9dgv

structure of dynactin, dynein tail with TRAK2 from dynein-dynactin-TRAK2 on microtubules

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 298.4 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Alpha-centractin

物种未注明

UniProt A0A8D1PMN0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–376 链 B; UniProt 1–376 链 C; UniProt 1–376 链 D; UniProt 1–376 链 E; UniProt 1–376 链 F; UniProt 1–376 链 G; UniProt 1–376 链 I; UniProt 1–376 未记录 Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A8D1PMN0_PIG
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376 作者链 B; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376 作者链 C; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376 作者链 D; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376 作者链 E; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376 作者链 F; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376 作者链 G; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376 作者链 I; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376

Actin, cytoplasmic 1

物种未注明

UniProt Q6QAQ1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 1–375 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 24 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ACTB_PIG
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375

Actin-related protein 10

物种未注明

UniProt I3LHK5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 1–417 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 21 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ARP10_PIG
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–417; UniProt 1–417

F-actin-capping protein subunit alpha-1

物种未注明

UniProt A0PFK5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 K; UniProt 1–286 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 17 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 CAZA1_PIG
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–286; UniProt 1–286

F-actin-capping protein subunit beta

物种未注明

UniProt A0PFK7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 L; UniProt 1–272 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 CAPZB_PIG
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–272; UniProt 1–272

Dynactin subunit 2

物种未注明

UniProt A0A5G2QD80

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 M; UniProt 1–405 链 N; UniProt 1–405 链 P; UniProt 1–405 链 Q; UniProt 1–405 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 DCTN2_PIG
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–405; UniProt 1–405 作者链 N; PDB构建体 1–405; UniProt 1–405 作者链 P; PDB构建体 1–405; UniProt 1–405 作者链 Q; PDB构建体 1–405; UniProt 1–405

Dynactin subunit 3

物种未注明

UniProt F1SEC0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 O; UniProt 1–186 链 R; UniProt 1–186 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 DCTN3_PIG
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 O; PDB构建体 1–186; UniProt 1–186 作者链 R; PDB构建体 1–186; UniProt 1–186

Dynactin subunit 6

物种未注明

UniProt D0G6S1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 U; UniProt 1–190 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DCTN6_PIG
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–190; UniProt 1–190

Dynactin subunit 5

物种未注明

UniProt A0A286ZK88

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 V; UniProt 1–182 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DCTN5_PIG
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 V; PDB构建体 1–182; UniProt 1–182

Dynactin subunit 1

物种未注明

UniProt A0A287B8J2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 W; UniProt 1–1281 链 Z; UniProt 1–1281 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DCTN1_PIG
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 W; PDB构建体 1–1281; UniProt 1–1281 作者链 Z; PDB构建体 1–1281; UniProt 1–1281

Dynactin subunit 4

物种未注明

UniProt A0A4X1TB62

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 Y; UniProt 1–467 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DCTN4_PIG
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 Y; PDB构建体 1–467; UniProt 1–467

Trafficking protein, kinesin binding 2

Mus musculus

UniProt Q6P9N8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 a; UniProt 1–913 链 b; UniProt 1–913 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q6P9N8_MOUSE
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–913; UniProt 1–913 作者链 b; PDB构建体 1–913; UniProt 1–913

Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1

物种未注明

UniProt A0A480I0V8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 e; UniProt 1–4646 链 f; UniProt 1–4646 链 m; UniProt 1–4646 链 n; UniProt 1–4646 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 × 4 (A0A4X1VH50) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A480I0V8_PIG
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 e; PDB构建体 1–4646; UniProt 1–4646 作者链 f; PDB构建体 1–4646; UniProt 1–4646 作者链 m; PDB构建体 1–4646; UniProt 1–4646 作者链 n; PDB构建体 1–4646; UniProt 1–4646

Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2

物种未注明

UniProt A0A4X1VH50

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric(33) 与蛋白拷贝数一致 链 g; UniProt 1–612 链 h; UniProt 1–612 链 o; UniProt 1–612 链 p; UniProt 1–612 未记录 Alpha-centractin × 8 (A0A8D1PMN0) Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Actin-related protein 10 × 1 (I3LHK5) F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 (A0PFK5) F-actin-capping protein subunit beta × 1 (A0PFK7) Dynactin subunit 2 × 4 (A0A5G2QD80) Dynactin subunit 3 × 2 (F1SEC0) Dynactin subunit 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) Dynactin subunit 1 × 2 (A0A287B8J2) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) Trafficking protein, kinesin binding 2 × 2 (Q6P9N8) Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 × 4 (A0A480I0V8) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 8.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A4X1VH50_PIG
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 g; PDB构建体 1–612; UniProt 1–612 作者链 h; PDB构建体 1–612; UniProt 1–612 作者链 o; PDB构建体 1–612; UniProt 1–612 作者链 p; PDB构建体 1–612; UniProt 1–612

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9dgv

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9dgv
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9dgv
沉积日期 deposition_date2024-09-03
结构标题 titlestructure of dynactin, dynein tail with TRAK2 from dynein-dynactin-TRAK2 on microtubules
关键词 keywordsdynein, TRAK2, dynactin, microtubule, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron111.30
零角强度 I(0) i021860300000.00
分子量 molecular_weight1226400.0 kDa
排除体积 excluded_volume1519600 ų
包络体积 envelope_volume2822400 ų
水化壳体积 shell_volume238150 ų
包络直径 envelope_diameter455.4
壳层 Rg shell_rg87.67
包络 Rg envelope_rg107.30
形状 Rg shape_rg111.20
总 Rg total_rg111.40
总原子数 total_atoms86528
残基数 n_residues11794
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax298.4
Rg (实空间) rg_real101.50
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.38
I(0) (实空间) i0_real2.0860e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.1430e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal99.74
I(0) (倒空间) i0_reciprocal21240000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9176
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary106.6
偏度 Skewness skewness0.379
峰度 Kurtosis kurtosis-0.486
角度范围 angular_range— – 0.0700 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.8117
最高正则化参数 α highest_alpha580000000.0000
实空间数据点数 n_real_points15
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.027; Oscil: 0.995; Stabil: 0.981; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.008

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)