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8xgc

Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 210.3 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA replication licensing factor MCM2

物种未注明

UniProt A0A6A5Q1S9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 2； UniProt 1–868 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–868（868 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
7PMK S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 2 1–868（868 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 2 1–868（868 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 2 1–868（868 aa）
链 a 1–868（868 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 2 1–868（868 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–868（868 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–868（868 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5Q1S9_YEASX
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 2； PDB构建体 1–868； UniProt 1–868

DNA replication licensing factor MCM3

物种未注明

UniProt P24279

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 3； UniProt 1–971 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JA8 Cryo-EM structure of the MCM2-7 double hexamer 提交 2015-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
5BK4 Cryo-EM structure of Mcm2-7 double hexamer on dsDNA 提交 2017-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 B 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5XF8 Cryo-EM structure of the Cdt1-MCM2-7 complex in AMPPNP state 提交 2017-04-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
6EYC Re-refinement of the MCM2-7 double hexamer using ISOLDE 提交 2017-11-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；All details as per 3ja8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6F0L S. cerevisiae MCM double hexamer bound to duplex DNA 提交 2017-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 B 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.77 Å
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 j 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 G 1–971（971 aa）
链 i 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6SKO Cryo-EM Structure of the Fork Protection Complex Bound to CMG at a Replication Fork - conformation 2 MCM CTD:ssDNA 提交 2019-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 3 1–971（971 aa） 片段：Mcm5-CTD
突变：CBP-tag at N-terminus ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.40 Å
6U0M Structure of the S. cerevisiae replicative helicase CMG in complex with a forked DNA 提交 2019-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 3 17–738（722 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6WGC Atomic model of semi-attached mutant OCCM-DNA complex (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6WGF Atomic model of mutant Mcm2-7 hexamer with Mcm6 WHD truncation 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
7P30 3.0 A resolution structure of a DNA-loaded MCM double hexamer 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 B 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.00 Å
7P5Z Structure of a DNA-loaded MCM double hexamer engaged with the Dbf4-dependent kinase 提交 2021-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 B 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.30 Å
7PMK S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PT6 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ATPgS, state III 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 C 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.20 Å
7PT7 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ADP:BeF3, state I 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 C 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 12 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.80 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7V3U Cryo-EM structure of MCM double hexamer with structured Mcm4-NSD 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 C 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7V3V Cryo-EM structure of MCM double hexamer bound with DDK in State I 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 C 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 11 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7W8G Cryo-EM structure of MCM double hexamer 提交 2021-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 C 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.52 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 b 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8RIF Cryo-EM structure of the MCM double hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 B 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8RIG Cryo-EM structure of an MCM helicase single hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 b 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9RHL Phospho-DH bound by Sld3-MBD on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 b 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9RHM Phospho-MCM double hexamer bound to Sld3-Sld7-Cdc45 on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 b 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 59 个其他 PDB 条目、59 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM3_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 3； PDB构建体 1–971； UniProt 1–971

DNA replication licensing factor MCM4

物种未注明

UniProt P30665

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 4； UniProt 1–933 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JA8 Cryo-EM structure of the MCM2-7 double hexamer 提交 2015-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
5BK4 Cryo-EM structure of Mcm2-7 double hexamer on dsDNA 提交 2017-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 C 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5XF8 Cryo-EM structure of the Cdt1-MCM2-7 complex in AMPPNP state 提交 2017-04-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
6EYC Re-refinement of the MCM2-7 double hexamer using ISOLDE 提交 2017-11-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；All details as per 3ja8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6F0L S. cerevisiae MCM double hexamer bound to duplex DNA 提交 2017-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 C 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.77 Å
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 k 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 H 1–933（933 aa）
链 j 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6SKO Cryo-EM Structure of the Fork Protection Complex Bound to CMG at a Replication Fork - conformation 2 MCM CTD:ssDNA 提交 2019-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 4 1–933（933 aa） 片段：Mcm6-CTD
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.40 Å
6U0M Structure of the S. cerevisiae replicative helicase CMG in complex with a forked DNA 提交 2019-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 4 177–929（753 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6WGF Atomic model of mutant Mcm2-7 hexamer with Mcm6 WHD truncation 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
7P30 3.0 A resolution structure of a DNA-loaded MCM double hexamer 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 C 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.00 Å
7P5Z Structure of a DNA-loaded MCM double hexamer engaged with the Dbf4-dependent kinase 提交 2021-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 C 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.30 Å
7PMK S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PT6 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ATPgS, state III 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 D 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.20 Å
7PT7 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ADP:BeF3, state I 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 D 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 12 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.80 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7V3U Cryo-EM structure of MCM double hexamer with structured Mcm4-NSD 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 D 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7V3V Cryo-EM structure of MCM double hexamer bound with DDK in State I 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 D 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 11 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7W8G Cryo-EM structure of MCM double hexamer 提交 2021-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 D 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.52 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 c 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8RIF Cryo-EM structure of the MCM double hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 C 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8RIG Cryo-EM structure of an MCM helicase single hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 c 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9RHL Phospho-DH bound by Sld3-MBD on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 c 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9RHM Phospho-MCM double hexamer bound to Sld3-Sld7-Cdc45 on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 c 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM4_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 4； PDB构建体 1–933； UniProt 1–933

Minichromosome maintenance protein 5

物种未注明

UniProt P29496

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 5； UniProt 1–775 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JA8 Cryo-EM structure of the MCM2-7 double hexamer 提交 2015-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
5BK4 Cryo-EM structure of Mcm2-7 double hexamer on dsDNA 提交 2017-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 5 1–775（775 aa）
链 D 1–775（775 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5XF8 Cryo-EM structure of the Cdt1-MCM2-7 complex in AMPPNP state 提交 2017-04-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
6EYC Re-refinement of the MCM2-7 double hexamer using ISOLDE 提交 2017-11-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；All details as per 3ja8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6F0L S. cerevisiae MCM double hexamer bound to duplex DNA 提交 2017-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 5 1–775（775 aa）
链 D 1–775（775 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.77 Å
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 5 1–775（775 aa）
链 l 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 5 1–775（775 aa）
链 I 1–775（775 aa）
链 k 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6SKO Cryo-EM Structure of the Fork Protection Complex Bound to CMG at a Replication Fork - conformation 2 MCM CTD:ssDNA 提交 2019-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 5 1–775（775 aa） 片段：Mcm7-CTD
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.40 Å
6U0M Structure of the S. cerevisiae replicative helicase CMG in complex with a forked DNA 提交 2019-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 5 24–693（670 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6WGF Atomic model of mutant Mcm2-7 hexamer with Mcm6 WHD truncation 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
7P30 3.0 A resolution structure of a DNA-loaded MCM double hexamer 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 5 1–775（775 aa）
链 D 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.00 Å
7P5Z Structure of a DNA-loaded MCM double hexamer engaged with the Dbf4-dependent kinase 提交 2021-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–775（775 aa）
链 D 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.30 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PT6 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ATPgS, state III 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 5 1–775（775 aa）
链 E 1–775（775 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.20 Å
7PT7 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ADP:BeF3, state I 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 5 1–775（775 aa）
链 E 1–775（775 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 12 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.80 Å
7V3U Cryo-EM structure of MCM double hexamer with structured Mcm4-NSD 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 5 1–775（775 aa）
链 E 1–775（775 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7V3V Cryo-EM structure of MCM double hexamer bound with DDK in State I 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 5 1–775（775 aa）
链 E 1–775（775 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 11 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7W8G Cryo-EM structure of MCM double hexamer 提交 2021-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 5 1–775（775 aa）
链 E 1–775（775 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.52 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8RIF Cryo-EM structure of the MCM double hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 5 1–775（775 aa）
链 D 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8RIG Cryo-EM structure of an MCM helicase single hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 5 1–775（775 aa）
突变：R549A ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 5 1–775（775 aa）
突变：R549A ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 5 1–775（775 aa）
链 d 1–775（775 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9RHL Phospho-DH bound by Sld3-MBD on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 5 1–775（775 aa）
链 d 1–775（775 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9RHM Phospho-MCM double hexamer bound to Sld3-Sld7-Cdc45 on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 5 1–775（775 aa）
链 d 1–775（775 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 54 个其他 PDB 条目、54 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM5_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 5； PDB构建体 1–775； UniProt 1–775

DNA replication licensing factor MCM6

物种未注明

UniProt P53091

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 6； UniProt 1–1017 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JA8 Cryo-EM structure of the MCM2-7 double hexamer 提交 2015-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
5BK4 Cryo-EM structure of Mcm2-7 double hexamer on dsDNA 提交 2017-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 E 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5XF8 Cryo-EM structure of the Cdt1-MCM2-7 complex in AMPPNP state 提交 2017-04-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
6EYC Re-refinement of the MCM2-7 double hexamer using ISOLDE 提交 2017-11-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；All details as per 3ja8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6F0L S. cerevisiae MCM double hexamer bound to duplex DNA 提交 2017-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 E 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.77 Å
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 m 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 J 1–1017（1017 aa）
链 l 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6SKO Cryo-EM Structure of the Fork Protection Complex Bound to CMG at a Replication Fork - conformation 2 MCM CTD:ssDNA 提交 2019-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.40 Å
6WGF Atomic model of mutant Mcm2-7 hexamer with Mcm6 WHD truncation 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
7P30 3.0 A resolution structure of a DNA-loaded MCM double hexamer 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 E 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.00 Å
7P5Z Structure of a DNA-loaded MCM double hexamer engaged with the Dbf4-dependent kinase 提交 2021-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 E 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.30 Å
7PMK S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PT6 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ATPgS, state III 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 F 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.20 Å
7PT7 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ADP:BeF3, state I 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 F 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 12 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.80 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7V3U Cryo-EM structure of MCM double hexamer with structured Mcm4-NSD 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 F 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7V3V Cryo-EM structure of MCM double hexamer bound with DDK in State I 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 F 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 11 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7W8G Cryo-EM structure of MCM double hexamer 提交 2021-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 F 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.52 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 e 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8RIF Cryo-EM structure of the MCM double hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 E 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8RIG Cryo-EM structure of an MCM helicase single hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
9BCX Cryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate 提交 2024-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 e 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9RHL Phospho-DH bound by Sld3-MBD on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 e 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9RHM Phospho-MCM double hexamer bound to Sld3-Sld7-Cdc45 on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 e 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 MCM6_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 6； PDB构建体 1–1017； UniProt 1–1017

DNA replication licensing factor MCM7

物种未注明

UniProt A0A8H4BTB2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 7； UniProt 1–845 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 7 1–845（845 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–845（845 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 A0A8H4BTB2_YEASX
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 7； PDB构建体 1–845； UniProt 1–845

DNA polymerase epsilon catalytic subunit A

物种未注明

UniProt P21951

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 8； UniProt 1–2222 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 G 1–2222（2222 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
4M8O TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE EPSILON WITH AN INCOMING dATP 提交 2013-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1228（1228 aa） 片段：POL2 domain, UNP residues 1-1228
突变：D290A,E292A DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 TAU 2-AMINOETHANESULFONIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% PEG-3350, 50 mM Hepes-NaOH pH 7.0, 10 mM MgCl2, 400 mM LiAc, and 10 mM 2-aminoethanesulfonic acid (taurine) , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.20 Å R-free 0.237
4PTF Ternary crystal structure of yeast DNA polymerase epsilon with template G 提交 2014-03-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1187（1187 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 1-1187)
未记录 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；12% PEG5000 MME, 25 mM magnesium acetate, 1% DMSO, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.81 Å R-free 0.247
5OKI Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC in complex with a 63 kDa fragment of DNA Polymerase epsilon 提交 2017-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–524（524 aa）
突变：D290A. E292A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 10000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium chloride
分辨率 4.50 Å R-free 0.312
5OKI Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC in complex with a 63 kDa fragment of DNA Polymerase epsilon 提交 2017-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–524（524 aa）
突变：D290A. E292A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 10000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium chloride
分辨率 4.50 Å R-free 0.312
6FWK The crystal structure of Pol2CORE-M644G in complex with DNA and an incoming nucleotide 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa）
突变：M644G DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；50mM MES, 150mM NaAc and 8% PEG20K
分辨率 2.50 Å R-free 0.263
6FWK The crystal structure of Pol2CORE-M644G in complex with DNA and an incoming nucleotide 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1186（1186 aa）
突变：M644G DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 FE FE (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；50mM MES, 150mM NaAc and 8% PEG20K
分辨率 2.50 Å R-free 0.263
6G0A The crystal structure of the Pol2 catalytic domain of DNA polymerase epsilon carrying a P301R substitution. 提交 2018-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa）
突变：P301R DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES pH 6.5, 150mM NaAc and 8% PEG20K
分辨率 2.62 Å R-free 0.265
6H1V The crystal structure of Pol2CORE in complex with DNA and an incoming nucleotide, carrying an Fe-S cluster 提交 2018-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1187（1187 aa）
突变：D290A and E292A SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% PEG-3350, 50 mM Hepes-NaOH pH 7.0, 10 mM MgCl2, 400 mM LiAc, and 10 mM 2-aminoethanesulfonic acid (taurine)
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% PEG-3350, 50 mM Hepes-NaOH pH 7.0, 10 mM MgCl2, 400 mM LiAc, and 10 mM 2-aminoethanesulfonic acid (taurine)
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
6HV8 Cryo-EM structure of S. cerevisiae Polymerase epsilon deltacat mutant 提交 2018-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1308–2221（914 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6I8A The crystal structure of the Pol2 catalytic domain of DNA polymerase epsilon carrying a P301R substitution. 提交 2018-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1185（1185 aa）
突变：P301R DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES pH 6.5, 150mM NaAc, 8%PEG20K
分辨率 2.65 Å R-free 0.279
6I8A The crystal structure of the Pol2 catalytic domain of DNA polymerase epsilon carrying a P301R substitution. 提交 2018-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1185（1185 aa）
突变：P301R DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES pH 6.5, 150mM NaAc, 8%PEG20K
分辨率 2.65 Å R-free 0.279
6QIB The crystal structure of Pol2CORE in complex with DNA and an incoming nucleotide, carrying an Fe-S cluster 提交 2019-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1187（1187 aa）
突变：D290A, E292A SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；10mM Tris HCl pH8, 10mM CaCl2, 15% PEG8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.286
6S1C P3221 crystal form of the Ctf18-1-8/Pol2(1-528) complex 提交 2019-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–524（524 aa）
突变：D290A, E292A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 14% PEG 20000, 0.1 M HEPES pH 7.0
分辨率 6.10 Å R-free 0.333
6S1C P3221 crystal form of the Ctf18-1-8/Pol2(1-528) complex 提交 2019-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–524（524 aa）
突变：D290A, E292A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 14% PEG 20000, 0.1 M HEPES pH 7.0
分辨率 6.10 Å R-free 0.333
6S2E Cryo-EM structure of Ctf18-1-8 in complex with the catalytic domain of DNA polymerase epsilon 提交 2019-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1186（1186 aa）
突变：D290A, E292A SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6S2F Cryo-EM structure of Ctf18-1-8 in complex with the catalytic domain of DNA polymerase epsilon (Class 2) 提交 2019-06-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1192（1192 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6WJV Structure of the Saccharomyces cerevisiae polymerase epsilon holoenzyme 提交 2020-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–2222（2222 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7PMK S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 Q 1–2222（2222 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 Q 1–2222（2222 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 G 1–2222（2222 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7R3X The crystal structure of the L439V variant of Pol2CORE in complex with DNA and an incoming nucleotide 提交 2022-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1185（1185 aa）
突变：L439V DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；8 % PEG 20K , 150 mM NaAc, 0-1,5% Glycerol, 50 mM MES pH6.5
分辨率 2.46 Å R-free 0.256
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 N 1–2222（2222 aa）
链 Q 1–2222（2222 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B67 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing CTP in the polymerase active site 提交 2022-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G CA CALCIUM ION × 3 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
8B6K The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing dCTP in the polymerase active site 提交 2022-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G, D290A, E292A CA CALCIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
8B6K The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing dCTP in the polymerase active site 提交 2022-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G, D290A, E292A CA CALCIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
8B76 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing dTTP in the polymerase active site 提交 2022-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G CA CALCIUM ION × 3 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.247
8B76 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing dTTP in the polymerase active site 提交 2022-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G CA CALCIUM ION × 3 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.247
8B77 The crystal structure of N828V variant of DNA Pol Epsilon containing dATP in the polymerase active site 提交 2022-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa）
突变：N828V DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.70 Å R-free 0.273
8B79 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing UTP in the polymerase active site 提交 2022-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES, PEG20K,2.5% glycerol, 150mM Sodium Actetate
分辨率 2.65 Å R-free 0.248
8B79 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing UTP in the polymerase active site 提交 2022-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES, PEG20K,2.5% glycerol, 150mM Sodium Actetate
分辨率 2.65 Å R-free 0.248
8B7E The crystal structure of N828V variant of DNA Pol Epsilon containing UTP in the polymerase active site 提交 2022-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：N828V UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.230
8B7E The crystal structure of N828V variant of DNA Pol Epsilon containing UTP in the polymerase active site 提交 2022-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：N828V UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.230
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 M 1–2222（2222 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 M 1–2222（2222 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 M 1–2222（2222 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 G 1–2222（2222 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 G 1–2222（2222 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 G 1–2222（2222 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8TW9 Cryo-EM structure of S. cerevisiae PolE-Ctf18-8-1-DNA 提交 2023-08-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 E 1–2222（2222 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8TWA Cryo-EM structure of S. cerevisiae Ctf18-RFC-PCNA-PolE-DNA complex 提交 2023-08-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 E 1–2222（2222 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å

共 33 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DPOE_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 8； PDB构建体 1–2222； UniProt 1–2222

DNA polymerase epsilon subunit B

物种未注明

UniProt P24482

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 9； UniProt 1–689 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 F 1–689（689 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6HV8 Cryo-EM structure of S. cerevisiae Polymerase epsilon deltacat mutant 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–689（689 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
6WJV Structure of the Saccharomyces cerevisiae polymerase epsilon holoenzyme 提交 2020-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 2 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7PMK S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 R 1–689（689 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 R 1–689（689 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–689（689 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 F 1–689（689 aa）
链 M 1–689（689 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 N 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 N 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 N 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 F 1–689（689 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 F 1–689（689 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 F 1–689（689 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 N 1–689（689 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 N 1–689（689 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 F 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 F 1–689（689 aa）
链 M 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DPB2_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 9； PDB构建体 1–689； UniProt 1–689

DNA replication complex GINS protein PSF1

物种未注明

UniProt Q12488

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 1–208 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 H 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 A 1–208（208 aa）
链 a 1–208（208 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 A 1–208（208 aa）
链 a 1–208（208 aa）
链 n 1–208（208 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–208（208 aa） 片段：Tof1
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6U0M Structure of the S. cerevisiae replicative helicase CMG in complex with a forked DNA 提交 2019-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 A 1–208（208 aa） 片段：Tof1
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 C 1–208（208 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 C 1–208（208 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–208（208 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 H 1–208（208 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 H 1–208（208 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 H 1–208（208 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 A 1–208（208 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 H 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 H 1–208（208 aa）
链 O 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 28 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSF1_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–208； UniProt 1–208

DNA replication complex GINS protein PSF3

物种未注明

UniProt Q12146

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 1–194 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 C 1–194（194 aa）
链 c 1–194（194 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 C 1–194（194 aa）
链 c 1–194（194 aa）
链 p 1–194（194 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6U0M Structure of the S. cerevisiae replicative helicase CMG in complex with a forked DNA 提交 2019-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 3–193（191 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 C 1–194（194 aa）
链 J 1–194（194 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 E 1–194（194 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 E 1–194（194 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–194（194 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 C 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 C 1–194（194 aa）
链 J 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 29 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSF3_YEAST
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–194； UniProt 1–194

DNA replication complex GINS protein SLD5

物种未注明

UniProt Q03406

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–294 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
4C95 Crystal structure of the carboxy-terminal domain of yeast Ctf4 bound to Sld5 提交 2013-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–19（19 aa） 片段：CTF4-BINDING MOTIF, RESIDUES 1-19
链 E 1–19（19 aa） 片段：CTF4-BINDING MOTIF, RESIDUES 1-19
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2 M TRI-SODIUM CITRATE PH 6.2, 7-9% PEG 8000
分辨率 2.69 Å R-free 0.214
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–294（294 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 D 1–294（294 aa）
链 d 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 D 1–294（294 aa）
链 d 1–294（294 aa）
链 q 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 D 1–294（294 aa） 片段：Ctf4
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6U0M Structure of the S. cerevisiae replicative helicase CMG in complex with a forked DNA 提交 2019-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 3–293（291 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7PMK S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 D 1–294（294 aa）
链 K 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 F 1–294（294 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 F 1–294（294 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–294（294 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 D 1–294（294 aa）
链 K 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SLD5_YEAST
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–294； UniProt 1–294

Cell division control protein 45

物种未注明

UniProt Q08032

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 E； UniProt 1–650 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 E 1–197（197 aa）
链 E 204–650（447 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 c 1–650（650 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 c 1–650（650 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–650（650 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 c 1–650（650 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 H 1–650（650 aa）
链 h 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 E 1–650（650 aa）
链 e 1–650（650 aa）
链 r 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–650（650 aa） 片段：Mcm4
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6U0M Structure of the S. cerevisiae replicative helicase CMG in complex with a forked DNA 提交 2019-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 E 5–650（646 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7PMK S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I) 提交 2021-09-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–197（197 aa）
链 E 203–650（448 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–197（197 aa）
链 E 203–650（448 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 E 1–198（198 aa）
链 E 203–650（448 aa）
链 L 1–198（198 aa）
链 L 203–650（448 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 G 1–198（198 aa）
链 G 203–650（448 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 G 1–198（198 aa）
链 G 203–650（448 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–198（198 aa）
链 G 203–650（448 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8J09 Crystal structure of the Sld3 Cdc45-binding-domain, in complex with Cdc45 提交 2023-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–650（650 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2M sodium acetate, 0.1M Bis-Tris propane (pH6.5: pH8.5 = 3:7), 20%(w/v) PEG33500
分辨率 2.61 Å R-free 0.262
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 E 1–197（197 aa）
链 E 204–650（447 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 E 1–197（197 aa）
链 E 204–650（447 aa）
链 L 1–197（197 aa）
链 L 204–650（447 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9RHM Phospho-MCM double hexamer bound to Sld3-Sld7-Cdc45 on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 E 1–197（197 aa）
链 E 204–650（447 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 34 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDC45_YEAST
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–650； UniProt 1–650

DNA polymerase alpha-binding protein

物种未注明

UniProt Q01454

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 1–927 链 G； UniProt 1–927 链 H； UniProt 1–927 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4C8H Crystal structure of the C-terminal region of yeast Ctf4, selenomethionine protein. 提交 2013-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 471–927（457 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN
链 B 471–927（457 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN
链 C 471–927（457 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2 M TRI-SODIUM CITRATE PH 6.2, 7-9% PEG 8000
分辨率 2.69 Å R-free 0.225
4C8S Crystal structure of the C-terminal region of yeast Ctf4 提交 2013-10-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 471–927（457 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 471-927
链 B 471–927（457 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 471-927
链 C 471–927（457 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 471-927
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2 M TRI-SODIUM CITRATE PH 6.2, 7-9% PEG 8000
分辨率 3.00 Å R-free 0.205
4C93 Crystal structure of the carboxy-terminal domain of yeast Ctf4 bound to Pol alpha. 提交 2013-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 471–927（457 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 471-927
链 B 471–927（457 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 471-927
链 C 471–927（457 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 471-927
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2 M TRI-SODIUM CITRATE PH 6.2, 7-9% PEG 8000
分辨率 2.69 Å R-free 0.210
4C95 Crystal structure of the carboxy-terminal domain of yeast Ctf4 bound to Sld5 提交 2013-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 471–927（457 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 471-927
链 B 471–927（457 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 471-927
链 C 471–927（457 aa） 片段：C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 471-927
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2 M TRI-SODIUM CITRATE PH 6.2, 7-9% PEG 8000
分辨率 2.69 Å R-free 0.214
5HOG Crystal structure of the carboxy-terminal domain of yeast Ctf4 bound to Dna2. 提交 2016-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 450–927（478 aa） 片段：UNP residues 450-927
链 B 450–927（478 aa） 片段：UNP residues 450-927
链 C 450–927（478 aa） 片段：UNP residues 450-927
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；0.2 M tri-sodium citrate pH 6.2, 7-9% PEG 8000 and 0.45-0.9 M NaCl.
分辨率 3.09 Å R-free 0.226
5HOI Crystal structure of the carboxy-terminal domain of yeast Ctf4 bound to Tof2. 提交 2016-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 472–927（456 aa） 片段：UNP residues 472-927
链 B 472–927（456 aa） 片段：UNP residues 472-927
链 C 472–927（456 aa） 片段：UNP residues 472-927
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；0.2 M tri-sodium citrate pH 6.2, 7-9% PEG 8000 and 0.45-0.9 M NaCl
分辨率 3.30 Å R-free 0.224
5NXQ Crystal structure of the carboxy-terminal domain of yeast Ctf4 bound to a stapled Sld5 CIP 提交 2017-05-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 471–927（457 aa） 片段：UNP residues 471-927
链 B 471–927（457 aa） 片段：UNP residues 471-927
链 C 471–927（457 aa） 片段：UNP residues 471-927
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M tri-sodium citrate pH 6.2 7.5-9% (w/v) PEG 8000 0.40-0.65 M NaCI
分辨率 2.41 Å R-free 0.211
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–927（927 aa）
链 F 1–927（927 aa）
链 G 1–927（927 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 E 1–927（927 aa）
链 F 1–927（927 aa）
链 G 1–927（927 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 X 1–927（927 aa）
链 Y 1–927（927 aa）
链 Z 1–927（927 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 F 1–927（927 aa） 片段：Mcm6
链 G 1–927（927 aa） 片段：Mcm6
链 H 1–927（927 aa） 片段：Mcm6
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 F 1–927（927 aa） 片段：Mcm6
链 G 1–927（927 aa） 片段：Mcm6
链 H 1–927（927 aa） 片段：Mcm6
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 H 1–927（927 aa）
链 K 1–927（927 aa）
链 L 1–927（927 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 H 1–927（927 aa）
链 K 1–927（927 aa）
链 L 1–927（927 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 F 1–927（927 aa）
链 G 1–927（927 aa）
链 H 1–927（927 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 F 1–927（927 aa）
链 G 1–927（927 aa）
链 H 1–927（927 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 F 1–927（927 aa）
链 G 1–927（927 aa）
链 H 1–927（927 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–927（927 aa）
链 G 1–927（927 aa）
链 H 1–927（927 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–927（927 aa）
链 G 1–927（927 aa）
链 H 1–927（927 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CTF4_YEAST
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–927； UniProt 1–927 作者链 G； PDB构建体 1–927； UniProt 1–927 作者链 H； PDB构建体 1–927； UniProt 1–927

Topoisomerase 1-associated factor 1

物种未注明

UniProt P53840

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 I； UniProt 1–1238 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 X 1–1238（1238 aa） 片段：Mcm2
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
7PMK S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 K 1–1238（1238 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 X 354–396（43 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TOF1_YEAST
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–1238； UniProt 1–1238

Chromosome segregation in meiosis protein 3

物种未注明

UniProt Q04659

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 J； UniProt 1–317 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 Y 1–317（317 aa） 片段：Mcm3
突变：CBP-tag at N-terminus ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
7PMK S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 Y 1–317（317 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 Y 1–317（317 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 Y 1–317（317 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 Y 1–317（317 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 Y 1–317（317 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 L 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 Y 48–139（92 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 Y 48–139（92 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CSM3_YEAST
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–317； UniProt 1–317

Mediator of replication checkpoint protein 1

物种未注明

UniProt P25588

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 K； UniProt 1–1096 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 P 1–1096（1096 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 P 1–1096（1096 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 P 1–1096（1096 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MRC1_YEAST
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–1096； UniProt 1–1096

FACT complex subunit SPT16

物种未注明

UniProt P32558

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 L； UniProt 1–1035 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3BIP Crystal structure of yeast Spt16 N-terminal Domain 提交 2007-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–465（465 aa） 片段：residues 1-465
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；298 K；25% Pentaerythritol Ethoxylate (15/4 EO/OH), 100mM Sodium Acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
3BIP Crystal structure of yeast Spt16 N-terminal Domain 提交 2007-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–465（465 aa） 片段：residues 1-465
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；298 K；25% Pentaerythritol Ethoxylate (15/4 EO/OH), 100mM Sodium Acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 1.94 Å R-free 0.244
3BIQ Crystal structure of yeast Spt16 N-terminal Domain 提交 2007-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–465（465 aa） 片段：residues 1-465
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；298 K；25% Pentaerythritol Ethoxylate (15/4 EO/OH), 100mM Sodium Acetate, pH 4.5, vapor diffusion, temperature 298K
分辨率 1.73 Å R-free 0.213
3BIT Crystal structure of yeast Spt16 N-terminal Domain 提交 2007-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–451（451 aa） 片段：residues 1-451
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；278 K；35% PEG 300, 200mM NaCl, 100mM Sodium Acetate, pH 4.5, vapor diffusion, temperature 278K
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
3BIT Crystal structure of yeast Spt16 N-terminal Domain 提交 2007-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–451（451 aa） 片段：residues 1-451
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；278 K；35% PEG 300, 200mM NaCl, 100mM Sodium Acetate, pH 4.5, vapor diffusion, temperature 278K
分辨率 1.90 Å R-free 0.224
4IOY Structure of the Spt16 Middle Domain Reveals Functional Features of the Histone Chaperone FACT 提交 2013-01-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 X 675–958（284 aa） 片段：Middle Domain (UNP residues 675-958)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；0.1 M sodium/potassium phosphate, pH 6.0, 0.2 M sodium chloride, 40% PEG400, 10 mM TCEP-HCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
分辨率 1.95 Å R-free 0.197
7NKY RNA Polymerase II-Spt4/5-nucleosome-FACT structure 提交 2021-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric
链 Q 1–1035（1035 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å

共 5 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SPT16_YEAST
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–1035； UniProt 1–1035

FACT complex subunit POB3

物种未注明

UniProt Q04636

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 M； UniProt 1–552 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2GCJ Crystal Structure of the Pob3 middle domain 提交 2006-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 220–478（259 aa） 片段：Pob3 Middle domain
突变：Q308K 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；21% PEG 3350, 20% Glycerol, 200mM NaCl, 50mM Ammonium Sulphate, 100mM Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.55 Å R-free 0.303
2GCJ Crystal Structure of the Pob3 middle domain 提交 2006-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 220–478（259 aa） 片段：Pob3 Middle domain
突变：Q308K 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；21% PEG 3350, 20% Glycerol, 200mM NaCl, 50mM Ammonium Sulphate, 100mM Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.55 Å R-free 0.303
2GCJ Crystal Structure of the Pob3 middle domain 提交 2006-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 220–478（259 aa） 片段：Pob3 Middle domain
突变：Q308K 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；21% PEG 3350, 20% Glycerol, 200mM NaCl, 50mM Ammonium Sulphate, 100mM Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.55 Å R-free 0.303
2GCJ Crystal Structure of the Pob3 middle domain 提交 2006-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 220–478（259 aa） 片段：Pob3 Middle domain
突变：Q308K 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；21% PEG 3350, 20% Glycerol, 200mM NaCl, 50mM Ammonium Sulphate, 100mM Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.55 Å R-free 0.303
2GCL Structure of the Pob3 Middle domain 提交 2006-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 220–478（259 aa） 片段：Middle domain
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；21% PEG 3350, 20% glycerol, 200mM NaCl, 50mM Ammonium sulphate, 100mM Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.21 Å R-free 0.264
2GCL Structure of the Pob3 Middle domain 提交 2006-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 220–478（259 aa） 片段：Middle domain
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；21% PEG 3350, 20% glycerol, 200mM NaCl, 50mM Ammonium sulphate, 100mM Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.21 Å R-free 0.264
3F5R The crystal structure of a subunit of the heterodimeric FACT complex (Spt16p-Pob3p). 提交 2008-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–168（168 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 FMT FORMIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-tris, 1.5M (NH4)2SO4., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.192
4PQ0 Crystal structure of POB3 middle domain at 1.65A 提交 2014-02-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 232–473（242 aa） 片段：UNP RESIDUES 232-473
未记录 MLA MALONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；287 K；0.1M Sodium malonate pH 7.0, 0.1M Ammonium acetate, 20% w/v PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
分辨率 1.65 Å R-free 0.248

共 4 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POB3_YEAST
Isoform —
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–552； UniProt 1–552

Histone H3

物种未注明

UniProt A0A6A5Q536

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 N； UniProt 1–136 链 R； UniProt 1–136 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8GHM Hir1 WD40 domains and Asf1/H3/H4 提交 2023-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 M 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å
8X2X The piccolo NuA4 bound to the H2A.Z nucleosome complex at pre-H4-acetylation state 提交 2023-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8X2Y The class1 of piccolo NuA4 bound to the H2A.Z nucleosome complex at harboring state 提交 2023-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8X2Z The class2 of piccolo NuA4 bound to the H2A.Z nucleosome complex at harboring state 提交 2023-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8X30 Structure of piccolo NuA4 and H2A.Z nucleosome 2:1 complex 提交 2023-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8X31 The piccolo NuA4 bound to the H2A.Z nucleosome complex with Ac-CoA at resetting state 提交 2023-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
8X32 The piccolo NuA4 bound to the H2A.Z nucleosome-H4KQ Complex with Ac-CoA at resetting state 提交 2023-11-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5Q536_YEASX
Isoform —
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 R； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

Histone H4

物种未注明

UniProt P02309

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 O； UniProt 1–103 链 S； UniProt 1–103 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H2A.1 × 1 （P04911） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1E6I Bromodomain from GCN5 complexed with acetylated H4 peptide 提交 2000-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 16–30（15 aa） 片段：ACETYLATED TAIL, RESIDUES 16-30
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；2.2M AMMONIUM SULPHATE, 20% V/V GLYCEROL, 4MM DITHIOTHREITOL, 100 MM HEPES PH 7.5, 125MM NACL 5:1 PEPTIDE:PROTEIN
分辨率 1.87 Å R-free 0.209
1ID3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE YEAST NUCLEOSOME CORE PARTICLE REVEALS FUNDAMENTAL DIFFERENCES IN INTER-NUCLEOSOME INTERACTIONS 提交 2001-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–102（102 aa）
链 F 1–102（102 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, Potassium chloride, cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 3.10 Å R-free 0.292
1Q1A Structure of the yeast Hst2 protein deacetylase in ternary complex with 2'-O-acetyl ADP ribose and histone peptide 提交 2003-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 12–21（10 aa） 片段：Residues 12-21
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 OAD 2'-O-ACETYL ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；294 K；PEG 4K, , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
1SZC Structural basis for nicotinamide cleavage and ADP-ribose transfer by NAD+-dependent Sir2 histone/protein deacetylases 提交 2004-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 12–21（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 CNA CARBA-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；Ammonium Sulfate, Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.75 Å R-free 0.239
1SZC Structural basis for nicotinamide cleavage and ADP-ribose transfer by NAD+-dependent Sir2 histone/protein deacetylases 提交 2004-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 12–21（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 CNA CARBA-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 2 GOL GLYCEROL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；Ammonium Sulfate, Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.75 Å R-free 0.239
1SZD Structural basis for nicotinamide cleavage and ADP-ribose transfer by NAD+-dependent Sir2 histone/protein deacetylases 提交 2004-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 12–21（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；Ammonium Sulfate, Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.230
1SZD Structural basis for nicotinamide cleavage and ADP-ribose transfer by NAD+-dependent Sir2 histone/protein deacetylases 提交 2004-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 12–21（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 APR ADENOSINE-5-DIPHOSPHORIBOSE × 2 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；Ammonium Sulfate, Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.230
2E3K Crystal structure of the human Brd2 second bromodomain in complexed with the acetylated histone H4 peptide 提交 2006-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Q 1–15（15 aa） 片段：N-terminal H4 di-acetylated tail
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；PEG4000, Ammonium Acetate,, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.268
2E3K Crystal structure of the human Brd2 second bromodomain in complexed with the acetylated histone H4 peptide 提交 2006-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 1–15（15 aa） 片段：N-terminal H4 di-acetylated tail
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；PEG4000, Ammonium Acetate,, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.268
2H2H The Structural basis of sirtuin substrate specificity 提交 2006-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 75–85（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293.15 K；20 % PEG, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K, pH 9.5
分辨率 2.20 Å R-free 0.239
2L5A Structural basis for recognition of centromere specific histone H3 variant by nonhistone Scm3 提交 2010-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 42–103（62 aa） 片段：Cse4(151-228), Scm3(93-172), H4(42-103)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.4；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.00；压力 ambient
NMR样品组成 0.8-1.0 mM [U-100% 15N] scCSH-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-100% 15N] scCSH-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-13C methyl; U-15N; U-2H] scCSH-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-13C ; U-15N; 35%-2H] scCSH-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM [U-13C ; U-15N] scCSH-5, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.8-0.85 mM scCSH-6, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2QQF Hst2 bound to ADP-HPD and Acetylated histone H4 提交 2007-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 13–23（11 aa） 片段：SEQUENCE DATABASE RESIDUES 13-23
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；2.0 M Ammonium Sulfate, 100 mM Na citrate and 200 mM K/Na tartrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
2QQF Hst2 bound to ADP-HPD and Acetylated histone H4 提交 2007-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 13–23（11 aa） 片段：SEQUENCE DATABASE RESIDUES 13-23
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；2.0 M Ammonium Sulfate, 100 mM Na citrate and 200 mM K/Na tartrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
2QQG Hst2 bound to ADP-HPD, acetyllated histone H4 and nicotinamide 提交 2007-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 13–23（11 aa） 片段：sequence database residues 13-23
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 1 NCA NICOTINAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；298 K；2.0 M Ammonium Sulfate, 100 mM Na citrate, pH 5.6, 200 mM K/Na tartrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 5.60
分辨率 2.05 Å R-free 0.245
2QQG Hst2 bound to ADP-HPD, acetyllated histone H4 and nicotinamide 提交 2007-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 13–23（11 aa） 片段：sequence database residues 13-23
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 A1R 5'-O-[(S)-{[(S)-{[(2R,3R,4S)-3,4-DIHYDROXYPYRROLIDIN-2-YL]METHOXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]ADENOSINE × 2 NCA NICOTINAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.6；298 K；2.0 M Ammonium Sulfate, 100 mM Na citrate, pH 5.6, 200 mM K/Na tartrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K, pH 5.60
分辨率 2.05 Å R-free 0.245
3TO6 Crystal structure of yeast Esa1 HAT domain complexed with H4K16CoA bisubstrate inhibitor 提交 2011-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 12–23（12 aa） 片段：UNP residues 12-23
未记录 CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M sodium cacodylate, 1.6 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.10 Å R-free 0.232
4JJN Crystal structure of heterochromatin protein Sir3 in complex with a silenced yeast nucleosome 提交 2013-03-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.05 M sodium cacodylate, 32% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.09 Å R-free 0.255
4KUD Crystal structure of N-terminal acetylated Sir3 BAH domain D205N mutant in complex with yeast nucleosome core particle 提交 2013-05-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
突变：S2A 突变：S2A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；289 K；16% PEG 400, 0.1M KCl, 0.01M CaCl2, 0.05M sodium citrate(pH4.8), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 3.20 Å R-free 0.237
4PSX Crystal structure of histone acetyltransferase complex 提交 2014-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–49（48 aa） 片段：UNP residues 2-49
突变：I21V COA COENZYME A × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.2M potassium sodium tartrate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3,350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.51 Å R-free 0.223
4PSX Crystal structure of histone acetyltransferase complex 提交 2014-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 2–49（48 aa） 片段：UNP residues 2-49
突变：I21V COA COENZYME A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.2M potassium sodium tartrate, 20%(w/v) polyethylene glycol 3,350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.51 Å R-free 0.223
4TWI The structure of Sir2Af1 bound to a succinylated histone peptide 提交 2014-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 9–21（13 aa） 片段：UNP residues 9-21
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris pH 8.5, 200 mM MgCl2, and 20% (w/v) PEG 8,000
分辨率 1.79 Å R-free 0.221
4TWJ The structure of Sir2Af2 bound to a myristoylated histone peptide 提交 2014-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 9–21（13 aa） 片段：UNP residues 9-21
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 ACT ACETATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；293 K；0.1 M Na-acetate pH 4.8, 14-18% (v/v) 2-propanol, and 14-15% (w/v) PEG 6,000
分辨率 1.65 Å R-free 0.205
5ZBA Crystal structure of Rtt109-Asf1-H3-H4-CoA complex 提交 2018-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–103（103 aa）
未记录 COA COENZYME A × 1 IOD IODIDE ION × 37 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；100mM sodium citrate, pH 5.0, 22% PEG 1500, 400mM sodium iodide
分辨率 3.50 Å R-free 0.294
5ZBB Crystal structure of Rtt109-Asf1-H3-H4 complex 提交 2018-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–103（103 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 23 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；100mM sodium citrate, pH 5.0, 22% PEG 1500, 400mM sodium iodide
分辨率 3.60 Å R-free 0.264
6GEJ Chromatin remodeller-nucleosome complex at 3.6 A resolution. 提交 2018-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GEN Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 b 25–103（79 aa）
链 f 25–103（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
6RXJ Crystal structure of CobB wt in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 13–22（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 22% PEG3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.188
6RXJ Crystal structure of CobB wt in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 13–22（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 22% PEG3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.188
6RXK Crystal structure of CobB wt in complex with H4K16-Butyryl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 13–23（11 aa） 片段：H4K16Bu
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；22% PEG 3350 0.1M Bis-Tris 0.03 mM HCL
分辨率 1.35 Å R-free 0.188
6RXL Crystal structure of CobB wt in complex with H4K16-Crotonyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 13–23（11 aa） 片段：H4K16Ac
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1 M Bis-Tris 22% PEG 3350 0.03 M HCl
分辨率 2.30 Å R-free 0.250
6RXM Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.03 HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
6RXM Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.03 HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
6RXM Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.03 HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
6RXM Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 J 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.03 HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
6RXM Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.03 HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
6RXM Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 L 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.03 HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.92 Å R-free 0.242
6RXO Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162A) in complex with H4K16-Buturyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 13–23（11 aa） 片段：H4K16Ac
突变：K16ALY 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.215
6RXO Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162A) in complex with H4K16-Buturyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 13–23（11 aa） 片段：H4K16Ac
突变：K16ALY 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.215
6RXP Crystal structure of CobB Ac2 (A76G,I131C,V162A) in complex with H4K16-Crotonyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.234
6RXP Crystal structure of CobB Ac2 (A76G,I131C,V162A) in complex with H4K16-Crotonyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 13–23（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.234
6RXQ Crystal structure of CobB Ac2 (A76G,I131C,V162A) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after soaking 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 mM Bis-Tris, 0.03M HCl, 23% PEG3350, soaked 36h with 1 mM NAD+
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXQ Crystal structure of CobB Ac2 (A76G,I131C,V162A) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after soaking 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 mM Bis-Tris, 0.03M HCl, 23% PEG3350, soaked 36h with 1 mM NAD+
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXQ Crystal structure of CobB Ac2 (A76G,I131C,V162A) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after soaking 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 mM Bis-Tris, 0.03M HCl, 23% PEG3350, soaked 36h with 1 mM NAD+
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXQ Crystal structure of CobB Ac2 (A76G,I131C,V162A) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after soaking 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.1 mM Bis-Tris, 0.03M HCl, 23% PEG3350, soaked 36h with 1 mM NAD+
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXR Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after co-crystallisation 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.02 M HCl, 22% PEG 3350, 1 mM NAD
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXR Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after co-crystallisation 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.02 M HCl, 22% PEG 3350, 1 mM NAD
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXR Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after co-crystallisation 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.02 M HCl, 22% PEG 3350, 1 mM NAD
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
6RXR Crystal structure of CobB Ac2 (A76G, I131C, V162G) in complex with H4K16Cr-2'OH-ADPr peptide intermediate after co-crystallisation 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 13–23（11 aa）
未记录 KMQ [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S})-4-[(~{E})-but-2-enoxy]-3,5-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.1 M Bis-Tris, 0.02 M HCl, 22% PEG 3350, 1 mM NAD
分辨率 1.70 Å R-free 0.228
7E9C Cryo-EM structure of the 1:1 Orc1 BAH domain in complex with nucleosome 提交 2021-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7E9F Cryo-EM structure of the 2:1 Orc1 BAH domain in complex with nucleosome 提交 2021-03-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7K78 antibody and nucleosome complex 提交 2020-09-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.10 Å
7K7G nucleosome and Gal4 complex 提交 2020-09-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XAY Crystal structure of Hat1-Hat2-Asf1-H3-H4 提交 2022-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 8–103（96 aa）
未记录 COA COENZYME A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；100 mM Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% PEG-3350, and 200 mM sodium nitrate
分辨率 3.30 Å R-free 0.256
7Z0O Structure of transcription factor UAF in complex with TBP and 35S rRNA promoter DNA 提交 2022-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8GHN Composite model of the yeast Hir Complex with Asf1/H3/H4 提交 2023-03-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric
链 N 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8QKU SWR1-nucleosome complex in configuration 1 提交 2023-09-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8QKV SWR1-nucleosome complex in configuration 2 提交 2023-09-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8QYV SWR1-hexasome complex 提交 2023-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QZ0 SWR1-hexasome-dimer complex 提交 2023-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9FBW SWR1 lacking Swc5 subunit in complex with hexasome 提交 2024-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 C 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å

共 43 个其他 PDB 条目、63 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 H4_YEAST
Isoform —
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 O； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 S； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103

Histone H2A.1

物种未注明

UniProt P04911

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 P； UniProt 1–132 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2B.2 × 1 （P02294） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1ID3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE YEAST NUCLEOSOME CORE PARTICLE REVEALS FUNDAMENTAL DIFFERENCES IN INTER-NUCLEOSOME INTERACTIONS 提交 2001-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–131（131 aa）
链 G 1–131（131 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, Potassium chloride, cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 3.10 Å R-free 0.292
3T7K Complex structure of Rtt107p and phosphorylated histone H2A 提交 2011-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 125–132（8 aa） 片段：phosphorylated C-terminal peptide
链 D 125–132（8 aa） 片段：phosphorylated C-terminal peptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；283 K；14%(w/v) PEG 1500, 0.2M NaCl, 0.1M MES, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 2.03 Å R-free 0.258
3T7K Complex structure of Rtt107p and phosphorylated histone H2A 提交 2011-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 125–132（8 aa） 片段：phosphorylated C-terminal peptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；283 K；14%(w/v) PEG 1500, 0.2M NaCl, 0.1M MES, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 2.03 Å R-free 0.258
3T7K Complex structure of Rtt107p and phosphorylated histone H2A 提交 2011-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 125–132（8 aa） 片段：phosphorylated C-terminal peptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；283 K；14%(w/v) PEG 1500, 0.2M NaCl, 0.1M MES, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 2.03 Å R-free 0.258
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–132（132 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–132（132 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
4WNN SPT16-H2A-H2B FACT HISTONE Complex 提交 2014-10-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；Crystals of ~ 60 x 60 mm formed within 10 days in 0.1M SPG (succinic acid:sodium dihydrogen phosphate:glycine ) pH 7, 25 % PEG 1500 (A4 of the PACT suite commercial screen (Qiagen).
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
5BT1 histone chaperone Hif1 playing with histone H2A-H2B dimer 提交 2015-06-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；287 K；0.1M Magnesium formate dihydrate, 15% PEG3350
分辨率 2.62 Å R-free 0.262
6GEJ Chromatin remodeller-nucleosome complex at 3.6 A resolution. 提交 2018-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–132（132 aa）
链 F 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GEN Chromatin remodeller-nucleosome complex at 4.5 A resolution. 提交 2018-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–132（132 aa）
链 F 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 g 17–121（105 aa）
链 i 17–118（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
7K78 antibody and nucleosome complex 提交 2020-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.10 Å
7K7G nucleosome and Gal4 complex 提交 2020-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7SSA Cryo-EM structure of pioneer factor Cbf1 bound to the nucleosome 提交 2021-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 2–132（131 aa）
链 G 2–132（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8OW0 Cryo-EM structure of CBF1-CCAN bound topologically to a centromeric CENP-A nucleosome 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 c 1–132（132 aa）
链 g 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 c 1–132（132 aa）
链 g 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8QYV SWR1-hexasome complex 提交 2023-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 E 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QZ0 SWR1-hexasome-dimer complex 提交 2023-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9C9G S.c INO80 in complex with S.c 0/80 nucleosome 提交 2024-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.91 Å
9C9T S.c INO80 in complex with S.c 0/40 nucleosome, Class 2 提交 2024-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.16 Å
9CAU DeltaArp8 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Nucleosome 提交 2024-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.18 Å
9CB7 DeltaNhp10 INO80 bound to S.c 0/40 nucleosome, Ino80-Nucleosome 提交 2024-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 4.04 Å
9FBW SWR1 lacking Swc5 subunit in complex with hexasome 提交 2024-05-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 E 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
9OB1 S.c INO80 in complex with Yeast 0/80 nucleosome, Apo State 提交 2025-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–132（132 aa）
链 G 1–132（132 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.20 Å

共 20 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2A1_YEAST
Isoform —
PDB实体 22
链与序列区间 作者链 P； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132

Histone H2B.2

物种未注明

UniProt P02294

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 27 DNA 2 PDB 声明：29-meric（29） 与全部聚合物数一致 链 Q； UniProt 1–131 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） Minichromosome maintenance protein 5 × 1 （P29496） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A8H4BTB2） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （Q12488） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （Q12146） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （Q01454） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） Mediator of replication checkpoint protein 1 × 1 （P25588） FACT complex subunit SPT16 × 1 （P32558） FACT complex subunit POB3 × 1 （Q04636） Histone H3 × 2 （A0A6A5Q536） Histone H4 × 2 （P02309） Histone H2A.1 × 1 （P04911） DNA (51-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8XGC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1ID3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE YEAST NUCLEOSOME CORE PARTICLE REVEALS FUNDAMENTAL DIFFERENCES IN INTER-NUCLEOSOME INTERACTIONS 提交 2001-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–130（130 aa）
链 H 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；292 K；Manganese chloride, Potassium chloride, cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 3.10 Å R-free 0.292
4JJN Crystal structure of heterochromatin protein Sir3 in complex with a silenced yeast nucleosome 提交 2013-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 2–131（130 aa）
链 H 2–131（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.05 M sodium cacodylate, 32% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.09 Å R-free 0.255
6QLD Structure of inner kinetochore CCAN-Cenp-A complex 提交 2019-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 d 37–129（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.15 Å
7E9C Cryo-EM structure of the 1:1 Orc1 BAH domain in complex with nucleosome 提交 2021-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7E9F Cryo-EM structure of the 2:1 Orc1 BAH domain in complex with nucleosome 提交 2021-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–131（131 aa）
链 H 1–131（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8F0X Cryo-EM structure of Kap114 bound to H2A-H2B 提交 2022-11-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–131（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris pH 7.5, 300 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP, and 0.1% NP-40
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
8F1E Cryo-EM structure of Kap114 bound to Gsp1 (RanGTP) and H2A-H2B 提交 2022-11-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–131（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2B2_YEAST
Isoform —
PDB实体 23
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8xgc

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8xgc
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8xgc
沉积日期 deposition_date2023-12-15
结构标题 titleStructure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map
关键词 keywordsReplisome, FACT, histone hexamer, REPLICATION; REPLICATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier82.37 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron81.88 Å
零角强度 I(0) i019408100000.00
分子量 molecular_weight1177200.0 kDa
排除体积 excluded_volume1469600 ų
包络体积 envelope_volume2425600 ų
水化壳体积 shell_volume238630 ų
包络直径 envelope_diameter303.6 Å
壳层 Rg shell_rg83.61 Å
包络 Rg envelope_rg81.76 Å
形状 Rg shape_rg81.97 Å
总 Rg total_rg81.59 Å
总原子数 total_atoms82765
残基数 n_residues10409
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax210.3 Å
Rg (实空间) rg_real79.10 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.57 Å
I(0) (实空间) i0_real1.8810e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.2700e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal82.18 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal19400000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8926
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary88.6 Å
偏度 Skewness skewness0.144
峰度 Kurtosis kurtosis-0.698
角度范围 angular_range— – 0.0950 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0853
最高正则化参数 α highest_alpha1889000000.0000
实空间数据点数 n_real_points20
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.982; Stabil: 0.978; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.987; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (27)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)