DNA-directed RNA polymerase subunit beta
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 异源复合物 蛋白 × 24 DNA 2 RNA 1 PDB 声明:27-meric(27) 与全部聚合物数一致 | 链 B; UniProt 1–1300 | 未记录 | DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 (A0A481DF93) RPOL4c domain-containing protein × 1 (A0A8D1GCS3) DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 (A0A4X1VTX4) DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 (A0A4X1VEK9) DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 (A0A4X1VKG7) DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 (A0A8D1AQR7) DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 (P60899) DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 (A0A8W4F9W9) RNA polymerase II subunit J × 1 (A0A8D0TE17) RNA polymerase II subunit K × 1 (A0A4X1TRS6) Transcription elongation factor SPT6 × 1 DNA (194-MER) × 1 Transcription elongation factor 1 homolog × 1 (P60002) ;RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*GP*GP*UP*GP*UP*GP*UP*CP*UP*GP*GP*GP*UP*GP*GP*UP*G)-3') ; × 1 RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog × 1 (Q6PD62) RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog × 1 Transcription elongation factor A protein 1 × 1 (P23193) DNA (194-MER) × 1 RNA polymerase-associated protein LEO1 × 1 (Q8WVC0) RNA polymerase II-associated factor 1 homolog × 1 (Q8N7H5) WDR61 × 1 (Q9GZS3) Parafibromin × 1 (Q6P1J9) Transcription elongation factor SPT4 × 1 (P63272) Transcription elongation factor SPT5 × 1 (O00267) Protein IWS1 homolog × 1 (Q96ST2) ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 2.40 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9MLC | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6EXV Structure of mammalian RNA polymerase II elongation complex inhibited by Alpha-amanitin 提交 2017-11-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:hexadecameric |
链 B
85–1251(1167 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6GMH Structure of activated transcription complex Pol II-DSIF-PAF-SPT6 提交 2018-05-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:heptadecameric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;10s wait prior to blotting, blotting 8.5s
|
分辨率 3.10 Å |
| 6GML Structure of paused transcription complex Pol II-DSIF-NELF 提交 2018-05-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:21-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6TED Structure of complete, activated transcription complex Pol II-DSIF-PAF-SPT6 uncovers allosteric elongation activation by RTF1 提交 2019-11-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:24-meric |
链 B
1–1251(1251 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;2 microliters applied to both sides of grid. Sample incubated on grid for 10s prior to blotting. Blotting for 8.5s.
|
分辨率 3.10 Å |
| 7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:58-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:32-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.30 Å |
| 7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:32-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.20 Å |
| 7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:32-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.60 Å |
| 7OKX Structure of active transcription elongation complex Pol II-DSIF (SPT5-KOW5)-ELL2-EAF1 (composite structure) 提交 2021-05-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric |
链 B
1–1251(1251 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7OKY Structure of active transcription elongation complex Pol II-DSIF-ELL2-EAF1(composite structure) 提交 2021-05-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:nonadecameric |
链 B
1–1251(1251 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.14 Å |
| 7OL0 Structure of active transcription elongation complex Pol II-DSIF (SPT5-KOW5) 提交 2021-05-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:hexadecameric |
链 B
1–1251(1251 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7OO3 Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA (Structure1) 提交 2021-05-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7OOB Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA-ADPBeF3 (Structure2) 提交 2021-05-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7OOP Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA-PAF-SPT6 (Structure 3) 提交 2021-05-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:26-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7OPC Pol II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (Structure 4) 提交 2021-05-31 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 25 PDB 声明:28-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7OPD Pol II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (Structure 5) 提交 2021-05-31 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 25 PDB 声明:28-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:24-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:24-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:24-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8A3Y Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex 提交 2022-06-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:30-meric |
链 B
50–1300(1251 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8A40 Structure of mammalian Pol II-TFIIS elongation complex 提交 2022-06-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:hexadecameric |
链 B
1–1251(1251 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 40 PDB 声明:42-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 38 PDB 声明:40-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:28-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8OEU Structure of the mammalian Pol II-SPT6 complex (composite structure, Structure 4) 提交 2023-03-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:hexadecameric |
链 B
1–1251(1251 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:nonadecameric |
链 B
1–1251(1251 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric |
链 B
1–1251(1251 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:nonadecameric |
链 B
1–1251(1251 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |
| 8P4A Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 1 提交 2023-05-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:hexadecameric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8P4B Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 2 提交 2023-05-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:hexadecameric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8P4C Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 3 提交 2023-05-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8P4D Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 4 提交 2023-05-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8P4E Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 5 提交 2023-05-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8P4F Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 6 提交 2023-05-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 43 PDB 声明:46-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:23-meric |
链 B
1–1300(1300 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:23-meric |
链 B
1–1300(1300 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:18-meric |
链 B
1–1300(1300 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:19-meric |
链 B
1–1300(1300 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:23-meric |
链 B
1–1300(1300 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9ER2 PolII-TCR-STK19 structure. 提交 2024-03-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:22-meric |
链 B
1–1167(1167 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9FD2 Structure of Pol II-TC-NER-STK19 complex 提交 2024-05-16 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:22-meric |
链 B
1–1300(1300 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9RTT Activated Elongation Complex with IWS1 and ELOF1 提交 2025-07-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:25-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.01 Å |
| 9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 31 PDB 声明:34-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.53 Å |
| 9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 32 PDB 声明:35-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.72 Å |
| 9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 31 PDB 声明:34-meric |
链 B
78–1251(1174 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.40 Å |
| 9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 35 PDB 声明:38-meric |
链 2
1–126(126 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
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| UniProt名称 | I3LGP4_PIG |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B; PDB构建体 1–1300; UniProt 1–1300 |