8q7n

cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Splicing factor 3A subunit 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SF3A1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 7； PDB构建体 1–793； UniProt 1–793

116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component

物种未注明

UniProt Q15029

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	U5S1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–972； UniProt 1–972

Thioredoxin-like protein 4A

物种未注明

UniProt P83876

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TXN4A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

Pre-mRNA-splicing factor 38A

物种未注明

UniProt Q8NAV1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PR38A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–312； UniProt 1–312

Microfibrillar-associated protein 1

物种未注明

UniProt P55081

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MFAP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–439； UniProt 1–439

NHP2-like protein 1, N-terminally processed

物种未注明

UniProt P55769

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NH2L1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128

Protein BUD31 homolog

物种未注明

UniProt P41223

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BUD31_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144

WW domain-binding protein 4

物种未注明

UniProt O75554

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	WBP4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376

Zinc finger matrin-type protein 2

物种未注明

UniProt Q96NC0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ZMAT2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 r； PDB构建体 1–199； UniProt 1–199

Ubiquitin-like protein 5

物种未注明

UniProt Q9BZL1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	UBL5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 s； PDB构建体 1–73； UniProt 1–73

U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31

物种未注明

UniProt Q8WWY3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRP31_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–499； UniProt 1–499

U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4

物种未注明

UniProt O43172

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRP4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–522； UniProt 1–522

Pre-mRNA-processing factor 6

物种未注明

UniProt O94906

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRP6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–941； UniProt 1–941

Pre-mRNA-processing-splicing factor 8

物种未注明

UniProt Q6P2Q9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRP8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–2335； UniProt 1–2335

U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1

物种未注明

UniProt O43290

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SNUT1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–800； UniProt 1–800

Transcription elongation regulator 1

物种未注明

UniProt O14776

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） U4 snRNA × 1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 × 1 （O43395）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TCRG1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–1098； UniProt 1–1098

U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3

物种未注明

UniProt O43395

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 17 RNA 4	U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Splicing factor 3A subunit 1 × 1 （Q15459） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Thioredoxin-like protein 4A × 1 （P83876） Pre-mRNA-splicing factor 38A × 1 （Q8NAV1） Microfibrillar-associated protein 1 × 1 （P55081） NHP2-like protein 1, N-terminally processed × 1 （P55769） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） WW domain-binding protein 4 × 1 （O75554） MINX pre-mRNA × 1 Zinc finger matrin-type protein 2 × 1 （Q96NC0） Ubiquitin-like protein 5 × 1 （Q9BZL1） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 × 1 （Q8WWY3） U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 × 1 （O43172） Pre-mRNA-processing factor 6 × 1 （O94906） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1 × 1 （O43290） Transcription elongation regulator 1 × 1 （O14776） U4 snRNA × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRPF3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	21
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–683； UniProt 1–683

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8q7n
沉积日期 deposition_date	2023-08-16
结构标题 title	cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region)
关键词 keywords	spliceosome, pre-catalytic spliceosome, spliceosomal B complex, SPLICING; SPLICING
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8q7n__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8q7n__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8q7n__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	72.57 Å
Rg（电子密度）	71.47 Å
总 Rg	71.33 Å
原子数	55463
残基数	6865
排除体积	954400 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8q7n__assembly_1__model_1`	21-meric （21）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (21)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	U5 snRNA
分子量 formula_weight	37254.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	5
原子数 atom_count	55463

AUACUCUGGUUUCUCUUCAGAUCGCAUAAAUCUUUCGCCUUUUACUAAAGAUUUCCGUGGAGAGGAACAACUCUGAGUCUUAACCCAAUUUUUUGAGGCCUUGCUUUGGCAAGGCUA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	U6 snRNA
分子量 formula_weight	34098.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	6

GUGCUCGCUUCGGCAGCACAUAUACUAAAAUUGGAACGAUACAGAGAAGAUUAGCAUGGCCCCUGCGCAAGGAUGACACGCAAAUUCGUGAAGCGUUCCAUAUUUU

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Splicing factor 3A subunit 1
分子量 formula_weight	88991.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	7

MPAGPVQAVPPPPPVPTEPKQPTEEEASSKEDSAPSKPVVGIIYPPPEVRNIVDKTASFVARNGPEFEARIRQNEINNPKFNFLNPNDPYHAYYRHKVSEFKEGKAQEPSAAIPKVMQQQQQTTQQQLPQKVQAQVIQETIVPKEPPPEFEFIADPPSISAFDLDVVKLTAQFVARNGRQFLTQLMQKEQRNYQFDFLRPQHSLFNYFTKLVEQYTKILIPPKGLFSKLKKEAENPREVLDQVCYRVEWAKFQERERKKEEEEKEKERVAYAQIDWHDFVVVETVDFQPNEQGNFPPPTTPEELGARILIQERYEKFGESEEVEMEVESDEEDDKQEKAEEPPSQLDQDTQVQDMDEGSDDEEEGQKVPPPPETPMPPPLPPTPDQVIVRKDYDPKASKPLPPAPAPDEYLVSPITGEKIPASKMQEHMRIGLLDPRWLEQRDRSIREKQSDDEVYAPGLDIESSLKQLAERRTDIFGVEETAIGKKIGEEEIQKPEEKVTWDGHSGSMARTQQAAQANITLQEQIEAIHKAKGLVPEDDTKEKIGPSKPNEIPQQPPPPSSATNIPSSAPPITSVPRPPTMPPPVRTTVVSAVPVMPRPPMASVVRLPPGSVIAPMPPIIHAPRINVVPMPPSAPPIMAPRPPPMIVPTAFVPAPPVAPVPAPAPMPPVHPPPPMEDEPTSKKLKTEDSLMPEEEFLRRNKGPVSIKVQVPNMQDKTEWKLNGQVLVFTLPLTDQVSVIKVKIHEATGMPAGKQKLQYEGIFIKDSNSLAYYNMANGAVIHLALKERGGRKK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component
分子量 formula_weight	109560.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGRETKDLDEMDDDDDDDDVGDHDDDHPGMEVVLHEDKKYYPTAEEVYGPEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDENLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGPLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVEPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQGQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELAKQDVVLNYPM

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Thioredoxin-like protein 4A
分子量 formula_weight	16807.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MSYMLPHLHNGWQVDQAILSEEDRVVVIRFGHDWDPTCMKMDEVLYSIAEKVKNFAVIYLVDITEVPDFNKMYELYDPCTVMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWAMEDKQEMVDIIETVYRGARKGRGLVVSPKDYSTKYRY

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Pre-mRNA-splicing factor 38A
分子量 formula_weight	37563.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MANRTVKDAHSIHGTNPQYLVEKIIRTRIYESKYWKEECFGLTAELVVDKAMELRFVGGVYGGNIKPTPFLCLTLKMLQIQPEKDIIVEFIKNEDFKYVRMLGALYMRLTGTAIDCYKYLEPLYNDYRKIKSQNRNGEFELMHVDEFIDELLHSERVCDIILPRLQKRYVLEEAEQLEPRVSALEEDMDDVESSEEEEEEDEKLERVPSPDHRRRSYRDLDKPRRSPTLRYRRSRSRSPRRRSRSPKRRSPSPRRERHRSKSPRRHRSRSRDRRHRSRSKSPGHHRSHRHRSHSKSPERSKKSHKKSRRGNE

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Microfibrillar-associated protein 1
分子量 formula_weight	52050.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MSVPSALMKQPPIQSTAGAVPVRNEKGEISMEKVKVKRYVSGKRPDYAPMESSDEEDEEFQFIKKAKEQEAEPEEQEEDSSSDPRLRRLQNRISEDVEERLARHRKIVEPEVVGESDSEVEGDAWRMEREDSSEEEEEEIDDEEIERRRGMMRQRAQERKNEEMEVMEVEDEGRSGEESESESEYEEYTDSEDEMEPRLKPVFIRKKDRVTVQEREAEALKQKELEQEAKRMAEERRKYTLKIVEEETKKELEENKRSLAALDALNTDDENDEEEYEAWKVRELKRIKRDREDREALEKEKAEIERMRNLTEEERRAELRANGKVITNKAVKGKYKFLQKYYHRGAFFMDEDEEVYKRDFSAPTLEDHFNKTILPKVMQVKNFGRSGRTKYTHLVDQDTTSFDSAWGQESAQNTKFFKQKAAGVRDVFERPSAKKRKTT

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	NHP2-like protein 1, N-terminally processed
分子量 formula_weight	14191.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MTEADVNPKAYPLADAHLTKKLLDLVQQSCNYKQLRKGANEATKTLNRGISEFIVMAADAEPLEIILHLPLLCEDKNVPYVFVRSKQALGRACGVSRPVIACSVTIKEGSQLKQQIQSIQQSIERLLV

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Protein BUD31 homolog
分子量 formula_weight	17032.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MPKVKRSRKAPPDGWELIEPTLDELDQKMREAETEPHEGKRKVESLWPIFRIHHQKTRYIFDLFYKRKAISRELYEYCIKEGYADKNLIAKWKKQGYENLCCLRCIQTRDTNFGTNCICRVPKSKLEVGRIIECTHCGCRGCSG

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	WW domain-binding protein 4
分子量 formula_weight	42575.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MADYWKSQPKKFCDYCKCWIADNRPSVEFHERGKNHKENVAKRISEIKQKSLDKAKEEEKASKEFAAMEAAALKAYQEDLKRLGLESEILEPSITPVTSTIPPTSTSNQQKEKKEKKKRKKDPSKGRWVEGITSEGYHYYYDLISGASQWEKPEGFQGDLKKTAVKTVWVEGLSEDGFTYYYNTETGESRWEKPDDFIPHTSDLPSSKVNENSLGTLDESKSSDSHSDSDGEQEAEEGGVSTETEKPKIKFKEKNKNSDGGSDPETQKEKSIQKQNSLGSNEEKSKTLKKSNPYGEWQEIKQEVESHEEVDLELPSTENEYVSTSEADGGGEPKVVFKEKTVTSLGVMADGVAPVFKKRRTENGKSRNLRQRGDDQ

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	MINX pre-mRNA
分子量 formula_weight	111300.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	Z

GGUACCUAAUACGACUCACUAUAGGGAGACGGAAUUCGAGCUCGCCCACUCUUGGAUCGGAAACCCGUCGGCCUCCGAACGGUAAGAGCCUAGCAUGUAGAACUGGUUACCUGCAGCCCAAGCUUGCUGCACGUCUAGGGCGCAGUAGUCCAGGGUUUCCUUGAUGAUGUCAUACUUAUCCUGUCCCUUUUUUUUCCACAGCUCGCGGUUGAGGACAAACUCUUCGCGGUCUUUCCAGUGGGGAUCCAAUAUCCGUACACCAUCAGGGUACGAGCUAGCCCAUGGCGUACACCAUCAGGGUACGACUAGUAGAUCUCGUACACCAUCAGGGUACGGAAUUCUCUAGA

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Zinc finger matrin-type protein 2
分子量 formula_weight	23664.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	r

MASGSGTKNLDFRRKWDKDEYEKLAEKRLTEEREKKDGKPVQPVKRELLRHRDYKVDLESKLGKTIVITKTTPQSEMGGYYCNVCDCVVKDSINFLDHINGKKHQRNLGMSMRVERSTLDQVKKRFEVNKKKMEEKQKDYDFEERMKELREEEEKAKAYKKEKQKEKKRRAEEDLTFEEDDEMAAVMGFSGFGSTKKSY

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Ubiquitin-like protein 5
分子量 formula_weight	8560.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	s

MIEVVCNDRLGKKVRVKCNTDDTIGDLKKLIAAQTGTRWNKIVLKKWYTIFKDHVSLGDYEIHDGMNLELYYQ

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31
分子量 formula_weight	55529.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MSLADELLADLEEAAEEEEGGSYGEEEEEPAIEDVQEETQLDLSGDSVKTIAKLWDSKMFAEIMMKIEEYISKQAKASEVMGPVEAAPEYRVIVDANNLTVEIENELNIIHKFIRDKYSKRFPELESLVPNALDYIRTVKELGNSLDKCKNNENLQQILTNATIMVVSVTASTTQGQQLSEEELERLEEACDMALELNASKHRIYEYVESRMSFIAPNLSIIIGASTAAKIMGVAGGLTNLSKMPACNIMLLGAQRKTLSGFSSTSVLPHTGYIYHSDIVQSLPPDLRRKAARLVAAKCTLAARVDSFHESTEGKVGYELKDEIERKFDKWQEPPPVKQVKPLPAPLDGQRKKRGGRRYRKMKERLGLTEIRKQANRMSFGEIEEDAYQEDLGFSLGHLGKSGSGRVRQTQVNEATKARISKTLQRTLQKQSVVYGGKSTIRDRSSGTASSVAFTPLQGLEIVNPQAAEKKVAEANQKYFSSMAEFLKVKGEKSGLMST

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4
分子量 formula_weight	58536.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MASSRASSTQATKTKAPDDLVAPVVKKPHIYYGSLEEKERERLAKGESGILGKDGLKAGIEAGNINITSGEVFEIEEHISERQAEVLAEFERRKRARQINVSTDDSEVKACLRALGEPITLFGEGPAERRERLRNILSVVGTDALKKTKKDDEKSKKSKEEYQQTWYHEGPNSLKVARLWIANYSLPRAMKRLEEARLHKEIPETTRTSQMQELHKSLRSLNNFCSQIGDDRPISYCHFSPNSKMLATACWSGLCKLWSVPDCNLLHTLRGHNTNVGAIVFHPKSTVSLDPKDVNLASCAADGSVKLWSLDSDEPVADIEGHTVRVARVMWHPSGRFLGTTCYDRSWRLWDLEAQEEILHQEGHSMGVYDIAFHQDGSLAGTGGLDAFGRVWDLRTGRCIMFLEGHLKEIYGINFSPNGYHIATGSGDNTCKVWDLRQRRCVYTIPAHQNLVTGVKFEPIHGNFLLTGAYDNTAKIWTHPGWSPLKTLAGHEGKVMGLDISSDGQLIATCSYDRTFKLWMAE

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Pre-mRNA-processing factor 6
分子量 formula_weight	107092.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MNKKKKPFLGMPAPLGYVPGLGRGATGFTTRSDIGPARDANDPVDDRHAPPGKRTVGDQMKKNQAADDDDEDLNDTNYDEFNGYAGSLFSSGPYEKDDEEADAIYAALDKRMDERRKERREQREKEEIEKYRMERPKIQQQFSDLKRKLAEVTEEEWLSIPEVGDARNKRQRNPRYEKLTPVPDSFFAKHLQTGENHTSVDPRQTQFGGLNTPYPGGLNTPYPGGMTPGLMTPGTGELDMRKIGQARNTLMDMRLSQVSDSVSGQTVVDPKGYLTDLNSMIPTHGGDINDIKKARLLLKSVRETNPHHPPAWIASARLEEVTGKLQVARNLIMKGTEMCPKSEDVWLEAARLQPGDTAKAVVAQAVRHLPQSVRIYIRAAELETDIRAKKRVLRKALEHVPNSVRLWKAAVELEEPEDARIMLSRAVECCPTSVELWLALARLETYENARKVLNKARENIPTDRHIWITAAKLEEANGNTQMVEKIIDRAITSLRANGVEINREQWIQDAEECDRAGSVATCQAVMRAVIGIGIEEEDRKHTWMEDADSCVAHNALECARAIYAYALQVFPSKKSVWLRAAYFEKNHGTRESLEALLQRAVAHCPKAEVLWLMGAKSKWLAGDVPAARSILALAFQANPNSEEIWLAAVKLESENDEYERARRLLAKARSSAPTARVFMKSVKLEWVQDNIRAAQDLCEEALRHYEDFPKLWMMKGQIEEQKEMMEKAREAYNQGLKKCPHSTPLWLLLSRLEEKIGQLTRARAILEKSRLKNPKNPGLWLESVRLEYRAGLKNIANTLMAKALQECPNSGILWSEAIFLEARPQRRTKSVDALKKCEHDPHVLLAVAKLFWSQRKITKAREWFHRTVKIDSDLGDAWAFFYKFELQHGTEEQQEEVRKRCESAEPRHGELWCAVSKDIANWQKKIGDILRLVAGRIKNTF

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Pre-mRNA-processing-splicing factor 8
分子量 formula_weight	273974.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MAGVFPYRGPGNPVPGPLAPLPDYMSEEKLQEKARKWQQLQAKRYAEKRKFGFVDAQKEDMPPEHVRKIIRDHGDMTNRKFRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVPVLYHITGAISFVNEIPWVIEPVYISQWGSMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLEAIQLELDPEEDAPVLDWFYDHQPLRDSRKYVNGSTYQRWQFTLPMMSTLYRLANQLLTDLVDDNYFYLFDLKAFFTSKALNMAIPGGPKFEPLVRDINLQDEDWNEFNDINKIIIRQPIRTEYKIAFPYLYNNLPHHVHLTWYHTPNVVFIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRHSVKSQEPLPDDDEEFELPEFVEPFLKDTPLYTDNTANGIALLWAPRPFNLRSGRTRRALDIPLVKNWYREHCPAGQPVKVRVSYQKLLKYYVLNALKHRPPKAQKKRYLFRSFKATKFFQSTKLDWVEVGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREVLRLTKLVVDSHVQYRLGNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAAGWRVWLFFMRGITPLLERWLGNLLARQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRAAVMHDILDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPTPIENMILRYVKAKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPYITAEEAVAVYTTTVHWLESRRFSPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLVPVYDVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPADTEPPPLLVYKWCQGINNLQDVWETSEGECNVMLESRFEKMYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFASFIVQYYGLVMDLLVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDIATEAAHPIRLFCRYIDRIHIFFRFTADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTVQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKCRTSYEEFTHKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHEEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTDFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKWKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFASYKWNVSRPSLLADSKDVMDSTTTQKYWIDIQLRWGDYDSHDIERYARAKFLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGSKPLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKGLQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRALHVNNDRAKVILKPDKTTITEPHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIRDIILGMEISAPSQQRQQIAEIEKQTKEQSQLTATQTRTVNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISAANLHLRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNVLKKFICISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMVPQWGTHQTVHLPGQLPQHEYLKEMEPLGWIHTQPNESPQLSPQDVTTHAKIMADNPSWDGEKTIIITCSFTPGSCTLTAYKLTPSGYEWGRQNTDKGNNPKGYLPSHYERVQMLLSDRFLGFFMVPAQSSWNYNFMGVRHDPNMKYELQLANPKEFYHEVHRPSHFLNFALLQEGEVYSADREDLYA

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1
分子量 formula_weight	90414.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MGSSKKHRGEKEAAGTTAAAGTGGATEQPPRHREHKKHKHRSGGSGGSGGERRKRSRERGGERGSGRRGAEAEARSSTHGRERSQAEPSERRVKREKRDDGYEAAASSKTSSGDASSLSIEETNKLRAKLGLKPLEVNAIKKEAGTKEEPVTADVINPMALRQREELREKLAAAKEKRLLNQKLGKIKTLGEDDPWLDDTAAWIERSRQLQKEKDLAEKRAKLLEEMDQEFGVSTLVEEEFGQRRQDLYSARDLQGLTVEHAIDSFREGETMILTLKDKGVLQEEEDVLVNVNLVDKERAEKNVELRKKKPDYLPYAEDESVDDLAQQKPRSILSKYDEELEGERPHSFRLEQGGTADGLRERELEEIRAKLRLQAQSLSTVGPRLASEYLTPEEMVTFKKTKRRVKKIRKKEKEVVVRADDLLPLGDQTQDGDFGSRLRGRGRRRVSEVEEEKEPVPQPLPSDDTRVENMDISDEEEGGAPPPGSPQVLEEDEAELELQKQLEKGRRLRQLQQLQQLRDSGEKVVEIVKKLESRQRGWEEDEDPERKGAIVFNATSEFCRTLGEIPTYGLAGNREEQEELMDFERDEERSANGGSESDGEENIGWSTVNLDEEKQQQDFSASSTTILDEEPIVNRGLAAALLLCQNKGLLETTVQKVARVKAPNKSLPSAVYCIEDKMAIDDKYSRREEYRGFTQDFKEKDGYKPDVKIEYVDETGRKLTPKEAFRQLSHRFHGKGSGKMKTERRMKKLDEEALLKKMSSSDTPLGTVALLQEKQKAQKTPYIVLSGSGKSMNANTITK

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	Transcription elongation regulator 1
分子量 formula_weight	124083.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MAERGGDGGESERFNPGELRMAQQQALRFRGPAPPPNAVMRGPPPLMRPPPPFGMMRGPPPPPRPPFGRPPFDPNMPPMPPPGGIPPPMGPPHLQRPPFMPPPMSSMPPPPGMMFPPGMPPVTAPGTPALPPTEEIWVENKTPDGKVYYYNARTRESAWTKPDGVKVIQQSELTPMLAAQAQVQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQVQAQVQAQVQAQAVGASTPTTSSPAPAVSTSTSSSTPSSTTSTTTTATSVAQTVSTPTTQDQTPSSAVSVATPTVSVSTPAPTATPVQTVPQPHPQTLPPAVPHSVPQPTTAIPAFPPVMVPPFRVPLPGMPIPLPGVAMMQIVSCPYVKTVATTKTGVLPGMAPPIVPMIHPQVAIAASPATLAGATAVSEWTEYKTADGKTYYYNNRTLESTWEKPQELKEKEKLEEKIKEPIKEPSEEPLPMETEEEDPKEEPIKEIKEEPKEEEMTEEEKAAQKAKPVATAPIPGTPWCVVWTGDERVFFYNPTTRLSMWDRPDDLIGRADVDKIIQEPPHKKGMEELKKLRHPTPTMLSIQKWQFSMSAIKEEQELMEEINEDEPVKAKKRKRDDNKDIDSEKEAAMEAEIKAARERAIVPLEARMKQFKDMLLERGVSAFSTWEKELHKIVFDPRYLLLNPKERKQVFDQYVKTRAEEERREKKNKIMQAKEDFKKMMEEAKFNPRATFSEFAAKHAKDSRFKAIEKMKDREALFNEFVAAARKKEKEDSKTRGEKIKSDFFELLSNHHLDSQSRWSKVKDKVESDPRYKAVDSSSMREDLFKQYIEKIAKNLDSEKEKELERQARIEASLREREREVQKARSEQTKEIDREREQHKREEAIQNFKALLSDMVRSSDVSWSDTRRTLRKDHRWESGSLLEREEKEKLFNEHIEALTKKKREHFRQLLDETSAITLTSTWKEVKKIIKEDPRCIKFSSSDRKKQREFEEYIRDKYITAKADFRTLLKETKFITYRSKKLIQESDQHLKDVEKILQNDKRYLVLDCVPEERRKLIVAYVDDLDRRGPPPPPTASEPTRRSTK

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	U4 snRNA
分子量 formula_weight	46528.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	4

AGCUUUGCGCAGUGGCAGUAUCGUAGCCAAUGAGGUUUAUCCGAGGCGCGAUUAUUGCUAAUUGAAAACUUUUCCCAAUACCCCGCCGUGACGACUUGCAAUAUAGUCGGCAUUGGCAAUUUUUGACAGUCUCUACGGAGACUGG

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3
分子量 formula_weight	77669.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MALSKRELDELKPWIEKTVKRVLGFSEPTVVTAALNCVGKGMDKKKAADHLKPFLDDSTLRFVDKLFEAVEEGRSSRHSKSSSDRSRKRELKEVFGDDSEISKESSGVKKRRIPRFEEVEEEPEVIPGPPSESPGMLTKLQIKQMMEAATRQIEERKKQLSFISPPTPQPKTPSSSQPERLPIGNTIQPSQAATFMNDAIEKARKAAELQARIQAQLALKPGLIGNANMVGLANLHAMGIAPPKVELKDQTKPTPLILDEQGRTVDATGKEIELTHRMPTLKANIRAVKREQFKQQLKEKPSEDMESNTFFDPRVSIAPSQRQRRTFKFHDKGKFEKIAQRLRTKAQLEKLQAEISQAARKTGIHTSTRLALIAPKKELKEGDIPEIEWWDSYIIPNGFDLTEENPKREDYFGITNLVEHPAQLNPPVDNDTPVTLGVYLTKKEQKKLRRQTRREAQKELQEKVRLGLMPPPEPKVRISNLMRVLGTEAVQDPTKVEAHVRAQMAKRQKAHEEANAARKLTAEQRKVKKIKKLKEDISQGVHISVYRVRNLSNPAKKFKIEANAGQLYLTGVVVLHKDVNVVVVEGGPKAQKKFKRLMLHRIKWDEQTSNTKGDDDEESDEEAVKKTNKCVLVWEGTAKDRSFGEMKFKQCPTENMAREHFKKHGAEHYWDLALSESVLESTD

▶

分辨率 resolution	3.10 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	251564

cryo-EM structure of the human spliceosomal B complex protomer (tri-snRNP core region)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Splicing factor 3A subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Thioredoxin-like protein 4A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Pre-mRNA-splicing factor 38A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Microfibrillar-associated protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NHP2-like protein 1, N-terminally processed

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein BUD31 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

WW domain-binding protein 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Zinc finger matrin-type protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ubiquitin-like protein 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体