SAXSdb — 9yop

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin-7,General control transcription factor GCN4,Enhanced Green fluorescent protein

Aequorea victoria

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform × 2 （P05977） Myosin regulatory light chain 11 × 2 （P97457） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PHOSPHATE ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GCN4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1017–1048； UniProt 250–281 作者链 B； PDB构建体 1017–1048； UniProt 250–281

Myosin-7,General control transcription factor GCN4,Enhanced Green fluorescent protein

Aequorea victoria

UniProt P12883

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform × 2 （P05977） Myosin regulatory light chain 11 × 2 （P97457） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PHOSPHATE ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYH7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1016； UniProt 1–1016 作者链 B； PDB构建体 1–1016； UniProt 1–1016

Myosin-7,General control transcription factor GCN4,Enhanced Green fluorescent protein

Aequorea victoria

UniProt P42212

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform × 2 （P05977） Myosin regulatory light chain 11 × 2 （P97457） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PHOSPHATE ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GFP_AEQVI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1055–1292； UniProt 1–238 作者链 B； PDB构建体 1055–1292； UniProt 1–238

Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform

物种未注明

UniProt P05977

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Myosin-7,General control transcription factor GCN4,Enhanced Green fluorescent protein × 2 （P03069,P12883,P42212） Myosin regulatory light chain 11 × 2 （P97457） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PHOSPHATE ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYL1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188 作者链 D； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188

Myosin regulatory light chain 11

物种未注明

UniProt P97457

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Myosin-7,General control transcription factor GCN4,Enhanced Green fluorescent protein × 2 （P03069,P12883,P42212） Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform × 2 （P05977） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PHOSPHATE ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYL11_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–169； UniProt 1–169 作者链 F； PDB构建体 1–169； UniProt 1–169

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9yop
沉积日期 deposition_date	2025-10-13
结构标题 title	Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin in the interacting-heads motif and S2-FH docked state
关键词 keywords	Cardiac Myosin, Interacting Heads Motif, Contractile Protein, Actin Binding; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9yop__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9yop__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9yop__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	53.53 Å
Rg（电子密度）	53.65 Å
总 Rg	53.74 Å
原子数	19465
残基数	2411
排除体积	347390 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9yop__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Myosin-7,General control transcription factor GCN4,Enhanced Green fluorescent protein
分子量 formula_weight	150656.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	19465

MGDSEMAVFGAAAPYLRKSEKERLEAQTRPFDLKKDVFVPDDKQEFVKAKIVSREGGKVTAETEYGKTVTVKEDQVMQQNPPKFDKIEDMAMLTFLHEPAVLYNLKDRYGSWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYTPEVVAAYRGKKRSEAPPHIFSISDNAYQYMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFAVIAAIGDRSKKDQSPGKGTLEDQIIQANPALEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLASADIETYLLEKSRVIFQLKAERDYHIFYQILSNKKPELLDMLLITNNPYDYAFISQGETTVASIDDAEELMATDNAFDVLGFTSEEKNSMYKLTGAIMHFGNMKFKLKQREEQAEPDGTEEADKSAYLMGLNSADLLKGLCHPRVKVGNEYVTKGQNVQQVIYATGALAKAVYERMFNWMVTRINATLETKQPRQYFIGVLDIAGFEIFDFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDLQACIDLIEKPMGIMSILEEECMFPKATDMTFKAKLFDNHLGKSANFQKPRNIKGKPEAHFSLIHYAGIVDYNIIGWLQKNKDPLNETVVGLYQKSSLKLLSTLFANYAGADAPIEKGKGKAKKGSSFQTVSALHRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCIIPNETKSPGVMDNPLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFPNRILYGDFRQRYRILNPAAIPEGQFIDSRKGAEKLLSSLDIDHNQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRDERLSRIITRIQAQSRGVLARMEYKKLLERRDSLLVIQWNIRAFMGVKNWPWMKLYFKIKPLLKSAEREKEMASMKEEFTRLKEALEKSEARRKELEEKMVSLLQEKNDLQLQVQAEQDNLADAEERCDQLIKNKIQLEAKVKEMNERLEDEEEMNAELTAKKRKLEDECSELKRDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEMAGLDEIIAKLTKEKKALQEAHQQALDDLQAEEDKMKQLEDKVEELLSKNYHLENEVARLKKLVGERGSGKLGVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLTYGVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIKVNFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLGMDELYKGLNDIFEAQKIEWHEDYKDDDDK

来源 Source

来源生物 organism	Aequorea victoria
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6100
宿主生物 host_organism	Mus musculus

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform
分子量 formula_weight	20620.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MAPKKDVKKPAAAPAPAPAPAPAPAKPKEEKIDLSAIKIEFSKEQQEDFKEAFLLFDRTGECKITLSQVGDVLRALGTNPTNAEVKKVLGNPSNEEMNAKKIEFEQFLPMMQAISNNKDQGGYEDFVEGLRVFDKEGNGTVMGAELRHVLATLGEKMKEEEVEALLAGQEDSNGCINYEAFVKHIMSV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Myosin regulatory light chain 11
分子量 formula_weight	18978.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

MAPKKAKRRAGAEGSSNVFSMFDQTQIQEFKEAFTVIDQNRDGIIDKEDLRDTFAAMGRLNVKNEELDAMMKEASGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEDVITGAFKVLDPEGKGTIKKQFLEELLTTQCDRFSQEEIKNMWAAFPPDVGGNVDYKNICYVITHGDAKDQE

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	42643

Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin in the interacting-heads motif and S2-FH docked state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin-7,General control transcription factor GCN4,Enhanced Green fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin-7,General control transcription factor GCN4,Enhanced Green fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin-7,General control transcription factor GCN4,Enhanced Green fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin regulatory light chain 11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9yop__assembly_1__model_1

9yop__assembly_1__model_1 | I(q)

9yop__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of human beta-cardiac myosin in the interacting-heads motif and S2-FH docked state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin-7,General control transcription factor GCN4,Enhanced Green fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin-7,General control transcription factor GCN4,Enhanced Green fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin-7,General control transcription factor GCN4,Enhanced Green fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin regulatory light chain 11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9yop__assembly_1__model_1

9yop__assembly_1__model_1 | I(q)

9yop__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)