当前蛋白身份：P08579
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1A9N CRYSTAL STRUCTURE OF THE SPLICEOSOMAL U2B''-U2A' PROTEIN COMPLEX BOUND TO A FRAGMENT OF U2 SMALL NUCLEAR RNA 提交 1998-04-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–96（96 aa）
片段：;RESIDUES 4 - 99 OF U2 B'', A COMPONENT OF U2 SNRNP
;
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.3；50MM NACL, 9MM MGCL2, 0.25 MM SPERMINE, 0.25% N-OCTYL-BETA-D-GLUCOPYRANOSIDE, 50MM TRIS-CL PH 7.3, 1% PEG600
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.328 |
| 1A9N CRYSTAL STRUCTURE OF THE SPLICEOSOMAL U2B''-U2A' PROTEIN COMPLEX BOUND TO A FRAGMENT OF U2 SMALL NUCLEAR RNA 提交 1998-04-08 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–96（96 aa）
片段：;RESIDUES 4 - 99 OF U2 B'', A COMPONENT OF U2 SNRNP
;
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.3；50MM NACL, 9MM MGCL2, 0.25 MM SPERMINE, 0.25% N-OCTYL-BETA-D-GLUCOPYRANOSIDE, 50MM TRIS-CL PH 7.3, 1% PEG600
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.328 |
| 5MQF Cryo-EM structure of a human spliceosome activated for step 2 of splicing (C* complex) 提交 2016-12-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：41-meric（41） 与蛋白数一致 |
链 X
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.90 Å |
| 5O9Z Cryo-EM structure of a pre-catalytic human spliceosome primed for activation (B complex) 提交 2017-06-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 1
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 5XJC Cryo-EM structure of the human spliceosome just prior to exon ligation at 3.6 angstrom 提交 2017-04-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 5YZG The Cryo-EM Structure of Human Catalytic Step I Spliceosome (C complex) at 4.1 angstrom resolution 提交 2017-12-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 5Z56 cryo-EM structure of a human activated spliceosome (mature Bact) at 5.1 angstrom. 提交 2018-01-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 13 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.10 Å |
| 5Z57 Cryo-EM structure of the human activated spliceosome (late Bact) at 6.5 angstrom 提交 2018-01-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ALA ALANINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 5Z58 Cryo-EM structure of a human activated spliceosome (early Bact) at 4.9 angstrom. 提交 2018-01-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：46-meric（46） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；20 mM HEPES-KOH, pH 7.9, 150 mM NaCl, 1.5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.90 Å |
| 6AH0 The Cryo-EM Structure of the Precusor of Human Pre-catalytic Spliceosome (pre-B complex) 提交 2018-08-15 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.70 Å |
| 6AHD The Cryo-EM Structure of Human Pre-catalytic Spliceosome (B complex) at 3.8 angstrom resolution 提交 2018-08-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric（63） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6FF7 human Bact spliceosome core structure 提交 2018-01-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：61-meric（61） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–225（225 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 5 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6ICZ Cryo-EM structure of a human post-catalytic spliceosome (P complex) at 3.0 angstrom 提交 2018-09-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6ID0 Cryo-EM structure of a human intron lariat spliceosome prior to Prp43 loaded (ILS1 complex) at 2.9 angstrom resolution 提交 2018-09-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：42-meric（42） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 6ID1 Cryo-EM structure of a human intron lariat spliceosome after Prp43 loaded (ILS2 complex) at 2.9 angstrom resolution 提交 2018-09-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：43-meric（43） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 6QDV Human post-catalytic P complex spliceosome 提交 2019-01-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 Y
4–95（92 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 7 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was applied to the grid, left for 25s, then blotted for 2.5-3.5s and immediately plunged into liquid ethane.
|
分辨率 3.30 Å |
| 6QX9 Structure of a human fully-assembled precatalytic spliceosome (pre-B complex). 提交 2019-03-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 65 PDB 声明：71-meric（71） 与全部聚合物一致 |
链 2B
1–225（225 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.28 Å |
| 6Y53 human 17S U2 snRNP low resolution part 提交 2020-02-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：nonadecameric（19） 与全部聚合物一致 |
链 b
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 6Y5Q human 17S U2 snRNP 提交 2020-02-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 b
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7A5P Human C Complex Spliceosome - Medium-resolution PERIPHERY 提交 2020-08-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物一致 |
链 X
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.00 Å |
| 7ABG Human pre-Bact-1 spliceosome 提交 2020-09-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.80 Å |
| 7ABI Human pre-Bact-2 spliceosome 提交 2020-09-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–225（225 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.00 Å |
| 7EVO The cryo-EM structure of the human 17S U2 snRNP 提交 2021-05-21 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–225（225 aa）
|
未记录 | 9B0 [(2~{S},3~{S},4~{E},6~{S},7~{R},10~{R})-3,7-dimethyl-2-[(2~{E},4~{E},6~{R})-6-methyl-6-oxidanyl-7-[(2~{R},3~{R})-3-[(2~{R},3~{S})-3-oxidanylpentan-2-yl]oxiran-2-yl]hepta-2,4-dien-2-yl]-7,10-bis(oxidanyl)-12-oxidanylidene-1-oxacyclododec-4-en-6-yl] 4-cycloheptylpiperazine-1-carboxylate × 1 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7VPX The cryo-EM structure of the human pre-A complex 提交 2021-10-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：35-meric（35） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–225（225 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 SJT spliceostatin A (form II) × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7W59 The cryo-EM structure of human pre-C*-I complex 提交 2021-11-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7W5A The cryo-EM structure of human pre-C*-II complex 提交 2021-11-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7W5B The cryo-EM structure of human C* complex 提交 2021-11-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 9 ZN ZINC ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 8C6J Human spliceosomal PM5 C* complex 提交 2023-01-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric（63） 与全部聚合物一致 |
链 Y
1–225（225 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8CH6 Structure of a late-stage activated spliceosome (BAqr) arrested with a dominant-negative Aquarius mutant (state B complex). 提交 2023-02-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 s
1–225（225 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 12 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；All solutions were sterile-filtered using a 0.22um vacuum filtration unit.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Volumes of 4 ul of the concentrated sample were applied to one side of glow-discharged UltrAuFoil 200 2/2 grids (Quantifoil) in a Vitrobot Mark IV (FEI), operated at 4 degrees Celsius and 100% humidity. The grids were blotted for 2s with blotting force 5 and immediately frozen by plunging into liquid ethane.
|
分辨率 5.90 Å |
| 8H6E Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the late pre-B state. 提交 2022-10-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric（61） 与全部聚合物一致 |
链 2C
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8H6J Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature pre-B state. 提交 2022-10-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric（61） 与全部聚合物一致 |
链 2C
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 8H6K Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the mature B state. 提交 2022-10-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric（63） 与全部聚合物一致 |
链 2C
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8H6L Cryo-EM structure of human exon-defined spliceosome in the early B state. 提交 2022-10-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 2C
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 8HK1 The cryo-EM structure of human pre-17S U2 snRNP 提交 2022-11-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–225（225 aa）
|
未记录 | 9B0 [(2~{S},3~{S},4~{E},6~{S},7~{R},10~{R})-3,7-dimethyl-2-[(2~{E},4~{E},6~{R})-6-methyl-6-oxidanyl-7-[(2~{R},3~{R})-3-[(2~{R},3~{S})-3-oxidanylpentan-2-yl]oxiran-2-yl]hepta-2,4-dien-2-yl]-7,10-bis(oxidanyl)-12-oxidanylidene-1-oxacyclododec-4-en-6-yl] 4-cycloheptylpiperazine-1-carboxylate × 1 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8I0P The cryo-EM structure of human pre-Bact complex 提交 2023-01-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8I0R The cryo-EM structure of human Bact-I complex 提交 2023-01-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8I0S The cryo-EM structure of human Bact-II complex 提交 2023-01-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8I0T The cryo-EM structure of human Bact-III complex 提交 2023-01-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8I0U The cryo-EM structure of human Bact-IV complex 提交 2023-01-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8I0V The cryo-EM structure of human post-Bact complex 提交 2023-01-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8I0W The cryo-EM structure of human C complex 提交 2023-01-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8QO9 Cryo-EM structure of a human spliceosomal B complex protomer 提交 2023-09-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：71-meric（71） 与全部聚合物一致 |
链 2B
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.29 Å |
| 8QXD Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B complex 提交 2023-10-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：61-meric（61） 与全部聚合物一致 |
链 2B
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.60 Å |
| 8QZS Cryo-EM structure of the cross-exon B-like complex 提交 2023-10-29 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 61 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 2B
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8R08 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+AMPPNP complex 提交 2023-10-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：71-meric（71） 与全部聚合物一致 |
链 2B
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 8R09 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss+ATPgammaS complex 提交 2023-10-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric（60） 与全部聚合物一致 |
链 2B
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 8R0A Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ss complex 提交 2023-10-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：62-meric（62） 与全部聚合物一致 |
链 2B
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.80 Å |
| 8R0B Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+ATP complex 提交 2023-10-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric（60） 与全部聚合物一致 |
链 2B
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8RM5 Cryo-EM structure of the cross-exon pre-B+5'ssLNG+ATPyS complex 提交 2024-01-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：60-meric（60） 与全部聚合物一致 |
链 2B
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.90 Å |
| 9FMD Integrative model of the human post-catalytic spliceosome (P-complex) 提交 2024-06-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：63-meric（63） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–225（225 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 6 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9R8V Cryo-EM structure of the human pre-Bact-OTS complex (whole map) 提交 2025-05-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：63-meric（63） 与全部聚合物一致 |
链 2B
1–225（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.50 Å |