CDK-activating kinase assembly factor MAT1
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 49 DNA 2 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物数一致 | 链 0; UniProt 1–309 | 未记录 | General transcription factor IIH subunit 1 × 1 (P32780) General transcription factor IIH subunit 2 × 1 (Q13888) General transcription factor IIH subunit 3 × 1 (Q13889) General transcription factor IIH subunit 4 × 1 (Q92759) General transcription factor IIH subunit 5 × 1 (Q6ZYL4) General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 (P19447) General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD × 1 (P18074) Cyclin-dependent kinase 7 × 1 (P50613) Cyclin-H × 1 (P51946) Transcription initiation factor TFIID subunit 1 × 1 (P21675) Transcription initiation factor TFIID subunit 2 × 1 (Q6P1X5) Transcription initiation factor TFIID subunit 4 × 2 (O00268) Transcription initiation factor TFIID subunit 5 × 2 (Q15542) Transcription initiation factor TFIID subunit 6 × 2 (P49848) Transcription initiation factor TFIID subunit 7 × 1 (Q15545) Transcription initiation factor TFIID subunit 8 × 1 (Q7Z7C8) Transcription initiation factor TFIID subunit 9 × 2 (Q16594) Transcription initiation factor TFIID subunit 10 × 2 (Q12962) Transcription initiation factor TFIID subunit 12 × 2 (Q16514) Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 (P52657) TATA-box-binding protein × 1 (P20226) Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 (P52655) Transcription initiation factor IIB × 1 (Q00403) General transcription factor IIF subunit 1 × 1 (P35269) General transcription factor IIF subunit 2 × 1 (P13984) General transcription factor IIE subunit 1 × 1 (P29083) Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 (P29084) DNA (71-MER) × 1 DNA (71-MER) × 1 Transcription initiation factor TFIID subunit 3 × 1 (Q5VWG9) Transcription initiation factor TFIID subunit 11 × 1 (Q15544) Transcription initiation factor TFIID subunit 13 × 1 (Q15543) DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 (P24928) DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 (A0A4X1TVZ5) DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 (I3LCH3) DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 (A0A481BYI6) DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 1 (A0A4X1VTX4) DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 1 (A0A4X1VEK9) DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 (A0A4X1VKG7) DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 (A0A4X1ULF2) DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 (P60899) RPB10 × 1 RNA_pol_L_2 domain-containing protein × 1 (A0A4X1UK25) RPB12 × 1 (A0A4X1TRS6) ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 3.90 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 7EGC | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1G25 SOLUTION STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF THE HUMAN TFIIH MAT1 SUBUNIT 提交 2000-10-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–65(65 aa)
片段:N-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.5;298 K;压力 ambiant
NMR测量条件
pH 7.5;290 K;压力 ambiant
NMR测量条件
pH 7.5;283 K;压力 ambiant
NMR样品组成
2 mM MAT1; 20 mM Tris-HCl pH 7.5; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 28JM Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH and XPC initial encounter complex 提交 2026-02-03 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Leica EM GP2
|
分辨率 3.29 Å |
| 28JS Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (composite map) 提交 2026-02-03 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:13-meric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Leica EM GP2
|
分辨率 3.32 Å |
| 28JV Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC complex bound to bulky lesion-mimic DNA (consensus map) 提交 2026-02-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:13-meric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Leica EM GP2
|
分辨率 3.91 Å |
| 28KE Cryo-EM structure of the human holo-TFIIH-XPC-XPA complex bound to bulky lesion-mimic DNA 提交 2026-02-04 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:12-meric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Leica EM GP2
|
分辨率 3.60 Å |
| 6NMI Cryo-EM structure of the human TFIIH core complex 提交 2019-01-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;A thin film of continuous carbon was floated onto Protochips C-flat CF-4/2 holey carbon grids and glow discharged or plasma cleaned before application of 4 uL of sample solution.
|
分辨率 3.70 Å |
| 6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 31 PDB 声明:33-meric |
链 3
1–309(309 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.20 Å |
| 6O9M Structure of the human apo TFIIH 提交 2019-03-14 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 3
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6TUN Helicase domain complex 提交 2020-01-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
66–141(76 aa)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris pH 8.5
25% PEG8000
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.227 |
| 6TUN Helicase domain complex 提交 2020-01-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
66–141(76 aa)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;100 mM Tris pH 8.5
25% PEG8000
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.227 |
| 6XBZ Structure of the human CDK-activating kinase 提交 2020-06-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6XD3 Structure of the human CAK in complex with THZ1 提交 2020-06-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
片段:residues 220-309
|
未记录 | V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7B5O Cryo-EM structure of the human CAK bound to ICEC0942 at 2.5 Angstroms resolution 提交 2020-12-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7B5Q Cryo-EM structure of the human CAK bound to ICEC0942 (PHENIX-OPLS3e) 提交 2020-12-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 49 PDB 声明:51-meric |
链 0
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16 | 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:76-meric |
链 0
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.07 Å |
| 7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16 | 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:76-meric |
链 0
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.13 Å |
| 7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:56-meric |
链 d
1–309(309 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:58-meric |
链 3
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7NVW TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3) 提交 2021-03-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric |
链 3
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7NVX TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric |
链 3
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:32-meric |
链 3
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.30 Å |
| 7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:32-meric |
链 3
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.20 Å |
| 7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:32-meric |
链 3
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.60 Å |
| 8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 40 PDB 声明:42-meric |
链 7
1–309(309 aa)
|
突变:0 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 38 PDB 声明:40-meric |
链 7
1–309(309 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 83 PDB 声明:87-meric |
链 HD
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.04 Å |
| 8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 83 PDB 声明:87-meric |
链 HD
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.16 Å |
| 8ORM Cryo-EM structure of CAK-THZ1 提交 2023-04-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å |
| 8P6V Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0942 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å |
| 8P6W Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor BS-181 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | X2H ~{N}5-(6-azanylhexyl)-~{N}7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å |
| 8P6X Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor BS-194 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | NS9 (2S,3S)-3-{[7-(benzylamino)-3-(1-methylethyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino}butane-1,2,4-triol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å |
| 8P6Y Cryo-EM structure of CAK in complex with nucleotide analogue ATPgS 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å |
| 8P6Z Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0510-R 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | X4L N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-N5-[(3R)-pyrrolidin-3-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.10 Å |
| 8P70 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0510-S 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | X4Q N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-N5-[(3S)-pyrrolidin-3-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.00 Å |
| 8P71 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0574 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | X4F (3R,4S)-4-[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]pyrrolidin-3-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.00 Å |
| 8P72 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0768 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | X2Z ~{N}7-(phenylmethyl)-~{N}5-[(3~{S})-piperidin-3-yl]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å |
| 8P73 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0829 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | X50 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidine-3,4-diol × 1 X58 (3S,4S)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidine-3,4-diol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.00 Å |
| 8P74 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0880 (ring-up conformation) 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | X3Z (2S,3S)-3-[[7-[(2-bromophenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]butane-1,2,4-triol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 8P75 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0880 (ring-down conformation) 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | X3Z (2S,3S)-3-[[7-[(2-bromophenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]butane-1,2,4-triol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.00 Å |
| 8P76 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0914 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | X1W N5-[(3S,4R)-4-phenylmethoxypyrrolidin-3-yl]-N7-(phenylmethyl)-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine-5,7-diamine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.00 Å |
| 8P77 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor ICEC0943 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | I73 (3S,4S)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.80 Å |
| 8P78 Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor dinaciclib 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | 1QK 3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å |
| 8P79 Cryo-EM structure of CAK with averaged inhibitor density 提交 2023-05-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9;Structure obtained by combining data from six samples of CAK bound to different non-covalent inhibitors. Four samples contained 5 mM beta-mercaptoethanol and two samples did not.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.70 Å |
| 8P7L Cryo-EM structure of CDK7 subunit of CAK in complex with inhibitor LDC4297 提交 2023-05-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | WD9 2-[(3S)-piperidin-3-yl]oxy-8-propan-2-yl-N-[(2-pyrazol-1-ylphenyl)methyl]pyrazolo[1,5-a][1,3,5]triazin-4-amine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.10 Å |
| 8PLZ Cryo-EM structure of CAK in complex with inhibitor CT7030 提交 2023-06-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | ZQ6 (3~{R},4~{R})-4-[[[7-[(2-methoxyphenyl)methylamino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å |
| 8PYR Crystal structure of the dual T-loop phosphorylated Cdk7/CycH/Mat1 complex 提交 2023-07-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
230–309(80 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;288 K;0.1 M Hepes (pH 7.0), 12% (v/w) medium weight PEG mix of PEG6K and PEG4K, 10% ethylene-glycol, and 0.2 M NDSB
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.241 |
| 8PYR Crystal structure of the dual T-loop phosphorylated Cdk7/CycH/Mat1 complex 提交 2023-07-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 G
230–309(80 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;288 K;0.1 M Hepes (pH 7.0), 12% (v/w) medium weight PEG mix of PEG6K and PEG4K, 10% ethylene-glycol, and 0.2 M NDSB
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.241 |
| 8S0R Cryo-EM structure of CAK modified by covalent inhibitor SY-1365 提交 2024-02-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | A1H46 ~{N}-[(1~{S},3~{R})-3-[[5-chloranyl-4-(1~{H}-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino]-1-methyl-cyclohexyl]-5-[4-(dimethylamino)butanoylamino]pyridine-2-carboxamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 8S0T Cryo-EM structure of CAK in complex with SY-5609 提交 2024-02-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | YNK 7-dimethylphosphoryl-3-[2-[[(3~{S})-6,6-dimethylpiperidin-3-yl]amino]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]-1~{H}-indole-6-carbonitrile × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9;Buffer contained 54 uM inhibitor SY-5609.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 8WAK Structure of transcribing complex 2 (TC2), the initially transcribing complex with Pol II positioned 2nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric |
链 0
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.47 Å |
| 8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric |
链 0
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.52 Å |
| 8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric |
链 0
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.07 Å |
| 8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric |
链 0
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.40 Å |
| 8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric |
链 0
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.85 Å |
| 8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric |
链 0
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.29 Å |
| 8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric |
链 0
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.20 Å |
| 8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric |
链 0
1–309(309 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.13 Å |
| 9HIX Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with THZ1 提交 2024-11-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | V0G N-(3-{[5-chloro-4-(1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-yl]amino}phenyl)-4-{[4-(dimethylamino)butanoyl]amino}benzamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9HIY Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with ATPgS 提交 2024-11-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 9HJ0 Cryo-EM structure of CAK (CDK7 D97N mutant) in complex with Samuraciclib 提交 2024-11-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | I74 (3R,4R)-4-[[[7-[(phenylmethyl)amino]-3-propan-2-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl]amino]methyl]piperidin-3-ol × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9I9I Cryo-EM structure of CAK-CDK11 提交 2025-02-06 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9I9J Cryo-EM structure of CAK-CDK2 (determined in the presence of ADP-nitrate) 提交 2025-02-06 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9I9K Cryo-EM structure of CAK-CDK2 (determined in the presence of ADP-AlFx) 提交 2025-02-06 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 9QCV Cryo-EM structure of CAK-CDK2-cyclin A2 bound to AMP-PNP 提交 2025-03-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 9QCX Cryo-EM structure of apo-CAK-CDK2-cyclin A2 提交 2025-03-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9QJN Cryo-EM structure of the human CAK bound to OTS964 提交 2025-03-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 H
220–309(90 aa)
|
未记录 | NK3 OTS964 × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 9SKQ Cryo-EM structure of CAK-CDK1-cyclin B1 提交 2025-09-02 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 H
1–309(309 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
共 66 个其他 PDB 条目、68 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | MAT1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 0; PDB构建体 1–309; UniProt 1–309 |