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6qdv

Human post-catalytic P complex spliceosome

Method: ELECTRON MICROSCOPY
▼

1. Protein Identity and Related Structures Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed

OrganismNot specified

UniProt P38919

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer
2hxy 2hxy 2hxy 2hxy 2j0u

5 assemblies

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
2hyi 2hyi 2j0q 2j0q 2j0s 2j0u 2xb2 2xb2 3ex7 3ex7 4c9b 5mqf

25 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name IF4A3_HUMAN
Isoform —
PDB entities 4
Chains and sequence ranges Author chain 7； PDBConstruct 1–390； UniProt 22–411

RNA-binding protein 8A

OrganismNot specified

UniProt Q9Y5S9

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
1p27 1p27 1p27 2hyi 2hyi 2j0q 2j0q 2j0s 2xb2 2xb2 3ex7 3ex7

24 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name RBM8A_HUMAN
Isoform —
PDB entities 5
Chains and sequence ranges Author chain 8； PDBConstruct 1–91； UniProt 64–154

Protein mago nashi homolog 2

OrganismNot specified

UniProt Q96A72

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5xjc 5yzg 6icz 6qdv

4 assemblies

View Construct and Data Evidence
UniProt name MGN2_HUMAN
Isoform —
PDB entities 6
Chains and sequence ranges Author chain 9； PDBConstruct 1–144； UniProt 5–148

Pre-mRNA-processing-splicing factor 8

OrganismNot specified

UniProt Q6P2Q9

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer
3e9l 3enb 3enb 4jk7 4jk7 4jk8 4jk8 4jk9 4jk9 4jka 4jka 4jkb

25 assemblies; showing the first 12

Homodimer
3lru

1 assemblies

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
3jcr 4kit 5mqf 5o9z 5xjc 5yzg 5z56 5z57 5z58 6ah0 6ahd 6ff4

87 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name PRP8_HUMAN
Isoform —
PDB entities 7
Chains and sequence ranges Author chain A； PDBConstruct 1–2335； UniProt 1–2335

U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase

OrganismNot specified

UniProt O75643

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer
4f91 4f92 4f93 5urj 5urk 5urm 5urm 6s8o 8bch

9 assemblies

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
3jcr 4kit 5o9z 5xjc 5yzg 5z56 5z57 5z58 6ah0 6ahd 6ff7 6icz

72 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name U520_HUMAN
Isoform —
PDB entities 8
Chains and sequence ranges Author chain B； PDBConstruct 1–1722； UniProt 404–2125

116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component

OrganismNot specified

UniProt Q15029

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
3jcr 5mqf 5o9z 5xjc 5yzg 5z56 5z57 5z58 6ah0 6ahd 6ff4 6ff7

68 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name U5S1_HUMAN
Isoform —
PDB entities 9
Chains and sequence ranges Author chain C； PDBConstruct 1–899； UniProt 56–955

PRKR-interacting protein 1

OrganismNot specified

UniProt Q9H875

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5xjc 6icz 6qdv 7w5a 7w5b 8c6j 9fmd

7 assemblies

View Construct and Data Evidence
UniProt name PKRI1_HUMAN
Isoform —
PDB entities 10
Chains and sequence ranges Author chain D； PDBConstruct 1–123； UniProt 20–142

Cactin

OrganismNot specified

UniProt Q8WUQ7

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
6qdv 7w5a 7w5b 8c6j 9fmd

5 assemblies

View Construct and Data Evidence
UniProt name CATIN_HUMAN
Isoform —
PDB entities 12
Chains and sequence ranges Author chain F； PDBConstruct 1–122； UniProt 648–769

Protein FAM32A

OrganismNot specified

UniProt Q9Y421

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
6qdv 7w5a 7w5b 8c6j 9fmd

5 assemblies

View Construct and Data Evidence
UniProt name FA32A_HUMAN
Isoform —
PDB entities 13
Chains and sequence ranges Author chain G； PDBConstruct 1–60； UniProt 54–113

Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog

OrganismNot specified

UniProt Q9HCG8

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
4c9b 5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 5z58 6ff7 6icz 6qdv 6yvh 6zym

27 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name CWC22_HUMAN
Isoform —
PDB entities 14
Chains and sequence ranges Author chain H； PDBConstruct 1–908； UniProt 1–908

Pleiotropic regulator 1

OrganismNot specified

UniProt O43660

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer
7dh6 7dh6 7dh6 7dh6

4 assemblies

Homodimer
4yvd

1 assemblies

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 5z58 6ff4 6ff7 6icz 6id0 6id1 6qdv

34 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name PLRG1_HUMAN
Isoform —
PDB entities 16
Chains and sequence ranges Author chain J； PDBConstruct 1–320； UniProt 185–504

SNW domain-containing protein 1

OrganismNot specified

UniProt Q13573

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 6ff4 6ff7 6icz 6id0 6id1 6qdv 6zym 7a5p 7aav

33 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name SNW1_HUMAN
Isoform —
PDB entities 17
Chains and sequence ranges Author chain K； PDBConstruct 1–295； UniProt 41–335

Protein BUD31 homolog

OrganismNot specified

UniProt P41223

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
4oed 4oh6 4okb 5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 6ff4 6ff7 6icz 6id0

38 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name BUD31_HUMAN
Isoform —
PDB entities 18
Chains and sequence ranges Author chain L； PDBConstruct 1–144； UniProt 1–144

Pre-mRNA-splicing factor RBM22

OrganismNot specified

UniProt Q9NW64

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer
2ytc

1 assemblies

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 6ff4 6ff7 6icz 6id0 6id1 6qdv 6zym

32 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name RBM22_HUMAN
Isoform —
PDB entities 19
Chains and sequence ranges Author chain M； PDBConstruct 1–289； UniProt 19–307

U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein

OrganismNot specified

UniProt Q96DI7

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
3jcr 5mqf 5o9z 5xjc 5yzg 5z56 5z57 5z58 6ah0 6ahd 6ff7 6icz

54 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name SNR40_HUMAN
Isoform —
PDB entities 20
Chains and sequence ranges Author chain N； PDBConstruct 1–306； UniProt 51–357

Cell division cycle 5-like protein

OrganismNot specified

UniProt Q99459

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer
2dim 2din

2 assemblies

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 5z58 6ff4 6ff7 6icz 6id0 6id1 6qdv

35 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name CDC5L_HUMAN
Isoform —
PDB entities 21
Chains and sequence ranges Author chain O； PDBConstruct 1–802； UniProt 1–802

Spliceosome-associated protein CWC15 homolog

OrganismNot specified

UniProt Q9P013

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 5z58 6ff4 6ff7 6icz 6id0 6id1 6qdv

34 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name CWC15_HUMAN
Isoform —
PDB entities 22
Chains and sequence ranges Author chain P； PDBConstruct 1–229； UniProt 1–229

Serine/arginine repetitive matrix protein 2

OrganismNot specified

UniProt Q9UQ35

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 6ff4 6ff7 6icz 6qdv 6zym 7a5p 7dvq

25 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name SRRM2_HUMAN
Isoform —
PDB entities 23
Chains and sequence ranges Author chain R； PDBConstruct 1–26； UniProt 1–26

Crooked neck-like protein 1

OrganismNot specified

UniProt Q9BZJ0

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 5z58 6ff4 6ff7 6icz 6id0 6id1 6qdv

31 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name CRNL1_HUMAN
Isoform —
PDB entities 24
Chains and sequence ranges Author chain S； PDBConstruct 1–848； UniProt 1–848

Pre-mRNA-splicing factor SYF1

OrganismNot specified

UniProt Q9HCS7

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 6ff7 6icz 6id0 6id1 6qdv 7a5p 7abi

26 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name SYF1_HUMAN
Isoform —
PDB entities 25
Chains and sequence ranges Author chain T； PDBConstruct 1–855； UniProt 1–855

Intron-binding protein aquarius

OrganismNot specified

UniProt O60306

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer
4pj3

1 assemblies

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 6ff7 6icz 6id0 6id1 6qdv 7a5p 7abi

26 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name AQR_HUMAN
Isoform —
PDB entities 26
Chains and sequence ranges Author chain U； PDBConstruct 1–1485； UniProt 1–1485

ATP-dependent RNA helicase DHX8

Homo sapiens

UniProt Q14562

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer
2eqs 6hys 6hys 6hys 6hys 6hyt 6hyt 6hyt 6hyt

9 assemblies

Homodimer
3i4u

1 assemblies

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 6hyu 6hyu 6icz 6qdv 7w59 7w5a 7w5b 8c6j 9fmd

11 assemblies

View Construct and Data Evidence
UniProt name DHX8_HUMAN
Isoform —
PDB entities 27
Chains and sequence ranges Author chain V； PDBConstruct 1–1220； UniProt 1–1220

;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ;

OrganismNot specified

UniProt P09661

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
1a9n 1a9n 5mqf 5o9z 5xjc 5yzg 5z56 5z57 5z58 6ah0 6ahd 6ff7

51 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name RU2A_HUMAN
Isoform —
PDB entities 28
Chains and sequence ranges Author chain W； PDBConstruct 1–162； UniProt 2–163

;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ;

OrganismNot specified

UniProt P08579

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
1a9n 1a9n 5mqf 5o9z 5xjc 5yzg 5z56 5z57 5z58 6ah0 6ahd 6ff7

51 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name RU2B_HUMAN
Isoform —
PDB entities 29
Chains and sequence ranges Author chain Y； PDBConstruct 1–92； UniProt 4–95

NF-kappa-B-activating protein

OrganismNot specified

UniProt Q8N5F7

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
6qdv 7w5b 8c6j 9fmd

4 assemblies

View Construct and Data Evidence
UniProt name NKAP_HUMAN
Isoform —
PDB entities 30
Chains and sequence ranges Author chain Z； PDBConstruct 1–30； UniProt 329–358

;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ;

OrganismNot specified

UniProt P14678

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
1d3b 1d3b 1d3b 1d3b 1d3b 1d3b 3cw1 3cw1 3cw1 3cw1 3jcr 4pjo

93 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name RSMB_HUMAN
Isoform —
PDB entities 31
Chains and sequence ranges Author chain b； PDBConstruct 1–82； UniProt 6–87 Author chain k； PDBConstruct 1–82； UniProt 6–87

Pre-mRNA-splicing factor SLU7

OrganismNot specified

UniProt O95391

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5xjc 6icz 6qdv 7w5a 7w5b 8c6j 9fmd

7 assemblies

View Construct and Data Evidence
UniProt name SLU7_HUMAN
Isoform —
PDB entities 32
Chains and sequence ranges Author chain c； PDBConstruct 1–586； UniProt 1–586

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3

OrganismNot specified

UniProt P62318

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
1d3b 1d3b 1d3b 1d3b 1d3b 1d3b 3cw1 3cw1 3cw1 3cw1 3jcr 3pgw

101 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name SMD3_HUMAN
Isoform —
PDB entities 33
Chains and sequence ranges Author chain d； PDBConstruct 1–84； UniProt 3–86 Author chain n； PDBConstruct 1–84； UniProt 3–86

Small nuclear ribonucleoprotein E

OrganismNot specified

UniProt P62304

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
3cw1 3cw1 3cw1 3cw1 3jcr 3pgw 3pgw 4pjo 4pjo 4pjo 4pjo 4v98

120 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name RUXE_HUMAN
Isoform —
PDB entities 34
Chains and sequence ranges Author chain e； PDBConstruct 1–81； UniProt 12–92 Author chain p； PDBConstruct 1–81； UniProt 12–92

Small nuclear ribonucleoprotein F

OrganismNot specified

UniProt P62306

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
3cw1 3cw1 3cw1 3cw1 3jcr 3pgw 3pgw 4pjo 4pjo 4pjo 4pjo 4v98

120 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name RUXF_HUMAN
Isoform —
PDB entities 35
Chains and sequence ranges Author chain f； PDBConstruct 1–72； UniProt 4–75 Author chain q； PDBConstruct 1–72； UniProt 4–75

Small nuclear ribonucleoprotein G

OrganismNot specified

UniProt P62308

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
3cw1 3cw1 3cw1 3cw1 3jcr 4pjo 4pjo 4pjo 4pjo 4v98 4v98 4v98

118 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name RUXG_HUMAN
Isoform —
PDB entities 36
Chains and sequence ranges Author chain g； PDBConstruct 1–73； UniProt 4–76 Author chain r； PDBConstruct 1–73； UniProt 4–76

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1

OrganismNot specified

UniProt P62314

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
1b34 3cw1 3cw1 3cw1 3cw1 3jcr 3pgw 3pgw 4pjo 4pjo 4pjo 4pjo

119 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name SMD1_HUMAN
Isoform —
PDB entities 37
Chains and sequence ranges Author chain h； PDBConstruct 1–80； UniProt 1–80 Author chain l； PDBConstruct 1–80； UniProt 1–80

Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1

OrganismNot specified

UniProt Q9Y3C6

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer
1xwn 2k7n

2 assemblies

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
2x7k 5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 6ff4 6ff7 6icz 6id0 6id1 6qdv

26 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name PPIL1_HUMAN
Isoform —
PDB entities 38
Chains and sequence ranges Author chain i； PDBConstruct 1–164； UniProt 3–166

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2

OrganismNot specified

UniProt P62316

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
1b34 3cw1 3cw1 3cw1 3cw1 3jcr 3pgw 3pgw 4pjo 4pjo 4pjo 4pjo

117 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name SMD2_HUMAN
Isoform —
PDB entities 39
Chains and sequence ranges Author chain j； PDBConstruct 1–118； UniProt 1–118 Author chain m； PDBConstruct 1–118； UniProt 1–118

Pre-mRNA-processing factor 17

OrganismNot specified

UniProt O60508

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 6ff4 6ff7 6icz 6id0 6id1 6qdv 6zym

28 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name PRP17_HUMAN
Isoform —
PDB entities 40
Chains and sequence ranges Author chain o； PDBConstruct 1–513； UniProt 69–581

Pre-mRNA-splicing factor SPF27

OrganismNot specified

UniProt O75934

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 6ff7 6icz 6id0 6id1 6qdv 7a5p 7w59

22 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name SPF27_HUMAN
Isoform —
PDB entities 41
Chains and sequence ranges Author chain s； PDBConstruct 1–225； UniProt 1–225

Pre-mRNA-processing factor 19

OrganismNot specified

UniProt Q9UMS4

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer
4lg8

1 assemblies

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 5z56 5z57 6ff7 6icz 6id0 6id1 6qdv 7a5p 7w59

22 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name PRP19_HUMAN
Isoform —
PDB entities 42
Chains and sequence ranges Author chain t； PDBConstruct 1–504； UniProt 1–504 Author chain u； PDBConstruct 1–504； UniProt 1–504 Author chain v； PDBConstruct 1–504； UniProt 1–504 Author chain w； PDBConstruct 1–504； UniProt 1–504

Pre-mRNA-splicing factor SYF2

OrganismNot specified

UniProt O95926

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Replication stress response regulator SDE2 × 1 （Q6IQ49） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

None

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
5mqf 5xjc 5yzg 6icz 6id0 6id1 6qdv 7a5p 7w59 7w5a 7w5b 8c6j

17 assemblies; showing the first 12

View Construct and Data Evidence
UniProt name SYF2_HUMAN
Isoform —
PDB entities 43
Chains and sequence ranges Author chain y； PDBConstruct 1–144； UniProt 100–243

Replication stress response regulator SDE2

OrganismNot specified

UniProt Q6IQ49

State in the Current Structure

Assembly Physical composition Protein state Molecular copy count Associated components Data consistency
1 Protein–RNA Heteromer Protein 49 RNA 5 U2 snRNA × 1 U5 snRNA × 1 U6 snRNA × 1 Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed × 1 （P38919） RNA-binding protein 8A × 1 （Q9Y5S9） Protein mago nashi homolog 2 × 1 （Q96A72） Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 × 1 （Q6P2Q9） U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase × 1 （O75643） 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component × 1 （Q15029） PRKR-interacting protein 1 × 1 （Q9H875） Ligated exons: MINX mRNA × 1 Cactin × 1 （Q8WUQ7） Protein FAM32A × 1 （Q9Y421） Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog × 1 （Q9HCG8） Intron lariat: MINX RNA × 1 Pleiotropic regulator 1 × 1 （O43660） SNW domain-containing protein 1 × 1 （Q13573） Protein BUD31 homolog × 1 （P41223） Pre-mRNA-splicing factor RBM22 × 1 （Q9NW64） U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein × 1 （Q96DI7） Cell division cycle 5-like protein × 1 （Q99459） Spliceosome-associated protein CWC15 homolog × 1 （Q9P013） Serine/arginine repetitive matrix protein 2 × 1 （Q9UQ35） Crooked neck-like protein 1 × 1 （Q9BZJ0） Pre-mRNA-splicing factor SYF1 × 1 （Q9HCS7） Intron-binding protein aquarius × 1 （O60306） ATP-dependent RNA helicase DHX8 × 1 （Q14562） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein A' ; × 1 （P09661） ;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' ; × 1 （P08579） NF-kappa-B-activating protein × 1 （Q8N5F7） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 2 （P14678） Pre-mRNA-splicing factor SLU7 × 1 （O95391） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 2 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein E × 2 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 2 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 2 （P62308） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 2 （P62314） Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 × 1 （Q9Y3C6） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 2 （P62316） Pre-mRNA-processing factor 17 × 1 （O60508） Pre-mRNA-splicing factor SPF27 × 1 （O75934） Pre-mRNA-processing factor 19 × 4 （Q9UMS4） Pre-mRNA-splicing factor SYF2 × 1 （O95926） MAGNESIUM ION × 7 POTASSIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZINC ION × 7 INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer
7n99

1 assemblies

Homodimer

None

Homotetramer

None

Other homooligomers

None

Heteromeric or nucleic-acid complex
6qdv 8c6j 8ro2 9fmd

4 assemblies

View Construct and Data Evidence
UniProt name SDE2_HUMAN
Isoform —
PDB entities 44
Chains and sequence ranges Author chain z； PDBConstruct 1–34； UniProt 95–128

The page prioritizes protein identity, the current assembly, associated components, oligomeric state and cross-PDB links. Chain mapping and sequence ranges are retained as data evidence. Internal IDs, import timestamps and assembly operation expressions are maintenance fields and are not shown here.

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2. Structure Basics 2. Structure Basics

Entry ID entry_id6qdv
Deposition date deposition_date2019-01-03
Structure title titleHuman post-catalytic P complex spliceosome
Keywords keywordsspliceosome, RNA, complex, SPLICING; SPLICING
Experimental Method methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model SAXS Official SAXS Profiles

This page reads only the latest assembly calculations. Every curve maps to an explicit PDB entry, official biological assembly and coordinate model.

6qdv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

Download this curve (.dat)

6qdv__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 plotted points; both axes use logarithmic scales.

6qdv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

The new assembly/model P(r) has not been calculated yet This placeholder does not display legacy data r (Angstrom) P(r)
P(r) will be calculated and displayed separately for the same assembly/model.
Rg（Guinier）0.00 Å
Rg (electron density)102.70 Å
Total Rg102.40 Å
Atom count121129
Residues14957
Excluded volume2117500 ų
Maximum q0.500 Å⁻¹
Assembly Model Structure unit Oligomeric description Status CRYSOL Actions
1 1 6qdv__assembly_1__model_1 54-meric （54） Success 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) View Download
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4. Crystallography and Experiment 4. Crystallography & Experiment

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5. Entities and Polymers Entities & Polymers (50)

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7. Citations (1)