5are

Bovine mitochondrial ATP synthase state 1b

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 209.8 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P19483

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 44–553 链 B; UniProt 44–553 链 C; UniProt 44–553 片段:UNP RESIDUES 44-553 ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00829) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05631) ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05630) ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL × 1 (P05632) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT C1, MITOCHONDRIAL × 8 (P32876) ATP SYNTHASE SUBUNIT O, MITOCHONDRIAL × 1 (P13621) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT B1, MITOCHONDRIAL × 1 (P13619) ATP SYNTHASE SUBUNIT D, MITOCHONDRIAL × 1 (P13620) ATP SYNTHASE-COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 (P02721) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 1 (P00847) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING, 分辨率 6.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 58 个其他 PDB 条目、62 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPA_BOVIN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–510; UniProt 44–553 作者链 B; PDB构建体 1–510; UniProt 44–553 作者链 C; PDB构建体 1–510; UniProt 44–553

ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P00829

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 47–528 链 E; UniProt 47–528 链 F; UniProt 47–528 片段:UNP RESIDUES 47-528 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P19483) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05631) ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05630) ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL × 1 (P05632) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT C1, MITOCHONDRIAL × 8 (P32876) ATP SYNTHASE SUBUNIT O, MITOCHONDRIAL × 1 (P13621) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT B1, MITOCHONDRIAL × 1 (P13619) ATP SYNTHASE SUBUNIT D, MITOCHONDRIAL × 1 (P13620) ATP SYNTHASE-COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 (P02721) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 1 (P00847) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING, 分辨率 6.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 55 个其他 PDB 条目、59 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPB_BOVIN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–482; UniProt 47–528 作者链 E; PDB构建体 1–482; UniProt 47–528 作者链 F; PDB构建体 1–482; UniProt 47–528

ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P05631

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 26–298 片段:UNP RESIDUES 26-298 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P19483) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00829) ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05630) ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL × 1 (P05632) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT C1, MITOCHONDRIAL × 8 (P32876) ATP SYNTHASE SUBUNIT O, MITOCHONDRIAL × 1 (P13621) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT B1, MITOCHONDRIAL × 1 (P13619) ATP SYNTHASE SUBUNIT D, MITOCHONDRIAL × 1 (P13620) ATP SYNTHASE-COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 (P02721) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 1 (P00847) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING, 分辨率 6.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 58 个其他 PDB 条目、62 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPG_BOVIN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–273; UniProt 26–298

ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P05630

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 23–168 片段:UNP RESIDUES 23-168 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P19483) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00829) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05631) ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL × 1 (P05632) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT C1, MITOCHONDRIAL × 8 (P32876) ATP SYNTHASE SUBUNIT O, MITOCHONDRIAL × 1 (P13621) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT B1, MITOCHONDRIAL × 1 (P13619) ATP SYNTHASE SUBUNIT D, MITOCHONDRIAL × 1 (P13620) ATP SYNTHASE-COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 (P02721) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 1 (P00847) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING, 分辨率 6.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 38 个其他 PDB 条目、39 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPD_BOVIN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–146; UniProt 23–168

ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P05632

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 2–51 片段:UNP RESIDUES 2-51 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P19483) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00829) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05631) ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05630) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT C1, MITOCHONDRIAL × 8 (P32876) ATP SYNTHASE SUBUNIT O, MITOCHONDRIAL × 1 (P13621) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT B1, MITOCHONDRIAL × 1 (P13619) ATP SYNTHASE SUBUNIT D, MITOCHONDRIAL × 1 (P13620) ATP SYNTHASE-COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 (P02721) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 1 (P00847) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING, 分辨率 6.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 38 个其他 PDB 条目、39 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP5E_BOVIN
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–50; UniProt 2–51

ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT C1, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P32876

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 63–134 链 K; UniProt 63–134 链 L; UniProt 63–134 链 M; UniProt 63–134 链 N; UniProt 63–134 链 O; UniProt 63–134 链 P; UniProt 63–134 链 Q; UniProt 63–134 片段:UNP RESIDUES 63-134 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P19483) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00829) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05631) ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05630) ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL × 1 (P05632) ATP SYNTHASE SUBUNIT O, MITOCHONDRIAL × 1 (P13621) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT B1, MITOCHONDRIAL × 1 (P13619) ATP SYNTHASE SUBUNIT D, MITOCHONDRIAL × 1 (P13620) ATP SYNTHASE-COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 (P02721) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 1 (P00847) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING, 分辨率 6.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AT5G1_BOVIN
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–72; UniProt 63–134 作者链 K; PDB构建体 1–72; UniProt 63–134 作者链 L; PDB构建体 1–72; UniProt 63–134 作者链 M; PDB构建体 1–72; UniProt 63–134 作者链 N; PDB构建体 1–72; UniProt 63–134 作者链 O; PDB构建体 1–72; UniProt 63–134 作者链 P; PDB构建体 1–72; UniProt 63–134 作者链 Q; PDB构建体 1–72; UniProt 63–134

ATP SYNTHASE SUBUNIT O, MITOCHONDRIAL

BOS TAURUS

UniProt P13621

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 S; UniProt 24–213 片段:UNP RESIDUES 24-213 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P19483) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00829) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05631) ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05630) ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL × 1 (P05632) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT C1, MITOCHONDRIAL × 8 (P32876) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT B1, MITOCHONDRIAL × 1 (P13619) ATP SYNTHASE SUBUNIT D, MITOCHONDRIAL × 1 (P13620) ATP SYNTHASE-COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 (P02721) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 1 (P00847) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING, 分辨率 6.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 30 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPO_BOVIN
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 S; PDB构建体 1–190; UniProt 24–213

ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT B1, MITOCHONDRIAL

BOS TAURUS

UniProt P13619

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 T; UniProt 76–249 片段:UNP RESIDUES 76-249 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P19483) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00829) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05631) ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05630) ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL × 1 (P05632) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT C1, MITOCHONDRIAL × 8 (P32876) ATP SYNTHASE SUBUNIT O, MITOCHONDRIAL × 1 (P13621) ATP SYNTHASE SUBUNIT D, MITOCHONDRIAL × 1 (P13620) ATP SYNTHASE-COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 (P02721) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 1 (P00847) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING, 分辨率 6.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 31 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AT5F1_BOVIN
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 T; PDB构建体 1–174; UniProt 76–249

ATP SYNTHASE SUBUNIT D, MITOCHONDRIAL

BOS TAURUS

UniProt P13620

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 U; UniProt 2–125 片段:UNP RESIDUES 2-125 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P19483) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00829) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05631) ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05630) ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL × 1 (P05632) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT C1, MITOCHONDRIAL × 8 (P32876) ATP SYNTHASE SUBUNIT O, MITOCHONDRIAL × 1 (P13621) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT B1, MITOCHONDRIAL × 1 (P13619) ATP SYNTHASE-COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 (P02721) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 1 (P00847) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING, 分辨率 6.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 29 个其他 PDB 条目、30 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP5H_BOVIN
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–124; UniProt 2–125

ATP SYNTHASE-COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL

BOS TAURUS

UniProt P02721

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 V; UniProt 32–108 片段:UNP RESIDUES 32-108 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P19483) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00829) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05631) ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05630) ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL × 1 (P05632) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT C1, MITOCHONDRIAL × 8 (P32876) ATP SYNTHASE SUBUNIT O, MITOCHONDRIAL × 1 (P13621) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT B1, MITOCHONDRIAL × 1 (P13619) ATP SYNTHASE SUBUNIT D, MITOCHONDRIAL × 1 (P13620) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 1 (P00847) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING, 分辨率 6.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 30 个其他 PDB 条目、32 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP5J_BOVIN
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 V; PDB构建体 1–77; UniProt 32–108

ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL

物种未注明

UniProt P00847

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 W; UniProt 10–226 片段:UNP RESIDUES 10-226 ATP SYNTHASE SUBUNIT ALPHA, MITOCHONDRIAL × 3 (P19483) ATP SYNTHASE SUBUNIT BETA, MITOCHONDRIAL × 3 (P00829) ATP SYNTHASE SUBUNIT GAMMA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05631) ATP SYNTHASE SUBUNIT DELTA, MITOCHONDRIAL × 1 (P05630) ATP SYNTHASE SUBUNIT EPSILON, MITOCHONDRIAL × 1 (P05632) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT C1, MITOCHONDRIAL × 8 (P32876) ATP SYNTHASE SUBUNIT O, MITOCHONDRIAL × 1 (P13621) ATP SYNTHASE F(0) COMPLEX SUBUNIT B1, MITOCHONDRIAL × 1 (P13619) ATP SYNTHASE SUBUNIT D, MITOCHONDRIAL × 1 (P13620) ATP SYNTHASE-COUPLING FACTOR 6, MITOCHONDRIAL × 1 (P02721) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3;pH 7.2;20 MM TRIS-HCL, 100 MM NACL, 10% (V/V) DODECYLMALTOSIDE, 2 MM ATP, 0.02% (WT/V) NAN3 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 100, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 27 SECONDS BEFORE PLUNGING, 分辨率 6.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP6_BOVIN
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 W; PDB构建体 1–217; UniProt 10–226

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5are

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5are
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5are
沉积日期 deposition_date2015-09-24
结构标题 titleBovine mitochondrial ATP synthase state 1b
关键词 keywordsHYDROLASE, ATP SYNTHASE, ROTARY ATPASE; HYDROLASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier61.20
回转半径 Rg (电子) rg_electron61.92
零角强度 I(0) i02525470000.00
分子量 molecular_weight260090.0 kDa
排除体积 excluded_volume256380 ų
包络体积 envelope_volume718980 ų
水化壳体积 shell_volume104100 ų
包络直径 envelope_diameter219.6
壳层 Rg shell_rg58.34
包络 Rg envelope_rg59.17
形状 Rg shape_rg61.89
总 Rg total_rg61.88
总原子数 total_atoms18545
残基数 n_residues4641
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax209.8
Rg (实空间) rg_real61.76
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.40
I(0) (实空间) i0_real2.5250e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.0720e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal60.70
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2521000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8057
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary64.6
偏度 Skewness skewness0.565
峰度 Kurtosis kurtosis-0.288
角度范围 angular_range— – 0.1300 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha246800000.0000
实空间数据点数 n_real_points27
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.687; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.414

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)