ARP1 actin related protein 1 homolog A
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 | 链 G; UniProt 1–376 链 I; UniProt 1–376 | 未记录 | Actin, cytoplasmic 1 × 1 (Q6QAQ1) Arp11 × 1 (I3LHK5) Dynactin subunit 2 × 1 (A0A5G2QD80) Dynactin 6 × 1 (D0G6S1) Dynactin subunit 5 × 1 (A0A286ZK88) BICD family-like cargo adapter 1,BICD family-like cargo adapter 1,BICDR1 × 2 (A0JNT9) Dynactin subunit 4 × 1 (A0A4X1TB62) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 4.10 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6ZNM | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5ADX CryoEM structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution 提交 2015-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 A
7–376(370 aa)
链 B
7–376(370 aa)
链 C
7–376(370 aa)
链 D
7–376(370 aa)
链 E
7–376(370 aa)
链 F
7–376(370 aa)
链 G
7–376(370 aa)
链 I
7–376(370 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50MM KCL, 25MM K2HPO4- KH2PO4, 1MM MGCL2,5MM DTT;pH 6.5;50MM KCL, 25MM K2HPO4- KH2PO4, 1MM MGCL2,5MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;LIQUID ENTHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 5AFU Cryo-EM structure of dynein tail-dynactin-BICD2N complex 提交 2015-01-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 33 PDB 声明:33-meric |
链 A
7–376(370 aa)
链 B
7–376(370 aa)
链 C
7–376(370 aa)
链 D
7–376(370 aa)
链 E
7–376(370 aa)
链 F
7–376(370 aa)
链 G
7–376(370 aa)
链 I
7–376(370 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
150MM KCL, 25MM HEPES-KOH, 1MM MGCL2, 0.1MM MGATP, 5MM DTT;pH 7.4;150MM KCL, 25MM HEPES-KOH, 1MM MGCL2, 0.1MM MGATP, 5MM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;LIQUID ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 5NW4 Human cytoplasmic dynein-1 bound to dynactin and an N-terminal construct of BICD2 提交 2017-05-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 39 PDB 声明:39-meric |
链 G
1–376(376 aa)
链 H
1–376(376 aa)
链 O
1–376(376 aa)
链 P
1–376(376 aa)
链 Q
1–376(376 aa)
链 T
1–376(376 aa)
链 U
1–376(376 aa)
链 W
1–376(376 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.70 Å |
| 6F1T Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and BICDR1 提交 2017-11-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 45 PDB 声明:45-meric |
链 A
1–376(376 aa)
链 B
1–376(376 aa)
链 C
1–376(376 aa)
链 D
1–376(376 aa)
链 E
1–376(376 aa)
链 F
1–376(376 aa)
链 G
1–376(376 aa)
链 I
1–376(376 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6F1U N terminal region of dynein tail domains in complex with dynactin filament and BICDR-1 提交 2017-11-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric |
链 B
1–376(376 aa)
链 D
1–376(376 aa)
链 F
1–376(376 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6F38 Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and HOOK3 提交 2017-11-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 45 PDB 声明:45-meric |
链 A
1–376(376 aa)
链 B
1–376(376 aa)
链 C
1–376(376 aa)
链 D
1–376(376 aa)
链 E
1–376(376 aa)
链 F
1–376(376 aa)
链 G
1–376(376 aa)
链 I
1–376(376 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.70 Å |
| 6F3A Cryo-EM structure of a single dynein tail domain bound to dynactin and BICD2N 提交 2017-11-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric |
链 A
1–376(376 aa)
链 B
1–376(376 aa)
链 C
1–376(376 aa)
链 D
1–376(376 aa)
链 E
1–376(376 aa)
链 F
1–376(376 aa)
链 G
1–376(376 aa)
链 I
1–376(376 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 6ZNL Cryo-EM structure of the dynactin complex 提交 2020-07-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:23-meric |
链 A
1–376(376 aa)
链 B
1–376(376 aa)
链 C
1–376(376 aa)
链 D
1–376(376 aa)
链 E
1–376(376 aa)
链 F
1–376(376 aa)
链 G
1–376(376 aa)
链 I
1–376(376 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6ZNN The pointed end complex of dynactin bound to Hook3 提交 2020-07-06 | 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 G
1–376(376 aa)
链 I
1–376(376 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 6ZNO The pointed end complex of dynactin with the p150 projection docked 提交 2020-07-06 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 G
1–376(376 aa)
链 I
1–376(376 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.80 Å |
| 6ZO4 The pointed end complex of dynactin bound to BICD2 提交 2020-07-07 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 G
1–376(376 aa)
链 I
1–376(376 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 7Z8F Composite structure of dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2022-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 43 PDB 声明:43-meric |
链 A
1–376(376 aa)
链 B
1–376(376 aa)
链 C
1–376(376 aa)
链 D
1–376(376 aa)
链 E
1–376(376 aa)
链 F
1–376(376 aa)
链 G
1–376(376 aa)
链 I
1–376(376 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ZN ZINC ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 20.00 Å |
| 7Z8I The barbed end complex of dynactin bound to BICDR1 and the cytoplasmic dynein tails (A2, B1, B2) 提交 2022-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:heptadecameric |
链 A
1–376(376 aa)
链 B
1–376(376 aa)
链 C
1–376(376 aa)
链 D
1–376(376 aa)
链 E
1–376(376 aa)
链 F
1–376(376 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 3.30 Å |
| 7Z8K Cytoplasmic dynein (A1) bound to BICDR1 提交 2022-03-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 F
1–376(376 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 4.37 Å |
| 7Z8M The pointed end complex of dynactin bound to BICDR1 提交 2022-03-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 G
1–376(376 aa)
链 I
1–376(376 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 3.37 Å |
| 8PTK Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1 提交 2023-07-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:53-meric |
链 A
1–376(376 aa)
链 B
1–376(376 aa)
链 C
1–376(376 aa)
链 D
1–376(376 aa)
链 E
1–376(376 aa)
链 F
1–376(376 aa)
链 G
1–376(376 aa)
链 I
1–376(376 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.00 Å |
| 9HHL Structure of Dynein-Dynactin-NuMA-LIS1 提交 2024-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 41 PDB 声明:41-meric |
链 A
1–376(376 aa)
链 B
1–376(376 aa)
链 C
1–376(376 aa)
链 D
1–376(376 aa)
链 E
1–376(376 aa)
链 F
1–376(376 aa)
链 G
1–376(376 aa)
链 I
1–376(376 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.53 Å |
共 17 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | F2Z5G5_PIG |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 G; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376 作者链 I; PDB构建体 1–376; UniProt 1–376 |