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8iai

Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, State II, Global map

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 310.4 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Adducin 1

物种未注明

UniProt A0A8D1Q0D0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric（31） 与蛋白拷贝数一致 链 1； UniProt 11–754 链 2； UniProt 11–754 链 9； UniProt 11–754 未记录 Beta-adducin × 2 （A0A480JMR2） Dematin actin binding protein × 3 （A0A8D1E7W3） Actin, cytoplasmic 1 × 11 （Q6QAQ1） Spectrin beta chain × 8 （A0A480J001） Tropomyosin-1.9 × 1 Tropomyosin 3 × 1 （Q6QA25） Tropomodulin-1 × 1 （A0A287BCZ0） SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein × 1 （A0A4X1V2Q0） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8IAI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8IAH Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, State I, Global map 提交 2023-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 0 11–754（744 aa）
链 1 11–754（744 aa）
链 2 11–754（744 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 A0A8D1Q0D0_PIG
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 1； PDB构建体 1–744； UniProt 11–754 作者链 2； PDB构建体 1–744； UniProt 11–754 作者链 9； PDB构建体 1–744； UniProt 11–754

Beta-adducin

物种未注明

UniProt A0A480JMR2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric（31） 与蛋白拷贝数一致 链 3； UniProt 1–724 链 4； UniProt 1–724 未记录 Adducin 1 × 3 （A0A8D1Q0D0） Dematin actin binding protein × 3 （A0A8D1E7W3） Actin, cytoplasmic 1 × 11 （Q6QAQ1） Spectrin beta chain × 8 （A0A480J001） Tropomyosin-1.9 × 1 Tropomyosin 3 × 1 （Q6QA25） Tropomodulin-1 × 1 （A0A287BCZ0） SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein × 1 （A0A4X1V2Q0） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8IAI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8IAH Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, State I, Global map 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 3 1–724（724 aa）
链 4 1–724（724 aa）
链 9 1–724（724 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 A0A480JMR2_PIG
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 3； PDB构建体 1–724； UniProt 1–724 作者链 4； PDB构建体 1–724； UniProt 1–724

Dematin actin binding protein

物种未注明

UniProt A0A8D1E7W3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric（31） 与蛋白拷贝数一致 链 5； UniProt 1–405 链 6； UniProt 1–405 链 7； UniProt 1–405 未记录 Adducin 1 × 3 （A0A8D1Q0D0） Beta-adducin × 2 （A0A480JMR2） Actin, cytoplasmic 1 × 11 （Q6QAQ1） Spectrin beta chain × 8 （A0A480J001） Tropomyosin-1.9 × 1 Tropomyosin 3 × 1 （Q6QA25） Tropomodulin-1 × 1 （A0A287BCZ0） SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein × 1 （A0A4X1V2Q0） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8IAI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8IAH Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, State I, Global map 提交 2023-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 5 1–405（405 aa）
链 6 1–405（405 aa）
链 7 1–405（405 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8IB2 Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, Pointed-end segment, headpiece domain of dematin optimized 提交 2023-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 5 1–405（405 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 A0A8D1E7W3_PIG
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 5； PDB构建体 1–405； UniProt 1–405 作者链 6； PDB构建体 1–405； UniProt 1–405 作者链 7； PDB构建体 1–405； UniProt 1–405

Actin, cytoplasmic 1

物种未注明

UniProt Q6QAQ1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric（31） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–375 链 B； UniProt 1–375 链 C； UniProt 1–375 链 D； UniProt 1–375 链 E； UniProt 1–375 链 F； UniProt 1–375 链 G； UniProt 1–375 链 H； UniProt 1–375 链 I； UniProt 1–375 链 J； UniProt 1–375 链 K； UniProt 1–375 未记录 Adducin 1 × 3 （A0A8D1Q0D0） Beta-adducin × 2 （A0A480JMR2） Dematin actin binding protein × 3 （A0A8D1E7W3） Spectrin beta chain × 8 （A0A480J001） Tropomyosin-1.9 × 1 Tropomyosin 3 × 1 （Q6QA25） Tropomodulin-1 × 1 （A0A287BCZ0） SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein × 1 （A0A4X1V2Q0） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8IAI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5ADX CryoEM structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution 提交 2015-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric
链 H 6–375（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50MM KCL, 25MM K2HPO4- KH2PO4, 1MM MGCL2,5MM DTT；pH 6.5；50MM KCL, 25MM K2HPO4- KH2PO4, 1MM MGCL2,5MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ENTHANE
分辨率 4.00 Å
5AFU Cryo-EM structure of dynein tail-dynactin-BICD2N complex 提交 2015-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 H 6–375（370 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 150MM KCL, 25MM HEPES-KOH, 1MM MGCL2, 0.1MM MGATP, 5MM DTT；pH 7.4；150MM KCL, 25MM HEPES-KOH, 1MM MGCL2, 0.1MM MGATP, 5MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 8.20 Å
6F1T Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and BICDR1 提交 2017-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6F38 Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and HOOK3 提交 2017-11-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6F3A Cryo-EM structure of a single dynein tail domain bound to dynactin and BICD2N 提交 2017-11-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
6ZNL Cryo-EM structure of the dynactin complex 提交 2020-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：23-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6ZNM The pointed end complex of dynactin bound to BICDR1 提交 2020-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6ZNN The pointed end complex of dynactin bound to Hook3 提交 2020-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6ZNO The pointed end complex of dynactin with the p150 projection docked 提交 2020-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6ZO4 The pointed end complex of dynactin bound to BICD2 提交 2020-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
7Z8F Composite structure of dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2022-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：43-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ZN ZINC ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；20 second incubation
分辨率 20.00 Å
7Z8M The pointed end complex of dynactin bound to BICDR1 提交 2022-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；20 second incubation
分辨率 3.37 Å
8IAH Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, State I, Global map 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 A 1–375（375 aa）
链 B 1–375（375 aa）
链 C 1–375（375 aa）
链 D 1–375（375 aa）
链 E 1–375（375 aa）
链 F 1–375（375 aa）
链 G 1–375（375 aa）
链 H 1–375（375 aa）
链 I 1–375（375 aa）
链 J 1–375（375 aa）
链 K 1–375（375 aa）
链 L 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8IB2 Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, Pointed-end segment, headpiece domain of dematin optimized 提交 2023-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–375（375 aa）
链 C 1–375（375 aa）
链 D 1–375（375 aa）
链 E 1–375（375 aa）
链 F 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8P94 Cryo-EM structure of cortactin stabilized Arp2/3-complex nucleated actin branches 提交 2023-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 H 1–375（375 aa）
链 J 1–375（375 aa）
链 K 1–375（375 aa）
链 N 1–375（375 aa）
链 O 1–375（375 aa）
链 P 1–375（375 aa）
链 Q 1–375（375 aa）
链 R 1–375（375 aa）
链 S 1–375（375 aa）
链 W 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50mM KCl, 1mM EGTA, 1mM MgCl2, 0.2 mM ATP and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Back blotting
分辨率 3.30 Å
8PTK Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1 提交 2023-07-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：53-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
9DGR Composite structure of dynein-dynactin on microtubules 提交 2024-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：39-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.00 Å
9DGS Dynactin and dynein tail region of dynein-dynactin complex on microtubules 提交 2024-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9DGT structure of dynactin, dynein tail with one BICDR from dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2024-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：35-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
9DGU structure of dynactin, dynein tail with two BICDR from dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2024-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：37-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
9DGV structure of dynactin, dynein tail with TRAK2 from dynein-dynactin-TRAK2 on microtubules 提交 2024-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：33-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.80 Å
9HHL Structure of Dynein-Dynactin-NuMA-LIS1 提交 2024-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：41-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.53 Å
9I2B SPIN90-Arp2/3 nucleated bidirectional actin filaments 提交 2025-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 I 1–375（375 aa）
链 J 1–375（375 aa）
链 S 1–375（375 aa）
链 T 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YNG Dynactin and dynein-1 tail region of dynein-dynactin complex on microtubule in the presence of LIS1 提交 2025-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric
链 H 1–375（375 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å

共 24 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACTB_PIG
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 B； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 C； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 D； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 E； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 F； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 G； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 H； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 I； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 J； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 K； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375

Spectrin beta chain

物种未注明

UniProt A0A480J001

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric（31） 与蛋白拷贝数一致 链 M； UniProt 1–2148 链 N； UniProt 1–2148 链 O； UniProt 1–2148 链 P； UniProt 1–2148 链 Q； UniProt 1–2148 链 R； UniProt 1–2148 链 S； UniProt 1–2148 链 T； UniProt 1–2148 未记录 Adducin 1 × 3 （A0A8D1Q0D0） Beta-adducin × 2 （A0A480JMR2） Dematin actin binding protein × 3 （A0A8D1E7W3） Actin, cytoplasmic 1 × 11 （Q6QAQ1） Tropomyosin-1.9 × 1 Tropomyosin 3 × 1 （Q6QA25） Tropomodulin-1 × 1 （A0A287BCZ0） SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein × 1 （A0A4X1V2Q0） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8IAI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8IAH Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, State I, Global map 提交 2023-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 M 1–2148（2148 aa）
链 N 1–2148（2148 aa）
链 O 1–2148（2148 aa）
链 P 1–2148（2148 aa）
链 Q 1–2148（2148 aa）
链 R 1–2148（2148 aa）
链 S 1–2148（2148 aa）
链 T 1–2148（2148 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480J001_PIG
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–2148； UniProt 1–2148 作者链 N； PDB构建体 1–2148； UniProt 1–2148 作者链 O； PDB构建体 1–2148； UniProt 1–2148 作者链 P； PDB构建体 1–2148； UniProt 1–2148 作者链 Q； PDB构建体 1–2148； UniProt 1–2148 作者链 R； PDB构建体 1–2148； UniProt 1–2148 作者链 S； PDB构建体 1–2148； UniProt 1–2148 作者链 T； PDB构建体 1–2148； UniProt 1–2148

Tropomyosin 3

物种未注明

UniProt Q6QA25

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric（31） 与蛋白拷贝数一致 链 V； UniProt 1–248 未记录 Adducin 1 × 3 （A0A8D1Q0D0） Beta-adducin × 2 （A0A480JMR2） Dematin actin binding protein × 3 （A0A8D1E7W3） Actin, cytoplasmic 1 × 11 （Q6QAQ1） Spectrin beta chain × 8 （A0A480J001） Tropomyosin-1.9 × 1 Tropomodulin-1 × 1 （A0A287BCZ0） SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein × 1 （A0A4X1V2Q0） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8IAI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8IAH Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, State I, Global map 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 V 1–248（248 aa）
链 W 1–248（248 aa）
链 X 1–248（248 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6QA25_PIG
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 V； PDB构建体 1–248； UniProt 1–248

Tropomodulin-1

物种未注明

UniProt A0A287BCZ0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric（31） 与蛋白拷贝数一致 链 Y； UniProt 1–359 未记录 Adducin 1 × 3 （A0A8D1Q0D0） Beta-adducin × 2 （A0A480JMR2） Dematin actin binding protein × 3 （A0A8D1E7W3） Actin, cytoplasmic 1 × 11 （Q6QAQ1） Spectrin beta chain × 8 （A0A480J001） Tropomyosin-1.9 × 1 Tropomyosin 3 × 1 （Q6QA25） SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein × 1 （A0A4X1V2Q0） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8IAI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8IAH Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, State I, Global map 提交 2023-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 Y 1–359（359 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287BCZ0_PIG
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 Y； PDB构建体 1–359； UniProt 1–359

SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein

物种未注明

UniProt A0A4X1V2Q0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric（31） 与蛋白拷贝数一致 链 Z； UniProt 1–107 未记录 Adducin 1 × 3 （A0A8D1Q0D0） Beta-adducin × 2 （A0A480JMR2） Dematin actin binding protein × 3 （A0A8D1E7W3） Actin, cytoplasmic 1 × 11 （Q6QAQ1） Spectrin beta chain × 8 （A0A480J001） Tropomyosin-1.9 × 1 Tropomyosin 3 × 1 （Q6QA25） Tropomodulin-1 × 1 （A0A287BCZ0） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8IAI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8IAH Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, State I, Global map 提交 2023-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 Z 1–107（107 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A4X1V2Q0_PIG
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 Z； PDB构建体 1–107； UniProt 1–107

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8iai

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8iai
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8iai
沉积日期 deposition_date2023-02-08
结构标题 titleStructure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, State II, Global map
关键词 keywordsMacrocomplex, membrane skeleton, spectrin-actin junction, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier— Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron116.50 Å
零角强度 I(0) i010369100000.00
分子量 molecular_weight859650.0 kDa
排除体积 excluded_volume1074100 ų
包络体积 envelope_volume1807900 ų
水化壳体积 shell_volume156200 ų
包络直径 envelope_diameter426.1 Å
壳层 Rg shell_rg70.71 Å
包络 Rg envelope_rg117.50 Å
形状 Rg shape_rg116.50 Å
总 Rg total_rg115.90 Å
总原子数 total_atoms60300
残基数 n_residues7612
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax310.4 Å
Rg (实空间) rg_real103.30 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.31 Å
I(0) (实空间) i0_real9.9190e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.4010e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal93.33 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal9774000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8782
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary71.6 Å
偏度 Skewness skewness0.460
峰度 Kurtosis kurtosis-0.771
角度范围 angular_range— – 0.0650 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.3741
最高正则化参数 α highest_alpha127900000.0000
实空间数据点数 n_real_points14
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.012; Oscil: 0.827; Stabil: 0.990; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.970; Smooth: 0.030
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 11 domains

CATH v4.4 (11 domains)

结构域编号 domain_id8iaiA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id8iaiB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id8iaiC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id8iaiD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id8iaiE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id8iaiF01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id8iaiG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id8iaiH01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id8iaiI01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id8iaiJ01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
结构域编号 domain_id8iaiK01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)