1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1 × 1 (Q96GM5) SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 × 1 (Q969G3) PHD finger protein 10 × 1 (Q8WUB8) Bromodomain-containing protein 7 × 1 (Q9NPI1) Unkown × 1 Unknown × 1 DNA (213-MER) × 1 DNA (213-MER) × 1 Unknown × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 29 个其他 PDB 条目、66 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PB1_HUMAN
Isoform Q86U86-7
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–1597; UniProt 1–1597

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7y8r

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7y8r
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7y8r
沉积日期 deposition_date2022-06-24
结构标题 titleThe nucleosome-bound human PBAF complex
关键词 keywordschromatin remodeling complexes, DNA BINDING PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex; DNA BINDING PROTEIN/DNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier70.72
回转半径 Rg (电子) rg_electron70.78
零角强度 I(0) i06702430000.00
分子量 molecular_weight618990.0 kDa
排除体积 excluded_volume744840 ų
包络体积 envelope_volume1319100 ų
水化壳体积 shell_volume155900 ų
包络直径 envelope_diameter249.2
壳层 Rg shell_rg69.53
包络 Rg envelope_rg69.59
形状 Rg shape_rg70.76
总 Rg total_rg70.83
总原子数 total_atoms43109
残基数 n_residues4908
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax252.6
Rg (实空间) rg_real70.78
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.59
I(0) (实空间) i0_real6.7030e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.4900e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal70.42
I(0) (倒空间) i0_reciprocal6697000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8503
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary80.4
偏度 Skewness skewness0.372
峰度 Kurtosis kurtosis-0.360
角度范围 angular_range— – 0.1100 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0007
最高正则化参数 α highest_alpha368000000.0000
实空间数据点数 n_real_points23
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.771; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.976; Smooth: 0.760

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (25)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)