2zwh

Model for the F-actin structure

Method: FIBER DIFFRACTION Dmax: 73.6 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

物种未注明

UniProt P68135

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 3–377 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 FIBER DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 293 个其他 PDB 条目、353 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACTS_RABIT
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–375; UniProt 3–377

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 2zwh

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 2zwh
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id2zwh
沉积日期 deposition_date2008-12-05
结构标题 titleModel for the F-actin structure
关键词 keywords;F-actin, G-actin, cytoskelton, CONTRACTILE PROTEIN, ATP-binding, Cytoskeleton, Methylation, Muscle protein, Nucleotide-binding, Phosphoprotein ;; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 methodFIBER DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier22.64
回转半径 Rg (电子) rg_electron21.75
零角强度 I(0) i031015700.00
分子量 molecular_weight42269.0 kDa
排除体积 excluded_volume52651 ų
包络体积 envelope_volume61992 ų
水化壳体积 shell_volume23787 ų
包络直径 envelope_diameter78.5
壳层 Rg shell_rg28.57
包络 Rg envelope_rg22.05
形状 Rg shape_rg21.76
总 Rg total_rg22.56
总原子数 total_atoms2961
残基数 n_residues374
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax73.6
Rg (实空间) rg_real22.58
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.34
I(0) (实空间) i0_real3.1020e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.9380e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal22.60
I(0) (倒空间) i0_reciprocal31020000.0000
解质量估计 total_estimate0.8972
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary25.6
偏度 Skewness skewness0.262
峰度 Kurtosis kurtosis-0.423
角度范围 angular_range— – 0.3500 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha7916000.0000
实空间数据点数 n_real_points67
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.890; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.991

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id2zwhA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id2zwhA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology36 — Actin; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Actin; Chain A, domain 2
结构域编号 domain_id2zwhA03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id2zwhA04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)